Coronavirus
Coronavirus
Coronavirus
Orthocoronavirinae
Plus récemment ont été identifiés trois types de coronavirus responsables de graves pneumopathies :
1. le SARS-CoV, agent pathogène du syndrome respiratoire
aigu sévère (SRAS) en 2002-2004
2. le MERS-CoV, celui du syndrome respiratoire du Moyen-
Orient à partir de 2012
3. le SARS-CoV-2, celui de la maladie à coronavirus 2019
(Covid-19) apparue en Chine en 2019 et responsable
d'une sévère pandémie en 2020-2021
Sommaire
Découverte, histoire SARS-CoV-2 3D virion
Épidémie du XXIe siècle
Pandémie de Coronavirus
Données de la pandémie de Sars-CoV-2 (2019-
2021)
Caractérisation
Dénomination
Hôtes du virus
Tropisme
Recherches
Biologie
Morphologie
Génome
Réplication
Infection à coronavirus
Types d'infection
Infections bénignes
Infections graves
Comparaison des infections graves
Passage de la barrière des espèces
Transmission interhumaine
Traitement
Vaccins
Taxonomie
Nommage des coronavirus
Classification
Liste des espèces
Notes
Références
Voir aussi
Bibliographie
Infographie
Articles connexes
t c es co e es
Liens externes
Découverte, histoire
Les coronavirus existent probablement depuis au moins des centaines
de millions d'années, mais du point de vue de l'épidémiologie et de
l'histoire médicale et en tant que zoonose c'est au XXIe siècle qu'ils ont
pris de l'importance : « cinq des sept coronavirus humains ont été
isolés au cours de ce siècle. Et malheureusement, les trois derniers
sont entrés dans notre vie avec les craintes liées à une épidémie, une
9
pandémie ou à la mort » .
e
Épidémie du XXI siècle
Pandémie de Coronavirus
Le dernier coronavirus humain (ou récemment humanisé, très probablement à partir d'une ou plusieurs souches
portées par des chauves-souris) semble avoir émergé à Wuhan en Chine en 2019 : le SARS-CoV-2. La
maladie qu'il cause (Covid-19) a provoqué en quelques mois la première grande pandémie à coronavirus,
caractérisée par un R0 élevé (2,3 en moyenne d'après les estimations disponibles en avril 2020, mais qui
semble pouvoir atteindre 5,7) ; avec un taux de létalité de 6,3 (très variable selon les âges et les contextes,
9
pouvant parfois dépasser 15%) .
Pandémie de Coronavirus
Sous-type
Pandémie Date Cas confirmés Décès Guérisons
impliqué
Épidémie de SRAS de 2002- 2002- Sars-Cov
8 096 774 -
2004 2004 (SRAS)
Coronavirus du syndrome 2012-
361 107 - MERS-CoV
respiratoire du Moyen-Orient 2014
+ 106 903 452 + 59 755 076 SARS-CoV-
Pandémie de Covid-19 (En 2019- + 2 341 010
Pandémie de Covid-19 (En 2019- + 2 341 010
(10 février 13 (10 février 2 (Covid-
cours) 2021 13 (10 février 2021) 13
2021) 2021) 19)
Brésil 12 984 956 331 530 11 357 521 2,55 % 1 578 16, 17
Afrique du Sud 1 551 964 52 987 1 477 363 3,41 % 889 38, 39
55
Pakistan 692 231 14 821 615 960 2,14 % 68 55
Émirats arabes unis 472 148 1 512 456 747 0,32 % 161 66
Costa Rica 216 764 2 957 192 699 1,36 % 603 97, 98
Macédoine du Nord 134 867 3 940 109 297 2,92 % 1 899 115
Macao 48 0 46 0% 0 263
Vanuatu 3 0 1 0% 0 275
Caractérisation
La taxonomie de ces nouveaux virus fait d'abord débat, pour finalement aboutir en 1975 à la création d'une
nouvelle famille (Coronaviridae) et d'une nouvelle sous-famille (Orthocoronavirinae) par l'International
10
Committee on Taxonomy of Viruses .
Dénomination
277
Le terme coronavirus (du latin corona et virus, littéralement « virus à couronne » ) provient de l'apparence
des virions au microscope électronique, caractérisée par une frange de grandes protubérances entourant
2
l'enveloppe avec l'apparence d'une couronne, par analogie avec la couronne solaire .
Hôtes du virus
Les hôtes idéaux des coronavirus, en tant que vertébrés volants à sang chaud, sont les chauves-souris (pour les
Alphacoronavirus et les Betacoronavirus) et les oiseaux (pour les Gammacoronavirus et les
5
Deltacoronavirus). Ces espèces-réservoir assurent l'évolution et la dissémination des coronavirus . Chez
d'autres espèces, les symptômes varient (maladies des voies respiratoires supérieures chez la poule, diarrhée
chez la vache ou le porc, des voies digestives chez le chat et le chien, etc.). Parfois, aucun symptôme n'est
associé à leur présence (ex. coronavirus du béluga).
L'être humain abrite naturellement quatre types de coronavirus bénins, qui provoquent des infections des voies
respiratoires, comme le rhume, et plus rarement affectent les systèmes gastro-intestinaux, cardiaques et
278
nerveux
nerveux .
279
Les groupes de coronavirus ont normalement un hôte animal spécifique (mammifères ou oiseaux ) mais ils
peuvent parfois changer d'hôte à la suite d'une mutation. Ce sont de telles mutations qui ont probablement
conduit à l'apparition de souches causant de graves infections chez l'homme (SRAS, MERS et Covid-19).
Tropisme
On a longtemps pensé que les coronavirus avaient un tropisme uniquement respiratoire ou gastrointestinal
(traduit par des pneumonies et entérocolites dans les cas graves), mais un nombre croissant d'études montrent
un tropisme bien plus large, cardiovasculaire notamment, et neurologique également (dès les années 1980, on a
montré que plusieurs coronavirus, dont en dernier cas le SARS-CoV-2 sont clairement aussi neuroinvasifs et
280, 281, 282
neurotropes , au point que cette diversité de tropismes et de symptômes font des coronavirus
(murins notamment, regroupées sous le sigle de MHV) un modèle animal pour l'étude de maladies humaines
aussi variées que la sclérose en plaques, l’hépatite virale ou la pneumonie (S. R. Weiss et al. 2011). Le MHV
pénètre le Système nerveux central (SNC) via les neurones du nerf olfactif, et peut causer une encéphalite
aiguë ou une maladie démyélinisante chronique s'il y persiste (il peut aussi se propager jusqu’à la moelle
281, 283
épinière) .
Recherches
En 2002, l’apparition du Sars-CoV, un virus responsable d'une maladie infectieuse des poumons, pousse
l’Union européenne à lancer plusieurs programmes afin de ne pas être prise au dépourvu en cas de nouvelles
émergences. Dès 2004, l’équipe de Bruno Canard, directeur de recherche CNRS à Aix-Marseille, spécialiste
des coronavirus, grâce aux réseaux collaboratifs européens, affiche des résultats prometteurs. « Nous avions eu
cette idée qui s’est révélée fructueuse : les virus ont une capacité énorme à être différents, variés, avec de larges
familles. Nous les avons donc étudiés tous en même temps, afin d’en avoir un modèle type qui nous
permettrait, en cas de menace d’un virus inconnu, d’en trouver un proche, d’où nous pourrions extraire des
284
données scientifiques. ».
Mais dès 2006, l’intérêt des politiques pour le Sars-CoV disparait. La crise financière de 2008 accélère le
désengagement de l’Europe et de la France pour la recherche, les stratégies de recherche fondamentale perdent
leurs financements. Aussi, en 2015, Bruno Canard, dénonce le désengagement européen et français dans le
secteur des sciences et adresse avec ses collègues belges et hollandais des lettres d’intention à la Commission
européenne, où il explique qu’il existe neuf familles de virus pour lesquelles une émergence est possible. « Le
premier sur la liste était le flavivirus, explique-t-il. Le second, le coronavirus. Un an plus tard, apparaissait
Zika, un flavivirus ». Or La Commission européenne ne donnera jamais de réponse. Et en 2020 surgit le Sars-
284
CoV-2, un coronavirus engendrant la Covid-19.
Biologie
Morphologie
Ce virus enveloppé est constitué d'une enveloppe virale entourant une capside hélicoïdale qui contient le brin
d'ARN. La taille du génome de ces virus varie d'environ 26 à 32 kilobases, valeurs parmi les plus élevées chez
les virus à ARN.
Les coronavirus ont en commun des protéines désignées par une lettre indiquant leur localisation : S
(protubérances), E (enveloppe), M (membrane) et N (nucléocapside). Certains, notamment ceux du sous-
d é (hé l é ) é
groupe A du genre Betacoronavirus, ont une protéine HE (hémagglutinine estérase (en)) caractéristique. Le
Réplication
1. grâce à leur protéine S, les coronavirus se lient aux molécules cellulaires de surface telles que
les métalloprotéinases. Les virus dotés en plus de la protéine HE (hémagglutinine-estérase)
dans leur enveloppe peuvent aussi se lier à l'acide N-acétylneuraminique qui sert de
corécepteur (lui-même initiateur de l'entrée d'un pathogène dans une cellule hôte). On ne sait
pas clairement si les virus entrent dans la cellule hôte par fusion des membranes virales et
cellulaires, ou par une internalisation à récepteur. Quel qu’en soit le mécanisme, le brin d'ARN
est inséré dans la cellule, et la capside (la coque) est abandonnée ;
2. les coronavirus sont munis d'un seul génome ARN à brin positif, à présent sur place dans le
cytoplasme. Le génome de l'ARN du coronavirus a une coiffe méthylée 5' et une queue
polyadénylée 3', ce qui permet à l'ARN de se fixer aux ribosomes pour la traduction. Les
ribosomes de la cellule décodent l'ARN viral, produisant les protéines qui y sont codées ;
3. d'abord l'ARN positif du virus est transcrit en protéine pour former une ARN polymérase propre
(une ARN polymérase ARN-dépendante). La réplicase est la première protéine fabriquée ; une
fois le gène codant la réplicase traduit par le ribosome de la cellule hôte, la traduction est
arrêtée par un codon stop. Cette réplicase virale ne reconnaît et produit que l'ARN viral, et
permet au génome viral d'être transcrit en nouvelles copies d'ARN, à l'aide de la machinerie de
la cellule hôte. Se servant du brin positif comme modèle, cet enzyme assemble le brin négatif ;
4. par la suite, ce brin
négatif sert lui-même
de modèle pour
transcrire de petits
ARN sous-
génomiques, qui sont
utilisés pour fabriquer
toutes les autres
protéines. C'est ce
qu'on appelle une
transcription
imbriquée. Ce
processus est une
forme d'économie
génétique, permettant
au virus de coder le
plus grand nombre de
gènes dans un petit
nombre de
nucléotides ;
le génome du brin
négatif est traduit par
le ribosome de la
cellule hôte, et une
longue polyprotéine
est formée, où toutes
les protéines virales
sont attachées. Les
coronavirus ont une
protéine non
structurale — une
protéase — qui est
capable de cliver la
Réplication du virus à couronne.
polyprotéine.
Par ailleurs, ce brin
négatif joue un rôle
dans la réplication de nouveaux génomes ARN à brin positif.
Le cytoplasme de la cellule hôte se remplit de protéines et d'ARN viraux ;
5. (a) la protéine N aide à lier l'ARN génomique pour réaliser l’encapsidation du génome virale
292
dans une enveloppe protectrice nommée capside ; la protéine M s'intègre à la membrane du
réticulum endoplasmique, côté capside ; et des protéines HE et S traversent la membrane du
réticulum endoplasmique, via la protéine de translocation, et se positionnent du côté opposé ;
(b) avec la liaison entre la capside et les protéines M, la membrane du réticulum s'invagine, et
bourgeonne. La capside (la coque) assemblée dotée d'ARN hélicoïdal se retrouve alors à
l'intérieur du réticulum endoplasmique, ayant capturé à son profit la membrane de ce dernier,
qui porte à présent à son extérieur les protéines HE et S ;
6. cette progéniture virale est ensuite (a) encapsulée et transportée par des vésicules golgiennes
vers la membrane cellulaire, (b) pour être enfin externalisée (par exocytose) hors de la cellule.
Infection à coronavirus
Types d'infection
293
Sept types de coronavirus infectent couramment l'homme , dont trois causent des infections graves.
Infections bénignes
Les quatre premiers types connus sont sans gravité : les coronavirus humains 229E, NL63, OC43 et HKU1,
inconnus chez la chauve-souris. Ils causent des rhumes avec fièvre et des maux de gorge dus à des végétations
294
adénoïdes gonflées, principalement en hiver et au début du printemps .
295
Les coronavirus seraient la cause de 15 à 30 % des rhumes courants .
Infections graves
Selon le virus en cause, les formes graves de la maladie ont leurs particularités. Par exemple, la diarrhée était
très fréquente dans le SRAS mais rare dans la maladie à coronavirus 2019.
Transmission interhumaine
Pour la pandémie de 2019-2020, se reporter aux articles dont les noms suivent.
ne pas entrer en contact avec des animaux manifestement malades, ne pas consommer de
viandes provenant d'animaux malades ;
ne pas consommer de produits animaux (viande...) mal cuits, ni de légumes crus s'ils n'ont
pas été lavés avec de l'eau non contaminée.
Traitement
Dans le cas du SRAS, des médicaments ont été utilisés pour tenter d'enrayer l'épidémie : la ribavirine, un
analogue de nucléotides, des anti-inflammatoires stéroïdiens et, après identification formelle de l'agent
pathogène et des criblages de sensibilité, l'interféron-alpha et des inhibiteurs de protéases. Leur efficacité est
encore sujette à caution. Aucun n'a fait l'objet d'une étude clinique adéquate : beaucoup d'études disponibles
ne permettent pas de conclusions scientifiques claires car elles ont été réalisées sur de petits nombres de sujets
ou alors sans protocole ou dose fixe. Certaines indiquent même que ces traitements pourraient avoir nui à
318
l'éradication du virus .
Bruno Canard dénonce en mars 2020 l'emballement et publie une lettre ouverte Coronavirus : la science ne
319
marche pas dans l’urgence ! . Il déclare : « Un vaccin demande au mieux 18 mois de recherches. Et pour
des virus non prévisibles, qui changent, il n’est pas adapté. Mieux vaut faire des médicaments qui ont un large
spectre dans une famille virale. Cela peut nécessiter 5 ans, parfois 10. D’où l’importance de l’anticipation
284
scientifique . ».
Vaccins
L'éradication rapide de l'épidémie de SRAS précédente n'a pas laissé place à beaucoup d'essais cliniques. Des
vaccins à base de virus inactivé, et d'autres fondés sur les protéines S et N, sont à l'étude depuis plusieurs
320
années . Pour les vaccins, les éléments viraux produisant l'immunité ne sont souvent pas assez conservés
dans la même famille virale. "Ainsi, s'il y avait eu un vaccin contre le coronavirus de 2003, il est pratiquement
321
certain qu'il n'aurait pas marché de manière satisfaisante contre le Covid-19" (Bruno Canard) .
Taxonomie
Classification
Les coronavirus (CoV) sont des virus à ARN monocaténaire de sens positif (groupe IV de la classification
1
Baltimore) correspondant à la sous-famille Orthocoronavirinae de la taxonomie de l'ICTV , dans la famille
324, 325
Coronaviridae, et de l'ordre Nidovirales .
Selon les caractéristiques de leurs séquences protéiques, les CoV sont classés en 4 genres (alpha-CoV, beta-
4
CoV, gamma-CoV et delta-CoV), qui tous contiennent des virus pathogènes pour les mammifères :
1. Alphacoronavirus, qui inclut le virus de la diarrhée
épidémique porcine (PEDv), le virus de la gastro-entérite
transmissible porcine (TGEV), le coronavirus du syndrome
de la diarrhée aiguë porcine (SADS-CoV), le coronavirus
canin, le coronavirus entérique félin, le virus de la
péritonite infectieuse féline (FIPV) ;
2. Betacoronavirus, dont le virus respiratoire-respiratoire du
SRAS (SARS-CoV), le SARS-CoV-2, le coronavirus du
syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS-CoV), virus
de l'hépatite murine (MHV), coronavirus bovins, virus de la
sialodacryoadénite du rat, virus de la sialodacryoadénite Arbre phylogénétique des
porcine, hémagglutinose porcine, virus de coronavirus
l'hémagglutinose porcine coronavirus équin. Dans ce
genre Betacoronavirus, le SARS-CoV et le SARS-CoV-2
appartiennent tous les deux au sous-genre Sarbecovirus au sein duquel trois clades distincts
ont été identifiés :
326
- Clade1: souches "chauve-souris" de Bulgarie et Kenya ;
326
- Clade2: SARS-CoV-2 et souches "chauve-souris" de Chine orientale ;
326
- Clade3: SARS-CoV et souches "chauves-souris" de Chine du sud-ouest :
3. Gammacoronavirus: surtout trouvé chez des oiseaux migrateurs, causant notamment des
bronchites ; un Gammacoronavirus a été isolé d'un béluga en captivité,
4. Deltacoronavirus: connus depuis peu, qui semblent surtout infecter les oiseaux, mais aussi
trouvé chez les porcs.
Remarques :
On a parfois nommé un coronavirus selon l'espèce animale où il a d'abord été trouvé (par
exemple : coronavirus respiratoire canin, ou CRCoV pour Canine respiratory coronavirus,
327, 328
virus appartenant au genre betacoronavirus et à son sous-groupe 2a) .
Le dernier coronavirus trouvé, en 2019, est le SARS-CoV-2, responsable de la pandémie de
Covid-19.
Sous-famille Orthocoronavirinae
Genre Alphacoronavirus
Sous-genre Colacovirus
Bat coronavirus CDPHE15
Sous-genre Decacovirus
Bat coronavirus HKU10
Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013
Sous-genre Duvinacovirus
Human coronavirus 229E (HCoV-229E)
Sous-genre Luchacovirus
Lucheng Rn rat coronavirus
Sous-genre Minacovirus
Ferret coronavirus
Mink coronavirus 1
Mink coronavirus 1
Sous-genre Minunacovirus
Miniopterus bat coronavirus 1
Miniopterus bat coronavirus HKU8
Sous-genre Myotacovirus
Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011
Nyctacovirus
Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013
Sous-genre Pedacovirus
Porcine epidemic diarrhea virus
Scotophilus bat coronavirus 512
Sous-genre Rhinacovirus
Rhinolophus bat coronavirus HKU2
SADS-CoV (Coronavirus du syndrome de la diarrhée aiguë porcine)
Sous-genre Setracovirus
Human coronavirus NL63 (HCoV-NL63)
NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b
Sous-genre Tegacovirus
Alphacoronavirus 1
Coronavirus de la gastro-entérite transmissible porcine (TGEV, porc)
Coronavirus canin
Coronavirus félin
Genre Betacoronavirus
Sous-genre Embecovirus
Betacoronavirus 1
HCoV-OC43
Bovine coronavirus
Canine respiratory coronavirus
Coronavirus HKU23
Equine coronavirus
Porcine hemagglutinating encephalomyelitis virus
Yak coronavirus
China Rattus coronavirus HKU24
Human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1)
Murine coronavirus
Myodes coronavirus 2JL14
Sous-genre Hibecovirus
Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013
Sous-genre Merbecovirus
Hedgehog coronavirus 1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Pipistrellus bat coronavirus HKU5
Tylonycteris bat coronavirus HKU4
Sous-genre Nobecovirus
Rousettus bat coronavirus GCCDC1
Rousettus bat coronavirus HKU9
Sous-genre Sarbecovirus
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus (SARSr-CoV)
SARS-CoV (humain; SRAS)
SARSr-CoV WIV1 (chauve-souris)
SARSr-CoV HKU3 (chauve-souris)
SARSr-CoV RP3 (chauve-souris)
SARS-CoV-2 (humain; Covid-19)
Genre Gammacoronavirus
Sous-genre Cegacovirus
Beluga whale coronavirus SW1
g
Sous-genre Igacovirus
Avian infectious bronchitis coronavirus
Genre Deltacoronavirus
Sous-genre Andecovirus
Wigeon coronavirus HKU20
Sous-genre Buldecovirus
Bulbul coronavirus HKU11
Coronavirus HKU15
Munia coronavirus HKU13
White-eye coronavirus HKU16
Sous-genre Herdecovirus
Night heron coronavirus HKU19
Sous-genre Moordecovirus
Common moorhen coronavirus HKU21
Notes
1. Sont inclus les cas recensés à Porto Rico et aux îles Vierges des États-Unis.
2. Sont inclus les cas recensés en Guadeloupe, en Guyane, à La Réunion, en Martinique, à
Mayotte, en Nouvelle-Calédonie, en Polynésie française, à Saint-Barthélemy, à Saint-Martin et
à Saint-Pierre-et-Miquelon.
3. L'université Johns-Hopkins additionnant les cas confirmés et probables, les données de Santé
publique France sont utilisées pour la France (source (https://dashboard.covid19.data.gouv.fr/)).
4. Les chiffres ci-contre ne tiennent pas compte de la déclaration de la vice-première ministre en
charge de la santé, Tatiana Golikova qui indiquait le 28 décembre que la COVID-19 aurait fait
186 000 morts depuis le début de la pandémie. Voir « Moscou admet que le nombre de morts
du Covid-19 en Russie est trois fois supérieur au bilan officiel » (https://www.lemonde.fr/internat
ional/article/2020/12/29/pandemie-de-covid-19-la-russie-admet-un-bilan-largement-superieur_6
064739_3210.html), sur Le Monde, 29 décembre 2020
5. Sont inclus les cas recensés à Anguilla, aux Bermudes, à Gibraltar, aux îles Anglo-Normandes,
aux îles Caïmans, aux îles Turques-et-Caïques, aux îles Vierges britanniques, dans l'île de Man
et à Montserrat.
6. Sont inclus les cas recensés à Aruba, à Curaçao et à Saint-Martin.
7. Le total des décès enregistrés au 10 avril se répartissent comme suit: 57 % sont survenus en
milieu hospitalier, 40 % en maisons de soins et de repos (sans test de confirmation), 1 % au
domicile du patient et pour 2 %, l'information n'est pas disponible selon Sciensano.
8. Sont inclus les cas recensés au Groenland et dans les îles Féroé.
Références
1. (en) « Virus Taxonomy: 2018b Release » (https://talk.ictvonline.org/taxonomy/), ICTV,
juillet 2018 (consulté le 24 janvier 2020).
2. (en) « Virology: Coronaviruses », Nature, vol. 220, no 5168, novembre 1968, p. 650–650
(ISSN 0028-0836 (http://worldcat.org/issn/0028-0836&lang=fr) et 1476-4687 (http://worldcat.or
g/issn/1476-4687&lang=fr),
PMCID PMC7086490 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7086490),
DOI 10.1038/220650b0 (https://dx.doi.org/10.1038%2F220650b0), lire en ligne (http://www.nat
ure.com/articles/220650b0), consulté le 14 mai 2020)
3. (en) Zi-Wei Ye et Shuofeng Yuan, « Zoonotic origins of human coronaviruses » (http://www.ijb
s.com/v16p1686.htm), sur International Journal of Biological Sciences, 2020 (ISSN 1449-2288
(http://worldcat.org/issn/1449-2288&lang=fr),
PMID 32226286 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32226286),
PMCID PMC7098031 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7098031),
DOI 10.7150/ijbs.45472 (https://dx.doi.org/10.7150%2Fijbs.45472), consulté le 22 mai 2020),
p. 1686–1697
4. SARS-CoV, B.S (2020) Mutation and Recombination (https://cahss.ca/media/uploads/CEZD/d
ocuments/20-02-18_16-24/Infosheet_-_Coronaviruses_at_the_Human-Animal_Interface.pdf).
5. (en) Patrick C. Y. Woo, Susanna K. P. Lau, Carol S. F. Lam, Candy C. Y. Lau, Alan K. L. Tsang,
John H. N. Lau, Ru Bai, Jade L. L. Teng, Chris C. C. Tsang, Ming Wang, Bo-Jian Zheng, Kwok-
Hung Chan et Kwok-Yung Yuen, « Discovery of Seven Novel Mammalian and Avian
Coronaviruses in the Genus Deltacoronavirus Supports Bat Coronaviruses as the Gene
Source of Alphacoronavirus and Betacoronavirus and Avian Coronaviruses as the Gene
Source of Gammacoronavirus and Deltacoronavirus », Journal of Virology, vol. 86, no 7,
avril 2012, p. 3995-4008 (PMID 22278237 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22278237),
DOI 10.1128/JVI.06540-11 (https://dx.doi.org/10.1128%2FJVI.06540-11),
Bibcode 3302495 (https://ui.adsabs.harvard.edu/abs/3302495), lire en ligne (https://jvi.asm.org/
content/jvi/86/7/3995.full.pdf), consulté le 6 mars 2020)
6. « Coronaviruses 101: Focus on Molecular Virology » (https://www.youtube.com/watch?v=8_bO
hZd6ieM) (consulté le 2 avril 2020).
7. (en-US) « Coronavirus | Human Coronavirus Types | CDC » (https://www.cdc.gov/coronavirus/ty
pes.html), sur www.cdc.gov, 27 février 2020 (consulté le 15 avril 2020)
8. A. Z. Kapikian, « The coronaviruses », Developments in Biological Standardization, vol. 28,
1975, p. 42–64 (ISSN 0301-5149 (http://worldcat.org/issn/0301-5149&lang=fr),
PMID 1092577 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1092577), lire en ligne (https://www.ncb
i.nlm.nih.gov/pubmed/1092577), consulté le 15 avril 2020)
9. Cemal BULUT et Yasuyuki KATO, « Epidemiology of COVID-19 », TURKISH JOURNAL OF
MEDICAL SCIENCES, vol. 50, no SI-1, 21 avril 2020, p. 563–570 (ISSN 1303-6165 (http://worl
dcat.org/issn/1303-6165&lang=fr),
DOI 10.3906/sag-2004-172 (https://dx.doi.org/10.3906%2Fsag-2004-172), lire en ligne (http://jo
urnals.tubitak.gov.tr/medical/issues/sag-20-50-si-1/sag-50-si-1-12-2004-172.pdf), consulté le
25 avril 2020)
10. Marc Gozlan, « Il était une fois les coronavirus » (https://www.lemonde.fr/blog/realitesbiomedic
ales/2020/03/27/il-etait-une-fois-les-coronavirus%e2%80%a8/), sur
https://www.lemonde.fr/blog/realitesbiomedicales, Le Monde, mars 2020 (consulté le
4 avril 2020)
11. K McIntosh, W B Becker et R M Chanock, « Growth in suckling-mouse brain of "IBV-like"
viruses from patients with upper respiratory tract disease. », Proceedings of the National
Academy of Sciences of the United States of America, vol. 58, no 6, décembre 1967, p. 2268–
2273 (ISSN 0027-8424 (http://worldcat.org/issn/0027-8424&lang=fr),
PMID 4298953 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/4298953), lire en ligne (https://www.ncb
i.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC223830/), consulté le 15 avril 2020)
12. Steven Brocklehurst, « The woman who discovered the first coronavirus » (https://www.bbc.co
m/news/uk-scotland-52278716), sur https://www.bbc.com, British Broadcasting Corporation,
avril 2020 (consulté le 17 avril 2020)
13. (en) « COVID-19 Dashboard by the Center for Systems Science and Engineering (CSSE) at
Johns Hopkins University (JHU) » (https://gisanddata.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/ind
ex.html#/bda7594740fd40299423467b48e9ecf6), sur gisanddata.maps.arcgis.com (consulté le
14 juin 2020)
14. « COVID-19 Dashboard by the Center for Systems Science and Engineering (CSSE) at Johns
Hopkins University (JHU) » (https://gisanddata.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.htm
l#/bda7594740fd40299423467b48e9ecf6), sur ArcGIS, Johns Hopkins University (consulté le
5 avril 2021)
15. « COVID-19/Coronavirus Real Time Updates With Credible Sources in US and Canada » (http
s://coronavirus.1point3acres.com/en), sur 1point3acres (consulté le 4 avril 2021)
16. (pt) « Painel Coronavírus » (https://covid.saude.gov.br/), Ministry of Health (Brazil) (consulté le
4 avril 2021)
17. (pt-BR) « Brasil chega a 331,5 mil mortes por Covid e se aproxima de 13 milhões de casos » (h
ttps://g1.globo.com/bemestar/coronavirus/noticia/2021/04/04/brasil-chega-a-3315-mortes-por-c
ovid-e-se-aproxima-de-13-milhoes-de-casos.ghtml), G1, 4 avril 2021 (consulté le 4 avril 2021)
18. « COVID-19 India » (https://www.mohfw.gov.in/), Ministry of Health and Family Welfare (India)
2021
19. « info coronavirus covid-19 » (https://www.gouvernement.fr/info-coronavirus/carte-et-donnees),
Gouvernement.fr (consulté le 2 avril 2021)
20. « COVID-19 : bilan et chiffres clés en France » (https://www.santepubliquefrance.fr/dossiers/co
ronavirus-covid-19/coronavirus-chiffres-cles-et-evolution-de-la-covid-19-en-france-et-dans-le-
monde), www.santepubliquefrance.fr (consulté le 3 avril 2021)
21. (ru) « ru:Оперативные данные » (https://xn--80aesfpebagmfblc0a.xn--p1ai/), sur
Стопкоронавирус.рф (consulté le 5 avril 2021)
22. « Coronavirus (COVID-19) in the UK » (https://coronavirus.data.gov.uk/), sur
coronavirus.data.gov.uk (consulté le 3 avril 2021)
23. (it) « COVID-19 ITALIA » (https://opendathunadpc.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/inde
x.html#/b0c68bce2cce478eaac82fe38d4138b1), sur opendatadpc.maps.arcgis.com,
Protezione Civile (consulté le 3 avril 2021)
24. « Turkiye COVID-19 Hasta Tablosu » (https://covid19.saglik.gov.tr), sur covid19.saglik.gov.tr
(consulté le 3 avril 2021)
25. (es) « La pandemia del coronavirus, en datos, mapas y gráficos » (https://www.rtve.es/noticias/
coronavirus-graficos-mapas-datos-covid-19-espana-mundo/), sur RTVE (consulté le
2 avril 2021)
26. (de) « Corona-Karte Deutschland: COVID-19 live in allen Landkreisen und Bundesländern » (h
ttps://interaktiv.tagesspiegel.de/lab/karte-sars-cov-2-in-deutschland-landkreise/), sur
Tagesspiegel (consulté le 3 avril 2021)
27. (de) « Wie sich das Coronavirus in Ihrer Region ausbreitet » (https://www.zeit.de/wissen/gesun
dheit/coronavirus-echtzeit-karte-deutschland-landkreise-infektionen-ausbreitung), Zeit Online
(consulté le 3 avril 2021)
28. « CORONAVIRUS (COVID-19) » (https://covid19.minsalud.gov.co/), sur
covid19.minsalud.gov.co, 4 avril 2021 (consulté le 4 avril 2021)
29. (es) « Información epidemiológica » (https://www.argentina.gob.ar/salud/coronavirus-COVID-1
9/sala-situacion), Ministerio de Salud (consulté le 4 avril 2021)
30. (pl) « Ministerstwo Zdrowia » (https://twitter.com/MZ_GOV_PL), sur Twitter, Ministry of Health
(Poland), 5 avril 2021 (consulté le 5 avril 2021)
31. (es) « Covid-19 Mexico » (https://coronavirus.gob.mx/datos/), Instituciones del Gobierno de
México (consulté le 5 avril 2021)
32. « COVID-19 kills 161 more people in Iran » (https://en.irna.ir/news/84283663/COVID-19-kills-1
61-more-people-in-Iran), sur IRNA English, 4 avril 2021 (consulté le 4 avril 2021)
33. (uk) « За весь час пандемії в Україні » (https://www.facebook.com/maksym.stepanov.official/p
osts/904071480135848), Maksym Stepanov, 5 avril 2021 (consulté le 5 avril 2021)
34 Coronavirus epidemic monitoring system (https://covid19 rnbo gov ua/) National Security
34. « Coronavirus epidemic monitoring system » (https://covid19.rnbo.gov.ua/), National Security
and Defense Council of Ukraine (consulté le 5 avril 2021)
35. (es) Ministry of Health (Peru), « Sala Situacional COVID-19 Perú » (https://covid19.minsa.gob.
pe/sala_situacional.asp), 4 avril 2021
36. (es) « Minsa: Casos confirmados por coronavirus COVID-19 ascienden a 1 582 367 en el Perú
(Comunicado N°477) » (https://www.gob.pe/institucion/minsa/noticias/374886-minsa-casos-co
nfirmados-por-coronavirus-covid-19-ascienden-a-1-582-367-en-el-peru-comunicado-n-477),
sur gob.pe, 4 avril 2021 (consulté le 5 avril 2021)
37. (cs) « Aktuálně o koronaviru » (https://koronavirus.mzcr.cz/), Ministry of Health of the Czech
Republic (consulté le 5 avril 2021)
38. « COVID-19 Statistics in South Africa » (https://sacoronavirus.co.za/), sur sacoronavirus.co.za,
4 avril 2021 (consulté le 3 avril 2021)
39. « Dr Zweli Mkhize » (https://twitter.com/DrZweliMkhize), sur Twitter, Dr Zweli Mkhize,
4 avril 2021 (consulté le 4 avril 2021)
40. « Peta Sebaran » (https://covid19.go.id/peta-sebaran) (consulté le 5 avril 2021)
41. (nl) « Actuele informatie over het nieuwe coronavirus (COVID-19) » (https://www.rivm.nl/coron
avirus-covid-19/actueel), RIVM, 3 avril 2021 (consulté le 3 avril 2021)
42. « Statistieken over het Coronavirus en COVID-19 » (https://allecijfers.nl/nieuws/statistieken-ov
er-het-corona-virus-en-covid19/), sur allecijfers.nl (consulté le 3 avril 2021)
43. (es) « Casos confirmados COVID-19 » (https://www.gob.cl/coronavirus/cifrasoficiales/),
Gobierno de Chile (consulté le 4 avril 2021)
44. « Tracking every case of COVID-19 in Canada » (https://www.ctvnews.ca/mobile/health/corona
virus/tracking-every-case-of-covid-19-in-canada-1.4852102), CTV News, 3 avril 2021 (consulté
le 3 avril 2021)
45. (ro) « Comunicate de presă » (https://www.mai.gov.ro/category/comunicate-de-presa/), Ministry
of Internal Affairs (Romania) (consulté le 5 avril 2021)
46. (nl) « COVID-19 – Epidemiologische situatie » (https://covid-19.sciensano.be/nl/covid-19-epid
emiologische-situatie), sur Sciensano (consulté le 4 avril 2021)
47. (nl) « Coronavirus COVID-19 » (https://www.info-coronavirus.be/nl/news/) (consulté le
4 avril 2021)
48. (ar) « ٢٠٢٠ ﺗﺸﺮﻳﻦ اﻟﺜﺎﻧﻲ٥ ( » اﻟﻤﻮﻗﻒ اﻟﻮﺑﺎﺋﻲ اﻟﻴﻮﻣﻲ ﻟﺠﺎﺋﺤﺔ ﻛﻮروﻧﺎ ﻓﻲ اﻟﻌﺮاق ﻟﻴﻮم اﻟﺨﻤﻴﺲ اﻟﻤﻮاﻓﻖh
ttps://www.facebook.com/MOH.GOV.IQ/posts/3876583895729313), sur Facebook, Ministry of
Health of Iraq, 3 avril 2021 (consulté le 3 avril 2021)
49. (he) « he:( » נגיף הקורונה בישראל – תמונת מצב כלליתhttps://datadashboard.health.gov.il/COVID
-19/general) (consulté le 3 avril 2021)
50. (pt) « Ponto de Situação Atual em Portugal » (https://covid19.min-saude.pt/ponto-de-situacao-
atual-em-portugal/), Direção-Geral da Saúde (consulté le 5 avril 2021)
51. (pt) « Já se encontra disponível o relatório de situação de hoje » (https://www.facebook.com/di
recaogeralsaude/posts/3965581683464423), Direção-Geral da Saúde (consulté le
5 avril 2021)
52. (sv) « Antal fall av covid-19 i Sverige – data uppdateras 11:30 och siffrorna är tillgängliga
14:00 » (https://experience.arcgis.com/experience/09f821667ce64bf7be6f9f87457ed9aa), sur
Public Health Agency of Sweden – Official statistics at arcgis (consulté le 1er avril 2021) :
« "Data updated daily at 11:30 [CEST]" »
53. « COVID-19 Case Bulletin » (https://doh.gov.ph/bulletin), Department of Health (Philippines)
(consulté le 5 avril 2021)
54. « COVID-19 Tracker » (https://ncovtracker.doh.gov.ph/), Department of Health (Philippines)
(consulté le 5 avril 2021)
55. « COVID-19 Situation » (http://covid.gov.pk/), sur covid.gov.pk, Government of Pakistan
(consulté le 5 avril 2021)
56. « Tájékoztató oldal a koronavírusról Aktualis » (https://koronavirus.gov.hu/), koronavirus.gov.hu
(consulté le 3 avril 2021)
00. « Lia Tadesse » (https://twitter.com/lia_tadesse), sur Twitter, Lia Tadesse, 4 avril 2021 (consulté
le 5 avril 2021)
01. (ar) « ar:وزﻳﺮة اﻟﺼﺤﺔ ﺗﺘﺎﺑﻊ ﻣﺴﺘﺠﺪات ﻓﻴﺮوس ﻛﻮروﻧﺎ وﺗﻮﺟﻪ ﺑﺘﺬﻟﻴﻞ أي ﺗﺤﺪﻳﺎت ﻟﺴﻴﺮ اﻟﻌﻤﻞ
( » ﺑﺎﻟﻤﺴﺘﺸﻔﻴﺎتhttps://www.facebook.com/EgyMohpSpokes/posts/1461383904198774), sur
Facebook, 3 avril 2021 (consulté le 4 avril 2021)
02. (hy) « hy:Հաստատված դեպքերն ըստ օրերի » (https://ncdc.am/coronavirus/confirmed-c
ases-by-days/), NCDC Armenia, 4 avril 2021 (consulté le 4 avril 2021)
03. (es) « Coronavirus » (https://tablerocovid.mspas.gob.gt/), Ministerio de Salud Pública
(Guatemala), 3 avril 2021 (consulté le 5 avril 2021)
04. (es) « Secretaría de Salud » (https://twitter.com/saludhn), sur Twitter, Secretary of Health
(Honduras), 4 avril 2021 (consulté le 5 avril 2021)
05. (es) « Coronavirus en Honduras » (https://covid19honduras.org/), Secretaria de Salud de
Honduras (consulté le 5 avril 2021)
06. « Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) » (https://covid19.moph.gov.qa/EN/Pages/default.asp
x), Ministry of Public Health (Qatar) (consulté le 5 avril 2021)
07. « COVID-19 in Bosnia and Herzegovina » (http://mcp.gov.ba/?lang=en), Ministry of Civil Affairs
of Bosnia and Herzegovina, 2 avril 2021 (consulté le 2 avril 2021)
08. « NCDC Covid-19 Page » (https://covid19.ncdc.gov.ng/), Nigeria Centre for Disease Control,
4 avril 2021 (consulté le 5 avril 2021)
09. « Covid-19 cases in Oman » (https://covid19.moh.gov.om/#/home), Ministry of Health (Oman),
4 avril 2021 (consulté le 4 avril 2021)
10. (es) « Estadísticas Venezuela » (https://covid19.patria.org.ve/estadisticas-venezuela/), MPPS
COVID Patria, 4 avril 2021 (consulté le 4 avril 2021)
11. (ar) « ar:( » اﻟﺒﻮاﺑﺔ اﻟﺠﻐﺮاﻓﻴﺔ ﻟﻤﺮاﻗﺒﺔ اﻧﺘﺸﺎر ﻓﻴﺮوس ﻛﻮروﻧﺎ ﻓﻲ ﻟﻴﺒﻴﺎhttps://ncdc.org.ly/Ar/libyan-covi
d-19-dashboard/), National Centre of Disease Control (Libya), 2 avril 2021 (consulté le
2 avril 2021)
12. « Daily COVID-19 Report » (https://healthalert.gov.bh/en/category/daily-covid-19-report),
Ministry of Health (Bahrain), 2 avril 2021 (consulté le 2 avril 2021)
13. « Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Surveillance Dashboard (Myanmar) » (https://mohs.g
ov.mm/Main/content/publication/2019-ncov), Ministry of Health and Sports (Myanmar),
4 avril 2021 (consulté le 5 avril 2021)
14. « Ministry of Health » (https://twitter.com/MOH_Kenya), sur Twitter, Ministry of Health (Kenya),
5 avril 2021 (consulté le 5 avril 2021)
15. (mk) « Real-time Coronavirus condition in North Macedonia » (https://gdi-sk.maps.arcgis.com/a
pps/opsdashboard/index.html#/2096bd4b051b42948ac3f5747e80c3a5), sur gdi.net (consulté
le 4 avril 2021)
16. (sq) « Lajme Archives » (https://shendetesia.gov.al/category/lajme/), sur Ministria e
Shëndetësisë dhe Mbrojtjes Sociale (consulté le 3 avril 2021)
17. (sq) « Coronavirus Albania Statistika » (https://coronavirus.al/statistika/), Agjencia Kombëtare e
Shoqerisë së Informacionit (consulté le 4 avril 2021)
18. (es) « Visualizador de casos coronavirus COVID-19 en Uruguay » (https://www.gub.uy/sistema
-nacional-emergencias/pagina-embebida/visualizador-casos-coronavirus-covid-19-uruguay),
sur Sistema Nacional de Emergencias (consulté le 5 avril 2021)
19. (es) « Comunicados » (https://www.gub.uy/sistema-nacional-emergencias/comunicacion/comu
nicados), sur Sistema Nacional de Emergencias (consulté le 5 avril 2021)
20. « Coronavirus COVID-19 in Algeria » (http://covid19.cipalgerie.com/en/), sur
covid19.cipalgerie.com, 31 mars 2021 (consulté le 31 mars 2021)
21. « Information about Coronavirus disease COVID-19 » (https://koroonakaart.ee/en), Estonian
( p ),
Health Board (consulté le 5 avril 2021)
90. (en) Lok-Yin Roy Wong et Pak-Yin Lui, « A molecular arms race between host innate antiviral
response and emerging human coronaviruses » (http://link.springer.com/10.1007/s12250-015-
3683-3), sur Virologica Sinica, février 2016 (ISSN 1674-0769 (http://worldcat.org/issn/1674-076
9&lang=fr), PMID 26786772 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26786772),
PMCID PMC7090626 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7090626),
DOI 10.1007/s12250-015-3683-3 (https://dx.doi.org/10.1007%2Fs12250-015-3683-3), consulté
le 23 mai 2020), p. 12–23
91. (en) Shuo Su et Gary Wong, « Epidemiology, Genetic Recombination, and Pathogenesis of
Coronaviruses » (https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0966842X16000718), sur Trends
in Microbiology, juin 2016 (PMID 27012512 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27012512),
PMCID PMC7125511 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7125511),
DOI 10.1016/j.tim.2016.03.003 (https://dx.doi.org/10.1016%2Fj.tim.2016.03.003), consulté le
23 mai 2020), p. 490–502
92. (en) Ping-Kun Hsieh, Shin C. Chang, Chu-Chun Huang et Ting-Ting Lee, « Assembly of
severe acute respiratory syndrome coronavirus RNA packaging signal into virus-like particles
is nucleocapsid dependent », Journal of Virology, vol. 79, no 22, novembre 2005, p. 13848–
13855 (ISSN 0022-538X (http://worldcat.org/issn/0022-538X&lang=fr),
PMID 16254320 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16254320),
PMCID 1280188 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/1280188),
DOI 10.1128/JVI.79.22.13848-13855.2005 (https://dx.doi.org/10.1128%2FJVI.79.22.13848-1385
, lire en ligne (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1280188/), consulté le
13 mars 2020).
93. (en) CDC, « Human Coronavirus Types » (https://www.cdc.gov/coronavirus/types.html), sur
Center for Disease Control Prevention (consulté le 22 janvier 2020).
94. (en) Liu P, Shi L, Zhang W, He J, Liu C, Zhao C, Kong SK, Loo JF, Gu D, Hu L, « Prevalence
and genetic diversity analysis of human coronaviruses among cross-border children »,
Virology Journal, vol. 14, no 1, novembre 2017, p. 230
(PMID 29166910 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29166910),
PMCID 5700739 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/5700739),
DOI 10.1186/s12985-017-0896-0 (https://dx.doi.org/10.1186%2Fs12985-017-0896-0)).
95. Fehr AR, Perlman S, « Coronaviruses: an overview of their replication and pathogenesis »,
Methods in Molecular Biology, vol. 1282, 2015, p. 1–23 (ISBN 978-1-4939-2437-0,
PMID 25720466 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25720466),
PMCID 4369385 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/4369385),
DOI 10.1007/978-1-4939-2438-7_1 (https://dx.doi.org/10.1007%2F978-1-4939-2438-7_1)).
96. L'hypothèse du pangolin javanais comme hôte intermédiaire du coronavirus (https://www.futura
-sciences.com/sante/actualites/coronavirus-pangolin-source-coronavirus-proches-sars-cov-2-7
9290/)
97. Coronavirus Disease (COVID-19 (https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/) cdc.gov,
consulté le 02 mars 2020.
98. « MERS-CoV » (https://www.pasteur.fr/fr/centre-medical/fiches-maladies/mers-cov), Institut
Pasteur, 6 octobre 2015 (consulté le 29 janvier 2020).
99. (en-US) CDC, « Middle East Respiratory Syndrome (MERS) » (https://www.cdc.gov/coronaviru
s/mers/index.html), sur Centers for Disease Control and Prevention, 2 août 2019 (consulté le
29 janvier 2020).
00. « SRAS » (https://www.pasteur.fr/fr/centre-medical/fiches-maladies/sras), Institut Pasteur,
6 octobre 2015 (consulté le 29 janvier 2020).
01. O.M.S, « Syndrome aiguë respiratoire » (https://www.who.int/topics/sars/fr/), sur O.M.S
(consulté le 29 janvier 2020).
02. (en-US) « SARS | Home | Severe Acute Respiratory Syndrome | SARS-CoV Disease | CDC »
(https://www.cdc.gov/sars/index.html), sur www.cdc.gov, 22 octobre 2019 (consulté le
29 janvier 2020).
03. Vincent J. Munster, Marion Koopmans, Neeltje van Doremalen et Debby van Riel, « A Novel
Coronavirus Emerging in China — Key Questions for Impact Assessment », The New England
Journal of Medicine, vol. 382, no 8, 20 février 2020, p. 692–694 (ISSN 0028-4793 (http://worldc
at.org/issn/0028-4793&lang=fr),
DOI 10.1056/NEJMp2000929 (https://dx.doi.org/10.1056%2FNEJMp2000929), lire en ligne (htt
ps://doi.org/10.1056/NEJMp2000929), consulté le 3 mars 2020).
04. Organisation mondiale de la santé, "Consensus document on the epidemiology of severe
acute respiratory syndrome (SARS)", 2003, page 15.
05. (en) Huijun Chen, Juanjuan Guo, Chen Wang et Fan Luo, « Clinical characteristics and
intrauterine vertical transmission potential of COVID-19 infection in nine pregnant women: a
retrospective review of medical records », The Lancet, vol. 395, no 10226, 7 mars 2020,
p. 809–815 (ISSN 0140-6736 (http://worldcat.org/issn/0140-6736&lang=fr) et 1474-547X (http://
worldcat.org/issn/1474-547X&lang=fr),
PMID 32151335 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32151335),
DOI 10.1016/S0140-6736(20)30360-3 (https://dx.doi.org/10.1016%2FS0140-6736%2820%2930
, lire en ligne (https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30360-3/abs
tract), consulté le 27 mars 2020).
06. Corwin A. Robertson, Sara A. Lowther, Thomas Birch et Christina Tan, « SARS and
Pregnancy: A Case Report », Emerging Infectious Diseases, vol. 10, no 2, février 2004, p. 345–
348 (ISSN 1080-6040 (http://worldcat.org/issn/1080-6040&lang=fr) et 1080-6059 (http://worldca
t.org/issn/1080-6059&lang=fr),
PMID 15030710 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15030710),
PMCID PMC3322896 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3322896),
DOI 10.3201/eid1002.030736 (https://dx.doi.org/10.3201%2Feid1002.030736), lire en ligne (htt
p://wwwnc.cdc.gov/eid/article/10/2/03-0736_article.htm), consulté le 15 avril 2020)
07. (en) Kimberly A. Lackey, Ryan M. Pace, Janet E. Williams et Lars Bode, « SARS-CoV-2 and
human milk: what is the evidence? », medRxiv, 11 avril 2020, p. 2020.04.07.20056812
(DOI 10.1101/2020.04.07.20056812 (https://dx.doi.org/10.1101%2F2020.04.07.20056812), lire
en ligne (https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.07.20056812v1), consulté le
15 avril 2020)
08. Étude du Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, de Baltimore associée à School
of Public Health and Health Sciences du Massachusetts, et à la Ludwig-Maximilians-
Universität de Munich.
09. (en) David L. Swerdlow et Lyn Finelli, « Preparation for Possible Sustained Transmission of
2019 Novel Coronavirus: Lessons From Previous Epidemics », JAMA, 11 février 2020
(ISSN 0098-7484 (http://worldcat.org/issn/0098-7484&lang=fr),
DOI 10.1001/jama.2020.1960 (https://dx.doi.org/10.1001%2Fjama.2020.1960), lire en ligne (htt
ps://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2761285), consulté le 12 février 2020).
10. « Le taux de reproduction de COVID-19 est plus élevé que celui du SRAS » (https://www.medi
square.be/index.php/2020/02/19/le-taux-de-reproduction-de-covid-19-est-plus-eleve-que-celui-
du-sras/).
11. https://www.lemonde.fr/les-decodeurs/article/2020/02/06/coronavirus-une-affiche-du-ministere-
ecarte-trop-vite-le-risque-de-contagion-lors-de-l-incubation_6028658_4355770.html
12. (en) Smriti Mallapaty, « What the cruise-ship outbreaks reveal about COVID-19 », Nature,
26 mars 2020, d41586–020–00885-w (ISSN 0028-0836 (http://worldcat.org/issn/0028-0836&la
ng=fr) et 1476-4687 (http://worldcat.org/issn/1476-4687&lang=fr),
DOI 10.1038/d41586-020-00885-w (https://dx.doi.org/10.1038%2Fd41586-020-00885-w), lire
en ligne (http://www.nature.com/articles/d41586-020-00885-w), consulté le 27 mars 2020).
13. « Coronavirus : la maladie pourrait aussi se transmettre par voie fécale » (https://www.pourquoi
docteur.fr/Articles/Question-d-actu/31511-Coronavirus-maladie-pourrait-transmettre-voie-fecal
e) sur www pourquoidocteur fr (consulté le 17 mars 2020)
e), sur www.pourquoidocteur.fr (consulté le 17 mars 2020).
14. « Coronavirus : L’OMS indique que le taux de mortalité est de 3,4 % », Intellivoire, 5 mars 2020
(lire en ligne (https://intellivoire.net/coronavirus-loms-indique-que-le-taux-de-mortalite-est-de-3
4/), consulté le 5 mars 2020).
15. (en) Jie Cui, Fang Li et Zheng-Li Shi, « Origin and evolution of pathogenic coronaviruses »,
Nature Reviews Microbiology, vol. 17, no 3, mars 2019, p. 181–192 (ISSN 1740-1534 (http://wo
rldcat.org/issn/1740-1534&lang=fr),
DOI 10.1038/s41579-018-0118-9 (https://dx.doi.org/10.1038%2Fs41579-018-0118-9), lire en
ligne (https://www.nature.com/articles/s41579-018-0118-9), consulté le 17 mars 2020).
16. Coronavirus disease (COVID-19) advice for the public (https://www.who.int/emergencies/disea
ses/novel-coronavirus-2019/advice-for-public), OMS, 2020.
17. « Coronavirus – informations et conseils » (https://www.vaccinations-airfrance.fr/vaccination-sa
nte-voyage/maladie-voyage-vaccination/coronavirus-vaccin-vaccinations-conseils), sur Centre
de vaccinations internationales Air France (consulté le 13 mars 2020).
18. Stockman LJ, Bellamy R, Garner P. SARS: systematic review of treatment effects (https://www.
ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16968120). PLoS Med. 2006;3:e343.
doi:10.1371/journal.pmed.0030343
19. https://universiteouverte.org/2020/03/04/coronavirus-la-science-ne-marche-pas-dans-lurgence/
20. Zhu, M. 2004. SARS immunity and vaccination (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1621916
7). Cell. Mol. Immunol. 1:193-198
21. https://sciences-critiques.fr/bruno-canard-demander-un-medicament-des-le-lendemain-dune-
epidemie-na-aucun-sens/
22. coronavirus Study Group ou CSG
23. Gorbalenya A.E & a. (2020) Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: The
species and its viruses – a statement of the Coronavirus Study Group. bioRxiv,
https://www.biorxiv. org/content/10.1101/2020.02.07.937862v1.full.pdf.
24. de Groot RJ, Baker SC, Baric R, Enjuanes L, Gorbalenya AE, Holmes KV, Perlman S, Poon L,
Rottier PJ, Talbot PJ, Woo PC, Ziebuhr J, Ninth Report of the International Committee on
Taxonomy of Viruses, Oxford, Elsevier, 2011, 806–828 p. (ISBN 978-0-12-384684-6), « Family
Coronaviridae ».
25. International Committee on Taxonomy of Viruses, « ICTV Master Species List 2009 – v10 » (htt
p://talk.ictvonline.org/files/ictv_documents/m/msl/1231/download.aspx) [xls], 24 août 2010.
26. Lu R, Zhao X, Li J, Niu P, Yang B, Wu H, [...] Tan W, 2020. Genomic characterisation and
epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding.
The Lancet doi: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30251-8.
27. (en) Kerstin Erles, Kai-Biu Shiu et Joe Brownlie, « Isolation and sequence analysis of canine
respiratory coronavirus », Virus Research, vol. 124, no 1, 1er mars 2007, p. 78–87 (ISSN 0168-
1702 (http://worldcat.org/issn/0168-1702&lang=fr),
DOI 10.1016/j.virusres.2006.10.004 (https://dx.doi.org/10.1016%2Fj.virusres.2006.10.004), lire
en ligne (http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168170206003005), consulté le
17 mars 2020).
28. (en) Kerstin Erles, Crista Toomey, Harriet W Brooks et Joe Brownlie, « Detection of a group 2
coronavirus in dogs with canine infectious respiratory disease », Virology, vol. 310, no 2,
5 juin 2003, p. 216–223 (ISSN 0042-6822 (http://worldcat.org/issn/0042-6822&lang=fr),
DOI 10.1016/S0042-6822(03)00160-0 (https://dx.doi.org/10.1016%2FS0042-6822%2803%2900
, lire en ligne (http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0042682203001600), consulté
le 17 mars 2020).
29. (en) « Virus taxonomy: 2018b release » (https://talk.ictvonline.org/taxonomy/), sur ICTV online,
juillet 2018 (consulté le 24 janvier 2020).
Voir aussi
Bibliographie Sur les autres projets Wikimedia :
Coronavirus (https://commons.wikimedia.
(en) Christine V.F. Carrington, Jerome E.
Foster, Hua Chen Zhu, Jin Xia Zhang, org/wiki/Category:Coronavirus?uselang=f
Gavin J.D. Smith, Nadin Thompson, Albert r), sur Wikimedia Commons
J. Auguste, Vernie Ramkissoon, Abiodun A.
Adesiyun et Yi Guan, « Detection and coronavirus, sur le Wiktionnaire
Phylogenetic Analysis of Group 1
Coronaviruses in South American Bats »,
Emerging Infectious Diseases journal, Centers for Disease Control and Prevention, vol. 14,
no 12, décembre 2008, p. 1890-1893
(DOI 10.3201/eid1412.080642 (https://dx.doi.org/10.3201%2Feid1412.080642), lire en ligne (http://wwwnc.cdc.go
v/eid/article/14/12/08-0642_article.htm))
Habibzadeh P, Stoneman EK "The Novel Coronavirus: A Bird's Eye View". The International
Journal of Occupational and Environmental Medicine. 11 (2): 65–71.
doi:10.15171/ijoem.2020.1921. (résumé (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32020915)).
Saif, L. J., Wang, Q., Vlasova, A. N., Jung, K., & Xiao, S. (2019). Coronaviruses (https://cloudfl
are-ipfs.com/ipfs/bafykbzaced4xstofs4tc5q4irede6uzaz3qzcdvcb2eedxgfakzwdyjnxgohq/pdf
s/2019%20Diseases%20of%20Swine%20__%20Coronaviruses.pdf). Diseases of swine,
488-523.
Nathalie Kin et Astrid Vabret, « Les infections à coronavirus humains » (https://linkinghub.els
evier.com/retrieve/pii/S1773035X16303690), sur Revue Francophone des Laboratoires,
décembre 2016 (PMID 32288826 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32288826),
PMCID PMC7140280 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7140280),
DOI 10.1016/S1773-035X(16)30369-0 (https://dx.doi.org/10.1016%2FS1773-035X%2816%2930369-0), consulté le
22 mai 2020), p. 25–33
Infographie
Frédérique Schneider, « Coronavirus, les chiffres de l’épidémie » (https://www.la-croix.com/Fr
ance/INFOGRAPHIE-Coronavirus-chiffres-lepidemie-2020-01-24-1201073908), sur La Croix,
17 février 2020 (consulté le 18 février 2020)
Articles connexes
Coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS-CoV pour Middle East
respiratory syndrome coronavirus, anciennement NCoV)
Virologie
Coronavirus félin
Péritonite infectieuse féline
Maladie à coronavirus 2019
Syndrome respiratoire aigu sévère
Pneumonie aiguë
Urgence de santé publique de portée internationale (USPPI)
Sociétés biopharmaceutiques en développement sur un vaccin : Moderna Therapeutics,
CureVac, etc.
Pandémie de Covid-19
Liens externes
Notices d'autorité : Gemeinsame Normdatei (http://d-nb.info/gnd/4276392-7)
(en) CDC (https://www.cdc.gov/), CDC Novel Coronavirus (https://www.cdc.gov/coronavirus/n
cv/index.html) et CDC’s case definitions and guidance (https://www.cdc.gov/coronavirus/ncv/
case-def.html).
(en) CDC, Site internet (CDC) consacré au novel coronavirus (https://www.cdc.gov/coronavir
us/ncv/case-def.html).
(en) OMS, WHO Novel Coronavirus Infection—UpdateExternal (http://www.who.int/csr/diseas
e/coronavirus_infections/en/index.html).
(en) Health Protection Agency Novel Coronavirus 2012 (http://www.hpa.org.uk/Topics/Infectio
usDiseases/InfectionsAZ/NovelCoronavirus2012/).
(fr) Cartes situation générale [1] (https://www.cartograf.fr/carte_coronavirus_chinois.php).
(en) ECDC, ECDC: Novel Coronavirus update to Rapid Risk AssessmentExternal (http://ecd
c.europa.eu/en/press/news/Lists/News/ECDC_DispForm.aspx?List=32e43ee8%2De230%2
D4424%2Da783%2D85742124029a&ID=847&RootFolder=%2Fen%2Fpress%2Fnews%2F
Lists%2FNews).
(en) CDC Mise à jour : Severe Respiratory Illness Associated with a Novel Coronavirus—
Worldwide (https://www.cdc.gov/mmwr/preview/mmwrhtml/mm62e0307a1.htm?s_cid=mm62
e0307a1_x), 2012–2013 MMWR March 7, 2013/62 (Early Release), p. 1-2.
(en) CDC Severe Respiratory Illness Associated with a Novel Coronavirus — Saudi Arabia
and Qatar (https://www.cdc.gov/mmwr/preview/mmwrhtml/mm61e1004a1.htm?s_cid=mm61e
1004a1_e), 2012 MMWR October 12, 2012/61, p. 820-820.
Thankyoucaretakers.com/fr (https://thankyoucaretakers.com/fr/), initiative mise en place lors
de la pandémie de COVID-19 de 2019/2020 et ayant pour objectif de rassembler 1 million de
messages de remerciements pour les soignants du monde.
Droit d'auteur : les textes sont disponibles sous licence Creative Commons attribution, partage dans les mêmes
conditions ; d’autres conditions peuvent s’appliquer. Voyez les conditions d’utilisation pour plus de détails, ainsi que les
crédits graphiques. En cas de réutilisation des textes de cette page, voyez comment citer les auteurs et mentionner la
licence.
Wikipedia® est une marque déposée de la Wikimedia Foundation, Inc., organisation de bienfaisance régie par le
paragraphe 501(c)(3) du code fiscal des États-Unis.