2019 5/30 タイトル修正、関連ツール追加 バクテリアに感染するウイルスであるファージは、バイオインフォマティクスに独自の課題をもたらす。どのくらいの量のDNAをキャプシドにパッケージングすることができるかには限界があり、したがってファージゲノムは一般に短く、典型的には20〜100kbの範囲である。 必然的に、それらのゲノムはコンパクトである:ファージ遺伝子はそれらの細菌ホモログより短く、しばしば同時に転写され、そして隣接するオープンリーディングフレームはしばしば重なり合う(Kang et al、2017)。いくつかの場合では、ファージ遺伝子は互いにコードされている(Cahill et al、2017; Summer et al、2007)。対照的に、細菌遺伝子は一般に長く、遺伝子間スペーサーによって分離され、そして鎖を頻繁に交換する(Kang et al、2017)。ファージゲノム