Química Computacional

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UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS

Universidad del Perú, Decana de América


Facultad De Ingeniería Geológica, Minera,
Metalúrgica Y Geográfica
Escuela Profesional de Ingeniería Geográfica

CURSO:
Química
DOCENTE:
Esteban Castellanos
ALUMNO:
Miguel Velasquez Cruz
INTRODUCCIÓN
¿Que es la quimica
computacional?
La química computacional nace con la
necesidad de comprender aspectos
importantes que no se pueden resolver de
forma práctica, como lo es conocer estados
intermediarios en reacciones que se efectúan
rápidamente, conocer el comportamiento de
un material a temperaturas muy altas que son
muy difíciles de alcanzar en un laboratorio, o
simplemente calcular propiedades en sistemas
de alto costo.
GENERALIDADES DE LA QUÍMICA
COMPUTACIONAL

La química computacional es una


parte de la ciencia que comprende las
áreas de química, biología y física
unidas a la computación, la cual
permite la investigación de
átomos,moléculas y macromoléculas
mediante un sistema de ordenadores.
MÉTODOS COMPUTACIONALES

Mecánica Molecular: Aplica las leyes de


la física clásica al núcleo molecular sin
considerar explícitamente a los
electrones.
Mecánica cuántica: Se basa en la
ecuación de Shrödinger para describir
una molécula con un tratamiento
directo de la estructura electrónica y
que se subdivide a su vez en dos clases
según el tratamiento realizado, métodos
semiempíricos y métodos de ab initio
(“desde el principio”).
Los modelos matemáticos de la química
computacional

Las interacciones entre los átomos se


describen usando el concepto de superficie de
energía potencial, una función que indica cómo
varía la energía con las posiciones atómicas.
. Son modelos que se pueden operar en
programas computacionales, de los que existen
varios al alcance de los ámbitos académicos y
industriales, como el Gaussian y el Quantum
Espresso .
Química computacional y salud
El radical peroxinitrito, mencionado
en el primer párrafo, reacciona con el
dióxido de carbono, que es muy
abundante en el organismo, lo que da
origen a peroxinitrito-dióxido de
carbono, un aducto (producto que
resulta de la adición de dos
compuestos o especies químicas) que
ilustra la figura 1. Esa reacción fue
analizada mediante cálculos de
mecánica cuántica considerando, en
primer lugar, solo ambas sustancias.
QUÍMICA COMPUTACIONAL Y
NANOTECNOLOGÍA

Unos de los sistemas de gran interés en el ámbito de la


nanociencia son los constituidos por nanopartículas y
por pequeños. El tamaño de estos sistemas se encuentra
comprendido entre las décimas y los cientos de
nanómetros (la millonésima parte de un milímetro). Su
interés radica en que es posible manipular
La discreción sus propiedades físicas, químicas,
electrónicas y mecánicas variando la composición, el
tamaño o el ordenamiento espacial de sus átomos y
moléculas. Esto abre las puertas al diseño de nuevos
materiales, lo mismo que a aplicaciones novedosas en
catálisis, medicina y electrónica
Química computacional
y electrónica molecular

Otras de las áreas en las que la


química computacional podría
contribuir a que acontezca una
revolución tecnológica es la
electrónica molecular. La idea
central de esta es generar
circuitos de una molécula
Aplicaciones

La representación computacional de estructuras tales como los


átomos y las moléculas,
El almacenamiento, estructuración y búsqueda de información
sobre entidades químicas,
La identificación de pautas, tendencias y relaciones entre las
diferentes estructuras químicas y sus propiedades
El estudio de estructuras basadas en la simulación de campos de
fuerzas
Los modelos para favorecer una síntesis eficiente de compuestos
El diseño de moléculas que interactúen entre ellas, sobre todo para
el diseño de fármacos
Conclusiones y
perspectivas

Existen aplicaciones de la química en


casi todas las áreas de la química, en las
que cumplen dos funciones
fundamentales. Por un lado, sus
herramientas permiten explicar
comportamientos observados
experimentalmente. Esto es de gran
interés para diseñar sistemas nuevos y
modular su comportamiento.
BIBLIOGRÁFIAS
S. A. Rahman, M. Bashton, G. L. Holliday, R. Schrader and J. M. Thornton (2009) Small Molecule
Subgraph Detector (SMSD) toolkit, Journal of Cheminformatics, 1:12. DOI:10.1186/1758-2946-1-12

Cummings, Maxwell D.; Maxwell, Alan C.; DesJarlais, Renee L. (2007) Processing of Small Molecule
Databases for Automated Docking. Medicinal Chemistry 3(1):107-113

Pearlman, R.S. and Smith, K.M., Metric Validation and the Receptor-Relevant Subspace Concept, J.
Chem. Inf. Comput. Sci., 1999, 39:28-35

LIN Jr-Hung ; CLARK Timothy (2005) An analytical, variable resolution, complete description of
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