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Bioquímica*

Tema 4B. Bioenergética

4.2 Bioenergética (continuación):
*Papel del ATP en el metabolismo. Energía libre estándar
de la hidrólisis del ATP
*Otros compuestos fosforilados y tioésteres con variaciones
de energía libre de hidrólisis elevadas
* Mecanismo de acción de la hidrólisis del ATP

* Transformaciones entre nucleótidos

*El polifosfato inorgánico

4.3 Reacciones de óxido-reducción biológicas

*Potenciales de reducción y potenciales de reducción
estándar
* Transportadores de electrones especializados
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4.2 Bioenergética (continuación):

*Papel del ATP en el metabolismo. Energía libre estándar
de la hidrólisis del ATP

Las dos grandes vías del metabolismo celular, catabolismo y anabolismo, están
necesariamente conectadas a través de moléculas con funciones muy definidas. Por un
lado las vías se conectarán a través de moléculas transportadoras de energía (ciclo del
ATP); pero, además, existe una clara conexión con moléculas encargadas de la
transferencia de electrones. En las dos vías metabólicas se producen reacciones de
oxidación-reducción: en la vías catabólicas, donde se realizan reacciones de oxidación,
los electrones se irán cediendo a moléculas oxidadas que, a su vez, se irán reduciendo; y
en las vías anabólicas, las moléculas irán captando los electrones de estas moléculas
reducidas.

La principal molécula transportadora de energía es el ATP, y las moléculas

transportadoras de electrones serán nucleótidos corno el NADH y el NADHP. Estas
moléculas se conocen corno coenzimas. Existen muchas coenzimas encargadas de
transportar grupos funcionales como el acetilo, el metilo, etc.

Para entender por qué la hidrólisis del ATP es tan exergónica, deben considerarse varios
factores.

1.*Para los valores característicos de pH intracelular, la unidad trifosfato del ATP lleva
tres o cuatro cargas negativas que se repelen entre sí. La hidrólisis del ATP
reduce la repulsión electrostática.

2.*Debido a la estabilización por resonancia, los productos de la hidrólisis son más

3.*Los productos hidrolizados del ATP, bien ADP y Pi, o bien AMP y PPi, se solvatan

4.*Ocurre un incremento del desorden causado por un aumento en el número de

moléculas. El ATP se convierte en dos moléculas (ADP y Pi) y las dos se
mueven ahora al azar.
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Los bioquímicos escriben las ecuaciones metabólicas de forma simplificada, hecho que
es especialmente evidente en las reacciones que las que interviene el ATP. Los
compuestos fosforilados pueden existir en diversos estados de ionización y las
diferentes especies pueden unir Mg2+. Por ejemplo, a pH 7,0 y Mg2+ 2mM, el ATP
puede existir en las formas ATP4-, HATP3-, H2ATP2-, MgHATP- y Mg2ATP. Sin
embargo, al pensar acerca del papel biológico del ATP no siempre estamos interesados
en todo este detalle, por lo que consideramos el ATP como una entidad constituida por
una suma de especies; así pues, escribimos su hidrólisis con la ecuación bioquímica

ATP + H2O ⇒ ADP + Pi

en donde ATP, ADP y Pi son sumas de especies

La variación de energía libre para la hidrólisis del ATP es -30,5 kJ/mol en condiciones
estándar, pero la energía libre real de hidrólisis (ΔG) del ATP en las células vivas es
muy diferente: las concentraciones celulares de ATP, ADP y Pi no non idénticas y son
mucho menores que las concentraciones estándar 0,1M. Además el Mg2+ del citosol se
une al ATP y al ADP y en la mayoría de las reacciones enzimáticas en las que
interviene el ATP como dador de grupo fosforilo, el verdadero sustrato es MgATP2- . La
ΔG´0 pertinente es por lo tanto la de la hidrólisis del MgATP2- . Puede calcularse de ΔG
para la hidrólisis del ATP a partir de los datos de la tabla. La energía libre de hidrólisis
real de ATP en las condiciones intracelulares se la llama a menudo potencial de
fosforilación ΔGp.
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*Otros compuestos fosforilados y tioésteres con

variaciones de energía libre de hidrólisis elevadas
La tendencia del ATP a hidrolizarse, que también se denomina potencial
de transferencia de grupos fosforilo, no es única. Diversas biomoléculas
pueden transferir grupos fosfato a otros compuestos. En el cuadro se
proporcionan varios ejemplos importantes
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Los compuestos fosforilados con valores de hidrólisis'ΔG´0 muy negativos poseen

potenciales de transferencia de grupos fosforilo más elevados que aquellos compuestos
con valores negativos más pequeños. Dado que el ATP tiene un potencial medio de
transferencia de grupos fosforilo, puede ser un transportador intermediario de grupos
fosforilo de compuestos de energía más elevada, como el fosfoenolpiruvato, a
compuestos de baja energía. De ahí que el ATP sea la “moneda energética” de los
sistemas vivos, debido a que las células usualmente transfieren el fosfato acoplando
reacciones a la hidrólisis del ATP.

Las células contienen otros metabolitos con energías libres de hidrólisis grandes y
negativas: fosfoenolpiruvato, 1,3-bisfosfoglicerato, fosfocreatina. Como el ATP,
tienen un elevado potencial de transferencia del grupo fosforilo. Los tioésteres también
tienen elevadas energías libres de hidrólisis

Hidrólisis del fosfoenolpiruvato (PEP).

Esta reacción catalizada por la piruvato quinasa va seguida de la tautomerización espontánea del
producto, el piruvato. La tautomerización no es posible en el PEP, por lo que los productos de
hidrólisis están estabilizados en relación a los reactivos. También tiene lugar la estabilización
por resonancia del Pi

Hidrólisis del 1,3.bisfosfoglicerato

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El producto directo de la hidrólisis es el ácido 3-fosfoglicérico, que posee un grupo ácido

carboxílico sin disociar, pero la disociación se produce inmediatamente. Esta ionización y las
estructuras resonantes que hace posibles estabilizan el producto con relación a los reactivos. La
estabilización por resonancia del Pi también contribuye a la variación de energía libre negativa.

Hidrólisis de la fosfocreatina.

La rotura del enlace P—N de la fosfocreatina produce creatina, que está estabilizada por la
formación de un híbrido de resonancia. El otro producto, Pi, también está estabilizado por
resonancia.

Energía libre de hidrólisis de los tioésteres y los ésteres de oxígeno.

Los productos de ambos tipos de reacciones de hidrólisis tienen aproximadamente el

mismo contenido de energía libre, pero el tioéster tiene un contenido de energía libre
superior a la del éster de oxígeno. El solapamiento de orbitales entre los átomos de O y
C permite la estabilización por resonancia en los ésteres de oxígeno, pero el
solapamiento de orbitales entre los átomos de S y C no es tan bueno, y tiene lugar poca
estabilización por resonancia
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* Mecanismo de acción de la hidrólisis del ATP

La hidrólisis directa del ATP es la fuente de energía en procesos que son impulsados
por cambios de conformación pero, generalmente, no es la hidrólisis del ATP sino la
transferencia de un grupo fosforilo, pirofosforilo o adenililo del ATP al sustrato o al
enzima la que acopla la energía de rotura del ATP a transformaciones endergónicas de
sustratos.

Las reacciones del ATP son generalmente desplazamientos nucleofílicos Sn2 en los que
el nucleófilo puede ser, por ejemplo, el oxígeno de un alcohol o carboxilato o un
nitrógeno de la creatina o de la cadena lateral de la arginina o histidina. Cada uno de los
tres fosfatos del ATP es susceptible de ataque nucleofílico y cada posición de ataque
conduce a un tipo diferente de producto.

Cualquiera de los tres átomos de P (α, β o γ ) puede servir como diana electrofílica
para un ataque nucleofílico, en este caso por el nucleófilo marcado R18 0: El nucleófilo
puede ser un alcohol (ROH), un grupo carboxilo (RCOO_), o un fosfoanhídrido (un
nucleósido mono- o difosfato, por ejemplo)

(a) Cuando el oxígeno del nucleófilo ataca la posición γ, se marca el oxígeno enlazante
del producto, lo que indica que el grupo transferido desde el ATP es un fosforilo (—
PO32-), no un fosfato (—OPO32-).

(b) El ataque sobre la posición p desplaza AMP y conduce a la transferencia de un

grupo pirofosforilo (no pírofosfato) al nucleófilo.

(c) El ataque sobre la posición a desplaza PPi y transfiere el grupo adenililo al

nucleófilo.
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* Transformaciones entre nucleótidos

Aunque nos hemos centrado en el ATP como moneda energética celular y dador de
grupos fosforilo, los otros nucleósido trifosfatos (GTP, UTP y CTP) y todos los
desoxinucleósido trifosfatos (dATP, dGTP, dTTP y dCTP) son energéticamente
equivalentes al ATP. Los cambios de energía libre estándar asociados con la hidrólisis
de sus enlaces fosfoanhídrido son casi idénticos a los del ATP. En preparación para sus
diversos papeles biológicos, estos otros nucleótidos se generan y mantienen en forma de
nucleósido trifosfato (NTP) por transferencia de grupos fosforilo a los correspondientes
nucleósido difosfatos (NDP) y monofosfatos (NMP).

Las transferencias de grupo fosforilo desde el ATP provocan la acumulación de ADP;

por ejemplo, cuando el músculo se contrae fuertemente, el ADP se acumula e interfiere
con la contracción dependiente de ATP. En períodos de demanda intensa de ATP, la
célula disminuye la concentración de ADP, al tiempo que adquiere ATP, mediante la
reacción de la adenilato quinasa:

Esta reacción es completamente reversible, de forma que cuando cesa la demanda

intensa de ATP el enzima puede reciclar también AMP convirtiéndolo en ADP, el cual a
continuación puede fosforilarse a ATP en la mitocondria
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*El polifosfato inorgánico

Es un polímero lineal compuesto de muchas decenas o centenas de residuos Pi unidos
a través de enlaces fosfoanhídrido. Este polímero, presente en todos los organismos,
puede acumularse en grandes cantidades en algunas células

Un papel potencial del PoliP es el de fosfágeno, una reserva de grupos fosforilo que se
puede utilizar para generar ATP, de la misma manera que se utiliza la creatina fosfato
en el músculo. El poliP tiene aproximadamente el mismo potencial de transferencia de
grupos fosforilo que el PPi.

4.3 Reacciones de óxido-reducción biológicas

*Potenciales de reducción y potenciales de reducción
estándar:
La transferencia de grupos fosforilo es una de las características centrales del
metabolismo. De igual importancia es otro tipo de transferencia, la transferencia de
electrones en las reacciones de oxidación-reducción. Estas reacciones implican la
pérdida de electrones por una especie química, que es así oxidada, y la ganancia de
electrones por otra, que es reducida. El flujo de electrones en las reacciones de
oxidación-reducción es responsable, directa o indirectamente, de todo el trabajo
realizado por los organismos vivos.
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El carbono aparece en las células vivas en diversos y diferentes estados de oxidación .

Cuando un átomo de carbono comparte un par de electrones con otro átomo
(típicamente H, C, S, N u O), lo comparten de manera desigual en favor del átomo más
electronegativo. El orden de electronegatividad creciente es H < C < S < N < O.

En términos muy simplificados, pero útiles, los electrones enlazantes que se comparten
con otro átomo “pertenecen” al átomo más electronegativo. Por ejemplo, en el metano
(CH4), el carbono es más electronegativo que los cuatro hidrógenos a que está unido, y
por lo tanto los ocho electrones enlazantes “pertenecen” al átomo de C.

En el etano, los electrones del enlace C—C son compartidos por igual, de forma que a
cada átomo de carbono le “pertenecen” sólo siete de sus ocho electrones enlazantes. En
el etanol, el C-1 es menos electronegativo que el oxígeno al que está unido, y por tanto
los dos electrones del enlace C— O “pertenecen” al átomo de O, dejando al C-1 con
sólo cinco electrones enlazantes.

Con cada pérdida formal de electrones enlazantes “propios”, el átomo de carbono ha

sufrido una oxidación, incluso cuando no interviene ningún oxígeno, como en la
conversión de un alcano a un alqueno. En este caso, la oxidación (pérdida de electrones)
coincide con la pérdida de hidrógeno.

En los sistemas biológicos, la oxidación es a menudo sinónimo de deshidrogenación, y

muchos enzimas que catalizan reacciones de oxidación son deshidrogenasas.
Obsérvese que los compuestos más reducidos del cuadro son más ricos en hidrógeno
que en oxígeno, mientras que los compuestos más oxidados (abajo) tienen más oxígeno
y menos hidrógeno.
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Los potencíales de reducción son una medida de la afinidad por los electrones:

Cuando en una solución se encuentran conjuntamente dos pares redox conjugados, se

puede producir espontáneamente la transferencia de electrones desde el dador de
electrones de un par al aceptor de electrones del otro. La tendencia a que tenga lugar tal
reacción depende de la afinidad relativa del aceptor de electrones de cada par redox por
los electrones. El potencial de reducción estándar, E0, es una medida (en voltios) de
esta afinidad. La semi reacción estándar es:

Los potenciales de reducción estándar permiten el cálculo de la variación de

energía

Los electrones tienen tendencia a fluir en dirección a la semicelda con el E más

positivo, y la fuerza de esta tendencia es proporcional a la diferencia en los potenciales
de reducción, ΔE. La energía disponible por este flujo espontáneo de electrones (la
variación de energía libre, ΔG, para la reacción de oxidación-reducción) es proporcional
ΔE:

Con esta ecuación es posible calcular la variación de energía libre real para cualquier
reacción de oxidación-reducción a partir de los valores de E´0 de una tabla de
potenciales de reducción y la concentración de las especies que intervienen en la
reacción.
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* Transportadores de electrones especializados

La multitud de enzimas que catalizan las oxidaciones celulares canalizan los electrones
desde centenares de sustratos diferentes a sólo unos cuantos tipos de transportadores
universales de electrones. La reducción de estos transportadores en los procesos
catabólicos permite la conservación de la energía libre que se produce en la oxidación
de los sustratos. El NAD+, NADP+, FMN y FAD son coenzimas hidrosolubles que
experimentan oxidación y reducción reversibles en muchas de las reacciones de
transferencia de electrones del metabolismo. Los nucleótidos NAD+ y NADP+ se
trasladan fácilmente de un enzima a otro; los nucleótidos de flavina FMN y FAD están
normalmente muy fuertemente unidos a los enzimas, denominados flavoproteínas, en
los que actúan de grupo prostético

'
El NADH y el NADPH actúan con las deshidrogenasas como
transportadores solubles de electrones

'
El nicotinamida adenina dinucleótido (NAD; NAD+ en su forma oxidada) y su análogo
próximo, el nicotinamida adenina dinucleótido fosfato (NADP; NADP+ en su forma
oxidada) están compuestos por dos nucleótidos unidos a través de sus grupos fosfato
por un enlace fosfoanhídrido. Debido a que el anillo de nicotinamida se parece a la
piridina, a estos compuestos se los denomina a veces nucleótídos de piridina.

El nicotinamida adenina dinucleótido (NAD+) y su análogo fosforilado NADP+ se

reducen a NADH y NADPH, aceptando un ión hidruro (dos electrones y un protón) a
partir de un sustrato oxidable. El ión hidruro se puede adicionar en la parte frontal (cara
A) o posterior (caraB) del anillo plano de la nicotinamida.
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Los nucleótidos de flavina están fuertemente unidos en las

flavoproteínas
Las flavoproteínas son enzimas que catalizan reacciones de oxidación-reducción
utilizando flavina mononucleótido (FMN) o flavina adenina dinucleótido (FAD) como
coenzima. Estos coenzimas, los nucleótidos de flavina, provienen de la vitamina
riboflavina. La estructura de anillos fusionados de los nucleótidos de flavina (el anillo
isoaloxazina) se reduce de manera reversible, aceptando uno o dos electrones en forma
de uno o dos átomos de hidrogeno (cada átomo consiste en un electrón más un protón)
desde un sustrato reducido. Las formas completamente reducidas se abrevian FMNH2 y
FADH2. Cuando un nucleótido de flavina totalmente oxidado acepta solo un electrón
(un átomo de hidrógeno), se produce la forma semiquinona del anillo de isoaloxazina,
abreviada FADH* y FMNH*. Debido a que los nucleótidos de flavina tienen una
especialidad química algo diferente de la de los coenzimas de nicotinamida (la
capacidad de participar tanto en transferencias de uno como de dos electrones), las
flavoproteínas intervienen en una mayor variedad de reacciones que las deshidrogenasas
ligadas a NAD(P)

El FMN consiste en la estructura que se muestra por encima de la línea a trazos del
FAD (forma oxidada), los nucleótidos de flavina aceptan dos átomos de hidrógeno (dos
electrones y dos protones}, que aparecen ambos en el sistema anular de la flavina.
Cuando el FAD o el FMN aceptan un solo átomo de hidrógeno, se forma la
semiquinona que es un radical libre estable.
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