Elizabeth Magill, rektor för University of Pennsylvania i Philadelphia, lämnar sin post efter att hon och två andra toppuniversitets rektorer uttalat sig inför kongressen om antisemitism och yttrandefrihet bland studerandena.
Magill sa under utfrågningen i kongressen den 5 december att det inte självklart strider mot universitetets uppförandekod om trakasserier eller mobbning att uppmana till folkmord på judar.
– Det är ett beslut som fattas beroende på sammanhanget, svarade Magill på frågan.
Hon bad senare om ursäkt för sitt uttalande.
Hennes uttalanden väckte starka reaktioner och fick bland annat en av det anrika universitetets främsta donatorer att hota dra in en planerad donation på 100 miljoner dollar, uppger CNN.
Antisemitismen och hatbrotten vid universiteten i USA har ökat efter att konflikten i Gaza bröt ut.
Källa: AFP