Guia Practicas
Guia Practicas
Guia Practicas
MEJORAMIENTO GENÉTICO
GUÍA DE PRÁCTICAS
Docentes:
2021
1
CONTENIDO
Registros y Estandarización
Varianza 12
Heredabilidad 17
Parentesco y Consanguinidad 38
Cruzamiento 46
2
I. REGISTROS PRODUCTIVOS Y GENEALÓGICOS
1) OBJETIVOS:
• Entender la importancia de los registros productivos en el mejoramiento de
la productividad animal
• Entender el procedimiento para la inscripción de una especie en los
registros genealógicos
• Registros productivos y criterios de evaluación de producción.
3) ACTIVIDADES GENERALES
• Antes de la práctica: Conocer que asociaciones existen en el Perú y cuál es la
finalidad de su creación.
El propósito de esta revisión es presentarle los principios y procedimientos usados para hacer
el registro productivo animal, más informativo. En mejoramiento genético se han desarrollado
modelos que explican los factores que influencian el rendimiento productivo.La mayoría de
modelos básicos usados en mejoramiento genético definen el rendimiento
3
o producción animal, P (Phenotype), de cualquier carácter como la suma de tres valores
(ecuación 1). La media total, μ, es la media poblacional o el rendimiento promedio esperado
para la población. Los efectos genéticos, G, representan el efecto acumulativode todos
los genes sobre el carácter. Los efectos ambientales, E (Environmental), representan el
efecto acumulativo de todos los efectos no genéticos o efectos ambientales sobre un carácter.
Es importante resaltar que tanto G como E, son registrados como desviaciones (positivo o
negativo), del efecto promedio. Los animales que se encuentran en el promedio en su mérito
genético tendrán un valor de cero para G. animales que tienen mejores genes que el
promedio tendrán un valor positivo para G. la suma de todos los valores para G y E en una
población es cero por definición.
Error de medición:
4
una preocupación cuando difieren enormemente de un animal a otro. Por ejemplo, cuando
el peso al año de un animal es 50 libras en exceso, y el peso al año de otro animal es 60
libras en defecto. Estos errores combinados podrían incorrectamente diferenciar estos dos
toros por más de 100 libras. El error de medición esta minimizado cuando las diferencias
en el error de medición (e) son muy pequeñas (varianza pequeña) (ecuación 2). Cuandolos
errores de medición no son minimizados, entonces las diferencias entre valores de
rendimiento no serán indicadores confiables de las diferencias genéticas. Es importante tomar
en cuenta los errores de medición cuando se diseñan programas de registro de rendimientos.
Por simplicidad, asumiremos en todas nuestras discusiones que la varianza del error de
medición es pequeña y puede ser ignorada.
Ambiente uniforme
5
K fuese separado de las enfermedades? Comparando el rendimiento animal cuando los
ambientes bajo las cuales ellos son evaluados, esta diferencia no es significativa o
informativa. Cuando el ambiente, en el cual el rendimiento esta expresado, varia, no
sabríamos que causo la diferencia en los registros. No podemos determinar con precisión
si el rendimiento fue diferente debido al ambiente o porque los animales fueron
genéticamente diferentes. Si queremos hacer una comparación directa de registros, entonces
los ambientes para los dos registros deben ser razonablemente uniformes. El ambiente
uniforme está caracterizado por animales en el mismo hato o rebaño durante la misma
temporada en la cual reciben el mismo alimento y manejo en el mismo corral.
Grupo contemporáneo
6
grupo contemporáneo sea lo suficientemente grande para medir confiablemente el
rendimiento promedio esperado de un grupo contemporáneo bajo el ambiente en cuestión.
La comparación del rendimiento de un animal con el rendimiento promedio del grupo
contemporáneo nos ayuda a reducir el efecto del ambiente sobre el rendimiento. En nuestro
ejemplo inicial, suponga que el rendimiento promedio para el grupo contemporáneo del toro
A fue 940 lb, pero para el toro B fue 1060 lb
El toro A tuvo una diferencia de +10 lb comprado con sus contemporáneos mientras que
el toro B tuvo una diferencia de -10 lb cuando se compara con sus contemporáneos. Si
asumimos que los contemporáneos del toro A y el toro B son de igual merito genético,
entonces el toro A debería ser definitivamente el que tenga el mejor merito genético. Estas
diferencias entre contemporáneos sugieren que el toro B tuvo mejor rendimiento que el
toro A al inicio, debido a un mejor ambiente. Es importante recordar un par de cosas acerca
de grupos contemporáneos.
1. El grupo contemporáneo debe tener el mismo ambiente uniforme como el animal con
el cual queremos compararlo.
2. Los animales incluidos en el grupo contemporáneo no deberían ser seleccionados por
su rendimiento. Por ejemplo, si los peores animales son sacrificados y no son
incluidos en el grupo contemporáneo, entonces solamente los mejores animales
estarán incluidos en el grupo contemporáneo. Si solamente los mejores son incluidos
en el grupo contemporáneo entonces el rendimiento promedio del grupo
contemporáneo sobreestimara la calidad del ambiente y subsecuentemente
subestimara el mérito genético de cualquier animal que comparemos con el grupo
contemporáneo.
7
Los grupos contemporáneos son una forma de medir el efecto de un ambiente uniforme
común. Si podemos medir el efecto del ambiente uniforme común, entonces podemos
eliminarlo de los registros de rendimiento. Si calculamos el rendimiento promedio de un
gran grupo de contemporáneos, este promedio estimara el efecto promedio de ese ambiente
en un genotipo promedio. El mérito genético promedio del grupo contemporáneo se espera
que sea cero si el grupo contemporáneo es suficientemente grande y viene de una muestra
aleatoria de la población. Si el grupo contemporáneo puede ser asumido como
representante del rendimiento promedio de la población bajo un ambiente particular, entonces
es razonable comparar diferencias de grupos contemporáneos cuando los animales producen
en ambientes diferentes.
Una desviación del rendimiento promedio del grupo contemporáneo se calcula restando el
rendimiento promedio del grupo contemporáneo del rendimiento del animal evaluado. En
nuestro ejemplo inicial, el toro A debería tener una desviación de +10 (calculado como 950
– 940) y el toro B debería tener una desviación de -10 (calculado como 1050 – 1060). Las
desviaciones serán tanto positivas como negativas. Una desviación positiva significa que el
animal ha producido mejor que el grupo contemporáneo. Una desviación negativa significa
que el animal ha producido peor que el grupo contemporáneo. Una desviación de cero
significa que el animal ha producido lo mismo que el grupo contemporáneo. Los productores
usan estas desviaciones como evidencia de que el mérito genético del animal puede haber
sido mejor, peor o el mismo que el de sus contemporáneos.
8
debería tener una proporción de 101 (950/940 * 100) y el toro B debería tener una proporción
de 99 (1050/1060 * 100). Animales con una proporción mayor a 100 tendrán valores de
rendimiento mayores que el rendimiento promedio del grupo contemporáneo. Animales con
una proporción menor a 100 tendrán valores de rendimientos menores que el rendimiento
promedio del grupo contemporáneo. Animales con una proporción igual a
100 tendrán valores de rendimiento igual al rendimiento promedio del grupo contemporáneo.
Debido a que las proporciones tienen propiedades estadísticas indeseables, el uso de las
proporciones en evaluaciones comerciales de criadores, esmuy limitada.
Las diferencias en desviaciones y proporciones están más relacionadas con las diferencias
genéticas que con las diferencias en registros de rendimiento. Este postulado es cierto en
tal sentido que el rendimiento promedio del grupo contemporáneo mide con precisión el
rendimiento promedio esperado en este ambiente para animales con un mérito genético
promedio. El rendimiento promedio del grupo contemporáneo medirá con precisión el
rendimiento esperado en este ambiente para animales con un mérito genético promedio si:
Estas desviaciones y proporciones deberán mejorar nuestra habilidad para predecir cuales
animales tienen el mejor merito genético.
9
estandarizar los registros de rendimiento a una cierta edad. Algo que se debe recordar es
que los ajustes pueden ser muy confusos o precisos si se usan fuera de un rango limitado.
Supongamos que esperamos hasta que un toro tenga 16, 18 o incluso 24 mesesde edad
para registrar el peso al año. Ajustando a 365 días de 730 días no sería confiable. Debemos
tratar de medir o registrar la producción de los animales cuando el animal promedio en un
grupo contemporáneo este en la edad deseada. La medición deun grupo contemporáneo
cuando el animal promedio es de la edad correcta minimiza la magnitud de nuestros ajustes
y es más probable obtener ajustes precisión.
5) ACTIVIDADES PRÁCTICAS
a. Revisión e importancia de modelos de registros productivos
b. Importancia de estandarización de productividad.
c. Discusión de la importancia de los registros genealógicos
d. Procedimiento para registrar un animal en el Libro Abierto
10
6) TAREA
11
II. VARIANZA
1) OBJETIVOS:
• Estimar los componentes de varianza genética
• Aprender la importancia de la aplicación de la varianza
• Estimar el valor de cría o valor genético aditivo (EBV)
2) TEXTOS RECOMENDADOS:
• Cardellino, F y Rovira. 1994. Mejoramiento Genético Animal. Ed.
Hemisferio Sur.
• Falconer, D.S., Mackay, T.F.C. 1996. Introduction to quantitative genetics.
Ed. Prentice Hall.
• Simm G. 1998. Genetic improvement of cattle and sheep.
3) ACTIVIDADES GENERALES
4) ACTIVIDADES PRÁCTICAS
a. Revisión de conceptos de varianza
b. Efecto del tipo de herencia sobre el valor genético
c. Aplicación del coeficiente de variación
d. Distribución normal en una población
12
e. Ejercicios de aplicación
Varianza
VP = VG + VE + VGE
La varianza genética dominante (VD) es la variación debido a la interacción de los alelos dentro
de cada locus, varianza intralocus. Esta varianza es una función del estado diploide (genotipo) y
por esta razón no es transmitida de una generación a la siguiente, sino que es creada
(reconstituida) en cada generación. La varianza de interacción (VI) es producto de la interacción
de los alelos entre dos o más loci; es decir, es una varianza interloci, también es una función del
estado diploide y tampoco se transmite de una generación a la siguiente. La varianza genética
aditiva (VA) es el componente debido al efecto aditivo de los genes. Esta es la suma del efecto
de todos los alelos en todos los loci; es decir, la varianza genética aditiva es la suma del efecto
de cada uno de los alelos que ayudan a producir el fenotipo y no depende de las combinaciones
específicas de los alelos, sino que de cada alelo en sí. Por lo tanto, no es afectada por la meiosis,
de este modo la varianza genética aditiva es transmitida desde los padres a la progenie en cada
13
generación.
Referencias
• Falconer, A. 1989. Introduction to Quantitative Genetics. Longman, New York.
• Silva-Díaz, Rubén, García-Mendoza, Pedro, Faleiro-Silva, Diego, & Lopes de Souza,
Cláudio. (2018). Determinación de componentes de la varianza y parámetros genéticos
en una población segregante de maíz tropical. Bioagro, 30(1), 67-77. Recuperado en 24
de marzo de 2021, de http://ve.scielo.org/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1316-
33612018000100007&lng=es&tlng=es.
• Gállego Araceli y Araneda Cristian.2018. Genética cuantitativa. Problemas de genética.
Cuaderno de ejercicios. 1ra edición. Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad
de Ciencias.
• Cardellino R y Rovira J. Mejoramiento genético animal. Capítulo 4: Componentes de la
variancia. Ed. Agropecuaria hemisferio sur S.R.L.
14
5) TAREA
Asuma que los efectos independientes de cada gen y los valores de combinación de los genes
han sido determinados para 3 genes que influencian el peso al nacimiento en ganado bovino
de carne (Ver tabla 1).
Para los siguientes animales, calcular su valor genético aditivo, su valor de combinación
génica, y sus valores de cría.
100505 13-33-12
100511 22-13-11
100515 23-13-33
100518 11-22-13
100525 23-22-12
100526 11-33-13
15
2. Considere un hipotético carácter cuantitativo que es afectado por 5 genes. Asuma lo
siguiente:
2. AAbbCCddEE + 12
16
III. PARÁMETROS GENÉTICOS – HEREDABILIDAD
1) OBJETIVOS:
• Entender los conceptos de Heredabilidad
• Calcular e interpretar los valores de heredabilidad
• Entender la relación e importancia de los parámetros genéticos.
2) TEXTOS RECOMENDADOS:
• Cardellino, F y Rovira. 1994. Mejoramiento Genético Animal. Ed.
Hemisferio Sur.
• Falconer, D.S., Mackay, T.F.C. 1996. Introduction to quantitative genetics.
Ed. Prentice Hall.
• Bourdon R.M. 2000. Understanding Animal Breeding. Ed. Prentice Hall.
3) ACTIVIDADES GENERALES
4) ACTIVIDADES PRÁCTICAS
a. Revisión de conceptos de heredabilidad, repetibilidad y correlación genética
b. Discusión de limitaciones y procedimientos para cálculo de heredabilidad
c. Aplicación de parámetros genéticos
d. Ejercicios de aplicación
e. Uso de herramientas de Excel
17
Heredabilidad
Como ya vimos en el en el capítulo anterior, una parte de la variación observada de los caracteres
tiene un origen genético y otra parte tiene una variación ambiental. Si la mayor variación es de origen
genético, la diferencia observada entre especies será debido a los genes presentes, y estos serán en
gran parte transmitidos a la progenie, son heredables. En cambio, si la variación ambiental es mayor,
esta diferencia no será observable en la progenie, solamente en los padres. Existen 2 tipos de
heredabilidad: Se define como heredabilidad en sentido amplio (H2) a la fracción de la varianza
fenotípica que se explica por la varianza genética total (VG), mientras que la heredabilidad en sentido
estricto (h2) es la fracción de la varianza fenotípica que se explica por la varianza genética aditiva.
H2 = VG / VP
h2 = VA / VP = VA/ VA+VD+VI+VE
De ambas, la heredabilidad en sentido estricto es la más empleada ya que permite determinar el valor
de cría en base al fenotipo, en otras palabras, describe el porcentaje o proporción de varianza
fenotípica que es heredado de una manera confiable y predecible ya que, está determinado por la
varianza aditiva, o por diferencias genéticas aditivas entre los progenitores.
Puesto que la heredabilidad es una proporción (o porcentaje), ella toma valores entre cero y uno (0 <
h2 < 1), considerándose altos los valores superiores a 0,40 y bajos los valores inferiores a 0,15. Si el
resultado es 0, significa que nada de la variación es de origen genético y la selección será totalmente
inefectiva. Pero, sí la heredabilidad es 1, significa que no hay variación ambiental presente y el valor
fenotípico es igual al valor de cría, dando una selección muy efectiva.
Todos los métodos para determinar la heredabilidad se basan de una u otra forma en determinar
cuánto más se parecen entre sí animales emparentados y los no emparentados, dentro de una
población. Esto puede ser dependiendo del grado de semejanza entre grupos de parientes, entre
hermanos o medios hermanos y líneas isogénicas.
Otra forma de definir la heredabilidad es como la regresión del valor de cría sobre el valor fenotípico:
h2 = bAP
El coeficiente “b” de la regresión indica el grado de inclinación de la recta, es igual a h 2. Esto se lee:
para un cambio de magnitud “a” en el valor fenotípico, se obtiene un cambio “ab” en el valor de cría.
La equivalencia de esta definición podría ser en base a covarianzas también:
bAP=Cov(A,P)/VP
18
Referencias
• Falconer, A. 1989. Introduction to Quantitative Genetics. Longman, New York.
• Gállego Araceli y Araneda Cristian.2018. Genética cuantitativa. Problemas de genética.
Cuaderno de ejercicios. 1ra edición. Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad de
Ciencias.
• Cardellino R y Rovira J. Mejoramiento genético animal. Capítulo 5: Heredabilidad. Ed.
Agropecuaria Hemisferio Sur S.R.L.
19
5) TAREA
Halle el coeficiente de regresión lineal (regresión del peso a los 300 días sobre el
peso a los 150 días) y el coeficiente de correlación entre las dos variables.
20
2) Se realizó una evaluación de la vida productiva de las vacas del establo Santa
Juana obteniéndose los siguientes resultados de la población total:
d) ¿Cuál es el valor de cría estimado de una oveja que tiene un fenotipo de125
libras?
21
5) En el mismo rebaño de ovinos, el valor estimado de la variancia de valor decría
para el carácter número de corderos nacidos es 0.0135 corderos2, y la variancia
fenotípica para el mismo carácter es 0.09 corderos2.
CM
Fuente de variación gl
PVS PV
Entre carneros 39 0.5799 38.2885
22
1040 854
1025 880
994 882
1030 895
1021 952
1078 953
964 961
976 979
1110 995
1041 997
1035 1040
Rpta: h2= 1.15, ES= 0.1268 (Valores obtenidos y recalculados de Cardelino y Rovira)
23
Gallos
1 2 3 4 5
687 618 618 600 717
691 680 687 657 658
793 592 763 669 674
675 683 747 606 611
700 631 678 718 678
753 691 737 693 788
704 694 731 669 650
717 732 603 648 690
Rpta: h2= 0.38 ES= 0.5986
Gallos
1 2 3 4 5
687 618 618 600 717
691 680 687 657 658
793 592 763 669 674
675 683 747 606 611
700 631 678 718
691 737 693
694 731
732
Rpta: h2=0.45; ES=0.72
Fuente de variación gl SC
Toros 19 34942.8
Año 4 157189.8
Sexo 1 57700.6
Edad de la madre 8 172146.5
Manejo 2 60662.5
Error 2474 1615771.5
Rpta: h2=0.102, ES= 0.051
24
6) En aves Leghorn se midió la longitud del tarso (LT) y peso corporal (PC) a las 16
semanas de edad, en un diseño de hermanos enteros, cuyo análisis de varianza
fue el siguiente: (k1=4.73; k2=6.31; k3=31.16) (Tomado de Cardellino y Rovira, 1994)
Fuente de variación gl CM LT CM PC
Papas 16 1.1784 39189.89
Madres/papas 90 0.2596 14787.86
Hijos/madres/papas 426 0.1493 9209.85
Total 532
25
IV. PARÁMETROS GENÉTICOS – REPETIBILIDAD
1) OBJETIVOS:
• Entender los conceptos de Repetibilidad y Correlaciones genéticas
• Calcular e interpretar los valores de repetibilidad
• Calcular e interpretar los valores de correlación genética.
• Entender la relación e importancia de los parámetros genéticos.
2) TEXTOS RECOMENDADOS:
• Cardellino, F y Rovira. 1994. Mejoramiento Genético Animal. Ed.
Hemisferio Sur.
• Falconer, D.S., Mackay, T.F.C. 1996. Introduction to quantitative genetics.
Ed. Prentice Hall.
• Bourdon R.M. 2000. Understanding Animal Breeding. Ed. Prentice Hall.
3) ACTIVIDADES GENERALES
4) ACTIVIDADES PRÁCTICAS
a. Revisión de conceptos de heredabilidad, repetibilidad y correlación genética
b. Discusión de limitaciones y procedimientos para cálculo de heredabilidad
c. Aplicación de parámetros genéticos
d. Ejercicios de aplicación
e. Uso de herramientas de Excel
26
Repetibilidad
Ciertos caracteres productivos se repiten a lo largo de la vida productiva de un animal como el peso de
vellón, días de lactación, peso al nacimiento de la cría, etc. Este parámetro no es una constante biológica,
sino que depende de la composición genética de la población y del ambiente en la que se encuentre el
animal. Entonces, la repetibilidad (R) es la correlación entre medidas repetidas sobre un mismo individuo,
medidas en distintas etapas de la vida del animal. Sí asumimos que el genotipo del animal es el mismo
durante todas las etapas de su vida, entonces las diferencias encontradas entre producciones deberían estar
basada en diferencias ambientales. Entonces, es importante conversar sobre la varianza ambiental y sus
divisiones. La varianza ambiental es la variación fenotípica que no tiene origen genético. Cuando realizamos
la observación sobre una característica en un mismo individuo, parte de la variación ambiental es
permanente (VEp), ya que refleja los aspectos que no han variado en la vida del animal y afectan todas las
medidas, mientras que la otra parte de la variación es temporal (VEt), ya que influye en la medida por única
vez y es diferente entre medida y medida. Un buen ejemplo es la nutrición. Si una ternera ha tenido con un
fuerte desbalance nutricional por mucho tiempo, esto afectara su tasa productiva en la adultez de manera
permanente, sin influencia ambiental, en cambio, si el cambio de nutrición ocurre en un momento corto y
especifico de la lactación, este es una variación temporal y afectara solo esa campaña.
Correlaciones genéticas
Desde hace mucho tiempo se conoce que existen ciertos parámetros que pueden estar relacionados entre
sí. La correlación que se puede calcular a simple vista es la correlación fenotípica:
rP12=rA12*h1*h2+rE12*e1*e2
rA=Cov(A1,A2)/σA1σA2
Referencias
27
• Falconer, A. 1989. Introduction to Quantitative Genetics. Longman, New York.
• Cardellino R y Rovira J. Mejoramiento genético animal. 1994. Capítulo 6: Correlaciones
genéticas. Ed. Agropecuaria hemisferio sur S.R.L.
• Cardellino R y Rovira J. Mejoramiento genético animal. 1994. Capítulo 7: repetibilidad. Ed.
Agropecuaria hemisferio sur S.R.L.
f. TAREA
Animales
Medidas 1 2 3 4 5 6
1 2.3 2.2 2.1 2.3 2.1 2
2 2.2 3.1 2.6 2.4 2 1.9
3 2.2 2.7 2.7 2.1 2.2 2.6
4 3 2.2 2.0 2.6 2 2.5
5 2.4 2.5 1.9 2 2 2.3
6 2.8 2.6 1.9 1.7 1.8 2
7 2.6 2.9 1.8 2.4 2 2.5
8 2.5 2.3 2.3 2.1 1.7 2.2
9 2.2 2.2 2.1 2.5 1.8 2
10 2.3 3.0 2.2 2.7 1.7 1.7
28
Fuente de variación gl CM
Sexo ternero 1 67755.4
Mes nacimiento 2 1164.5
Año nacimiento 6 8355.3
Edad de la madre 7 6804.5
Mes x Año 12 919.2
Vacas 1568 798.3
Error 2098 391.3
Total 3694
29
Horizontal
2. Se crea de una población cerrada
3. Se conoce también como valor de cría
6. Se obtiene por regresión de rendimiento de padres - hijos
7. Se obtiene por consanguinidad
Vertical
1. Se obtiene por regresión de primer rendimiento con segundo rendimiento
4. Apareamiento de dos individuos de diferente raza o especie
5. Asociación de dos fenotipos
Fuente de variación gl CM
Entre gallos 44 0.636505
Entre muestras de gallos 315 0.043875
30
V. PROGRESO GENÉTICO Y SELECCIÓN
1) OBJETIVOS:
• Entender las implicaciones para seleccionar por más de un carácter
• Entender como el progreso genético por selección puede predecirse
• Aplicar los usos de los registros productivos para predecir EBV
• Entender la aplicación de los modelos lineales.
2) TEXTOS RECOMENDADOS:
• Cardellino, F y Rovira. 1994. Mejoramiento Genético Animal. Ed.
Hemisferio Sur.
• Falconer, D.S., Mackay, T.F.C. 1996. Introduction to quantitative genetics.
Ed. Prentice Hall.
3) ACTIVIDADES GENERALES
4) ACTIVIDADES PRÁCTICAS
a. Revisión de métodos de selección en animales domésticos
b. Aplicaciones de Progreso genético e Intervalo generacional.
c. Ejercicios de aplicación
El efecto más esperado de la selección es el progreso genético. El progreso genético (ΔG) es la respuesta
observada en base a la selección realizada. Para predecir el progreso genético es necesario tener en
cuenta el grado de exactitud con la que se seleccionan los individuos, la intensidad de la selección y la
variación genética existente en la población, además, podríamos ajustarlo con el intervalo entre
generaciones, para tener una predicción anual:
ΔG= rAC*i*VA/ ΔT
Si analizamos esta fórmula, la rAC, es la correlación entre el valor de cría y el criterio de selección utilizado.
Esto varía de acuerdo con el carácter y en palabras simples se puede hallar sacando la raíz cuadrada de
la heredabilidad (h).
El intervalo generacional depende de la especie con la que se está trabajando. Se define como la edad
promedio de los padres cuando nacen los hijos. Se calcula ponderando la edad de los animales al parto,
utilizando como pesos el número de los hijos producidos. Se debe calcular para ambos parentales y luego
promediar.
Referencias
• Falconer, A. 1989. Introduction to Quantitative Genetics. Longman, New York.
• Cardellino R y Rovira J. Mejoramiento genético animal. 1994. Capítulo 8: Selección genéticas.
Ed. Agropecuaria hemisferio sur S.R.L.
32
TAREA 1
33
TAREA 2
Pastor alemán:
b1 para peso adulto = - 0.62
b2 para talla adulta = -0.27
1. En una población de bovinos de carne, con 500 vacas de cría, se realiza la selección
por ganancia de peso entre 205 y 365 días de edad, en machos yhembras. Calcular
la intensidad de selección para las 24 combinaciones siguientes:
34
Edad de la vaca Porcentaje
(Años) (%)
3 15
4 20
5 20
6 15
7 10
8 10
9 5
10 5
3. Con los datos del problema 2 de la tarea 7, realice una predicción del progreso
genético anual esperado si la heredabilidad del peso de vellón sucio en la población
es de 0.35 y si los carneros se usan solamente un año a partir de 1 añoy 7 meses
de edad y la edad promedio de las ovejas al parto es de 4 años. Si la media de la
población es de 4500 g, calcule el progreso genético anual en porcentaje.
4. Tres carneros tienen los siguientes datos de producción corregida por edad, como
desvíos del promedio: h2=0.35, R=0.5
B 0.2 -0.1
C 0.5
35
Rpta: 0.1768, 0.0233, 0.175
5. Calcular el valor de cría esperado de dos toros, para peso ajustado a los 550 días
(promedio del rodeo: 450 kg). h2 = 0.2
36
Se tienen dos poblaciones de caninos
Número de Número de
Edad de Edad de
cachorros cachorros
hembras machos
A B A B
2 32 30 2 30 48
3 28 23 3 30 0
4 17 19 4 0 20
5 9 13 5 40 0
6 14 15 6 0 32
37
VI. PARENTESCO Y CONSANGUINIDAD
1) OBJETIVOS:
• Entender que mide la consanguinidad y parentesco.
• Entender como la consanguinidad está influenciada por el tamaño de la
población.
• Entender como calcular la consanguinidad utilizando diagramas.
• Determinar e interpretar los coeficientes de consanguinidad y parentesco.
2) TEXTOS RECOMENDADOS:
• Cardellino, F y Rovira. 1994. Mejoramiento Genético Animal. Ed.
hemisferio sur.
• Falconer, D.S., Mackay, T.F.C. 1996. Introduction to quantitative genetics.
Ed. Prentice Hall.
3) ACTIVIDADES GENERALES
4) ACTIVIDADES PRÁCTICAS
a. Revisión de conceptos de consanguinidad y parentesco
b. Estimación de coeficientes de consanguinidad y parentesco
c. Calculo por método covarianzas
d. Cálculo de Coeficientes de consanguinidad por Pedigraph
38
e. Cálculo de consanguinidad mediante uso de Applet de Bryan Lewis.
f. Ejercicios de aplicación.
Consanguinidad
Los individuos que poseen parentales tienen algún grado de parentesco son endogámicos o
consanguíneos. Se define como individuos emparentados a los que poseen algún antepasado en
común. La importancia de la consanguinidad es la permanencia de algunos genes y la perdida de otros,
lo que conlleva a tener individuos homocigotos. El coeficiente de consanguinidad nos permite
determinar la posibilidad de que un individuo sea homocigoto idéntico para determinado locus X, solo
siendo posible porque las gametas poseían copias del mismo gen por ascendencia.
Referencias
• Falconer, A. 1989. Introduction to Quantitative Genetics. Longman, New York.
• Cardellino R y Rovira J. Mejoramiento genético animal. 1994. Capítulo 12: Consanguinidad.
Ed. Agropecuaria hemisferio sur S.R.L.
Pasos:
1) Para la población base (padres que no están en la población), las diagonales son
1 y fuera de diagonales 0
2) Llenar los elementos comenzando desde la primera fila con la fórmula de
Covarianzas
3) Copiar la fila en las columnas
4) Repetir el mismo procedimiento con todas las filas
5) Para el cálculo de consanguinidad del individuo, restar 1 de la tabla.
6) Para calcular el coeficiente de parentesco de la tabla:
39
40
41
5) EJEMPLOS DE APLICACIÓN
http://www.husdyr.kvl.dk/htm/kc/popgen/genetik/applets/tabularapp.htm
An Applet for general matrix handling and calculating relationship and inbreeding
The relationship and inbreeding, and the inversion part of the matrix method has been
programmed by Nils Toft and Thomas Nejsum Madsen, respectively, whereas the general
matrix part has been borrowed from Bryan Lewis's General Matrix Applet.
Matrices are just defined by line length and number of lines. To edit data in the data field is
very troublesome as the return key can not be used for giving a new line as it works as pressing
the eval. button. For larger sets of data use notepad or any other editor. Move the data to the
input area by means of the clip board using ctrl-ins (copy) and shift-ins (insert).
Example:
Example of calculating inbreeding where the columns in the matrix shown below are animal,
sire and dam, where the oldest animals should appear first. The pedigrees are converted in
the 'a' matrix as done below (0 means unknown parent):
42
animal sire dam
-
a=
1 0 0
2 1 0
3 1 0
4 1 0
5 2 3
6 4 3
7 5 6
Take these data including (a=) in the clip board and transfer them to input window and there
after press the 'evaluate' button and the matrix should appear in the result window. There after
use in the input window:
rel = :tabular(a)
and press the 'evaluate' button
The rel relationship matrix will appear in the result window and will look as shown below.
Number of digits can be set, replacing the 6 with 3 will change the number of digits to 3.
The inbreeding for each animal is given by its diagonal element minus one, i.e. the last three
animals are inbred with an inbreeding coefficient of 0.125, 0.125 and 0.218 respectively.
The identifying numbers of each animal can be any number, as long as the oldest animals
appear first in the list. When defining the base (oldest) generation both parents are set as
zeros (0 = unknown).
If you are interested in the inbreeding coefficient, only, you run the inbred procedure as follow:
inb = :inbred(a)
you will have the following, in the results window, with animal number and inbreeding
coefficient:
43
Animal F (inbreeding)
inb =
1.000 0.000
2.000 0.000
3.000 0.000
4.000 0.000
5.000 0.125
6.000 0.125
7.000 0.218
inv = :invert(rel)
Or setting up the inverse relationship matrix direct from the a matrix only to use with non
inbreeding:
d_inv = :dinvers(a)
Below is shown a hand calculated example with the two general formula in use.The
relationship between two animals is the average relationship between the oldest and the
others two parents. And the inbreeding of an individual is half the relationship between the
two parents.
37
For your own data put them in the matrix 'a' and repeat the process:
In the pedigree shown below the individuals have been assigned the numbers from 1 to
11.
Animal Sire Dam , where 0 means
unknown
1 0 0
2 0 0
3 0 0
4 0 0
5 0 0
6 2 1
7 5 4
8 7 3
9 7 6
10 7 8
11 10 9
Calculate the inbreeding coefficient for the individuals No 10 and 11 and calculate the additive
relationship coefficient between individual 11 and all others in the pedigree. Thedata set
to be used for the calculations is given above.
What would be the inbreeding coefficient after 5 generation of full sib mating?
38
Análisis de pedigrí usando el programa “Pedigraph”
Pedigraph ofrece un entorno de trabajo en formato DOS. Entre sus principales utilidades esta
la presentación grafica de árboles de pedigrí y coeficientes de consanguinidad entre otras.
Para descargar el programa diríjase al aula virtual desde donde descargara un archivo ZIP.
Guárdelo en una carpeta y descomprima los documentos. Para correr el programa no es
necesario realizar ninguna instalación, pero si debe tomar en cuenta que no debe modificar
los archivos incluidos excepto el documento en block de notas. Para mayores
especificaciones refiérase al manual del usuario.
1) Ingrese a Pedigraph
2) Antes de ingresar el archivo recuerde que debe estar en block de notas (Notepad)
con separación de columnas por ID, PAPA, MAMA, y SEXO. A continuación, se
presenta un pedigrí de una familia de 7 individuos.
100M
210F
310M
410F
523M
643F
756M
Cuando no se conocen los padres se coloca “0”. El sexo es Macho “M” y Hembra “F”. en
el block de notas debe aparecer de esta manera:
39
Al final aparece un individuo más (8), pero solo como referencia, para que el programa
considere al individuo “7” dentro del pedigrí. Dentro de la carpeta esta un archivo con
extensión .DAT, con el nombre pedigraph. Este es un archivo con comandos de opciones,
por lo tanto, es importante seguir las instrucciones en función lo que se quiere obtener. Para
poder abrirlo, use block de notas o Notepad.
40
Cualquier línea que empiece con # no será considerado. Por ejemplo, deseamos graficar
el pedigrí de 7 individuos, con sus coeficientes de consanguinidad en un archivo en formato
.jpg para observar el grafico. Entonces tipeamos lo siguiente.
Luego haga doble click en pedigraph.exe y tipee el archivo de consulta en formato Notepad
y presione enter.
41
Aquí se tiene los 7 individuos y en la parte inferior de cada uno su respectivo coeficiente
de consanguinidad. Cada rectángulo es macho y los círculos son hembras.
42
Se obtiene un archivo con el nombre test2output en extensión .txt con la siguiente
información:
Inbreeding Coefficients
Max: 0.21875
Average: 0.0669643
Smallest non-zero: 0.125
10
20
30
40
5 0.125
6 0.125
7 0.21875
43
6) TAREA 7
B
E
G A
C
D
b) Con el archivo Excel suministrado por el aula virtual, calcule lo siguiente:
Coeficiente de Consanguinidad promedio, máximo, mínimo, desviación estándar
y depresión consanguínea.
44
EJERCICIOS PROPUESTOS:
Rpta: 0.275
Rpta: 0.375
45
VII. CRUZAMIENTO
1) OBJETIVOS:
• Entender la heterósis y cómo usarlo efectivamente.
• Entender la diferencia entre heterósis individual, maternal y paternal.
• Entender como predecir la cantidad de heterósis esperada de varios cruces
• Diseñar sistemas de cruzamiento tomando en cuenta la heterósis
esperada.
2) TEXTOS RECOMENDADOS:
• Cardellino, F y Rovira. 1994. Mejoramiento Genético Animal. Ed.
Hemisferio Sur.
• Falconer, D.S., Mackay, T.F.C. 1996. Introduction to quantitative genetics.
Ed. Prentice Hall.
• Simm G. 1998. Genetic improvement of cattle and sheep.
3) ACTIVIDADES GENERALES
4) ACTIVIDADES PRÁCTICAS
a. Revisión de sistemas de cruzamiento en animales domésticos
b. Predicción de la heterósis individual, maternal y paternal
c. Aplicación del cruzamiento
46
d. Cálculo de predicción de heterósis.
e. Ejercicios de aplicación.
Cruzamiento
La base del mejoramiento genético es la selección de individuos para luego realizar el cruzamiento entre
ellos para observar los resultados esperados en la descendencia. Lo más común es el cruzamiento entre
razas, variedades y líneas para aprovechar el vigor híbrido. El vigor híbrido o heterosis es la diferencia
entre el valor fenotípico de la cruza y el promedio de los progenitores:
H = ½ (Mp1 + Mp2)
M es la media y p los progenitores.
Se pueden conocer dos casos de heterosis: (1) cuando el promedio de las cruzas no supera la
performance media de uno de los padres y (2) cuando el promedio de la cruza supera la media del
progenitor más productivo. La que nos interesa encontrar es el segundo caso. Otro punto importante para
tener en cuenta con la heterosis es el ambiente, la interacción genotipo-ambiente, que ya conversamos
anteriormente.
Existen 3 tipos de heterosis: (1) la heterosis individual, es propio del individuo relacionado a la media de
los padres. (2) heterosis materna, se refiere a la heterosis observada en la población por el empleo de
madres cruzadas y (3) heterosis paterna, que se observa con el empleo del padre cruzado.
Literatura
• Falconer, A. 1989. Introduction to Quantitative Genetics. Longman, New York.
• Cardellino R y Rovira J. Mejoramiento genético animal. 1994. Capítulo 13: Cruzamiento. Ed.
Agropecuaria hemisferio sur S.R.L.
5) TAREA 8
a) Complete el siguiente cuadro con la información abajo proporcionada: (Adaptado
de Lab Exercises Animal Breeding - Iowa State University)
47
Valor de cría directa de: Raza A = 95; Raza B = 105
48
b) Resuelva las proporciones esperadas de los siguientes cruces.
1. Girolando x Holstein
3. Girolando x Girolando
49
7. Retrocruza: Girolando x Gir
50
VIII. MEJORAMIENTO GENÉTICO EN VACUNOS DE LECHE
1) OBJETIVOS:
• Entender como los principios de mejora animal están siendo
implementados en la industria láctea.
• Familiarizarse con las fuentes y recursos para el mejoramiento genético en
la industria láctea.
• Estandarizar la productividad lechera
• Interpretar los valores genéticos de catálogos lecheros.
2) TEXTOS RECOMENDADOS:
• Simm G. 1998. Genetic improvement of cattle and sheep.
3) ACTIVIDADES GENERALES
4) ACTIVIDADES PRÁCTICAS
a. Revisión de información de rendimiento de toros.
b. Uso de recursos y fuentes para responder las preguntas de desarrollo.
c. Estandarización de productividad lechera.
d. Interpretación de catálogos de toros.
51
CATALOGO DE TORO LECHERO NACIONAL
52
CATALOGO DE TORO IMPORTADO (CRI)
53
PRINCIPALES ABREVIACIONES Y SU INTERPRETACIÓN
54
https://www.naab-css.org/naab-uniform-coding-system
55
56
IX. MEJORAMIENTO GENÉTICO EN VACUNOS DE CARNE
1) OBJETIVOS:
• Entender como los principios de mejora animal están siendo
implementados en la industria de ganado de engorde.
• Familiarizarse con las fuentes y recursos para el mejoramiento genético en
la industria de ganado de engorde.
2) TEXTOS RECOMENDADOS:
• Simm G. 1998. Genetic improvement of cattle and sheep.
3) ACTIVIDADES GENERALES
4) ACTIVIDADES PRÁCTICAS
a. Revisión de información de rendimiento de toros.
b. Uso de recursos y fuentes para responder las preguntas de desarrollo en clase.
c. Interpretación de EPD’s
d. Identificación de principales caracteres a evaluar.
e. Interpretación de catálogos para selección de toros de carne
57
INTERPRETACION DE CATALOGOS DE TOROS (SELECT SIRE)
58
59
FACTORES DE AJUSTE A SUMAR A LOS EPD’s DE DIFERENTES RAZAS PARA
COMPARACION ENTRE RAZAS
INTERPRETACION DE DEFINICIONES:
60
continuación se menciona algunos conceptos y caracteres encontrados en catálogos
de toro de carne.
PRODUCCIÓN:
EPD Peso al Año (YW): Expresado en libras, es un predictor de la habilidad del padre
para transmitir el peso al año a su progenie comparada a la de los otros padres.
EPD Talla al Año (YH): Es un predictor de la habilidad del padre para transmitir su
talla al año, expresado en pulgadas, comparada con la de otros padres.
61
MATERNAL
EPD Leche Maternal (Milk): Es un predictor del merito genético de un padre para
leche y habilidad materna como una expresión de sus hijas, comparado con las
hijas de otros toros. En otras palabras, esto es parte de un peso al destete de las
crias atribuido a la habilidad materna y la leche.
Hatos (MkH): Indica el número de hatos de los cuales se obtuvieron reportes de las
hijas.
Hijas (MkD): Refleja el número de hijas que tienen progenie con registros depesos
al destete incluidos en el análisis.
Valor Energía de Vaca ($EN): Expresado en dólares ahorrados por vaca por año,
analiza las diferencias en requerimientos de energía de la vaca como una diferencia
esperada en dólares ahorrados en hijas de los padres.
CARCASA
62
entre las costillas 12 y 13) de la progenie de un padre comparado con la progenie
de otros padres.
ULTRASONIDO
ÍNDICES DE VALOR:
63
Valor de Carne ($B): Expresado en dólares por cabeza, es la diferencia promedio
esperada en el rendimiento de la progenie futura para valores de peso de carcasa
y posdestete, comparada con la progenie de otros padres.
64
X. MEJORAMIENTO GENÉTICO EN OVINOS Y CAMELIDOS
1) OBJETIVOS:
• Entender como los principios de mejora animal están siendo
implementados en la industria de fibras animales.
• Familiarizarse con las fuentes y recursos para el mejoramiento genético en
la industria textil.
2) TEXTOS RECOMENDADOS:
• Simm G. 1998. Genetic improvement of cattle and sheep.
3) ACTIVIDADES GENERALES
4) ACTIVIDADES PRÁCTICAS
a. Revisión de información de rendimiento textil en ovinos y camélidos.
b. Uso de recursos y fuentes para responder las preguntas de desarrollo.
c. Interpretación de valores de calidad de fibra.
d. Estandarización de pesos en ovinos.
e. Medición de caracteres de calidad de la fibra.
f. Interpretación de valores genéticos en poblaciones.
65
FACTORES DE AJUSTE MULTIPLICATIVO PARA PESO AL
DESTETE SEGÚN SEXO DEL CORDERO,
EDAD DE LA MADRE Y TIPO DE NACIMIENTO
Peso Ajustado 180 días = Peso Dest. Aj. final. + (Peso final – peso destete) * 90
Edad final – edad destete
66
TAREA
Con la siguiente información estandarice el peso a los 90 días y a los 180 días de los
siguientes ovinos y determine los dos mejores y los dos peores en base al carácter
peso a los 180 días (Ajustado), para ser o no considerados como futuros reemplazos
Peso Peso
Edad Peso Peso Edad Peso de Edad de
Tipo de destete final
Cordero Sexo madre Nac Destete destete venta selección
parto Ajustado Ajustado
(años) (Kg) (Kg) (días) (Kg) (días)
90 dias 180 dias
1 Macho 1 Simple 2.9 25 89 45 191
2 Hembra 2 Doble 2.8 29 93 48 195
3 Macho 1 Doble 2.7 23 80 49 185
4 Hembra 1 Simple 4 28 85 44 179
5 Hembra 1 Doble 2.5 24 83 45 175
6 Macho 2 Doble 3 29 84 45 189
7 Macho 2 Simple 4 31 99 47 175
8 Macho 4 Triple 2.9 25 75 49 179
9 Macho 2 Doble 2.8 29 84 44 170
10 Hembra 2 Doble 2.6 28 83 44 174
11 Hembra 7 Simple 3 28 83 43 185
12 Hembra 6 Triple 2.5 30 88 48 184
13 Macho 5 Triple 2.6 32 89 43 181
14 Macho 3 Doble 3.1 33 93 49 179
15 Macho 4 Simple 3.5 25 84 45 179
16 Hembra 5 Triple 2.5 24 87 45 183
17 Hembra 4 Doble 2.8 21 88 44 185
18 Macho 4 Simple 3.5 22 83 43 195
19 Macho 6 Triple 2.9 26 84 42 193
20 Hembra 7 Doble 2.8 24 85 41 191
1. ¿Cuál es el promedio?
67
3. ¿Cuál es la desviación estándar fenotípica?
68
XI. ESTADISTICA APLICADA AL MEJORAMIENTO GENÉTICO
(PRÁCTICA DE REPASO)
1) OBJETIVOS:
• Entender los conceptos de la estadística descriptiva
• Conocer las propiedades de la distribución normal o gausiana
• Aplicar los conceptos de probabilidad en ganadería
• Entender la aplicación de la estadística en la mejora animal
FIGURA 1
69
Lo primero es definir una población base. Puede ser una raza, una raza de una región,
una especie, los bovinos de una zona, de un país, etc. esta población base está
caracterizada por parámetros y por distribuciones de probabilidad. Es sobre esos
parámetros (medias, varianzas, correlaciones, regresiones, etc.) que deseamos
saber algo, generalmente sus valores. Como lo común es que no se trabaje con todos
los elementos de la población base, se define un proceso de muestreo, que debe
cumplir ciertos requisitos (aleatoriedad, representatividad) para que la etapa de
inferencia sea válida. A partir de esta muestra se calculan todos los estadísticos que
son estimaciones de los parámetros de la población. Sobre la base de estos valores
se realizan pruebas de hipótesis. La etapa final esla inferencia estadística, o sea,
extrapolar estos resultados a la población base. Si calculamos la heredabilidad de los
caracteres X e Y en la muestra, realmente nos interesa no lo que pueda pasar en un
programa de selección realizado en la muestra, sino en un programa realizado en la
población base que es el verdadero objeto de nuestro trabajo de mejoramiento
genético.
70
La distribución normal tiene forma de campana con la mayoría de las observaciones
cerca de la media o del promedio. Ciertos estadísticos son particularmente en
caracterizar y resumir caracteres que tienen variables continuas con una
distribución normal.
FIGURA 2
La media es uno de los estadísticos más simples y también uno de los más útiles
en describir la distribución normal. La media de la muestra es un estimado del valor
promedio para una población. La media identifica en donde está localizadoen
centro de la distribución normal y donde la mayoría de los valores de rendimiento se
espera que estén localizados. Mientras que la media se localiza enel centro de la
distribución normal, la varianza y la desviación estándar miden la amplitud o
distribución de la media. La desviación estándar es más fácil de entender ya que
sus unidades son las mismas que las observaciones originales. La desviación
estándar puede ser usada para predecir la probabilidad de que las observaciones
difieran por una cierta cantidad de la media en una distribución normal.
71
PARÁMETRO FORMULA DEFINICIÓN Y USO
Definición: Promedio aritmético.
Uso: Se utiliza para indicar cuál es el
𝑛
Xi valor central de una población o un
Media (μ)
𝜇 = ∑ grupo de animales para un carácter
𝑋 analizado.
𝑛 La media marca el centro de la
i=1
distribución normal para la variable en
estudio. También se utiliza para calcular
la varianza y la covarianza.
72
Correlación Definición: Parámetro que mide el grado
de “fortaleza” en la relación de dos
(r) COV (𝑥, 𝑦) variables.
𝑟(𝑥, 𝑦) = Usos: Aporta el signo (sentido) y fortaleza
𝜎𝑥𝜎𝑦 (grado) de la relación entre ambas
variables. Toma valores entre 1 y
–1. En Mejora Genética hablamos de
correlaciones genéticas, correlaciones
∑𝑛 1(Xi − 𝜇𝑋)(𝑌i − 𝜇𝑦) fenotípicas y correlaciones ambientales
i=
𝑟𝑋𝑌 = entre caracteres o parámetros. También
√∑𝑛 (Xi − 𝜇𝑥)2 √∑𝑛 (Xi − 𝜇𝑦)2
i=1 i=1 se emplea para ver la correlación entre los
valores de cría y fenotípicos (indicador de
la heredabilidad) o la precisión en la
estimación de los valores de cría
(correlación entre el valor de cría
verdadero y el valor de cría estimado).
3) TEXTOS RECOMENDADOS:
• Cardellino, F y Rovira. 1994. Mejoramiento Genético Animal. Ed.Hemisferio
Sur.
73
Esta guía de practicas fue desarrollada tomando ejercicios y ejemplos adaptados de los siguientes
documentos. Para más información, se sugiere al estudiante revisarlos.
1. Buxadé, Carlos. 1995. Tomo IV. Genética, Patología, Higiene y Residuos Animales. Ediciones Mundi-
Prensa. Madrid. España. IV: 6-181.
2. Cardellino, F y Rovira. 1994. Mejoramiento Genético Animal. Ed. Hemisferio Sur.
3. Falconer, D.S., Mackay, T.F.C. 1996. Introduction to quantitative genetics. Ed. Prentice Hall
4. Fernandez, G, Mernier, B, Silveira, C. 2002. Guía de prácticas de mejora genética. Universidad de la
Republica. Uruguay.
5. Simm G. 1998. Genetic improvement of cattle and sheep.
6. Spike 2009. Guia de prácticas de mejoramiento genético. Iowa State University. USA.
7. Vilela, J. 2014. Mejoramiento Genético en Animales Domésticos. 1ra Edición. Editorial Macro. Perú
74