Bio 2.1 Tema 1

Descargar como docx, pdf o txt
Descargar como docx, pdf o txt
Está en la página 1de 8

TEMA 1: BIOENERGÉTICA

1. Definiciones Principios de la Termodinámica Sistemas en Equilibrio Estados Estándar


2. Energía Libre y Equilibrio
3. Energética del transporte
4. ATP como moneda de cambio en Bioenergética
5. Acoplamiento de Reacciones Químicas
6. Concepto de compuesto rico en energía
7. El ATP como compuesto rico en energía
8. Otros compuestos fosforilados con enlaces ricos en energía
9. Adenilato quinasa y Otros nucleósidos y nucleótidos 5´-fosfatos
10. Introducción al metabolismo intermediario: Catabolismo y Anabolismo
11. El ciclo del ATP

1. DEFINICIONES.
Termodinámica: ciencia que estudia las relaciones entre el calor y las demás formas de energía

Sistema y Entorno: Un sistema puede ser cualquier objeto, cualquier cantidad de materia, cualquier región del
espacio, etc., seleccionado para estudiarlo y aislarlo (mentalmente) de todo lo demás, lo cual se convierte entonces
en el entorno del sistema: Sistema + Entorno = Universo

Según como interacciona el sistema con el entorno, puede ser de res tipos.

 Sistema aislado: no puede intercambiar materia ni energía con su entorno.


 Sistema cerrado: sólo puede intercambiar energía con su entorno, pero no materia.
 Sistema abierto: puede intercambiar materia y energía con su entorno.

Equilibrio: se define como aquel estado en que no ocurre ningún cambio físico o químico ulterior, y en el que la
temperatura, la presión y la concentración son uniformes en todo el sistema.

Estado inicial: es el contenido de energía del sistema y del entorno, al iniciar el proceso que se analiza.

Estado final: contenido de energía de sistema y entorno una vez que se ha alcanzado el equilibrio.

Funciones de estado: son magnitudes cuyas variaciones para un sistema aislado dependen de los estados inicial y
final exclusivamente, siendo independientes del camino seguido.

2. PRINCIPIOS DE LA TERMODINÁMICA.
2.1 Primer principio de la termodinámica.
Si un sistema está aislado su energía es constante. Si el sistema interacciona con su entorno su variación de energía
interna: ΔU = ΔQ - ΔW
ΔQ: calor absorbido( no es función de estado) ΔW: trabajo realizado ( no es función de estado)
El calor absorbido a presión constante: Qp= ΔU + PΔV = ΔH (entalpía, calor )  función de estado

 Reacción exotérmica: transcurre con desprendimiento de calor (ΔH<0), es el calor absorbido por el sistema.
 Reacción endotérmica: reacción que absorbe calor del entorno (ΔH>0)
 Si ΔH=0, entonces la reacción transcurre sin intercambio de calor.

2.2 Segundo principio de la termodinámica.


Si una reacción ocurre de una manera espontánea, libera calor, es irreversible, no se puede transformar todo ese
calor que se libera, en trabajo, de modo que no se podrá aprovechar todo el calor de las reacciones espontáneas(
ha pérdida de calor) .

1
La 1º ley de la termodinámica establece que si ocurre un suceso en el que por ejemplo, la mitad de un liquido se
enfría espontáneamente desde una T0 a T1, mientras que la otra mitad de su contenido se calentara desde T0 a T2 de
tal manera que los incrementos son iguales (T0 – T1 = T2 – T0) para que la cantidad de energía del sistema sea la
misma.

En un proceso espontáneo parte de la energía que se libera es en forma de calor, y no es posible convertir todo el
calor producido en trabajo. Así, una forma de enunciar el Segundo Principio de la Termodinámica es que es
imposible construir una máquina que, operando cíclicamente, no produzca otro efecto que la absorción de calor de
un depósito y su conversión en una cantidad equivalente de trabajo. A esa supuesta máquina se le conoce como
móvil perpetuo de segunda especie.

2.2.1 Entropía grado de desorden (función de estado):


La segunda ley establece algunas limitaciones en los tipos de transformaciones energéticas que ocurren en los
procesos físicos-químicos, y predice la dirección en que es probable que ocurra un proceso determinado.

Establece que todos los procesos tienden a evolucionar en una dirección tal que la entropía del sistema más la del
entorno, aumenta hasta alcanzar un estado de equilibrio.

La Entropía: se define como el grado de desorden del sistema. Siempre que ΔS>Q/T la reacción tendrá lugar
(proceso espontáneo)

2.3 Tercer principio de la termodinámica.


Se establece una referencia para los valores de la entropía (0).
● En un sólido cristalino a la temperatura del cero absoluto, 0 K, la energía de sus átomos es cero y no poseen
movimiento, por lo que existe un orden perfecto de sus átomos en la red cristalina.
● La entropía de los cristales perfectos de todos los elementos y compuestos puros es cero a la temperatura del cero
absoluto.
La entropía de los cristales perfectos de todos los elementos y compuestos puros es cero a 0ºK

3. SISTEMAS EN EQUILIBRIO.
Es un sistema que ha agotado su capacidad de realizar trabajo sobre su entorno. El proceso no puede invertirse de
modo espontáneo y volver a su estado inicial, lo cual requerirá una disminución de entropía. Un sistema
desordenado al azar no se reordena por si mismo espontáneamente. No se puede invertir el equilibrio de la
reacción, a que el proceso no sería espontáneo como consecuencia requeriría un gasto de energía.

 Los procesos que se realizan con aumento de entropía se denominan irreversibles.


 Los procesos reversibles son los que están en equilibrio (Entropía la Suniverso =0)
 Los procesos irreversibles son los que no están en equilibrio (Entropía la Suniverso > 0)
Siempre que ΔSsistema>Q/T la reacción tendrá lugar (proceso espontáneo)

4. ENERGÍA LIBRE GIBS( función de estado).

ΔS > Q/T; TΔS > Q; a P y Tª constante. Q = ΔH; TΔS > ΔH: ΔH – TΔS < 0 Función de estado ΔG = ΔH – TΔS

Si un proceso tiene lugar se cumple que ΔG < 0, ΔG = 0 en equilibrio a P y T constante el proceso se realizará
siempre que ΔG < 0, y la condición de equilibrio viene dada por ΔG = 0. Al símbolo G se le conoce como energía libre
de Gibs y queda definido como: G = H·T·S
Para una reacción a P y T constante:
ΔG = ΔH(cambios de calor o entalpía) – TΔS(cambios en el órden o desorden en el sistema)
 Si ΔG<0: la reacción será espontánea, libera energía exoergónica.
 Si ΔG=0: la reacción no transcurre en ningún sentido  equilibrio.
 Si ΔG>0: la reacción no transcurre en el sentido previsto, no espontánea, requiere energía  endoergónica.
2
ΔG nos da el balance energético y si el proceso es posible o no desde el punto de vista termodinámico.
Por el signo de AG nos permite averiguar en qué sentido se desarrolla la reacción.

5. ESTADOS ESTÁNDAR (SOLO DEFINE LAS CONCENTRACIONES)


Se define a presión de 1 atmósfera, a una concentración 1M para todas las especies que intervienen en el proceso, y
no se especifica la temperatura, depende de la temperatura. Esto significa que todo lo que hay en el sistema es 1 M
y si hay gases estos últimos son a 1 atm.

El estado estándar se representa con un cero como superíndice:

ΔGº (valor de la energía libre en condiciones estándar) = ΔHº - TΔSº

El estado estándar bioquímico,( solo reacciones biológicas) se diferencia del estado estándar solamente en que la
concentración de protones se define a 10-7 M en vez de 1M, siendo el pH = 7. Para indicar el estado estándar
bioquímico se añade una tilde al lado del superíndice. ΔGº’ = ΔHº’ - TΔSº’

6. ENERGÍA LIBRE Y EQUILIBRIO.


Supongamos una reacción general del tipo que: aA + bB  cC dD.

Se puede demostrar que la variación de energía libre para esta reacción, será : No es constante de equilibro,
solo es constante de
[𝐂]𝐜 [𝐃]𝐝
𝚫𝐆 = 𝚫𝐆𝟎 + 𝐑𝐓 · 𝐥𝐧 equilibrio , cuando vale 1 M.
[𝐀]𝐚 [𝐁]𝐛

Si el sistema se encuentra en equilibrio, las concentraciones serán concentraciones en equilibrio, el cociente es la


constante de equilibrio. A su vez, en el equilibrio. A su vez en el equilibrio ΔG = 0

ΔG = ΔG0 + RT·lnK = 0 ; ΔG0 = -RT·lnK

7. TRANSPORTE A TRAVÉS DE MEMBRANA (difusión de moléculas a través de la


membrana)
La variación de energía libre asociada al movimiento de un compuesto a través de una membrana (diferencia del
potencial químico p), viene dada por.
A (fuera)  A
G ®= R*T *ln( (A dentro )/(A fuera ) +  Gr º dentro)

Grº = 0, en procesos de difusión. G r = R*T * ln ((A) d/(A)f)

Todo este proceso nos vale, siempre y cuando no tenga carga la molécula.
Para una especie cargada debe considerarse el potencial eléctrico () que se genera a ambos lados de la
membrana. Grº = z* F*  (la diferencia de potencial que existe en la membrana) en procesos donde existe una
diferencia de potencial entre ambos lados de la membrana.

Gr =R*T *ln (( Cd/Cf)+ z*F *

F= cte de Faraday = 95, 5 kJ/mol V = 95.000 Cul/mol   = potencial de membrana (V0-V1) z = carga del ion afecta
al equilibrio.

La velocidad de energía libre es la misma, pero la velocidad es mayor si hay una proteína que interviene.

¿Qué pasa si estamos en equilibrio? Si existe un potencial de membrana, no hace falta que todo lo que esté fuera
esté dentro.

3
Ejemplo: Concentración de Sodio es de 10 mM dentro y 144 mM fuera, el potencial de membrana es de -100 mV
(por convenio V0-V1 fuera  dentro)

Gr (Na + fuera  Na+ dentro) =R*T *ln ((Na dentro/Na fuera)+ z*F *

Gr (Na + fuera  Na + dentro) = 8,1344 J/mol * K *(272+ 37) K * ln (10mM /144 mM) + 1*96480 C/mol K *(-100
*10^-3 *V)= -16522,7 J/mol es lo mismo que C= J/V

G (Na + dentro  Na + fuera) = + 16522,7 J/mol = + 16, 5 kJ / mol. La entrada de Sodio me da energía.

¿Cuánto ATP necesitaría para que pueda tener lugar el transporte de Na?

Na+ dentro  Na+ fuera G (Na + dentro  Na + fuera) = + 16522,7 J/mol = + 16, 5 kJ / mol.

ATP  ADP + Pi (regla de 3) Gº`= -30,5 kJ/mol

Na+ dentro + x ATP --< Na fuera + x ADP + x Pi G (NA+ dentro --< Na+ fuera ) + x Gº` (ATP --> ADP + Pi)

G (Na+ dentro Na+ fuera) + xG º` (ATP  ADP + P ) =0

+16522,7 J/mol --- x 30400 J /mol = 0 1 mol ATP  30500 J

X= 166522,7 /30500 =0,54 moles ATP /mol Na x moles de ATP  166522 , 7 J

El ATP necesario para el transporte de 1 mol de Na+ tendrá que ser > 0,54 moles ATP

El sodio no va a salir espontáneamente desde la célula hacia fuera, sino que se necesita subministrar energía.

8. ACOPLAMIENTO DE REACCIONES.
[𝐂][𝐃]
Gº 1 = -R*T*lnK1
𝐀 + 𝐁 <=> 𝐶 + 𝐷 𝐊𝟏 = [𝐀][𝐁]
𝚫𝐆𝟏𝟎 = −𝐑𝐓𝐥𝐧𝐊 𝟏

[𝐗][𝐘] Gº 2 = -R*T*lnK2


𝐂 <=> 𝐗 + 𝐘 𝐊𝟐 = [𝐂]
𝚫𝐆𝟐𝟎 = −𝐑𝐓𝐥𝐧𝐊 𝟐

[𝐃][𝐗][𝐘]
𝐀 + 𝐁 <=> 𝐷 + 𝐗 + 𝐘 𝐊𝟏 = 𝚫𝐆𝟑𝟎 = −𝐑𝐓𝐥𝐧𝐊 𝟑
[𝐀][𝐁]

[𝐃][𝐂] [𝐗][𝐘]
𝐊𝟑 = · = 𝐊𝟏 · 𝐊𝟐
[𝐀][𝐁] [𝐂]

−𝐑𝐓𝐥𝐧𝐊 𝟑 = −𝐑𝐓𝐥𝐧𝐊 𝟏 − 𝐑𝐓𝐥𝐧𝐊 𝟐 : 𝚫𝐆𝟑𝟎 = 𝚫𝐆𝟏𝟎 + 𝚫𝐆𝟐𝟎

8.1 Reacciones acopladas.


En las reacciones acopladas la energía liberada por la hidrólisis del ATP se utiliza para la conversión de sustancias en
productos. Utiliza el ATP para producir las reacciones no espontáneas. Si no acoplamos las reacciones, por si solas de
forma aislada no se producen de forma espontánea. C+D(acoplamiento) A+B

Por ejemplo: Gº (Kcal/mol)


1. Glucosa-6- fosfato ( es un compuesto rico en fructosa 6 fosfato +0,4
energía, pero es así porque su hidrólisis es rica en
energía)
2. fructosa 6 fosfato + ATP Fructosa 1 6 bis P + ADP -3,4
3. glucosa 6 P + ATP Fructosa 1 6 bis P + ADP -3
Hay algunas reacciones que no son espontáneas, pero si se acoplan con las reacciones de hidrólisis de ATP (
espontánea, muy exoergónica) , se puede dar una reacción global.

4
9. CONCEPTO DE COMPUESTO RICO EN ENERGÍA.
Vamos a calcular Gº de la siguiente reacción:

- fosfoglucomufasa (glucogenolisis)
- Glucosa-1-fosfato  glucosa-6-fosfato Keq = 19
- Fosfoglucomufasa (glucogenogénesis)

ΔG0 = -RTln(K’eq)
ΔG0 = -1,987 cal/mol·K ·298K·2,303log19=-1745cal/mol
Puesto que ΔG0 es negativo, la conversión de glucosa 1 fosfato en glucosa 6 fosfato es espontánea.
Hay dos tipos de reacciones que tienen lugar: oxidación y reducción.

A) El ATP como compuesto rico en energía:


El ATP fue aislado por primera vez, en 1929 por Fiske y Subbarow, de los extractos ácidos de músculo. En 1939-1941
Lipmann propuso que actuaba como medio principal de transferencia de la energía química en la célula.

[ATP] + [ADP] + [AMP] = 2-15 mM

En general [ATP] > [ADP] > [AMP]

Están presentes no sólo en el citoplasma sino también en orgánulos como mitocondrias y núcleo. Su
compartimentación intracelular constituye una característica importante en la regulación celular del metabolismo..

B) ATP COMO MONEDA DE CAMBIO EN BIOENERGÉTICA.

El sistema ATP-ADP actúa como transportador de energía química, ya que si el ADP es capaz de aceptar un grupo
fosfato en las reacciones acopladas productora de energía del catabolismo, y el ATP así formando puede ceder su
grupo fosfato terminal, en otras reacciones acopladas que requieren energía.

C) ATP COMO COMPUESTO RICO EN ENERGÍA

Siempre que se libera el fosfato γ, hay α y β también:

ADENOSINA TRIFOSFATO ADENOSINA

ADENINA

RIBOSA

La cantidad de ATP es mayor que en ADP, sin embargo en el citosol no se encuentran libres, si no que se
encuentran compensados con Mg.

En la célula existen muy pocas cantidades de ATP y ADP en forma de aniones libres, se hallan en complejos con Mg
(ATP-Mg) a causa de la gran cantidad de los grupos pirofosfato para unir cationes divalentes y de elevada

5
concentración del ión Mg2+ con el fluido intracelular. La afinidad del ATP por el Mg2+ es unas 10 veces mayor que la
del ADP.

D) EFECTO DEL PH

ATP + H2O  ADP + HPO4 2- + H+

E) DETERMINACIÓN DE Gº

Determinación de ΔG0: ATP + H2O  ADP + Pi Determinar Keq y de ahí ΔG0 ΔG0 = -RTlnK0eq

Para poder medir el ΔG0, la hidrólisis del ATP se descompone en varias etapas que pueden medirse más fácilmente:
hexoquinas
a → ADP + Glucosa-6-P K’eq = 661; ΔG0 = -4 Kcal/mol
ATP + Glucosa
fosfatasa
Glucosa-6-P + H2O→( hidroxilación) Glucosa + Pi K’eq = 171; ΔG0 = -3,3 Kcal/mol

ATP + H2O → ADP + Pi K’eq = 1,13 · 10-5; ΔG0’= -7,3 Kcal/mol a 37ºC

ATP + H2O → ADP + Pi ΔG0’= -7,3 Kcal/mol (Rompe enlace anhídrido (Pi-O-Pi)
ADP + H2O → AMP + Pi ΔG0’= -7,3 Kcal/mol (Rompe enlace anhídrido (Pi-O-Pi)
AMP + H2O → Adenosina + Pi ΔG0’= -3,4 Kcal/mol (Rompe enlace éster (Pi-O-ribosa)
Carga energética o la carga de Adenilato es la cantidad de ATP que ha disponible en la célula.

10. OTROS COMPUESTOS FOSFORILADOS RICOS EN ENERGÍA.


Hay dos clases de compuestos fosforilados que poseen una ∆Gº de hidrólisis más negativa que la del ATP:

A) Los compuestos fosfato que se forman durante la ruptura enzimática.


Son el 1,2-BPG y el PEP, los cuales se forman durante la glucolísis.
1,3-BPG + ADP → ATP + H2O ΔG0= -4,5
ATP + H2O → ADP + Pi ΔG0= -7,3
Total: ΔG0= -11,8 Kcal/mol
B) Los fosfatógenos: fosfocreatina (hallada en muchos vertebrados) y Compuesto ΔG de hidrólisis
de fosfoarginina (invertebrados). El equilibrio se halla desplazado a la
Fosfoenol piruvato -14,8
formación de ATP. Son compuestos fosfato utilizados como
Carbamil-fosfato -12,3
almacenadores de la energía.
Fosfocreatina + ADP → creatina + ATP Fosfocreatina -10,3
Fosfoarginina + ADP → arginina + ATP ATP/ADP -7,3
AMP -3,4
La fosfocreatina + ATP es usado en los ejercicios intensos. Glucosa-6-P -3,3
En concentraciones 1M. Glicerol-1-P -2,2

C) Carga energética (Nivel de Adelinato)


Adenilato quinasa: AK o mioquinasa, es una fosfotransferasa de nucleótidos de adenina que participa en la
homeostásis de la energía de las células y en la biosíntesis de nucleótidos de adenina. Eso lo hace el músculo. Odo el
ADP se convierte en ATP, para las necesidades de los músculos.
2ADP  ATP + AMP /
Keq= 1; ΔGo = 0 Carga energética: [ATP] + ½ [ADP] [ATP ]+[ADP]+[AMP]
En el músculo: [ATP] = 7-10 [ADP] ATP > 100 [ADP]
- Los valores energéticos cercanos a 0,85 indican existencia de equilibrio entre los procesos de generan ATP y los
que lo utilizan.
- Los valores inferiores a 0,85 activan los procesos generadores de ATP.
6
Se han identificado 5 isoenzimas:

 AK1: interviene en procesos neuronales, espermatozoides y en el citoesqueleto de células cardiacas.


 AK2,3 y 4:
 AK2: se encuentra en el espacio intermembranal, implicado en la regulación del ritmo circadiano como un
reloj metabólico.
 AK3: se encuentran en la matriz mitocondrial de los tejidos. Participa en el mantenimiento y actividad celular.
 AK4: Se encuentra en la matriz mitocondrial, riñón, cerebro, corazón e hígado.
 AK5: solo se encuentra en algunas zonas del cerebro.

D) Otros nucleósidos y nucleótidos 5-fosfato.


Participan en la transferencia de Pi los 5’-di y tri-Pi-ribonucleósidos y los 2-
desoxirribonucleótidos.

nocleótido difosfato
quinasa
ATP + Nu-diP → ADP + Un-triP

11. INTRODUCCIÓN AL METABOLISMO INTERMEDIARIO:


CATABOLISMO Y ANABOLISMO.
El metabolismo se divide en catabolismo y anabolismo:
El catabolismo es la degradación enzimática, mediante reacciones de oxidación, de moléculas nutritivas
relativamente grandes (carbohidratos, lípidos y proteínas) procedentes del entorno de la célula o de sus propios
depósitos de reservas nutritivas, hasta transformarlas en moléculas simples y menores, por ejemplo, ácido láctico,
ácido acético, CO2, amoníaco o urea. El catabolismo va acompañado de liberación de energía libre, la cual se
conserva en el ATP.

El anabolismo es la síntesis enzimática de componentes celulares relativamente grandes de la célula, ejemplo:


polisacáridos, ácidos nucleicos, proteínas, lípidos a partir de moléculas precursoras sencillas. Puesto que los procesos
sintéticos provocan un aumento en el tamaño y la complejidad de las estructuras, se necesita la energía
proporcionada por el enlace fosfato del ATP.

12. EL CICLO DEL ATP.


Es el ciclo de hidrólisis y regeneración de ATP que se
lleva a cabo en la célula, es una reacción exergónica que
nos ayuda a producir energía, acoplándola a reacciónes
endergónicas como la síntesis de cualquier molécula.
También se usa en la transmisión del impolso nervioso
para mantener el equilibrio de iones. También en la
contracción muscular.

Para la síntesis de ATP acopla el ADP a reacciónes


exergónicas como la respuesta celular, es decir,
procesos que liberan energía.

La energía de las reacciones endoergónicas (por


ejemplo la síntesis de proteínas, transmisión nerviosa,
contracción muscular)

La energía de las reacciones exoergónicas ( por ejemplo:


respiración celular)

7
8

También podría gustarte