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001 Retrocruzamiento en El MJ V2

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Nº 40

OCTUBRE 2018
IBÉRICO
CERDO

AECERIBER
Raza, genética y reproducción
MINISTERIO
DE AGRICULTURA, PESCA,
Y ALIMENTACIÓN

Programa de recuperación por


retrocruzamiento y conservación
de la variedad de cerdo ibérico
Manchado de Jabugo

INTRODUCCIÓN se han ido incorporando otros


1 2, 3*
Forero J. , Gómez M. M. , para mejorar parámetros como el
Venegas M.1, Landi V.2, 3, Martínez de retrocruzamiento que trata de
A.M.2, 3 y Delgado J.V.3

L
a variedad de cerdo Ibérico superar la fuerte consanguinidad
1
Diputación de Huelva. Huelva,
Manchado de Jabugo (MJ) que existía como consecuencia de
España. tiene su origen a finales del la escasez de ejemplares (www.a-
2
Animal Breeding Consulting S.L. siglo XIX en el término municipal
Córdoba, España. grodiariohuelva.es, 2016).
3 de dicha población onubense con
Departamento de Genética,
Facultad de Veterinaria. la participación, entre otros, de
Universidad de Córdoba, España. cerdos ibéricos rubios y negros de Sin embargo, su situación
la zona. En la actualidad se censal actual hizo que la
encuentra catalogada en peligro Diputación de Huelva y la
de extinción (Forero, 1999). Universidad de Córdoba firmaran
Tradicionalmente está vinculada el proyecto titulado “Puesta en
al área de dehesa del suroeste de marcha del Programa de
la península Ibérica, aunque con R e c u p e r a c i ó n p o r
expansión en los últimos años a Retrocruzamiento y Conservación
otras zonas de España. Es un de la variedad de Cerdo Ibérico
animal rústico que aprovecha muy Manchado de Jabugo”. En este
bien las montaneras y que es proyecto se plantearon dos
capaz de proporcionar paletas y acciones específicas: una cuyo
jamones de gran aceptación. objetivo es la conservación de la
variedad del cerdo Ibérico
Manchado de Jabugo en pureza y
El programa de conserva- otra la recuperación de esta
ción del Manchado de Jabugo variedad tan amenazada median-
sigue abierto y, de forma paralela, te retrocruzamientos.

Contacto: jforero@diphuelva.org. Avda. Martín Alonso Pinzón, 9. Telf. 959 494 600

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Lechones de la 1ª generación Descendencia de la 3ª generación

Un retrocruzamiento se refiere al Se analizaron 93 muestras de pelo


cruce de un descendiente híbrido de de animales nacidos entre el año 2013 y
primera generación con uno de los padres 2017 y pertenecientes a las fincas Las
o con un genotipo idéntico al paterno, en Peñasquillas y Huerto Ramírez. La
este caso sería de animales puros de extracción del DNA se ha realizado con el
Manchado de Jabugo y animales de la método de Kawasaki (1990). Un panel de
estirpe Villalón (Vill). 25 microsatélites específicos de la espe-
cie porcina fueron establecidos de acuer-
do a las recomendaciones de la FAO y de
Esta estirpe tiene su origen a
la Sociedad Internacional de Genética
principios del siglo XX a partir del cruce
Animal (ISAG). Se analizaron mediante la
entre verracos retintos portugueses y
técnica de la reacción en cadena de la
hembras retintas extremeñas, surge así el
polimerasa (PCR) y la separación por
denominado “retinto mejorado” del cual se
tamaños de los fragmentos obtenidos se
originará de manera directa, por selección
ha realizado mediante una electroforesis
en núcleo cerrado, la estirpe Villalón
en gel de poliacrilamida en un secuencia-
(Clemente y cols., 2006).
dor automático ABI 377XL (Applied
Biosystems, Foster City, CA, USA). El
El objetivo de este estudio fue análisis de los fragmentos y la tipificación
utilizar los retrocruzamientos con la alélica se ha realizado mediante los
estirpe Villalón, una estirpe filogenética- programas informáticos Genescan
mente próxima para incrementar los Analysis 3.1.2 y Genotyper 2.5, respecti-
tamaños real y efectivo del Manchado de vamente.
Jabugo y a través del uso de marcadores
moleculares hacer un seguimiento de la
Análisis estadístico
integración de los animales retro-
absorbidos en la población original.
Se calcularon la Heterocigosidad
esperada y observada y el número de
MATERIAL Y MÉTODOS alelos mediante la extensión MS Tools del
programa EXCEL (Park, 2001). Se
Muestreo comparan los resultados con los encontra-
dos en otras líneas/variedades del Ibérico:

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Villalón, Dorado gaditano, Retinto, les. Esta probabilidad es en realidad la


Entrepelado, Torbiscal, Lampiño y distribución posterior de cada porcentaje
Manchado de Jabugo. Los animales de de genoma que proviene de las poblacio-
Manchado de Jabugo analizados en este nes ancestrales y es calculada aplicando
proyecto se incorporan a la población de un enfoque bayesiano utilizando técnicas
referencia de Manchado de Jabugo de la MCMC (Monte Carlo Markow Chain). Este
base de datos del Grupo de Investigación procedimiento presenta como ventajas
PAI-AGR-218 del Departamento de más destacables el no requerir especificar
Genética de la Universidad de Córdoba. las frecuencias alélicas de las poblaciones
Además, se incluyeron razas comerciales ancestrales y el permitir tener en cuenta
como son: Duroc, Pietrain, Large White y situaciones genéticas complejas, incluyen-
Landrace. Se calcularon las distancias do el caso de muestras que provienen de
genéticas DA de Nei (Nei y cols., 1983) y se mezcla entre varias poblaciones. Para
construye un árbol de distancias con el realizar este estudio se utilizará la base de
programa Populations (Langella, 1999). El datos del Laboratorio de Genética molecu-
árbol se dibuja mediante la utilización del lar Aplicada que contiene todas las posi-
programa Treeview (Page, 1996). bles poblaciones ancestrales que podrían
haber contribuido en la conformación del
genoma de los animales estudiados. Se
La asignación individual de cada
realiza un análisis en los que se tienen en
animal a una raza se realiza utilizando el
cuenta las siguientes líneas/variedades
programa STRUCTURE (Pritchard y cols.,
del Ibérico: Retinto del Andévalo, Villalón,
2000) que se basa en un método no
Dorado gaditano, Retinto, Entrepelado,
supervisado que asume situación de
Torbiscal, Lampiño y Manchado de
equilibrio de Hardy-Weinberg para las
Jabugo. Se introducen también otras razas
frecuencias de los alelos, estimando para
porcinas como Duroc, Pietrain, Large
cada individuo incluido en el análisis la
White, Landrace y un cruce comercial
probabilidad de que pertenezca a cada una
Landrace x Large White.
de las poblaciones consideradas ancestra-

Figura 1. Cruzamientos entre los ejemplares puros de Manchado de Jabugo (MJ) y animales de la estirpe
Villalón (Vill).

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Tabla 1. Progresión esperada de la absorción por retrocruzamiento entre el Manchado de Jabugo y el Villalón.

Retrocruzamiento valores de asignación individual por los


ejemplares analizados, teniendo así
información que ha permitido planificar de
Como se muestra en la Figura 1, forma objetiva los cruzamientos entre las
se utilizaron los retrocruzamientos con la dos variedades próximas genéticamente.
variedad Villalón, estirpe filogenéticamen-
te próxima al Manchado de Jabugo para
incrementar el tamaño real y efectivo de la Un pedigrí bien estructurado y la
población. inclusión permanente de los animales
más próximos a la línea pura MJ garanti-
zaran la supervivencia de la raza. En la
Si los cruzamientos se realizan Figura 2, se observa la evolución de la
según los resultados obtenidos en la información molecular respecto a los
asignación individual la progresión coeficientes de asignación individual se
“teórica” o “esperada” de la absorción por refiere. Esta tendencia positiva es resulta-
retrocruzamiento en el pedigrí sería como do de la aplicación correcta de los resulta-
se muestra en la Tabla 1. dos en campo por parte de los ganaderos,
produciéndose un éxito para la conserva-
RESULTADOS Y DISCUSIÓN ción de esta variedad tan emblemática del
cerdo ibérico como es el Manchado de
Jabudo.
La Diputación de Huelva junto al
Grupo PAIDI AGR218 de la Universidad
de Córdoba vienen trabajando conjunta-
mente en la recuperación de una variedad
tan importante en el sector porcino como
es el Manchado de Jabugo. Uno de los
objetivos perseguidos fue la mejora de la
cantidad y calidad de información genea-
lógica que será empleada posteriormente
en la planificación de los apareamientos
dirigidos. Desde la firma del proyecto de
investigación, transcurridos ya 5 años,
cada anualidad se ha ido recopilando toda
la información genealógica generada y los
Figura 2. Evolución del porcentaje de asignación a Manchado de Jabugo (MJ).

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Tabla 2. Poblaciones estudiadas, tamaño de la muestra (N), Heterocigosidad esperada (He), Heterocigosidad
observada (Ho), Número medio de alelos (NMA) y sus desviaciones estándar (SD).

Por otro lado, no debemos olvidar el La variabilidad genética en los


mantenimiento de la diversidad genética animales de la estirpe MJ x Vill de la 3ª a la
de la población, por ello cada año se 5ª generación es inferior a la encontrada
analizaba y evaluaba estadísticamente los en la línea pura Villalón (0,438), con
resultados moleculares obtenidos. En la niveles de Heterocigosidad observada
Tabla 2 se muestran los principales indica- inferiores (0,383). Sin embargo, son
dores de la diversidad genética en las superiores a los hallados en el Manchado
distintas poblaciones incluidas en el de Jabugo puro de la población de referen-
estudio. cia. Con respecto al resto de las varieda-
des y razas incluidas en el estudio, esta
estirpe presenta valores inferiores a las
Para los 25 microsatélites analiza-
demás líneas/variedades de cerdo Ibérico
dos, un promedio de 4,66 alelos son
introducidas en el estudio, a excepción del
detectados en los 707 individuos de las 14
Retinto del Andévalo que presentó una Ho
poblaciones estudiadas, un valor más bajo
de 0,242. Por otro lado, haciendo una
(5,14) del observado por Gama y cols.,
comparativa entre los resultados observa-
(2013) aunque en el estudio se incluyen
dos en la estirpe MJ x Vill se aprecia un
razas de toda la península Ibérica, sin
descenso de los niveles de variabilidad de
embrago en línea con lo encontrado por
los animales a partir de la 3ª generación
Martínez y cols., (2000) en un estudio con
con respecto a los animales de la 1ª y 2ª
todas las variedades el cerdo Ibérico. La
generación. Aunque los valores de variabi-
media de la heterocigosidades esperada y
lidad genética como el número de alelos y
observada en la estirpe MJ x Vill fueron de
la heterocigosidad observada son bajos
0,457±0,05 y 0,479±0,02, respectivamen-
hay que considerar que se están compa-
te. Mientras que para el resto de las
rando variedades de una raza, que por el
poblaciones fue de 0,530±0,04 y
solo efecto muestreo aportan un valor bajo,
0,502±0,02, respectivamente.
pero siempre en línea con lo observado en

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otras razas locales de cerdos. El hecho


que el retro cruce vuelva a valores bajos
de estos parámetros era de esperarse en
cuanto se va sustituyendo el genoma de la
raza.

En la Figura 3 se observan las


relaciones genéticas entre las poblacio-
nes estudiadas, en ella se identifican dos
clústeres. El primer clúster observados
corresponde al grupo de las razas del
tronco Ibérico que comparten un origen
común y su distribución geográficamente
cerca, mientras en el otro cluster se ubican
las razas comerciales. Dentro del grupo
de los Ibéricos en este dendrograma se Figura 3. Árbol de distancias genéticas entre las 14 poblaciones porcinas.
observa como la estirpe MJ x Vill ocupa
una posición muy próxima a la línea pura ancestrales inferidas fueron K=2 hasta el
Manchado de Jabugo, alejándose de la K=15 con un total de 10 repeticiones para
otra línea de la que procede (Villalón). cada valor de K. Utilizando la prueba de
Evano y cols., (2005) se determinó que el
K=6 es el número más probable de
Como era de esperarse, el poblaciones ancestrales que contribuyen
Manchado de Jabugo y su cruce con la a la variabilidad genética observada en las
variedad Villalón se sitúan en la misma 14 poblaciones observadas (Figura 4). Se
rama del árbol a una distancia genética muestran en la Figura 4, los animales de
muy baja, pero el dato más importante que la estirpe MJ x Vill se agrupan junto a los
refleja este análisis es que todos los Manchados de Jabugo puros y solo
individuos utilizados convergen dentro del algunos animales de la primera y segunda
agrupamiento de las variedades ibéricas generación muestran signos de los cruces
subrayando su pureza genética, entendi- de las variedades Manchado de Jabugo
da como ausencia de cruce con animales (en naranja) y Villalón (amarillo), aunque
de razas mejorantes (Duroc, etc.). estos individuos muestran diversas
proporciones de ambas líneas (Tabla 3).
El enfoque Bayesiano implementa-
do por el programa STRUCTURE fue Por otro lado, algunos animales
usado para estimar el número más están compuestos por líneas de color
probable de poblaciones subyacentes a la verde (Duroc) y Azul (Pietrain). Esto
diversidad genética observada (Gama y puede deberse a la presencia de animales
cols., 2013). El número de poblaciones que contienen un porcentaje de genoma

Figura 4. Representación gráfica de los resultados del análisis de la estructura genética de 14 poblaciones
porcinas (1, Estirpe Manchado x Villalón; 2, Manchado de Jabugo; 3, Villalón; 4, Torbiscal; 5, Retinto del
Andévalo; 6, Dorado gaditano; 7, Retinto; 8, Entrepelado; 9, Lampiño; 10, Duroc; 11, Pietrain; 12, Landrace; 13,
LargeWhite y 14 Landrace x Large White).

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Tabla 3. Resultados de asignación individual de los animales de la estirpe Manchado de Jabugo x Villalón.

de estas razas ocasionado probablemente asignan a Manchado de Jabugo con


a un cruce lejano. Por lo tanto, esta herra- valores similares a los presentados por los
mienta no solo nos permite monitorear la animales Manchado de Jabugo puros. Lo
composición genómica del retrocruce sino mismo sucede en los animales de la 4ª y 5ª
también a detectar individuos cuya “pure- generación: genéticamente pueden
za” genética obliga a una utilización más considerarse animales Manchado de
atenta en el plan de conservación del MJ. Jabugo puros.

Los valores de asignación indivi- Estos mismos resultados de forma


dual, expresados en porcentaje, de cada gráfica se presentan en la Figura 5. Se
uno de los animales analizados se encuen- observa cómo los valores de asignación
tran en la Tabla 3. Los animales de la individual van aumentando y se van
primera generación presentan valores muy estabilizando, alcanzándose porcentajes
dispares de manera que algunos se próximos al 100%.
asignan a la variedad Manchado de
Jabugo con valores elevados (91,60%)
CONCLUSIONES
mientras que otros presentan valores muy
bajos (4,30%). En la segunda generación
los valores son en general más elevados, Estos resultados muestran que los
aunque sigue habiendo animales con animales Manchado de Jabugo x Villalón
porcentajes de asignación reducidos. Sin sometidos a retrocruces con Manchado de
embargo, los animales de la tercera Jabugo se podrían integrar en la población
generación de retrocruzamientos se pura de Manchado de Jabugo a partir de la
tercera generación. Con el
desarrollo de este proyecto se
ha conseguido aumentar el
tamaño real y efectivo de la
población, garantizando su
supervivencia y minimizando
al máximo su erosión genéti-
ca.

Figura 5. Representación gráfica de los resultados de asignación individual de los animales de la


estirpe Manchado de Jabugo x Villalón.

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