Apuntes Genética
Apuntes Genética
Apuntes Genética
En 1866, Mendel publica su trabajo. Hay ciertos rasgos que se trasmiten de generación a
generación. No se le dio importancia a su trabajo.
En 1800´s, Kossel aísla las histonas y determina que el ADN contiene bases nitrogenadas.
Transforma las no virulentas en virulentas. Avery, McLod y McCarty demuestran que el principio
transformante es el ADN. Chargaff y sus colaboradores descubren los ratios en las bases del
ADN.
En 1952, Hershey y chase demuestran que el ADN es el material genético de bacteriófagos. Y
Rosalind franklin obtiene la fotografía 51, en el laboratorio de Maurice Wikins.
FOTOGRAFIA 51: estructura helicoidal, diámetro más ancho que el de una hebra de ADN y
posición detallada de las bases y las desoxirribosas.
1. En cada escalón (1 pb), el giro es de 36º, y se avanza 0,34 nm. Por tanto, para una vuelta
completa (360º), se requieren 10 pb, y se avanza 3,4 nm.
2. La doble hélice gira a la derecha (dextrógira).
3. La molécula se refuerza mediante fuerzas de apilamiento entre las bases, lo
que genera un surco mayor y un surco menor, alternado.
Propiedades de los ácidos nucleicos: ABSORBANCIA
o Absorción de luz ultravioleta por las bases nitrogenadas (λ= 260 nm)
o Hipercromicidad de los ácidos nucleicos:
Absorbancia nucleótidos libres > moléculas monocatenarias > moléculas
bicatenarias
Los ribonucleoproteinas presentan acción reguladora. Son propias de la unión proteína + ARN
o En el centro: metacéntrico.
o Un poco al extremo: submetacéntrico.
o En el extremo casi: acrocéntrico.
o En el extremo total: telocéntrico.
Formación de los cromosomas. Resumen
Genoma nuclear:
Tiene 16.600 pb
ADN circular: no tiene principio ni final.
Tiene 37 genes.
El genoma humano fue secuenciado y publicado en 2001. Cada célula expresa solo una parte del
genoma en cada momento.
Las mitocondrias surgieron a partir de una bacteria aeróbica que tenía relación
simbiótica con un eucariota anaeróbico primitivo. Los cloroplastos surgieron más
tarde por eucariotas que fagocitaron bacterias fotosintéticas y establecieron una
relación simbiótica con ellas.
o 15% de único o bajo número de copias (una copia o número muy bajo).
o 59% de moderada o altamente repetitivo (se repiten muchas veces) dan repeticiones
dispersas (están en diferentes lugares) y de tándem (están seguidas, en fila).
Genes y secuencias relacionadas: exones, intrones y regiones reguladoras
1. Cromosomas: Genes (26%) + ADN extragénico (74%).
2. Genes: Regiones reguladoras (promotor “el que manda” y terminador “el que termina”)
+ intrones (no llegan al ADN maduro) + exones (van a ser transcrito a un ADN maduro).
3. Pre-RNA: intrones + exones (transcripción).
4. RNA maduro: solo exones (splicing). El splicing: elimina los intrones y une exones.
5. RNA maduro: puede ser codificante (mRNA) o no codificante (t/rRNA, sno/snRNA,
mi/lncRNA).
Los genes puedes estar presentes como copia única, o en varias copias.
Pueden ser:
o Mioglobina: transporte de ¿?
o Hemoglobina: transporte de ¿?. Se duplicó y formó: alfa y beta globina.
Duplicaciones segmentarias:
o 5% del genoma.
o Al menos un 90% de identidad.
o No varían entre individuos.
o Cerca de centrómeros y telómeros.
o Dos tipos:
Intracromosómicas (100 Kb).
Intercromosómicas (10 – 50 Kb). Se copia a otro cromosoma.
Transposones de ADN: son regiones del genoma que codifican transposasa. Dos en los extremos
repetitivos y la transposasa. Son elementos moviles que cambian de sitio.
La enzima transposasa guía la inserción del transposón en diferentes sitios del genoma,
mediante dos mecanismos:
Las copias aparece una a continuación de la anterior, con una secuencia repetida definida. Una
copia va después de la anterior. Tres tipos principales:
ADN Satélite
La Heterocromatina constitutiva:
ADN Microsatélite: el núcleo esta entre 2-6 pb. Están repartidos en los genomas.
1. Planta del guisante (fácil cultivo, rápido crecimiento y gran cantidad de semillas
lo que permitió el recuento matemático).
2. Elección de caracteres adecuados (genéticamente puros, solo 2 alelos, fácilmente
distinguibles).
3. Formulación de tres leyes de herencia de caracteres.
Locus: Lugar físico que ocupa un gen en el cromosoma (en plural, loci). Es donde se encuentra
el gen.
Alelo: Cada una de las formas alternativas (secuencias de ADN) que puede presentar un gen
determinado.
Genotipo: Conjunto de alelos que posee un individuo diploide, mitad heredados del padre y la
otra mitad de la madre.
Alelo dominante: Alelo capaz de manifestar un fenotipo tanto si se encuentra en doble dosis
como si está en dosis simple. Se simboliza en mayúsculas (A).
Alelo recesivo: Alelo que sólo es capaz de manifestar un fenotipo si se encuentra en doble dosis.
Se simboliza en minúsculas (a).
Generación parental: es la unión de dos caracteres diferentes. Mendel lo llamo así debido a que
cruzo una variedad de plantas con semilla amarilla con otras con semilla verde.
2ª Ley de Mendel: Ley de la segregación independiente
Para un carácter, cada individuo posee dos copias del factor hereditario (dos alelos). Las copias
se separan al azar en la formación de los gametos (una sola copia por gameto). Cuando se
cruzaron semillas de la generación F1 (Aa), la descendencia semillas amarillas y verdes, siendo
las amarillas más abundantes:
o Herencia dominante
Mujeres: los genotipos XAXA y XAXa producen el fenotipo
Hombres: el genotipo XAY produce el fenotipo.
o Herencia recesiva
Mujeres: el genotipo XaXa produce el fenotipo.
Hombres: el genotipo XaY produce el fenotipo. Alelo solo en el cromosoma X.
Pedigríes de caracteres autosómicos de herencia dominante
1. No salta generaciones.
2. Los varones afectados tienen madres afectadas.
3. Las mujeres afectadas tienen madres o padres afectados.
4. A partir de una madre afectada, la mitad de sus hijas e hijos estarán afectados.
5. A partir de un padre afectado todas sus hijas estarán afectadas.
6. Las mujeres heterocigóticas suelen presentar un fenotipo más suave y más variable.
Codominancia: sistema MN
Los individuos heterocigóticos se distinguen de los homocigotos y su fenotipo muestra
características de ambos homocigóticos. Cuando se juntan, se están coagulando. Cuando
metemos en anticuerpo anti-M en un genotipo LMLM, se juntan. Si presentan LNLN y metemos
anti-N, se juntan. Si presentan LMLN y metemos anti-M y anti-N, se producirá la coagulación.
IA es codominante de IB
Tema 4: Factores no mendelianos que afectan al fenotipo
1. Penetrancia.
2. Expresividad.
Estos dos parámetros pueden ser modificados por varios factores que afectan al fenotipo:
1. Heterogeneidad genética
2. Pleiotropía
3. Interacciones génicas y epistasia
4. Interacciones genotipo-ambiente
5. Herencia poligénica o cuantitativa
Penetrancia
La penetrancia es la proporción de individuos que manifiestan el fenotipo correspondiente al
genotipo que presentan:
Penetrancia (P) = (Nº individuos con fenotipo esperado / Total individuos con el genotipo) x 100
Un gen tiene expresividad variable cuando distintos individuos con un mismo genotipo
manifiestan el fenotipo, pero pueden presentar diferentes síntomas o nivel de gravedad.
Ejemplo: síndrome de Waardenburg produce sordera, ojos de distinto color, mechón blanco,
canas prematuras todos tienen la misma enfermedad y no todos dan los mismos síntomas
Heterogeneidad genética
Heterogeneidad genética: un mismo fenotipo está causado por distintas variantes genéticas.
o Variante del gen PAH (fenilalanina hidroxilasa): fenilcetonuria, ojos azules y piel clara.
Fenilalanina Tirosina Melanina. Falta de melanina produce no solo la
fenilcetonuria, sino también ojos azules y la piel clara.
o Variante del gen HBB (subunidad beta de la hemoglobina): protección frente a la malaria
(los eritrocitos no distribuyen el parásito) y riesgo de anemia falciforme. Frecuente en
individuos de ascendencia africana. Personas homocigóticas con esta enfermedad, no
viven y las heterocigotas, produce una enfermedad pero también produce la resistencia
en otra enfermedad. Los heterocigotas pueden sobrevivir porque presentan una parte
sana.
El gen A, en homocigosis para el alelo recesivo (aa), impide la manifestación del gen B A es
epistático (nivel superior de control) y B es hipostático (depende del gen A).
Fenotipo Bombay: ejemplo de epistasia recesiva
El locus H (gen epistático) codifica la función para sintetizar el carbohidrato precursor, a su vez
sustrato del locus AB0 (gen hipostático). En el cuadro había una mutación en el locus H
Interacciones genotipo-ambiente
Interacción genotipo-ambiente: fenómeno por el cual un genotipo puede producir fenotipos
diferentes en función de las condiciones ambientales.
Los factores ambientales también podrían actuar como condicionantes, de forma que su
interacción con el genotipo genera un rango de fenotipos (herencia multifactorial).
La división celular implica que el material genético sea copiado (duplicado) por completo de
manera previa. Antes de la división celular, el ADN debe duplicarse y debe ser fiel, no debe tener
problemas. Presenta tres fases:
Fase S: se da el proceso de replicación. A partir de una doble cadena, damos dos dobles cadenas.
Fase M (mitosis): cada una de esas copias van a una célula hija.
No ocurre de manera espontánea. El ADN molde: cadena que dice donde se deben colocar. Con
ella se sintetiza la cadena complementaria.
El ADN poli δ (delta)/ε (épsilon): continúan la síntesis polimerasa 5’3’. Elongación de las
cadenas. Si es alta, una vez que se une, no se suelta
El ADN poli γ (gamma): esta codificada en un gen mitocondrial. Es capaz de introducir una serie
de ribonucleotidos.
Con mis palabras: en la exonucleasa 3’--->5’, la enzima que va de 5’-->3’, se equivoca y si dispone
de una actividad Exo 3’--->5’, vuelve hacia atrás y la coloca bien.
Las cadenas que son replicadas en contra del avance de la horquilla (cadena retrasada), forman
un bucle, para poder realizar la síntesis de ADN en sentido 5’--->3’, pero de manera discontinua,
formando los fragmentos de Okazaki.
Delta: se cree que sintetiza la cadena a la misma dirección que avanza. Si avanza 5-->3, se
sintetiza en dirección 5-->3. Se trata de una cadena líder. La síntesis se da en 5-->3.
La FEN1: corta y elimina ese cebador que tenía errores. No corta desde el extremo
porque había 3-fosfato.
Las secuencias asociadas al telómero, con miles o cientos de miles de repeticiones complejas.
Terminación: replicación en los telómeros
La telomerasa, es una ribonucleoproteinas (secuencia de aminoácidos con secuencia de ARN). Y
en su interior, una cadena ARN homologa a esa repetición y media más. La telomerasa se une a
las 3 últimas bases y ella misma sintetiza ADN a partir de su ARN y los otros 6, para extenderlo.
Se mueve hacia delante y reconoce las 3 primeras de nuevo (translocación). Se cree que está
relacionado con el envejecimiento.
Transcriptasa inversa:
La localización del promotor nos determina que cadena se transcribirá: Cadena molde.
De esta manera tenemos: Genes FORWARD o con sentido (Gen A) y genes REVERSE o antisentido
(Gen B).
En humanos existen 3 tipos de ARN polimerasas (RNA-pol I, II y III), cada una se encarga de
transcribir una clase de ARN diferente:
ARN pol II y ARN pol III ---> transcriben el micro ARN y el ADN nuclear pequeño.
Transcripción de los genes estructurales
Son genes que son transcritos por la ARN polimerasa II, generando ARN mensajeros que se
traducen a proteínas. El sitio +1: primer nucleótido que se transcribe a ARN y viene
determinado por el promotor núcleo. Presenta unas etapas:
El ARN polimerasa siempre va a hacia abajo corriente abajo (con signos positivo). Corriente
arriba (signo negativo).
Las secuencias del promotor son reconocidas por factores de transcripción que guían a la ARN
polimerasa, regulando la transcripción. Se da en la cadena no molde.
El factor TFIIF (que está en el citoplasma) atrae a la ARN polimerasa II (presenta una
cola, que denomina CTD) hacia el complejo de transcripción. Se unen otras proteínas
activadoras de la transcripción (TFIIE, TFIIH), lo cual estimula la desnaturalización del
ADN del promotor.
Splicing:
Se corta el ARN, liberando una molécula de mRNA prematuro (pre-RNA), mientras la ARN
polimerasa sigue transcribiendo.
Una RNasa (Xrn2) degrada el RNA que queda unido a la polimerasa, en dirección 5’ → 3’,
alcanzando a la ARN polimerasa II y cesando la transcripción.
Puede darse el caso, que se produzca un error pero generalmente no puede ocurrir error ya que
si no se obtiene la proteína que queremos.
El factor CstF estimula el corte del mRNA por parte del factor CPSF, y
abandona el complejo.
Hay distintos puntos dentro de la célula en los que puede llevarse a cabo la
regulación de la expresión génica:
1. Remodelación de la cromatina.
2. Transcripción: Tenía regiones reguladoras (que dentro tiene el promotor
núcleo) y exones. La célula determina que promotor sirve y cual no.
3. Procesamiento RNA.
4. Transporte RNA.
5. Degradación RNA.
6. Traducción: de inmadura pasa a madura.
7. Modificación post-traduccional.
Remodelación de la cromatina
Cromatina es el complejo más importante de la dinámica de la célula. En
sentido general, el empaquetamiento de la cromatina reprime la expresión
génica.
Hay tres procesos por los que se puede alterar la estructura de la cromatina:
Desplazamiento nucleosomas
a) Remodelado del nucleosoma: cambia la estructura de ADN y así unirse las estructuras
de transcripción.
b) Deslizamiento del nucleosoma: es un giro del nucleosoma. Es un cambio brusco.
c) Transferencia del nucleosoma a otra molécula de ADN: es un salto del nucleosoma.
Modificación histonas
o Acetilación: adición de un grupo acetilo, no tiene carga positiva. Lo lleva a cabo la HAT
y la que lo puede revertir son las HDAC y sus residuos son lisina.
o Metilación: adición de grupo metilo. Lo lleva a cabo HMT, lo elimina HMD y residuos
son lisina y arginina.
o Fosforilación: adición de grupo fosfato. Lo lleva a cabo HK, lo elimina HP y sus residuos
son serina y treonina.
Ocurre en los dinucleótidos CpG, en una o ambas cadenas del ADN: Islas CpG.
Las Islas CpG son regiones de unas 0,5 a 5,5 kb con alto contenido
en dinucleótidos CpG, donde se unen activadores de la expresión
génica. Las islas CpG suelen estar próximas a las regiones
reguladoras:
Promotor núcleo: secuencias reconocidas por la maquinaria de transcripción (Caja TATA, BRE...).
Regiones reguladoras:
El promotor regulador posee distintos elementos (Cajas OCT, GC y/o CAAT), se produce una
unión de factores activadores. Regulan el ensamblado y estabilidad de la maquinaria de
transcripción.
Mismo elemento respuesta en distintos genes → Todos los genes son activados por el mismo
estímulo.
Varios elementos respuesta en un mismo gen → Un gen puede ser activado por distintos
estímulos.
Los intensificadores (enhancers) pueden ejercer su función sobre todos los genes a su alcance:
Mediante este mecanismo, los genes localizados a ambos lados de un aislador pueden tener
distintos patrones de expresión.
Ejemplo: Expresión coordinada de los genes Igf2 (insulin-like growth factor 2) y H19. Ambos en
Cromosoma 11.
Región aisladora entre ambos → ICR (Imprinting control region) con metilación diferencial.
o ICR demetilado → Se une CTCF a ICR que bloquea el paso del enhancer → El activador
solo “alcanza” a H19.
o ICR metilado → metilación de promotor H19 → El activador “salta” a ICR y H19 → solo
activa Igf2.
Este proceso es posible gracias a la existencia de secuencias en el pre-mRNA que son reconocidas
por proteínas activadoras o represoras del splicing:
Procesamiento ARN: edición post-transcripcional del ARN
Edición post-transcripcional del ARN: Modificación de la secuencia del ARN una vez maduro. Se
ha detectado en mRNA (codifica proteínas), tRNA (lleva los aminoácidos y lleva el anticodón) y
rRNA (forman los ribosomas).
En el hígado,
En el intestino, hay otro gen que codifica a otra enzima (citidina desaminasa), podre una
desaminación y produce uracilo. Tenemos un codón de parada y la proteína que se forma es
Apo48, la cual absorbe los lípidos de la dieta.
Se lleva a cabo por el ARN interferente (21-25 nucleótidos). Dos tipos principales: Micro-RNA
(miRNA) y RNA de interferencia pequeños (siRNA).
Inhibición de la traducción: miRNA
1. ARN de doble cadena originado por transcripción a partir de virus, o regiones que
generan horquillas largas.
2. La enzima Dicer corta el ARN bicatenario en pequeñas moléculas (siRNAs).
3. Una de las cadenas es reconocida por RISC (complejo silenciador inducido por RNA).
4. El complejo RISC guía al siRNA hasta su mRNA diana.
5. El apareamiento de bases perfecto con el mRNA provoca un corte que induce la
degradación.
Existen dos tipos de mutaciones que dependen del efecto que tenga en sus generaciones:
Mutaciones que causan cambios en la region codificante: no solo a codones sino a intrones
también. Puede afectar a un codón, a sitios de splicing (produce que aparezca o desaparezca
intrones), a sitios intensificadores (ESE, ISE) o silenciadores (ESS, ISS) de splicing. El 5’ UTR y 3’
UTR y sitio de poliadenilación.
Mutación sinónima (silenciosa): el triplete que se origina codifica el mismo aminoácido. Afecta
a un codón pero no al aminoácido.
o Tipo de modificación
o Sustitución
o Inserción/deleción
o Localización
o Región codificante
o Regiones reguladoras
o Causas
o Inducidas: Agentes químicos y radiación.
o Espontáneas:
Modificación química de las bases
a) Despurinaciones
b) Desaminaciones
c) Mutágenos endógenos
Errores de replicación o recombinación
a) Formas tautoméricas
b) Tambaleo de Crick
c) Deslizamiento de cadenas con repeticiones
d) Recombinación desigual
e) Expansión de trinucleótidos
Desaminaciones:
e) Expansión de trinucleótidos:
o Etilmetanosulfonato (EMS): añade grupo etilo a G. Se aparea con T. Hay una transición
G ---> A.
o Nitrosoguanidina (NG): se añade grupo metilo a G. Se aparea con T. Hay una transición
G --> A.
1. Reordenación cromosómica:
A. Duplicaciones.
B. Deleciones.
C. Inversiones.
D. Translocaciones.
2. Aneuploidía: Aumento o pérdida de
cromosomas individuales
3. Poliploidía: Alteración de la dotación
en el conjunto completo cromosomas
(3n, 4n…).
Reordenación cromosómica
Cuantos más genes presenten un cromosoma y presente aneuploidía, más efecto tiene.
En la no disyunción en meiosis I:
La disomía uniparental, son dos cromosomas homólogos de una pareja que provienen del
mismo progenitor. Hay dos tipos principales:
1. Heterodisomía uniparental:
o Los dos cromosomas que proceden del mismo progenitor son
homólogos.
o No disyunción en meiosis I.
2. Isodisomía uniparental:
o Los dos cromosomas que proceden del mismo progenitor son
idénticos.
o No disyunción en meiosis II.
Síndrome de Prader-Willi
Células cerebrales
Síndrome de Angelman
o Ocurre entre dos cromosomas acrocéntricos: 13, 14, 15, 21, y 22.
o Se fusionan los brazos largos en un solo cromosoma. Los brazos cortos se unen en otro
cromosoma pequeño, que se pierde durante la división celular.
Las DNA polimerasas de alta fidelidad (δ/ε) detienen su síntesis ante lesiones
en el ADN.
o El fármaco es beneficioso.
o El fármaco no es beneficioso. Se le puede subir la dosis, pero no pasaría nada.
o El fármaco produce reacciones adversas, las cuales pueden ser peor que la propia
enfermedad.
Se hace un seguimiento ciclo por ciclo, usando compuestos fluorescentes que se visualizan
según transcurre la reacción (agentes intercalantes, como SYBR green, o fluoróforos unidos a
sondas TaqMan). Si no se intercalan, no hay fluorescencia.
El amplicón resultante de la PCR se calienta gradualmente desde 55°C hasta 95°C (50-100ºC) y
su desnaturalización se detecta por la disminución de señal del agente intercalante fluorescente
(solo emite cuando está unido al dsDNA).
Los genotipos distintos tendrán una temperatura de fusión (Tm, melting) diferente.
qPCR: sondas TaqMan
Permite la detección de los alelos de un SNP, añadiendo a la reacción dos oligonucleótidos con
secuencias específicas de cada alelo marcadas con fluoróforos distintos (sondas).
Las sondas constan de un reporter (emite una señal de fluorescencia) y un quencher (apantalla
la señal) que sólo emitirán fluorescencia si hay emparejamiento perfecto y degradación de la
sonda (actividad exonucleasa 5’-3’ acoplada a la extensión).
Son trozos de ADN homólogos a la región que queremos genotipar. En un extremo está quencher
y en el otro el reporter. El quencher impide la fluorescencia del reporter, es decir, capta la
fluorescencia y la apantalla.
Varias escalas: desde equipos que pueden conectarse a un móvil y permiten secuenciar
genomas pequeños (MinION) hasta equipos de mayor tamaño con los que se pueden
secuenciar genomas humanos (PromethION).
m.