Enligt preliminära uppgifter var det svåraste jordskalvets magnitud 7,6. Skalvet inträffade 9.10 finsk tid. Epicentrum ligger vid kusten i norra Ishikawa prefekturen.
Video visar hus som kollapsar i området nära jordbävningens epicentrum. Japans kabinettschef och tidigare utrikesminister Yoshimasa Hayashi bekräftar att flera hem har kollapsat, och att myndigheterna hittills nåtts av rapporter att sex personer begravts i rasmassorna.
En tre meter hög flodvåg befaras slå till mot delar av den japanska kusten efter en serie jordbävningar vid ön Honshus västkust i centrala Japan på måndagsmorgonen. Tidigare gällde varningen en fem meter hög flodvåg.
En tsunamivarning har utfärdats i regionerna Ishikawa, Niigata och Toyama.
En första våg slog enligt nyhetsbyrån Reuters till mot staden Wajima i Ishikawa kort efter jordbävningen, men den var inte så stor som befarat, utan 1,2 meter hög. Från Kashizawaki i Nilgata rapporteras om en våg på 40 centimeter.
Vid tiotiden finsk tid utfärdade de japanska myndigheterna en varning för en eventuell ny jordbävning. Enligt en tjänsteman vid landets meteorologiska institut JMA måste man nu vara uppmärksam på jordbävningar i uppemot en vecka, speciellt de kommande 2–3 dagarna.
Varningar även i Sydkorea, Nordkorea och Ryssland
I Sydkorea har man uppmätt en 45 centimeter hög tsunami, och man varnar för att det kan komma flera och större tsunamin. Invånare längs delar av kusten har varnats, och uppmanas att ta sig till högre mark.
Också i Ryssland har det utfärdats tsunamivarningar vid landets kust till Japanska havet. Enligt nyhetsbyrån Tass evakuerar man vissa delar av ön Sachalin. Det har också utfärdats varningar i Vladivostok och Nachodka.
Också Nordkorea har utfärdat en tsunamivarning.
Läget är under kontroll vid det närmaste kärnkraftverket
Kärnkraftverket Shika befinner sig mindre än 100 kilometer från den största jordbävningens epicentrum, på kusten vid området där den starkaste tsunamivarningen utfärdades. Kraftverket är ändå byggt för att klara av större tsunamin än det som det varnats för.
Kraftverkets två reaktorer var avstängda för inspektion när skalvet inträffade. Man har inte noterat något ovanligt vid kraftverket.
År 2011 ledde en jordbävning och efterföljande tsunamivågor till en kärnkraftsolycka i japanska Fukushima. Jordbävningen och den följande tsunamin där var betydligt mer omfattande än jordbävningen som nu skett och tsunamin som nu väntas.
Källor: Reuters, AFP, NHK, Yonhap