Minister Kiren Rijiju, som ansvarar för geovetenskaper, skriver på sociala medietjänsten X att resultatet 52,9 grader berodde på ett sensorfel som förvrängde resultatet med tre grader.
Den rätta siffran är 49,9 grader.
Resultatet 52,9 uppkom på bara en enda mätstation i Mungeshpur, vilket genast väckte meteorologernas misstankar. Indiens meteorologiska institut började genast utreda saken.
Indiens högsta temperatur någonsin är alltså fortfarande 51 grader. Det rekordet mättes i öknen i delstaten Rajasthan 2016.
Över 30 valarbetare dog i hettan
Samtidigt uppgav en högt uppsatt valtjänsteman att minst 33 indiska valarbetare avled under den sista röstningsdagen i parlamentsvalet på lördagen, och detta bara i en delstat. Enligt tjänstemannen dog de av hettan.
Flera dödsfall har rapporterats i värmeböljan i Indien, men att tiotals valarbetare dör på en och samma dag är exceptionellt.
I Indien är man van vid höga temperaturer, men klimatförändringen har gjort att värmeböljorna är fler, längre och intensivare än förr.
I valet ser hindunationalistiska premiärministern Narendra Modi ut att gå mot en tredje jordskredsseger i följd. Det officiella valresultatet väntas på tisdag.
Källor: AFP, STT