Regulacin gnica en

eucariotes

Hay diversos motivos por los que la regulacin gnica en eucariotas es

mas compleja que en procariotas:
1.Contienen mucha mas informacin gentica.
2.Su DNA esta completado con histonas y otras protenas para formar la
cromatina; esta es el principal interruptor de la regulacin gnica
dependiendo del estado de condensacin en el que se encuentre.
3.Contienen la informacin gentica contenida en muchos cromosomas.
4.La informacin gentica esta separada del citoplasma, por lo que la
transcripcin esta separada de la traduccin tanto temporal como
espacialmente.
5.El RNAm eucariotico tiene una vida media mucho mas larga, lo que le
brinda mayor estabilidad; pero debido a esto se utilizan mas controles
de la traduccin.
6.La mayora de los eucariotas son pluricelulares con tipos celulares
diferenciados. Los distintos tipos celulares utilizan diferentes conjuntos
de genes para hacer protenas diferentes, a pesar de que cada clula

La organizacin de los cromosomas en el ncleo influyen en la expresin

gnica, ya que los mecanismos estructurales determinan si un gen se
expresara o no.
En el ncleo interfasico cada cromosoma ocupa un dominio denominado
territorio cromosmico, que lo separan de otros cromosomas.
Los cromosomas se organizan en el ncleo segn su tamao y su
densidad gnica, de manera que los cromosomas con menos genes se
localizan en la periferia y los genes con mayor densidad gnica en la
Los canales entre cromosomas
parte mas interna.
se
denominan
compartimentos
intercromosmicos,

los

cuales pueden contener muy

poco DNA o no contener.

La estructura de los cromosomas se reajusta continuamente de

manera que los genes transcripcionalmente activos se desplazan
hasta el borde de los territorios cromosmicos, en la frontera de
los canales de los dominios intercromosmicos.
Cuando el gen se ha desplazado al extremo del territorio
cromosmico, la iniciacin de la expresin gnica requiere 2
pasos:
1 la remodelacin y la activacin de la cromatina por enzimas que
alteran la estructura de los nucleosomas, lo que hace los sitios
promotores queden accesibles a la maquinaria transcripcional.
2 el reclutamiento de coactivadores que ensamblan las protenas
necesarias

para

la

transcripcin

que

transcripcin generales y la RNA pol II.

incluyen

factores

de

Es un proceso complejo
Iniciacin de la transcripcin

Regulado que implica diferentes tipos de

secuencias de DNA
La interaccin de mas de 100 protenas
La remodelacin de la cromatina

Principal forma de regulacin gnica

El plegamiento y la formacin de lazos de

las secuencias de DNA

Genes eucarioticos, tienen 3

Promotores

secuencias reguladoras en cis

Silenciadores

que controlan la transcripcin:

Intensificadores

Promotores
Son secuencias nucleotdicas que sirven de punto de reconocimiento para la
maquinaria transcripcional.
Es la regin necesaria para iniciar la transcripcin.
Ubicada adyacente a los genes que regulan.
Tiene varios cientos de nucletidos de longitud y especifican el sitio en el que
empieza la transcripcin y su direccin a los largo del DNA.
Contiene varios elementos, que incluyen las cajas TATA, CAAT y GC.
La regin a la que se une la RNA pol II es una secuencia denominada caja
TATA o ncleo del promotor. Se localiza a unas 25-30 bases corriente arriba
del punto inicial de transcripcin. Esta se encuentra formada por una
secuencia consenso de 7-8 pares de bases de AT, a menudo flanqueada por
ambos lados de secuencias GC.
Una mutacin en esta caja reduce la transcripcin y las delecciones pueden
alterar el punto de inicio de la transcripcin.

Caja CAAT o CCAAT

Las contienen muchas regiones promotoras
Se localiza frecuentemente en la regin de 70 a 80 pb corriente arriba del
sitio de inicio de la transcripcin.
El anlisis mutacional sugiere que estas cajas son los sitios donde las
protenas se unen al DNA y son esenciales para la capacidad del promotor
de facilitar la transcripcin.

Caja GC
Su secuencia consenso es GGGCGG y a menudo se encuentra,
aproximadamente en la posicin - 110

Los elementos CAAT y GC se unen a los factores de transcripcin

y funcionan de manera parecida a los intensificadores

Intensificadores
Son secuencias de DNA
Pueden estar en cualquier lado del gen, a cierta distancia del mismo e incluso dentro
de el.
Son reguladores en cis por que se encuentran adyacentes a los genes que regulan.
Interaccionan con mltiples protenas reguladoras y con factores de transcripcin y
pueden incrementar la eficiencia de la iniciacin de la transcripcin y activar el
promotor. Poseen diversas caractersticas que los distingue de estos ltimos:
1.Su posicin no es fija; pueden estar corriente arriba, abajo o dentro del gen que
regulan.
2.Puede invertirse su orientacin sin producir efectos significativos en su accin.
3. si experimentalmente se mueve un intensificador a otra posicin del genoma, o si
un gen no relacionado se coloca cerca del intensificador, se intensifica la
transcripcin del gen adyacente.

Un ejemplo es el intensificador localizado dentro del gen que regula la cadena

pesada de las inmunoglobinas, especficamente en un intron entre 2 regiones
codificantes. Es un gen activo solo en las clulas que expresen los genes de las
inmunoglobinas, lo que indica la expresin gnica especifica del tejido.
El gen B-globina humana y el de la timidina-quinasa de pollo tienen
intensificadores ubicados corriente abajo. En el pollo hay un intensificador situado
entre los genes de la B-globina y de la E-globina que actan en una direccin para
controlar la transcripcin del gen E- globina durante el desarrollo embrionario y en
la direccin opuesta para regular la expresin del gen de la B-globina durante la
vida adulta

Por el contrario las secuencias promotoras son esencial para el nivel de

transcripcin basal, mientras que los intensificadores son esenciales para lograr
el mximo nivel de transcripcin. Por ultimo los intensificadores son.
responsables de la expresin gnica especifica tisular y espacial.
Los intensificadores realizan al menos 2 funciones: se unen a los factores de
transcripcin, los cuales alteran la configuracin de la cromatina; y segundo
estos factores hacen lazos en el DNA, para juntar los intensificadores distantes
y los promotores, lo que permite la formacin de complejos entre los factores de
transcripcin y las polimerasas. En su nueva configuracin, la transcripcin se
estimula hasta su nivel mas alto, incrementando la tasa total de sntesis de
RNA.

Pasos de la transcripcin en los eucariotas

El primer paso es la remodelacin de la
cromatina para abrir el DNA y hacerlo
accesible a la transcripcin. Una vez abierto
el DNA, los factores de transcripcin y la
RNA pol se unen a las regiones promotoras
del DNA, formando el complejo de iniciacin
de la transcripcin.

Remodelacin de la cromatina
En los eucariotas el DNA se combina con protenas histnicas y no histnicas
para formar la cromatina. Algunas regiones cromosmicas estn fuertemente
condensadas

en

el

ncleo

interfsico,

formando

heterocromatina

transcripcionalmente inerte.
Los cambios en la conformacin de la cromatina, denominados remodelacin
de la cromatina, son sensibles para muchos procesos, incluyendo la unin de
las polimerasas y la recombinacin del DNA.
Implica un cambio en la interaccin entre DNA y las histonas en los
nucleosomas. Cuando se termina la remodelacin, las secuencias promotoras
quedan libres de histonas y son accesibles a las protenas que inician la
transcripcin. La remodelacin es realizada por un grupo diverso de complejos
proteicos con actividad ATPasa.

Ncleosomas
Son considerados como las unidades estructurales
de los cromosomas. Son formados por 8 molculas
de histonas 2 H2, 2 H2B, 2 H3 y 2 H4, formando un
octmero regular sobre el cual se enrolla la doble
cadena del ADN, dando casi dos vueltas por
ncleosoma
Los ncleosomas son unidos entre s por segmentos
de ADN de aproximadamente 50 nucletidos de
largo, formando los nucleofilamentos.
Luego de varios niveles de organizacin espacial,
anclados por varios tipos de protenas, llegamos a la
estructura final de los cromosomas.

Uno

de

los

complejos

de

remodelacin

mejor

estudiados en el complejo es SWI/SNF; esta formado

por

11 subunidades,

distribuido

en

algunos

el

cual

esta

eucariotas;

ampliamente
una

de

sus

subunidades contiene un dominio que permite una

unin no especifica al DNA y otra es una ATPasa. Los
complejos de remodelacin de los nucleosomas
pueden domiciliarse en sitios especficos de diversas
maneras.

Los

activadores

de

la

transcripcin

incluyendo los que contienen dominios denominados

cremalleras de leucina, puede dirigir la unin del
complejo SWI/SNF.

Los complejos de remodelacin con llevan

la alteracin de los contactos entre el DNA
y

las

protenas

histnicas

de

los

nucleosomas, lo que provoca que el

nucleosoma se deslice por la molcula de
DNA. Puede alterarse el camino seguido
por el DNA alrededor de la partcula central
del nucleosoma lo que empuja al DNA
fuera del nucleosoma. Otra posibilidad es
que se pueda alterar la estructura de la
partcula

central

del

nucleosoma,

produciendo un nucleosoma dimrico.

La alteracin qumica del componente histnico de los nucleosomas es

catalizado por las enzimas histona acetiltransferasas (HAT). Cuando se aade
un grupo acetato a un aminocido bsico especfico en las colas de las histonas,
disminuye la atraccin entre la protena histonica bsica y el DNA acido. Los
HAT son domiciliados a los genes por factores de transcripcin especficos.
Por supuesto todo lo que puede abrirse tambin puede cerrarse; en este caso,
las histonas desacetilasas (HDAC) pueden eliminar los grupos acetato de las
colas de las histonas. Adems de la acetilacin, las histonas pueden modificarse
mediante fosforilacin y metilacin. Estas alteraciones estructurales se producen
en residuos aminoacidicos especficos de las histonas.

Esta

observacin

condujo

la

propuesta que patrones especficos y

reversibles de modificacin covalente
de las histonas producen la activacin o
el

silenciamiento

gentico.

Estos

patrones de modificaciones mediadas

por enzimas constituyen una serie de
seales conocidas como el cdigo de
las

histonas,

un

mecanismo

de

regulacin que altera la conformacin

de la cromatina y, a la vez, la actividad
gentica.

Los

genes

eucarioticos

usan 3 tipos de RNA pol

para la transcripcin

RNA I (para losRNA r)

RNA II (para los RNA m)
RNAIII (para los RNA t y
los RNA r 5S)

Los factores de transcripcin basales o generales:

- son una coleccin de protenas
-actan en trans para controlar la iniciacin de la transcripcin
- no forman parte de la RNA pol
- se ensamblan en el promotor, formando el complejo preiniciacin de la transcripcin (PIC)

Complejo

de

transcripcin:

un

complejo
denominado

proteico
TFIID

se

une a la caja TATA a

travs de una de sus
subunidades TBP.
TFIID esta formado por:
TBP + TAF (aprox. 13
protenas mas, factores
asociados a TATA). Unos
20 pb del DNA estn
asociados a la unin a
TBP.

TFIID

responde

al

contacto

de

protenas

activadora

con

cambios

conformacionales, que facilitan la unin de otros factores asociados como:

TFIIB, la cual interacciona con TBP y con secuencias de DNA corriente arriba
de TATA, entonces se une TFIIA, la RNA pol y otros factores como: TFIIF,
TFIIE, TFIIH y TFIIJ.
En la etapa final la RNA pol abandona TATA y se produce la transcripcin del
gen adyacente.
Hay otros factores de transcripcin que se unen a los intensificadores y
afectan la tasa de transcripcin; estas protenas pueden actuar como factores
positivos (activadores) incrementando la transcripcin o como negativos
(represores) para disminuirla.
Estas protenas controlan donde, cuando y donde se expresaran los genes,
as como su tasa de expresin.

Estos son los activadores que se unen al intensificador e interaccionan con el

complejo transcripcional en el promotor, y pueden incrementar la tasa de
transcripcin hasta 100 veces.
Los activadores son protenas modulares, que se unen a la secuencia del DNA
intensificadora

complejo de intensificacin
Dominio de unin al DNA se une a las secuencias

Activadores,

de DNA presentes en el intensificador

2 dominios funcionales:

Dominio

de

activacin

en

trans,

activa

la

transcripcin mediante la interaccin protenaprotena

Los dominios de unin al DNA tienen patrones estructurales

caractersticos o motivos.
Por ejemplo: el motivo hlice-giro-hlice (HTH)
tambin se encuentra en procariotas
Se caracteriza por una secuencia de 2
hlices adyacentes separadas por un
giro de varios as lo que permite que la
protena se una a el DNA.
Se ha encontrado en diferentes regiones
de un gran numero de genes eucarioticos,
que regulan los procesos de desarrollo.

La caja hometica (homeobox) de 180 pb que especifica una secuencia de 60 as

dominio hometico, puede formar una estructura HTH, presente en casi todos
los organismos eucarioticos , de los 60 as muchos son arginina y lisina; y es muy
importante durante los procesos de desarrollo de los animales.
Homoeotic

genes

are

almost

identical in very different species.

We can study homeotic genes in
the fruit fly to learn about the same
genes the control development in a
human or mouse. These groups of
genes have remained relatively
unchanged throughout evolutionary
history.
Similar genes, in the same order, control the development of the
front and back part of the bodies of flies and mice.

Motivo dedo de Zinc

Representa una de las familias mas
importantes de factores de transcripcin
eucarioticos,

implicados

en

muchos

procesos de regulacin gnica

Hay varios tipos de protenas con dedos
de zinc. Por ejemplo una protena tpica
con dedos de cinc contiene grupos de 2
residuos de cistena y 2 de histidina a
intervalos repetidos.
Estos grupos son los que unen tomos de cinc covalentemente que
permiten la unin de cationes Zn2+ a la protena, producindose un
enlace coordinativo del metal en el centro de ellos. Este fenmeno
confiere al dominio aspecto de un dedo

Cremalleras de leucina (ZPI) este dominio de unin al DNA se encuentra

adyacente a una cremallera de leucina, una regin que permite la dimerizacin
protena-protena. Es un motivo que se origina por la distribucin repetitiva de 4
residuos de leucina espaciados por 7 aminocidos.

b) cuando las regiones de hlice forman una cremallera de leucina, las regiones que
hay mas all de la cremallera forman una regin en forma de Y que sujeta el DNA
mediante una configuracin semejante a unas tijeras

La tasa de expresin de un gen es la resultante de la interaccin de varios de estos

factores de transcripcin especficos que inducen o impiden la formacin del
aparato basal de transcripcin (compuesto por los factores de transcripcin
generales). Los factores de transcripcin de unin al ADN pueden activar o bloquear
la transcripcin si se fijan a secuencias reguladoras consenso cercanas a la regin
del promotor. Si estas protenas se fijan a intensificadores distantes de la regin del
promotor pueden aumentar o disminuir la tasa transcripcional de un gen que se est
transcribiendo.
La actividad de estos factores de transcripcin puede regularse a su vez a travs de
modificaciones covalentes mediadas por cascadas de quinasas/fosfatasas y en
algunos casos por induccin/represin, dependiendo en todos los casos de seales
externas. Esto es muy importante para coordinar las funciones biolgicas de la
clula y su interaccin con el medio.

Represores

Eucariotas

Organizacin
estructural de la
cromatina

Regulacin gnica a nivel

transcripcional

Factores de
transcripcin

Induccin positiva y represin por catabolito en los genes

gal de levadura
Primeros sistemas modelos utilizados, que codifica las enzimas para la
degradacin de la lactosa.
La expresin es inducible (inductor: galactosa), solo se activa si la [ ] de
glucosa es baja
La represin por catabolito es diferente en levaduras, implica una enzima
(quinasa) y no implica AMPc.
Genes: GAL1 y GAL10, estn controlados por una regin de control central,
denominada UASG, su funcin es parecida a la de las intensificadores, esta
abierta y no esta asociada a nucleosomas; requiere la accin del complejo
SWI/SNF.
En UASG hay 4 sitios de unin para la protena Ga14, los cuales estn
permanentemente ocupados por esta, ya sea si estn activados o
desactivados los genes gal.

Ga14 es negativamente regulada por Ga180, la cual se encuentra cubriendo su

sitio de activacin de Ga14.
La induccin se inicia cuando la galactosa fosforilada, se une a Ga180 o a Ga14
(o ambas), causando alteracin estructural para que el sitio de activacin de
Ga14 quede expuesto.
Estos genes tienen un segundo nivel de control

represin por catabolito.

Ga14 , formada por 881 aas que incluyen un dominio de unin a DNA, que
reconocen y se unen a UGSG, y un dominio de activacin en trans que activa la
transcripcin.
Se han identificado 2 regiones de la protena relacionadas con la activacin de la
transcripcin: 148 196 aas, 768- 881 aas
La activacin implica el contacto directo entre el dominio de activacin del factor
de transcripcin y otras protenas; que incluyen la remodelacin de la cromatina,
la estabilizacin entre el DNA del promotor y la RNA pol; as como el incremento
de la tasa de desenrrollamiento de la doble cadena de DNA de la regin
transcrita.

Metilacin del DNA

Otro mecanismo que desempea la regulacin de la expresin gnica: la
modificacin qumica del DNA, mediante la adicin o la eliminacin de grupos
metilo a las bases del DNA.
Este mecanismo lo realizan la mayora de los organismos eucariticos.
Estas protenas podran reclutar correpresores o histonas desacetilasas

A T G C
DNA

Operador

Cambio en la afinidad
del represor por el
operador

Metilaci
n
La metilacin se produce generalmente, en la citosina de dobletes CG, en ambas
cadenas

Relacin metilacin expresin gnica

Bajos niveles de metilacin

Niveles altos de expresin genica

Altos niveles de metilacin

Niveles bajos de expresin genica

Relacin inversa
Inactivado

Altos niveles de metilacin

Cromosoma
X
En hembras
de
mamfero

Activado

Bajos niveles de metilacin

Los patrones de metilacin son especficos de tejido y, una vez establecidos, se

heredan a todas las clulas de ese tejido
Prueba de la funcin de la metilacin: el nucletido 5-azacitidina se incorpora en el
DNA en lugar de la citidina y no puede metilarse, provocando un nivel de metilacin
inferior en los sitios donde se incorpora; debido a que la 5-azacitidina causa
cambios en el patrn de la expresin de los alelos del cromosoma X.
La 5-azacitidina esta siendo utilizada para el tratamiento de la anemia falciforme
Provoca cambios en la
forma de los glbulos rojos

Hemoglobi
na
defectuos
a

Se dejan de transcribir despus

del nacimiento
Genes E y
Yg de la
globina

Bajos niveles de metilacin

Reemplaza a la B-globina

5azacitidina

Reexpresin

Regulacin postranscripcional
Antes de la traduccin se eliminan los intrones no codificantes, los exones
restantes se unen con gran precisin, y el RNAm s modifica mediante la adicin
de una caperuza en el extremo 5y de una cola de poli A en el extremo 3,
entonces es transportado al citoplasma

Corte empalme alternativo

y del RNam

Regulacin
postranscripcional

Regulacin de la estabilidad
del RNAm

Corte y empalme del RNAm: a partir de una nica molcula de RNAm se

pueden generar diferentes formas
Protena A
Protena B
Gen

RNA
m

Protena C
Protena D

Los cambios en el patrn de corte y empalme son sucesos importantes en

el desarrollo, la apoptosis y la conexin entre axones en el sistema
nervioso; las mutaciones que afectan este proceso son la base de
diversas enfermedades genticas

TRANSCRIPCIN EN EUCARIONTES
- Existen tres tipos de ARN polimerasa I, II y III.
- Los genes estn fragmentados en zonas sin sentido o intrones y zonas con sentido o
exones. Antes ha de madurar y eliminar los intrones.
- Desempaquetamiento de las histonas.
En la trascripcin de eucariontes se distinguen las siguientes fases:
a) Iniciacin: la ARN polimerasa II se une a una zona del ADN llamada promotor (posee
secuencias CAAT y TATA) b) Elongacin: la sntesis continua en sentido 5-3. Al poco se
aade una caperuza (metil-guanosn trifosfato) al extremo 5. c) Finalizacin: parece que
est relacionado con la secuencia TTATTT. Ahora interviene un poli-A polimerasa que aade
una cola de poli-A al pre-ARNm (ARNhn). d) Maduracin: se produce en el ncleo y la hace
un enzima llamada RNPpn, que elimina los nuevos intrones (I) formados. Posteriormente
las ARN ligasas empalman los exones (E) y forman el ARNm.

TRANSCRIPCIN EN PROCARIONTES
En ella podemos distinguir las siguientes fases:
a) Iniciacin: la ARN polimerasa se une a un cofactor

que permite su

unin a una regin del ADN llamada promotor, la cual posee una
secuenciaa TATAAT TTGACA.
b) Elongacin: la ARN polimerasa recorre la hebra de ADN hacia su
extremo 5 sintetizando una hebra de ARNm en direccin 5-3
c) Finalizacin: presenta dos variantes. En una interviene un cofactor "p" y
en otra no interviene dicho cofactor. El proceso fiinaliza al llegar a una
secuencia rica en G y C (zona llamada operador). El ADN vuelve a su
forma normal y el ARNm queda libre.
d) Maduracin: si lo que se forma es un ARNm no hay maduracin, pero si
se trata de un ARNt o ARNr hay procesos de corte y empalme.

Regulacin CIS: Secuencia reguladora del DNA (por ejemplo, un

operador o un promotor) que solo puede controlar un gen que se
encuentre en el mismo cromosoma. En bacterias el elemento de
regulacin CIS se encuentra adyacente al gen o genes que controla,
mientras que en eucariontes los genes pueden encontrarse lejos.
Regulacin TRANS: Secuencia de DNA que codifica protenas que
difunden a travs de las membranas nucleares y que actan como
represores o activadores del mismo o diferente cromosomas.