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    R TD1

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    Abdo Elmamoun
    Le document décrit différentes représentations graphiques utilisées en statistique avec le logiciel R, notamment des diagrammes en bâtons, camemberts, histogrammes, boîtes à moustaches, diagrammes cartésiens, diagrammes en fagot et diagrammes temporels. Il utilise un jeu de données sur la santé mentale en prison pour illustrer ces graphiques.

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    R TD1

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    Le document décrit différentes représentations graphiques utilisées en statistique avec le logiciel R, notamment des diagrammes en bâtons, camemberts, histogrammes, boîtes à moustaches, diagrammes cartésiens, diagrammes en fagot et diagrammes temporels. Il utilise un jeu de données sur la santé mentale en prison pour illustrer ces graphiques.

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    Chapitre 2

    Introduction à la statistique avec R

    Représentations Graphiques

    1 Pr. Bruno Falissard


    Plan
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    • Variables qualitatives
    • Variables quantitatives
    • Diagramme en bâtons, camemberts,
    histogrammes, boîtes à moustaches,
    diagrammes cartésiens, diagrammes en fagot

    2 Pr. Bruno Falissard


    Le fichier smp.c
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    • L’étude santé mentale en prison (smp)


    – 799 détenus tirés ausort
    – Âge
    – Profession
    – Dépression, schizophrénie (diagnostic issudu
    consensus de deux cliniciens)
    – Gravité de la pathologie éventuelle
    – Nombre d’enfants

    3 Pr. Bruno Falissard


    Le fichier smp.c
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    • L’étude santé mentale en prison (smp),variables


    évaluant la personnalité des détenus
    – Recherche de sensation (rs) : curiosité,attrait pour
    le risque et lanouveauté
    – Évitement du danger (ed) : timidité,précautionneux
    – Dépendance à la récompense (dr) : sensibilitéaux
    relations sociales, influençable

    4 Pr. Bruno Falissard


    Le fichier smp.c
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    > smp.c <- read.csv2("D:/MOOC/Data/smp1.csv")


    > str(smp.c)
    'data.frame': 799 obs. of 9 variables:
    $ age : int 31 49 50 47 23 34 24 52 42 45 ...
    $ prof : Factor w/ 8 levels "agriculteur",..: 3 NA 7 6...
    $ dep.cons : int 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 ...
    $ scz.cons : int 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
    $ grav.cons: int 1 2 2 1 2 1 5 1 5 5 ...
    $ n.enfant : int 2 7 2 0 1 3 5 2 1 2 ...
    $ rs : int 2 2 2 2 2 1 3 2 3 2 ...
    $ ed : int 1 2 3 2 2 2 3 2 3 2 ...
    $ dr : int 1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 ...

    5 Pr. Bruno Falissard


    Diagramme en bâton
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    > barplot(table(smp.c$prof))
    200
    150
    100
    50
    0

    agriculteur artisan cadre prof.intermédiaireemployé ouvrier autre sans emploi

    6 Pr. Bruno Falissard


    Diagramme en bâton
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    > barplot(table(smp.c$prof))

    > str(smp.c$prof)
    Factor w/ 8 levels "agriculteur",..: 3 NA 7 6 8 6 3 2 6 6 ...
    > table(smp.c$prof)

    agriculteur artisan autre


    6 90 31
    cadre employé ouvrier
    24 135 227
    prof.intermédiaire sans emploi
    58 222

    7 Pr. Bruno Falissard


    Diagramme en bâton
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    > barplot(table(smp.c$prof))
    200
    150
    100
    50
    0

    agriculteur artisan cadre prof.intermédiaireemployé ouvrier autre sans emploi

    8 Pr. Bruno Falissard


    Camembert
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    > pie(table(smp.c$prof))

    employé
    cadre
    autre

    artisan

    agriculteur
    ouvrier

    sans emploi
    prof.intermédiaire

    9 Pr. Bruno Falissard


    Histogramme
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    > hist(smp.c$age)

    120
    100 Histogram of smp.c$age
    Frequency

    80
    60
    40
    20
    0

    20 30 40 50 60 70 80

    smp.c$age

    10 Pr. Bruno Falissard


    Histogramme
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    > hist(smp.c$age,col="grey",main="",
    xlab="age")

    120
    100
    Frequency

    80
    60
    40
    20
    0

    20 30 40 50 60 70 80

    age

    11 Pr. Bruno Falissard


    Boîte à moustache
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    > boxplot(smp.c$age,xlab="age")

    80
    70

    25% desdonnées
    60
    50

    25% desdonnées
    40

    25% desdonnées
    30

    25% desdonnées
    20

    age

    12 Pr. Bruno Falissard


    Boîte à moustache
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    > boxplot(smp.c$age~smp.c$rs,ylab="age",
    xlab="Recherche de sensation")

    80
    70
    60
    age

    50
    40
    30
    20

    1 2 3

    Recherche de sensation

    13 Pr. Bruno Falissard


    Diagramme cartésien (« ou diagramme en x,y »)
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    > plot(smp.c$age,smp.c$n.enfant)

    14 Pr. Bruno Falissard


    Diagramme cartésien (« ou diagramme en x,y »)
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    > plot(jitter(smp.c$age),
    jitter(smp.c$n.enfant))

    15 Pr. Bruno Falissard


    Diagramme temporel
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    > repdat <- read.csv2("C:/Users/Bruno/outils hdrs.csv")


    > str(repdat)
    'data.frame': 1053 obs. of 3 variables:
    $ NUMERO: int 96 96 96 96 96 96 96 96 157 157 ...
    $ VISIT : int 0 4 7 14 21 28 42 56 0 4 ...
    25
    $ HDRS : int 34 26 12 7 5 1 1 1 27 19 ...
    repdat$HDRS

    20
    15
    10

    n=146 n=139 n=137 n=133 n=129 n=127 n=122 n=120

    0 4 7 14 21 28 42 56

    repdat$VISIT

    16 Pr. Bruno Falissard


    Diagramme temporel
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    > library(gplots)
    > plotmeans(repdat$HDRS~repdat$VISIT,gap=0,
    barcol="black")
    25
    repdat$HDRS

    20
    15
    10

    n=146 n=139 n=137 n=133 n=129 n=127 n=122 n=120

    0 4 7 14 21 28 42 56

    repdat$VISIT

    17 Pr. Bruno Falissard


    Diagramme en fagot
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    > interaction.plot(repdat$VISIT,repdat$NUMERO,
    repdat$HDRS,lty=1,legend=FALSE)
    mean of repdat$HDRS

    40
    30
    20
    10
    0

    0 4 7 14 21 28 42 56

    repdat$VISIT

    18 Pr. Bruno Falissard


    Conclusion
    Introduction à la statistique avec R > Représentations Graphiques

    smp.c <- read.csv2("D:/MOOC/Data/smp1.csv")


    str(smp.c)
    barplot(table(smp.c$prof))
    pie(table(smp.c$prof))
    hist(smp.c$age)
    hist(smp.c$age,col="grey", main="",xlab="age")
    boxplot(smp.c$age,xlab="age")
    boxplot(smp.c$age~smp.c$rs,ylab="age",xlab=
    "Recherche de sensation")
    plot(smp.c$age,smp.c$n.enfant)
    plot(jitter(smp.c$age),jitter(smp.c$n.enfant))
    repdat <- read.csv2("D:/MOOC/Data/hdrs.csv")
    str(repdat)
    library(gplots)
    plotmeans(repdat$HDRS~repdat$VISIT,gap=0,
    barcol="black")
    interaction.plot(repdat$VISIT,repdat$NUMERO,
    repdat$HDRS,lty=1,legend=FALSE)

    19 Pr. Bruno Falissard

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