Aksel E. Christensen var en dansk historiker. Han ble dr.philos. i 1941 på avhandlingen Dutch Trade to the Baltic About 1600, og var professor ved universitetet i København i perioden 1948–76.
Blant de fremste av Christensens verker er Kongemagt og Aristokrati (1945, ny utgave 1968) og Hansestæderne og Norden (1957). Hans store unionshistorie Kalmarunion og Nordisk Politik 1319–1439 kom ut 1980 (1. bind, bind 2 ble ikke ferdig før han døde).