Apuntes Biología - Repaso Parcial 1
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Apuntes Biología - Repaso Parcial 1
Interacciones moleculares
El agua es una molcula polar, porque la distribucin de sus enlaces covalentes hace
que se forme un dipolo. Adems, generan campos de electronegatividad positiva entre el
tomo de oxgeno propenso a atraer electrones- y los tomos de hidrgenos dispuesto a
cederlo-.
Cuando una molcula tiene un comportamiento ambivalente frente al agua se dice que es
una molcula anfiptica. Esto tiene su razn de ser porque presentan en su estructura
grupos polares, y tambin zonas de uniones covalente puras, que no son polares y por lo
tanto son hidrofbicas. Un ejemplo de esto es el cido graso, molcula compuesta por una
cadena carbonada (no polar-hidrofbica), con un grupo carboxilo (C-O-O-H), que por tener
oxgeno e hidrgeno genera una zona de polaridad, por lo que le permite interactuar con el
agua.
Biomolculas
A primera vista uno podra considerar que la materia viva tiene una diversidad infinita de
compuestos orgnicos. Sin embargo qumicamente los grupos funcionales son acotados, y
en trminos estructurales las molculas orgnicas pueden agruparse en 4 grupos
fundamentales. Protenas, Lpidos, cidos nucleicos y Glcidos.
1 - Protenas
Son las biomolculas ms abundantes, y las que tienen mayor variedad estructural y
diversidad funcional.
a- Composicin estructural.
Son macromolculas, es decir molculas formadas por molculas ms pequeas unidas
entre s por enlaces covalentes. En este caso, son compuestos por secuencias de
aminocidos, unidos entre s por un enlace peptdico. Los aminocidos son la unidad
estructural de las protenas. Presentan un carbono central (carbono alpha), unido a un
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grupo amino (H2N), un grupo carboxilo (COOH). Los otros dos electrones los usa con un
hidrgeno y le queda tiene un electrn libre para unirse a un radical (estructura variable).
Los aminocidos se unen entre s por enlaces peptdicos formando una cadena
peptdica. Se caracteriza por establecerse entre el grupo amino de uno de los
aminocidos, con el grupo carboxilo del otro aminocido. Es una unin Carbono-Nitrgeno.
Se d por condensacin, requiere aporte de energa, y libera una molcula de agua.
Las protenas polipeptdicas sern las nicas que adquieren un cuarto nivel
estructural. El ejemplo tpico es el de la hemoglobina, compuesta por 4 cadenas.
2 - cidos Nucleicos
Los cidos nucleicos son las macromolculas que contienen y transmiten la informacin
gentica, los precursores monomricos son los nucletidos.
Los nucletidos estn conformados por una base nitrogenada (que se llaman pricas
cuando tienen anillo doble: adenina y guanina, y pirimidnicas cuando el anillo es simple:
uracilo, timina y citosina), ms una pentosa (un azcar de 5 carbonos), sea Ribosa o
Desoxiribosa, y un grupo fostato (de uno a tres).
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Polimerizados por enlace covalente, los nucletidos forman los cidos nucleicos
responsables de transmitir la informacin gentica.
ADN & ARN Polmeros formados por 4 nucletidos
ADN Adenina y Timina; Citosina y Guanina
ARN Adenina y Uracilo; Citosina y Guanina.
3 - Glcidos
tienen una formula general de Cn (H2O)n donde "n" debe ser mayor de tres.
Es decir que la cadena de carbonos que componen la molcula debe ser de 3 o
ms. Son polialcoles (al menos dos alcoholes), aldehdos o cetonas.
Luego est el grupo de los oligosacaridos (los prefijos oligo/poli refieren a cuntos
monosacridos componen las molculas), que est formado por molculas de entre 3 y 20
monosacaridos, siempre enlazados por uniones glucosdicas. De estos compuestos, que
tiene una altisima variedad estructural, los que mayor inters biolgico presentan son las
Glucoproteinas. La parte glucdica es la que cumple funcin de reconocimiento y
sealizacion que tienen estas biomolculas: difrencia de lo propio de lo ajeno, distribucin
de biomoleculas entre diferentes tejidos, guas de procesos de migracin celular. Donde
estn los puntos reactivos, los alcoholes, es en la parte glucdica.
Los polisacridos son glcidos polimerizados de alto peso molecular. Por hidrlisis
(enzimtica o cida) pueden romperse las uniones glucosdicas, desagregndose en
monosacridos.
Los polisacridos se agrupan en dos tipos segn estn compuestos por un tipo nico o ms
de un tipo de monosacridos.
Homosacridos se denominan los polisacridos que tras hidrlisis se obtienen slo un tipo
de monosacrido.
A su vez, de segn qu tipo de enlace glucosdico se establezcan entre los monosacridos,
hay dos subespecies.
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1. con estructura glucosdica alpha (monmeros unidos forman cintas abiertas,
laxas. Al no curvarse la estructura de la cinta, no se establecen fuerzas
intermoleculares -puentes de hidrgeno-, lo que le brinda algo de hidrosolubilidad).
La funcin de estos polmeros es la de almacenamiento intracelular de energa, a
diferencia de la glucosa su mayor densidad molecular hace que estos compuestos
sean menos dispersos por smosis. El Almidn y el Glucgeno son dos ejemplos de
estas macromolculas. Ambas son molculas compuestas por glucosa. El primero
es la molcula que producen las clulas vegetales para el almacenamiento de
glucosa, en cambio el glocgeno es el que producen las clulas animales. las
clulas procariotas, producen estas macromolculas o slo son producidas por
organismos pluricelulares?
2. Con estructura glucosdica beta (cada una de las partes adquiere una
disposicin de torcin respecto a la que la antecede o precede, esto se debe al
tipo de unin glucosdica que establece. sto facilita la formaicin de puentes de
hidrgeno, aumentando la resistencia mecnica de la molcula y disminuyendo la
capacidad soluble. Este tipo de unin contituye molculas con una importante
funcin estructural como lo son la celulosa (presente en la pared celular de las
clulas eucariotas vegetales), la quitina (glcido que forma parte de los
exoesquelotos de insectos).
4 - Lipidos
Son el nico tipo de macromolculas que no son polmeros. Tienen una gran variedad
estructural, sin embargo comparten algunas caractersticas: no son solubles en compuestos
polares, estn conformados mayormente por tomos de Hidrgeno, Carbono y Oxgeno,
con una presencia mucho menor de Oxgeno en comparacin a los otros dos.
Dentro de las funciones que cumplen los lpidos pueden sealarse bsicamente dos. Una
es de reserva energtica ya que por su conformacin molecular (mucho menos presencia
de oxgeno), a misma masa la molcula de lpido rinde ms energa que la de un
carbohidrato. Por ser hidrofbicas, las molculas de lpidos pueden ser almacenadas en el
citoplasma celular sin generar resistencia omeosttica. La otra funcin central de los
lpidos es estructural: se encuentran en la membrana plasmtica, en la membrana
nuclear, en la vaina que cubre a las clulas nerviosas (mielina). Adems, es un efectivo
aislante trmico.
Suele clasificarse a los lpidos segn puedan o no formar jabones. Los que pueden son
los Saponificables y disponen de al menos un cido graso (la estructura del cido graso lo
hace anfiptico -tener una relacin dual con el agua-, la cabeza del cido graso -hidroxilo-
es polar, y su cola -hidrocarbonada- es no polar). Dentro de este grupo tiene una gran
importancia biolgica los Glicridos, que son steres (???) de Glicerol con cidos grasos.
Estas molculas forman parte del reservorio energtico citoplasmtico, son los lpidos
biolgicos ms abundantes. Otro grupo dentro de los lpidos que puden volverse jabones
son los fosfoacilglicridos (sinnimo de fosfolpidos?). Estn formados por una unin ester
(?) en el tercer carbono con el cido fosfrico. El cido fosfrico le brinda la caracterstica
de ser anfipticos (cabeza con fsforo -tomo electronegativo-, y cola no polar), su
funcin es estructural, se los encuentran en las membranas.
Los Glucolpidos establecen un enlace con otro tipo de alcohol, ya no el glicerol sino ahora
es esfingo. Este tipo de lipidos estn son los que conforman las membranas nerviosas.
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Los insoporificables derivan de la polimerizacin de un hidrocarburo de 5 carbonos, el
isopreno. (?)
Podemos ubicar dentro de este grupo a terpenos (presente en la la coenzima Q
-responsable del transporte de electrones en la cadena respiratoria-, tambin en las
vitaminas liposolubles A, E y K. En las plantas se la ubica en el ltex y tambin en las
membranas. Adems estn los Esteroides, Hormonas, Vitaminas y cidos Biliares. Por
ltimo, los Esteroles siendo el colesterol el caso ms abundante.
Energa - Termodinmica
La energa slo puede ser observada por nosotros a travs de sus transformaciones,
transferencias y efectos que produce.
Una definicin fsica para energa dice que es la causa capaz de producir trabajo.
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Es espontnea, porque se da sin el auxilio de energa externa.
El universo tiende a un estado ms estable, y ese estado es el de
caos. As, el orden implica gasto energtico (trabajo - W) para poder
oponerse al desorden.
Segn estas dos leyes podemos diferenciar dos tipos de procesos entre un sistema y
el medio. Estos procesos son:
Metabolismo celular
El metabolismo es el conjunto de reacciones qumicas que permiten las transformaciones
de energa en los seres vivos, las clulas estn preparadas para poder llevar a cabo estos
procesos, a los que llamaremos metabolismo celular. Mientras que en la naturaleza de dan
reacciones qumicas donde se da una relacin entre sustrato y reactivo para lograr un
producto (sustrato + reactivo = producto), las clulas deben, para lograr cualquier
producto, efectuar una serie de pasos intermedios, la suma de todas las reacciones
qumicas intermedias recibirn el nombre de proceso o va metablica. El ejemplo ms
claro para ejemplificar es la respiracin celular: la glucosa se degrada obtenindose CO 2 y
H2O, pero dicho proceso no sucede en una sola reaccin qumica sino a travs de un
complejo proceso
Para que una reaccin qumica se d debe aportarse al compuesto reactivo una
determinada energa mnima necesaria, sta se llama energa de activacin. Las
enzimas son catalizadores biolgicos que disminuyen la energa de activacin,
con lo cual aceleran la reaccin qumica.
El ATP es el intermediario energtico celular (pero no sirve para almacenar energa, otras
son las molculas que almacenan: polisacridos y triglicridos). Transporta la energa desde
las reacciones exergnicas en el tercer enlace de fsforo, esa energa es la que
catalizar las reacciones endergnicas. Se forma principalmente por fostorilacin
oxidativa (utilizacin de energa libre para fosforilar ADP).
Estructuralmente es un nucletido. Su base nitrogenada es la adenina, est unida a una
pentosa (ribosa) y a tres grupos fofatos unidos entre s.
Se pueden clasificar las reacciones metablicas:
Anabolismo fase constructiva y biosinttica del metabolismo el ATP brinda la energa
Catabolismo fase de degradacin de biomolculas obtencin de energa sntesis de ATP
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Las Enzimas son los catalizadores biolgicos que reducen la energa de activacin para
que reaccione un sustrato.
Las enzimas son protenas, su estructura tridimensional es que le confiere sus
caractersticas. El sitio activo (un espacio dentro de la estructura tridimensional) es la
zona de la enzima que va a interactuar con el sustrato, de ese tipo de unin:
Modelo Llave/Cerradura: se propone que el sitio activo de la enzima y es
complementario con el sustrato, coincidiendo en forma y en distribucin de carga
(polaridad, hidrofilia/hidrofobia)
Las enzimas se clasifican en distintos tipos segn cul sea su parte activa.
1) Simples la estructura proteica es la que dispone de sitio de activacin.
2) Conjugadas Holoenzimas (activa)
a) Apoenzima (inactiva) parte proteica de la enzima
b) Cofactor (parte activa) que puede ser
i) In inorgnico
ii) Molcula orgnica
(1) Coenzima (unida a la protena con unin no-covalente)
(2) Grupo protsico (unin covalente)
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La cintica enzimtica es la rama de la qumica que estudia la velocidad de las
reacciones qumicas catalizadas por enzimas, midiendo la cantidad de producto que se
puede generar en determinada unidad de tiempo.
Factores que afectan la actividad enzimtica. Las velocidades de reaccin qumica
catalizadas por la enzima se pueden ver afectadas por diversos factores.
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Agente Reductor elemento que suministra electrones/protones de su estructura siendo
oxidado
Agente Oxidante elemento qumico que capta electrones/protones del medio siendo
reducido
Cuando una molcula puede puede oxidarse y a la vez reducirse se la llama anfolito. Tal es
el caso de los aminocidos, en el cual el grupo amino puede funcionar como base (capta
electrones) mientras que el carboxilo tiende a oxidarse, volvindose cido (perder
electrones)
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Fotosntesis
Ecuacin general
6 (CO2 ) + 6 (H2O) ----- [luz] ----> O6H12C6 + 6 O2
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Etapa Fotolumnica
No es necesaria que haya luz. Sucede en el estoma. El aporte energtico proviene de los
productos de la etapa fotoqumica, el ATP y el NAPH 2 . En esta etapa el CO2 se reduce, y se
ensambla con los protones aportados por el NADPH+H (que contiene los Hidrgenos del
agua). La sntesis de los hidratos de carbono se produce a travs de una serie de
reacciones qumicas encadenadas en un ciclo, el conjunto de esas reacciones recibe el
nombre de ciclo de Calvin
Respiracin celular
La respiracin celular es un proceso metablico ordenado, catalizado por enzimas, en el
que la energa se libera por etapas.
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Es un proceso catablico y exergnico.
Si consideramos la ecuacin general, la glucosa se oxida formando CO 2 y el O2
se reduce formando H2O
Ecuacin general
O6H12C6 +O2 H2O + CO2
1 Gluclisis.
Primera degradacin de la glucosa. Por su composicin logra traspasar la membrana
citoplasmtica. En un primer momento es necesario consumo de energa (ATP) para
degradar parcialmente la glucosa. El primer producto son dos molculas de cido pirvico
(piruvato).
2 Descarboxilacin oxidativa.
El piruvato entra en la matriz mitocondrial, puede atravesar libremente la membrana. Este
sustrato se va a oxidar catalizado por la coenzima A y va a originar un acetilo (2
carbonos). Los electrones librados van a reducir el NAD+ (pasa a NADH). Al final del
proceso se libera CO2 .
3 Ciclo de Krebs.
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Conjunto de reacciones que conforman un ciclo 6 pasos enzimticos, al igual que en el
ciclo de Calvin, la cadena de reacciones es cclica, con lo cual el compuesto inicial se
regenera al final del proceso. Se va a producir la oxidacin completa del acetil-CoA. Los
electrones liberados van a reducir NAD+ a NADH + H, y tambin FAD+ a FADH2. Tambin
hay liberacin de energa que sirve para sintetizar GTP (un nucletido trifosfato)
La va anaerbica: fermentacin
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Biomembranas
El modelo que describe la estructura y funcionamiento de toda membranas biolgicas se
llama Modelo del Mosaico Fluido
Caractersticas:
1) Estructuras laminares construidas por lpidos y protenas. Muchas tambin
tienen asociadas glcidos.
2) Son fuidas: los lpidos y protenas se pueden desplazar lateralmente y/o rotar
por la bicapa.
3) Son asimtricas respecto a la conformacin de sus componentes
4) Poseen permeabilidad selectiva.
Componentes de la membrana
1) Lpidos (aproximadamente el 40%)
a) Fosfolpidos: son anfipticos (cabeza polar, interacta con el agua; cola no-
polar hidrocarbonada, hidrofbica) La fluidez de la membrana se debe a la
membrana depende del tipo de cadena hidrocarbonada (insaturada, aumenta la
fluidez; saturadas la disminuyen).
b) Colesterol. Su funcin es disminuir la permeabilidad de la bicapa, y regular la
fluidez.
2) Protenas (conforman aprox el 60% de la masa de las clulas): son el componente
funcional de las membranas (enzimas de reconocimiento, protenas de transporte y
canales, etc). De acuerdo a cmo se ubiquen en la bicapa estas pueden ser:
a) Integrales insertas dentro de la bicapa. Interactan tanto con la cabeza polar,
como con la cola no polar. Atraviezan toda la membrana.
b) Perifrica no penetran en el interior hidrofbico. Se asocian a las protenas
integrales o a la cabeza de los fosfolpidos.
3) Glcidos: se presentan como oligosacridos (polmeros de hasta 20 monosacridos),
unidos a lpidos (glucolpidos) o a protenas (glucoprotenas) de la membrana.
Transporte en la membrana
Siendo la membrana una barrera con permeabilidad selectiva, en la posibilidad de que
pasen o no determinados solutos se deber a
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Los mecanismos de transporte se clasifican segn implique o no gasto de energa.
Sistema de endomembranas
Sistema de endomembranas consiste en un conjunto de membranas intracelulares que se
encuentran relacionadas fsica y funcionalmente. El Sistema Vacuolar Citoplasmtico (SVC)
comprende
1) Envoltura nuclear: formada por dos membranas concntricas separadas por un
espacio. La membrana externa tiene ribosomas adheridos.
2) Retculo endoplasmtico liso (REL). Carece de ribosomas. Funciones
i) Sntesis de lpidos
ii) Detoxificacin
iii) Participa en uno de los pasos de degradacin del glucgeno
iv) Almacenamiento y liberacin de calcio, tiene bombas de calcio (importante en
las clulas del msculo estriado.
3) Retculo endoplasmatico rugoso (RER). Se origina a partir de la membrana
externa del nucleo. Tambin tiene ribosomas, eso le posibilita la sntesis de protenas.
i) Proteinas de membranas
ii) Protenas de exportacin y secrecin
iii) Enzimas para el SVC.
iv) Enzimas hidrolticas y lisosomales
4) Sistema de Golgi. Compuesto por cisternas apiladas. Es el madurador,
empaquetador y distribuidor de molculas en la clula.
5) Lisosomas: Vesculas membranosas que en su interior contienen enzimas
hidrolticas. Se ocupan de la degradacin de macromolculas. En su interior tienen un
pH 5,
6) Endosomas: son organelas que se encargan de recibir el material que ingresa a la
clula por endocitosis. Se transforman en lisosomas cuando incorporan enzimas. Segn
estn ms cerca o ms lejos de la membrana sern lisosomas tempranos o tardos.
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Adems hay organelas que no tienen relacin con el SVC
Clulas y el medio.
Da forma a la clula.
Participa en el movimiento celular.
Transporte intracelular de vesculas.
Participa en la divisin celular.
Componen el citoesqueleto
i) Microtubos Formados por tubulina polimerizada. Responsable del transporte
intracelular de vesculas. Participa en la divisin celular. Conforma flagelos y
cilios.
ii) Microfilamento formado por actina, que se polimeriza. Actna y miosina son
responsables de la contraccin muscular. Participa con el movimiento celular
(contraccin). Es responsable de la fluidez o rigidez del citosol.
iii)Filamentos intermedios. Depende del tipo de clula puede ser de queratina
(clulas epiteliales) o neurofilamentos (neuronas).
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