Orten har fått sitt namn efter pilgrimerna som på väg till Olav den heliges grav i Nidaros (Trondheim) stannade till vid pilgrimskällan och drack av det rena vattnet. Enligt historierna som berättats genom tiderna var träden runt pilgrimskällan full av käppar då pilgrimerna blev kvitt sina krämpor när de drack av vattnet. Än i dag är pilgrimskällan ortens primära vattentäkt.
Tätorten Pilgrimstad växte upp som ett brukssamhälle kring ett sågverk som anlades 1905.
På 1920-talet köpte familjerna Lycke och Busch sågverket i Pilgrimstad. Tor Busch fick uppdraget att starta upp verksamheten som legat nere en tid.
Sågverket i Pilgrimstad växte och trävarorna exporterades runt om i Europa.
Efter andra världskriget utvecklades företaget vidare under Tor Busch ledning. Sågverket lades ner 1950 och i dess ställe etablerades en
wallboardfabrik.
1964 sålde familjerna Lycke och Busch företaget till skogsindustrikoncernen Ström-Ljusne AB, vilken senare förvärvades av Bergvik och Ala AB som drev fabriken vidare till 1986,
och i dess lokaler har nu ett antal mindre industrier etablerats, bland andra en husfabrik och ett mikrobryggeri, Jämtlands Bryggeri.
^Kodnyckel för SCB:s statistiska tätorter och småorter - Koppling mellan gammalt och nytt kodsystem, SCB, 11 november 2021, läs online.[källa från Wikidata]