Klaipėdos „Baltija“ buvo Klaipėdos laivų statyklos sporto kolektyvas, žaidęs kelių sporto šakų čempionatuose. Jis priklausė „Žalgirio“ sporto draugijai.[1] Ankstyvuoju sovietmečiu „Baltija“ kartu su „Audra“ buvo viena pagrindinių Klaipėdos miesto futbolo komandų. 1958 m. pradžioje į „Baltiją“ perėjo „Švyturio“ ekipa, 1958 m. spalį komandą ėmė remti Laivų remonto įmonė (LRĮ). 1960 m. „Baltija“ perėmė „Audros“ vietą LTSR aukščiausiojoje lygoje. 1961 m. rudenį „Baltijos“ komandą šefavo Klaipėdos statybos trestas (KST), bet greitai ji nusilpo ir 1962 m. pradžioje Klaipėdoje suburta „Granito“ komanda, kuriai II rate „Baltija“ ir perdavė savo vietą A klasėje. Tačiau netrukus „Baltija“ buvo vėl atkurta,[2] ji veikė prie Klaipėdos laivų statyklos.
Atgavus Nepriklausomybę, komanda žaisdavo III lygos Klaipėdos zonoje.
Pastaba: neįskaitomi 1924–1930, 1935, 1942–1943, 1945 m. sezonai, kai nebuvo vientisos lygos, taip pat 1939–1940, 1941, 1943–1944 m. nebaigtos pirmenybės.