Dr.

David Reyes Ruvalcaba

Bioquímica Médica
Programa de Medicina
Departamento de Ciencias de la Salud
Instituto de Ciencias Biomédicas
Universidad Autónoma de Ciudad Juárez
Ácidos nucleicos
El ARN y ADN, son polímeros lineales cuya unidad
repetitiva son los nucleótidos.
Tanto el ADN como el ARN se encuentran en todas las
células, con predominio de uno u otro según sea el caso,
por ejemplo en el timo predomina más el ADN y en la
levadura el ARN.
Desempeñan funciones esenciales a nivel molecular
relacionados con el crecimiento y la reproducción.
La mayoría de los elementos constituyentes de los ácidos
nucleicos son biosintetizados, en lugar de ser obtenidos a
partir de la dieta.
Nucleótidos
Cada nucleótido consta de tres componentes: un
éster fosfórico, un azúcar de la clase de las
pentosas y una base heterocíclica (base
nitrogenada).
En el ARN el azúcar es la D-Ribosa, mientras que
en el ADN se encuentra el azúcar 2-desoxi-D-
Ribosa. En ambos casos la base está unida a la
posición 1 del azúcar mediante un enlace -N-
glucosídico.
Nucleótidos
• La hidrólisis de los ácidos nucleicos mediante
enzimas como la desoxirribonucleasa (ADNasa) o
la ribonucleasa (ARNasa), dan lugar a
mononucleótidos, los cuales contienen cantidades
equimolares de una base nitrogenada, un azúcar y
ácido fosfórico.
• La hidrólisis subsiguiente con fosfatasas da lugar a
fosfato inorgánico y a nucleósidos.
• Tanto los nucleótidos como los nucleósidos
pueden ser desoxirribonucleótidos (nucleósido)
como ribonucleótidos (nucleósido).
Nombre de los nucleósidos
Base Ribonucleósido Desoxiribonucleósido
Adenina Adenosina Desoxiadenosina
Guanina Guanosina Desoxiguanosina
Citosina Citidina Desoxicitidina
Uracilo Uridina Desoxiuridina
Timina Ribósido de timina Timidina
Nombres de los nucleótidos
Ácidos Fosfatos Abreviatura
Ribonucleótidos
Ácido 2´-adenílico Adenosina 2´-monofosfato 2´-AMP
Ácido 3´-adenílico Adenosina 3´-monofosfato 3´-AMP
Ácido 5´-adenílico Adenosina 5´-monofosfato AMP
Ácido 3´-gunílico Guanocina 3´- monofosfato 3´-GMP
Ácido 3´-citidílico Citidina 3´-monofosfato 3´-CMP
Ácido 3´-uridílico Uridina 3´-monofosfato 3´-UMP
Desoxiribonucleótidos
Ácido desoxiadenílico Desoxiadenina 5´-monofosfato dAMP
Ácido desoxiguanílico Desoxiguanina 5´-monofosfato dGMP
Ácido desoxicitidílico Desoxicitidina 5´-monofosfato dCMP
Ácido timidílico Timidina 5´-monofosfato dTMP
Purinas y pirimidinas
• En los ácidos nucleicos se encuentran dos clases
principales de bases: las purinas y pirimidinas.
• Las purinas más abundantes son la guanina (G) y la
adenina (A), que se encuentran tanto en el ADN como en
el RNA y se hallan unidas al azúcar en la posición N-9.
• La xantina e hipoxantina también forman parte de las
purinas.
• Hay tres bases pirimidínicas principales: la citosina, el
uracilo y la timina. La citosina está presente tanto en el
ADN como en el ARN. Sin embargo, el uracilo sólo se
encuentra en el ARN, y la timina sólo en el ADN. Las
pirimidinas están unidas al azúcar en la posición N-1.
Purinas y pirimidinas
En el ARNt también se pueden encontrar otras bases
en pequeñas cantidades, representando menos del 5%
del número total de las bases. Suelen ser derivados
metilados de las bases principales (Dihidrouracilo,
2,2-dimetilguanina y 5-metilcitosina).
Una base nitrogenada con cualquiera de las pentosas
se denomina nucleósido.
Aspectos importantes de los
nucleótidos
• Las coenzimas de ácido fólico desempeñan un importante
papel en la síntesis de diversos constituyentes celulares,
pero su función esencial es la síntesis de los nucleótidos de
purina y pirimidina.
• Las funciones metabólicas del ácido fólico también son
importantes en el tratamiento del esprúe tropical y de la
anemia megaloblástica.
• La forma en que se sintetizan los compuestos relacionados
con el ácido fólico permiten explicar la eficiencia de los
análogos del folato y de las sulfamidas contra ciertas
infecciones bacterianas.
Aspectos importantes de los
nucleótidos
• La utilidad de los análogos del folato en el
tratamiento de la leucemia refleja el papel que
desempeñan las coenzimas del ácido fólico en la
biosíntesis de los nucleótidos de purina y pirimidina
en las células de crecimiento rápido. Además, en
algunos casos de gota y del síndrome de Lesch-Nyhan,
tienen en común un defecto genético del
metabolismo de los nucleótidos púricos, por lo que es
necesario conocer dichas vías metabólicas para
comprender estos trastornos
Funciones principales
Reacciones de transferencia de ATP y otros trifosfatos de
nucleósidos: UDP-glucosa y la UDP-galactosa intervienen en la
biosíntesis de los CHO`s.
Forman parte de la estructura de coenzimas (FAD, NAD+,
NADP+, coenzima A y S-adenosilmetionina.
Funciones reguladoras: ADP regula el índice de fosforilación
oxidativa mitocondrial, el AMP y GMP cíclicos tienen funciones
de segundos mensajeros. Algunos otros actuan como
reguladores alostéricos de la actividad enzimática.
Los trifosfatos de nucleósidos son las unidades monoméricas
precursoras de los acidos nucleicos ARN y ADN.
Polinucleótidos
• La polimerización de los nucleótidos da origen a los
ácidos nucleicos.
• La unión entre los monómeros de los ácidos nucleicos
requiere la formación de dos enlaces éster por el
ácido fosfórico.
• Los grupos hidroxilo a los que se esterifica el ácido
fosfórico son los carbonos 3’ y 5’ de residuos
adyacentes. El enlace resultante es un enlace 3’, 5’-
fosfodiester, que se repite a lo largo de la cadena de
un ácido nucleico.
Polinucleótidos
• Los residuos nucleótidos de los ácidos nucleicos se
numeran a partir del extremo 5’, que lleva un grupo
fosfato, al extremo 3’, que de manera normal tiene un
grupo hidroxilo libre.
• En algunas ocasiones es necesario indicar la posicion
del azúcar a la que esta unido el grupo fosfato (pA-
nucleotido 5’, adenosina 5’-monofosfato (5’-AMP); Ap
nucleotido 3’, nucleotido 3’, adenosina 3’-monofosfato
(3’-AMP)).
• Una cadena de ADN difiere de la cadena de un ARN,
por el azúcar diferente, además de que no hay uracilo.
Polinucleótidos
• Pequeñas cantidades de purinas y pirimidinas
adicionales se encuentran en el ADN y el ARN. Por
ejemplo: 5-metilcitosina (ADN bacteriano y humano),
5-dihidroximetilcitosina (bacterias y virus) y adenina
y guanina mono y di-N-metiladas (ARN mensajero de
mamíferos) que funcionan en el reconocimiento de
oligonucleótidos y en la regulación de la vida media
de los ARN.
• Los nucleótidos libres (xantina, hipoxantina y ácido
úrico) son intermediarios en el catabolismo de la
adenina y guanina.
Polinucleótidos
• También encontramos en la naturaleza heterociclos
metilados de vegetales como los derivados de la
xantina: cafeína del café, teofilina del té y teobromina
del cacao.
• Los grupos fosforilo tienen valores de pKa de
alrededor de 1.0; por ende, los nucleótidos tienen
carga negativa a pH fisiológico.
• A pH de 7.0 todos los nucleótidos comunes absorben
luz a una longitud de onda de 260 nm.
Usos quimioterapéuticos
• Análogos sintéticos de las bases, nucleósidos y nucleó-tidos
modificados en el anillo heterocíclicos o en la porción del
azúcar, tienen aplicaciones en medicina clínica.
• Sus efectos tóxicos inhiben enzimas esenciales en las
síntesis de ácido nucleico o su incorporación hacia ácidos
nucleicos, con alteración resultante de la formación de
pares de bases. Por ejemplo en oncología se utilizan: 5-
fluoouracilo o 5-yodouracilo, 3-desoxiuridina, 6-tioguanina
y 6-mercaptopurina, 5 o 6-azacitidina y 8-azaguanina, que
se incorporan hacia el ADN antes de la división celular.
Usos quimioterapéuticos
Por ejemplo en oncología se utilizan: 5-fluorouracilo
o 5-yodouracilo, 3-desoxiuridina, 6-tioguanina y 6-
mercaptopurina, 5 o 6-azacitidina y 8-azaguanina,
que se incorporan hacia el ADN antes de la división
celular.

El análogo de purina alopurinol, Tx de hiperuricemia

y gota, es un inhibidor de la biosíntesis de purina y la
actividad de la xantina oxidasa.
Usos quimioterapéuticos
La citarabina se usa en la terapia del cáncer. agente
antineoplásico específico de una fase del ciclo celular,
que afecta sólo a las células durante la fase S de la
división celular. En el interior de la célula, citarabina
es convertida en citarabina-5-trifosfato (ara-CTP), que
es el metabolito activo.

La azatioprina, que se cataboliza hacia 6-

mercaptopurina, se emplea en el trasplante de
órganos para suprimir el rechazo inmunitario.
Metabolismo
Proceso global a través del cual los sistemas vivos
adquieren y utilizan energía libre para realizar sus
diferentes funciones; esto se logra mediante cambios
químicos que ocurren cuando los organismos vivos
consumen tejidos animales o vegetales como alimento o
cuando las plantas llevan a cabo la fotosíntesis.
El metabolismo celular es el conjunto de reacciones
bioquímicas que tiene lugar en una célula, lo que incluye
una gran diversidad de conversiones moleculares. Estas
reacciones se encargan de mantener la viabilidad del
organismo.
Metabolismo
Aunque cada reacción es importante en sí misma, el
funcionamiento del organismo entero se debe a la
organización de las reacciones individuales para
formar una compleja interacción, controlada por un
conjunto de sensibles mecanismos regulatorios de
verificación y equilibrio.
En general, el mantenimiento y control de esta
organización preserva el metabolismo normal,
mientras que su alteración se traduce en un
metabolismo anormal.
Metabolismo
El metabolismo, para su estudio, puede subdividirse
en dos categorías principales:
1) Catabolismo (del griego katá “abajo”) se refiere a la
secuencia de reacciones de degradación de sustancias
complejas .
2) Anabolismo (del griego aná “arriba”) se refiere a la
secuencia de reacciones sintéticas “síntesis de
moléculas complejas”
Metabolismo
Metabolismo
En las vias catabólicas los metabolitos complejos se
degradan exérgonicamente a productos sencillos, la
energía libre originada en estos procesos, se conserva por
síntesis de ATP a partir de ADP y fosfato, o por la
reducción de la coenzima NADP+ a NADP. El
metabolismo degradativo se caracteriza por su capacidad
de transformar un gran número de sustancias diferentes
(carbohidratos, lípidos y proteínas) en intermediarios
comunes. Estos intermediarios son, posteriormente,
metabolizados aún más en una vía oxidativa central que
termina en unos pocos productos finales.
Metabolismo
Las macromoléculas primero se descomponen (hidrólisis)
en los bloques unitarios que las forman (nivel 1). Una vez
hidrolizadas las macromoléculas en sus componentes
(aminoácidos, nucleótidos, azúcares y ácidos grasos), la
célula puede reutilizar los componentes directamente para
formar otras macromoléculas de la misma clase,
convertirlas en compuestos diferentes para elaborar otros
productos o descomponerlos aun más (niveles 2 y 3), y
extraer una parte de su contenido de energía libre. El
curso que sigue depende de varios mecanismos
reguladores sensibles a las necesidades de la célula en ese
momento.
Metabolismo
Las vías de degradación de los diversos componentes
de las macromoléculas varían según el compuesto
particular que debe catabolizarse. Sin embargo,
finalmente todas estas moléculas se convierten en una
variedad de pequeños compuestos que se metabolizan
de manera similar. Así, aunque las sustancias
empiezan como macromoléculas con estructuras muy
diferentes a través de las vías catabólicas, se
convierten en los mismos metabolitos de bajo peso
molecular. Por esta razón, se dice que las vías
catabólicas son convergentes.
Metabolismo
En las vías anabólicas se lleva se lleva a cabo el
proceso opuesto. Un número relativamente reducido
del metabolitos, piruvato, acetil-CoA y los
intermediarios del ácido cítrico principalmente,
sirven de material de partida para la biosíntesis de
una gran variedad de productos. Estas vías requieren
energía y utilizan la energía química almacenada que
se libera en las vías catabólicas exergónicas.
Metabolismo
Las vías anabólicas y catabólicas son dos formas
diferentes de representar los mecanismos celulares y
forman parte del metabolismo intermediario. Esto
sólo comprende las reacciones las reacciones
relacionadas con el almacenamiento y la generación
de energía metabólica y el empleo de esa energía en la
biosíntesis de compuestos de bajo peso molecular; no
se incluye la biosíntesis de los ácidos nucleicos y las
proteínas a partir de sus precursores monoméricos.
Catabolismo de purinas
El catabolismo de los nucleótidos de purina conduce
en última instancia a la producción de ácido úrico que
es insoluble y es excretado en la orina como cristales
de urato de sodio.
Catabolismos de purinas
La síntesis de los nucleótidos desde las bases de
purina y de los nucleósidos de purina ocurre en una
serie de pasos conocidos como vías de salvamento.
Las bases libres de purina, adenina, guanina, e
hipoxantina, pueden ser reconvertidas a sus
correspondientes nucleótidos mediante
fosforibosilación. Dos enzimas transferasas
importantes están implicadas en el salvamento de las
purinas: adenosin fosforibosil transferasa (APRT), que
cataliza la siguiente reacción:
Biosíntesis de purinas
Biosíntesis de purinas
 Medicamentos que afectan la
biosíntesis de nucleótidos de purinas
Fármacos antifolato y análogos de glutamina
bloquean la síntesis de purinas
Los derivados del tetrahidrofolato de las reacciones 4
y 10 de la biosíntesis de novo de las purinas,
contribuyen con los carbonos añadidos en las
reacciones.
Una deficiencia de purinas, es rara en humanos, y la
causa principal son una deficiencia de la vitamina B9
(ácido fólico).
 Medicamentos que afectan la
biosíntesis de nucleótidos de purinas
Situación que ha sido aprovechada para crear
tratamientos vs el cáncer que inhiben la formación de
estos tetrahidrofolatos y como consecuencia la
síntesis de purinas.
El metotrexato (anticancerígeno) se utiliza como un
inhibidor de la dihidrofolato reductasa. La
dihidrofolato reductasa convierte dihidrofolato en
tetrahidrofolato, un donador de grupos metilo
requerido para la síntesis de novo de purinas, y timina
monofosfato (pirimidina).
 Medicamentos que afectan la
biosíntesis de nucleótidos de purinas
Otros quimioterapéuticos son:
La azaserina (1) inhibe en la reacción 5 .
Diazanorleucina (2), inhibe en la reacción 2.
Diazanorleucina (3), inhibe las reacciones 13 y 14.
Ácido micofenólico (4), reacción 14
Inhibidores de la biosíntesis de purinas

Deficiencia vitamina B9

Deficiencia vitamina B9
Biosíntesis de purinas

3y4

3
Biosíntesis de purinas
Catabolismo de purinas
Catabolismo de purinas

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Nucleótido adenina/CoA
Nucleótido adenina/CoA
Nucleótido adenina/FMN
Nucleótido adenina/FAD
Nucleótido adenina/NAD
Nucleótido adenina/NADP
Malonil CoA
Biosíntesis de pirimidinas
Medicamentos que afectan la biosíntesis
de nucleótidos de pirimidinas
En la reacción 12 de la biosíntesis de pirimidinas, se
utiliza un derivado tetrahidrofolato, elgrupo metilo
del N5, N10-metileno-tetrahidrofolato, se reduce
haciael grupo metilo que se transfiere, y el
tetrahidrofolato se oxida hacia dihidrofolato.
Para que ocurra la síntesis adicional de los
nucleótidos de pirimidinas el dihidrofolato se reduce
de nuevo hacia tetrahidrofolato, reacción catalizada
por la dihidrofolato reductasa, .
Las células en división deben de generar TMP y
dihidrofolato.
Medicamentos que afectan la biosíntesis
de nucleótidos de pirimidinas
El metotrexato (anticancerígeno) se utiliza como un
inhibidor de la dihidrofolato reductasa. La
dihidrofolato reductasa convierte dihidrofolato en
tetrahidrofolato, un donador de grupos metilo
requerido para la síntesis de novo de purinas, y timina
monofosfato.
 Acción antimicrobiana
Sulfonamidas: bacteriostáticos, actúan por
antagonismo competitivo con el ácido
paraaminobenzoico (PABA) un componente esencial
en la síntesis de ácido fólico. Inhiben a las bacterias
grampositivas como las gramnegativas,
Nocardia, Chlamydia trachomatis y algunos
protozoarios. Algunas bacterias entéricas, tales
como E. coli, Klebsiella, Salmonella,
Shigella y Enterobacter, también pueden ser inhibidas.
El grupo de las ricketsias no son inhibidas por las
sulfonamidas, sin embargo, sí son estimuladas en su
crecimiento por dichos fármacos.
Trimetoprim: de estructura semejante al ácido fólico
es un inhibidor selectivo de la dihidrofolato reductasa
bacteriana, el cual evita la síntesis de la forma activa
tetrahidro del ácido fólico.
Trimetoprim y sulfametoxazol: cuando ambos
fármacos se usan combinados se produce sinergia
antimicrobiana a causa del bloqueo secuencial de la
síntesis de folato. La combinación farmacológica es
bactericida contra organismos susceptibles.
Biosíntesis de pirimidinas

Metotrexato
Biosíntesis de pirimidinas
Biosíntesis de pirimidinas
Catabolismo de pirimidinas
 Catabolismo de pirimidinas

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 Vía de recuperación
(salvamento) de purinas
 DESORDEN DEFECTO NATURALEZA DEL DEFECTO

PRPP sintetasa Actividad incrementada

Gota HGPRTa deficiencia
Glucosa-6 fosfatasa deficiencia

Síndrome de Lesch-Nyhan HGPRT Ausencia de la enzima

SCID ADAb Ausencia de la enzima

Inmunodeficiencia PNPc Ausencia de la enzima

Litiasis renal APRTd Ausencia de la enzima

Xantinuria Xantina oxidasa Ausencia de la enzima

Enfermedad de von Gierke Glucosa-6-fosfatasa Deficiencia de la enzima

Replicación

Trascripción

Traducción