ChEBI
Hemijski entitet sa biološkim značajem (ChEBI)[1][2] je baza podataka i ontologija molekulskih entiteta za fokusom na 'mala' hemijska jedinjenja.[3] Ta jedinjenja su bilo prirodni ili sintetički proizvodi koji se koriste za pravljenje promena u procesima živih organizama. Molekuli koji su direktno kodirani genomom, kao što su nukleinske kiseline, proteini i peptidi izvedeni iz proteina proteolitičkim razlaganjem, se po pravilu ne unose u ChEBI.
Kontent | |
---|---|
Opis | Hemijska baza podataka |
Tipovi podataka | Hemijski entitet sa biološkim značajem |
Kontakt | |
Istraživački centar | Evropska laboratorija za molekularnu biologiju |
Laboratorija | Evropski bioinformatički institut |
Primarni citat | [1] |
Pristup | |
Veb stranica | ChEBI |
URL za preuzimanje | Preuzimanje |
Veb servis URL | Veb servis |
SPARQL krajnja tačka | BIO2RDF |
Alati | |
Veb | ChEBI vebsajt |
Razno | |
Frekvencija objavljivanja podataka | mesečno |
Sadašnja smernica | manualna anotacija |
Literatura
уреди- ^ а б De Matos, P.; Alcantara, R.; Dekker, A.; Ennis, M.; Hastings, J.; Haug, K.; Spiteri, I.; Turner, S.; Steinbeck, C. (2009). „Chemical Entities of Biological Interest: An update”. Nucleic Acids Research. 38 (Database issue): D249—54. PMC 2808869 . PMID 19854951. doi:10.1093/nar/gkp886.
- ^ Degtyarenko K.; De Matos P.; Ennis M.; Hastings J.; Zbinden M.; McNaught A.; Alcantara R.; Darsow M.; Guedj M. (2007). „ChEBI: A database and ontology for chemical entities of biological interest”. Nucleic Acids Research. 36 (Database issue): D344—50. PMC 2238832 . PMID 17932057. doi:10.1093/nar/gkm791.
- ^ IUPAC. „molecular entity”. Kompendijum hemijske terminologije (Internet izdanje).