Cas9

Cas9
Cas9
شناسه‌ها
نماد	؟
اینترپرو	IPR028629

CRISPR-associated endonuclease Cas9
CRISPR-associated endonuclease Cas9
	Crystal structure of S. pyogenes Cas9 in complex with sgRNA and its target DNA at 2.5 Å resolution.
Identifiers
Organism	استرپتوکوک پیوژنز M1
Symbol	cas9
Alt. symbols	SpCas9
آنتره	۹۰۱۱۷۶
بانک داده پروتئین	4OO8
مرکز ملی اطلاعات زیست‌فناوری	NC_002737.2
مرکز ملی اطلاعات زیست‌فناوری	NP_269215.1
UniProt	Q99ZW2
Other data
عدد گروه آنزیم	-. - ۳٫۱. -. -
کروموزوم	Genomic: خطای عبارت: نویسه نقطه‌گذاری شناخته نشده «۸» - خطای عبارت: نویسه نقطه‌گذاری شناخته نشده «۸» Mb

کَس۹ یا Cas9 (کوتاه شده CRISPR associated protein 9 که قبلاً Cas5، Csn1 یا Csx12 نامیده می‌شد) یک پروتئین ۱۶۰ کیلودالتونی است که نقش حیاتی در دفاع ایمنی برخی باکتری‌ها در برابر ویروس‌های DNA و پلاسمیدها ایفا می‌کند و به شدت در برنامه‌های مهندسی ژنتیک مورد استفاده قرار می‌گیرد. کارکرد اصلی آن برش دی‌ان‌ای و در نتیجه تغییر ژنوم سلول است. تکنیک ویرایش ژنوم CRISPR-Cas9 نقش مهمی در اهدای جایزه نوبل شیمی در سال ۲۰۲۰ به امانوئل شارپنتیه و جنیفر دودنا داشت.^[۱]

از نظر فنی‌تر، Cas9 یک آنزیم اندونوکلئاز DNA هدایت‌شده با RNA دوگانه است که با سیستم ایمنی تطبیقی خوشه‌ای با تکرارهای کوتاه پالیندرومیک بین‌فاصله منظم (کریسپر) در استرپتوکوک پیوژنز مرتبط است.^[۲]^[۳] S. pyogenes از CRISPR برای به خاطر سپردن و از Cas9 برای بازجویی و جدا کردن DNA خارجی، مانند DNA باکتریوفاژ مهاجم یا DNA پلاسمید، استفاده می‌کند.^[۳]^[۴]^[۵]^[۶] Cas9 این بازجویی را با باز کردن DNA خارجی و بررسی مکان‌های مکمل ناحیه ۲۰ جفت پایه RNA راهنما انجام می‌دهد. اگر سوبسترای DNA مکمل RNA راهنما باشد، Cas9 DNA مهاجم را می‌شکافد. از این نظر، مکانیسم CRISPR-Cas9 دارای تعدادی مشابه با مکانیسم تداخل آران‌ای (RNAi) در یوکاریوت‌ها است.

جستارهای وابسته

منابع

↑ "The Nobel Prize in Chemistry 2020". NobelPrize.org (به انگلیسی). Retrieved 2020-10-07.
↑ Deltcheva E, Chylinski K, Sharma CM, Gonzales K, Chao Y, Pirzada ZA, Eckert MR, Vogel J, Charpentier E (March 2011). "CRISPR RNA maturation by trans-encoded small RNA and host factor RNase III". Nature. 471 (7340): 602–607. Bibcode:2011Natur.471..602D. doi:10.1038/nature09886. PMC 3070239. PMID 21455174.
↑ ^۳٫۰ ^۳٫۱ Jinek M, Chylinski K, Fonfara I, Hauer M, Doudna JA, Charpentier E (August 2012). "A programmable dual-RNA-guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity". Science. 337 (6096): 816–21. Bibcode:2012Sci...337..816J. doi:10.1126/science.1225829. PMC 6286148. PMID 22745249.
↑ Heler R, Samai P, Modell JW, Weiner C, Goldberg GW, Bikard D, Marraffini LA (March 2015). "Cas9 specifies functional viral targets during CRISPR-Cas adaptation". Nature. 519 (7542): 199–202. Bibcode:2015Natur.519..199H. doi:10.1038/nature14245. PMC 4385744. PMID 25707807.
↑ Barrangou R, Fremaux C, Deveau H, Richards M, Boyaval P, Moineau S, et al. (March 2007). "CRISPR provides acquired resistance against viruses in prokaryotes". Science. 315 (5819): 1709–12. Bibcode:2007Sci...315.1709B. doi:10.1126/science.1138140. PMID 17379808. {{cite journal}}: |hdl-access= requires |hdl= (help)
↑ Garneau JE, Dupuis MÈ, Villion M, Romero DA, Barrangou R, Boyaval P, Fremaux C, Horvath P, Magadán AH, Moineau S (November 2010). "The CRISPR/Cas bacterial immune system cleaves bacteriophage and plasmid DNA". Nature. 468 (7320): 67–71. Bibcode:2010Natur.468...67G. CiteSeerX 10.1.1.451.9645. doi:10.1038/nature09523. PMID 21048762.

خواند بیشتر

Kennedy EM, Cullen BR (May 2015). "Bacterial CRISPR/Cas DNA endonucleases: A revolutionary technology that could dramatically impact viral research and treatment". Virology. 479–480: 213–20. doi:10.1016/j.virol.2015.02.024. PMC 4424069. PMID 25759096.
Abbott TR, Dhamdhere G, Liu Y, Lin X, Goudy L, Zeng L, et al. (May 2020). "Development of CRISPR as an Antiviral Strategy to Combat SARS-CoV-2 and Influenza". Cell. 181 (4): 865–876.e12. doi:10.1016/j.cell.2020.04.020. PMC 7189862. PMID 32353252. Lay summary – WIRED. {{cite journal}}: Cite uses deprecated parameter |lay-url= (help)

پیوند به بیرون

خلاصه‌ای از اطلاعات ساختاری موجود در بانک داده پروتئین برای یونی‌پروت: Q99ZW2 (Streptococcus pyogenes CRISPR-associated endonuclease Cas9/Csn1) در PDBe-KB.

[1] "The Nobel Prize in Chemistry 2020". NobelPrize.org (به انگلیسی). Retrieved 2020-10-07.

[Deltcheva2011-2] Deltcheva E, Chylinski K, Sharma CM, Gonzales K, Chao Y, Pirzada ZA, Eckert MR, Vogel J, Charpentier E (March 2011). "CRISPR RNA maturation by trans-encoded small RNA and host factor RNase III". Nature. 471 (7340): 602–607. Bibcode:2011Natur.471..602D. doi:10.1038/nature09886. PMC 3070239. PMID 21455174.

[P22745249-3] ۳٫۰ ^۳٫۱ Jinek M, Chylinski K, Fonfara I, Hauer M, Doudna JA, Charpentier E (August 2012). "A programmable dual-RNA-guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity". Science. 337 (6096): 816–21. Bibcode:2012Sci...337..816J. doi:10.1126/science.1225829. PMC 6286148. PMID 22745249.

[Heler2015-4] Heler R, Samai P, Modell JW, Weiner C, Goldberg GW, Bikard D, Marraffini LA (March 2015). "Cas9 specifies functional viral targets during CRISPR-Cas adaptation". Nature. 519 (7542): 199–202. Bibcode:2015Natur.519..199H. doi:10.1038/nature14245. PMC 4385744. PMID 25707807.

[5] Barrangou R, Fremaux C, Deveau H, Richards M, Boyaval P, Moineau S, et al. (March 2007). "CRISPR provides acquired resistance against viruses in prokaryotes". Science. 315 (5819): 1709–12. Bibcode:2007Sci...315.1709B. doi:10.1126/science.1138140. PMID 17379808. {{cite journal}}: |hdl-access= requires |hdl= (help)

[Garneau2010-6] Garneau JE, Dupuis MÈ, Villion M, Romero DA, Barrangou R, Boyaval P, Fremaux C, Horvath P, Magadán AH, Moineau S (November 2010). "The CRISPR/Cas bacterial immune system cleaves bacteriophage and plasmid DNA". Nature. 468 (7320): 67–71. Bibcode:2010Natur.468...67G. CiteSeerX 10.1.1.451.9645. doi:10.1038/nature09523. PMID 21048762.

[۱]

[۲]

[۳]

[۴]

[۵]

[۶]

داده‌های کتابخانه‌ای
کتابخانه‌های ملی	فرانسه (داده‌ها) اسرائیل ایالات متحده آمریکا
سایر	کاربرد چندوجهی اصطلاحات موضوعی سوداک (فرانسه) 1