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    PROTEÒMICA

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    Este documento describe la proteómica y sus tres ramas principales: la proteómica de expresión, la proteómica estructural y la proteómica funcional. Explica que la proteómica permite identificar, categorizar y clasificar proteínas, así como identificar marcadores de diagnóstico y nuevos fármacos. Además, detalla algunas técnicas clave de proteómica como la electroforesis bidimensional, la espectrometría de masas y los sistemas "yeast two hybrids" para estudiar interacciones entre prote

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    Este documento describe la proteómica y sus tres ramas principales: la proteómica de expresión, la proteómica estructural y la proteómica funcional. Explica que la proteómica permite identificar, categorizar y clasificar proteínas, así como identificar marcadores de diagnóstico y nuevos fármacos. Además, detalla algunas técnicas clave de proteómica como la electroforesis bidimensional, la espectrometría de masas y los sistemas "yeast two hybrids" para estudiar interacciones entre prote

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    PROTEMICA

    ALUMMNOS:
    ESPINOZA BALDEN JOSELYN
    CASTRO CAPISTRN KATHERINE

    INTRODUCCIN
    PROTEOMA:
    ES EL CONJUNTO COMPLEMENTO DE PROTENAS EXPRESADAS POR UN
    GENOMA, CLULA U ORGANISMO. ES EL CONJUNTO DE PROTINAS
    EXPRESADAS EN UN TIEMPO DADO, BAJO CONDICIONES DADAS.

    PROTEMICA:

    Existen tres ramas en la


    protemica que tratan de caracterizar el proteoma
    estudiando distintos aspectos del mismo:
    La protemica de expresin se encarga del estudio de la
    abundancia relativa de las protenas y de sus modificaciones
    postranscripcionales.
    La protemica estructural se encarga de la caracterizacin de la
    estructura tridimensional de las protenas
    La protemica funcional se encarga de la localizacin y
    distribucin subcelular de protenas y de las interacciones que
    se producen entre las protenas y otras molculas con el fin de
    determinar su funcin

    USOS

    Permite identificar , categorizar y clasificar las protenas con respecto a


    su funcin y las interacciones que establecen entre ellas

    Identificacin de nuevos marcadores para el diagnstico de las


    enfermedades.

    Identificacin de nuevos frmacos.

    Determinacin de mecanismos moleculares involucrado en la patogenia


    de las enfermedades.

    Anlisis de rutas de transduccin de seales.

    TCNICAS DE PROTEMICA

    Tcnicas empleadas para analizar


    globalmente el proteoma y separar sus
    protenas.

    ELECTROFORESIS BIDIMENSIONAL:

    -DIGE (Difference In Gel Electrophoresis: electroforesis diferencial en gel)


    -ICAT (Isotope-Coded Affinity Tags: marcaje isotpico diferencial)
    -MudPIT(Multidimensional Protein Identification Technology: tecnologa de
    identificacin de protenas multidimensional)

    Tcnicas usadas para analizar


    individualmente las protenas.

    TIPOS DE ESPECTROMETRA DE MASAS

    - MALDI-TOF (Matrix-assisted laser desorption/ionization Time Of Flight:


    desorcin/ionizacin mediante lser asistida por matriz en tiempo de
    vuelo)

    SELDI-TOF-MS (Surface Enhanced Laser Desorpcion Ionization Time Of


    Flight Mass Spectrometry: espectrometra de masas en "Tiempo de
    Vuelo" mediante desorcin/ionizacin por lser de superficie)

    MS/MS (Mass Spectrometry/ Mass Spectrometry: espectrometra de


    masas en tndem).
    Actualmente hay numerosas bases de datos que recogen las
    huellas peptdicas de multitud de protenas conocidas. Estas
    bases de datos se pueden rastrear usando programas
    bioinformticos para buscar la huella peptdica que
    corresponda con la huella peptdica de la protena que se est
    estudiando y por tanto poder identificarla.

    Tcnicas que se usan para


    estudiar interacciones entre
    proteinas
    los sistemas yeast two hybrids de alto rendimiento

    La tcnica Phage Display permite averiguar con qu protenas


    interacciona una protena problema o sonda.

    Esta tcnica consiste en la expresin en la superficie de un fago


    de las protenas que se quieren analizar. La protena problema o
    sonda se inmoviliza sobre un soporte o membrana de tal modo
    que los fagos que expresan las protenas que se unen a la sonda
    quedan inmovilizados sobre el soporte. Estos fagos se pueden
    recuperar fcilmente de la membrana y pueden ser empleados
    para la expresin de la protena en Escherichia coli y su posterior
    identificacin.

    El anlisis y la interpretacin de los datos obtenidos


    con las tcnicas de protemica descritas
    anteriormente, especialmente cuanto se utilizan a
    gran escala, necesita herramientas bioinformticas.
    Durante los ltimos aos la genmica, la protemica y
    la bioinformtica se han desarrollado de forma
    sinrgica experimentando un desarrollo sorprendente
    que est aportando grandes avances a la medicina

    GRACIAS

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