Traducción
Traducción
Traducción
Traducción
52
CAPÍTULO 6 • Traducción 53
Tercer nucleótido
Primer nucleótido
U
CUU CCU CAU CGU se encuentran los nucleótidos en el ADN, que determina el
Extremo 3’
Extremo 5’
Histidina
C
C CUC CCC CAC CGC Arginina
CUA
Leucina
CCA
Prolina
CAA CGA A ordenamiento que se tiene al momento de ser transcrito a
Glutamina
CUG CCG CAG CGG G
un ARNm y, por ende, define la secuencia de aminoácidos
AUU ACU AAU Asparagina AGU Serina
U
que tendrá una proteína.
A AUC Isoleucina ACC AAC AGC C
Treonina
AUA ACA AAA Lisina AGA Argenina
A
AUG Metionina ACG AAG AGG G
Cuadro 6-1. Degeneración del código genético. Es una característica del código genético y se refiere a que existen
más codones distintos de los necesarios para guardar la información genética.
Triptófano 1 Isoleucina 3
Asparagina 2 Alanina 4
Aspartato 2 Glicina 4
Cisteína 2 Prolina 4
Glutamina 2 Treonina 4
Glutamato 2 Valina 4
Histidina 2 Arginina 6
Lisina 2 Leucina 6
Fenilalanina 2 Serina 6
54 PARTE I • Conceptos básicos de biología molecular
Cuadro 6-2. El código genético es casi universal. Se le considera así, porque es el mismo para todos los organismos existentes,
con excepciones mínimas, observadas en mitocondrias y en algunos protistas.
tipos diferentes de aminoácidos. Cuando un aminoácido al citoplasma el mensaje contenido en el ADN a los sitios de
puede ser traducido por dos, tres, cuatro y hasta seis codo- síntesis proteica (los ribosomas).
nes diferentes, estos tripletes son conocidos como “sinóni- Las moléculas de ARNt son de pequeño tamaño con
mos”, y no todos pueden ser reconocidos por el mismo estructura de bucles y son los ARN encargados de transpor-
anticodón, por lo que en estos casos se observan dos o tres tar al aminoácido hasta el ARNr, donde serán unidos, uno
ARNt distintos, que pueden transportar el mismo aminoá- tras otro, mediante enlaces peptídicos. La enzima ami-
cido, pero con diferentes anticodones. noacil-ARNt-sintetasa es la encargada de dicha unión, en
Los tres codones restantes (UAA, UGA y UAG) tienen un proceso que consume ATP. Los ARNt contienen en su
la función de terminar la traducción de una secuencia secuencia al anticodón, un triplete de bases que se encuen-
nucleotídica; esto es, que una vez que se ha agregado el últi- tra en el asa central del ARNt, en las posiciones 34, 35 y 36,
mo aminoácido que conforma la proteína en la cadena poli- que se une de manera complementaria con el codón del
peptídica, mandan señales de paro para detener el proceso ARNm, durante la síntesis de una proteína, con la finalidad
de traducción e informar a la célula que la síntesis proteica de introducir un aminoácido específico a la cadena polipep-
ha finalizado. Estos tripletes reciben el nombre de codones tídica naciente.
de terminación, de paro o sin sentido. El dominio del anticodón está implicado de manera
Otra característica del código genético es su universali- lejana en la discriminación entre las formas de iniciación y
dad, ya que hasta hace poco se consideraba que desde las elongación del ARNt y en las funciones alternas del ARNt,
bacterias hasta el hombre, la interpretación de los codones tales como la iniciación de la transcriptasa inversa en los
por aminoácidos era igual en todas las células de todas las retrovirus.
especies, es decir, que todas “leen” los genes de la misma El ARNr es el tipo de ARN más abundante en las células
manera. Hoy por hoy, se conoce que esto no es totalmente y forma parte de los ribosomas, que son las estructuras
cierto, ya que se han encontrado excepciones en las mito- citoplasmáticas responsables de la biosíntesis proteica.
condrias humanas, en otros mamíferos y en ciertas bacte- Como los otros ARN, el ARNr está formado por una
rias. Por tanto, es más correcto afirmar que el código sola hebra nucleotídica, con bases complementarias en
genético es casi universal (cuadro 6-2). algunas regiones, lo que le permite adquirir una estructu-
ra secundaria especial. Se denomina según su coeficiente de
sedimentación, medido en Svedbergs (S) y, de esta manera,
Componentes del complejo traduccional en organismos procariotas existen tres ARNr distintos: 5S,
16S y 23S y en organismos eucariotas cuatro: 5S, 5.8S, 18S y
La traducción ocurre en el citoplasma de la célula, con la
28S.
formación del complejo traduccional, formado por tres
El ARNr forma parte de los ribosomas, los cuales están
tipos de ARN, mensajero (ARNm), de transferencia (ARNt)
formados por dos subunidades llamadas subunidad menor
y ribosomal (ARNr).
y subunidad mayor (figura 6-2). En el proceso de traducción
El ARNm es una molécula de ácido nucleico de cadena
el ribosoma tiene dos funciones:
sencilla que contiene la información genética almacenada
en el ADN y su secuencia es complementaria a una de las • Permitir la unión del ARNm al ARNt, proporcionando
cadenas del ADN, a la que se la llama cadena molde. Pre- los sitios donde interactúan el codón del ARNm con el
senta una disposición de tripletes de nucleótidos o codones, anticodón del ARNt.
esto es, que están agrupados de tres en tres de manera • Catalizar la transferencia del aminoacil-ARNt (ARNt
secuencial, los cuales determinan la secuencia de aminoáci- unido a su aminoácido) al peptidil-ARNt (ARNt unido
dos en la proteína. Dicho de otro modo, esta molécula se a la cadena peptídica naciente o creciente), siguiendo la
obtiene mediante la transcripción, en la cual secuencias secuencia de codones del ARNm, según las equivalen-
específicas de ADN son copiadas a ARNm, que transporta cias del código genético.
CAPÍTULO 6 • Traducción 55
Fenómeno de bamboleo
La interacción codón/anticodón ocurre básicamente con la
E P A
teoría de complementariedad de base establecida por Wat-
son y Crick, por lo que debería de existir igual número de
anticodones que de codones, es decir 61; sin embargo, se
sabe que existen menos de 61 ARNt, por lo que se deduce
que un ARNt puede complementarse con más de dos codo-
nes diferentes.
Subunidad menor
El reconocimiento se da entre la complementariedad de
las bases 1, 2 y 3 del codón con las bases 3, 2 y 1 del anticodón,
Figura 6-2. Estructura del ribosoma. Complejo molecular formado
respectivamente (figura 6-3A). Para explicar este fenómeno
por dos subunidades (mayor y menor). Es el encargado de sinte-
tizar proteínas a partir de la información contenida en el ARNm. se estableció la hipótesis de bamboleo o fluctuación, que
expresa dos reglas:
1. Las bases tercera y segunda del anticodón forman puen-
El ribosoma cuenta con tres sitios llamados A, P y E tes de hidrógeno con las bases primera y segunda del
(figura 1). Los dos primeros sitios se encuentran en ambas codón, lo que determina la especificidad de la interac-
subunidades del ARNr y participan directamente en la ción codón/anticodón.
decodificación del ARNm. El sitio P (centro P o peptidilo) 2. La primera base del anticodón puede orientarse o girar-
es donde se localiza al peptidil-ARNt y, por lo tanto, donde se de formas ligeramente distintas (bamboleo o fluctua-
se observa la elongación de la cadena peptídica, mientras ción), para interaccionar con distintas bases en la
que en el sitio A (centro A o aminoacilo) es el lugar por el posición tercera del codón (figura 6-3B). Estas uniones
cual el aminoacil-ARNt (correspondiente a la lectura del presentan enlaces de hidrógeno diferentes a los obser-
codón) entra al complejo traduccional, para después trans- vados en las bases tercera y segunda. Debido a esto, la
ferir este aminoácido al peptidil-ARNt y generar el enlace interacción codón/anticodón es más débil.
peptídico. El centro catalítico donde se genera este enlace se
localiza en la subunidad mayor. En cambio, el sitio E (centro Dicho de otra manera, esta hipótesis ocurre entre la ter-
Eliminación o salida) es el lugar por donde saldrá del com- cera base del codón y la primera base del anticodón. Las
plejo ribosomal el ARNt sin aminoácido, una vez que lo reglas originales del bamboleo sugirieron que el primer
dejó en la cadena polipeptídica en formación. nucleótido del anticodón podía complementarse con más
de un nucleótido en la tercera posición del codón. Así, los
Interacción codón/anticodón anticodones con un uracilo en la primera posición podían
unirse con los codones que tenían adenina o guanina en
La interacción codón/anticodón permite al ARNm, diri- la tercera posición. Los que presentaban una guanina en la
gir el orden de incorporación de los aminoácidos dentro de posición 3, podían unirse con los codones que terminaban
la cadena polipeptídica. Estas interacciones ocurren dentro con uracilo o citosina. Pero algo más interesante se observó
de la subunidad menor. cuando el ARNt que presentaba una inosina en la posición
La interpretación de un codón requiere el principio de 3 podía reconocer los codones que terminaban con citosi-
complementariedad de bases con el anticodón del aminoacil- na, uracilo o adenina. Por ejemplo, el ARNt-Ala de la leva-
ARNt correspondiente. Los tripletes complementarios se dura, anticodón 5’-IGC-3’, se puede unir a tres codones:
aparean no sólo por acoplamiento de AU y de GC, sino que 5-GCC-3’, 5’-GCU-3’ y 5’-GCA-3’.
también el ribosoma controla el ambiente, de manera tal
que el acoplamiento convencional ocurra en las primeras dos
posiciones del codón, pero se permiten reacciones adiciona- Fases de la traducción
les en la tercera base. En consecuencia, un solo aminoacil-
La biosíntesis de las proteínas se divide en las siguientes
ARNt puede reconocer más de un codón. Además, el
fases o estadios (cuadro 6-3):
apareamiento de interacciones también puede influir en la
introducción de bases especiales en ARNt, en especial por • Fase de activación de los aminoácidos.
modificaciones en el anticodón o cerca de él. La tendencia • Fase de traducción, que comprende:
para que los aminoácidos “similares” sean representados por – Inicio de la síntesis proteica.
56 PARTE I • Conceptos básicos de biología molecular
P
B P
AA
AA Aminoácido de
alta energía
Aminoácido
ATP AMP
específico
A Aminoácido
Metionina AA
2 ATP
Metionina
2 Pl + AMP ARNt específico
P
AT
ARNt Sitio del aminoácido AA
Aminoacil Sitio del ATP
sintetasa Sitio de ARNt AMP
AMP
PNAt Inicio del ciclo
2 Pl + AMetionill -PNAt
AA
AA
ARNt cargado
Figura 6-4. Activación de los aminoacil-ARNt. Proceso que requiere de la hidrólisis de ATP en dos reacciones secuenciales, que se
catalizan en la enzima, la aminoacil-AENt sintetasa. Primero, la enzima une el aminoácido al fosfato del ATP con la liberación con-
comitante de pirofosfato. Esto es llamado un intermediario aminoacil-adenilato. En el segundo paso, la enzima cataliza la trans-
ferencia del aminoácido a los OH (2’ o 3’) de la porción de ribosa del residuo de adenosina 3’ terminal del ARNt generando un
aminoacil-ARNt activado. Aunque esta reacción es libremente reversible, la reacción hacia delante es favorecida por la hidrólisis
acoplada del PPi.
Cuadro 6-4. Maquinaria necesaria para llevar a cabo la traducción de una proteína. Diferencias entre procariotas y eucariotas.
Eucariotas Procariotas
ARNr 80S 70S
Met Met
EF-G (en bacterias) o EF-2 (en eucariotas), lo que permite
que se realice un desplazamiento del ribosoma (tres nucleó-
A
EF-Ts
TRY
GTP EF-Tu-Ts
EF-Ts
EF-G
EF-Tu-GTP
M
EF-Tu
et
GTP
TR
E GTP GDP+Pi E E
3’ 5’ 3’ 5’ 3’ 5’
P A P A P A
A B C
Sar
M M M
et et et
TR TR TR
Y Y Y
E E
3’ 5’ 3’ 5’ 3’ 5’
P A P A E P A
F E D
Figura 6-6. Fase de elongación: segunda etapa de la biosíntesis proteica, requiere proteínas específicas llamadas EF. El alarga-
miento de polipéptidos se produce en forma cíclica, de tal manera que al final de un ciclo completo y la formación de un enlace
peptídico, el sitio A estará libre de aminoácidos y se preparará para aceptar el aminoacil-ARNt entrante dictado por el siguiente
codón del ARNm.
CAPÍTULO 6 • Traducción 59
Mat Mat
Try Try
Ts Ts
Pro Pro
Ch Ch
Val Val
Atm Atm
LB LB
Tm Tm
Hls Hls
A
E A E RF1
GUA GUA
3’ 5’ 3’ 5’
C AU UGG C AU UGG
P P
Mat
Try
Ts
Pro
at
M Try Ts ro Ch
P Ch al m Val
V At B Atm
L Tm ls
H LB
Tm
Hls
E
P
A A
E
GUA
3’ 5’ 3’ 5’
C AU UGG
P
RF1
P A
Figura 6-7. Biosíntesis de proteínas (terminación): tercera etapa de la biosíntesis proteica, requiere de factores de terminación (RF).
Las señales para la terminación de la síntesis proteica son las mismas tanto en procariotas como en eucariotas. Estas señales son
codones de terminación (UAG, UAA y UGA) y se encuentran presentes en el ARNm.
molécula de GTP para permitir que el polipéptido recién de liberación y del ARNt para la siguiente síntesis proteica.
sintetizado se libere del complejo traduccional y, al mismo Una vez finalizada la síntesis de una proteína, el ARNm
tiempo, permite que se disocie la unión entre el ARNr y el queda libre y puede leerse de nuevo. De hecho, es muy fre-
ARNm (figura 6-7). cuente que antes de que finalice la síntesis de una proteína
La terminación de la traducción requiere de dos RF: ya esté comenzando otra, con lo cual una misma molécula
de ARNm está siendo utilizada por varios ribosomas de
a) Factores clase I, también llamados factores de libera-
forma simultánea. Cuando esto se observa, a la estructura
ción específicos de codón (RF-1 y RF-2 para procariotas
que se forma (como un rosario) se le llama polirribosoma
y eRF-1 para eucariotas).
o polisoma.
b) Factores clase II, también llamados factores de libera-
ción no específicos (RF-3 en procariotas y eRF-3 en
eucariotas) que une un nucleótido de guanina.
Cuando los RF reconocen correctamente el codón de
paro, el centro de transferencia o de formación del enlace
peptídico dentro del ARNr (llamado dominio V en la subu-
nidad mayor) cambia el modo catalítico e hidroliza al pep-
tidil-ARNt, lo que permite la liberación de la cadena
peptídica del ARNt. Ya libre el péptido, el complejo traduc-
cional se disocia por un factor de reciclaje del ribosoma
denominado factor de terminación (RRF en bacterias), y
permite con esto la reutilización del ARNr, de los factores