Decacovirus
Subgenul Decacovirus este un subgen de coronavirusuri din genul Alphacoronavirus care include 2 specii de coronavirusuri: alfacoronavirusul HuB-2013 al liliacului Rhinolophus ferrumequinum (Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013) și coronavirusul HKU10 al liliecilor (Bat coronavirus HKU10).[1][2] Ambele specii nu sunt zoonotice, adică nu se transmit la om.[3]
| Colacovirus | |
|---|---|
| Clasificarea virusurilor | |
| Grupă: | Grupa IV ((+)ssRNA) |
| Ordin: | Nidovirale |
| Familie: | Coronaviride |
| Subfamilie: | Coronavirinae (Orthocoronavirinae) |
| Gen: | Alphacoronavirus |
| Subgen: | Decacovirus |
| Specii | |
|
Alfacoronavirusul HuB-2013 al liliacului | |
Modifică text  |
|
Alfacoronavirusul HuB-2013 al liliacului Rhinolophus ferrumequinum include 2 tulpini virale: BtMs-AlphaCoV/GS2013 și BtRf-AlphaCoV/HuB2013. Tulpina BtMs-AlphaCoV/GS2013 (GenBank nr. KJ473810[4]) a fost descoperită în 2013 în provincia Gansu, China, la liliecii cu urechi de șoarece (Myotis spp.). Tulpina BtRf-AlphaCoV/HuB2013 (GenBank nr. NC_028814[5]) a fost descoperită tot în 2013 în provincia Hubei, China, la liliecii mari cu potcoavă (Rhinolophus ferrumequinum). Ambele tulpini au o identitate foarte mari a secvențelor genetice (peste 98%), dar mai mică a genelor care codifică proteina spiculară S (numai 85% de nucleotide sunt identice).[6]
A doua specie a subgenului, coronavirusul HKU10 al liliecilor, a fost descoperită în 2005 în China la liliecii ruzet, numiți și câini zburători (Rousettus spp. - GenBank nr. NC_018871[7]) și la liliecii filorini (Hipposideros spp.). Alte tulpini de la liliecii filorini (Hipposideros spp.) au fost apoi descoperite în 2006 și 2010.[8] O tulpină virală asemănătoare cu HKU10 a fost identificată la liliacul filorin pomon (Hipposideros pomona) în 2018 în China (GenBank nr. MN611523[9]).
Referințe
modificare- ^ Decacovirus. NCBI taxonomy database
- ^ Decaro, N., Lorusso, A. (2020). Novel human coronavirus (SARS-CoV-2): A lesson from animal coronaviruses. Veterinary Microbiology, Volume 244, May 2020, 108693
- ^ Helmy YA, Fawzy M, Elaswad A, Sobieh A, Kenney SP, Shehata AA. The COVID-19 pandemic: a comprehensive review of taxonomy, genetics, epidemiology, diagnosis, treatment, and control. J Clin Med 2020; 9(4):E1225-E1225.
- ^ BtMs-AlphaCoV/GS2013, complete genome. GenBank.
- ^ BtRf-AlphaCoV/HuB2013, complete genome. GenBank.
- ^ Wu, Z., Yang, L., Ren, X., He, G., Zhang, J., Yang, J., Qian, Z., Dong, J., Sun, L., Zhu, Y., Du, J., Yang, F., Zhang, S., Jin, Q., 2016. Deciphering the bat virome catalog to better understand the ecological diversity of bat viruses and the bat origin of emerging infectious diseases. ISME J. 10, 609-620.
- ^ Rousettus bat coronavirus HKU10, complete genome. GenBank.
- ^ Lau, S.K., Li, K.S., Tsang, A.K., Shek, C.T., Wang, M., Choi, G.K., Guo, R., Wong, B.H., Poon, R.W., Lam, C.S., Wang, S.Y., Fan, R.Y., Chan, K.H., Zheng, B.J., Woo, P.C., Yuen, K.Y., 2012. Recent transmission of a novel alphacoronavirus, bat coronavirus HKU10, from Leschenault's rousettes to pomona leaf-nosed bats: first evidence of interspecies transmission of coronavirus between bats of different suborders. J. Virol. 86, 11906-11918.
- ^ Hipposideros pomona bat coronavirus HKU10-related isolate 160942, complete genome. GenBank.