Genética. Eje 5. Transcripción y Traducción
Genética. Eje 5. Transcripción y Traducción
Genética. Eje 5. Transcripción y Traducción
EL GEN
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El ADN que se encuentra a cierta distancia (entre 5-10 Kb) de un gen particular a
menudo contiene secuencias que son copias parecidas pero inexactas del gen. Estas
secuencias, se denominan genes codificadores de proteínas duplicados; es probable que
los genes duplicados constituyan la mitad del ADN codificador de proteínas de los
genomas de los vertebrados. Se denomina familia de genes al conjunto de genes
duplicados, que codifican proteínas con secuencias de aminoácidos similares, pero no
idénticas (familia de proteínas) como por ej. Los factores de transcripción y las
inmunoglobulinas de los vertebrados, que incluyen cientos de miembros, mientras que
otras familias abarcan entre unas pocas proteínas hasta alrededor de 30 (citoesqueleto-
actinas, tubulinas, queratinas- cadena de miosina, ovoalbúmina, entre otras
Los genes codificadores de ARNt, ARNr e Histonas y varias otras proteínas aparecen en
disposiciones repetidas en tándem. Éstas se distinguen de los genes duplicados de las
familias de genes porque los genes múltiples repetidos en tándem codifican proteínas
idénticas, o ARN funcionales. En la mayoría de los casos, las copias de una secuencia
aparecen una después de la otra a lo largo de una porción prolongada de ADN. Cada
copia es exactamente igual a todas las demás, o muy poco diferente. Los genes repetidos
en tándem de ARNt, ARNr e histonas son necesarios para cubrir la gran demanda
celular de sus transcripciones.
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El segmento codificador comprende sectores codificantes para la síntesis de una
proteína llamados exones y sectores no codificantes llamados intrones.
La mayoría de los genes que codifican ARNm contienen entre 1 y 60 intrones.
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ESTRUCTURA DEL ARN (ácido ribonucleico)
TRANSCRIPCIÓN EN EUCARIOTAS
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un complejo con TFIIA, TFIIB, TFIID y TFIIF, al que se une la ARN POL II. La unión
posterior de TFIIH Y TFIIE, añade otras actividades al complejo, como la actividad
helicasa necesaria para abrir la doble hélice y permitir el copiado de una cadena, y hace
que comience la transcripción. Por lo tanto, la formación de este complejo de
preiniciación sobre promotores específicos es la forma de controlar que la ARN
polimerasa comience a sintetizar en el lugar correcto.
Una vez “ubicada”, separa las cadenas, creando así la BURBUJA DE
TRANSCRIPCIÓN, a fin de poder leer la secuencia de bases de la cadena de ADN que
le sirve de molde.
Con la fosforilación del extremo carboxilo-terminal de esta enzima, comienza su
desplazamiento por la cadena molde de ADN. La ARN pol lee sólo una de las dos
cadenas de ADN, que es la única sobre la que puede construir ARN, en sentido 5´3´, a
partir del promotor. El ARN transcripto es antiparalelo y complementario a la cadena
ANTISENSE (molde, o complementaria) y presenta la “misma” secuencia de bases que
la SENSE (Hebra sentido o codificante) con la que difiere solo en que en lugar de
timina aparece uracilo.
La RNA pol va incorporando NTPs, respetando la complementariedad de bases del
molde, uniéndolos unos con otros mediante enlace fosfodiéster. Debido a que la enzima
polimeriza en sentido 5´3´, el primer extremo del ARN que se sintetiza es el 5´. Cuando
el ARN así sintetizado alcanza una longitud considerable comienza a ser “despegado”
del ADN molde a partir del extremo 5´ del ARN.
Las bases del ADN molde, al soltarse el ARN, quedan reexpuestas y vuelven a formar
uniones puente de hidrógeno con las bases de la otra cadena de ADN (complementaria).
Así, se reconstituye el ADN doble cadena por donde ya pasó la ARN pol, mientras que
la burbuja, manteniendo su tamaño, se desplaza junto con la enzima (la burbuja es
abierta por acción de la enzima y se va cerrando a su paso).
De esta manera la RNA pol va copiando hasta encontrar alguna secuencia que le indique
“fin” (secuencia de terminación). La cadena de ARN sintetizada es separada por
completo del molde.
Durante la transcripción, cuando la ARN polimerasa avanza, hay una torsión en la doble
hélice. Este superenrrollamiento de la molécula de ADN es aliviado por la
TOPOISOMERASA I.
Todo este
proceso
descripto es
común a los
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distintos tipos de ARN, así como a todos los tipos celulares (procariotas y eucariotas).
Sin embargo existen algunas diferencias: en las células eucariotas, la enzima que
transcribe a cada uno de ellos es una RNA pol diferente y también es distinto el sitio del
núcleo en el que ocurre la transcripción. Mientras que todos los ARN se sintetizan en el
nucleoplasma, la mayoría de los ARNr se sintetizan en el nucleolo.
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*CADENA DEL ADN: El ADN proporciona una de las cadenas (cadena antisense) que
servirá de molde para que la ARN polimerasa la copie y transcriba el ARN.
Cuando un gen es transcripto por varias ARN polimerasas a la vez se observa una
imagen semejante a un ARBOL DE NAVIDAD cuyo “tronco” corresponde al gen y las
“ramas” a los ARN. Dichas ramas se alargan progresivamente desde la punta del árbol
hacia la base indicando la dirección de la transcripción. En el punto en que cada rama se
une al tronco se localiza una ARN polimerasa. Esta imagen puede observarse con un
microscopio electrónico.
Procesos post-transcripcionales
La mayoría de los ARN recién transcriptos no son definitivos ni funcionales (se los
llama precursores), por lo tanto deben sufrir algún tipo de proceso posterior a la
transcripción. Estos procesos son diferentes en procariotas y eucariotas, y también entre
los distintos tipos de ARN. Los ARNm presentan tamaños sumamente variables que
dependen de la longitud de la proteína que codifican, además una única molécula de
ARNm puede llevar información para sintetizar varias proteínas del mismo tipo.
En Eucariotas los procesos post-transcripcionales son:
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- CAPPING (o encapuchamiento o caperuza)
- POLIADENILACIÓN (aprox. 250 nucleótidos)
- SPLICING (o corte y empalme)
Los precursores de los ARNm son denominados transcriptos primarios, los que son
copias fieles de toda la información que contiene el gen en el ADN. Sin embargo, no
toda la información llega al citoplasma para ser traducida, ya que ciertas porciones
del transcripto primario son cortadas y eliminadas (splicing), y no forman parte del
ARN maduro (procesamiento del ARN). Los transcriptos primarios, además, sufren
otras modificaciones en el núcleo (capping y poliadenilación), antes de “viajar” al
citoplasma para ser traducido.
El conjunto de transcriptos primarios se conoce como ARN heterogéneo nuclear
(ARN hn). Estos transcriptos primarios se combinan con proteínas básicas formando
un complejo llamado RIBONUCLEOPROTEÍNA HETEROGÉNEA NUCLEAR
(RNP hn). Estas parecen ayudar en el transporte de los ARNm por los poros
nucleares.
- Capping:
Consiste en el agregado de un nucleótido metilado inusual, el de 7-metil guanosina
(guanina metilada en posición 7), en el extremo 5´ de los transcriptos primarios. Este
nucleótido constituye el “CAP” 5´ (o casquete o capuchón o caperuza) que se une por su
carbono 5´ al primer grupo fosfato de la cadena. Por lo tanto, el enlace entre el 7- metil-
y el primer nucleótido es atípico, ya que es un enlace 5 ´ 5´ en vez del enlace 5´3´
habitual. Este capuchón además es reconocido por la subunidad menor de los
ribosomas en el proceso de traducción.
El CAP: - Indica que el ARNm está completo
- Incrementa la estabilidad del ARNm
- Evita la degradación del extremo 5´del ARNm por fosfatasas o nucleasas
- Permite la remoción de los intrones
- Participa en el arribo del ARNm al citoplasma
- Permite la unión del ARNm a los ribosomas
- Poliadenilación
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polimerasa es la responsable de agregar de a una por vez las 250 adeninas en el
extremo 3´ del ARNm, no precisa de molde y únicamente utiliza ATP.
El poli A es necesario para:
- Proteger el extremo 3´ del ARNm de la degradación por las ribonucleasas
- Ayuda al ARNm a salir del núcleo.
Es importante recordar que dicha cola no se añade al extremo final del transcripto
primario, sino que previamente tiene lugar un corte interno. El punto de corte viene
definido por la presencia de una señal de poli-adenilación en el ARNm (cuya
secuencia consenso es 5´- AAUAAA- 3’. El proceso está mediado por factores
proteicos que se unen a esta señal, cortan al ARNm unos 20 nucleótidos por debajo
de la señal de poliadenilación, y se comienza a añadir adeninas.
En los ARNm encargados de codificar a las histonas, los extremos 3´ NO se
poliadenila, pero este sector también está protegido por una secuencia corta de
nucleótidos que al plegarse adquiere la forma de un bucle.
- Splicing
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Mientras tanto, están siendo modificados los precursores de los otros ARN.
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3) Maduración del precursor de ARNr en el nucleolo
La subunidad menor contiene el ARNr 18 S más 33 proteínas llamadas S1, S2, S3,
S4, S5……S33 (la letra S corresponde a “small”).
El ARNm (ARN mensajero maduro), los ARNt y las subunidades ribosomales,
salen del núcleo hacia el citoplasma, donde intervendrán conjuntamente, en la
síntesis de proteínas. Pero aún no está todo listo para la traducción, ya que los
ARNt deben ser cargados con sus aminoácidos correspondientes. Este proceso
pretraduccional es conocido como activación de los aminoácidos o cargado de los
ARNt, y consiste en preparar los aminoácidos de tal manera que queden propensos a
reaccionar. Esta activación requiere del consumo de ATP.
En el cargado de los ARNt interviene una familia de 20 enzimas diferentes que, en
conjunto, reciben el nombre de Aminoacil-ARNt-sintetasas. Los ARNt son
reconocidos por la aminoacil-ARNt-sintetasa correspondiente en uno de sus bucles
laterales (D). A su vez, la enzima reconoce a un determinado aminoácido al que une
al extremo 3´ de ese ARNt.
Hay tantas enzimas como aminoácidos diferentes, ya que cada una de las enzimas
reconoce específicamente a cada uno de ellos. Sin embargo, existen 61 ARNt
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distintos frente a los 20 aminoácidos. Es evidente que varios ARNt serán cargados
con un mismo aminoácido.
-ARN pequeño nuclear o ARN pn: es parte de una ribonucleoproteína llamada RNApn
localizada en el núcleo y responsable del splicing del ARNm.
La mayoría de estos ARN pequeños son transcriptos por la ARN POLIMERASA II y
unos pocos por la ARN POLIMERASA III.
Todas las moléculas y estructuras de este proceso han sido elaboradas durante la
transcripción, que en el caso de las eucariotas, ocurrió en el núcleo. De allí saldrán al
citoplasma donde se lleva a cabo la traducción.
En los procariotas, al no haber núcleo, la transcripción y la traducción ocurren en el
mismo lugar y a la vez, por lo que se dice que la traducción es cotranscripcional. Para
poder traducir el mensaje del lenguaje de los nucleótidos del ARNm al de los
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aminoácidos de la proteína que se va a sintetizar, hace falta un sistema decodificador.
El sistema decodificador “trabaja” reconociendo tripletes de bases en el ARNm
llamados CODONES. Primero debe haber una señal que marque el inicio de la
traducción, un marco de lectura abierto que permita que el mensaje sea traducido
correctamente. A partir de allí, el mensaje es decodificado de triplete en triplete, o sea,
de codón en codón. Para lograr esto, el sistema decodificador cuenta con una molécula
adaptadora, el ARNt (o transfer) que, apareándose con los codones del ARNm, por
complementariedad de bases (ANTICODONES), consigue ubicar los aminoácidos.
Los diferentes ARNt no están cargados con cualquier aminoácido, por lo tanto, estas
moléculas adaptadoras permiten que la secuencia de codones del ARNm se corresponda
con la secuencia de aminoácidos de la proteína que se sintetiza. La aminoacil- ARNt
sintetasa (enzima) cataliza el enlace entre los ARNt específicos y los aminoácidos que
concuerdan con sus anticodones. El producto de esta reacción es una molécula de
aminoacil-ARNt. Este aminoacil-ARNt viaja al interior del ribosoma, donde los
codones de ARNm se enfrentan con los anticodones específicos del ARNt mediante el
emparejamiento de bases. Luego se utilizan los aminoácidos que portan los ARNt para
montar una proteína. La energía requerida o el número de enlaces fosfato de alta energía
necesarios (GTP), para traducir proteínas que contenga n aminoácidos, es significativa.
La traducción ocurre en tres pasos: Iniciación, Elongación y Terminación.
INICIACIÓN
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Una vez que la subunidad menor reconoció el AUG iniciador del ARNm, llega un
ARNt cargado con un aminoácido, el cual contiene, en uno de sus bucles, un triplete
llamado anticodón, el que podrá aparearse (por complementariedad de bases) con el
codón de iniciación. Como el primer codón es AUG (5´3´), el ARNt iniciador es
siempre el que tiene el anticodón UAC (3´5´) que lleva el aminoácido metionina (Met).
Una vez que se ha unido este ARNt, llega la subunidad mayor y se ensambla el
ribosoma completo, porque esta subunidad se “inserta” sobre la otra.
La subunidad mayor tiene diferentes sitios en su interior, llamados P o peptidil, A o
aminoacil, un sitio E (salida
del ARNt) y un sitio M
para la unión con el
ARNm.
Al ensamblarse las dos
subunidades del ribosoma,
el primer ARNt queda
ubicado en el sitio P. Así
concluye la etapa de
iniciación.
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En la siguiente tabla se indican los emparejamientos codón-anticodón permitidos por la
regla del tambaleo:
Emparejamientos codón-anticodón
permitidos
Extremo 5' del Extremo 3' del
anticodón (ARN-t) codón (ARN-m)
G UoC
C sólo G
ELONGACIÓN A sólo U
U AoG
El sitio P está ocupado por el
primer ARNt (anticodón 3´UAC 5
´) y el sitio A queda libre. En el mensajero “bajo el sitio A” queda un triplete expuesto.
Un ARNt con un anticodón complementario a ese segundo codón se fija sobre el
ARNm, uniéndose, a su vez, al ribosoma por uno de sus bucles. Este ARNt, está
cargado con el aminoácido correspondiente y ocupa el sitio A del ribosoma. De esta
manera, dos aminoácidos activados se encuentran juntos, y se cataliza la formación de
un enlace peptídico entre ese aminoácido y el que está unido al ARNt en el sitio A.
Debido a que la subunidad mayor realiza esta
acción se dice que tiene actividad peptidil
transferasa. Además estos procesos están
ayudados por dos factores de elongación
(eEF1 y eEF2, del inglés eukaryotic
elongation factor).
En realidad, primero debe separar a la met de
su transfer para luego unirla por su extremo
carboxilo al extremo amino del aminoácido que sigue. Se ha formado un dipéptido, con
los aminoácidos correspondientes al mensaje escrito en el ARNm.
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Cuando la Met está unida al segundo aminoácido, el primer ARNt se libera de la misma,
se mueve al sitio E y luego se disocia del ribosoma, retornando al citosol donde vuelve a
cargar otra metionina. El ribosoma se transloca hacia el extremo 3´del ARNm de
manera de permitir que el siguiente codón sea leído. Esta translocación la efectúa la
enzima translocasa y ocurre con gasto de energía obtenida de la hidrólisis de una
molécula de GTP. Así, el segundo ARNt, unido ahora al dipéptido, queda en el sitio P o
peptidil, donde se ubica siempre el péptido creciente, y el sitio A queda libre y “sobre”
el codón que sigue.
TERMINACIÓN
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ningún aminoácido ni se unen al ARNt. En cambio, unen proteínas o factor de
liberación (eRF1 y eRF3 en eucariotas, del inglés eukaryotic release factor), que
permite la hidrólisis del enlace entre la cadena polipeptídica y el ARNt en el sitio P.
A continuación, el polipéptido recién completado se separa del ribosoma. Su extremo C
terminal es coincidente con el último aminoácido en unirse a la cadena. Su extremo N
terminal, al menos inicialmente, es coincidente con la metionina, como consecuencia
del codón de iniciación AUG. En su secuencia de aminoácidos, contiene información
que especifica su conformación, al igual que su destino celular final.
Una vez finalizada la traducción del mensaje, el
péptido se libera y todos los componentes de la
maquinaria traduccional se desensamblan.
Después de todos estos procesos, la información
contenida en el ADN ha sido expresada en la
estructura primaria de las proteínas, las mismas
se pliegan posteriormente, ayudadas por factores
celulares, alcanzando estructuras secundaria y
terciaria y, en algunos casos, cuaternaria. De
esta manera, adquieren funcionalidad biológica.
CÓDIGO GENÉTICO
Uno de los grandes hitos de la Biología Molecular fue el descifrar qué aminoácido
corresponde a cada codón, pudiéndose así establecer el conjunto completo de
equivalencias codón-aminoácidos: EL CÓDIGO GENÉTICO.
Podríamos decir que el ADN tiene un alfabeto de 4 letras (A-G-T-C) con el cual se
escriben palabras de tres letras llamadas TRIPLETES.
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Entonces tenemos la posibilidad de formar 64 palabras distintas (43), es decir tripletes,
que luego serán transcriptos en el ARNm como CODONES.
*Es universal porque es el mismo para todos los seres vivos, incluyendo a los virus y a
las mitocondrias y cloroplastos, aunque estas dos últimas presentan algunas variantes; el
código difiere levemente del que está en los procariontes y en el núcleo de las células
eucariontes; en un grupo de protistas, UAA y UAG codifican glutamina en lugar de
funcionar como codones de terminación. Es decir, para casi cada especie, los codones
que especifican los aminoácidos son los mismos. Por consiguiente, el código debe ser
tan antiguo que se ha mantenido intacto a través de la evolución de los organismos
vivos.
Que el código genético sea común significa que también existe un lenguaje común para
la evolución. Como la selección natural trajo aparejados cambios graduales en los
genomas de diferentes tipos de organismos, la materia prima de la variación genética
sigue siendo la misma.
*Es degenerado porque algunos aminoácidos son codificados por más de un codón, o
sea que existen codones con un mismo significado: son codones sinónimos. Esto
implica que el código genético es redundante. En general, los ARNt que reconocen
codones sinónimos sólo se diferencian en la tercera base de su anticodón, lo que implica
que las dos primeras bases del codón bastarían para unir el transfer al mensajero.
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*Es consistente porque a pesar de la redundancia de codones, cada codón en particular
tiene un único significado. Cada codón se corresponde con un único aminoácido, por lo
tanto el código genético NO es ambiguo.
Colinealidad: El ADN es una larga cadena lineal de nucleótidos y una proteína es una
larga cadena lineal de aminoácidos.
El ordenamiento de los aminoácidos en la proteína es un reflejo de la secuencia de
tripletes en el ADN. Por lo tanto si cambiamos el orden de las bases nitrogenadas en el
ADN, también se produce un cambio en el ordenamiento de los aminoácidos en la
proteína; por eso se dice que el ADN y la cadena proteica son colineales.
El flujo de la información genética debe ser regulable para que la célula pueda ajustar la
síntesis de los distintos ARN y proteínas a sus necesidades. La regulación puede darse
en diferentes puntos de la vía.
A nivel de la transcripción se regula qué gen se expresa, en qué momento, en qué tipo
celular y con qué intensidad. El control de la transcripción es llevado a cabo por factores
de iniciación de la transcripción, que uniéndose a determinadas secuencias específicas
en el ADN, son capaces de activar o inhibir la actividad de la ARN pol. Un ejemplo de
la actividad de estos factores es la expresión tejido-específica de determinadas
proteínas, como ocurre con el gen de la insulina que sólo se expresa en ciertas células
del páncreas. El hecho que no se exprese en otros tejidos muestra que los factores
activadores de la transcripción se encuentran únicamente en esas células del páncreas.
Otro mecanismo regulatorio de la transcripción consiste en el grado de condensación de
la cromatina (ADN + histonas, en eucariontes), lo que afecta el acceso de la ARN pol a
sus promotores, ya que cuanto más compacto está el ADN, más difícil es para la enzima
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alcanzar y reconocer a las secuencias de iniciación. Este mecanismo consiste en que la
cromatina descondensada o laxa, eucromatina, se condensa a heterocromatina, o
viceversa.
Un caso bien claro de este tipo de regulación es el de la heterocromatinización
diferencial del ADN durante la embriogénesis. En este caso, ciertas regiones del ADN
que deben dejar de expresarse por completo, después de un tiempo limitado de
expresión durante el desarrollo del embrión, se compactan: la eucromatina se condensa
a heterocromatina, la cual es transcripcionalmente inactiva.
Con posterioridad a la transcripción, otra manera de regular es a través de la vida media
de los mensajeros, o sea qué tan rápido son degradados, cuánto tiempo están disponibles
para la maquinaria traduccional.
Más allá de la regulación del flujo de información, también puede regularse la actividad
y la vida media de las proteínas sintetizadas. La vida media de las proteínas está
regulada por la acción enzimática de proteasas (enzimas que rompen los enlaces
peptídicos de las proteínas).
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TRABAJO DE APLICACIÓN
ARN………............
___E_______E_________E_________E__________E____ AAAAAAAA
……… …………………….
…………………………………
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7) a) La siguiente representación corresponde al:………………………
b) ¿Cómo se halla conformada cada parte del mismo? Explique
c) Nombre de la organela celular donde se produjo su maduración…
………………………………………………………………………
d) ¿Dónde ocurrió la transcripción de cada molécula que constituye esta
organela?..............................................................................................................................
.............................................................................................................................................
.............................................................................................................................................
9) Dado el anticodón ACG, indique el aminoácido transportado por el ARNt que posee
ese anticodón:
a) Treonina b) Asparagina c) Cisteína d) Isoleucina e) Tirosina
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10) Dado el siguiente fragmento de ADN (exones) 3´AATTCAGGTCGATATATA 5´y
utilizando el código genético, indique el primer aminoácido del péptido:
11) Dado el siguiente péptido: histidina, lisina, fenilalanina, serina, tirosina, valina y
analizando el código genético, indique la cadena de ADN que contiene la información
para ese péptido:
a) 3´GCGTGTAAGAGGATACAA 5´
b) 5´GTATTTAAATCAATACAA 3´
c) 5´GUUUAUUCCUUCACAAUA 3´
d) 3´GTATTTAAATCAATACAA 5´
5´ 3´
ARNt ( ) UGU ( )
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13) Utilice el esquema para: cargar el aminoácido correspondiente en el sitio
correspondiente.
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