3) Génétique Bactérienne 2009

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Génétique bactérienne

HANDOR najat
L a b o ra t o i r e d e b a c t é r i o l o g i e - H S R -
EL ALAMI sanae
L a b o ra t o i r e d e b a c t é r i o l o g i e - H I S -
Plan
• Rappels
1.Génome
2.Génotype/ phénotype
3.Variations génotypiques/ Variations
phénotypiques
• Variations génétiques
1.Mutation
2.Acquisition d’un ADN exogène
3.Remaniement intra-génomique
• Importance des variations génétiques

2
Rappels

3
Génome bactérien
• Ensemble de gènes présents sur:
Les chromosomes
Les plasmides
• Les séquences nucléotidiques complètes des
génomes d’une 10ène d’espèces bactériennes sont
connues (ex: E.coli, Haemophilus, Helicobacter
pylori…)
Séquences consultables sur @ dans des
banques de données
Intérêt : comparaison entre séquences de
gènes étudiés avec ceux déjà connus
4
Génotype/ Phénotype
1. Génotype:

• Ensembles des informations codées par le génome

Transcription Traduction

Génome ARNm Protéines

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Génotype/ Phénotype
2. Phénotype:
• Expression du génotype
• Dépend souvent des conditions ext.
• Ex: Génotype β galactosidase +
Lactose X
Lactose

Synthèse de l’enzyme Pas de synthèse de l’enzyme

Phénotype
Phénotype
β galactosidase + β galactosidase -

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Variations:
Génotypiques/ Phénotypiques
1. Variations phénotypiques:
• Adaptation de la population bactérienne à son milieu
grâce à des variations de l’expression du génome

Sans modification de la structure

Ex: souche possédant l’équipement génétique pour


l’utilisation du lactose et qui en fonction du milieu va
synthétiser ou non une β galactosidase

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Variations:
Génotypiques/ Phénotypiques
2. Variations génotypiques:
• Modification du génome

Avec modification de la structure


• Circonstances: réplication ou autres
Caractères qui peuvent alors apparaître/
disparaître dans la descendance de la cellule
Variations génétiques
• Peuvent être:
Délétères
Moteur de l’évolution
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• 3 types de variations génétiques chez les bactéries:

1.Mutations
2.Acquisition d’ADN exogène
3.Remaniement intra-génomique

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1. Mutations

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1. Généralités :
• Variation génotypique qui va aboutir à un phénotype nv
• Circonstances: réplication de l’ADN ( le + svt)
• Il peut s’agir d’une:
Délétion
Insertion
Substitution de nucléotides
• Mutation sur un seul nucléotide
mutation ponctuelle
• Peuvent être provoqués par des agents mutagènes :
(ex: UV, RX..)

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2. MEE des mutations :

104 cellules

Gélose
+
Sm

Bactéries Sm S
104 cellules

108 cellules

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3. Régulation génétique :
• Malgré ces mutations la structure génomique reste
relativement stable

• Systèmes de réparation qui restaurent l’ADN initial,


grâce à des protéines capables de reconnaître les
régions mutées et à des enzymes qui réparent l’ADN
soit par:
Excision suivie de synthèse
Réparation post-réplicative

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3. Régulation génétique :
• En cas d’altération: la fc de l’apparition des cellules
mutantes Souche hypermutatrice

• Les souches hypermutatrices permettent aux


bactéries d’offrir à la sélection naturelle un gd nbr de
variants dt certains seront plus performants que la
souche sauvage
Moteur de l’évolution de l’espèce

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4. Caractères des mutations :

• Au nombre de 4:
A.Spontanéité
B.Rareté
C.Stabilité
D.Spécificité indépendante

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A. Spontanéité:

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2. MEE des mutations :

104 cellules

Gélose
+
Sm

Bactéries Sm S
104 cellules

108 cellules

17
109 cellules

106 cellules

102 cellules

0.1 ml

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B. Rareté :
• Expérience de Lederberg: caractère spontané/ rare

• 108 cellules : 1 seul mutant résistant

• Fc s’exprime par le taux de mutation:


Probabilité qu’a une mutation d’apparaître ds 1
intervalle de tps compris entre 2 divisions
Probabilité d’observer 1 individu mutant spontané ds
1 population microbienne

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B. Rareté :

Ex: Taux de mutation de 10-6 pr 1 caractère donné signifie


que ds 1 population de 106 bactéries l’une d’elles est 1
mutant spontané pr ce caractère

• Taux compris entre 10-4 et 10-20 ( agents mutagènes)

• Intérêt: résistance aux ATB

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C. Stabilité :

• Nv génotype transmis de génération en génération


• Une seconde mutation peut redonner à la souche son
phénotype antérieur

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D. Spécificité indépendante :
• Une bactérie mutante pr 1 caractère conserve ses autres
caractères intacts

• Notion de mutation simultanée:


Taux de mutation (TM) simultanée= TM pr chaque caractère
Ex: pr une souche le TM pr la R à la rifampicine est de 10-4
et de taux et de 10-6 pr la sterptomycine
TM= 10-4 x 10-6 = 10-10

Emergence de souche R aux 2 ATB est très peu probable


Intérêt: Justification polyATB / ex : ttt de la
tubérculose

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5. Expression phénotypique des
mutations:
• Les mutations se manifestent soit par:
Apparition d’un nv phénotype
Phénotype muté ≠ du phénotype initial
Mort de la cellule
Mutation létale
Pas de modification
Mutation silencieuse

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2. Acquisition d’ADN exogène

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• Transfert d’1 réplicon (unité génétique capable
d’autoréplication) d’une cellule à une autre
• Cellule donneuse + cellule receveuse
• Zone d’homologie
recombinant: génotype/ phénotype ≠
• 3 processus:
A.Transformation
B.Conjugaison
C.Transduction

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A. Transformation
Expérience de Griffith (1928)

26
A. Transformation
16 ans plus tard…..
Avery, Mac Leod et Mac Carthy montrent que le « principe
transformant » impliquée dans cette transformation est l’ADN

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Fragment d’ADN Cellule receveuse
issus d’1 cellule
donneuse 1. La cellule receveuse
absorbe l’ADN de la
cellule donneuse

ADN non intégré 2. Recombinaison entre


(en cours de ADN cellule donneuse et
dégradation) ADN cellule receveuse

Cellule transformée sur le plan


génétique
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A. Transformation
• Conditions:
1. Cellule receveuse compétente (paroi permet le
passage trans-pariétal d’ADN: naturellement/
artificiellement)
2. Zone d’homologie
• L’origine du matériel génétique transféré n’a aucune
importance mais la transformation est optimale
lorsque le lien de parenté est étroit entre la bactérie
donatrice et réceptrice
Transfert entre espèce possible

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B. Conjugaison
• les organismes ont mis au point un système leur
permettant de s'échanger du matériel génétique, en
particulier des plasmides
• Processus: 2 cellules entrent en contact et
s'échangent toute une partie de leur matériel
génétique
• Ce mécanisme est particulièrement important à�
l'intérieur d'une même espèce, mais le phénomène
de conjugaison peut également avoir lieu entre des
organismes qui ne font pas partie de la même espèce

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B. Conjugaison
Expérience de Lederbreg et Tatum (1946)

Mutant Mutant
A+B+C-D- A-B-C+D+

Mutant
A+B+C+D+
31
B. Conjugaison
• La qualité du donneur dans la conjugaison est conféré
par 1 plasmide appelé facteur de fertilité (F)
• Code pr la synthèse des pili sexuels qui jouent un rôle
ds l’accolement des 2 bactéries qui vont conjuguer

• Bactérie F+
Bactérie mâle
• Bactérie F-
Bactérie femelle

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Quand le facteur F est transféré
d’une cellule donneuse F+ à une
cellule receveuse F- cette
dernière est convertie en cellule
F+

33
B. Conjugaison
1.Recombinaison
entre facteur F et 2.Insertion du facteur F
chromosome se fait à ds chromosome
1 endroit spécifique
de chaque molécule

Quand le facteur F s’intègre ds le chromosome d’une


cellule F+ :
Formation d’1 cellule à haute fc de recombinaison HFr
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B. Conjugaison
1. Réplication et 2. Recombinaison entre
transfert d’1 partie du fragment chromosome
chromosome HFr et chromosome F-

• Quand une cellule HFr donneuse transmet une partie de son


chromosome à une cellule receveuse F- : résultat cellule F-
recombinée
• Elle demeure F- si le facteur F ne passe pas entier en cas de
conjugaison
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C. Transduction

• ADN est transféré d'une espèce à une autre via


des virus ou des phages
• Certains types de virus sont des organismes
capables d'intégrer leurs matériels génétiques
dans l'hôte et s'inspirent du génome de l'hôte
pour donner naissance à de nouvelles particules
virales

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C. Transduction

• Ils peuvent amener par erreur une partie du


matériel génétique de l'hôte et comme ces
organismes n'ont pas une spécificité d'hôte très
importante, ils sont capables de passer d'une
espèce à une autre et donc de transférer du
matériel génétique par erreur d'une espèce à une
autre

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Bactérie donneuse

2. -ADN phage répliqué


3. - Assemblage par
1. Phage infecte une -Chromosome
erreur de l’ADN
cellule bactérienne bactérien fragmenté
bactérien ds capside
donneuse virale
- Libération des phages
contenant de l’ADN
bactérien après lyse
cellule donneuse

Bactérie recombinée 5. Recombinaison:Bactérie receveuse


bactérie recombinée
4. Infection d’1 nvlle
avec génotype cellule
≠ receveuse par
bactérie donneuse + contenant ADN
phage
receveuse bactérien
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Acquisition de l’ADN exogène

Transformation Conjugaison Transduction

Vecteur ADN Plasmide Phage

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3.Remaniement intra-génomique

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• Modification de l’organisation du génome (/ ex: ordre
des gènes)
Déplacement de transposons d’un site génomique à
un autre
des régions génomiques vont être éloignées ou
rapprochées l’une de l’autre

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Importance des variations
génétiques

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• Source ce variabilité chez les bactéries

• Ces phénomènes de transferts, de recombinaison ou de


remaniement génétique sont responsables
Adaptation des bactéries à leur milieu
Ex: caractères de résistance aux ATB
Adaptation des bactéries à un milieu riche en ATB

• Usage en biologie expérimentale en biotechnologie:


Etude structure/ fonction des régions génomiques ou
de gènes
Clonage et expression des gènes dans des cellules
hétérologues

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Récapitulation
• Mutation:
Anomalie réplication ADN
1 ou qlq nucléotides
Apparition/ disparition brutale et héréditaire
d’1 caractère
• Acquisition d’ADN exogène
Bactérie donneuse/ receveuse
Recombinaison/ réassortiment (transmis à la
descendance)
• Remaniement intra-génomique
Modification de l’organisation du génome et qui
aboutit à 1 génotype nv
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Merci

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