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N° d’ordre :
N° de série :
Intitulé :
Jury d’évaluation :
Année universitaire
2023 - 2024
….
Présenté par :Laib Nahla
Année universitaire : 2023-2024
Sadaoui hadil
Recherche in silico des gènes liés à la réponse aux stress salin chez le
modèle Medicago truncatula.
par une analyse in silico de données de transcription qui provient des puces
Affymetrix, après l’utilisation d’un gène clé de la voie de signalisation
comme le gène référence LOC11422042.
L'étude a permis de constater que les gènes impliquée dans cette réaction
sont extrêmement variés et appartiennent à différents groupes
telles que : les gènes codant aux protéines de type LEA , des facteurs de
transcription, des facteurs de virulences , aussi des gênes qui codes pour
d’autre fonction .
The objective of this work is to carry out a bioinformatics analysis on the genes
involved in the response of the biological model M.truncatula during high
concentrations of salt stress, through an in silico analysis of transcription data
coming from Affymetrix chips, after the use of a key gene in the signaling
pathway such as the reference gene LOC11422042.
The grouping of the genes studied shows the similarity of their expression
profile to the reference gene LOC11422042. by contribution to the distances
found.
The study revealed that the genes involved in this reaction are extremely varied
and belong to different groups such as: genes coding for LEA type proteins,
transcription factor , virulence factor , also gene which code for d other
function.
Keywords:
Medicago Trancatula, stress salin NaCl, gene of CSE.
ملخص:
الهدف من هذا العمل هو إجراء تحليل المعلوماتية الحيوية على الجينات المشاركة في استجابة النموذج البيولوجي
M.truncatulaأثناء التركيزات العالية من اإلجهاد الملحي ،من خالل تحليل سيليكو لبيانات النسخ القادمة من رقائق
،Affymetrixبعد استخدام جين رئيسي في مسار اإلشارة مثل الجين المرجعي LOC11422042.
يُظهر تجميع الجينات التي تمت دراستها تشابه ملف تعريف التعبير الخاص بها مع الجين المرجعي LOC11422042من خالل
المساهمة في المسافات الموجودة.
كشفت الدراسة أن الجينات المشاركة في هذا التفاعل متنوعة للغاية وتنتمي إلى مجموعات مختلفة مثل :الجينات التي ترمز
للبروتينات من نوع ،LEAوعوامل النسخ ،وعوامل الفوعة ،وكذلك الجينات التي ترمز لوظيفة أخرى.
105 "وقل اعملوا فسيرى هللا عملكم و رسوله و المؤمنون" سورة التوبة _االية: بعد بسم هللا الرحمان الرحيم
اللهم، نحن ال نسعى حيثما اردنا انما نسعى أينما شاء هللا فاللحمد هلل الذي وفقنا لتمام هذا العمل
. انه خالص لوجهك فتقبله منا يا هللا و اجعل لنا من خيره ما يسرنا
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A la femme qui a souffert sans me laisser souffrir, qui n’a jamais dit non
âmes exigences et qui n’a épargné aucun effort pour me rendre heureuse:
« Mon adorable maman »
A l’homme, qui doit ma vie, ma réussite et tout mon respect, « Mon papa »
A Mon adorable petit frère « Nassim » qui sait toujours comment procurer
la joie et le bonheur pour toute la famille .
‘Nahla laib’
1
Dédicaces :
Avant de dédier ce travaille on tient d’abord à remercier ‘’ALLAH’, le
tout puissant qui nous a permis de mener à bien ce modeste travaille .
À celui dont le front était couvert de sueur et à celui qui m'a appris que le succès
ne vient qu'avec la patience et la persévérance. À la lumière qui a éclairé mon Page | 1
chemin et à la lampe dont la lumière ne s'éteindra jamais dans mon cœur à «
mon cher père ».
À celle qui a mis le paradis sous ses pieds et m'a facilité l'adversité par ses
prières. À la personne formidable que j'ai toujours voulu me voir dans ce lieu, «
ma chère mère ».
À mes frères « Rachid, walid, Achraf »,qui non pas cessé de conseiller ;
encourager et soutenir au long de mes études À mon adorable grande sœur «
Samira » et ses enfants « djabar et raid « et , a quelqu'un qui me tient à cœur, «
mon beau destin F » Sans oublier Mon amie et ma sœur de sang « cheima » Et
ma belle famille que me donne le courage , mes cousins « rawnek, rahma , aya,
hadjer, anfel » .
‘Sadaoui Hadil’
Sommaire
introduction 1
I.2 botanique 4
I.2.1 la morphologie 4
I.2.2 classification 5
II .2 Méthodes 17
-LEA: ateembreyogenesisabundant
-PR: Pathogenesis-related
Figure 12 :
Figure 1 4:
Figure 17:
Figure 18 :
Figure 19 :
Figure 24: le code pour affichier que les conditions sont remplies
Liste des tableaux :
Le terme in silico est devenu de plus en plus utilisé pour désigner les études biologiques
réalisées sur ordinateur, rejoignant ainsi les termes in vivo et in vitro qui désignent des
méthodes d'études expérimentales plus classiques. Pour les biologistes, le terme "in vitro"
désigne "dans du"
Le terme "verre" désigne l'utilisation d'un tube à essai ; in vivo désigne l'utilisation de la
vie, c'est-à-dire dans les organismes vivants. Les premières puces informatiques étaient en
silicium, ce qui explique le terme in silico. Différentes techniques ne reposent plus sur le
silicium, ce qui nous amène à privilégier l'utilisation de termes plutôt que d'algorithmes.
Dès l'invention des ordinateurs, on a pu constater une tendance similaire en biologie, mais
celle-ci a considérablement augmenté depuis les dix dernières années grâce au projet
génome humain et au séquençage de génomes complets de divers organismes. Le nombre
de donnés expérimentales collectés. .
Il est souvent trop important de collecter et d'analyser pour le biologiste seul, qui doit
désormais faire appel à l'ordinateur pour gérer ces immenses quantités d'informations.
L'informatique joue un rôle bien plus important que le simple stockage et la récupération
des données biologiques ; il est désormais envisageable d'étudier les systèmes vivants à
l'aide de simulations informatiques. Par exemple, lorsque l'on détermine la séquence d'un
ADN, elle peut être sauvegardée sur l'ordinateur, et des programmes peuvent être
développés pour repérer des sites de restriction .
Cette étude vise à repérer et à analyser les gènes impliqués dans la réponse aux stress
abiotiques chez Medicago truncatula, en utilisant une méthode in silico basée sur l'analyse
de données de transcription. Les stress abiotiques tels que la salinité, la sécheresse et les
températures extrêmes sont très préjudiciables à la croissance et au rendement des plantes.
Les plantes ont besoin d'une régulation complexe de l'expression génique pour répondre à
ces stress .
En utilisant l'approche in silico, il est possible d'explorer et de prédire les gènes et les voies
de signalisation impliqués dans la réponse aux stress abiotiques, en exploitant les grandes
quantités de données de transcription disponibles dans les bases de données publiques.
1
Introduction
stress envisageable de détecter des régulateurs essentiels et des voies de signalisation clés
dans la Cette étude a pour but de permettre une meilleure compréhension des mécanismes
moléculaires qui régissent la réponse aux stress abiotiques chez Medicago truncatula, ce
qui fournit des éléments indispensables pour développer des stratégies d'amélioration de la
tolérance au stress chez les plantes cultivées. En identifiant les principaux gènes et voies de
signalisation, cette recherche pourrait ouvrir de nouvelles perspectives pour l'ingénierie
génétique dans le but d'améliorer la résistance des cultures aux stress environnementaux,
ce qui contribuerait à la sécurité alimentaire mondiale dans un contexte de changements
climatiques.
2
Chapitre I :
Revue
Bibliographique
Chapitre I : Revue bibliographique
I.1.l’origine d’espèce :
Medicago truncatula, ou trèfle à barils, est une légumineuse annuelle de la famille des
légumineuses de la région méditerranéenne. Feuilles trifoliées, fleurs jaunes seules ou en
petites inflorescences de deux à cinq inflorescences. Elle produit un petit fruit épineux. On
étudie cette espèce de plante comme modèle pour la biologie des légumineuses, car elle
peut être en symbiose avec les rhizobiums fixateurs d'azote et les champignons
mycorhiziens orbiculaire . Ceci en fait un instrument essentiel pour l'analyse de ces
processus.
M. truncatula est également connue pour son petit génome diploïde, son auto fertilité, son
temps de génération rapide et sa prolifique production de graines, ce qui la rend pratique
pour la transformation génétique. Il a aussi été séquencé son génome, ce qui permet aux
chercheurs d'analyser la plante à un niveau moléculaire plus approfondi. La revue Nature a
publié en 2011 le projet de séquence du génome du cultivar A17 de M. truncatula. Un
groupe international de laboratoires de recherche a collaboré à la réalisation de ce projet,
avec des chercheurs de l'institut J. Aux États-Unis, Craig Venter, du Genoscope en France
et du Centre Sanger au Royaume-Uni. Grâce à cette publication, les chercheurs du monde
entier ont pu approfondir leur compréhension de la biologie de cette plante modèle. M.
truncatula est aussi une espèce fourragère importante pour le bétail en Australie. Cette
plante, ayant la capacité de fixer l'azote atmosphérique, produit de grandes quantités de
protéines, ce qui en fait une nourriture parfaite pour les animaux. En résumé, la plante M.
truncatula joue un rôle essentiel dans la biologie des légumineuses et est également
employée comme espèce fourragère en Australie. Cette plante est un outil de recherche
précieux pour les scientifiques du monde entier, car elle peut former des symbioses avec
les rhizobiums et les champignons mycorhiziens arbusculaires , ainsi que son petit génome
diploïde.
M. truncatula est une espèce originaire de la Méditerranée. Parmi les légumineuses, elle a
été choisie comme modèle en raison de ses propriétés biologiques bénéfiques. La
génération de M. truncatula est courte, d'une durée d'environ dix à douze semaines de
graine à graine, et elle produit de nombreuses petites graines. L'autogame de cette plante
1
Chapitre I : Revue bibliographique
implique que les populations sont génétiquement identiques. Elle possède un génome
diploïde et petit, d'environ 450 Mb haploïde. M. truncatula est plus génétiquement proche
des légumineuses cultivées en Europe que d'autres espèces de légumineuses, ce qui en fait
un choix privilégié dans de nombreux laboratoires pour des études de recherche
I.2.botanique :
I.1.2.la morphologie :
2
Chapitre I : Revue bibliographique
3
Chapitre I : Revue bibliographique
M. truncatula est un modèle privilégié pour l'analyse de divers processus biologiques, tels
que la coexistence des racines, la réaction aux stress environnementaux et le
développement des plantes. La petite taille, le court cycle de vie et la facilité de culture en
font un organisme modèle idéal pour les études de biologie végétale.
Est également connue sous le nom de luzerne tronquée, est remarquable. Cette plante
herbacée annuelle appartient à la famille des Fabaceae, sous-famille des Faboideae, et est
originaire du bassin méditerranéen. Elle est étroitement liée à la luzerne cultivée
(Medicago sativa) et peut atteindre jusqu'à 40 cm de hauteur .Comme toutes les espèces
du genre Medicago, M. truncatula présente des feuilles trifoliées composées de trois
folioles,
ce qui la rend facilement identifiable. Mais ce qui la distingue des autres légumineuses,
c'est sa capacité à former des associations symbiotiques avec des bactéries du sol pour
fixer l'azote atmosphérique. Cette caractéristique en fait une plante modèle des Fabaceae,
largement utilisée pour étudier les mécanismes de fixation de l'azote .De nombreux
cultivars de M. truncatula sont parfois cultivés comme plantes fourragères, car ils sont
riches en protéines et en nutriments. En outre, la petite taille et le cycle de vie court de
cette plante en font un organisme d'étude privilégié, facile à cultiver et à manipuler en
laboratoire .En somme, M.truncatula est une légumineuse herbacée annuelle aux
caractéristiques uniques, utilisée comme plante modèle grâce à sa capacité à former des
nodules fixateurs d'azote. Sa morphologie particulière, sa proximité avec la luzerne
cultivée et son utilité pour l'agriculture en font une plante digne d'intérêt pour les
chercheurs et les agriculteurs. (Huguet T et al, 1995), (Lesins et Lesins, 1979).
4
Chapitre I : Revue bibliographique
I.2.classification :
Règne Plantae
Clade Angiospermes
Clade Rosidées
Clade Fabidées
Ordre Fabales
Famille Fabaceae
Sous-famille Faboïdeae
Tribus Trifolieae
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Chapitre I : Revue bibliographique
Genre Medicago
Espèce Medicago truncatula
I.2.2Classification scientifique :
Règne Plantae
Embranchement Spermatophytes
Sous-embranchement Angiospermes
Super division Dicotylédones
Division Magnoliophyta
Classe Magnoliopsida
sous- classe Rosidae
Ordre Fabales
Famille Fabaceae (Légumineuses)
Sous-famille Faboïdeae
Tribus Trifolieae
Genre Medicago
Espèce Medicago truncatula
I.3.1.cicle de vie :
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Chapitre I : Revue bibliographique
M. truncatula est une plante herbacée annuelle qui a été largement utilisée comme modèle
pour étudier le développement des légumineuses. Son cycle de vie est court, d'environ 10 à
12 semaines de graine à graine, ce qui en fait un choix idéal pour les études de
développement.
La plante modèle M. truncatula est couramment employée dans les études en raison de son
génome séquencé et de ses propriétés propices à l'étude de la symbiose racinaire avec les
bactéries fixatrices d'azote. Quant à ses besoins de vie, voici quelques éléments essentiels :
• 1. La plante M. truncatula est une plante annuelle qui vit dans le bassin
méditerranéen, ce qui signifie qu'elle apprécie un climat tempéré à chaud. Il est
possible de la cultiver à différentes températures, mais elle se développe mieux à
des températures modérées, comprise entre 20 et 25 °C.
7
Chapitre I : Revue bibliographique
• 2. La lumière est essentielle pour M.truncatula, tout comme la plupart des plantes,
afin de pouvoir réaliser la photosynthèse. En plein soleil, elle se développe
davantage, mais elle peut supporter une certaine ombre partielle.
• 3. Le sol doit être correctement drainé afin d'éviter la détérioration des racines. On
préfère un sol légèrement acide à neutre. La plante est capable de supporter des sols
plutôt pauvres en nutriments.
• 4. L'eau est essentielle pour M. truncatula, mais elle peut supporter des périodes de
sécheresse modérée une fois qu'elle est bien établie. Il est essentiel de limiter
l'arrosage afin d'éviter l'engorgement du sol.
Comme nous l'avons déjà mentionné, la plante peut supporter des sols relativement
pauvres en nutriments. Toutefois, une alimentation équilibrée en engrais peut
encourager une croissance dynamique.
• 5-Comme nous l'avons déjà mentionné, la plante peut supporter des sols
relativement pauvres en nutriments. Toutefois, une alimentation équilibrée en
engrais peut encourager une croissance dynamique.
• 6. L'interaction symbiotique entre M. truncatula et des bactéries fixatrices d'azote
du genre Rhizobium se produit dans les racines, ce qui lui permet de fixer l'azote
présent dans l'air. La croissance et le développement de cette interaction sont
cruciaux dans des environnements où l'azote est restreint.
En somme, M. truncatula a une bonne réputation dans des régions de climat méditerranéen,
où il y a une bonne exposition au soleil, un sol bien drainé et des apports d'eau ponctuels.
Ses besoins de vie reposent également sur son interaction symbiotique avec les bactéries
fixatrices d'azote.
Un stress englobe tous les troubles biologiques causés par une agression quelconque sur un
être humain. D'après Levitt (1980), il s'agit d'un élément de l'environnement qui peut
engendrer une contrainte potentiellement néfaste sur un être vivant. Les émotions
stressantes
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Chapitre I : Revue bibliographique
• Stress biotiques :
• Stress abiotiques :
Le stress salin est défini comme une concentration excessive en sel. Le terme stress salin
s’applique surtout à un excès des ions, en particulier Na+ et Cl-.
La salinité est une contrainte majeure qui affecte la croissance et le développement des
plantes :
La majorité des plantes présentent une sensibilité accrue à la salinité pendant leurs
périodes de germination et de croissance. La variation de l'équilibre hormonal a été
mentionnée parmi les raisons de l'inhibition de la germination en présence de sel
10
Chapitre I : Revue bibliographique
(Ungar,1978etKabar,1986dansBouchoukh,2010).
Malgré la présence d'une forte teneur en sel dans les tissus des halophytes à l'état
adulte, leurs graines ne sont pas aussi sensibles au sel lors de la germination.
La salinité du sol limite souvent le stade de germination, qui est le plus sensible que
les autres stades.
*Les effets osmotiques du stress salin peuvent également limiter la croissance des
racines, ce qui limite les possibilités d’absorption des éléments nutritifs du so
11
Chapitre I : Revue bibliographique
b)Évolution de la nutrition :
La salinité a deux effets nutritionnels principaux sur les plantes : la toxicité directe causée
par l'accumulation excessive d'ions dans les tissus et un effet de salinité.
Équilibre nutritionnel causé par l'accumulation excessive de certains ions. La présence de
concentrations salines excessives dans l'environnement entraîne une détérioration de la
nutrition minérale des plantes.
. La présence d'ions Na+ dans la plante restreint l'absorption des cations essentiels comme
le K+ et le Ca2+. Le Na+ et le Ca+ seraient en concurrence pour les mêmes sites de
fixation apoplasmique. Les ions Na+ et Ca2+ interagissent
Il est possible d'estimer : une réponse protectrice rapide associée à une réponse
d'adaptation à long terme. Les changements dans l'architecture de la plante et de sa
croissance (pousses et racines), les variations d'épaisseur des feuilles de la cuticule, la
12
Chapitre I : Revue bibliographique
Ces changements sont associés à différentes modifications cellulaires, telles que les
changements de la membrane et de la stabilité des protéines, une augmentation de la
capacité antioxydante et l'activation des voies de signalisation hormonales, en
particulier celles qui sont liées à l'hormone synthase .
Par exemple, des changements de lipides en réponse à un traitement de sel ont été
caractérisés dans les membranes soja profondes (Surjus et Durand, 1996) ainsi que
l'effet du stress de sel d'acide aminé, un acide organique, et la composition en hydrates
de carbone des racines, des bactéroïdes, et cytosol de luzerne (Medicago
sativaFougère et al, 1991). En réponse au stress salin, le tréhalose a également été
proposé comme un smoprotectant dans Lotus japonicus (Lopez et al, 2006) alors
qu'une augmentation de la proline et le contenu de la glycine bétaïne, ainsi que dans la
protéase et les activités ATPase a été décrite dans l'arachide. (Trinchant et al, 2004)
ont étudié les réponses à long terme de plantes de luzerne nodulées au stress salin,
avec un intérêt particulier pour la proline et l'accumulation de bétaïne, cloisonnement,
et le métabolisme. Trigonelline, une bétaïne de la pyridine, qui fonctionne également
comme un régulateur du cycle cellulaire ,accumule dans des feuilles de sel de soja
13
Chapitre I : Revue bibliographique
L'accumulation de proline a été montré pour induire une tolérance à un stress de sel, et
(Mahajan, 2005)
14
Chapitre I : Revue bibliographique
➢ Examinons à présent l'objectif de cette étude, qui consiste à trouver un gène lié à la
protection cellulaire contre le stress salin, et à identifier d'autres gènes présentant
un profil d'expression similaire, car ils jouent également un rôle dans le stress salin
chez le modèle Medicago truncatula.
15
Chapitre II :
Matériels et
Méthodes
Chapitre II :matériel et methode
II.1 Matériel :
• INRAE :
Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement
• NCBI :Le National Center for Biotechnology Information (NCBI) est un centre de
recherche américain qui fait partie des National Institutes of Health (NIH). Il abrite
plusieurs bases de données importantes pour la biotechnologie et la biomédecine..
Il a été utilisé pour identifier le nom du gène et ses informations
• MTGEA :
Le Gene Expression Atlas de M.truncatula est une base de données qui permet de
créer un atlas des profils d'expression génique pour la plupart des gènes de cette
variété de légumineuses. Cette base de données est utilisée car Medicago truncatula
est un modèle important pour la génétique, la génomique et la sélection des
légumineuses.
• python:
Python est un langage de programmation polyvalent utilisé dans une variété de
domaines, notamment le développement de logiciels, la science des données, le
machine learning et les applications Web.
• GENBANCK:
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Chapitre II :matériel et methode
Une base de donnés de séquence ADN ,contenant les séquences des de nucléotides
qui sont accessibles au public et leur traduction en protéines.
• Excel : Logiciel tableur.
II.2. Méthodes :
19
Chapitre II :matériel et methode
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Chapitre II :matériel et methode
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Chapitre II :matériel et methode
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Chapitre II :matériel et methode
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Chapitre II :matériel et methode
➢ les regrouper dans un nouveau fichier excel avec leur moyenne calculer.
24
Chapitre II :matériel et methode
Grace a ce langage de programmation ,nous avons pu créer ce code qui est utilisé pour
analyser les données d'expression d'un gène spécifique (probset ID) et de ses ensembles de
sondes associés en fonction de leurs distances.
25
Chapitre II :matériel et methode
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Chapitre II :matériel et methode
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Chapitre II :matériel et methode
Cette analyse permet d'identifier les ensembles de sondes les plus similaires à l'ensemble
de sondes d'intérêt en fonction de leurs modèles d'expression.
28
Chapitre III :
Résultats et
discussion
Résultats et discussion
III.1 Résultats :
En analysant les données d’expression de 20 gènes sélectionnés par le logiciel python , nous
avons pu observer les résultats suivant :
Une carte de chaleur, également connue sous le nom de heatmap,qui est un outil de
visualisation de données ,on utilisant des couleurs pour représenter les zones les plus visitées
et les moins visitées
Dans cet carte de chaleur , on distingue 20 gènes de M.truncatula, ces gènes sont regroupés
entre eux dans un graphique en couleur , où les coleurs les plus froid )du violet aux bleu )
represent el’ensemble des gênes les plus proches aux géne références LOC11422042 selon
leur distances , et les couleurs les plus chaudes )du vert aux jaune ) représente l’ensemble des
gènes les plus loin du gène clé .
29
Résultats et discussion
➢ L’utilisation des probset ID des différents gènes nous permis de trouver l identiant des
gènes correspondents.
30
Résultats et discussion
dehydrogenase
Mtr.43389.1.S1_at Medtr7g112403 protein 0.279185
dehydration-induced 19
Mtr.18010.1.S1_at Medtr4g101090 AUTOPHAGY-RELATED 0.288781
PROTEIN
Mtr.40034.1.S1_at Medtr1g104930 hydroxyisoflavanone 0.291311
dehydratase, Carboxylesterase
Mtr.12862.1.S1_at Medtr1g103150 Histone acetyltransferase of the 0.295135
GNAT family
Mtr.24373.1.S1_at Medtr1g083780 zinc-binding protein. 0.29837815:08
III.2 Discussion :
Lorsque les plantes sont confrontées à des conditions environnementales difficiles,tels que
une forte salinité (stress salin ) développent des réactions contrôlées par des voies de
signalisation qui dépendent des changements dans l'expression de leurs gènes.
Dans cette étude, en se concentrant sur la voie de l'ABA, nous avons pu identifier différents
groupes de gènes impliqués dans les réponses des plantes aux stress salins, en fonction de leur
rôle spécifique :
➢ Des genes code pour les proteines :Les plantes d'Arabidopsis thaliana développent des
mécanismes de tolérance au stress salin grâce à des protéines spécialisées. Ces
protéines jouent des roles essentielle comme l'équilibre des ions, en préservant les
protéines et les membranes, en ajustant la concentration des solutés à l'intérieur des
cellules et en évitant la perte de turgescence, les processus physiologiques restent
stables et efficaces.(SaharSellamiJallouli ,2019)
➢ Les genes codants pour Les facteurs de virulence :L’étudevise a comprendre comment
les plantes réagissent aux stress salin chez la M.truncatula en analysant les facteurs de
31
Résultats et discussion
➢ Les facteurs de transcription : Les facteurs de transcription sont reconnus pour leur
influence dans la régulation de l'expression génique et jouent un rôle essentiel dans
l'immunité innée des plantesParmi les différentes familles de facteurs de transcription
identifiées on cite la calmoduline qui est une proteine qui contrôle l’activité de
facteurs de transcription en réponse aux conditions salines ,l’isoforme CAM4
augmente la transcription des genes de stress gérés par le facteur MYB , améliorant
ainsi la capacité de la plantes à résister aux stress salin . (BenoîtRanty*, Didier
Aldon et Jean-Philippe Galaud,2007)
➢ Groupes qui codes pour les kinases dépendantes de calcium :La protéine kinase
CPK3, activée par le calcium, est primordiale pour qu'Arabidopsis thaliana s'adapte au
stress salé. Son activation est indépendante des voies de signalisation MAPK. Lorsque
le gène cpk3 est muté, la plante devient plus sensible au stress salin, mais une
expression élevée de CPK3 améliore sa résistance à ce stress.(Norbert
Mehlmer,2010)
➢ Groupe de genes codes pour les Proteines type dehydrine (DHN) et lateembreyo genes
isabundant (LEA) :Ces proteines sont hydrophile et joue un roleimportant pour
protéger les cellules de la M.truncatula lorsqu'elles subissent le stress salin , Elles
contribuent à la tolérance de cette plante en protégeant les structures cellulaires et en
régulant l'équilibre osmotique. Une étude approfondie de ces protéines permettrait de
mieux comprendre leurs fonctions précises dans la réponse de la plante au
stress.(OUIS Miryam et BELKHODJA Moulay,2012)
➢ Les Proteines ribosomal :Le role des proteines ribosomales dans le strss salin chez
l’Arabidopsis thaliana est lié a la régulation de la croissance et de la reponse au stress
salin.Les individus présentant certaines mutations, en particulier dans les voies de
32
Résultats et discussion
➢ Groupes des proteines transmembranaire :Le role des transmembranaire dans le stress
salin chez l’Arabidopsis thaliana est étudié dans plusieur travaux scientifique .des
protéines de défense spécialisées, comme les glucanases et les protéines PR
(Pathogenesis-related) joue un rolecurcial aux stress envirommentaux ,Ces protéines
protègent les cellules végétales contre les dommages causés par le stress aussi sert a
modifier la fonctionnalité des plantes , en participant au transport des ions .
➢ les facteurs de transcription de type C2H2 :les facteurs de transcription de type C2H2
sont essentiels pour permettre aux plantes, comme Arabidopsis thaliana, de faire face
aux défis environnementaux, tels que le stress salin . Ils assurent une régulation fine
des processus cellulaires lorsque la plante est soumise à des stress abiotiques.permet
de modifier l’expression du gène impliqué dans la gestion du stress , tels que la
biosynthèse de métabolite secondaires et la régulation de l’homeostasie ionique.
➢ Les supafamily des protéines :Les supafamilyde proteines joue un role crucial dans la
gestion du stress salin chez arabidopsis thaliana tels que : Proteines PPR
(PentatricopeptideRepeat) et Proteines F-box
• PPR (Pentatrico peptide Repeat) :Les PPR sont impliqué dans la maturation des ARN
des organites qui influence l’expression des gène des organites
• Proteines F-box : Les proteines F box sont impliqué dans la régulation de la
dégradation des protéines et jouent un role dans la réponse au stress salin .Face aux
defis du stress salin,les plantes mettent en place des mécanismes de signalisation,
réglés par différentes groupes du genes tels que : les protein esribosomals , les facteurs
de transcriptions,les facteurs de virulences et les kinases .
34
Conclusion et
perspectives
Conclusion et perspectives
➢ Concernant notre perspective, pour les projets à venir, notre objectif est d'étendre et
d'enrichir notre travail :
L'identification de la fonction des gènes peut être réalisée en combinant diverses
méthodes expérimentales, telles queles analyse in silico ou bien analyses in vivo et
invitro.
Ces gènes sont capables de s'adapter à d'autres situations stressantes, leur
permettant ainsi de s'engager sur la voie de Medicago truncatula.
35
Référence
bibliographique
Références bibliographique :
1-Revue des Régions Arides - Numéro Spécial - n° 35 (3/2014) - Actes du 4ème Meeting
International ‘’Aridoculture et Cultures Oasisennes : Gestion des Ressources et Applications
Biotechnologiques en Aridoculture et Cultures Sahariennes : perspectives pour un développement
durable des zones arides,17-19/12/2013
7-Merakchi, D. (2015). Influence des métaux lourds sur la croissance des bactéries
isolées à partir des nodules des légumineuses Hedysarum coronarium et Medicago
truncatula. Mémoire de Master, présenté et soutenu publiquement le 16 juin 2015. Sous la
direction de Tchanderli Braham Safa, Université des Frères Mentouri Constantine Faculté
des Sciences de la Nature et de la Vie
11- Aouane, B., & Aouane, A. (2023). Caractérisation des endosymbiotes chez la
légumineuse Trigonella gladiata Stev. Mémoire de Master, Domaine : Sciences de la
2
Nature et de la Vie, Filière : Ecologie et environnement, Spécialité : Ecologie microbienne.
Université Ferhat Abbas Sétif 1, Constantine, Algérie.
14- Huguet T., Prosperi J.M.. 1995. Medicago truncatula: a legume model-plant. 171-
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DOCTEUR DES UNIVERSITÉS DE LIMOGES ET CARTHAGE et soutenu
publiquement le 25/03/2014. UNIVERSITE DE CARTHAGE FACULTE DES
SCIENCES DE BIZERTE Département de Biologie et Physiologie Végétales
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Labbé, Gerald A. Tuskan, and Jin-Gui Chen Titre de l'article : "Silencing
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