Henry Petersen var en dansk arkæolog, i 1879 ansat ved Nationalmuseet, fra 1892 som chef for middelalderafdelingen. Petersens forfatterskab omhandler dels forhistorien, Vognfundene i Dejbjerg Præstegaardsmose (1888) og Jernaldergravpladsen ved Nordrup (1890), dels middelalderen, hvor hans hovedværker er Danske gejstlige Sigiller (1886) og Danske adelige Sigiller (1897, posthumt udgivet).
Henry Petersen ydede en stor indsats for registrering og bevaring af fortidsminder.