l3 Microbiologie. La Transcription 2022

Rappels
Les rappels porteront sur
1. Organisation du génome chez les procaryotes chromosomes

et gènes et schéma de l’expression
2. Organisation du génome chez les eucaryotes chromosomes
plasmides et gènes et schéma de l’expression
 structure d’un gène et d’une unité de transcription
Structure des gènes est continue et souvent en opérons pour des

raisons économiques mais aussi pour que les bactéries puissent
s’adapter très rapidement à de nouvelles conditions environnementales.
On parlera d’unité de transcription avec un cistron ou plusieurs.
Pr DALACHE F. Biologie moléculaire et génie génétique Page 1 sur 8

2022/2023
Expression des gènes chez les procaryotes
La transcription a pour résultat la synthèse d'une molécule d'ARN à partir

d'une molécule d'ADN double brin. En réalité un seul brin de l’ADN est
transcrit. L’ARN produit est identique au brin codant et complémentaire au brin
matrice. On parle aussi de brin [transcrit= anti-sens= non codant] et de brin
[non transcrit= sens= codant] (voir figure 1)
Figure 1. Convention d’appellation des brins d’ADN lors de la transcription
La transcription se fait au niveau des unités de transcription et elle est

catalysée par l'ARN polymérase ADN dépendante qui requière un ADN matrice
double brin ainsi que des ribonucléotides précurseurs : ATP, GTP, CTP, UTP. La
polymérisation se fait dans le sens 5' 3' selon l'anti-parallélisme des
chaînes (voir figure 2).
Figure 2. Polymérisation de l’ARNm

2022/2023
Une unité de transcription est composée d’une séquence d’ADN transcrite en
une seule molécule d’ARN.
La transcription débute au niveau du promoteur et se termine au niveau du

terminateur et le premier produit est nommé transcrit primaire. A partir du
premier nucléotide transcrit on parle de séquences en amont et de séquences
en aval (voir figure 3).
Figure 3 : désignation des séquences

La transcription produit essentiellement des ARNr (ribosomiques), des ARNt
(transfert), des ARNm (messagers) dont la concentration dans les cellules est la
plus faible.
1. La transcription chez les procaryotes : Bactéries
Chez les procaryotes une unité de transcription peut comporter une seule
séquence codante ou plusieurs comme par exemple dans le cas des gènes de
structure de l’opéron lactose dans ce cas la transcription donne un ARNm
polycistronique.
Un seul type d'ARN polymérase est à l'origine de la transcription de tous les
ARN chez les bactéries. Chez E. coli elle a une masse moléculaire de 465 KDa et
elle est constituée de 5 sous unités : 2α, 1β, 1β', ω et σ et nommé aussi
holoenzyme. Cette holoenzyme est constituée du core enzyme (l'enzyme
cœur) et du facteur sigma. La totalité de l'ARN polymérase se fixe à une région
couvrant 60 pb (voir figure 4).

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Le core-enzyme est capable de rester fixer sur des sites
flottant pendant 1h alors que l’ARN polymérase plusieurs
heures.
Les deux sous-unités α permettent de maintenir le brin non-transcrit à l'écart,
les sous-unités β’ et β contiennent le site catalytique. La sous-unité σ se détache
au début de la transcription, c'est-à-dire dés que l’étape d’initiation est
terminée. Cette sous-unité permet de diminuer d'un facteur 10000 l'affinité de
l'ARN polymérase pour des séquences quelconques d'ADN et au contraire
augmente l'affinité de cette même enzyme pour le site promoteur.
Le schéma suivant montre la disposition de l’ARNpol sur la chaîne d’ADN
β’
α
5’ β 3 Brin non transcrit
3’ α
5’ Brin transcrit
σ
60 nucléotides
Figure 4. Structure de l’ARN polymérase
Les 5 sous-unités s'organisent pour former 3 domaines fonctionnels de

l'enzyme (figure 5) :
 2 domaines d'interaction avec l'ADN

 1 site catalytique pour la formation des liaisons phosphodiester.

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Figure 5. Sites d’interaction de l’ARN polymérase avec l’ADN
Contrairement à l'ADN pol, l'ARN pol n'a pas d'activité exonucléasique (activité
correctrice). Mais le manque d'activité correctrice est sans gravité pour
plusieurs raisons :
 Il n'y a pas de transmission à la descendance.

 Le taux d'erreurs est relativement faible : 10-4 à 10-5.
 Il y a beaucoup de molécules d'ARNm.
 Le temps de demi-vie de l'ARNm est relativement court.
La transcription se résume en trois étapes :

 L’initiation.
 L’élongation.
 La terminaison.
1.1 L’initiation
L’ARN polymérase commence d’abord par se fixer au promoteur qui est

une séquence double brin.
Dans une bactérie, tous les promoteurs n’ont pas la même efficacité
(nombre d’initiation de la transcription / unité de temps) et ceci dépend de
leurs séquences
 Promoteurs forts: protéines abondantes c’est à dire à une grande
concentration.
 Promoteurs faibles : proteins à faible concentration ou rares.
 Promoteurs faibles : protéines rares.

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La bactérie peut adapter l’expression de ses gènes (transcription + ou -) en
fonction de son milieu (nutriments)
L’ARN polymérase doit d’abord identifier et se fixer sur la séquence consensus

–35 puis la séquence -10 et enfin le nucléotide +1 (voir figure 6). Lorsque toutes
les séquences consensus sont reconnues la molécule d’ADN s’ouvre au niveau
de -10 et la transcription commence à partir du nucléotide +1 (voir figure 6).
Le point de départ est le nucléotide numéro +1, c’est la paire de base qui
correspond au premier nucléotide de l’ARN. Plusieurs transcription seront
amorcées mais ne se termineront pas, jusqu’à la libération de l’ARN
polymérase du promoteur. A ce moment la transcription pourra se poursuivre
et donc entamer l’étape d’élongation.
Figure 6. Initiation de la transcription
1.2 L’élongation
Cette étape commence après plusieurs essais de démarrage. Elle débute

seulement si l’ARN polymérase dépasse 9 nucléotides dans le nouvel ARN.
Lorsque l’enzyme se déplace, elle déroule localement l’ADN, séparant les
brins. L’hélice est reformée derrière la polymérase. Un complexe ternaire

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(ADN/ARN/ARNpolymérase) d’élongation se forme, il s’étend sur 12
nucléotides. Il est formé lorsque l’initiation réussit. Le facteur sigma est libéré.
Le noyau de l’enzyme se détache du promoteur et se déplace le long de la
matrice d’ADN, et la transcription de la chaîne d’ARN se poursuit par
polymérisation de ribonucléotides.
1.3 La terminaison
La terminaison de la transcription est régulée par :
- Séquence du brin matrice.
- Configuration du transcrit.
Il existe deux types de terminateurs : terminateurs intrinsèques et terminateurs
rhô dépendants.
1.3.1 Terminateurs intrinsèques
On nomme terminateurs intrinsèques les sites de terminaison qui ne font
intervenir aucun facteur supplémentaire, externe à la séquence d’ADN, pour
assurer la terminaison.
Ils sont constitués d’une séquence palindromique riche en bases G-C suivie
d'une région riche en bases A-T.
La séquence de l'ADN est une séquence palindromique riche en GC suivit
de A: l'ARN va donc être constituée d'une séquence palindromique (C)n (G)n
suivit de U. La séquence palindromique forme une tige boucle stable (voir
figure 7) sur le transcrit, suivit d'un poly rU apparié aux poly dA. L'appariement
entre rU et dA est peu stable, l'ARN se décroche de l'ADN de façon spontanée,
l'ADN se referme et le core-enzyme de l’ARN polymérase se détache de l'ADN.
Terminateurs intrinsèques
 Séquences palindromiques qui donnent des épingles à cheveux sur l'ARN. Ce qui
entraîne un ralentissement de l'ARNpol ou arrêt.
 Cette séquence est suivie de 6 à 10 adénines nommée séquence polyA. (ADN/ARN : A-

U). Au niveau de cette séquence l'ADN et l'ARN se dissocient.

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La présence de la région poly U est indispensable au détachement de l'ARN
polymérase du brin matrice lors de son arrêt sur l'épingle à cheveux.
Figure 7. Epingle à cheveux et séquence poly U sur le transcrit
1.3.2 Terminateurs ρ dépendant

Dans ce cas, la séquence poly U n'est pas présente après l'épingle à cheveux
mais un autre mécanisme intervient pour la terminaison de la transcription.
L’Intervention du facteur ρ (rhô) qui interagit avec ADN/ARN et le dissocie en
consommant de l'ATP.
Le facteur ρ : est une protéine hexamérique ARN-dépendante. Ce facteur se
fixe sur un site de reconnaissance au niveau de l'ARN, se déplace le long de
l'ARN et rejoint l'ARN polymérase des qu'elle marque un temps d'arrêt. Le
temps d’arrêt a lieu lorsque Le core-enzyme de l’ARN polymérase rencontre
une structure en épingle à cheveux. Lorsque ce facteur a rattrapé l'extrémité 3'
il décroche l'ARN. L'ADN se referme.
Dans le cas des ARN polycistroniques il existe des espaceurs entre les
gènes de structure.

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 structure d’un gène et d’une unité de transcription

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La transcription se fait au niveau des unités de transcription et elle est

Figure 2. Polymérisation de l’ARNm

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La transcription débute au niveau du promoteur et se termine au niveau du

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Les deux sous-unités α permettent de maintenir le brin non-transcrit à l'écart,

les sous-unités β’ et β contiennent le site catalytique. La sous-unité σ se détache

au début de la transcription, c'est-à-dire dés que l’étape d’initiation est

terminée. Cette sous-unité permet de diminuer d'un facteur 10000 l'affinité de

l'ARN polymérase pour des séquences quelconques d'ADN et au contraire

augmente l'affinité de cette même enzyme pour le site promoteur.

Le schéma suivant montre la disposition de l’ARNpol sur la chaîne d’ADN

Figure 4. Structure de l’ARN polymérase

Les 5 sous-unités s'organisent pour former 3 domaines fonctionnels de

 2 domaines d'interaction avec l'ADN

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 Il n'y a pas de transmission à la descendance.

La transcription se résume en trois étapes :

L’ARN polymérase commence d’abord par se fixer au promoteur qui est

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Figure 6. Initiation de la transcription

Cette étape commence après plusieurs essais de démarrage. Elle débute

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 Cette séquence est suivie de 6 à 10 adénines nommée séquence polyA. (ADN/ARN : A-

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Figure 7. Epingle à cheveux et séquence poly U sur le transcrit

1.3.2 Terminateurs ρ dépendant

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