TUM - Cap.9biología Molecular Salazar PDF
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CAPÍTULO 9 • Mecanismos de reparación del ADN 83
A) A) H
N
Br O.... H N
H H
N O
H
N N
Desaminación N H.... N N
O O N N
N N O
Adenina
Citosina Uracilo 5-BU en forma
cetónica
B)
O O B)
NH N
4 CH3 HN
HN Br O-
3 6 O
OH O
2 7
O 1 OH N N
N H NH2 N.... H N N
dR
dR
8-Oxo-hidroxiguanosina
Glicol de timidina (8-Oxo-G) N N
O.... H N
Figura 9-1. Desaminación y daño oxidativo de las bases.
5-BU en forma H
cetónica Guanina
ción de su ARNm, ya que altera la secuencia codificadora Figura 9-2. Análogos de bases.
en su marco de lectura correcto.
Análogos de bases. Son compuestos químicos con
estructura similar a la de las bases nitrogenadas normales y den alterar la secuencia codificadora o reguladora de un gen
se pueden incorporar al ADN en lugar de éstas. Debido a e impedir el uso del ADN como plantilla para la replicación
que los análogos de bases presentan diferencias estructura- y transcripción.
les con las bases convencionales, se aparean de forma in-
correcta, lo que provoca errores frecuentes en el proceso de
replicación. El 5-bromouracilo (5BrU) es análogo de la timi- Sistemas de reparación del ADN
na que contiene un bromo en el carbono 5. En su forma
Para minimizar el daño del material genético el organismo
cetónica, el 5BrU forma un par de base con la adenina,
dispone de diversos sistemas de reparación que se activan
mientras que en su forma enólica lo hace con la guanina. Si
dependiendo del tipo de daño provocado en el genoma.
se incorpora la forma cetónica del bromouracilo, se produce
Estos mecanismos de reparación se pueden clasificar en
una transición AT-GC y si se incorpora la forma enólica
cuatro categorías: reparación directa, reparación por esci-
se produce una transición GC-AT (figura 9-2).
sión, reparación de emparejamientos erróneos (aparea-
Energía ionizante. La exposición del ADN a la luz
mientos incorrectos) y reparación de roturas de doble
ultravioleta (UV) produce dímeros de pirimidinas, sobre
cadena.
todo de timinas, cuando hay dos timinas consecutivas en la
misma cadena de ADN. La luz UV produce que se formen
enlaces covalentes entre dos pirimidinas contiguas, lo que Reparación directa
interfiere con la unión normal de las bases nitrogenadas con La reparación directa involucra sistemas que eliminan
la cadena complementaria. La radiación UV induce también directamente el daño en el ADN inmediatamente después
transiciones GC–AT, transversiones, mutaciones con cam- de producidos. Este tipo de reparación no es muy común,
bio de marco de lectura, duplicaciones y deleciones (véase el ya que hay algunos daños en el ADN irreversibles. La fo-
capítulo 8). La radiación ionizante produce daño directo en torreactivación es el mecanismo de organismos procariotes
las bases nitrogenadas del ADN e induce la gene-ración de mediante la enzima fotoliasa para reconocer los dímeros de
especies reactivas de oxígeno. Además, produce roturas del pirimidinas producidos por la luz UV. Esta enzima se une al
enlace N-glucosídico que conducen a la formación de sitios dímero de timina y utiliza la energía de la luz para romper
apurínicos, así como rompimientos en la doble cadena del los enlaces covalentes entre las pirimidinas, con lo que logra
ADN, responsables de efectos letales en la célula. Estas lesio- que vuelvan a formar complementariedad con la cadena
nes ocasionan cambios permanentes en el ADN que pue- antiparalela (figura 9-3). Otro tipo de enzimas que partici-
84 PARTE I • Conceptos básicos de biología molecular
A G T G T T C A C G A G T G T T C A C G A G T G T T C A C G
T C A C A A G T G C T C A C A A G T G C T C A C A A G T G C
pan en este sistema de reparación son las alquiltransferasas, UvrA y UvrB se unen para formar un complejo que se
enzimas que eliminan los grupos alquilos de la guanina y encarga de reconocer las distorsiones en la cadena de ADN.
restauran la estructura original, sin la necesidad de alterar el Una vez que localizan el daño, UvrA se disocia del complejo;
esqueleto del ADN. UvrB separa la doble cadena de ADN; a continuación, UvrC
se une a UvrB, y el complejo corta a siete nucleótidos de
Sistemas de reparación por escisión:
reparación por escisión de bases y
reparación por escisión de nucleótidos A G T G T T U A C G
Reparación por escisión de bases
El sistema de reparación por escisión de bases (base excision T C A C A A G T G C
repair, BER) elimina del genoma las bases dañadas que se
producen por alquilación, radiación ionizante, oxidación
y desaminación. En este sistema intervienen las enzimas La glucosilasa elimina
denominadas ADN glucosilasas, de las cuales existen por lo la base dañada
menos ocho tipos distintos específicos para cada lesión. La
reparación se realiza hidrolizando el enlace glucosídico
entre la base nitrogenada y el azúcar, con lo que se elimina la A G T G T T A C G
base dañada. Esta rotura genera sitios apurínicos o apirimi-
dínicos reconocidos por una AP endonucleasa 1 (APE-1)
T C A C A A G T G C
que rompe el enlace fosfodiéster adyacente. Posteriormente,
la ADN polimerasa β adiciona los nucleótidos para rellenar
el hueco generado empleando la cadena que no está dañada La endonucleasa corta el ADN
como molde. El fragmento recién sintetizado forma el enla- y la exonucleasa elimina los
ce fosfodiéster faltante para su ligación gracias a la ligasa nucleótidos
(figura 9-4).
A G T G C G
Reparación por escisión de nucleótidos
El sistema de reparación por escisión de nucleótidos
T C A C A A G T G C
(nucleotide excision repair, NER) reconoce cualquier lesión
que provoque una distorsión importante en la doble cadena
del ADN. Implica en primer lugar el reconocimiento del La polimerasa I rellena el hueco
daño en la secuencia del ADN; posteriormente, una endo- generado y se liga el fragmento
nucleasa hidroliza los enlaces fosfodiéster a cada lado y
varios pares de bases de distancia de la lesión, y se elimina
el fragmento de ADN de cadena sencilla que presenta la
lesión. El hueco que se genera por la rotura se rellena con A G T G T T C A C G
ayuda de la ADN polimerasa I y, por último, la ligasa sella la
cadena que se sintetiza. Defectos en las proteínas de este
T C A C A A G T G C
sistema provocan el síndrome xeroderma pigmentosa (XP).
En Escherichia coli esta reparación la llevan a cabo cua-
tro proteínas: UvrA, UvrB, UvrC y UvrD (UV resistant). Figura 9-4. Reparación por escisión de bases.
CAPÍTULO 9 • Mecanismos de reparación del ADN 85
a
in
gu ón
5´ 3´
an
T T restaura la base
la aci
C T A G T T G C A C G C T A G A C G
d e xid
incorrecta
G A C T G A
O
G A T C A A C G T G C A A G A T C T G C G A C T G A G A C T G A
3´ 5´
C T G A C T C T G A A T C T G A C T
Unión con la adenina
UvrA UvrB
5´ 3´
Figura 9-6. Sistema de reparación GO.
T T
C T A G T T G C A C G C T A G A C G
G A T C A A C G T G C A A G A T C T G C
3´ 5´
3´ 5´ cadena hija
C T A G T T G T A C G A G C T A G A C G
G A T C A A C G T G C T C G A T C T G C
5´ 3´ cadena molde
(Metilada)
Eliminación de la base mal apareada y
la polimerasa añade la base correcta
T T G T A C G A G C T A G
3´ 5´ cadena hija
C T A G A C G
G A T C A A C G T G C T C G A T C T G C
5´ 3´ cadena molde
3´ 5´ cadena hija
C T A G T T G C A C G A G C T A G A C G
G A T C A A C G T G C T C G A T C T G C
5´ 3´ cadena molde
es la reparación por escisión de nucleótidos (NER), que tra- recombination 11), RAD50 y NBS1 (Nijmegen breakage syn-
tará de corregir el daño sin un encendido total de la vía drome 1). Además, intervienen otros genes, como BRCA1 y
SOS. Si el sistema NER no es suficiente para la reparación BRCA2 (cáncer de mama 1 y 2). En humanos, RAD51 des-
del ADN, las concentraciones de LexA disminuyen y se empeña un papel primordial en los mecanismos de recom-
expresan genes como sulA, umuD y umuC (UV-induced binación homóloga para la reparación de roturas en la doble
mutagenesis). La proteína SulA se une a FtsZ (molécula indis- cadena del ADN. La recombinación homóloga implica gas-
pensable para el inicio del ciclo celular) y detiene la división to e hidrolisis de adenosín trifosfato (ATP) para el inter-
celular. Con ello, se induce al sistema de reparación Umu- cambio de la cadena de ADN, por secuencias homólogas. El
DC dependiente de mutagénicos. primer paso para la reparación por recombinación homólo-
ga involucra la activación del gen de la ataxia-telangiectasia
Reparación de roturas de doble cadena mutado (ataxia telangiectasia mutated, ATM) que recluta
el complejo MRN para que se una al ADN y, por su acti-
Reparación por recombinación homóloga vidad de exonucleasa 5’-3’, procesa los extremos donde ocu-
Es un sistema de reparación preciso que actúa durante la rrió el daño dejando expuestos los extremos 3´ en forma de
fase S del ciclo celular. Durante el proceso de replicación, cadena sencilla. A continuación, la proteína de replicación
este sistema se induce por la necesidad de tener una copia A (RPA) se une al ADN de cadena sencilla e interactúa con
de ADN correcta que sirva como molde para restaurar la RAD52; éste es desplazado por BRCA2, que atrae a RAD51.
información perdida en la cadena dañada. En este sistema Por último, RAD51 se une a la cadena sencilla y forma una
de reparación están involucrados los genes que pertenecen nucleoproteína filamentosa con el ADN. Con ayuda de
al grupo de epistasia de RAD52 (radiation sensitive mutant RAD54 invade la hélice homóloga que sirve como molde
52), como RAD50, RAD51, RAD52, RAD55, RAD57, para restaurar el fragmento dañado (figura 9-9). Alteracio-
RAD59 y el complejo MRN formado por MRE11 (meitoic nes en las proteínas que participan en este sistema provo-
CAPÍTULO 9 • Mecanismos de reparación del ADN 87
5´ 3´
C T A G T T G C A C G T T C T A G A C G A
G A T C A A C G T G C A A G A T C T G C T
3´ 5´
Doble cadena de ADN
5´ 3´
A C G T A G T A A T G C T A T C T A T C G
T G C A T C A T T A C G A T A G A T A G C
3´ 5´
5´ 3´ 3´
A C G T A G T A A T C T A T C G
T G C A T G A T A G A T A G C
3´ 3´ 5´
5´ 3´
C T A G T T G C A C G T T C T A G A C G A
G A T C G T A G A T C T G C T
3´ 5´
Recombinación homóloga
5´ 3´
A C G T A C G T G C A T C T A T C G
T G C A T C A T A T A G A T A G C
3´ 3´ 5´
5´ 3´
C T A G T T G C A C G T T C T A G A C G A
G A T C G T A A T G G A T C T G C T
3´ 5´
Reparación del fragmento
5´ 3´
A C G T A C G T G C A T C T A T C G dañado
T G C A T C A T T A C G A T A G A T A G C
3´ 5´
5´ 3´
C T A G T T T A A T G C T A T C T A T C G
G A T C A A A T T A C G A T A G A T A G C
3´ 5´
FANCF, FANCG, FANCI, FANCJ, FANCL). Los defectos en neuronal progresiva, telangiectasia ocular, inmunodeficien-
cualquiera de los genes de anemia de Fanconi conllevan cia, hipogonadismo, envejecimiento prematuro, inestabili-
inestabilidad genómica y un riesgo elevado de presentar dad genómica y predisposición al cáncer. A nivel celular, se
leucemias y carcinomas. El descubrimiento de BRCA2 presenta inestabilidad cromosómica, hipersensibilidad a las
como uno de los genes de la anemia de Fanconi fortalece el radiaciones, defectos en los puntos de control del ciclo celu-
papel de esta enfermedad en el procesamiento de roturas de lar, acortamiento telomérico y alto nivel de especies reacti-
doble cadena mediante recombinación homóloga. vas de oxígeno.
La ataxia-telangiectasia es causada por defectos en el
Ataxia-telangiectasia gen supresor de tumor ATM. En respuesta a las roturas de
Es un síndrome genético con un complejo fenotipo clínico. doble cadena, ATM fosforila rápidamente una serie de pro-
Las principales características clínicas son degeneración teínas involucradas en vías de señalización, como p53 o
CAPÍTULO 9 • Mecanismos de reparación del ADN 89
Ruptura de ADN
5´ 3´
A C G T A G T A A T C T A T C G
T G C A T C A T T A G A T A G C
3´ 5´
Se une KU70/80
5´ 3´
A C G T A G T A A T C T A T C G
T G C A T C A T T A G A T A G C
3´ 5´
KU recluta a
ADN-PKcs
5´ 3´
A C G T A G T A A T C T A T C G
T G C A T C A T T A G A T A G C
3´ 5´
Finalmente Xrcc4/ligasa IV
unen los extremos
5´ 3´
A C G T A G T A A T C T A T C G
T G C A T C A T T A G A T A G C
3´ 5´
ADN reparado
5´ 3´
A C G T A G T A A T G C T A T C T A T C G
T G C A T C A T T A C G A T A G A T A G C
3´ 5´
Mdm2, así como otras proteínas de reparación, como elevada predisposición a desarrollar cáncer de piel. El xero-
RAD50-MRE11-NBS1 y BRCA1, relacionadas con síndro- derma pigmentoso es causado por defectos en uno o varios
mes de inestabilidad cromosómica. de los ocho genes XPA-XPG, más una variante, XPV; por lo
tanto, existen nueve subtipos clínicos de la enfermedad, que
incluyen varias manifestaciones cutáneas y neurológicas.
Xeroderma pigmentoso Estos genes codifican para las proteínas que participan en
Es una enfermedad cutánea multigénica caracterizada por los mecanismos de reparación NER, por lo que las mutacio-
una elevada sensibilidad a todas las fuentes de radiación nes en los genes XPA-XPG son las responsables de la ines-
UV. Las personas afectadas presentan envejecimiento pre- tabilidad genómica presente en los pacientes con xeroderma
maturo, lesiones oculares, trastornos neurológicos y una pigmentoso.