Tutu hade själv gett instruktioner om att hans begravningsceremoni skulle vara enkel. Han hade bett om donationer till välgörenhet i stället för blomsterarrangemang och mitt i allas blickfång låg den enklaste möjliga kistan i furu.
Virusrestriktionerna hade dessutom lett till att bara ett hundratal människor fick delta i ceremonin inne i katedralen. Katedralen S:t George i Kapstaden, som Tutu förvandlade till "Folkets katedral" och en tillflyktsort för antiapartheidaktivister under de turbulenta 1980- och 90-talen.
Desmond Tutu dog i söndags, 90 år gammal. Han fick Nobels fredspris 1984 för sin kamp mot apartheidsystemet i Sydafrika.
"Vi minns honom med ett leende"
Efter att apartheid avskaffades och demokrati infördes 1994, utsåg landets första svarta president, Nelson Mandela, Tutu till ordförande i Sannings- och försoningskommissionen TRC. Kommissionen utredde brott som begåtts under apartheidregimen och erbjöd amnesti för dem som erkände sina brott.
Men Tutu tillrättavisade också "de egna". Han kritiserade ofta ledare för det styrande ANC-partiet för korruption och inkompetens. Det uppmärksammade Ramaphosa också i sitt tal.
– Också efter införandet av demokratin tvekade han inte att rikta uppmärksamheten mot våra brister som ledare, sa Ramaphosa.
Till mångas förargelse försvarade Tutu också LGBTQ-personers rättigheter.
– Han levde ett ärligt och fullt liv. Han lämnade efter sig en bättre värld. Vi minns honom med ett leende, tillade Ramaphosa.
"Han lärde oss vad kärlek är"
Tutu var känd för sin humor och självironi. Under sin predikan beskrev Tutus kollega och vän, den pensionerade biskopen Michael Nuttall honom med Nelson Mandelas ord.
– Ibland högljudd och skarp, ofta öm, aldrig rädd och sällan utan humor. Tutu kommer alltid att ge en röst till dem som ingen har, sa Nuttall.
Begravningsmässan avslutades med Sydafrikas nationalsång Nkosi sikelel' Afrika och därefter överräckte president Ramaphosa Sydafrikas flagga till änkan Leah Tutu.
Begravningen sändes direkt på flera sydafrikanska tv-kanaler och i många andra länder världen över. En del följde med ceremonin via en storbildsskärm som hade satts upp några hundra meter från katedralen.
Bland dem 63-åriga Washilah Isaacs.
– Han lärde oss vad kärlek är. Och jag älskade hans humor, sade Isaacs till nyhetsbyrån AFP. Hon tillade att hon också gillade Tutu för hans stöd till palestinierna.
Källor: AFP, AP, Reuters, Yle