Samtalet med Zelenskyj fördes på initiativ av Finland. Niinistö försäkrade sin ukrainske kollega om att Finland skarpt fördömer Rysslands militära insatser i Ukraina.
Finland "stöder Ukrainas självständighet, suveränitet, självbestämmanderätt och territoriella integritet", hette det i ett pressmeddelande från Republikens presidents kansli efter samtalet.
Niinistö uttryckte på hela det finska folkets vägnar djup sympati för Ukraina.
Niinistö berättade för Zelenskyj om att Finland stöder Ukraina med närmare 15 miljoner euro. Pengarna ska överföras till en fond "som stöder Ukrainas resiliens och humanitära bistånd", heter det i pressmeddelandet.
Senare samma förmiddag träffade Niinistö Ukrainas ambassadör i Finland, Olga Dibrova, på Talludden.