Elucidacion Estructural

ELUCIDACION ESTRUCTURAL
INTRODUCCIN
La elucidacin estructural es fundamental en el descubrimiento y desarrollo de
nuevos frmacos, pues permite, al combinar la informacin obtenida mediante
la aplicacin de diversas tcnicas espectroscpicas y espectromtricas,
establecer la estructura qumica de una molcula, un hecho fundamental para
entender la forma en cmo se da la interaccin entre el frmaco y su diana
biolgica. Las tcnicas espectroscpicas y espectromtricas ms comnmente
empleadas en la elucidacin estructural de frmacos son: Ultravioleta visible
(UV
VIS),
Infrarrojo
(IR),
Resonancia
Magntica
H-RMN, y Carbono 13C-RMN y Espectrometra de Masas (EM).
Artculo principal: Tabla de correlaciones en espectroscopia infrarroja
Las absorciones se expresan en cm-1.
de
Protn
OBJETIVOS:
Conocer y hacer uso de las espectroscopias de infrarrojo, de masas,

resonancia magntica nuclear de protones y carbono trece.
Integrar las diferentes tcnicas de elucidacin estructural en la

identificacin de compuestos orgnicos.
Marco teorico
Interpretacin del espectro IR
El procedimiento para identificar un compuesto desconocido se basa en el
hecho constatado de que determinados grupos de tomos vecinos dentro de
una molcula experimentan vibraciones que resultan casi independientes de
las de los dems tomos. Adems, las vibraciones de cada grupo dan lugar
normalmente a bandas cuyo nmero de ondas es aproximadamente
constante (dentro de un cierto intervalo), independientemente de la naturaleza
de la molcula en la que se encuentre el grupo en cuestin. La tabla siguiente
recoge algunas frecuencias y absorciones de grupo tpicas.
Los valores exactos pueden encontrarse dentro de un intervalo de hasta 100

cm-1 de anchura porque las vibraciones de las distintas partes de una molcula
estn acopladas en cierta medida; es decir, no son completamente
independientes del resto de tomos o grupos de tomos de la molcula.
La figura anterior ilustra un espectro IR tpico (en transmitancia) en el que se

muestran las bandas caractersticas de algunos grupos tpicos y en qu
regiones aparecen. Hay zonas del espectro especialmente tiles como el
intervalo entre 1200 y 600 cm-1, llamado de las huellas dactilares porque cada
compuesto da un patrn espectral muy concreto en esa regin (algunos
autores extienden este intervalo hasta 1500 cm-1).
Como el movimiento vibratorio global de una molcula de n tomos es una
combinacin de 3n6 modos normales de vibracin, cada uno de los cuales
da, tericamente, una banda fundamental en el espectro, podra pensarse que
las molculas grandes sern intratables mediante esta tcnica. Sin embargo,
en la prctica todo es ms sencillo. Por un lado, no todas las vibraciones son
activas en infrarrojo; es decir, no todos los modos dan lugar a una banda. De
las que son activas, si suponen un cambio de momento dipolar muy pequeo la
banda ser tan poco intensa que normalmente quedar cubierta por otras ms
intensas y anchas. Adems, debido a ciertos efectos algunas bandas de
nmeros de ondas prximos tienden a coalescer (fundirse para dar una nica
banda). Este fenmeno se da especialmente en los hidrocarburos, que
contienen muchos grupos CH2 prcticamente equivalentes.
Normalmente, cuanto ms anchas son las bandas, ms difcil es interpretar el
espectro IR, por el solapamiento de estas. Algunas bandas estrechas aparecen
como hombros de otras ms intensas (por ejemplo, en el espectro de la figura
6.12 se aprecia a ~1640 cm-1 un hombro de la banda con mximo a ~1730 cm1). Estas envolventes complejas pueden, no obstante, descomponerse en sus
bandas constituyentes por mtodos matemticos.
Tambin puede complicar el espectro la aparicin de bandas
de sobretono y combinacin, el fenmeno conocido por resonancia de Fermi,
que duplica algunas bandas; o la existencia de enlaces de hidrgeno y otras
interacciones inter- e intramoleculares que pueden conducir a desplazamientos
de los nmeros de ondas esperados y a desdoblamientos de bandas.
Finalmente hay que tener en cuenta que los espectros de una misma sustancia
en fases slida, lquida y gaseosa no son iguales y que tambin influye el
mtodo de preparacin de la muestra en el aspecto del espectro.
A la hora de identificar los grupos funcionales con la espectroscopia IR vamos a
considerar el espectro de IR dividido en varias zonas tal y como se muestra en la
siguiente figura:
De 4000 a 2900 cm-1 : Tensin de C-H, O-H y N-H

De 2500 a 2000 cm-1 : Tensin de triples enlaces y dobles enlaces acumulados.
De 2000 a 1500 cm-1 : Tensin de C=O, C=N y C=C.
De 1500 a 600 cm-1 : Zona de la huella dactilar (Flexin de enlaces CH,CO,CN,CC,
etc..)
De acuerdo con dicha divisin se podrn identificar diversos grupos funcionales, tal
y como se indica en la siguiente Tabla:
GRUPO FUNCIONAL
OH
NUMERO
DE ONDA
(cm-1)
GRUPO
FUNCIONAL
NUMERO
DE ONDA
(cm-1)
3100-3200 -C C-
2300-2100
3600
~ 2250
(enlace de hidrgeno)
OH
-C N
(sin enlace de hidrgeno)
Cetonas
1725-1700 -N=C=O
~ 2270
Aldehdos
1740-1720 -N=C=S
~ 2150
Aldehdos y cetonas ,- 1715-1660 C=C=C

insaturados
~ 1950
Ciclopentanonas
3500-3300
1750-1740 NH
Ciclobutanonas
1780-1760 C=N-
1690-1480
cidos carboxlicos
1725-1700 NO2
16501500
14001250
Esteres
1750-1735 S=O
1070-1010
Esteres ,-insaturados
1750-1715 sulfonas
13501300
11501100
-Lactonas
1750-1735 Sulfonamidas y
sulfonatos
1370-1300
1180-1140
-lactonas
1780-1760 C-F
1400-1000
Amidas
1690-1630 C-Cl
780-580
-COCl
1815-1785 C-Br
800-560
Anhidridos
18501740(2)
600-500
C-I
INTERPRETACION DEL ESPECTRO DE MASAS
En el espectro de masas nos damos cuenta que el pico ms alto es de

119 el cual nos indica que es el peso molecular total de la molcula.
Tambin nos indica algo importante el peso molecular es impar el cual

nos refiere que hay presencia de nitrgeno en su composicin.
Por ser un peso molecular alto nos refiere que podra tratarse de un
anillo aromtico.
INTERPRETACION DEL ESPECTRO IR
DISCUSIN:
A.-Se observa una banda alrededor de3500-3000 que es caracterstica de

los OH.
B.-Las bandas sealadas con verde, conocidas como armnicos, nos

indican que estamos frente a una molcula aromtica.
C.- La banda sealada con azul es caracterstica de un nitrilo.
D.-La banda alrededor de 1481 nos indica flexin C=C.
E.- Las bandas alrededor 1200-1300 nos indica que es fenol.
INTERPRETACION DEL ESPECTRO DE 1H-RMN
2
solven
te
Se puede observar 2 seales,estas seales indica que hay 2 tipos de

hidrgeno distintos en la molcula.
Ambas seales se encuentran en el rango de 6.5 a 8, lo que significa que estos
hidrgenos pertenecen a un compuesto aromtico.
Tambin se puede observar que ambas seales estn acopladas y ms o
menos separadas entre s; por la forma que se encuentran se puede decir que
la molcula presenta compuestos disustituidos en posicin para.
(1
(2
(2
(1
Figura 1. Patrones RMN para anillos bencnicos

disustituidos
INTERPRETACION DEL ESPECTRO DE C/DEPT NMR
Segn el espectro observado existen cuatro seales diferentes para carbonos

Carbono con hibridacin sp. La seal expresa un carbono enlazado por un
triple enlace a otro tomo. Adems es un carbono sin hidrogeno por la ausencia
de la seal en la regin del espectro que indican los enlaces C-H.
Solucin de Ind-
Regin de los carbonos con hibridacin sp2. La seal expresa a los carbonos
enlazados por dobles enlaces. Esta regin del espectro es caracterstica de los
alquenos o de los anillos aromticos .Existen cuatro carbonos diferentes con
hibridacin sp2; esto quiere decir que posiblemente se trate de un anillo
aromtico mono sustituido o para sustituido.
Los carbonos en 120 y 160 ppm no tienen seal para los hidrgenos, lo cual
seala que se trata de un anillo aromtico di sustituido descartando la
posibilidad de un anillo aromtico mono sustituido. Los cuatro carbonos
restantes estaras enlazados a hidrgenos, esto se confirma al analizar las
seales en 115 y 135 ppm que presentan seal para el hidrogeno DEPT.
En la regin del espectro que muestra los enlaces entre carbonos e hidrgenos
no existe seal para el metileno (-CH2), sin embargo existen dos seales que
indican la presencia de un metilo (-CH3) o un -CH. Las seales en la tercera
lnea del espectro confirman que se trata de un -CH. Por lo tanto tenemos
cuatro carbonos sustituidos con un hidrogeno en cada uno de ellos.
H
H
H
H
Armando la molcula segn C/DEPT NMR tendramos:
ESPECTROS
MASS
IR
H-RMN
INFORMACION
Masa del compuesto :
119
Presencia de
nitrgeno (N)
Posiblemente es un
anillo aromtico
Presencia de un OH
en la formula.
Indica que es un anillo
aromtico.
Presencia de nitrilo
Es un fenol.
2 tipos de hidrgeno
distintos en la
molcula.
estos hidrgenos
pertenecen a un
compuesto aromtico.
la molcula presenta
compuestos
.disustituidos en
posicin para.
POSIBLE ESTRUCTURA
C/DEPT NMR
Hay un carbono
enlazado por un triple
enlace a otro tomo.
sin hidrogeno
Es un anillo
disustituido en
posicin para.
Tenemos cuatro
carbonos sustituidos
con un hidrogeno en
cada uno de ellos.
CONCLUSION
P-HIDROXIBENZONITRILO
NOMBRE (IUPAC) SISTEMTICO

1,7,7-Trimethylbicyclo[2.2.1]heptan-2-one
GENERAL
Frmula molecular
C10H16O1
BIBLIOGRAFA
Tutorial para la interpretacin de espectros de resonancia magntica
nuclear de protn, Juan A. Palop.
Organic Chemistry, Thomas N. Sorrell.
Spectral Database forOrganic Compounds SDBS, SDBS-1H NMR SDBS
No. 5625HSP-45-723.
http://triplenlace.com/2012/12/30/espectroscopia-infrarroja-ii-en-el laboratorio/http://www.ugr.es/~quiored/espec/ir.htm

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ELUCIDACION ESTRUCTURAL

H-RMN, y Carbono 13C-RMN y Espectrometra de Masas (EM).

Artculo principal: Tabla de correlaciones en espectroscopia infrarroja

Las absorciones se expresan en cm-1.

Conocer y hacer uso de las espectroscopias de infrarrojo, de masas,

Integrar las diferentes tcnicas de elucidacin estructural en la

Los valores exactos pueden encontrarse dentro de un intervalo de hasta 100

La figura anterior ilustra un espectro IR tpico (en transmitancia) en el que se

De 4000 a 2900 cm-1 : Tensin de C-H, O-H y N-H

(sin enlace de hidrgeno)

Aldehdos y cetonas ,- 1715-1660 C=C=C

INTERPRETACION DEL ESPECTRO DE MASAS

En el espectro de masas nos damos cuenta que el pico ms alto es de

Tambin nos indica algo importante el peso molecular es impar el cual

INTERPRETACION DEL ESPECTRO IR

A.-Se observa una banda alrededor de3500-3000 que es caracterstica de

B.-Las bandas sealadas con verde, conocidas como armnicos, nos

INTERPRETACION DEL ESPECTRO DE 1H-RMN

Se puede observar 2 seales,estas seales indica que hay 2 tipos de

Figura 1. Patrones RMN para anillos bencnicos

INTERPRETACION DEL ESPECTRO DE C/DEPT NMR

Segn el espectro observado existen cuatro seales diferentes para carbonos

Armando la molcula segn C/DEPT NMR tendramos:

NOMBRE (IUPAC) SISTEMTICO

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