Polisen hittade männen efter att en av dem anmälts som försvunnen.
En av männen, en Raumobo, anmäldes tidigare som försvunnen och polisen letade efter honom. Polisen fick ett tips om att mannen kunde befinna sig i ett egnahemshus i Pyhämaa.
Då polisen på måndag gick in i huset visade det sig att det brunnit inne i huset. Branden syntes inte utåt.
Två döda män hittades i huset. Den ena mannen är den försvunna Raumobon, den andra mannens identitet är ännu oklar.
Polisen utreder brand- och dödsorsaken, inget brott misstänks.