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5810
2-PARCIAL-APUNTES.pdf
Parte Microbiología 2ndo Parcial
3º Biotecnología
Grado en Farmacia
Facultad de Farmacia
Universidad de Granada
Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su
totalidad.
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Los bienes pueden ser cualquier producto industrial, alimento, químicos, enzimas,
medicamentos..,
Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
·DNA recombinante: sustancias químicas, vacunas, enzimas, hormonas, anticuerpos...
Explotación de los recursos del mar para la generación de productos y aplicaciones de interés
industrial. Sus aplicaciones son prometedoras para la agricultura, cuidados sanitarios, cosmética
y productos alimentarios.
Dentro de los microorganismos acelulares con estructura molecular encontramos a los virus,
organismos muy pequeños con información genética y sin estructura celular. Son parásitos
celulares estrictos.
9.Ser seguro, no patógeno y no producir agentes tóxicos (a no ser que sea el producto buscado).
Son organismos similares biológicamente, fáciles de manipular y de estudiar. Presentan una serie
de ventajas: rápido desarrollo, ciclos de vida cortos, tamaño pequeño, disponibles, fáciles de
obtener. De ellos se puede obtener una gran cantidad y valiosa información para el análisis del
desarrollo humano, regulación genética, enfermedades y procesos de evolución.
Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
·Modelos bacterianos:
·Modelos eucariotas:
·Modelos acelulares:
Son los virus más utilizados en ingeniería genética para aplicaciones de terapia génica. Se
conoce su genoma completo y su ciclo de vida, así como sus sistemas de infección de células
hospedadoras. Son virus cuyas estructuras son conocidas y genomas han sido secuenciados.
Tenemos 2 posibilidades:
·Aislarlos de la naturaleza de orígenes variados: el material puede ser el suelo, fondos marinos,
tracto gastrointestinal...
Estrategias:
Utilizar para aislar las bacterias: ph extremo si queremos aislar bacterias acidófilas o alcalófilas; o
alta concentración de sal si queremos aislar bacterias halófilas.
·medios selectivos: medios sólidos, con inhibidores del crecimiento de bacterias, sólo las
resistentes sobreviven.
Cultivos comunitarios: mezcla de bacterias para cultivar aquellas no cultivables que requieren de
la cooperación.
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·utilización de la metagenómica o Genómica ambiental: aislamiento in situ de su ADN
TECNOLOGÍAS “ÓMICAS”
·Genómica
·Transcriptómica
·Proteómica
·Integrómica
1.En todos los países hay organizaciones que preparan o almacenan colecciones de cultivos tipo
o puros.
2.Se consideran organismos nacionales acreditados para su función de ser garantes del depósito
de nuevas cepas bacterianas descritas como especies nuevas.
3.Se rigen por un código para el depósito de las cepas y para la dispensación de las mismas a
los distintos demandantes.
Se llaman colecciones de cultivo tipo porque elijo la cepa más representativa de la especie.
Son las mismas especies y diferentes genotipos o fenotipos. Necesito esta variabilidad para
poder hacer un producto específico. Son diferentes cepas.
Pérdida de productividad.
Suave: -18ºC.
Fuerte: -80ºC.
Ultracongelación: -196ºC
Paralización del metabolismo celular por la disminución del agua disponible. Utilización de crio
protectores que minimizan daños durante la congelación. Necesitamos críoconservadores para
evitar la formación de agujas en el citoplasma y evitar así la lisis de la célula. Se utilizan: glicerol,
dmso, etc...todo lo que permita el intercambio iónico en la membrana.
2.Por liofolización: paso de liquido a sólido y tengo la estructura de la bacteria desecada pero
perfectamente viable. En medio liquido se recupera. Este es el preferido para mantener las celulas
en los repositorios.
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La liofilización consiste en la paralización del metabolismo celular por falta de agua: congelación
y sublimación.
Inconvenientes: no todo el mundo tiene el equipo necesario, alto coste, preparación incorrecta de
los distintos lotes.
En la fase exponencial quiero que se mantenga la mayor parte del tiempo para producir más.
·Productos de tipo 1: de la fosforilación oxidativa. Como etanol, ácido láctico, cítrico, que serán
excretados por la célula.
El quimiostato nos permite controlar el sistema y los nutrientes así como la turbidez del medio.
Busco un equilibrio dinámico. El quimiostato mide un nutriente relevante a las células.
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BIOPROCESOS: procesos mediante los cuales determinados sustratos son transformados por
acción biológica (microorganismos, células, tejidos) en biomasa y productos diversos.
1.Identificación del producto: obtener el mejor catalizador biológico para una función o proceso.
En esta fase interviene la investigación y desarrollo. Se identifican células vivas, sobre todo
microorganismos. Manejo de los microorganismos.
2.Fabricación a pequeña escala y gran escala: obtener el mejor ambiente para la función de ese
catalizador biológico, mediante una serie de diseños técnicos en los que es fundamental la
ingeniería química. A la pequeña intervienen los investigadores. Primer entorno de laboratorio,
despúes industrial (biorreactores o fermentadores) y eliminación del material biológico.
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3.Procesamiento del material: separar y eventualmente purificar el material biológico producido.
Bioproceso: metodología específica que utiliza alguna entidad biológica particular que genera
como producto alguna sustancia de interés. (seguridad)
Bacterias biotecnológicas:
·Transformación bacteriana: captación y asimilación de ADN libre (desnudo), a partir del medio,
por parte de una célula receptora.
Esta transformación se puede dar de forma natural, por choque térmico, por reacción química o
por electroporación.
·Choque térmico: se generan poros instantáneos que permiten la entrada del DNA. Esta técnica
degrada mucho los lípidos de las membranas celulares.
Se hacen lavados sucesivos en una solución fría a 4ºC de Cl2Ca, tras la cual la mezcla de células
y ADN se someten a unos 1-2 min a 42ºC. Este tratamiento altera las envueltas (sobre todo la
membrana externa) y aumenta su permeabilidad al ADN.
·Electroporación: se abre y se cierra un poro que se crea en la membrana celular. Es más eficiente
que el choque térmico porque se hace más rápido y se carga menos la membrana. Se utiliza un
electroporador y cubetas de electroporación. Se preparan células competentes y el plásmido que
va a ser utilizado como vector del gen recombinante.
ESCHERICHIA COLI
·E.coli K12, están clasificadas desde el punto de vista de la bioseguridad, como el vehículo más
seguro para la clonación eficiente y la expresión de proteínas recombinantes.
·E.coli XL1-Blue
·E.coli DH5-alpha
Debemos conocer el fenotipo y el genotipo de cada cepa.
Se utilizan cepas diferenciales para usar la bacteria perfectamente necesaria para mantener
viables los plásmidos que hay que usar. IMP. Hay múltiples tipos de cepas que podríamos usar
para nuestra investigación biotecnológica.
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clonado por el sistema endonucleasa EcoK, lo que asegura la correcta y eficiente amplificación
de los vectores.
Enzimas: celulasas producidas por E.coli; proteasas y amilasa producidas por Bacillus.
·Bacillus licheniformis: produce Subtilisina, una proteasa que puede usarse como
biodetergente, actúa contra las manchas de proteínas.
Comité EMA
Son comités que deciden is un producto biotecnológico cumple condiciones de ser GRAS y QPS.
Estos productos biotecnológicos no se pueden tolerar como productos 100% seguros porque
proceden de microorganismos, ya que no se puede asegurar 100% que no contienen sustancias
trazas que puedan ser alérgicas o dañinas.
Han sido seleccionados y todos los microorganismos de esta lista se meten dentro de GRAS y
QPS por designación de los comités, salvo Aspergillus que no se considera seguro y no entra en
la clasificación QPS.
AGROBACTERIUM TUMEFACIENS
Tiene el plásmido Ti (Variedades de plantas transgénicas)(Tumor inducing) que es de gran
tamaño. Es capaz de insertar DNA en cromosomas vegetales.
BACILLUS THURINGIENSIS
·Gen Cry: proteína Cry con efecto insecticida para la pirálide del maíz.
·Gen Del : glifosato, efecto insecticida de otro microorganismo del género Bacillus.
PSEUDOMONAS SYRINGAE
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Estimula la formación de cristales de hielo por simbiosis con plantas. Efecto “antiescarcha”.
STREPTOCOCCUS MUTANS
Cepa recombinante que reduce las caries patológicas. No puede metabolizar los azúcares para
producir ácido láctico. Aprobada por la FDA para sustituir la microbiota normal.
Los primeros son unicelulares de forma redondeada y con reproducción por gemación. Los
segundos son multicelulares, forman hifas y crecen por ramificación.
Los mejores para producción biotenológica serían las levaduras ya que su extracción es más fácil
ya que son unicelulares. Pero ambos son útiles en biotecnología.
Hongos (filamentosos)
LEVADURAS
4x10^6 = 4 Mb.
Microorganismo GRAS probiotico. IMP. TODAS LAS LEVADURAS GENERALMENTE SON GRAS.
Aprobado por la FDA/EMA.
Económico.
En biotecnología clásica esta levadura ha sido muy usada en producción de bebidas y comidas.
La producción de enzimas: quimosina fue el salto al uso de esta levadura como recombinante.
AH109
PJ69-4alpha
Y187
Schizosaccharomyces pombe
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Tiene características mejoradas que la anterior y se usa para obtener un mayor rendimiento.
Su genoma es del mismo tamaño que el anterior pero se secuenció 6 años después. Presenta 3
cromosomas.
Centrómeros repetitivos.
IMPORTANTE: Tiene dos genes de la alcohol oxidasa AOX1 y AOX2 que tienen un promotor
inducible fuertemente.
Utiliza metanol como fuente de carbono y energía. Los promotores AOX son inducidos por
metanol y son reprimidos por ej, glucosa.
Hansenula polymorpha
Crece a 50ºC
Productora de glicoproteínas.
Cepas: CBS4732
DL-1
NCYC495
Kluyveromyces lactis. (Nos tenemos que acordar de que se relaciona con ambiente láctico)
Produce quimosina.
Promotor LAC4
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Yarrowia lipolytica
HONGOS FILAMENTOSOS
ASPERGILLUS NÍGER
ASPERGILLUS ORYZAE
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pectinasas.
ASPERGILLUS GLAUCUS
Productores de pigmentos (la Antártida recibe más impacto UV y estos hongos se protegen
produciendo pigmentos)
Degradadores de polisacáridos.
ASPERGILLUS SOYAE
Especie fermentadora.
GEOTRICHUM SPP.
Todos los virus necesitan parasitar o infectar una célula para sobrevivir, de modo que son
parásitos obligados.
Son estructuras acelulares, sin membrana pero con cápside. Son extremadamente pequeños y
constituidos con ácidos nucleicos ADN o ARN. Cada tipo de virus muestra una gran especificidad
celular y presentan tropismo por un tipo celular para parasitarlo.
Fuera del hospedador, los virus no pueden considerarse como seres vivos autónomos. Todos
provocan enfermedad, son patógenos de animales, vegetales, bacterias, hongos...
Nuestro organismo produce interferón que nos ayuda a prevenir la infección viral.
El estudio de genomas virales es importante en la actualidad para aprender cómo los virus
causan enfermedades y a desarrollar nuevos y eficaces medicamentos antivirales:
VIRUS SINTÉTICOS
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Se han conseguido sintetizar virus de forma artificial (biología sintética). Ej: virus de la polio.
La biología sintética sintetiza de Novo un ente biológico que funciona mientras que la clonación
hace el mimeting de un gen para sobreproduzco (son diferentes).
Son especialistas en la destrucción de bacterias. Son las partículas biológicas más abundantes
en la naturaleza.
La presencia de fagos es primordial para la estabilidad de los ecosistemas. Mantienen los niveles
de bacterias en su justo porcentaje conforme se va instaurando la microbiota como ecosistema
(por ejemplo). Si hay un desajuste en estos fagos, las comunidades de bacterias se verían
incrementados o disminuidos y se ocasionarían problemas en el ecosistema.
Los fagos sólo infectan bacterias. Sus estructuras externas sólo les permiten reconocer un tipo
específico, por lo que es imposible que provoquen daños a otras formas de
vida.
Presenta ciclo lítico (no hay integración del material genético, el fago lisa a la
bacteria) y ciclo lisogénico. Necesitaríamos aprovechar el ciclo litico para usar
los fagos como potencial agente terapéutico. A través de las proteínas
codificadas por los fagos que inhiben el metabolismo de las células parasitadas.
Los ensayos clínicos con fagos como terapia son los siguientes:
Se ha tratado la disentería bacilar producida por Shigella, busco el fago específico de la shigella
que produce esta enfermedad.
Se han tratado infecciones de la piel y mucosa nasal producida por Klebsiella con el fago
específico de la Klebsiella que lleva a cabo esta infección.
VENTAJAS E INCONVENIENTES DE
LA TERAPIA FÁGICA FRENTE A LA
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ANTIBIOTERAPIA
Fueron puestos estos cocktails de fagos en mercado clínico la compañía LÒréal y la Eli Lilly
(USA).
Para hacer frente al aumento de la resistencia de muchas bacterias patógenas comunes como
SAMR o EVR.
Buena en infecciones de la mucosa intestinal y piel (donde hay rápida multiplicación fágica).
No útil en infecciones donde hay dificultad de multiplicación fágica por nº excesivo de células
(abscesos).
Aprovechar la información génica de los fagos. Sus proteínas afectan a las células hospedadoras.
Utilizar fagos como fuente de información sobre dianas bacterianas para la búsqueda d e nuevos
antibióticos.
Búsqueda de un fármaco que mimético el efecto producido por las proteínas fágica. Ej: S.aureus.
Son enzimas líticas (lisinas) codificadas por fagos ADNbc. Efecto bactericida por hidrolizar
enlaces covalentes del peptidoglucano.
Amidasas
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Endopeptidasas
Muramidasas
Glucaminidasas
Transglucosidasas
ESTO CAE SEGURÍSIMO: PHAGE DISPLAY: expresión en fagos para la selección de variantes
de proteínas. Relacionada con la biotecnología roja.
Definición breve: técnica de selección de proteínas in vitro. Desarrollado x George P.Smith, 1985.
Con facilidad se pueden crear numerosos clones de fagos que muestran diferentes péptidos.
Esta colección de fagos se les llama librería o biblioteca de péptidos.
2.Unión/selección.
Unión de la proteína terapéutica expresada como proteína del fago y selección de la colección de
fagos diferentes para quedarnos con el fago que contenga la proteína con actividad terapéutica.
3.Lavado
Por un sistema de lavado y los que se quedan unidos en la diana no los perdemos porque son los
que necesitamos, los que no presenten actividad terapéutica se lavan del sistema.
4.Elución
5.Amplificación
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Con los seleccionados finalmente llevo a cabo circuitos de amplificación y análisis final de cual es
la proteína final que es valida como proteína terapéutica.
*****IMP: el gen recombinante ocupa una parte del gen bastante importante y necesita un fago
helper para que el fago recombinante sobreviva y pueda proliferar.
Tecnología de ADN recombinante para incorporar el cDNA de interés en el DNA viral. Fusión al
gen para proteína de cápsida y así el péptido se expondrá en la superficie de las partículas
fágicas.
Los genes vienen de un RNA que convertimos en cDNA de interés y luego se producen todas las
variantes. Los cDNAs se clonan y tendré una serie de modificaciones en función de los distintos
fragmentos de RNA de los cuales hemos partido.
Diferentes genes se insertan en los genomas de los fagos. Cada fago sólo mostrará un
determinado péptido. El conjunto de estos fagos son las librerías de péptidos.
Las salas blancas evitan el contagio del operario del virus así como la contaminación de la
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muestra.
Un fago no es viable porque le hemos quitado una parte de su genoma y queda deficiente de
proteinas para su empaquetamiento, el fago helper será el responsable de que el fago inicial
pueda ser viable. El fago helper no tiene el gen de replicación ni los orígenes de replicación,
tampoco tiene señal de empaquetamiento; el helper dona al fago inicial todas las estructuras que
servirán como enzimas que harán al fago inicial viable y estructuras propias al fago recombinante
para darle la posibilidad de empaquetarse sin problema al haberle quitado el gen que se ha
retirado al principio del todo.
Los fagémidos se diseñan para expresar proteínas recombinantes de difusión bajo condiciones
controladas pero no codifican ninguna proteína viral. Los fagémidos combinan propiedades de
los plásmidos (resistencia a antibióticos y replicación de ADNbc) con los de vectores fágicos
(producción y empaqueta miento de ADNmc en viriones).
Sólo por la coinfección de la bacteria con un fago helper puede el fagémido replicar ADNmc y
empaquetarlo.
La diana tiene que tener cierta afinidad a la proteína expuesta en la superficie del fago.
Paso de la solución de fagos a través de un soporte sólido con los receptores (que contiene
receptores dianas).
3.LAVADO
Para eliminar los fagos que no tiene afinidad por los receptores de las dianas. Los fagos no
unidos se retiran por lavados solo quedan unidos al soporte los que presentan afinidad por los
receptores.
4.ELUCIÓN (imp)
Cuando quiero recuperar estos fagos, he de romper enlaces covalentes que se han unido entre
ellos y los receptores. Usando urea puedo desnaturalizar las proteínas, así como usando
proteasas, ph ácidos o alcalinos, etc. Además, se puede pasar por la columna la bacteria porque
los fagos se unirían directamente de forma selectiva a la bacteria y saldrían.
Se usan agentes que rompen los enlaces covalentes y son los que permiten eluir los fagos que se
habían unido de forma más fuerte mediante enlaces receptor-ligando (imp).
·Tampones ácidos o alcalinos, urea, adición de ligandos solubles para el receptor, proteasas.
5.AMPLIFICACIÓN Y ANÁLISIS
Los fagos eludidos que muestran especificidad se utilizan para infectar nuevas células y
amplificar en E.coli.
El ciclo se repite 2-3 veces para seleccionar la mejor secuencia de unión y seleccionar la proteína
más activa frente a la diana terapéutica que necesito.
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Los procesos de selección son fáciles y variados, si el diseño está correcto desde el principio.
Pueden crear variaciones de las librerías (fagotecas) por la inducción de mutaciones por PCR
propensa a error, etc...
Poca longitud del péptido, el fago tiene un genoma reducido. Esto impide el plegado.
Pérdida de fagos si los pasos de unión y lavados son demasiado rigurosos. Si la columna no está
bien diseñada o se añade un disolvente más astringente de la cuenta, pierdo los fagos que tienen
capacidad de reconocer las dianas, que son los que necesito.
Los métodos de unión o afinidad para la selección pueden no funcionar in vivo. Cuando meto el
fago en un animal vivo, no se produce la interacción y aunque todo el proceso esté correcto,
fracasa in vivo. Esto se debe a que las interacciones in vivo son mucho más complejas que las in
vitro.
APLICACIONES DEL PHAGE-DISPLAY (IMP TAMBIÉN PUEDE CAER: PARA QUE SIRVE)
Descubrimiento de medicamentos.
·Amplificación por infección y crecimiento de los fagos entre las diferentes rondas de selección.
Selección:
·Tras las rondas de replicación, los fagos se depositan en los pocillos de ELISA.
·Los clones específicos para el antígeno se detecta con conjugados anti-fagos en combinación
con un sustrato colorimétrico.
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APLICACIÓN DE LOS VIRUS EN LA TERAPIA
TERAPIA GÉNICA: transferencia de ácidos nucleicos (ADN o ARN) con fines terapéuticos.
·Vectores virales: virus recombinantes y defectivos (carecen de alguna función necesaria para su
propio ciclo replicativo).
Los vectores más usados en terapia génica con los Adenovirus y los Retrovirus.
Los virus son parásitos intracelulares obligados, muy eficaces en transferir DNA viral a las células.
paciente.
(Generalmente se tratan las monogenéticas, porque las poligénicas son más complicadas).
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que presenta un defecto en la adenosina aminasa (ADA).
Ejemplo bebés burbuja.
·Hemofilia A y B
·Hipercolesterolemia familias
·Enfermedad de Gaucher
·Vectores integrativos (se va dentro de una zona especifica del genoma, a veces al azar y otras de
forma específica). Tiene riesgo de la tasa de mutación insercional.
Retrovirus
Lentivirus
RETROVIRUS (imp)
Son virus con genoma de ARN monocatenario. Se replican a ADNbc intermediario. Éste es el que
se inserta en el genoma para permitir la produccion de la proteina terapéutica.
VECTORES RETROVIRALES
Tenemos muy poco espacio (gal, Pol, env) pero éste se suple por los genes terapéuticos.
Las estructuras o virus helper permiten que existan de forma estructural todo lo que necesito
para empaquetar el genoma terapéutico.
Éstas proteinas constituyen el vector retro viral para que lleguen al cromosoma celular. (Esquema
bien grande).
·Buena infectividad
·Tropismo amplio
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Tiene un periodo de incubación muy largo. Los signos y síntomas de las infecciones que
producen se desarrollan con lentitud. A veces se usan como vectores integrativos que requieren
tiempos más largos de incubación. Infectan células en división y no mitóticas.
VECTORES LENTIVIRALES
Se usan porque tienen un genoma mucho más largo, son retrovirus que pueden infectar células
en división y quiescentes.
Son más complicados que los retrovirus pues contienen además proteínas extra, tat, rev...
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Con poca respuesta inmune (apto para terapia in vivo) y expresión por 6 meses.
No se integra en el genoma celular. Se quedan fuera del genoma per dentro del núcleo porque
necesita las estructuras metabólicas y enzimas del núcleo para replicarse.
VECTORES ADENOVIRALES
VENTAJAS:
INCONVENIENTES
Virus ADNmc simples no patógenos que dependen de virus helper (adenovirus) para replicar.
Dibujo
VENTAJAS
Extremadamente simples
Aplicaciones in vivo
INCONVENIENTES
·polisacáridos
·bioplásticos (poli-hidroxi-alcanoatos)
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Los exopolisacáridos están en :
·encapsulación
·utilidad como moduladores de la respuesta biológica (se inyectan para incrementar la respuesta
inmune)
POLISACÁRIDOS
Los EPS son los exopolisacáridos: son polisacáridos de alto peso molecular, pudiendo
encontrarse bajo dos formas:
·como cápsula
IMP: Los EPS pueden ser producidos por un amplio numero de microorganismos
·Levaduras, Hongos
Tiene una serie de estructuras adicionales de acido hialuronico que proporciona las
características físico químicas utiles. Si añadimos sustancias adicionales realizamos un make up.
Compuestos de almacenamiento
Compuestos estructurales
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·Se han descrito alrededor de 20 EPS diferentes con mercado potencial, pero la mayor parte
corresponde al xantano, con una produccion aprox de 20.000 toneladas por año.
BIOSÍNTESIS DE HOMOPOLISACARIDOS
DEXTRANO: homopolímero de glucosa con uniones alfa 1-6. La actividad necesaria para su
biosíntesis es la glucosiltransferasa (IMP), que permite la union consecutiva de glucosas. Si el
microorganismo carece de esta encima, no va a producir este polisacarido.
El polímero muestra un variable grado de ramificaciones y contiene enlaces alfa 1-3 y alfa 1-6.
4.Modificacion del EPS: acetilación, carboxietilación. Aquí está la etapa de make up.
La agrupación de genes EPS son transcritos como una unica unidad transcripción al= unidad
policistrónica. Están conservados.
Una región central con genes que muestran homologa con glicosiltransferasas.
Dos regiones que flanquean la región central que muestran homología a enzimas que determinan
la longitud de la cadenas, procesos de polimerización y exportación-transporte.
GENES DE EPSs
·Las regiones más conservadas son las que codificaban para glicosiltransferasas, el resto son
variables: podemos encontrar pseudo-genes, cuando contienen cambios en el ORF o codones
de terminación. También existen los genes mosaicos que tienen una alta divergencia con
secuencias relacionadas.
·Fermentación:
·Recuperación:
Según su utilización posterior, el grado de pureza del polímero viene regulado por su proceso de
extracción (FDA gomas solubles: uso cosmético, alimentario, farmacéutico).
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POLI-BETA-HIDROXI-ALCANOATOS
Bacillus cereus
Los genes son phaA que es el gen central que sintetiza la beta cetotiolasa.
Se generan 3 enzimas:
·La enzima phaA, una beta cetotiolasa para condensar dos moléculas de acetil-coa para formar
acetoacetil-coa.
·La enzima PhaB es una acetoacetil-coA reductasa que convierte este compuesto en 3-
hidroxibutiril-coa introduciendo el grupo hidróxilo.
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Dependiendo del tipo de microorganismo, también se llaman PHA polimerasas. Permite en ultimo
termino generar polímeros o bioplásticos diferentes. Encargada de dar el polímero diferencial.
Los genes que sintetizan la monocapa de proteínas suelen estar flanqueando los genes phaA,
phaB y phaC. Los genes flanqueantes dan la consolidación del saco.
Necesita D polimerasas para romper el saco y liberar el carbono inerte que constituye el PHA.
La estructura polimerica del PHA está dentro del saco recubierta de una pequeña capa de
fosfolipidos y proteínas ademas de polimerasas para poder liberar el carbono necesario. No
tenemos una unidad policistrónica, no todo se sintetiza al mismo tiempo.
·Organización genética especifica de la región pha de Azotobacter sp. FA8: las flechas indican el
sentido de la transcripción.
Para lograr una buena acumulación del polímero en E.coli recombinante es necesario utilizar
vectores de expresión estables con un alto numero de copias: la expresión estable y sostenida de
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los genes pha.
A pesar de tener los mismos genes, los procesos downstream son diferentes en función de los
microorganismos que se utilizan, así obtendré por ejemplo unos productos más opacos y otros
menos. EL BIOPLÁSTICO NO SE LIBERA AL SOBRENADANTE, ESTÁ DENTRO DE LA CÉLULA
NECESITO ROMPER LA CÉLULA PARA LIBERARLO.
·Optimizar el rendimiento.
·Producción de aminoácidos:
·Producción de etanol
METABOLITOS PRIMARIOS
Los metabolitos primarios son moléculas de bajo peso molecular. Son productos finales o
intermediarios de las rutas metabólicas. Son producidos durante la fase de crecimiento del
microorganismo.
Pueden ser resultado del metabolismo anabólico: proteínas, lípidos, carbohidratos, ácidos...
PRODUCCIÓN DE AMINOÁCIDOS
Suponía antes un método caro de obtención de un producto útil y ahora se obtiene de forma
fácil. Japón líder mundial en fermentaciones industriales.
Glutamato sódico
·En la industria química como material de partida para la síntesis de otras sustancias: polímeros
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de polialanina y resinas de isocianato de Lisina...
Estrategias:
Control negativo: los genes estructurales se expresan hasta que se inhibe por la acción de un
represor. Lo asociamos con el principio de economía de las bacterias. Tipos:
B) control negativo con efectos represores (operón trp): el represor per se es inactivo, pero en
presencia del correpresor se activa (adquiere su capacidad funcional) y se reprime al operón
estructural.
Todos los metabolitos primarios atienden a este control primario: si no está el metabolito en el
medio, lo produce; si está en el medio, no lo va a producir. Se autorregula la producción del
metabolito primario.
Cinco genes estructurales en la secuencia trpEDCBA, que codifican 5 polipéptidos que a su vez
constituyen 3 enzimas implicadas en el paso de corísmico a triptófeno. (Saberse los genes)
Promotor.
Los MO producen AA para utilizarlos en sus vías metabólicas por los eu la producción está
altamente regulada.
La excreción se debe estimular por varios métodos, como ejemplo el caso del ácido glutámico.
mutagénesis no dirigida
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Microorganismo: Corynebacterium glutamicum
IMP: para potenciar la liberación de acido glutámico al medio de fermentación, para conseguir
una cepa súper productora de este producto, he de tener una cepa auxotrofa para la biotina(si
no pongo biotina en el medio, la cepa no crece y no se produce glutamato) y deficiente en alfa-
KG DH (porque quiero desviar una ruta metabólica para derivarla a la producción de L-glutámico).
·por cepas mutantes con diferentes mecanismos reguladores (deficiente en le enzima anterior)
·por ingeniería metabólica, poniendo las condiciones necesarias en el medio para desviar la ruta
de los ácidos carboxílicos hacia la producción de glutamato.
La carencia de biotina produce la carencia de glutámico (salida del mismo) porque ella es
necesaria para la síntesis de ácidos grasos. Si no hay biotina, no se generan ácidos grasos y no
hay fosfolípidos, componente estructural primario de las membranas celulares. Se hacen éstas
mucho más laxas, con mas poros y una mayor posibilidad de excretar glutámico al exterior
celular.: salida del glutámico.
Necesito la cepa auxotrofa de biotina porque así sirve de interruptor para que cuando la
producción de glutámico este al 100% en el citoplasma, se disminuya la biotina y pueda liberarse
el glutámico al exterior celular para poder obtenerlo.
Se pone una cantidad intermedia de oxígeno para así permitir que siendo una cepa deficiente en
la enzima, toda la derivación del producto sea hacia el glutamato.
·Con oxígeno, las moléculas se oxidan por el ciclo del glioxalato, no se forma ni alfaKG ni
glutamato.
¿Por qué entonces se produce mucho glutámico? El crecimiento en fermentador gran masa
celular que mantiene unos niveles intermedios de oxígeno y así no hay eoxidción completa a CO2
y agua y se acumula además alfaKG y por tanto glutamato.
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Para administración parenteral usamos glucosa.
El medio utilizado para la producción comercial de ácido glutámico debe contener, suficiente
biotina para obtener un buen crecimiento, después del cual se impone una deficiencia de bioteina
y el ácido glutámico es excretado.
Una bacteria producirá un metabolito secundario cuando tiene que competir con otros
microorganismos. Necesita sobrevivir y para ello genera el metabolito primario, pero cuando
empieza a haber competencia por los nutrientes, se comenzarán a producir metabolitos
secundarios en función de la competencia por los nutrientes presentes en su nicho ecológico.
Este metabolito sirve como reserva, competencia, como molécula hormonal, etc.
DEFINICIÓN
Los metabolitos secundarios son productos naturales con bajo peso molecular, no son esenciales
y su producción depende de las condiciones ambientales. Se pueden generar en plantas,
animales y microorganismos.
Son muy diversos con gran actividad biológica, con centros quirales, SAR.
·Inconvenientes: extracto crudo-purificación más difícil, bajas concentraciones, hay que aumentar
la escala de fermentación.
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3.Coleccionar los extractos de interés para escalar la fermentación a diferentes condiciones que
promuevan diferentes estreses mediante medios de cultivo variados.
Aquí se pueden usar botellas de co-cultivo de dos especies distintas. En una se pone el
microorganismo que se cree que produce el metabolito que queremos, con el objetivo de
producir un intercambio que nos haga obtener el metabolito de interés.
Permite hace una selección en medio solido, liquido, en ensayos de sensibilidad, en ensayos de
gen reportero...Ya vamos detectando qué actividad específica tiene ese metabolito secundario
mediante este screening.
·Intraceular: phenotype biological system based ensayos. Ensayo en Medio Sólido (antibiograma),
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Ensayo con Gen Reportero, selecciona la acción antibiótica con un marcador (LacZ).
6. Elucidación estructural.
Necesitamos diana-ensayo o phenotype-ensayo para buscar cual es el uso que le vamos a dar a
ese metabolito secundario, por tanto, necesitamos ademas las condiciones de cultivo. Se
prueban muchos medios de cultivo hasta encontrar aquel en el que se produce el metabolito de
interés con mayor rendimiento. Así podemos encontrar una única molécula que sea activa frente
al microorganismo. (Diapositiva de círculos resumen) saber además, los 6 pasos.
·Platensimicina y Platencin
·CESPOFUNGIN molécula activa frente a cándida que fue aislada de un río de Madrid.
·Kocurin.
Ejemplo: Micotoxinas, son metabolitos secundarios que producen Micotoxicoxis. Son las
aflatoxinas, cortao toxina, fumonisina...
En aquellos en los que están separados ambos factores, se generan vacunas 100% inocuas.
Pero cuando no están tan bien separados, se generan vacunas que pueden dar reacción a cierta
parte de la población porque en la vacuna quedan ciertos elementos estructurales que dan
reacción.
·inocuidad
·precio competitivo
Como las zonas endémicas se han ido modificando y la prevalencia de las enfermedades va
cambiando. Por tanto el calendario de vacunas es diferente en cada país e incluso dentro de
distintas comunidades dentro de un país. En el 86 aparece la primera vacuna recombinante.
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VACUNAS RECOMBINANTES
·Vivas atenuadas: consiste en eliminar la virulencia del patógeno pero manteniendo los productos
que crean la respuesta inmune. Ej: la gripe.
·Vivas polivalentes: en las cuales un mismo microorganismo puede conferir inmunidad para dos
enfermedades diferentes: Virus recombinante vivo que ofrece protección frente a la preste aviar
como a la enfermedad de Newcastle.
CARACTERÍSTICAS
Las técnicas con DNA recombinante pueden facilitar la modificación de un patógeno porque las
técnicas genéticas in vitro suelen ser más precisas y más potentes que las técnicas tradicionales,
se eliminan simplemente los genes implicados en la virulencia, dejan los que tiene productos que
crean una respuesta inmunitaria, lo que da lugar a una vacuna recombinante viva atenuada.
Son más seguras que las vacunas normales atenuadas o las muertas.
Se fabrican mucho más rápido que las que se producen mediante métodos más tradicionales.
Suelen ser más baratas que las producidas por otros métodos.
Son vacunas que contienen solo una o varias proteínas del agente patógeno. Utilizan los factores
inmunogenicos que me permiten generar el antígeno para obtener el anticuerpo, clonarlo, incluirlo
en estructuras y producir la vacuna.
Ej: en el caso de los virus se suelen utilizar proteínas de la cubierta, puesto que son altamente
inmunogénicas.
Ventajas: al no estar formadas por la totalidad de la estructura del agente infeccioso, es posible
diferenciar serológicamente a los animales vacunados de los animales enfermos.
Clonación de los genes de la proteína de cubierta del virus dentro de un vector adecuado.
Si se elige como hospedador E.coli, las vacunas suelen ser muy poco inmunógenas (no
consiguen proteger a los animales de infecciones posteriores) porque las proteínas
recombinantes no están glicosiladas.
Si se opta por un hospedador eucariótico, las vacunas tienen gran capacidad inmunogénica y
esto es debido a que las proteínas recombinantes sí están glicosiladas.
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HEPATITIS B (sabérselo de memoria!!!!!) IMP
La primera vacuna aprobada en uso humano se fabricó utilizando levaduras, fue clonado y
expresado en levaduras.
El antigeno HBsAg es el antigeno aislado del virus que se usa actualmente en la actual vacuna
de la hepatitis B, producido por ingeniería genética en levaduras. La glicosilacoin le da un plus
de capacidad inmunogénica desencadenando una mayor respuesta inmunogenica.El
antigeno se produce a altos niveles en grandes fermentadores de modo seguro.
Son conocidas como “vacunas genéticas”, son utilizadas en tratamientos de enfermedades como
el sida o la malaria. Éstas vacunas utilizan el material genético del patógeno en cuestión para
conseguir la inmunización.
El material genético puede encontrarse en forma de fragmentos definidos del genoma del
patógeno, o en forma de genes del patógeno clonado en un plásmido o en un vector virico.
IMP: inducen una respuesta inmune completa y duradera que incluye anticuerpos así como
una activación fuerte y duradera de células T cooperadoras y citotoxicas.
IMP: cuando se inyecta el plásmido en el músculo o en la piel, éste penetrante dentro de la celula
y llega al núcleo, para desencadenar la producción de los antígenos del patógeno contra el que
se quiere obtener inmunidad. De esta forma lo que se hace es trasladar la fábrica de la vacuna a
los tejidos de la misma persona, lo que se hacía en grandes plantas industriales pasa a hacerse
en las propias células de la persona vacunada, y con gran eficiencia.
Porque no conocemos el gen específico que desencadena la respuesta inmune. Solo para los
patógenos que conocemos el gen que desencadena la inmunología son los candidatos perfectos
para generar esa inmunidad. Con los demás, se previene no inyectando todo el dna. la
especificidad de cada micoorganismo es lo que nos falta por identificar en los patógenos no
susceptibles de crear vacunas.
Explican el gran interés generado por las vacunas de DNA, las cuales se han probado con éxito
contra un número creciente de enfermedades.
No crea respuesta inmune hacia el vector, por lo que pueden administrarse repetidas veces.
Fácil producción. Bajo coste. Muy estable. Fácil almacenaje y distribución. Segura.
·Una única unidad transcripcional que incluye un promotor, un intrón, un cDNA que codifica para
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el antígeno y una secuencia de terminación de la transcripción.
·Un esqueleto plasmídico que contiene el origen de replicación, un sitio de clonación múltiple que
facilita la inserción del gen, un gen de resistencia a antibióticos y las secuencias CpG que son
inmunoestimulatorias que funcionan como un adyuvante interno en la misma vacuna,
dando un plus en el desencadenamiento de la respuesta inmune.
·Bacterianas:
La parte de la bacteria útil sería la que hace el primer contacto con la célula eucariota y que
genera la capacidad infecciosa, es decir, de la cápsula, la subunidad es ésta propia cápsula.
La vacuna de subunidad se hace con la cápsula de la bacteria y por eso también se llaman
vacunas de subunidades.
·Vírales: antihepatitis B.
VACUNAS TOXOIDES
Este tipo de alternativa, llamada vacuna terapéutica, ayudaría por lo menos a reducir el número
de muertos y sujetos en situación de enfermedad crónica grave que el sida produce en estos
momentos. La estrategia de los métodos que se están evaluando es estimular el sistema
inmunológico de los enfermos para identificar y matar a las células del organismo en las
que se esconde el agente patógeno.
Ninguna de las investigaciones está dirigida a prevenir la enfermedad sino a estimular las
defensas de los pacientes ya infectados, por eso es vacuna terapéutica. No demostró proteger
contra la enfermedad, sino que mantiene la carga antigénica constante y dar calidad de vida al
paciente.
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VÍAS DE ADMINISTRACIÓN
Vía subcutánea.
Vía intramuscular.
IMP TEMA 20: Ventajas recombinantes. Vacunas de dna. vacunas de subunidades. Microniddles.
INSULINA
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Proteína importantísima para la regulación del metabolismo de los carbohidratos. Es producida
en el páncreas y su función en el organismo es incrementar la producción de glucosa y su
posterior degradación, controlando su nivel en sangre. Su ausencia/alteración provoca diabetes.
Las hormonas implicadas en mantener los niveles de glucosa en sangre son la insulina y el
glucagón.
Ej. insulina. Tiene dos cadenas, dos polipéptidos en su forma activa: A y B; unidos por un puente
disulfuro, codificados por partes separadas del gen de insulina. Además este gen también
codifica la preproinsulina y un polipéptido de unión de los polipéptidos A y B.
Las dos cadenas se pueden generar cada una en un E.coli o todo con un solo E.coli al que se le
hayan insertado los genes de codificación de ambas cadenas. La hipótesis de diseño es conocer
perfectamente la estructura final de la proteína y conocer los aminoácidos de la cadena primaria
de la proteína terapéutica y cuales son los elementos secundarios necesarios para que la proteína
esté activa.
La insulina recombinante nos permitió hacer insulina rápida con aminoácidos Humalog y también
insulina lenta con aminoácidos Lantus. La diferencia entre la insulina d e humanos y la bovina y
porcina se diferencia solo en unos aminoácidos Humanos ya que la mayoría de los aminoácidos
de la estructura de la insulina es igual para vertebrados, bovinos y porcinos, ya que contienen los
mismos aminoácidos y en gran proporción en la Constitución de la proteína.
Primero tenemos que ver al estructura de la proteína recombinante que vamos a hacer. Si hay un
ejercicio que nos pide obtener una proteína desde cero en un vial, tenemos que empezar a
diseñar sabiendo el tipo de aminoácidos que componen la proteína que vamos a sintetizar de
forma recombinante.
En caso de la insulina tenemos una cadena alfa y una cadena beta. Se codificaran genes que
codifiquen al péptido A, se meterán en un E.coli y en un matriz tendremos e.coli transformado
con el plásmido que porta el gen que codifica el polipéptido A. En otro clon ponemos el gen que
codifica el polipéptido B. Lo introduciremos transformando un e.coli para obtener un e.coli
transformado con el gen B que nos va a dar el polipéptido B.
El polipéptido A y b se purifican de ese cultivo y se le ponen las condiciones óptimas para que se
genere finalmente la insulina con los puentes disulfuro intra e intercatenarios que unen ambos
polipéptidos para formar la insulina.
La insulina en su forma activa esta formada por 2 polipéptidos A y B, unidos por un enlace
disulfuro, codificados por partes separadas del gen de insulina. Además, este gen también
codifica la preproinsulina y un polipéptido de union de los polipéptidos A y B.
La siguiente forma de síntesis es usando solo un vector que se introduce en un único e.coli y que
genera preproinsulina de nuevo, conteniendo la proteína a y la b más la parte de fusión. De modo
que podemos generar dos cadenas independientes, con 2 e.coli codificados de forma
independiente o bien podemos usar gen A y gen B que se insertan en e.coli unidos mediante una
proteína de fusión en un único e.coli donde finalmente se elimina la proteína de fusión. Sin
embargo, lo mas importante en ambos casos es conocer la secuencia de aminoácidos principal
que codifica la proteína recombinante que queremos obtener.
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Compañía Novo Nordisk.
Ideo la biotransformación de un aminoácido de ala niña por treonina para humanizar la insulina de
cerdo. (Esto es importante). Así consiguieron que fuese lo más parecida posible a la humana. De
aquí hay que saberse el nombre de la compañía farmacéutica, que consiste en una modificación
enzimática de una alanina por una treonina, y que fue una biotransformación.
1.En ingeniería genética, los científicos utilizan enzimas de restricción para aislar un segmento
de ADN que contiene un gen de interés, por ejemplo: el gen que regula la producción de insulina.
2.Un plásmido extraído de su bacteria y tratado con la misma enzima de restricción puede
formar un híbrido con estos extremos de ADN complementario.
3.El plásmido híbrido se reincorpora a la célula bacteriana, donde se replica como parte de DNA
celular.
4.Se pueden cultivar un gran número de células hijas y obtener sus productos genéticos para el
uso humano.
·Cada cadena de la insulina se separaba de la proteína de fusión mediante una hidrólisis con
BrCN.
Obtendríamos la insulina con sus dos cadenas y la proteína de fusión cortada. Perseguimos
producir con un único E.coli transformado las dos cadenas de la insulina, por eso se llama
preproinsulina porque no obtenemos directamente nunca la insulina, tenemos que llevar a cabo
una serie de pasos para obtener finalmente la insulina activa. Las posibilidades de obtención es
variable pero depende de la estructura secundaria de ambas cadenas, así como de la secuencia
de aminoácidos de ambas.
INSULINAS MODIFICADAS
Las insulinas modificadas buscan una mayor eficacia terapéutica: las moléculas de insulina
tienden a dimerizar y hexamerizar (u oligomerización, entonces su acción hormonal se ve
limitada, ya que precipita y entonces ya no actúa adecuadamente) cuando se almacenan y a las
dosis terapéuticas lo que retrasa el efecto de la insulina porque retarda su absorción en el
torrente circulatorio por vía subcutánea o intramuscular.
(Aprender:)
·Las insulina Humalog y Liprolog de Eli Lilly tienen la Pro28 y la Lys29 de la cadena invertidas en
su posición con lo que se consigue una insulina de acción más rápida.
·De forma parecida la insulina NovoRapid de Novo Nordisk tiene sustituida la Pro28 por ácido
aspártico para conseguir el mismo efecto que las anteriores insulina de Eli Lilly.
·La insulina Lantus de Aventis tiene sustituido el Asp21 de la cadena (por glicina y además tiene
2 argininas adicionales en la posición C-terminal, con lo que se consigue una insulina de acción
más lenta.
Humulina: insulina idéntica a la humana producida por Lilly producida en E.coli y fue la primera
recombinante.
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Nordisk, es idéntica a la humana y la
produjo 10 años despues casi, en
S.cerevisiae.
Todas se utilizan para la diabetes. Todas son idénticas a la humana y hay que aprenderse solo las
bacterias, las compañías y el año. El sistema de producción es la biofábrica, es decir, la bacteria
o la célula en la que se va a producir la proteína, en nuestro caso: la insulina.
Consiste en que las propias células del individuo generasen la insulina que necesita el individuo.
Lo primero que tenemos que saber es cómo es la naturaleza de la proteína recombinante que
queremos obtener.
La extracción de la HGHr es a partir de animales y era muy costosa y difícil, pero puede ser
obtenida de forma recombinante con 9 litros de producción bacteriana en cultivo de un clon
transgénico que contenga los genes específicos.
Esta hormona se puede obtener a partir de animales transgénicos. Se coge el gen de la hormona
del crecimiento se mete en un embrión de un ternero y se introduce en una vaca. De modo que el
ternero que nace cuando ya es vaca produce leche en
la cual obtenemos la proteína.
ERITROPOYETINA: EPO Hr
(recombinante)
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élite (mayor rendimiento).
La eritropoyetina es el medicamento
recombinante más vendido en todo el mundo. Necesitamos saber su secuencia de
aminoácidos(165)para sintetizarla a nivel recombinante. La ponemos en un clon, elegimos un
vector y la producimos.
Una vez obtenido los genes, se ha de elegir muy bien el hospedador porque para ser activa, la
EPO ha de estar glicosilada. Es importante señalar que la EPO recombinante ha de producirse en
células de mamífero, ya que para ser activa tiene que estar adecuadamente glicosilada.
·Esta glicosilación es esencial, a veces de forma diferencial. No hay EPO recombinante activa si o
está glicosilada y ésta ha de ser específica, por eso se mete en células de mamíferos (elección
adecuada de la biofábrica es decir del tipo celular).
BIORREACTORES
PROCESOS UPSTREAM
Conservación de la cepa.
perfectamente catalogado.
PROCESOS DOWNSTREAM
·Llamados en general “procesamiento”, engloban todas las fases requeridas para recuperar los
productos útiles del bioproceso industrial. Son tan importantes como los anteriores.
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MOLÉCULAS RECOMBINANTES
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segunda se genera el producto, en reacciones procedentes del metabolismo intermediario.
·PRODUCTIVIDAD
·CONSTANTE DE RENDIMIENTO
·PRODUCCIÓN DE CALOR
Para obtener los rendimientos óptimos, las fermentaciones deben darse a temperatura constante.
·Los microorganismos se cultivan en primer lugar en un tubo de ensayo como cultivo de reserva
o “stock” (5-10ml), y como “cultivos de trabajo”.
·Ese primer cultivo se inocula en un matraz con 200-1000ml (cultivo en agitación para
crecimiento del inóculo).
·Posteriormente se pasa a un pequeño fermentador (10-100L): se trata del cultivo fermentador
de semilla (starters).
(1 000-100 000L).
SENSORES
Es conveniente recurrir a sensores capaces de medir una serie de parámetros físicos, químicos y
biológicos.
·Lo ideal es que los sensores estén conectados al fermentador y sean automáticos (sensores on-
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line, nos dan medidas digitales directas de lo que está pasando en el fermentador).
·sensores ex situ (en una derivación o salida del fermentador, de modo que el volumen de
·Algunos parámetros aún deben medirse “a mano” en el laboratorio a partir de una muestra
extraída de la cuba del fermentador (sensores off-line, se analiza una muestra del fermentador,
se da una medida indirecta porque no es en tiempo real).
·Motor: distribuye de forma homogénea a través su agitación mecánica todo el medio de cultivo y
toda la biomasa.
·todos los sellos del biofermentador tienen que estar estériles bloqueando la entrada de otros
microorganismo que no sean el propio del inoculo
·sonda.
·posibilidad de inyectar o sacar material de desecho dentro del biorreactor. Se usan filtros que
permiten la entrada o que bloquean la salida, son filtros de 0.22 micras porque este tamaño de
poro deja pasar aire y otras sustancias pero no deja pasar los microorganismos, permitiendo la
esterilidad.
·sensor de ph unido a un dispositivo que vierta acido o base dependiendo de como vaya el
crecimiento del microorganismo. Si es un microorganismo general, el ph 7 seria el optimo. De
modo que la sonda de ph tiene que estar midiendo constantemente el ph para añadir acido o
base en función de este. Por eso necesitamos un sensor de ph adicionado a dos válvulas: una
que adicione base y otra que adicione acido.
·Salida de agua: totalmente exterior, que no contacta directamente con el medio de cultivo
·medio de cultivo: aporta los nutrientes y la base del crecimiento de microorganismo productor
del producto BIOTECNOLÓGICO
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·distribuidor de burbujas de aire
·aire estéril para distribuir perfectamente todo el oxigeno en todo el tanque del biofermentador
·entrada de vapor, necesario para el autoclavado, para la esterilización. Este vapor permanece
unos minutos de rigor y luego sale. Permite el autoclavado del medio de cultivo.
Todos los componentes necesarios para la producción de penicilina están en los cuadritos++
Es importante controlar la homogeneidad del tanque. Esto se hace con un control a diferentes
niveles dentro del biofermentador. Con la ayuda de ventanas nos permite controlar lo que ocurre
a los distintos niveles de biofermentadores, permitiendo una monitorización de lo que está
pasando a todos los niveles. Esto se hace con un sistema de sensores a los diferentes niveles del
biorreactor porque basta con que uno de los niveles no funcione para que se arruine todo.
MEDIOS DE CULTIVO
Consiste en alterar alguna propiedad del microorganismo u otro material en suspensión, para
facilitar su separación: floculación y eventual precipitación.
El extracto de malta.
El almidón y las dextrinas pueden ser usadas por los microorganismos amilolíticos.
·Agitación
·Transferencia de calor
·Control de pH
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Tienden a hacer más efectivo el proceso, se diseñan las mejoras posibles en función de una
mejor homogeneización. A menor viscosidad, mejor separación de células.
-Inyección directa de vapor: los fermentadores industriales pueden venir preparados con las
tuberías y las válvulas necesarias para la esterilización de la vasija y de las tuberías asociadas.
-Calentamiento indirecto: se pasa vapor de agua a través de la camisa que rodea externamente al
fermentador, o a traviestan de los serpentines internos. Este tipo de procedimiento es menos
eficiente que la inyección directa de vapor. Ej: esterilización UHT: 150 grados durante 2 o 3
segundos, se genera el autoclavado durante pocos segundos y es indirecto porque no toca
directamente el medio de cultivo.
·Esterilización por flujo continuo: presenta varias ventajas, ahorra espacio, mayor ahorro de
energía, daña menos el medio de cultivo. Los procesos de tratamiento en continuo se diseñan
para lograr 3 etapas sucesivas: inyección directa de vapor y calentamiento indirecto.
Los microorganismos pueden ser GRAS y QPS pero nadie dirá que son 100% seguros.
BIOSEGURIDAD
Seguridad: calidad de seguro, libre y exento de todo daño o peligro. 100% seguro no va a ser
nunca en ningún caso en la producción.
Bioseguridad es igual a protección. Los niveles de bioseguridad se van a definir en función de ese
daño o peligro. ¿Protección para quién o de qué? Población general, medio ambiente, personal
manipulador, el propio producto terapéutico y al usuario (paciente). En este sentido se ha
evolucionado muchísimo con tratados de diferentes áreas para controlar los impactos que tiene la
manipulación de los microorganismos.
Acceso limitado, no beber, no comer. Utilizar guantes, ropas protectoras como bata, calzado
cerrado, cabello recogido. No pipetear con la boca, no oler los reactivos y materiales. Etc.
1. No producen enfermedad
NIVELES DE BIOSEGURIDAD
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·vías de exposición
NIVEL DE BIOSEGURIDAD 1
NIVEL DE BIOSEGURIDAD 2
·Trabajos con agentes de riesgo potencial moderado para el personal y el medio ambiente; puede
causar enfermedades graves, pero solo se transmite por vía sanguínea, no inhalatoria.
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gabinetes de seguridad biológica o en otros equipos de contención física.
NIVEL DE BIOSEGURIDAD 3
NIVEL DE BIOSEGURIDAD 4
·Instalaciones e infraestructuras muy complejas para trabajar con agentes peligrosos y exóticos
que poseen un riesgo individual alto de producir infecciones letales, transmitidas por aerosoles y
para las que actualmente no se cuenta con vacunas ni tratamiento.
Por ejemplo: si en el examen nos pregunta en que consiste el nivel de bioseguridad 2 pues se
utiliza cuando hay un riesgo potencial moderado de infección con ese microorganismo,siempre
por transmisión sanguínea y no por aerosoles.
De modo que está relacionado con la clasificación de los microorganismos tipo 2 pero no es lo
mismo ya que ene este caso hablamos de prevenciones que tomamos para no coger la infección.
Esquema de las salas que se usan en el nivel de bioseguridad 4 y en el 3 que éste último es
cuando trabajamos con agentes indígenas o exógenos,es decir, con microorganismos que no
están tipificados es decir, que no sabemos qué va a producir ese microorganismo. En el 4 es
cuando son muy peligrosos, exóticos, etc.
ESQUEMA. (4)
·Sala tipo D: sala normal,contacto con el exterior. Ej: la clase sería una sala tipo D.
Entre una sala y otra, normalmente el personal se esteriliza con un lavado: lluvia con agua o
gases esterilizantes. De una sala a otra, el personal se va poniendo una ropa de protección.
Es decir, en la sala C ya te pondrías más ropa de protección que en la sala D porque no hay tanto
contacto con el exterior como en la sala D.
·Sala tipo C.
·Sala B: en esta sala estaríamos muy cubiertos, el personal usa trajes que cubren todo el cuerpo
tipo buzo.
·Ailslador A: con guantes y no acceso al aislador. No es una sala en sí sino que es un aislador en
el que nosotros no estamos en contacto con el microorganismo sino que nos ponemos unos
guantes y trabajamos desde los guantes. Nosotros no estamos dentro del aislador, no tenemos
acceso al aislador.
Cuando salimos hacia fuera, el personal se va quitando la ropa estéril que se ha ido poniendo
para protegerse.
·Almacenamiento
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·Recepción de materias primas/reactivos
·Muestreo
·Ensayos
·Alicuoteado
Se controla desde el almacenamiento del material de partida hasta la validación de los ensayos.
El producto que va a al mercado se controla en los últimos lotes, haciendo un muestreo al azar en
ellos para verificar que no tiene particular microbianas, que no esta contaminado, que contiene
las unidades que dice. Se hace un recorrido y se revisa el producto a todos los efectos para
comprobar que lo que se pone en el mercado tiene ausencia de riesgos mayores o cero.
En todos los pasos ha de haber una persona responsable que garantice que se están haciendo
de forma adecuada.
La posibilidad de rastrear cada uno de los procesos o pasos que se van dando para la
produccion del producto final es en lo que consiste el control de calidad.
NORMATIVA-MÉTODOS (leer)
Normativa Nacional.
·Se conservan suficiente muestras de referencia de los materiales de partida y de los productos
para posibilitar el futuro examen.
FARMACOPEA
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de los consumidores.
2.Excipientes.
ESTÉRIL/ESTERILIDAD
La esterilidad NO puede garantizarse por análisis, esto quiere decir que siempre cabe la
posibilidad de que quede algún resto de partícula que provengan del microorganismo.
La esterilidad es lo que nos importa del producto final que ponemos a la venta.
ESTÉRIL/ESTERILIDAD
Pero sí puede contener unas trazas mínimas de microorganismo que no genere daño en el
hospedador (esto para entender).
1.detección crecimiento.
2.detección directa.
4.caracteristicas genotipicas
·Caldo de sosa e hidrolizado caseína: si quiero buscar aerobios u hongos a 20-25 grados.
La prueba debe realizarse en condiciones asépticas utilizando una cabina de flujo laminar clase A
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situada en entorno B o en un aislador.
AISLADORES
No quiero que haya contaminación ninguna con el operario para que nada del operario contamine
la terapia: presión necesaria es hacia fuera, es por tanto: negativas
Vacunas víricas
DNA recombinante
Anticuerpos
Interferón
Se hace una serie de ensayos para detectar si tengo una contaminación vírica.
Cultivo de virus
Microscopía electrónica
Detección GENÓMICA