Analisis de Las Variantes de Los Genomas Del Sars Cov 2

ANALISIS DE LAS VARIANTES DE LOS GENOMAS DEL SARS COV 2
 El coronavirus es una particula pleomórfica que contiene una ARN monocatornario de

carácter positivo
 Posee un genoma pesado debido a que cuenta con 26.4-31.7 kilobases presenta diversas
secciones de genoma ORF en toda su secuencia genética tanto en regiones codificantes
para la proteína SPIKE ,para la proteína de envoltura, para la proteína de membrana y para
la proteína de nucleocapside
 SAR COVS 2 posee una secuencia de traducción para la generación de la proteína
hemaglutinzesterasa e coronavirus consta de 29.903 bases nitrogenadad de los cuales el
genoma cuenta con regiones sin traducir sus regiones con UTR 5 prima y UTR 3 prima los
cuales no se traduce
 A lo largo de todo su genoma tiene 10 marcos de lectura para el gen URF y los restantes
tiene codificación para 26 genes mas
 El genoma viral del coronavirus contiene fragmentos de N terminal el cual se encuentra en
la proteína Spike
 La proteína Spike es la proteína más representativa del coronavirus ya que esta tiene una
potencia muy grave por las enzimas convertidoras de angiotensina 2 que este receptor es
la entrada del coronavirus hacia el organismo humano
¿Cómo se genera una variante en relación al coronavirus?
 La manera en la cual se generan las variantes son por mutaciones genéticas .Los tipos de
mutaciones genéticas son:
 Mutación sinónima
 Mutacion missensa o mutación no sinomica
 Mutación nonsense o mutación sin senido
 -mutación Frameshift o mutación en el marco de lectura
 Estas son mutaciones más frecuentes por las cuales un genoma sufre un cambio en su
estructura de traducción
Mutación sinónima
 Se refiere a que una base nitrogenada de un codón del ARNm ha sido cambiada por otra
base nitrogenada
 Este cambio de bases se llama mutación sinónima por que el cambio de bases es
bioquímicamente estructural similar a la cual sufre una mutación ejemplo AAA guanina se
cambia por una adenina AGA ,esto afecta en la lectura del marco lo cual nos hace tener
envés de una lisina una argenina sin embargo bioquímicamente tienen la misma
estructura tanto la lisina como la argenina entonces no se genera una afección en la
protcina de proteína sigue teniendo la misma funcionalidad
Mutación de missense o no sinónimas o mutación de sentido erróneo
 Cambia 2 bases nitrogenadas pero de diferente grupo es decir una purina con una
pirimidina
 Ejemplo cambia guanina por citosina
 En esta mutación se ve afectada la secuencia de los aminoácidos y esto genera una
alteración en la estructura de la proteína
Mutación nonsense o mutacion sin sentido
 Tipo de mutación que genera un codon deperada prematura genere una finalización
prematura de la transcripción
 Esta mutación puede que una proteína cambie su funcionalidad y sea defectuoso
Mutación Frameshift o mutación en marco de la lectura
 Se genera por una delección o una adición en el marco de la lectura de la traducción esto
genera que los codones cambien de posición y que exista una proteína diferente a la que
debería hacerse producido originalmente
Mutación D614
 Las secuencias encontradas es de 15.755 para llegar a este número fusión eliminando
secuencias que se rebundan, de esa manera eliminaban los falsos positivos la secuencia
del genoma de referencia que se utilizo es la NCO45-5012 está la obtuvieron en diciembre
de 2019
 Para identificar esto utilizaron serip farton,softwas 2.5 y marco de lectura abierta fono de
ORF 1 tambien se utilizo coordenadas de la proteína YP -009724389.1 se utilizo estudio 25
variantes de cambio del fotograma y la paragadama que causaban lesiones o infecciones
que estos podían detectar posibles artefactos causados por las bases indeterminadas
 Dentro de las variaciones mas comunes que encontraron fueron T3mil 37 citocinas por
timinas dándonos una mutación sinónima
 Una de las mutaciones mas relevantes es la 23.403 de Adenina-guanina en el cambio de
aminoácidos y nos a dado un gen D6146 este tiene bastate afinifaf con la proteína Skipe
llamado proteína piro es la principal para poder tener unreceptor en el AC2
 Hay 2669 mutaciones sin sentido
 1905 mutaciones sinónimas
 484 de lesiones no codificantes
 100 de lesiones en marco
 66 infecciones codificada
 36 variantes de parada obtebida
 11 de lesiones con desplazamiento de marco
 2 inserciones de marco
Comparación de los genomas secuenciados desde julio de 2020 hasta enero de 2021
 Analisis de re filogenetca se encontraron 160 genomas completos de los cuales se
encontraron que hay 3 variantes contrales que son A,B y C que se distribuyen pos los
cambio de los aminoácidos
 La variante A se subdivide en 2 grupos que se distinguen en mutación sinómica de
T29095C uno en el alelo T y otro en el alelo C
 La variante B presenta dos tipos de mutaciones en T8782C
 Mutación sininima en T8782C
 Mutación no sinónima en C28144T que genera que exista un cambio de leurina por cerina
 Variante C tiene como mutación no sinónima a 626144T que cambia la glicina por la valina
 En este análisis se estudio 1600 genomas completo donde sedescubrieron 24 nuevas
variantes de 1059 cambios de citosina-timina en la región en 5P2 de ORF1A y 25563 de
guanina-tioxina en la región de ORF3A
 Se encuentran a una alta frecuencia dentro de poblaciones con una tasa de 43%-49%
 La variante 23.403 que cambia de adenina a guanina causa cambio de aminoácido de
D61415 en la proteína de pico o SP11Le causa mayor transmisibilidad de la enfermedad
 Las variantes del genoma de SARS COV 2 a lo largo del tiempo se muestran codificaciones
genéticas protéicas los nuceótidos de ADN de citosina-guanina-adenina-timina se
muestran en 44 ubicaciones con una frecuencia alelo alternativo mayor al 1%
Variantes mas preocupante del SARS COV 2
 B.1.1.7 VARIANTE DE REINO UNIDO QUE ES UN 50 % ,AS DE TRANSMISIÓN QUE TIENE UNA
MAYOR PROBABBILIDAD de letalidad y hospitalizaciones
 B-1-351 variante sudafricana que tiene un 50% mayor de transmisión pero se neutraliza
con terapias anticuerpos monocronales
 P-1 es la variante japonesa baresilera neutraliza terapias con anticuerpos monocronales
 B-1.427 y B.1.429 VARIANTE DE ESTADOS UNIDOS DE CALIFORNIA ES UN 20% MAS DE
TRANSMISIBILIDAD

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