– Israel är i ett försvarskrig mot Hamas, inte mot det palestinska folket, sa det israeliska utrikesministeriets juridiska rådgivare Tal Becker under sessionen.
Han poängterade att det som kännetecknar ett folkmord, det vill säga att avsiktligt förstöra ett folk helt eller delvis, saknas totalt i den pågående militäroperationen.
Det israeliska team som uppträdde vid Internationella domstolen består av landets främst juridiska experter, vilket anses reflektera landets oro över ett kommande domsutslag.
Israel brukar i allmänhet avfärda FN:s rättsinstanser som partiska.
Folkmordsanklagelserna betecknades av Israel i rätten under fredagen som djupt förvrängda och ondskefulla.
Man presenterade långa redogörelser för Hamas blodiga massaker den 7 oktober, och förnekade att det skulle vara regeringens politik att förgöra Gazas invånare.
Israel har också vidtagit åtgärder för att lindra den humanitära krisen i det palestinska området, sa man.
Svar på en detaljerad presentation av Sydafrika
Dagen innan hade Sydafrika presenterat sina argument för varför man ska fälla Israel för dess agerande i Gaza.
– Israels folkmordsavsikter bygger på tron att fienden inte bara är Hamas militära flygel eller Hamas i allmänhet, utan är inbäddad i det palestinska livet i Gaza, sa advokaten Tembeka Ngcukaitobi under sitt anförande i rättssalen.
Till stöd för det här angav man bland annat att största delen av de över 23 000 dödade är kvinnor och barn, att skadade inte får sjukhusvård, och att majoriteten av Gazaborna har drivits från sina hem och lider stor brist på mat och rent vatten.
Både Israel och Sydafrika har förbundit sig att följa Folkmordskonventionen från 1948, som handlar om att stater inte ska begå folkmord och att man dessutom har en plikt att förhindra folkmord.
Därför handlar Israels brott också om att landet inte har avvärjt ett folkmord på Gazaremsan, menar man från den sydafrikanska sidan.
Skadat anseende den största påföljden?
Sydafrika vill också att domstolen utfärdar en order om att Israel omedelbart ska stoppa de militära aktionerna i och mot Gaza.
Det kan bli politiskt kostsamt för den israeliska premiärministern Benjamin Netanyahu som vidhåller att Israel har rätt att försvara sig tills man har uppnått vad han beskrivit som en ”total seger”
Själva rättsprocessen om folkmordsanklagelserna kommer att ta åratal, och även om FN-domstolens beslut är juridiskt bindande kan man inte utmäta straff.
En fällande dom kan däremot påtagligt skada Israels internationella anseende, och redan den pågående rättsprocessen i sig anses öka trycket på Netanyahus regering att avsluta militäroperationen i Gaza.
Det är en bland annat en grupp på 57 muslimska länder som stöder Sydafrika i rättsprocessen, medan USA och Storbritannien hör till de länder som motsätter sig folkmordsanklagelserna.