Kosovos premiärminister Albin Kurti anklagar Serbien för att ha stött den beväpnade gruppen, medan Serbien lägger skulden för det upptrappade våldet på Kosovos regering.
Samtidigt har de EU-ledda förhandlingarna för att minska på spänningarna mellan de två länderna kört fast.
Poliser sköts ur bakhåll
Söndagens strider var de blodigaste på flera år och kommer efter månader av ökade spänningar i de kosovoserbiska områdena.
Våldet började då en väpnad grupp öppnade eld mot en kosovansk polispatrull i närheten av byn Banjska . En polis dödades och en skadades.
Enligt Kosovo var det fråga om ett bakhåll där angriparna använde sig av tunga vapen.
‒ Attacken genomfördes av proffs, de var maskerade och hade tillgång till tunga vapen. Vi fördömer den här kriminella terrorattacken, sa Kosovos premiärminister Albin Kurti.
‒ Organiserade kriminella gäng som får finansiellt och logistiskt stöd från Belgrad angriper vårt land, tillade han.
Belägrat kloster
Under dagen fortsatte striderna i området. Kosovo uppger att tre milismän dödades. Alla tre ska ha varit kosovoserber.
Enligt kosovanska myndigheter retirerade angriparna till ett kloster i området där de omringades av kosovansk polis.
Serbiens ortodoxa kyrka som driver klostret uppger att männen lämnade klostret under natten, men det är oklart var de befinner sig nu.
Stor vapengömma
Kosovo uppger att sex personer gripits av polisen. Kosovos inrikesminister Xhelal Svecla uppgav att polisen beslagtagit ett stort antal vapen, sprängämnen och uniformer. Enligt honom skulle vapnen ha räckt för att utrusta hundratals milismän.
Serbiens president Aleksandar Vucic har fördömt attacken polisen men förnekar att Serbien är inblandat i våldet.
I stället beskyller Vuvic Kosovos regering för att ha provocerat fram våldet genom att förtrycka den serbiska minoriteten.
Vucic lyfter upp Kosovos vägran att ge de serbdominerade områdena i norr större autonomi.
Inga framsteg
Kosovoserberna har länge krävt att Kosovo verkställer ett avtal från 2013 om utökat självstyre. Enligt avtalet som medlades fram av EU ska de serbdominerade kommunerna i norr bilda en autonom sammanslutning.
Kosovos regering anser att planen i praktiken skulle leda till bildandet av en ministat inne i Kosovo och dela upp landet enligt etniska gränser.
Kosovos vägran att verkställa avtalet har lett till att att EU:s försök att skapa bättre relationer mellan Kosovo och Serbien har kört fast.
Serbien vägrar också fortsättningsvis att erkänna Kosovos självständighet.
Källor: Reuters, AFP, BBC