Dopo l'armistizio dell'8 settembre 1943 l'Italia centrale e settentrionale fu occupata dalle truppe tedesche e il campionato nazionale di calcio fu interrotto. Al suo posto le Federazioni organizzarono vari campionati a carattere locale. Alcune squadre della regione toscana (Forte dei Marmi, Carrarese, Montecatini, Lucchese e Massese) presero parte al Campionato Alta Italia 1944, vinto dai Vigili del Fuoco della Spezia; alla fase finale di quest'ultimo presero parte esclusivamente club che si trovavano a nord della Linea Gotica, a causa dell'esclusione delle squadre laziali e toscane (che avevano preso parte alla fase eliminatoria regionale) dovuta al fatto che il fronte di guerra aveva raggiunto la loro regione.
Nella stagione seguente i comitati regionali organizzarono numerosi tornei calcistici locali. La Coppa Toscana prevedeva nove gironi di cui tre gestiti dal comitato provinciale di Livorno. Le squadre vincenti i gironi A-F si scontrarono in un torneo a eliminazione diretta che avrebbe individuato una delle due finaliste. Le vincenti dei gironi G-I, quelli gestiti dal comitato provinciale di Livorno, si scontrarono in un triangolare a girone semplice (partite di sola andata in campo neutro) per determinare la seconda finalista. Le finali tra le vincenti dei gironi A-F furono disputate dalla Fiorentina e dall'Empoli, che venne superato per 1-0 nella prima gara, e perse per 3-2 anche nella seconda. La finalissima con la vincente del campionato della provincia di Livorno si disputò il 29 luglio tra la Fiorentina e i biancoverdi della Pro Livorno e fu vinta dai gigliati per 3-1.
Il campionato toscano di guerra faceva parte del campionato misto di Divisione Nazionale 1944-1945 e metteva in palio tre posti per le finali interregionali per l'assegnazione del titolo di Campione dell'Italia Liberata.[3][4] Tuttavia problemi organizzativi (tra cui l'eccessivo protrarsi dei campionati regionali) impedirono l'effettuazione delle finali interregionali (a cui avrebbero dovuto partecipare sedici squadre centromeridionali).[5]
Nota: Si può supporre che il risultato di Livorno-ISU (1-1 sul campo il 15 aprile) fosse stato modificato a tavolino in favore del Livorno (il comunicato ufficiale n. 2 del Comitato Provinciale non lo omologò per reclamo del Livorno e fu inviata la documentazione al Comitato Regionale affinché decidesse sul reclamo) in quanto a fine girone Livorno e ISU risultarono in vetta a pari punti, richiedendo uno spareggio che fu vinto dal Livorno per forfait degli avversari (17 giugno 1945).
^Storia 1940-1949, in Empoli F.C. Official Website, Empoli F.C. S.p.A.. URL consultato il 20 gennaio 2015 (archiviato dall'url originale il 15 dicembre 2015).
Calcio
Italia
Fiorentina
Pro Livorno
Empoli
Certaldo
Poggibonsi
Quarrata
Livorno
Solvay Rosignano
Cecina
Piombino