Tema 9 Anticuerpos
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Inmunobiotecnología Bea Volckaert
Si se mira la secuencia de los aminoácidos de las dos cadenas, pesada u ligera, se observa que si
se alinean secuencias de diferentes anticuerpos se ve que hay regiones de poca variabilidad
(parte constante) y otras de mucha variabilidad (parte variable).
Obs: Las asas hipervariables pueden imaginarse como unos dedos que
sobresalgan de cada dominio variable, tres dedos de la cadena pesada y tres
de la cadena ligera, que se juntan para formar una zona de unión al antígeno.
Idiotipo: diferencias entre dos anticuerpos con diferentes aminoácidos en las regiones variables.
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2. Generación de anticuerpos
Anticuerpos Policlonales
Inconvenientes:
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Anticuerpos Monoclonales
Un anticuerpo monoclonal se
obtiene si inmunizamos un ratón con
un ag (se hace varias veces para
estimular específicamente las células
B), se testa el nivel en sangre de ac,
se sacrifica el animal y se extrae el
bazo. Se separan las células
plasmáticas y se fusionan con una
línea celular de mieloma (célula
plasmática cancerígena). Se ha
desarrollado una técnica para
mezclar una célula B y un mieloma, y
se forma un hibridoma: posee las
propiedades de crecimiento inmortal
de la célula de mieloma y secreta
anticuerpos producidos por la célula B.
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El hibridoma se pone en una placa de cultivo. Los clones resultantes de células de hibridoma,
que secretan grandes cantidades de anticuerpo monoclonal y son inmortales, se cultivan en cada
pozo una sola célula, que empezará a crecer y a formar más clones. Estos anticuerpos (Mab) se
llaman monoclonales porque vienen de única célula B, que es un clon de células híbridas -
hibridoma- en cultivo. Un ac monoclonal está compuesto por moléculas idénticas que solo
reconocen un solo determinante antigénico.
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Tras esto, se realiza la separación. En los orígenes de la técnica se realizaban diluciones en placas
de 96 pocillos y se buscaban colonias aisladas en cada pocillo. Cada clon que caía en un pocillo
forma en un principio una colonia. Si caen dos se ven perfectamente dos colonias (aunque estén
pegadas) y no serviría pues no tendríamos el anticuerpo monoclonal. Actualmente es fácil
separar una célula por pocillo gracias a técnicas como FACS (cell sorters en general). Se puede
coger el sobrenadante y probar contra el antígeno. Si hay unión (buena respuesta), rápidamente
se replica y se congela para tener una alícuota sin alteraciones adicionales que afecten a las
características del anticuerpo o la estabilidad de la línea celular.
Podemos tener bastantes anticuerpos que responden contra mi antígeno, pero aún tenemos
que saber muchas más cosas; por ejemplo, contra qué epítopos van dirigidos estos anticuerpos
monoclonales. Para comprobar esto se realiza la reacción cruzada entre todos los clones. Así, se
adhiere un anticuerpo de un clon en la base de un pocillo; se añade el antígeno; y se añade
después el otro anticuerpo marcado. Si reaccionan contra el mismo epítopo, no tendremos señal
(pues el hueco estará ocupado), pero si no son específicos para éste, tendremos señal. (Se
pueden utilizar los anticuerpos contra sí mismos como control negativo). De esta manera
podemos determinar diferentes familias, siendo una aquella que recoge los clones que
reconocen un mismo epítopo. Si reconozco 5 familias, tengo 5 grupos de ac.
A partir de aquí, también podemos pedir que un laboratorio de síntesis peptídica nos sintetice
péptidos superpuestos que compongan toda la longitud de la secuencia aminoacídica del
antígeno (si hay 500aa en total, diseño del 1 al 20, del 2 al 21, del 2 al 22, etc). Así, si los fijamos
en una lámina de nitrocelulosa o nylon, podemos probar cada anticuerpo y ver con qué zona de
la proteína interaccionan. Aquí veríamos muy claro los determinantes antigénicos lineales. No
obstante es posible apreciar ciertas zonas marcadas, pero menos, que nos indiquen que hay un
determinante conformacional o discontinuo (más difícil).
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Y to esto pa que. Gracias a la clonación, las posibilidades que se abren son enormes:
construcciones tetraméricas, con otros dominios de proteínas o incluso hacer modificaciones en
cuanto a proteínas de fusión para simplificar. En la imagen de abajo tenemos unas cuantas de
las posibilidades, podemos hacer lo que nos dé la gana. Esto es gracias a que el dominio variable
de Ig es muy estable y permite hacer todo tipo de combinaciones. Por ejemplo se reduce el
tamaño molecular al mínimo en terapias con Lab on Chip (o como se llame).
Genoteca de Fagos
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Se puede realizar esta técnica solo con la parte variable, o también añadiendo el primer dominio
constante (aportará mayor estabilidad al complejo), aunque también puede dar problemas de
adecuación al tamaño. En el siguiente esquema vemos los pasos a seguir para el protocolo.
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IMPORTANTE DE TODO ESTO: la secuencia linker para añadirla se utilizan dos PCR seguidas. Toda
esta combinación aleatoria de fragmentos se clona en fagémidos (que son plásmidos que
generan fagos), que al transformar E.coli (capaces de sintetizar todo el resto necesario) se
producen fagos con la proteína expresada hacia el exterior normalmente sobre proteína pIII del
fago filiforme, aunque como está en menor cantidad se puede hacer en pVIII (aunque puede
haber más restricciones en cuanto a tamaño, y estructura del fago). Cuando purifico linfocitos
B, a partir del número de 50 millones de células puedo obtener todo el repertorio (10 18) por
simple probabilidad, e incluso obtener cosas que no existen ni en la naturaleza. Si este proceso
se repite, el de selección del fago, podríamos tener una población homogénea de fagos al cabo
de 7 ciclos. También podríamos ir mirando la afinidad de un tipo concreto, y mejorarla.
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4. Humanización de anticuerpos
El problema de la utilización de anticuerpos de ratón es que nuestro propio cuerpo genera una
respuesta contra ellos en forma de HAMA (human anti-mouse Ab), lo que afecta directamente
a la capacidad terapéutica de los anticuerpos monoclonales por formación de inmunocomplejos
y patologías asociadas a hipersensibilidades de tipo III (enfermedad del suero, glomerulonefritis,
etc.).
Para evitar estos problemas se han intentado modificar estos anticuerpos murinos. Por un lado
tenemos los anticuerpos quiméricos que presentan la parte variable de origen murino, mientras
que la parte constante es humano (esto se realiza por técnicas de DNA recombinante). Por el
otro lado están los anticuerpos humanizados o remodelados en los que se insertan los
aminoácidos responsables del reconocimiento (solo unos pocos) en la secuencia de una
inmunoglobulina humana (es decir, se reemplazan los CDR originales).
Aunque parezca lógico seguir el esquema de arriba, realmente se trabaja con una genoteca de
fagos, y se clona en solo lo que nos interesa. Ahora se están creando anticuerpos monoclonales
humanos producidos directamente en ratones.
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A partir de aquí, veremos los pasos a seguir para humanizar anticuerpos. Básicamente consiste
en insertar las CDR que nos interesen entre las FR aceptoras que conforman la región variable
del anticuerpo. ¿Cómo se hace? “A lo burro”, PCR secuenciales en donde se va acumulando el
producto hasta conseguir la cadena completa que buscamos. Por este motivo es importante
tener en cuenta la fidelidad de la polimerasa. Por lo que se recomienda el uso de polimerasas
de alta fidelidad para evitar la introducción de mutaciones que alteren el producto.
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El proceso para determinar las sustituciones y cambios en las regiones FR (habrá que hacer para
mantener la estructura), y en su caso a veces dentro de las regiones CDR se realiza siguiendo un
proceso de modelización y requiere técnicas de bioinformática. Posteriormente las predicciones
y sustituciones realizadas se ensayarán experimentalmente (BIACORE, ahora lo veremos) para
comprobar la mejora o pérdida de la afinidad del anticuerpo respecto al antígeno.
Hay que tener en cuenta que cristalizar un anticuerpo es relativamente fácil puesto que están
muy estandarizados, y se obtiene modelos en cristal de la construcción y se pueden observar los
ajustes en su conformación “real” después de las simulaciones.
Para determinar la eficacia de un anticuerpo rediseñado se pueden hacer varias pruebas, ya sea
por ELISA o por su efecto práctico directo. Esto da datos orientativos, pero sí de verdad
queremos obtener datos fiables y precisos tendremos que pasar a hacer BIACORE. Lo malo de
estos además, es que necesitan mucho tiempo de realización, requieren una purificación del
anticuerpo, etc.
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Para mayor rapidez, y precisión utilizamos la técnica BIACORE que toma medidas de manera
óptima de la interacción entre un ligando y un receptor. Se utiliza un microcapilar con una base
de oro e incide un láser sobre la base de oro que es tan fina que es trasparente. Este haz es
reflejado y refractado. Cuando solo hay tampón en el capilar se tiene una señal base. Se
introduce en el tubo un analito y se engancha a la superficie de oro y se ajusta la señal para que
se mantenga baja. Entonces se hace pasar el anticuerpo, si se une se generará una variación de
la resonancia de la superficie del plasmón y por tanto el grado de apertura de incidencia varía,
lo que genera una subida considerable de señal. Puede acabar saturándose (final de la subida).
Para desenganchar se utiliza una solución de elevada fuerza iónica (con cloruro sódico) y la señal
baja porque está lleno de sales, luego se limpia con tampón y queda la señal base. Esto dura
fracciones de minutos. La altura y la curvatura (disociación) es lo que nos da la intensidad de la
unión del antígeno al anticuerpo (en este caso), aunque podría ser interacción entre dos
moléculas cualesquiera: proteína-proteína, DNA-proteína, DNA-DNA, etc.
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Aquí se utilizan ratones transgénicos que producen inmunoglobulinas humanas. No hay reacción
contra la parte de ratón (pues no la hay). Se están aprobando para su utilización en clínica (hay
una tabla en el power). En este caso se centra mucho en cáncer, y es bastante prometedor en
general.
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5. Manipulación de anticuerpos
El mismo dominio se puede encontrar de múltiples maneras. Se juega mucho con el fragmento
scFv, y se coloca de mil maneras como vemos en la imagen de abajo (jugando con dímeros y
monómeros).
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No solo se pueden unir entre sí, sino que se pueden unir con una gran variedad de estructuras
para obtener dímeros, trímeros y tetrámeros. Por ejemplo una cremallera de leucina o dominios
alfa hélix-loop-alfa hélix pueden generar dímeros. Para obtener tetrámeros se puede usar
también cremalleras de leucina o dominios de unión de p53 (que en la naturaleza es un
tetrámero).
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*De CAR no ha explicado nada porque tenemos el seminario entero. Por si acaso leeros las
diapositivas del power para el parcial por si entra algo (no las pongo porque no ha dicho nada).
Aproximaciones biotecnológicas
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Los anticuerpos son generalmente iguales en secuencia, pero existen fuertes variaciones como
por ejemplo las modificaciones de glucosilación que sufren en su dominio constante. Estas
modificaciones son las que permiten que la vida media de los anticuerpos sea alta y facilitan y
estabilizan la interacción entre las dos cadenas pesadas. Se ve que depende del estado del
hibridoma puede haber variaciones dentro del mismo anticuerpo (no son células estables). Por
este motivo es importante reducirlas todo lo posible (dejando lo esencial o lo que nos interese)
para reducir problemas en las glucosilaciones. También puede haber pequeñas modificaciones
de este tipo en la región variable.
También podemos jugar con los puentes disulfuro para dar más movilidad a la molécula
(flexibilidad), con la longitud del cuello, etc.
En cierto modo también se pueden modificar el número de cargas que reconocen las partes
constantes, por ejemplo aumentar la activación del complemento, aumentar la respuesta ADCC,
promover propiedades antiinflamatorias, etc. Se pueden conjugar con radionucleos, fármacos
quimioterapéuticos, toxinas, etc, dejando al anticuerpo como mero vehículo para dirigir la
terapia. Esta conjugación se suele realizar por enlace químico (reacciones ácidos frente a
residuos de Gly), esto es típico de la cola (Fc), aunque hay que vigilar donde ocurre.
*No ha explicado toda la imagen en clase pero yo que vosotros me la leería.
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Se están estudiando también anticuerpos de otros animales para abrir más posibilidades en
cuanto a conformación se refiere (camello, tiburón, etc.).
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Aquí, en la imagen de arriba se ha conjugado con auristatina que actúa como antiinflamatorio
(creo). Hay más ejemplos, pero no hay que aprender, solo que hay muchas posibilidades (tabla).
Por ejemplo conjugación de anticuerpos con “fármacos” (anticuerpos terapéuticos), se puede
hacer con alguno muy específico pero que sean funcionales, por ejemplo, tan solo en el interior
celular. La gran mayoría por ahora son antitumorales. Por ejemplo la conjugación se genera con
un enlace sensible a pH ácido, de manera que cuando se internaliza por el endosoma (medio
acidificado), y se libera en el interior celular donde actúa.
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6. Obtención de anticuerpos
En procariotas no se puede obtener en un principio, pero sí que se utilizan para hacer dominios
de inmunoglobulinas que no necesiten extensas modificaciones post-traduccionales (ni muy
importantes), como por ejemplo los scFv.
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El proceso de producción tiene muchísimos procesos como los que vemos en el esquema
siguiente.
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7. Aplicaciones
Como vemos, las aplicaciones principales son cáncer, autoinmunidad e inflamación (ver tabla).
Esta tecnología pese a conocerse hace más de 30 años, pero se ha comenzado a darle impulso
comercial ahora, pues hasta hace pocos años no era posible, o no se había conseguido. Mirar la
última gráfica que mira el aumento brutal en terapia de los anticuerpos humanos generados en
ratones transgénicos, frente a los utilizados antes.
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Un tumor está plagado de células T reguladoras que generan un ambiente “regulador” en torno
al tumor, donde puede activarse el complemento, pero debido a las T reguladoras existe un
“escudo” que mantiene el resto del sistema inmune alejado y reprimido gracias a citoquinas y/o
quimiocinas. Por ejemplo así, la utilización de un anticuerpo contra CD25 (contra células T
reguladoras) permite eliminar estas células por ADCC y otros mecanismos para facilitar que
nuestro sistema inmune ataque al tumor. En la imagen de abajo vemos un esquema-resumen
de lo explicado aquí.
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Se han construido muchos tipos de anticuerpos para bloquear esta moléculas (TNF). Tenemos
desde quiméricos (infiliximab), a humanos, y la utilización de scFv PEGilados (la adición de PEG
aumenta la vida media en sangre del anticuerpo). También se ha clonado el receptor del TNF en
un fragmento Fc para tenerlo directamente. Todos se utilizan, pero para usos muy concretos
cada uno, no para todas las enfermedades cualquiera, sino que su eficiencia es mejor o peor en
función de la patología.
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Se han intentado utilizar anticuerpos como enzimas, y aunque parezca una chorrada irrealizable,
ha funcionado. Se fabrican siguiendo el siguiente esquema utilizando moldes de anticuerpos.
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Aquí, tenemos el esquema que demuestra su actividad. Una enzima tiene como función bajar la
energía de activación para una reacción específica. Efectivamente, estos anticuerpos-enzimas
son capaces de realizar esto con bastante eficacia.
Finalmente, están las plantas que producen anticuerpos, los “plantibodies”. No ha dicho gran
cosa sobre esto. “Plants produce Assembled Antibodies”. Como vemos abajo, los efectos son
muy similares a un anticuerpo de mamífero.
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Tardamos entre 2 y 3 años después de la infección en generar estos bNAbs y cuando aparecen,
las personas dominan la infección con elevada garantía (solo el 20% de las personas son
capaces). Es muy interesante a nivel vacunal ya que si conseguimos los péptidos específicos para
generar un estímulo que vaya directamente a estimular esta respuesta, la efectividad de la
vacuna será inmensa. Tendremos por lo tanto una vacuna preventiva y hasta una vacuna
terapéutica, las personas que ya tengan la infección se podrán curar.
Por ejemplo, se analizaron 1800 sueros de personas infectadas con HIV-1 (Tailandia, Australia,
UK, USA, Países subsaharianos) y se generaron 30000 clones de linfocitos B productores bNAbs
capaces de unirse a: gp120 (JR-CSF), a gp41 (Complejo trimérico, Env, HxB2) y de neutralizar a
los virus JR-CSF y SF162.
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En la imagen tenemos diferentes tipos de HIV enfrentados a diferentes clones de células B. Los
más en rojo tienen más capacidad de infección, y éstos son los bNAbs.
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Cuando la gp120 contacta con el CD4, la gp41 lanza unos garfios hidrofóbicos contra la mbna de
la célula que se tiene que infectar y hay fusión de membranas del virus con la célula.
Hay que tener en cuenta que la glicoproteína gp120 está llena de glicosilaciones y por tanto es
difícil generar Ab con elevada eficiencia contra esta proteína, es una estrategia del HIV-1.
Como que no se puede coger al ser humano como modelo, se humanizan ratones. Para ello se
cogen ratones NRG, también llamados NOD-Rag1null IL2rynull double mutant mice or
NOD.Rag1KO.IL2RycKO mice, ya que son ratones NOD con un KO para Rag en el cromosoma 2
(no producen ni linfocitos B ni T) y tampoco producen IL2 (mutación en cromosoma X) - inútiles
Estos ratones se utilizan para estudios de trasplante celular y tisular, en particular como modelo
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Lo que se hace es coger hígado fetal humano, se purifican las HSC y se inyectan a razón de 1,5-
2x105 (son poquitas) en un ratón de 1-5 días que 6h antes se ha tratado con mieloablativos
(quimioterapia). En unas 8 semanas tendremos un ratón humanizado, expresa el sistema
inmunitario completo. Cuando infectemos con HIV responderá como si fuese una persona.
Como podemos ver en la progresión de la infección por el HIV, hay un aumento de copias del
virus, hay una bajada de T CD4 (primeros linfocitos que mueren) y el virus muta con la misma
frecuencia que lo hace en humanos. Por lo tanto vemos que es un muy buen modelo
experimental pero es muy caro.
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En los quesitos tenemos las mutaciones de la gp120 de los diferentes animales tratados con cada
Ab monoclonal dependiendo del epítopo.
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Con un Ab no hay suficiente para parar la infección, pero se ha visto que si se combinan los Ab,
hay ratones que son capaces de dominar completamente la infección, se curan. Esto es porque
con 5 Ab a la vez se hace una presión selectiva tan grande que aunque el HIV tenga mutaciones,
el virus no lo podrá superar y el ratón ganará. En el estudio todos los ratones (menos 2 que
murieron por GVHD) bajaron el número de copias del HIV por debajo del basal.
Hay que tener en cuenta que las mutaciones en a gp120 que aparecen en los animales tras el
tratamiento quíntuple NO son las mismas que las de los animales que sucumben y TAMPOCO
son coincidentes.
En este estudio se hace una segunda infección con HIV después de una terapia con anticuerpos
(ID21 es una mezcla de 3 bNAbs (tri-mix) y ID129 es un penta-mix).
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Lo bNAbs presentan mayor tasa de mutación en los FWR que en los CDR (ver números derecha).
Los dos Ab son altamente neutralizantes del HIV-1, mientras los de abajo tienen una
neutralización limitada. Podemos observar la diferencia en el número de mutaciones. Si
revertimos tanto los CDR como los FWR, perdemos la neutralización; si revertimos los FWR de
los Abs poco neutralizantes, no varía en exceso la neutralización.
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El HIV tiene 3 sistemas de infección que por mucho Ab que tengamos, no lo podemos parar. Son
infecciones sinápticas célula-célula (diana y donante) y el virus entra en contacto en ese mismo
momento. En el caso de las DC, éstas no integran al virus en su genoma pero sí son portadoras
(DC-SIGN marca actina). El tercer caso es la sinapsis virológica combinada con células mieloides.
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