06 - Material Hereditario Síntesis de Adn y Proteínas

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Material hereditario

Síntesis y código genético

Flavio Lozano Isla


Plant breeder
Ing. Agr. MSc.

flozano@lamolina.edu.pe

lozanoisla.com

Material hereditario 2022 FLAVIO LOZANO ISLA 1


Replicación del DNA
Contenido

● Qué es la replicación del DNA?


● Cuál es la importancia de la
replicación del DNA?
● Cómo se lleva a cabo el proceso de
replicación?
● Cuáles son las características del
proceso de replicación?
● Cuales son las diferencias de la
replicación entre eucariotas y
procariotas?

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Replicación del DNA

● Proceso mediante el cual a partir de


una molécula de DNA progenitora o
parental se se sintetiza una nueva
○ Da origen dos moléculas DNA
○ Idéntica a la del DNA original

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Donde se produce la replicación del DNA

● La replicación se da en la fase S,
previa a la mitosis y meiosis I

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Características de la replicación del DNA

● Carácter semiconservador
● Simultaneidad (ambas hebras)
● Secuencial
● Bidireccional
● Origen
○ monofocal → procariotas
○ multifocal → eucariotas

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Replicación o síntesis del DNA

● Mecanismo de copia de la
información codificada en la
molécula de ADN
● Es una de las propiedades del
material genético
○ Permite dar origen a dos
moléculas idénticas
● Permite la conservación de la
información genética

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Carácter semiconservador

● Teóricamente son posible 3


mecanismos de replicación
○ R. conservadora
○ R. dispersante
○ R. semiconservadora
● Pero sólo el tercero tiene lugar en la
célula

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Carácter semiconservador

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Experimentos de Meselson & Stahl

● Mathew Meselson & Franklin


Stahl (1958)
○ Usaron técnica de equilibrio
de sedimentación en
gradientes de densidad
○ Introducción de isótopos en
la moléculas de ADN
15
■ N → infrecuentes
14
■ N → habitual

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Experimentos de Meselson & Stahl

● Concluyen que la hipótesis


correcta es la semiconservadora
● En la replicación
○ Cada molécula hija conserva
una hebra del DNA
progenitor
○ Cada hebra tiene una de
nueva síntesis

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Síntesis del ADN

Ocurre en 3 etapas
1. Iniciación
2. Elongación
3. Terminación
Las etapas requieren enzimas y factores
proteicos
La iniciación y elongación requieren
energía (GTP)

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Proceso de la replicación
1. Desenrollar la doble hélice
○ liberar la tensión de torsión
○ Topoisomerasas
2. Separar las dos hebras
○ Helicasas
3. Mantener la hebra desenrollada
○ RPA-replication Protein A
4. Sintetizar la nuevas hebras
○ Primasas
○ Polimerasas

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Las polimerasas

● Poseen actividad de extensión o


elongación del DNA
● Se añade un nucleótido a la vez en la
parte 3’-OH de la cadena
● El sentido de la nueva cadena 5’-3’
○ Alta fidelidad
○ Tipo de polimerasa
○ Tipo de secuencias

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Primer

● Un iniciador o cebador es una


secuencia corta de ADN de cadena
simple que se utiliza en una reacción
en cadena de la polimerasa (PCR).
● En el método PCR se emplea un par
de cebadores para hibridar con el
ADN de la muestra y definir la región
del ADN que será amplificada.

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Las polimerasas

● Requieren un cebador para iniciar la


síntesis de DNA
● Primasa: sintetiza fragmentos cortos
(40-400 nt) de RNA
● Tipos de cebador o ‘primer’
○ RNA: retrovirus
○ ADN: parvovirus
○ Proteína-nucleótido: Adenovirus

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Las polimerasas

● Posee correción de prueba


● La ADN polimerasa se encuentra en
todos los organismos

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Helicasas

● Separan las hebras de ADN


○ Protein dnaB
○ Mantenimiento de
mini-cromosomas (MCM)

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Ligasa

● Une los fragmentos de DNA

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Proceso de replicación del DNA
Carácteristicas
● Ocurre de manera bidireccional
● La síntesis es en el sentido 5’-3’
● Requiere un cebador de ARN
● La duplicación
○ continua → cadena líder
○ discontinua → cadena rezagada
● Cadena Rezagada
○ Opuesto a la cadena de
replicación
○ Fragmentos de Okazaki
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Proceso de replicación del DNA
Etapas

● Iniciación
○ Secuencias específicas de DNA
○ Complejo de replicación
○ Horquilla de replicación
● Elongación
○ Extensión de las hebras hijas
● Terminación
○ Telomerasas

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Replicación del DNA

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Replicación DNA: Procariota vs Eucariota

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Requerimientos para la síntesis

● Cebador/primer → comúnmente
ARN
● Sustratos → dNTPs (dATP, dGTP,
dCTP, y dTTP)
● Cofactores
○ Cofactor asociado a los dNTPs
○ Mn+2 o Mg+2
● Molde o plantilla
○ Define el orden correcto de
incorporación de los dNTPs

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Replicación: iniciación

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Replicación: elongación

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Fragmento de Okazaki

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Maduración fragmento de Okazaki

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Replicación: terminación

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Replicación de los telómeros

● Acortamiento de 50 – 200 pb
por cada división celular

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Mecanismo de acción de las telomerasas

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Código genético
Contenido

● Codificación de la Información
genética
○ Código genético
● Decodificación de los codones
○ tRNAs

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Qué es un gen?

Unidad molecular de la herencia,


ubicado en un locus, conformado por
ADN que codifica para un producto
genético (ARN o proteína)

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Dogma Central de la biología molecular

● Francis crick lo planteó en 1958


● “Solo el ADN puede replicarse y este
ADN se transcriben como ARN
mensajero el que finalmente se
traduce como proteína”
● En la actualidad se descubrieron
excepciones

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Dogma central: excepciones

● Transcriptasa inversa: Algunos virus


pueden sintetizar ADN partiendo de
ARN
● Traducción sin ARN: En laboratorio, el
ribosoma puede leer directamente el
ADN
● Priones: son solo proteínas sin ácido
nucleico y pueden propagar a otras
proteínas
● Ribosomas: son capaces de duplicarse
a sí mismos (ARN) sin requerir ADN ni
proteínas

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Síntesis de proteínas

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Código genético

● Es el conjunto de pautas que rige la


transferencia contenida en el mRNA
para la síntesis de proteínas
● Relación entre los lenguajes
○ mRNA → 4 letras
○ Aminoácidos (polipéptidos)
→ 20 letras (aa de las proteínas)

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Características: organizado en tripletes o codones

● Si cada nucleótido determinara un


aminoácido
○ 4 nc != 20 aa
● Si cada dos nucleótidos codifican un
aminoácido
○ 4x4 nc ~ 16 aa != 20 aa
● Si cada grupo de tres nucleótidos
determina un aminoácido
○ 4x4x4 nc = 64 aa > 20 aa

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tRNA

● Es el mediador entre el mensaje del


mRNA y la secuencia de aa
● La lectura de la secuencia de
codones está protagonizada por los
tRNAs
● Ejercen el papel de adaptadores de
la información genética a la
secuencia de las proteínas

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Modelos de representación

● Se han elaborado diversos modelos


para representar la correlación entre
codones del mRNA y aa del
polipéptido traducido
● En todos los modelos, la secuencia
del triplete se refiere al codón del
mRNA

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Codones sinónimos: degeneración

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La degeneración del código: motivos

● Algunos aminoácidos pueden ser


transportados por distintas especies
moleculares (tipos) de ARN-t que
contienen distintos anticodones
● Algunas especies moleculares de
ARN-t pueden incorporar su
aminoácido específico en respuesta
a varios codones, de manera que
poseen un anticodón que es capaz
de emparejarse con varios codones
diferentes
○ Flexibilidad de la 3ª base del
anticodón o tambaleo

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Hipótesis del balanceo o tambaleo

● Un mismo anticodón puede


establecer interacción con distintos
codones, que se diferencian en su
tercera base
○ mediante un pequeño
desplazamiento,
○ Unirse a un par distinto
■ G→ CoU
■ U→AoG

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Código genético: overview

● Universal → Presente en todos los


organismos
○ mRNA mitocondria
○ DNA nuclear: protistas & hongos
● Degenerativo
● No superpuesto
● Compuesto de tripletes de
nucleótidos

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Traducción

● Es el paso de la información del


mRNA a proteína
● Elementos
○ Los aminoácidos
○ ARN transferencia (tARN)
○ Los ribosomas
○ ARN mensajero (mARN)
○ Enzimas y nucleótidos

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RNA de transferencia (tRNA)
● Extremo 3’: lugar de unión al aa
(ACC)
● Lazo dihidrouracilo (DHU)
○ Lugar de unión del aa al tARN
● Lazo de T ψ C: lugar de enlace al
ribosoma
● Lazo del anticodón: lugar de
reconocimiento de los codones del
mensajero

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RNA ribosomal (rRNA)

● Su estructura secundaria y terciaria


presenta un plegamiento complejo
que le permite asociarse:
○ Proteínas integrales de los
ribosomas
○ Ribosomas con otros rRNA
○ Síntesis de proteínas

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Ribosomas

● Organelas que coordinan el


apareamiento de los anticodones
del tRNA con los codones del mRNA
● Es un componente mayoritario en la
célula
● Tiene el 10% de la proteína
bacteriana

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Ribosoma: sitios funcionales
● Sitio de unión del mRNA
○ Hendidura entre la interface de
las dos subunidades
● Sitio A:
○ Ingresa los aminoacil tRNA del
próximo aminoácido a ser
añadido
○ El tRNA se aparea con el codón
del mRNA
● Sitio P:
○ Se ubica el tRNA de la cadena
polipeptídica en crecimiento
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Ribosoma: sitios funcionales

● Sitio E (salida):
○ Donde el tRNA es descargado
después de transferir el péptido
en crecimiento al tRNA ubicado
en el sitio A
● Sitio para unión de los factores
○ Iniciación
○ Elongación
○ Terminación

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Ribosoma

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Procariota vs Eucariota

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Traducción: fases

● Activación de los aa’s en forma de


aminoacil-tRNA
● Aminoacil-tRNA
○ Enzima que cataliza la unión de
un aa a su tRNA
○ Cada aa’s (20) tiene un aminoacil
tRNA específico
La unión del aminoácido se da en 2 fases
● Enlace tRNA + aa ocurre antes que el
anticodón se aparee con el codón 1. Activación del aminoácido con ATP
complementario del mRNA 2. Transferencia del aminoácido al
tRNA
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Traducción: reglas básicas

1. El mRNA es traducido en dirección


5´-- 3´.
2. Las proteínas son sintetizadas a
partir del extremo N-terminal hacia
el extremo C-terminal

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Síntesis de proteínas: iniciación

1. Unión del mRNA a la subunidad pequeña 30S


○ Estimulada por el factor IF3
2. El tARN-iniciador se une al factor IF2 y a GTP
para unirse al sitio P
3. Unión de las subunidades 30S y 50S mediante
la hidrólisis del GTP y IF2 catalizado por una
proteína ribosomal
○ Unidas las subunidades el factor IF2 e IF3
de disocian

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Síntesis de proteínas: elongación
● La elongación o crecimiento de la
cadena polipeptídica tiene lugar ● Intervienen
mediante la formación de enlaces ○ peptidil-ARN-t
peptídicos entre los aminoácidos
sucesivos ○ Los aminoacil-tARN
○ Ribosomas
○ mARN
○ Enzimas
○ Factores proteicos de
elongación
■ EF-Tu, EF-Ts
○ Energía → GTP

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Síntesis de proteínas: elongación
Fase 1

● El aminoacil-tRNA correspondiente
al triplete del mRNA entra en el sitio
A del ribosoma con la intervención
del factor EF-Tu
● El EF-Tu se une al GTP, complejo
activado (EF-Tu-GTP), se une al
aminoacil tRNA
● Se produce la hidrólisis del GTP a
GDP y favorece la entrada del
aminoacil-tRNA al sitio A y el
completo EF-Tu-GTP se libera

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Síntesis de proteínas: elongación
Fase 2

● La liberación del complejo


EF-Tu-GDP del ribosoma está
mediada por intervención del factor
de elongación EF-Ts
● Este factor, EF-Ts, también interviene
en la regeneración y activación del
factor EF-Tu

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Síntesis de proteínas: elongación
Fase 3

● Transferencia de la cadena peptídica


del peptidil-tRNA que está en la Sitio
P al aminoacil-tRNA nuevo que ha
entrado en el sitio A
○ Reacción catalizada por la
enzima peptidil-transferasa

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Síntesis de proteínas: elongación
Fase 3

● El ribosoma avanza un codón sobre


el mRNA en dirección 5’ → 3’
○ Paso con la intervención del
factor EF-G activado por la
hidrólisis del GTP
● Se libera el tRNA y al moverse el
ribosoma el peptidil-tRNA recién
formado en el sitio A pasa a ocupar
el sitio P

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Síntesis de proteínas: terminación

● En bacterias tiene lugar cuando se encuentran


con cualquiera de los siguientes tripletes de
terminación o codones de fin: UAA, UAG y UGA
● Durante la terminación intervienen los factores
proteicos de terminación RF1, RF2 y RF3
● No hay ningún tRNA que reconozca a los
tripletes de terminación, son los factores de
terminación o liberación los que se encargan
de reconocer los codones de STOP

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Síntesis de proteínas: terminación

● El factor RF1 reconoce los codones UAA y UAG y


el factor RF2 identifica a los codones UAA y UGA.
El factor RF3 (GTP) estimula la unión de RF1 Y RF2
● Cuando el peptidil-tRNA está en el sitio P los
factores de terminación entran en el sitio A
● El polipéptido se libera del sitio P, se disocian las
dos subunidades del ribosoma y se libera el tRNA
que estaba en el sitio P

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Eucariotas: traducción
● Secuencia kozak: secuencia de
reconocimiento entre mRNA y las
subunidades del ribosoma
○ GCCACC (ATG ~ codon de
iniciación)
● Usa los factores EF1𝞪 and EF1𝝱𝜸
○ Análogos de EF-Tu y EF-Ts
● eIFe evita la reasociación del
ribosoma cuando la síntesis ha
concluido
● La fosforilación del factor eIF2 regula
la iniciación
● La fosforilación activa/desactiva la
iniciación.
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Genes
Constitutivos Inducibles

Se expresan de una forma constante, a Reguladas en tiempo y espacio. Se


la misma velocidad en todo momento de sintetizan o se activan en momentos
la vida celular específicos o en tejidos particulares

● G. domésticos ~ housekeeping G. ● G. regulables o expresión diferencial

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Secuencias del genoma nuclear en Eucariotes

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Codificación de secuencias en el genoma

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Conceptos

Exon: Un exón es la porción de gen que


codifica aminoácidos.
Intron: Las partes de la secuencia del gen que
no codifican se llaman intrones, porque están
en medio o interfieren con- los exones
Pseudogenes: Copia de un gen que carece
normalmente de intrones y de otras
secuencias de ADN esenciales para su
función, no se expresan y frecuentemente
contienen numerosas mutaciones

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Organización del genoma humano

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