Timus-specifična serin-proteaza jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom PRSS16.[5][6]

PRSS16
Identifikatori
AliasiPRSS16
Vanjski ID-jeviOMIM: 607169 MGI: 1859181 HomoloGene: 38106 GeneCards: PRSS16
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za PRSS16
Genomska lokacija za PRSS16
Bend6p22.1Početak27,247,701 bp[1]
Kraj27,256,624 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 13 (miš)
Hrom.Hromosom 13 (miš)[2]
Hromosom 13 (miš)
Genomska lokacija za PRSS16
Genomska lokacija za PRSS16
Bend13 A3.1|13 8.12 cMPočetak22,186,343 bp[2]
Kraj22,193,912 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0070122 peptidase activity
serine-type peptidase activity
hydrolase activity
dipeptidyl-peptidase activity
Ćelijska komponenta endozom
Lizozom
GO:0016023 citoplazmatska vezikula
Biološki proces GO:0044257 protein catabolic process
Proteoliza
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_005865

NM_019429

RefSeq (bjelančevina)

NP_005856

NP_062302

Lokacija (UCSC)Chr 6: 27.25 – 27.26 MbChr 13: 22.19 – 22.19 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 514 aminokiselina, а molekulska težina 55.049 Da.[7].

1020304050
MAVWLAQWLGPLLLVSLWGLLAPASLLRRLGEHIQQFQESSAQGLGLSLG
PGAAALPKVGWLEQLLDPFNVSDRRSFLQRYWVNDQHWVGQDGPIFLHLG
GEGSLGPGSVMRGHPAALAPAWGALVISLEHRFYGLSIPAGGLEMAQLRF
LSSRLALADVVSARLALSRLFNISSSSPWICFGGSYAGSLAAWARLKFPH
LIFASVASSAPVRAVLDFSEYNDVVSRSLMSTAIGGSLECRAAVSVAFAE
VERRLRSGGAAQAALRTELSACGPLGRAENQAELLGALQALVGGVVQYDG
QTGAPLSVRQLCGLLLGGGGNRSHSTPYCGLRRAVQIVLHSLGQKCLSFS
RAETVAQLRSTEPQLSGVGDRQWLYQTCTEFGFYVTCENPRCPFSQLPAL
PSQLDLCEQVFGLSALSVAQAVAQTNSYYGGQTPGANKVLFVNGDTDPWH
VLSVTQALGSSESTLLIRTGSHCLDMAPERPSDSPSLRLGRQNIFQQLQT
WLKLAKESQIKGEV

Funkcija

uredi

Ovaj gen kodira serin-proteazu eksprimiranu isključivo u timusu. Smatra se da ima ulogu u alternativnom putu prezentacije antigena koji koriste epitelne ćelije kore timusa, tokom pozitivne selekcije T-ćelija.

Gen se nalazi u velikoj grupi histonskih gena na hromosomu 6, u blizini glavnog kompleksa histokompatibilnosti (MHC) klase I. Opisana je druga varijanta transkripta, ali nije utvrđena njena puna dužina.[6]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000112812 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000006179 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Bowlus CL, Ahn J, Chu T, Gruen JR (Nov 1999). "Cloning of a novel MHC-encoded serine peptidase highly expressed by cortical epithelial cells of the thymus". Cellular Immunology. 196 (2): 80–6. doi:10.1006/cimm.1999.1543. PMID 10527559.
  6. ^ a b "Entrez Gene: PRSS16 protease, serine, 16 (thymus)".
  7. ^ "UniProt, Q9NQE7" (jezik: engleski). Pristupljeno 4. 10. 2021.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi

PRSS16 detalji ljudskog genoma u UCSC Genome Browser.