INTRO y MARCO TEORICO y Conclusiones

INTRODUCCIÓN:
El presente informe, muestra los resultados del análisis de la secuencia descargada en

formato fasta (brindado por asesor del curso), para encontrar los predictores de
estructuras secundarias de DNA y ARN, formación de enlaces a través de la energía libre
de Gibs, esta información nos la brindara el software RNAstructure, que es una
herramienta sencilla de interpretar.
Ingresamos a la página RNAstructure, seleccionamos la opción para producir secuencias
secundarias, Se procedió a seleccionar el archivo donde se encuentra la secuencia en
formato fast, se seleccionó el tipo de ácido nucleico (AND/RNA) se seleccionó RNA, se
observó otros parámetros a seleccionar pero no se modificó ninguno de ellos por
sugerencia del asesor del curso. Paralelamente se realizó una búsqueda en BLAST para
encontrar e identificar esa secuencia nucleotidica con la que se trabajó, se indentifico que
esa secuencia pertenece a (Bombyx mori Ala-tRNA-1) ósea pertenece a la secuencia de
RNA del gusano de seda, específicamente a un RNA de transferencia para el aminoácido
“Alanina”, se sabe que el número de codones que codifican a la Alanina son 4
(GCU,GCC,GCA,GCG) por lo tanto se concluyó que el codón es (GCC), el codón
complementario es (CGG), y por lo tanto el codón inverso complementario esta formado
por (GGC). Volviendo a los resultados del RNAstructure y exploramos las 4 estructuras
que nos mostraron y se escogió la estructura 2, ya que esa es la más adecuada y se
encontró el luc que contenía el anti codón (GGC) entre la región del nucleótido 30 y 4 en
sentido 5´ a 3´ y estaba libre ese anti codón, por lo tanto cumple con todo las
características explicadas por el asesor. Posterior a ello se realizó una tabla con los valores
de energía de formación de enlaces y las 4 imágenes generadas.
MARCO TEÓRICO
ARNtransferencia
El ARN de transferencia, ARN transferente o ARNt es un tipo de ácido ribonucleico que

tiene una función importante en la síntesis proteica. Es aquel que transfiere las moléculas
de aminoácidos a los ribosomas, para posteriormente ordenarlos a lo largo de la molécula
de ARN mensajero (ARNm); estos aminoácidos se unen por medio de enlaces peptídicos
para formar proteínas durante el proceso de síntesis de proteínas. Cada tipo de ARNt se
combina específicamente con 1 de los 20 aminoácidos que se van a incorporar en las
proteínas. Existe una molécula de ARNt para cada aminoácido, con una tripleta específica
de bases no apareadas, el anticodón, codón y el ARN (ribosomal).[CITATION wik \l 10250 ]
El ARN de transferencia (ARNt) es una pequeña molécula de ARN que participa en la

síntesis de proteínas. Cada molécula de ARNt tiene dos áreas importantes: una región de
trinucleótidos denominada anticodón y una región donde se une un aminoácido
específico. Durante la traducción, cada vez que un aminoácido se añade a la cadena en
crecimiento, se forma una molécula de ARNt cuyos pares de bases tienen una secuencia
complementaria con la molécula del ARN mensajero (ARNm) , asegurando que el
aminoácido adecuado sea insertado en la proteína. [CITATION Ins20 \l 10250 ]
Fuente: NIH, ARN de transferencia (ARNt)
Software RNAstructure
Su objetivo “es automatizar el modelado de la estructura y la función del ARN de la
secuencia del genoma a la estructura 3D (como se muestra en la figura anterior). Esto es
importante porque mejora nuestra comprensión de la Biología y también porque nos
ayuda a curar enfermedades. Desarrollamos herramientas de software para predecir la
estructura del ARN, modelar la flexibilidad conformacional, encontrar genes y genomas
estructurados, y diseñar secuencias de ARN que se plieguen en estructuras
específicas; predice y analiza la estructura secundaria del ARN, es decir, el conjunto de
pares base canónicos que forma el ARN. Utilizamos y mejoramos El ámbar para el
modelado de estructuras tridimensionales”. [ CITATION Mat19 \l 10250 ]
RNAstructure es un paquete completo para la predicción y análisis de la estructura

secundaria de ARN y ADN. Incluye algoritmos para la predicción de la estructura
secundaria, incluida la facilidad para predecir las probabilidades de emparejamiento base.
También se puede utilizar para predecir estructuras bimoleculares y puede predecir la
afinidad de unión de equilibrio de un oligonucleótido a un objetivo de ARN estructurado.
Esto es útil para el diseño de siRNA. También puede predecir estructuras secundarias
comunes a dos secuencias no alineadas, que es mucho más precisa que la predicción de
estructura secundaria de secuencia única. Por último, RNAstructure puede tomar varios
tipos diferentes de datos de asignación de experimentos para restringir o restringir la
predicción de la estructura. Estos incluyen mapeo químico, mapeo enzimático, RMN y
datos SHAPE. RNAstructure está disponible como una interfaz gráfica de usuario para
Windows; una interfaz gráfica de usuario JAVA para Mac OS-X o Linux; interfaces de línea
de comandos para Max OS-X, Linux o Windows; y código fuente para la compilación local.
El código fuente incluye un conjunto de clases de C++ para la inclusión conveniente de los
métodos en nuevos programas.
Fuente: Mathews lab,

RNAstructure, versión
6.2
CONCLUSIONES
Según la interpretación de los resultados, se puede concluir de manera adecuada, ya que se
hizo el análisis estudiado. Un modo fácil es comparar nuestra secuencia con proteínas
conocidas. Por ello, se comparó la estructura del gen utilizando el Blast, donde la estructura si
coincidió con el Blast al RNA de transferencia. Por otra parte, en dicho análisis se rescata que
los Ala-tRNAs son específicos de la glándula de seda, con respecto a la rápida producción de
fibroina. Estas ambas secuencias son idénticas, con excepción de un solo nucleótido en el tallo
anticodón.
Asimismo, la predicción de las estructuras presentes en una secuencia y el descifrado de la

información son de vital importancia en los proyectos de genoma; ya que enfrentamos a una
secuencia que contiene numerosos genes que no han sido estudiados experimentalmente.
Referencias Bibliográficas
Institute National Human Genome Research. (S.F.). ARN De Transferencia (Arnt). Recuperado El
12 De 07 De 2020, De Https://Www.Genome.Gov/Es/Genetics-Glossary/ARN-De-
Transferencia
Mathews Lab. (27 De Noviembre De 2019). Rnastructure, Versión 6.2. Obtenido De

Https://Rna.Urmc.Rochester.Edu/Rnastructure.Html
Wikipedia. (29 De 05 De 2020). Recuperado El 12 De 07 De 2020, De Arntransferencia:

Https://Es.Wikipedia.Org/Wiki/ARN_De_Transferencia#Cite_Note-:2-19

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El presente informe, muestra los resultados del análisis de la secuencia descargada en

El ARN de transferencia, ARN transferente o ARNt es un tipo de ácido ribonucleico que

El ARN de transferencia (ARNt) es una pequeña molécula de ARN que participa en la

Fuente: NIH, ARN de transferencia (ARNt)

RNAstructure es un paquete completo para la predicción y análisis de la estructura

Fuente: Mathews lab,

Asimismo, la predicción de las estructuras presentes en una secuencia y el descifrado de la

Mathews Lab. (27 De Noviembre De 2019). Rnastructure, Versión 6.2. Obtenido De

Wikipedia. (29 De 05 De 2020). Recuperado El 12 De 07 De 2020, De Arntransferencia:

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