原則論をいえば、著作権は社会の文化の発展のため限定的に認められる権利に過ぎない。
作者といえど社会の関わりの上で著作物がどう扱われるかを逐一制限することはできないのだから、嫌なら金庫に入れて最初から公表しないようにするしかない。
今回のリバースエンジニアリングの是非については本邦では既に第30条の4で規定済となっている。(プロジェクトは海外発なので関係なさそうだが)
ただ得られた結果を営利利用したりすれば倫理にもとることになるだろう。
作者と共有して最新のプラットフォーム向けに再販してもらうのがいいんじゃないかな。