Libro Final
Libro Final
Libro Final
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
1
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
1
© LA INVESTIGACIÓN CON Streptomyces spp. COMO HERRAMIENTA PARA EL ESTUDIO DE LOS MICROORGANISMOS
DEL SUELO
ISBN : 978-958-8859-62-0
ISBN Digital : 978-958-8859-61-3
Comité editorial:
© Rodolfo López Franco
© Adalucy Álvarez Aldana
© Daniel Arturo León Rodríguez
© Olga María Henao Trujillo
Imagen de la portada:
Título: Streptomyces spp.
Técnica: Fotografía / Tomada por Rodolfo López Franco- Laboratorio Microbiología.
Programa de Microbiología- Facultad de Ciencias de la Salud.
Diagramación y diseño:
Martha Liliana Giraldo Gallego
Molano Londoño e Hijos S.A.S.
Editorial Zapata - Manizales
Impresión:
Molano Londoño e Hijos S.A.S.
Editorial Zapata - Manizales
Reservados todos los derechos. No se permite la reproducción total o parcial de esta obra, ni su incorporación a un sistema informático,
ni su transmisión en cualquier forma o por cualquier medio (electrónico, mecánico, fotocopia, grabación u otros) sin autorización previa
y por escrito de los titulares del copyright. La infracción de dichos derechos puede constituir un delito contra la propiedad intelectual.
2
UNIVERSIDAD LIBRE
PEREIRA
DIRECTIVOS NACIONALES
Jorge Orlando Alarcón Niño
Presidente Nacional
DIRECTIVOS SECCIONALES
Miguel Hernando González Rodríguez
Presidente
3
AUTORES
5
Laura Katherine Pavas
6
TABLA DE CONTENIDO
INTRODUCCIÓN 9
Capítulo 1.
Streptomyces spp.: su importancia en la actividad de los suelos agrícolas 11
Capítulo 2.
Aislamiento de Streptomyces spp., a partir de un nicho ecológico del campus Belmonte de la
Universidad Libre, seccional Pereira. 19
Capítulo 3.
Pruebas bioquímicas para la identificación de Streptomyces spp. De aislados del campus de la
Universidad Libre 31
Capítulo 4.
Evaluación del desempeño en diferentes condiciones de laboratorio de aislados de
Streptomyces spp. 41
Capítulo 5.
Marcadores moleculares para Streptomyces spp. 56
Capítulo 6.
Microorganismos circunstantes en el proceso del compostaje de subproductos de la caña
de azúcar 67
7
INTRODUCCIÓN
LA INVESTIGACIÓN CON Streptomyces spp. COMO HERRAMIENTA PARA EL ESTUDIO
DE LOS MICROORGANISMOS DEL SUELO
Son diversas las formas en las que los que se reporta su presencia en las distintas fases
microorganismos participan en la actividad de los procesos de compostaje.
de los suelos agrícolas; algunos grupos actúan En el documento que se entrega a
como microorganismos solubilizadores de continuación, se reporta la búsqueda de
fósforo, al igual que otros son capaces de información relacionada con Streptomyces
solubilizar el potasio, permitiendo que los spp., tanto por sus generalidades como por
minerales del suelo sean de fácil acceso para sus posibildades de aplicar metodologías
las raíces vegetales, donde su consumo de relacionadas con marcadores moleculares, que
energía se afecta positivamente, en la búsqueda ubiquen al lector en el entorno científico de los
de elementos nutricionales. Además, un buen microorganismos del suelo. También se registra
número de tales microorganismos pueden la experiencia investigativa de laboratorio,
aportar sustancias que fomentan la actividad realizada con el género Streptomyces spp., desde
antimicrobiana, contra microorganismos la selección de nichos biológicos potenciales
fitopatógenos de vida libre en el suelo, evitando para aislamiento de microorganismos del suelo,
su diseminación y daño a los vegetales, sumados pasando por sus diferentes posibilidades de
a las bacterias que se reportan como promotoras aislamiento in vitro, además de la confirmación
de crecimiento vegetal. Muchos otros de diferentes técnicas bioquímicas aplicadas,
microorganismos son capaces de actuar como luego de evaluar el desempeño de Streptomyces
elementos entomopatógenos, que de diversas spp. en diferentes condiciones de crecimiento
maneras desarrollan actividad favorable en el in vitro en el laboratorio, con propósitos de
control de insectos plaga, tanto de las plantas su manejo en procesos de biocompostaje
como de los animales y el mismo ser humano. de subproductos agrícolas. Por último, se
Existen hongos que se destacan por su realiza una evaluación de microorganismos
condición de simbiosis como micorrizógenos, circunstantes en el proceso de compostaje de
que ayudan en la rizosfera a la captura de subproductos de la industria azucarera, donde se
elementos nutricionales del suelo, que son registra la presencia de Bacillus spp. y Aspergillus
llevados hasta las células corticales vegetales, spp. que se reportan por diversos investigadores
pasando vía simplasto y apoplasto, hasta llegar como importantes en el compostaje de diversos
a los haces vasculares. Otros microorganismos materiales biológicos de origen vegetal.
trabajan como descomponedores de la materia Recoge los diferentes planteamientos,
orgánica del suelo; unos son ligninolíticos conceptos, teorías y experiencias, de
mientras que otros se desempeñan como varios autores, que nos ayudan al estudio
celulolíticos. En este último grupo, se ha y la comprensión de Streptomyces spp., en
demostrado la capacidad que exhiben los beneficio de su aplicación como elemento de
actinomicetos del género Streptomyces spp para la biotecnología, para posteriores procesos
la descomposición de materiales vegetales, de lo biofertilizantes.
9
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
10
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
11
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
13
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
fases mesófilas y termófilas que implican geográfico del Río Cauca, se superan las 24.000
numerosos microorganismos. En varias etapas t de compost mensuales, producto de las plantas
que se suceden, las comunidades microbianas de procesamiento de residuos de caña de azúcar
son capaces de degradar sustratos orgánicos (13).
a formas humificadas más estables, junto con El crecimiento microbiano en procesos de
productos inorgánicos, donde se genera calor compostaje se logra con humedades entre 50% y
como producto de desecho metabólico. Debido 70%, con excelente actividad biológica, mientras
a la complejidad de sustratos y productos que decrece cuando la humedad sea inferior
intermedios, la diversidad microbiana y la al 30%; pero con humedad superior al 70%,
sucesión de poblaciones es una condición que el agua desplaza al aire en los espacios libres,
puede garantizar la biodegradación completa. ocasionando una reducción en la capacidad
Como es un proceso dinámico, en tiempo y en de transferencia de oxígeno, generando
espacio (micro hábitats), se refleja de manera condiciones de anaerobiosis, convirtiéndose
constante en el cambio de pH, la humedad, la en otra causa de los malos olores, además de
temperatura, que dificulta detectar y/o aislar disminuir la velocidad del proceso (14,15).
todos los microorganismos implicados en el Para evaluar pH sobre el crecimiento de
proceso (10). microorganismos en procesos de compostaje,
Basanta et al. (11), analizaron la problemática con aireación pasiva y sin aireación, Castrillón
que se genera con los residuos de la industria et al. (16) analizaron muestras de compost
azucarera, así como las posibilidades de reciclaje (de ambos tratamientos) que se incubaron
de los mismos, en un contexto de desarrollo en medio de cultivo cuyo pH se ajustó, según
sostenible; proponen la necesidad de investigar tratamientos, para valores de: 5, 6, 7, 8, 9
sobre metodologías de su compostaje con mejor comparados con pH de campo; a las 24 horas
aprovechamiento de los residuos, teniendo se sembraron para realizar el recuento de
en cuenta que la incorporación de residuos bacterias, mohos, levaduras y se realizó el
orgánicos frescos causa daños a las plantas, conteo de microorganismos; confirmaron que
debido a que en el proceso de descomposición el pH indica diferencias significativas en el
se liberan fitotoxinas, con aumento de crecimiento de bacterias (pH 5 para ambos
temperatura y disminución de la concentración tratamientos), mientras que en el compost
de oxígeno, por lo que el reciclaje de los residuos aireado, los mohos (pH 8) y levaduras (pH 9)
de la agroindustria azucarera debe pasar por un mostraron los mejores registros.
proceso previo de compostaje para su uso como En trabajos de caracterización microbiológica
biofertilizante. y su función en los procesos de compostaje
Deberá tenerse en cuenta que la incorporación de subproductos de la industria azucarera, a
al suelo de los subproductos cachaza, bagazo y los 30, 60 y 90 días de iniciado el compost, se
vinaza, en condiciones frescas, puede generar evaluó la dinámica poblacional de diferentes
un impacto negativo sobre las plantas; por microorganismos; se cuantificó las bacterias
tanto, realizar compostaje con dichos residuos, celulolíticas por el método del número más
permite su mejor aprovechamiento al emplearse probable; para la cuantificación de bacterias
como biofertilizante (12). heterótrofas aerobias mesófilas y termófilas
La práctica de compostaje ha avanzado y hongos, aplicaron el método de recuento
en los últimos años, contando en diferentes en placas; se reportó que el pH cercano a la
regiones con plantas de tratamiento de neutralidad permite que las bacterias mesófilas
residuos, principalmente de origen agrícola, lideren la fase inicial y la fase de estabilización,
con variaciones en materias primas, según mientras que en la fase termófila son las
la zona y el cultivo; para la región del valle termófilas las que se encuentran en mayor
14
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
proporción que las mesófilas. En la medida que esporas (comúnmente llamadas conidias), con
avanza el proceso de compostaje, las bacterias frecuencia en cadenas, que pueden ser rectas o
celulolíticas descienden en su actividad, flexuosas, enruladas o espiraladas. La superficie
mientras que los hongos la incrementan al de la espora puede ser lisa, rugosa o espinosa,
final del proceso; sin embargo, se registra la formando pigmentos asociados con las esporas
dominancia de Aspergillus flavus en la fase (azules, verdes, grises, rojos, violetas, blandos
inicial, y A. fumigatus en la fase termófila (17). o amarrillos). A diferencia de Norcardia,
Streptomyces no reduce nitratos o nitritos.
Streptomyces spp. Suelos alcalinos y neutros son más favorables
Son diversos los trabajos de investigación para el desarrollo de Streptomyces que los suelos
que tienen como objetivo acortar el tiempo ácidos (21).
de maduración del proceso de compostaje; Streptomycetes son habitantes naturales del
Chen et al. (18) realizaron la reinoculación suelo, que conforman un grupo heterogéneo
de microorganismos termotolerantes aislados de microorganismos unicelulares; producen la
a partir del mismo compost, entre los que sustancia geosmin, responsable de la fragancia
registran el género Streptomyces como terrosa después de las lluvias; además, contienen
importante en dicha operación. También una amplia variedad de metabolitos secundarios
Jiménez (19) registró aceleración del proceso de que poseen antibacterianos, antifúngicos y
compostaje en las pilas que fueron inoculadas antivirales, entre otros: ellos juegan un papel
con Streptomyces spp. Además, Escudero y importante en la mineralización en los procesos
Arias (20) evaluaron el mejor comportamiento del suelo, además de descomponedores de restos
de las colonias de Streptomyces en condiciones vegetales, con la ayuda de una gran cantidad
de humedad superior al 72%, y que su ubicación de enzimas requeridas en las actividades de
en la superficie de las pilas les permitió un buen degradación (22).
desarrollo. Estudios realizados con comunidades de
El género Streptomyces forma parte del Streptomyces spp., a partir de los materiales
orden Actinomicetales. Son actinomicetos de nidos fecales de termitas (Coptotermes
aerobios y se han venido agrupando según formosanus) que fueron muestreados en diversos
criterios morfológicos, tales como la capacidad lugares, permitió registrar que todos los nidos
de formar filamentos ramificados y esporas. tienen alguna manera confiable de asociación
La identificación de estas bacterias sigue con Streptomyces spp., entendiéndose que los
siendo difícil, y su diagnóstico y clasificación contenidos del nido fecal de C. formosanus,
se basa en características morfológicas (macro proporciona condiciones nutricionales para
y microscópicas), en las quimiotaxonómicas Streptomyces spp., con beneficiosos para el
y en las bioquímicas. Los representantes ambiente del suelo (23).
del género Streptomyces son gram positivas, La importancia de Streptomyces spp. en
aerobias estrictas y catalasa positiva; que no el biocontrol de enfermedades existentes en
se colorean con la técnica de Ziehl-Neelsen ni el suelo que afectan a las plantas, se puede
de Kinyoun (decoloración por ácido sulfúrico entender por las interacciones entre especies
al 2%); producen filamentos (o micelios) mediadas por antibióticos, debido a que los
largos (de 0.5 a 1.0 µm de diámetro y una impactos de una especie sobre otra, generan
longitud indefinida), muy ramificados; exhiben cambios en la dinámica de ellos; así, la detección
filamentos aéreos que pueden ser rudimentarios de tales impactos requiere métodos eficaces
o extensos y pueden estar embellecidos por que permitan la cuantificación de poblaciones
espirales, enroscamientos o ramificaciones y se puedan identificar las relaciones de las
múltiples. Tales filamentos aéreos producen comunidades microbianas (24).
15
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
Para Tokala et al. (25), Streptomyces lydicus multiplicación masiva con propósitos de
es un actinomiceto capaz de colonizar raíces, aplicarse en el compostaje de subproductos de
que inicialmente se aisló para evaluar sus la caña de azúcar.
propiedades como agente de control biológico
antimicótico, mediante la colonización Referencias bibliográficas
micoparasitaria de agentes patógenos causantes 1. López R. (2009). Fisiología Vegetal,
de enfermedades fúngicas en las raíces, con Un Enfoque Teórico. Editorial Arte Imagen.
la excreción de metabolitos antifúngicos en Armenia, Colombia. Isbn 978-958-44-5911-4.
la zona de rizosferas vegetales. Los mismos 134p.
autores indican que la cepa WYEC108 puede 2. Taiz, L., & Zeiger, E. (2006). Fisiologia
actuar como bacteria promotora de crecimiento Vegetal (Vol. 10). Universitat Jaume I.320 P.
vegetal. 3. Wei, Y., Wei, Z., Cao, Z., Zhao, Y., Zhao,
En trabajo realizado con residuos sólidos X., Lu, Q., … Zhang, X. (2016). A Regulating
orgánicos municipales, los autores reportan Method For The Distribution Of Phosphorus
que, en el proceso de compostaje, las Fractions Based On Environmental Parameters
poblaciones microbianas indicaron presencia Related To The Key Phosphate-Solubilizing
de actinomicetos (bacterias Gram-positivas), Bacteria During Composting. Bioresource
representados por Streptomyces, cuya actividad Technology, 211, 610–617. Http://Doi.
se registró con más frecuencia en todos los Org/10.1016/J.Biortech.2016.03.141
tratamientos evaluados (26). 4. Zhao, Y., Lu, Q., Wei, Y., Cui, H., Zhang,
En un trabajo realizado para la identificación X., Wang, X., … Wei, Z. (2016). Effect Of
de poblaciones microbianas presentes en Actinobacteria Agent Inoculation Methods On
compost a partir de residuos orgánicos de Cellulose Degradation During Composting
fincas cafeteras, tanto en los sustratos simples Based On Redundancy Analysis. Bioresource
como en los complejos evaluados, se indica que Technology, 219, 196–203. Http://Doi.
los microorganismos de mayor importancia Org/10.1016/J.Biortech.2016.07.117
se relacionan con actnomicetes del género 5. Sánchez De Prager, M., Posada, R.,
Streptomyces, además de bacterias del género Velásquez, D., & Narváez, M. (2010).
Bacillus y el hongo Aspergillus (27). Metodologías Básicas Para El Trabajo Con
Por tanto, el Grupo de Investigación Micorriza Arbuscular Y Hongos Formadores
MICROBIOTEC de la Universidad Libre Pereira, De Micorriza Arbuscular. Universidad Nacional
tiene especial interés por los microorganismos De Colombia, Palmira.
benéficos del suelo, con énfasis en el género 6. Cisneros, R. O. J. A. S., Carlos, A., Sánchez
Streptomyces, debido a su gran importancia en De P, M., Menjivar, F., & Carlos, J. (2016).
la participación de los procesos de compostaje Influencia De Microorganismos Solubilizadores
de materiales vegetales, entre otras razones. De Fósforo Del Suelo Y Su Absorción Por
Para su estudio, en el campus Belmonte se Plántulas De Café. Bioagro, 28(2), 95-106.
ha aislado una cepa del género Streptomyces; 7. Shanware, A. S., Kalkar, S. A., & Trivedi, M.
con dicho actinomiceto se han desarrollado M. (2014). Potassium Solublisers: Occurrence,
diferentes estudios, que han permitido la Mechanism And Their Role As Competent
elaboración del presente libro de investigación, Biofertilizers. Int J Curr Microbiol App Sci, 3(9),
donde se describen las diferentes fases, desde 622-9.
su aislamiento, pasando por diferentes pruebas 8. Peters, S., Koschinsky, S., Schwieger, F., &
bioquímicas de confirmación, además de evaluar Tebbe, C. C. (2000). Succession Of Microbial
aspectos de manejo del microorganismo, en Communities During Hot Composting As
condiciones de laboratorio, para su posterior Detected By Pcr–Single-Strand-Conformation
16
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
17
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
18
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
19
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
21
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
Figura 1. Tipos de ecosistemas presentes en la Universidad Libre Seccional Belmonte (Fuente: Autores).
22
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
Se analizó un nicho ecológico (Figura la NTC 3656 que incluye fecha, hora, nombre de
2), basados en la metodología propuesta la persona que realiza el muestreo, profundidad,
por Korayem et al. (2015widely used in tipo de análisis, mapa o esquema de la zona
pharmaceutical, cosmetic and food industries. muestreada.
The current study aimed to isolate Streptomyces Para optimizar y homogenizar las muestras
species from Egyptian arid soil, efficient in se adoptó la metodología enunciada en el
biosurfactant production. Fifty isolates of Manual de Laboratorio de Análisis Químico de
Streptomyces were obtained from arid soil Suelos de la UTP (7).
in Egypt. Primary screening, using lipase, Las muestras fueron recolectadas en bolsas
drop collapse, parafilm M and haemolysis con cierre hermético (Ziploc®); desde su sitio
tests, showed 37 isolates (74%) (26) para el de recolección, las muestras se transportaron
aislamiento de Streptomyces spp. en suelos en nevera portátil hasta al laboratorio de
áridos, así como la metodología propuesta por Microbiología, donde se llevó a cabo el proceso.
Salazar y Ordóñez (7), para el aislamiento de El trabajo se realizó en el laboratorio de
actinomicetos en diferentes ecosistemas. El sitio Microbiología de la Universidad Libre Seccional
de recolección de la muestra de suelo se indica Pereira. El cuarteo de las muestras de suelo se
con su posicionamiento geográfico, haciendo realizó sobre superficies asépticas; retirando
uso de un equipo GPS que denota: 4°48’19.72”N raíces, piedras y otros residuos sólidos (figura
75°45’34.91” O Elevación 1246 m. Dicho suelo 3). Paso seguido, se formó un montón simétrico
indicó al tacto una textura franco limosa, propia el cual se dividió en cuatro partes iguales, dos
de un suelo de la Unidad Montenegro, presente de las cuales se desecharon y los dos restantes
en la región del Eje Cafetero. se mezclaron nuevamente hasta homogeneidad
(Figura 4). Estos pasos se repitieron hasta lograr
una cantidad de muestra cercana a 100 g (NTC
3656) (Figura 5).
23
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
Componentes g/L
Sacarosa 20
CaCl2 0.2
KH2PO4 1
MgSO4 0.2
FeSO4 0.005
NaCl 0.2
Agar-Agar 15
Figura 6. Preparación de las diluciones desde 10-1
hasta 10-7
Se agregaron los componentes al agua
Para efectuar el aislamiento de especies de destilada; seguido se calentó hasta ebullición
Streptomyces, se tomaron 10 g de la muestra; por 5 min y se llevó a condiciones de autoclave
luego se suspendieron en 90 ml de agua estéril, (15lb y 121°C), por 20 min. Por último, se sirvió
y se realizaron diluciones por duplicado desde en cajas de petri estériles.
10-1 hasta 10-7 en solución peptona (28). También se empleó el agar GYM, propuesto
Para la suspensión de las diluciones, se por Glazebrook et al. (18) y por Shima et al. (19),
empleó el medio Agar-Avena (Tabla 1), cuyos componentes (Tabla 3) y preparación se
propuesto por Curvelo y Rojas (19). indican:
24
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
25
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
26
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
27
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
28
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
11. Joshi, M. V., Bignell, D. R., Johnson, Microbiology, 136(3), 581–588. Http://Doi.
E. G., Sparks, J. P., Gibson, D. M., & Loria, Org/10.1099/00221287-136-3-581
R. (2007). The Arac/Xyls Regulator Txtr 19. Shima, J., Hesketh, A., Okamoto, S.,
Modulates Thaxtomin Biosynthesis And Kawamoto, S., & Ochi, K. (1996). Induction Of
Virulence In Streptomyces Scabies. Molecular Actinorhodin Production By Rpsl (Encoding
Microbiology, 66(3), 633-642. Ribosomal Protein S12) Mutations That Confer
12. Seipke, R. F., Kaltenpoth, M., & Hutchings, Streptomycin Resistance In Streptomyces
M. I. (2012). Streptomyces As Symbionts: An Lividans And Streptomyces Coelicolor A3(2).
Emerging And Widespread Theme?. Fems Journal Of Bacteriology, 178(24), 7276–84.
Microbiology Reviews, 36(4), 862-876. Http://Doi.Org/10.1128/Jb.178.24.7276-
13. Kinkel, L. L., Schlatter, D. C., Bakker, 7284.1996
M. G., & Arenz, B. E. (2012). Streptomyces 20. Song, J., Lee, S.-C., Kang, J.-W., Baek, H.-
Competition And Co-Evolution In Relation J., & Suh, J.-W. (2004). Phylogenetic Analysis Of
To Plant Disease Suppression. Research In Streptomyces Spp. Isolated From Potato Scab
Microbiology, 163(8), 490–499. Http://Doi. Lesions In Korea On The Basis Of 16s Rrna Gene
Org/10.1016/J.Resmic.2012.07.005 And 16s-23s Rdna Internally Transcribed Spacer
14. Lu, L., Zeng, G., Fan, C., Ren, X., Wang, Sequences. International Journal Of Systematic
C., Zhao, Q., Jiang, M. (2013). Characterization And Evolutionary Microbiology, 54(1), 203–209.
Of A Laccase-Like Multicopper Oxidase Http://Doi.Org/10.1099/Ijs.0.02624-0
21. Schumann, P., & Maier, T. (2014). Chapter
From Newly Isolated Streptomyces Sp. C1 In
13 – Maldi-Tof Mass Spectrometry Applied To
Agricultural Waste Compost And Enzymatic
Classification And Identification Of Bacteria. In
Decolorization Of Azo Dyes. Biochemical
Methods In Microbiology (Vol. 41, Pp. 275–306).
Engineering Journal, 72, 70–76. Http://Doi.
Http://Doi.Org/10.1016/Bs.Mim.2014.06.002
Org/10.1016/J.Bej.2013.01.004 22. Montero-Calasanz, M. D. C., Goker, M.,
15. Cruz C., N., Castellanos S., D., & Argüello Potter, G., Rohde, M., Sproer, C., Schumann,
A., H. (2011). Degradación De Celulosa Y P., … Klenk, H.-P. (2013). Geodermatophilus
Xilano Por Microorganismos Aislados De Dos Normandii Sp. Nov., Isolated From Saharan
Tipos De Compost De Residuos Agrícolas En Desert Sand. International Journal Of Systematic
La Sabana De Bogotá. Revista Colombiana De And Evolutionary Microbiology, 63(Pt 9), 3437–
Ciencias Hortícolas, 3(2), 237–249. Http://Doi. 3443. Http://Doi.Org/10.1099/Ijs.0.051201-0
Org/10.17584/Rcch.2009v3i2.1215 23. Murashige, T., & Skoog, F. (1962). A
16. Jiménez Oj. Compostaje Indore Revised Medium For Rapid Growth And
Modificado Aplicado A Residuos Orgánicos Bio Assays With Tobacco Tissue Cultures.
Producto De Podas Vegetales. Jornadas Técnicas Physiologia Plantarum, 15(3), 473–497. Http://
Isa. 2012. 6p. Doi.Org/10.1111/J.1399-3054.1962.Tb08052.X
17. Curvelo, L. C., & Rojas, J. A. (2010). 24. Micropropagación Vegetal. Una Guía
Revisión Preliminar De Medios De Cultivo Teórico-Práctica. Editorial Arte Imagen.
Empleados En Estudios De Microorganismos Armenia, Colombia. Isbn 978-958-44-5925-1.
De Los Phylums Ascomycetes, Deuteromycetes 84p.
Y Oomycetes Como Agentes Causantes De 25. Ramírez L.A., Castaño S.M., López R.
Enfermedades En Plantas. (2009). Identificación De Bacterias Que Afectan
18. Glazebrook, M. A., Doull, J. L., El Establecimiento In Vitro De Segmentos
Stuttard, C., & Vining, L. C. (1990). Nodales De Guadua Angustifolia Kunth. Revista
Sporulation Of Streptomyces Venezuelae De Investigaciones Universidad Del Quindío.
In Submerged Cultures. Journal Of General 19:151-158.
29
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
30
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
31
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
33
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
el género Streptomyces son utilizados medios de carbono es uno de los componentes del medio
cultivo como el Agar avena donde sus nutrientes que ayudan a una identificación precisa (8).
y las condiciones ambientales permiten ver Las pruebas bioquímicas se basan
las colonias con particularidades altamente específicamente en la identificación de
significativas; en la parte más baja de la colonia una enzima generada al interior de un
consiste de hifas de micelio vegetativo y sustrato microorganismo para lograr la degradación
ramificado que comprenden directamente el de un sustrato dado. Existen pruebas que
medio, en la superficie se encuentra cubierta de pueden generar resultados a corto plazo como
hifas aéreas que utilizan nutrientes primarios la evaluación de enzimas preformadas; otro
procedentes de la hidrolisis del micelio sustrato tipo de pruebas es la detección de metabolitos,
más viejo. El estado final del desarrollo es la o la determinación de sensibilidad a ciertas
conversión de micelio aéreo en esporas y esto sustancias adicionadas al medio de cultivo;
ocurre en la parte más alta del micelio aéreo, algunas pueden realizarse de forma rápida, tras
donde se forman septos; finalmente estas la incubación del microorganismo de 2 a 6 horas,
esporas pueden dispersarse y reestablecer su donde se llevan a cabo reacciones enzimáticas
cromógenas o pruebas convencionales
ciclo de vida (6).
modificadas (9).
En la presente investigación se realizó
Prueba de catalasa: La catalasa es una
la evaluación de pruebas bioquímicas para
enzima presente en todas las bacterias aerobias
Streptomyces spp., sobre las cepas obtenidas de
descrita fue por Loew (10). La catalasa utiliza
aislados del campus Belmonte de la Universidad
una molécula de peróxido de hidrógeno (H2O2)
Libre Seccional Pereira; el propósito consistió
que se forma como producto terminal oxidativo
en confirmar la presencia de microorganismos
de la descomposición aeróbica de los azucares;
como presuntos Streptomyces spp. según
el peróxido de hidrogeno es descompuesto en
sus características morfológicas in vitro.
agua y oxígeno, donde el O2 genera un burbujeo
Por tanto, la pregunta que encaminó la
indicando que la reacción es positiva (11).
investigación se relacionó con la capacidad
Prueba de oxidasa: La enzima citocromo-
de identificar, mediante pruebas bioquímicas,
c-oxidasa fue descrita por Mac Munn (10);
los microorganismos del género Streptomyces
la reacción de oxidasa se debe a la presencia
sp., de cultivos que estuvieron sometidos
de un sistema citocromooxidasa presente
a diferentes condiciones de laboratorio, de
en organismos aerobios, algunos anaerobios
aislados obtenidos en el Campus Belmonte de
facultativos y, excepcionalmente, en algún
la Universidad Libre.
microaerófilo, esta enzima se activa con la
oxidación del citocromo que es reducido por el
Pruebas bioquímicas para la identificacion
oxígeno molecular que produce agua o peróxido
de Streptomyces spp.
de hidrógeno según la especie bacteriana, el
Para la identificación de Streptomyces sp.
oxígeno actúa como aceptor final de electrones
es necesario adoptar rutas metabólicas para
en la cadena transportadora de electrones;
la escogencia del modelo, las más utilizadas
donde al estar en contacto con el reactivo de
la cual ha dado resultados satisfactorios son:
kovacs tiñe las colonias oxidasa positivas de
hidrolisis de almidón, hidrolisis de caseína,
color fucsia que vira gradualmente a púrpura
actividad catalasa, oxidasa, descomposición de
(12).
tirosina entre otras (1). Es necesario saber qué
Prueba rojo de metilo: Esta prueba se
tipo de medio líquido y solido es ideal para su
realiza para determinar la capacidad de un
crecimiento (7); así mismo se debe conocer cada
microorganismo de fermentar la glucosa con
uno de sus componentes, donde la fuente de
producción de ácido por la vía ácido mixta o
34
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
con producción de un producto final neutro fuente de carbono, siendo estos componentes
como la acetoína por la vía butanodiólica, necesarios para el desarrollo bacteriano; es un
donde la coloración roja, indica la presencia de medio de cultivo diferencial en base a que los
ácidos provenientes de la fermentación de la microorganismos capaces de utilizar citrato
glucosa que constituye un resultado positivo y como única fuente de carbono, usan sales de
una coloración amarilla constituye una reacción amonio como única fuente de nitrógeno, lo
negativa (13). cual permite una producción de alcalinidad. El
Prueba Vogues proskauer: La glucosa puede metabolismo del citrato se realiza, en aquellas
ser metabolizada por los microorganismos, a bacterias poseedoras de citrato permeasa
través de diversas vías metabólicas, según la obteniendo reacciones con viraje a color azul
vía utilizada se originarán productos finales (16)
ácidos o neutros, que podrán ser reconocida
por la adición de alfa naftol para evidenciar Degradación de celulosa
la presencia de productos finales neutros, El ecosistema del compostaje es un foco
donde una coloración rojiza que aparece en apropiado para la identificación de gran
los medios de cultivo con glucosa de ciertos diversidad de microorganismos y metabolitos
microorganismos, es dada por la oxidación del secundarios, asociados a la degradación de
acetilmetil carbinol a diacetilo el cual reacciona celulosa participando en una parte importante
con la peptona del medio (13). del ciclo biogeoquímico del carbono (17).
Licuefacción de gelatina: La prueba de La celulosa es uno de los compuestos de
licuefacción de gelatina se utiliza como medio mayor abundancia presente en la biomasa
de cultivo gelatina nutritiva, en esta prueba vegetal, generalmente es descompuesta por
se pretende determinar la capacidad de un microorganismos con acciones enzimáticas
microorganismo de producir enzimas de tipo asociadas en complejos, siendo comúnmente
proteolíticas como las gelatinasas que licuan denominadas en actinomicetos celulosomas; las
e hidrolizan la gelatina o muestran cambios actividades hidrolíticas de estas enzimas se ven
característicos debido a los productos de seriamente afectadas por una gran diversidad
degradación (14). de factores físicos y químicos, es por esto que el
Hidrolisis de urea: El medio de cultivo urea aislamiento de microorganismos que segregan
formulado por Rustigian y Stuart, contiene enzimas al medio extra celular con propiedades
extracto de levadura como única fuente de específicas que puedan soportar variables como
carbono, nitrógeno, vitaminas y cofactores, temperatura, pH, solventes orgánicos entre
y aporta los nutrientes esenciales para el otros, son de gran interés a nivel industrial (18).
desarrollo bacteriano. Las sales de fosfatos Streptomyces sp. es un microorganismo que
constituyen el sistema buffer, el rojo de fenol es contiene gran diversidad enzimática para la
el indicador de pH y la urea es el sustrato de degradación de celulosa, ya sea actividad de
la enzima ureasa, para aquellas bacterias que endocelulasa, exocelulasa, celobiosa, xilanasa,
poseen la enzima ureasa, pueden utilizar el pectinasa, ligninasa, peroxidasa y lacasa. Para
nitrógeno proveniente de la urea, la hidrolizan, lograr una identificación especifica de las
liberando amoníaco y dióxido de carbono, estos enzimas para la degradación de celulosa, se
productos metabólicos alcalinizan el medio, hace necesario usar métodos cualitativos y
haciendo virar el indicador a rojo fenol (15). semicuantitativos en medio de cultivo sólido;
Prueba de citrato: En este medio de cultivo, evaluándose comúnmente la actividad de
el fosfato monoamónico es la única fuente endocelulasa en medio de cultivo líquido (19).
de nitrógeno y el citrato de sodio es la única Este tipo de microrganismos que pertenecen
35
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
36
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
37
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
38
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
muestras analizadas; y resaltan la biodiversidad como el rojo congo debido a los clivajes
encontrada en un mismo hábitat (34). intramoleculares que la enzima realiza (36,37).
La prueba se basa en la capacidad que El análisis estadístico de los resultados
tienen las Enterobacterias para utilizar citrato obtenidos indica que las condiciones óptimas
de sodio como única fuente de carbono para para que Strepromyces spp. pueda alcanzar la
su crecimiento y fosfato de amonio como máxima degradación de la celulosa, suceden
única fuente de nitrógeno (16). En el ensayo con pH 9 y T 24°C (Figura 2); cabe resaltar
realizado con Streptomyces spp. se logró que el pH no es una variable que afecte de
evidenciar que esta bacteria no es utiliza citrato manera considerable la degradación, puesto
de sodio como única fuente de carbono, lo que que el crecimiento del microorganismo no
permite diferenciarlo de otros Actinomycetos se ve afectado por este factor; con respecto a
que poseen características morfológicas la temperatura se percibe que es una variable
parecidas como Actinomyces timonensis (35). importante y el desarrollo del microorganismo
Sin embargo, existe la posibilidad de utilizar el en agar CMC puede llegar a inhibirse en
medio si se agregan suplementos adicionales temperatura de incubación, debido a que el
como la glucosa, extracto de levadura y extracto medio en estas condiciones pierde humedad
de carne (31). que requiere el microorganismo para llevar
En este ensayo se llevó a cabo la evaluación a cabo todas las fases de su crecimiento (37).
de la actividad enzimática de celulasas, En el experimento 2, con pH 7 y temperatura
específicamente las endoglucanasas que actúan ambiente, se observó un halo uniforme
sobre los enlaces B-1,4 glucosídicos esta acción de degradación por acción enzimática del
se ve reflejada sobre el sustrato celulósico, en microorganismo, alrededor de las colonias en
este caso en el medio CMC y se caracteriza agar CMC de aproximadamente 1,9 cm (Figura
por la disminución de la viscosidad del medio 2).
y se detecta mucho más fácil con indicadores
39
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
40
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
41
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
42
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
43
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
45
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
46
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
47
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
Tabla 1. Diseño experimental arrojado por Excel, mezclando los factores experimentales utilizados
a lo largo del proceso
48
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
seguidamente se depositó en una celda una conocer las combinaciones adecuadas para
pequeña cantidad del líquido obtenido y se leyó cada tipo de experimento.
mediante un espectrofotómetro.
Resultados y discusion
Evaluación estadística
La evaluación estadística se llevó a cabo Activación de la cepa
mediante el programa Statgraphics centurión Se realizó la activación de la cepa mediante la
XV; se pudo combinar un buen número técnica de repique, en medio sólido y líquido; se
de procedimientos analíticos y factores realizó siembra por estría en condición sólida,
determinantes; se pudieron generar gráficos cuyo crecimiento se hizo evidente a las 48 horas
interactivos que proporcionaron un modelo después de la inoculación, en donde en las
fácil y rápido de analizar; para esto mediante primeras 24 horas se notaba una línea tenue, con
los resultados de la escala de Mc farland, la colonias habanas o amarillentas; transcurrido
temperatura, el pH y la actividad acuosa; se aquel tiempo, las colonias presentaron un color
evaluó la combinación de los factores, para morado oscuro y finalmente se tornaron de color
determinar los mejores y/o peores rendimientos gris con olor característico a tierra húmeda; esto
en el crecimiento de Streptomyces spp. En medio teniendo en cuenta que el microorganismo en
GYM en estado sólido, el programa realizo un la etapa final presentaba micelios aéreos (Figura
análisis de varianza (ANOVA), que permitió 1).
Figura 1: Activación de la cepa Streptomyces sp. Mediante repique en medio GYM líquido y sólido.
49
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
50
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
51
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
Suma de Cuadrado
Fuente Gl Razón-F Valor-P
Cuadrados Medio
A:aw 8,27751E16 1 8,27751E16 2,54 0,1718
B:pH 3,08092E15 1 3,08092E15 0,09 0,7708
C:Temperatura 5,17581E16 1 5,17581E16 1,59 0,2631
AA 1,38443E16 1 1,38443E16 0,42 0,5432
AB 2,62894E16 1 2,62894E16 0,81 0,4102
AC 2,35211E16 1 2,35211E16 0,72 0,4343
BB 3,2566E16 1 3,2566E16 1,00 0,3633
BC 4,19129E15 1 4,19129E15 0,13 0,7345
CC 7,71785E16 1 7,71785E16 2,37 0,1844
Error total 1,62887E17 5 3,25775E16
Total (corr.) 4,82944E17 14
Según el diagrama de Pareto arrojado por crecimiento; sin embargo, ninguna tuvo una
el programa Statgraphics centurión XV, hay influencia o un efecto significativo mayor que
diferencias para pH, temperatura y actividad las otras, ya que aunque variaran el cambio no
acuosa; en cuanto a su afectación en crecimiento, era muy notorio, en el grafico se puede notar
la actividad acuosa presenta en este caso el que los resultados obtenidos, no estuvieron
factor con mayor afectación a crecimiento, es cerca para considerar un efecto significativo de
decir, fue la variable en donde más se presentó relevancia. (Figura 6).
52
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
53
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
Según el pH, puede existir mayor crecimiento bajo crecimiento, aún con 28°C; con respecto
con pH 7; con respecto a la temperatura el al pH 9, se interpreta muy bajo crecimiento
crecimiento es mayor a una temperatura (Figura 17).
alrededor de 28°C; con pH 5 se puede interpretar
Figura 17: Efecto del pH y la temperatura frente al crecimiento de Streptomyces sp. A nivel estadístico.
54
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
55
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
56
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
57
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
59
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
criterios que se utilizan para su nomenclatura, a plantear a los autores que se necesitan análisis
los cuales incluyen métodos moleculares tales más a profundidad que expliquen las causas y
como hibridación ADN-ADN y tipificación de las consecuencias de dichas tasas, y permitan
ARN ribosomal 16s y 23s (9,10). entender mejor la filogenia y taxonomía de este
Entre los avances más recientes, encontramos género (13). Otro estudio por su parte, encontró
metodología de última generación para los altas tasas de recombinación e intercambio
estudios genómicos. Como muchas otras, estas genético inter-especie, y puso en evidencia la
metodologías se han ido optimizando en la posible evolución reticular en este género, lo que
relación costo-beneficio (5). Esto ha permitido puede suponer un reto particular para el estudio
tener acceso a genomas completos de diferentes de las diferentes especies del género (14). Esto
especies de Streptomyces, aunque como lo también puede explicar la enorme variedad
advierten algunos autores, la calidad de las de metabolitos producidos por Streptomyces,
mismas puede variar entre diferentes estudios y como esa recombinación, y sus mecanismos
(11). En un análisis de estos genomas, se propios, pueden ser aprovechados para la
encontraron disparidades tales como genomas producción de cepas de interés biotecnológico.
con alrededor de 8 Mb hasta genomas de otras Una característica única en Streptomyces es
especies que alcanzaban una15 Mb. Incluso, en su aparato de transferencia de ADN conjugativo
algunos casos genomas reportados en la base de (15). De manera similar a otros géneros
datos de GeneBank como genomas completos, bacterianos, la transferencia de material
aparentemente tenían datos perdidos de acuerdo genético depende de la presencia de plásmidos
a herramientas bioinformáticas de análisis (11). conjugativos. Sin embargo, este sistema difiere
Es por esto por lo que, a pesar de los avances de otros ya que puede transferir de una bacteria
más recientes, la identificación molecular de a otra ADN de doble cadena (16), además es
Streptomyces debe ir acompañada de técnicas mucho más eficiente. Como elemento central,
de microbiología tradicional, como son medios la transferencia en Streptomyces depende de una
de cultivo diferenciales, pruebas bioquímicas, proteína en particular, la proteína TraB (15,16).
entre otras. Una característica que llama la atención es que en
No obstante, cabe destacar que para este género, los plásmidos de tamaño reducido,
Streptomyces, los análisis genómicos y pan- de menos de 10 kb, pueden ser transferidos,
genómicos de diferentes cepas han encontrado lo que demuestra que existe un mecanismo
una variedad en los contenidos de las mismas, único (15). A simple vista se ha observado un
viéndose que las cepas varían su contenido de fenómeno similar a grietas en el micelio, con
secuencias codificantes de ADN (CDS por su lo cual se concluido que hay una inhibición de
sigla en inglés). Por ejemplo, un estudio arrojó crecimiento debido a la toxicidad producida
resultados que iban desde unas 5900 hasta por las mismas proteínas contenidas en los
poco más de 10000 (12), y además, evidenció plásmidos, y que esto permite una transferencia
que los genomas de Streptomyces son flexibles rápida a través del micelio en formación. Este
en cuanto a su contenido, lo que explica su proceso de traslocación depende de una proteína
gran variedad de metabolitos secundarios producida por el gen traB, ya que al hacer una
(12). Otra investigación analizó como se supresión en condiciones experimentales,
comportaba la transferencia horizontal de impide llevar a cabo este proceso (16). Una
genes entre diferentes especies de este género, vez producida esta proteína, se forma un
utilizando los datos de cepas diferentes de S. complejo compuesto por diferentes proteínas
flavogriseus, y datos almacenados de 53 especies (traB y diferentes proteínas de tipo spd), el cual
(GeneBank) (13); se encontró una alta tasa de se localiza en las membranas, facilitando el
recombinación intra e inter especie, lo que lleva paso del material genético a través del micelio
60
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
formado por Streptomyces de una manera antes aclarar que también se deben seguir
rápida y eficiente (15,16)| Específicamente, metodologías clásicas como medios de cultivo
cuando una bacteria donante se encuentra con diferenciales, pruebas bioquímicas entre otros.
una bacteria receptora, traB forma un complejo Un estudio realizado por Huddleston y
hexamérico de proteínas, creando un poro en colaboradores en el año 1997 en Brasil, siguió
la membrana y la pared bacteriana, y éste a su una estrategia que les permitió la identificación
vez recluta a las otras proteínas facilitando la de diferentes especies de Streptomyces de interés
conexión entre diferentes unidades celulares biológico, es decir, productoras de antibióticos
(17). Una vez está establecida dicha conexión, el (18). Para este trabajo, se tomaron muestras
complejo protéico, por medio de una hidrólisis de la rizosfera de cultivos de soya, y evaluaron
de ATP, transfiere el plásmido desde la célula no solo la presencia de bacterias del género,
donante a la célula receptora, donde finalmente sino que también evaluaron la producción de
se replicará y dará inicio a un nuevo proceso una estreptomicina. Una vez tomadas las muestras
vez tenga contacto con otra célula aceptora (17). procedieron a cultivar, y secuenciar cuatro
Esta alta eficiencia de intercambio de material genes específicos, strA, strB1, ARNr 16s y trpBA
genético convierte a este género en el mayor (18). Entre los resultados más destacables de
reservorio genético, con genes codificantes este estudio, está el hallazgo de varias cepas
de diferentes sustancias de interés, tales como que no coincidieron con los datos alojados en
antibióticos. las bases de datos, lo que podría evidenciar
nuevos hallazgos, como la detección de
Trabajos y aproximaciones en la nuevos marcadores genéticos en otros géneros
identificación y caracterización de bacterias bacterianos, que corresponden a la producción
del género Streptomyces de estreptomicina, lo que indica que este gen se
Una característica clara respecto al género estaría transfiriendo en el suelo.
Streptomyces, es su variedad de metabolitos de Otro trabajo realizado con muestras de
interés que pueden usarse desde la medicina rizosfera de un terreno de artemisa en Estados
hasta la industria agrícola. Es por esto, que la Unidos encontró cepas de Streptomyces con
identificación y caracterización de las bacterias actividad antifúngica (19). En este caso, muestras
de este género representa un gran interés de suelo fueron separadas y sometidas a un
para diferentes profesionales, tales como, los tratamiento con fenol, en donde crecieron unas
microbiólogos, biólogos, agrónomos, etc. colonias resistentes que posteriormente fueron
Desde su aparición, las metodologías de analizadas. De esas colonias, se encontraron
identificación microbiana por técnicas basadas un total de 15 cepas con actividad antifúngica
en biología molecular se han ido convirtiendo al menos contra una de las seis especies de
de a poco en el estándar, siendo este hecho hongos y levaduras analizadas (19). A estas
reportado por ejemplo en revisiones que datan cepas se les hizo identificación con el ARNr 16s,
del año 1991 (10). En dichos reportes de revisión, encontrando diferentes especies bacteriana,
se enlistan lo que para la época se evidenciaba De las cepas, las bacterias relacionadas con
como metodologías moleculares que ayudaban Streptomyces violaceusniger presentaban
a la identificación de géneros bacterianos, siempre una fuerte actividad antifúnigica,
incluyendo Streptomyces: hibridación ADN- siendo capaces de inhibir el crecimiento de casi
ADN, hibridación ADN-ARNr, análisis de todos los hongos y levaduras analizadas en este
secuencia de ARNr 5s, 16s y 23s, entre otros estudio (19). Este procedimiento mostró ser
(10). Si bien la información creciente de las útil para el aislamiento de este tipo de cepas,
bases de datos permite crear estrategias para la las cuales pueden tener una amplia aplicación,
identificación, es importante como se mencionó para el control de hongos fitopatógenos como
61
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
Pythium ultimum, que pueden afectar la cinco aislamientos de Streptomyces con actividad
producción agraria u hongos que afectan la antimicrobiana (2). Para esa identificación, se
salud humana tales como Candida albicans. amplificó con primers específicos las regiones
En el año 2013, una investigación pudo espaciadoras ubicadas entre los genes de ARNr
determinar y caracterizar nuevas cepas del 16s y 23s. Al igual que otros estudios, esta
género (20). En esta investigación, muestras de metodología fue útil para la toma de muestras
suelo de regiones localizadas en el noroccidente y el correcto aislamiento de Streptomyces, lo que
de Irán fueron aisladas para su análisis en el indica el potencial de las pruebas moleculares
laboratorio. En primer lugar, por medio de para la identificación de éstas.
cultivo específicos se determinó su actividad Finalmente, en el trabajo publicado por
inhibitoria. De estos procedimientos, se Azimi y colaboradores en 2017, utilizando
seleccionaron 12 aislamientos con una alta identificación molecular y teniendo como base
actividad inhibitoria. Luego, a esos aislamientos el ARNr 16s, se pudo caracterizar una cepa de
se les secuenció el ARNr 16s, junto con un Streptomyces ramulosus con un pigmento con
análisis por RAPD-PCR, permitiendo una actividad antimicrobiana (22).
mejor caracterización de dichos aislados (20). Si bien, es claro que los estudios presentados
En conclusión, y acorde a otros estudios, los muestran la utilidad de las pruebas basada
autores proponen que esta metodología puede en biología molecular para la identificación
ayudar a identificar y caracterizar nuevas cepas, de las bacterias del género en diferentes
y que estos hallazgos son de vital importancia, aislamientos, es importante destacar que esas
ya que el suelo es un importante reservorio para pruebas moleculares también pueden ayudar
bacterias del género Streptomyces con actividad a la identificación de cepas con utilidad
antimicrobiana de alto interés en medicina y biotecnológica.
otros campos de estudio.
En Egipto, un grupo de investigadores Identificación de actividades biológicas
realizaron un análisis de aislamientos de suelo útiles en Streptomyces
(21). De un total de 75 aislamientos de bacterias Una de las características más importantes
del grupo Actinomycetes, encontraron 35 de este género es la gran cantidad de productos
correspondientes a Streptomyces. Al igual que metabólicos de aplicación variada. Como se ha
en otros estudios, este trabajo comenzó con mencionado en diferentes ocasiones, uno de los
una caracterización por métodos tales como intereses de su aislamiento y caracterización
siembra en medios de cultivo, caracterización es la posibilidad de obtener estos metabolitos
morfológica de colonias y evaluación de actividad para su aplicación en el día a día. Con el
antimicrobiana. Luego a los aislamientos con avance de la tecnología de secuenciación de
mejor actividad antimicrobiana se les secuenció siguiente generación (NGS por su silga en
el ARNr 16s, encontrando una similitud entre inglés), se ha establecido una metodología
el 99 y 100% en secuencia con otros miembros conocida como minería genómica (23). Dicha
del género Streptomyces (21). Esto muestra que, metodología incluye un análisis computacional
junto con las pruebas clásicas, la metodología de las secuencias obtenidas por medio de estos
molecular basado en secuencia puede ser útil nuevos protocolos de secuenciación, lo que
no solo para la identificación de Streptomyces, permite predecir o encontrar vías genéticas
sino que también puede caracterizar nuevas metabólicas de diferentes productos naturales
cepas con gran potencial. de interés, sin casi necesidad de comprobaciones
Un estudio realizado en muestras de suelo experimentales (23). Es por esto, que se ha
en cultivos de alma en Arabia Saudita, encontró pasado de caracterizar e identificar cepas de
62
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
63
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
hallazgo muestra que no solo los actinomicetes permitan obtener cepas que puedan presentar
terrestres, sino que los actinomicetes aislados funciones metabólicas interesantes. Luego, se
de ambientes marinos, pueden ser fuente de puede hacer identificación de las especies ya
una gran cantidad de compuestos de interés. sea usando métodos moleculares más sencillos,
Similares resultados se encontraron en un pero menos robustos, como amplificación
trabajo donde fueron evaluados los aislamientos y secuenciación sencilla de ARNr 16s. Pero
provenientes de muestras de manglares en en la medida de lo posible, se debe recurrir
Macao (29). De los aislamientos, se pudieron a tecnologías basadas en secuenciación de
analizar diferentes vías genéticas, entre las siguiente generación. Este tipo de tecnologías
cuales se pueden destacar, la producción de permiten obtener una gran cantidad de datos,
metabolitos secundarios de interés como que, con el poder computacional adecuado,
terpenos, indoles, sideróforos, bacteriocinas, permitirá analizar de manera más efectiva, vías
entre otros. metabólicas potenciales para los productos
Otros estudios se vienen realizando, y derivados de cepas presentes en los aislamientos.
cada vez más, se encuentran nuevas especies Es de gran importancia ver cómo estas
de Streptomyces que producen diferentes bacterias tienen, además, un mecanismo
productos de interés. Con el avance de la único de transferencia genética. Esto abre un
tecnología en campos como la secuenciación y abanico de oportunidades únicas para conocer
la bioinformática, cada vez se hallan más cepas, diferentes procesos genéticos-metabólicos.
y más compuestos de interés, lo que hace de este Con todo esto, los marcadores moleculares del
tipo de trabajo una fuente inagotable de nuevos género Streptomyces siguen y seguirán siendo un
descubrimientos que serán de gran utilidad en fascinante campo de estudio en microbiología y
biotecnológica, haciendo de Streptomyces un biotecnología.
género de importancia no solo biológica, sino
agrícola, médica y económica. Referencias bibliográficas
1. Anderson AS, Wellington E. The
Conclusiones y perspectivas taxonomy of Streptomyces and related genera.
Si bien es cierto, que la tecnología ha Int J Syst Evol Microbiol [Internet]. 2001 May
permitido un gran avance en el análisis del 1;51(3):797–814. Available from: https://www.
género Streptomyces, todavía queda un amplio microbiologyresearch.org/content/journal/
camino por recorrer. Los estudios llevados ijsem/10.1099/00207713-51-3-797
a cabo con estas bacterias muestran una 2. Al_husnan LA, Alkahtani MDF.
secuencia lógica para su análisis y resalta que Molecular Identification of Streptomyces
debe seguir siendo la columna vertebral para producing antibiotics and their antimicrobial
el descubrimiento de nuevas especies, cepas, y activities. Ann Agric Sci [Internet]. 2016
metabolitos de interés. Dec;61(2):251–5. Available from: https://
Se debe recordar que este género puede l i n k i n g h u b. e l s e v i e r. c o m / r e t r i e v e / p i i /
aislarse de diferentes entornos, y que eso permite S0570178316300197
tener una infinidad de distintos escenarios para 3. Solecka J, Zajko J, Postek M, Rajnisz
la obtención de microorganismos que puedan A. Biologically active secondary metabolites
ser potencialmente productores de metabolitos from Actinomycetes. Open Life Sci [Internet].
de interés. En primer lugar, una vez sea elegido 2012 Jan 1;7(3). Available from: http://www.
el escenario se deben tomar tantas muestras degruyter.com/view/j/biol.2012.7.issue-3/
como sea posible. Luego, un primer paso por s11535-012-0036-1/s11535-012-0036-1.xml
lo general debe ser el reto microbiológico en 4. Bérdy J. Thoughts and facts about
diferentes medios selectivos y diferenciales, que antibiotics: Where we are now and where we
64
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
are heading. J Antibiot (Tokyo) [Internet]. 2012 Streptomyces Species. J Microbiol Biotechnol
Aug 18;65(8):385–95. Available from: http:// [Internet]. 2015 Oct 28;25(10):1599–605.
www.nature.com/articles/ja201227 Available from: http://www.jmb.or.kr/journal/
5. Chater KF. Recent advances in view.html?doi=10.4014/jmb.1504.04008
understanding Streptomyces. F1000Research 13. Doroghazi JR, Buckley DH. Widespread
[Internet]. 2016 Nov 30;5:2795. Available from: homologous recombination within and between
https://f1000research.com/articles/5-2795/v1 Streptomyces species. ISME J [Internet]. 2010
6. Ser H-L, Tan LT-H, Law JW-F, Sep 15;4(9):1136–43. Available from: http://
Chan K-G, Duangjai A, Saokaew S, et al. www.nature.com/articles/ismej201045
Focused Review: Cytotoxic and Antioxidant 14. Cheng K, Rong X, Huang Y. Widespread
Potentials of Mangrove-Derived Streptomyces. interspecies homologous recombination
Front Microbiol [Internet]. 2017 Nov 1;8. reveals reticulate evolution within the genus
Available from: http://journal.frontiersin.org/ Streptomyces. Mol Phylogenet Evol [Internet].
article/10.3389/fmicb.2017.02065/full 2016 Sep;102:246–54. Available from:
7. Paradkar A, Trefzer A, Chakraburtty R, https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/
Stassi D. Streptomyces Genetics: A Genomic S1055790316301427
Perspective. Crit Rev Biotechnol [Internet]. 2003 15. Thoma L, Muth G. The conjugative
Jan 29;23(1):1–27. Available from: http://www. DNA-transfer apparatus of Streptomyces. Int J
tandfonline.com/doi/full/10.1080/713609296 Med Microbiol [Internet]. 2015 Feb;305(2):224–
8. Hopwood DA. Highlights of 9. Available from: https://linkinghub.elsevier.
Streptomyces genetics. Heredity (Edinb) com/retrieve/pii/S1438422114001799
[Internet]. 2019 Jul 12;123(1):23–32. Available 16. Thoma L, Dobrowinski H, Finger C,
from: http://www.nature.com/articles/s41437- Guezguez J, Linke D, Sepulveda E, et al. A
019-0196-0 Multiprotein DNA Translocation Complex
9. Stackebrandt E, Witt D, Kemmerling Directs Intramycelial Plasmid Spreading during
C, Kroppenstedt R, Liesack W. Designation of Streptomyces Conjugation. Chen C, Winans
Streptomycete 16S and 23S rRNA-based target SC, editors. MBio [Internet]. 2015 May 26;6(3).
regions for oligonucleotide probes. Appl Environ Available from: https://mbio.asm.org/lookup/
Microbiol [Internet]. 1991 May;57(5):1468–77. doi/10.1128/mBio.02559-14
Available from: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 17. Thoma L, Muth G. Conjugative DNA
pubmed/1854202 transfer in Streptomyces by TraB: is one protein
10. Stackebrandt E, Liesack W, Webb R, enough? FEMS Microbiol Lett [Internet].
Witt D. Towards a Molecular Identification of 2012 Dec;337(2):81–8. Available from: https://
Streptomyces Species in Pure Culture and in academic.oup.com/femsle/article-lookup/
Environmental Samples. Actinomycetologica doi/10.1111/1574-6968.12031
[Internet]. 1991;5(1):38–44. Available 18. Huddleston AS, Cresswell N, Neves
from: http://joi.jlc.jst.go.jp/JST.JSTAGE/ MC, Beringer JE, Baumberg S, Thomas DI, et al.
saj/5_38?from=CrossRef Molecular detection of streptomycin-producing
11. Studholme DJ. Genome Update. Let streptomycetes in Brazilian soils. Appl Environ
the consumer beware: Streptomyces genome Microbiol [Internet]. 1997 Apr;63(4):1288–97.
sequence quality. Microb Biotechnol [Internet]. Available from: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
2016 Jan;9(1):3–7. Available from: http://doi. pubmed/9097426
wiley.com/10.1111/1751-7915.12344 19. Kang MJ, Strap JL, Crawford DL.
12. Kim J-N, Kim Y, Jeong Y, Roe J-H, Isolation and characterization of potent
Kim B-G, Cho B-K. Comparative Genomics antifungal strains of the Streptomyces
Reveals the Core and Accessory Genomes of violaceusniger clade active against Candida
65
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
albicans. J Ind Microbiol Biotechnol [Internet]. via Bioassays, Genome Analyses, and Mass
2010 Jan 26;37(1):35–41. Available from: http:// Spectrometry. Front Microbiol [Internet]. 2018
link.springer.com/10.1007/s10295-009-0641-9 Jun 12;9. Available from: https://www.frontiersin.
20. Maleki H, Dehnad A, Hanifian S, Khani org/article/10.3389/fmicb.2018.01270/full
S. Isolation and Molecular Identification of 27. Undabarrena A, Ugalde JA, Seeger M,
Streptomyces spp. with Antibacterial Activity Cámara B. Genomic data mining of the marine
from Northwest of Iran. Bioimpacts [Internet]. actinobacteria Streptomyces sp. H-KF8 unveils
2013;3(3):129–34. Available from: http://www. insights into multi-stress related genes and
ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24163805 metabolic pathways involved in antimicrobial
21. Mabrouk MI, Saleh NM. Molecular synthesis. PeerJ [Internet]. 2017 Feb 14;5:e2912.
identification and characterization of Available from: https://peerj.com/articles/2912
antimicrobial active actinomycetes strains from 28. Paulus C, Rebets Y, Tokovenko B,
some Egyptian soils. DNA. 2014;11:12. Nadmid S, Terekhova LP, Myronovskyi M, et al.
22. Azimi S, Basei Salehi M, Bahador N. New natural products identified by combined
Isolation and Identification of Streptomyces genomics-metabolomics profiling of marine
ramulosus from Soil and Determination of Streptomyces sp. MP131-18. Sci Rep [Internet].
Antimicrobial Property of its Pigment. Mod 2017 Mar 10;7(1):42382. Available from: http://
Med Lab J [Internet]. 2017 Apr 1;1(1):36–41. www.nature.com/articles/srep42382
Available from: http://modernmedlab.com/ 29. Hu D, Chen Y, Sun C, Jin T, Fan G,
article-1-41-en.html Liao Q, et al. Genome guided investigation of
23. Ziemert N, Alanjary M, Weber antibiotics producing actinomycetales strain
T. The evolution of genome mining in isolated from a Macau mangrove ecosystem.
microbes – a review. Nat Prod Rep [Internet]. Sci Rep [Internet]. 2018 Dec 24;8(1):14271.
2016;33(8):988–1005. Available from: http:// Available from: http://www.nature.com/
xlink.rsc.org/?DOI=C6NP00025H articles/s41598-018-32076-z
24. Mao Y, Varoglu M, Sherman DH.
Molecular characterization and analysis of the
biosynthetic gene cluster for the antitumor
antibiotic mitomycin C from Streptomyces
lavendulae NRRL 2564. Chem Biol [Internet].
1999 Apr;6(4):251–63. Available from:
https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/
S1074552199800404
25. Book AJ, Lewin GR, McDonald
BR, Takasuka TE, Doering DT, Adams
AS, et al. Cellulolytic Streptomyces Strains
Associated with Herbivorous Insects Share a
Phylogenetically Linked Capacity To Degrade
Lignocellulose. Lovell CR, editor. Appl Environ
Microbiol [Internet]. 2014 Aug 1;80(15):4692–
701. Available from: http://aem.asm.org/
lookup/doi/10.1128/AEM.01133-14
26. Kibret M, Guerrero-Garzón JF, Urban
E, Zehl M, Wronski V-K, Rückert C, et al.
Streptomyces spp. From Ethiopia Producing
Antimicrobial Compounds: Characterization
66
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
67
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
69
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
que las poblaciones y las comunidades varían En trabajos relacionados con la aceleración
continuamente en función de la evolución del proceso de compostaje de subproductos
de la temperatura, de la disponibilidad de de cosecha de café, aislaron un consorcio
nutrientes, de la concentración de oxígeno, del de microorganismos afines a la pulpa de
contenido de agua, del pH, y de la acumulación café, participantes de la biodegradación de
de compuestos antibióticos, entre otros; uno de dichos residuos orgánicos, entre los que
los indicadores de la actividad microbiana y de destacan: Pseudomonas aeruginosa, Bacillus
la tasa de actividad actual es la Temperatura. El spp., Pseudomonas spp., donde se reporta una
ecosistema del compostaje se limita a sí mismo relación C/N final entre 9.5 y 10, que indica
cuando la acumulación de calor es excesiva. A estabilidad y madurez, con menores tiempos de
medida que se va elevando la temperatura, las compostaje (7).
poblaciones microbianas son reemplazadas Luego de la caracterización química del
por otras mejor adaptadas, y cada una de ellas compost obtenido de subproductos de la caña
posee una duración limitada. En el caso de de azúcar, se pudo establecer que el aumento
realizarse una correcta y continua aireación, la en la cantidad de bagazo condicionó mayor
porcentaje de humedad en el medio, con
fase termófila continúa hasta que la producción
menores temperaturas durante el proceso; se
de calor es inferior a la disipación del mismo,
indicó que la fase termófila del compost no
debido al agotamiento de los compuestos
tuvo consistencia, en la medida que la pérdida
fácilmente metabolizables (3).
de calor superó la ganancia térmica, explicable
Una amplia diversidad de microorganismos
por el tamaño pequeño de las pilas establecidas,
conforma las poblaciones mixtas del proceso siendo estable la temperatura a los 113 días
de compostaje. Las más importantes son de iniciado el compostaje. Se explica que las
bacterias, Actinomycetes y hongos filamentosos. variables indicadoras de madurez del compost,
El proceso de compostaje de residuos se asocian con: la producción de NH4 durante
sólidos orgánicos, involucra condiciones de la fase termófila; la disminución de temperatura
sanitización, con menores índices de presencia (pasada la fase termófila); y mayores niveles de
de microorganismos patógenos; y estabilización, NO3 en la fase mesófila, acompañados de mayor
promoviendo materiales maduros, libres de CIC en la síntesis de sustancias húmicas (8).
putrefacción, sin olores contaminantes; además Cuando se realiza proceso de compostaje que
de las condiciones químicas, físicas y biológicas contiene cachaza y bagazo de caña de azúcar, se
que aportan beneficio al suelo agrícola (5). pueden alcanzan niveles más altos nitrógeno
Los microorganismos que actúan de y de materia orgánica, que cuando el compost
diferentes formas en los procesos de compostaje, no suma dichos materiales; para las demás
son exigentes en carbono y nitrógeno (en menor variables evaluadas no se indican diferencias
proporción), para desarrollar sus actividades atribuibles a la cachaza y al bagazo de caña (9).
biológicas; la relación inicial proporcionada de
C/N (entre 25 y 35), permite una multiplicación Bacterias
eficiente de los microorganismos, que conduce a Las bacterias en el proceso de compostaje
una descomposición acelerada de los materiales constituyen entre el 80% y el 90% de la
orgánicos en compost; pero si la relación C/N es población microbiana. Las bacterias utilizan
superior, la descomposición se hará más lenta; un amplio rango de enzimas que degradan
mientras que con relaciones C/N inferiores a 20, una gran cantidad de compuestos orgánicos,
aumenta la producción de amoníaco gaseoso, gracias a su diversidad metabólica. Hay diversos
bastante contaminante para el ambiente, grupos de bacterias que se destacan, dentro de
disminuyendo la calidad del compost (6). este tipo de microorganismos, como es el caso
70
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
71
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
Generalidades del compostaje del Ingenio icopor para ser transportada hasta el laboratorio
Risaralda de la Universidad Libre Seccional Pereira.
En el Ingenio Risaralda se obtienen
subproductos resultantes de la fabricación de Fase de laboratorio
azúcar y etanol. Entre estos se encuentran el
bagazo, cachaza, ceniza de bagazo, hoja de caña Preparación de las muestras
y vinaza que son los utilizados en el proceso Se prepararon los medios de cultivo Agar
para la producción de compost. Papa Dextrosa para hongos y Agar Extracto
A los residuos sólidos (cachaza, ceniza, hoja) de Levadura para Bacterias y otros hongos
se les realiza un pre-tratamiento para eliminar el Filamentosos, los cuales se realizaron en el
exceso de humedad. Después de esto se procede laboratorio de Investigación de la Universidad
a la conformación de una pila (unidad de Libre Seccional Pereira.
tratamiento), verificando a través de un balance Posteriormente a la homogenización de cada
de masa su relación C/N, C/S y humedades de muestra, se tomaron 10 g de cada muestra y
ingreso. Las pilas tienen aproximadamente 120 les adicionó 90 mL de agua triptona; luego se
metros de largo, Una vez armada la se procede realizó una dilución de las muestras hasta 10-8
a mezclar y airear con el equipo BACKHUS en la cabina de flujo laminar.
creando las condiciones necesarias para el
Luego con una micropipeta se inocularon100
crecimiento de microorganismos los cuales
microlitros en cada caja de Petri desde la
descomponen los residuos hasta transformarlos
dilución 10-6 hasta la 10-8, en siembra de superficie
en compostaje. Dependiendo de la humedad
en placa por tripliclado cada muestra.
de la pila se adiciona otro subproducto en
forma líquida llamado vinaza, el cual se va
incorporando en las pilas por medio de volteos Identificación de microorganismos.
diarios, en donde se controla la temperatura Para la identificación de las bacterias y
y la humedad hasta alcanzar la proporción de hongos del proceso de compostaje se incubo a
vinaza requerida para la producción de compost temperatura ambiente (24 °C) durante siete días
de excelente calidad. según lo propuesto por Rincón (12); luego se
Posterior a la aplicación de vinaza, la pila aplicaron técnicas de microscopia y macroscopia,
continua los procesos de secado natural, en el Laboratorio de Microbiología de la
maduración y estabilización (Comunicación Universidad Libre Seccional Pereira, teniendo
verbal). en cuenta la Norma Técnica Colombiana (NTC
4491-2) sobre procedimientos microbiológicos
Toma de las muestras (13).
Se realizó un muestreo aleatorio en una pila
de compostaje 4 veces durante todo su ciclo de Bacterias
compost, tomando 5 muestras por visita al área
de compostaje del Ingenio Risaralda. Macroscopía
Primero se seleccionó la pila que Se hizo la caracterización macroscópica,
sería evaluada durante todo su proceso; con base en los siguientes criterios: superficie;
aleatoriamente se seleccionaron los puntos Crecimiento (abundante, moderado, escaso);
para tomar la muestra y con un tubo de pvc color; forma (regulares, redondas, ovaladas,
se tomaban aproximadamente 150 gramos irregulares, filamentosas, rizoides); elevación
del material de la composta y se guardaban en de las colonias (plana, elevada, convexa
una bolsa de cierre hermético, se rotulaba y monticular); bordes (entero, ondulado,
posteriormente se guardaban en una nevera de aserrado, filamentoso y rizado); tamaño de las
72
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
73
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
Se aislaron 2 géneros del grupo de Bacterias Éstas se identificaron por sus características
Gram Negativas (Gluconacetobacter y morfológicas, macroscópicas y microscópicas
Pseudomonas). También se aisló un género (Figura 2).
del grupo Bacterias Gram Positivas (Bacillus).
74
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
Blanc et al. (17) aislaron representantes del Glucanocetobacter es una bacteria fijadora de
género Bacillus del compost. Las especies del nitrógeno, capaz de oxidar etanol, que tuvo su
género Bacillus son capaces de vivir en el proceso presencia en la primera fase del compostaje; ésta
de compostaje, gracias a su adaptabilidad a la se ha reportado en plantas de caña de azúcar,
temperatura mesófila. Pseudomonas son capaces por lo que se puede confirmar su presencia en el
de degradar muchos compuestos orgánicos proceso de compostaje (19).
sintéticos y naturales ya que metabólicamente Los actinomicetos son un importante grupo
son muy versátiles, pero solo crecieron en la de organismos procariotas, que se caracterizan
primer toma por lo tanto se deduce que las por su actividad antimicrobiana y ayudan a
afecto la fase termófila (18). la fertilidad de los suelos. Estos se presentan
75
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
76
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
77
La investigación con Streptomyces spp. como herramienta para el estudio de los microorganismos del suelo
78
Rodolfo Lopez Franco / Adalucy Álvarez Aldana / Daniel Arturo León Rodríguez / Viviana Milena Taylor Orozco /
Daniela Guiral Guiral / Stephanie Ríos Cifuentes / Érika Loranz Sánchez / Laura Katherine Pavas / Silvana Vergara Acevedo
79