BIOLOGÍA MOLECULAR

Ciencia que se complementa con otras áreas afines a la Biología y a la Química, particularmente la Genética y
la Bioquímica.
- Se enfoca al entendimiento de las interacciones de los diferentes sistemas de la célula, entre ellas el
ADN con el ARN, la síntesis de proteínas y cómo estas interacciones son reguladas para lograr el buen
funcionamiento celular.

Inicio: En el año 1953 con el descubrimiento de los ácidos nucleicos por los biólogos moleculares James
Watson y Francis Crick, lo cuales presentaron la forma tridimensional del material genético.

Célula:
Unidad funcional de cualquier organismo vivo
Características
- Poseen un programa genético y los medios para usarlo.
- Son capaces de producir más de sí mismas.
Adquieren y utilizan energía.
- Llevan a cabo una variedad de reacciones químicas y participan en actividades
mecánicas.
- Son capaces de responder a los estímulos y son capaces de autorregularse.
- Las células evolucionan.
Tipos de células
Procariota Eucariota
Son bacterias Vegetal y animal
No tiene núcleo Tiene núcleo
Mide menos de 10 mm Mide más de 10 mm
No tiene organelos Tiene organelos
No tiene citoesqueleto Tiene citoesqueleto
Son unicelulares Unicelulares y pluricelulares
Reino Bacteria y Archaea Reino Protista, fungi, Plantae y Animalia
Reproducción asexual Sexual

Organización celular
Célula, tejido, órgano, sistema, organismo
- Membrana plasmática: Proteínas intrínsecas, extrínsecas
- Citoplasma: organelos
- Material genético: cromosomas contienen ADN
 Genotipo: composición genética de un organismo heredada de sus progenitores.
 Fenotipo: característica o rasgo observable de un organismo, como su morfología, desarrollo,
propiedades bioquímicas, fisiología y comportamiento.
Gen es la unidad funcional de la herencia
Ácidos nucleicos
ARN: Información de generación en generación (replicación)
RNA: Síntesis proteica (transcripción y traducción)

ESTRUCTURA DEL DNA

 1865 Medel: Descubrimiento de las unidades de la herencia, los llamó genes
 1869 Friedrich Miescher: Descubrimiento de la nucleína (hoy= núcleo proteína)
 1880 Walther Flemming: Desc. Cromosomas (corpúsculos coloreados)
 1903 Walter Sutton: Desc de cromosomas homólogos
 1909-1911 Descubrimiento del entrecruzamiento
 1911-1913 Desc. los genes pueden mapearse en orden a lo largo de la long. de cromosomas
  1944- 52’ Desc del ADN como material genético
 1953 Desc de la estructura del ADN
Estructura básica del DNA
- En los 50’s composicioón básica del DNA: el nucleotido
- Erwin Chargaff
Teoría del tetranucleótido
 DNA tiene una estructura simple de repeticiones
 No almacena información
 Cantidad de cada base en DNA debía ser casi 25% del total
Composcición de bases
 Reación de bases es muy distinta entre organismos diferentes
 Numero de purinas= numero de pirimidinas
 Esto confirió especialidad e individualidad de un organismo a otro

La revista científica Nature divulgó el 25 de abril de 1953 el artículo ‘Estructura del ácido desoxirribonucleico’,
firmado por el británico Francis Crick y el estadounidense James Watson, quienes recibieron el Premio Nobel de
Fisiología y Medicina en 1962.

Estructura
El ácido desoxirribonucleico (ADN) es una molécula compuesta de unidades llamadas nucleótidos, en los que
se almacena la información de los rasgos de un individuo (aspecto físico, grupo sanguíneo, predisposición a
enfermedades y más).

Caracteristicas
1. La molécula está formada por dos cadenas de nucleótidos, Pauling creia que se componía de tres
cadenas de nucleótidos.
2. Las dos cadenas se enrollan en espiral una alrededor de la otra, formando un par de hélices
dextrógiras.
3. Son-antiparalelas: Anti-sentido, una sube, una baja
4. El esqueleto covalente (azúcar-fosfato) se localiza en el exterior de la molécula (hidrófilo), con dos
grupos de bases que se proyectan hacia el centro (hidrófobo). Los grupos fosfato confieren a la
molécula una gran carga negativa.
5. Las bases ocupan planos más o menos perpendiculares al eje longitudinal de la molécula.
6. Las dos cadenas se conservan unidas mediante puentes de hidrógeno formados entre las bases.
7. El ancho de la doble hélice es de 2 nm.
8. Una pirimidina en una cadena está siempre pareada con una purina en la cadena complementaria.
9. Los únicos pares posibles son A-T, G-C; no hay restricciones acerca de la secuencia de bases; una
molécula de DNA puede tener cualquiera de una variedad ilimitada de secuencias de nucleótidos.
10. Los espacios entre los giros que forman la hélice crean dos surcos de diferente amplitud. Surco mayor y
surco menor. Las proteínas que se unen al DNA ocupan a menudo sus surcos
11. La doble hélice da una vuelta completa cada 10 residuos de nucleótido (3.4 nm) o 150 vueltas por cada
millón de daltones de masa molecular.
12. Las dos cadenas siempre es fija en relación con la otra, por está razón las dos cadenas de la doble
hélice son complementarias entre sí.

Importancia de la propuesta de watson y crick

3 funciones principales
1. Almacenamiento de información genética.
 El DNA debe contener un registro grabado de instrucciones que determina todas las características
heredables que un organismo puede exhibir.
2. Replicación y herencia
El DNA debe contener la información para la síntesis de nuevas cadenas
(replicación).

3. Expresión del mensanaje genético

El DNA es director de la actividad celular, la
información codificada en él tiene que
expresarse de alguna forma que participe en los
sucesos internos de la célula. Debe usarse para dirigir el orden por medio del
cual aminoácidos específicos se incorporan a una cadena polipeptídica.

- Fue de suma importancia para conocer de qué manera se llevaban a

cabo las dos primeras de estas tres funciones genéticas.
- La secuencia específica de nucleótidos en dicha fracción dicta la sucesión de aminoácidos en el
polipéptido correspondiente.
- Apoyaba que la información del DNA residía en la secuencia lineal de sus bases.
- Un cambio de la secuencia lineal de los nucleótidos de
dicho segmento provoca una mutación hereditaria en
dicho gen.
- A cada gen corresponde determinado segmento de DNA.

Empaquetamiento
1. DNA unido a histonas
2. Los nucleosomas forman “cuentas” sobre una “hebra”
del DNA”
3. Selenoides: Los nucleosomas se empaquetan en un
espiral que se enrrolla en otro espiral y así
sucesivamente
4. Los espirales se pliegan formando asas
5. Las asas se enrrollan y forman cromosomas

Formas del DNA

- La hidratación de los cristales de DNA y el contenido de
sales en los mismos modifica la laxitud de la doble hélice, originando diferentes formas del DNA.
- Se considera que el B-DNA es la forma en que se presenta la mayor parte del DNA dentro de las
células

- DNA-A
ADN con 75% de humedad, requiere Na, K o Cs como contraiones,
presenta 11
pares de bases por giro completo y 23 Å de diámetro.
- DNA-B
ADN en disolución, 92% de humedad relativa, se encuentra en
soluciones con baja fuerza iónica se corresponde con el modelo de la Doble Hélice.
- DNA-Z
Con giro a la izquierda (levógira) en un esqueleto en zigzag, y es común en secuencias de ADN que
alternan purinas y pirimidinas (GCGCGC), por lo que requiere de una concentración de cationes mayor
a la de DNA-B

ADN-A ADN-B ADN-Z

Sentido de giro Dextrógiro Dextrógiro Levógiro
Surco mayor Estrecho, profundo Amplio, profundidad Sin profundidad
media
Surco menor Amplio, no profundo Estrecho, profundidad Estrecho, profundo
 media
Diámetro hélice 255 nm 2.37 nm 1.84 nm
Unidad estructural Par de bases Par de bases Dos pares de base
Pares base/vuelta 11 10.4 12
Niveles estructurales de los ácidos nucleicos

ESTRUCTURA PRIMARIA
- Es la secuencia de nucleótidos, unidos por enlaces fosfodiéster.
- La cadena presenta dos extremos libres. el 5’ unido al gpo. fosfato y el 3’ unido a un hidroxilo
- Cada cadena se diferencia de otra por: Su tamaño, composición y secuencia de bases
- La secuencia se nombra con la inicial de la base que contiene cada nucleotido

ESTRUCTURA SECUNDARIA
- A-DNA, B-DNA, Z-DNA
- Formado por 2 cadenas de polinucleótidos en doble hélice
enrolladas en el mismo eje.
- Es antiparalela. Es complementaria. Forma un giro helicoidal dextrógiro o
levógiro.
- Descrita por Watson y Crick en 1953.
- Permite explicar el almacenamiento de la información genética y el
mecanismo de duplicación del ADN.

ESTRUCTURA TERCIARIA
- Superenrollamiento: Procariotas (DNA circular),
Eucariotas(lineal=cromosomas)
- Almacena el ADN en un volumen reducido, varía según se trate de
organismos procariontes o eucariontes
- Superenrollamiento de la molécula, negativo o positivo
ESTRUCTURA CUATERNARIA
Exclusivo de Eucariotas(empaquetamiento)
FORMA
- Eucariotal lineales
- Gran parte del ADN de las bacterias y de los virus, el ADN mitocondrial y el de los plásmidos, adoptan
formas circulares.

TOPOLOGIA DEL ADN Superenrrollamiento

 En 1963, Jerome Vinograd y colaboradores, descubrieron que dos moléculas de DNA circular de
idéntica masa molecular podían demostrar grados muy diferentes de sedimentación durante la
centrifugación.

Retorcimiento de una hélice sobre sí misma, de forma que su eje no sigue una línea recta, sino otra hélice

DNA CIRCULAR
 Negativo (-): Gira hacia la derecha una hebra con respecto la otra
 Positivo(+) : Gira hacia la izq una hebra con respecto a otra

Topoisomerasas

Las células dependen de enzimas para cambiar el estado de

superenrollamiento del DNA de doble cadena.
“Topoisomerasas porque cambian la topología del DNA."
James Wang de la Universidad de California en Berkeley descubrió las topoisomerasas

 Topoisomerasa I
Cambian el estado de superenrollamiento de la molécula de DNA tras crear una rotura transitoria en una
cadena del dúplex Esencial para la replicación y la transcripción del DNA.
 Topoisomerasa II
Rompen de manera transitoria ambas cadenas del DNA dúplex.
Son capaces de bobinar y relajar el DNA , por lo tanto pueden anudar una molécula de
DNA o desanudarla
Es necesaria para desenredar las moléculas de DNA antes que los cromosomas
duplicados puedan separarse durante la mitosis.
Son blanco de diferentes fármacos (etopósido y doxorrubicina) que se unen a la enzima
para prevenir que cadenas de DNA cortadas se unan de nuevo.

DNA MITOCONDRIAL MT
- Doble hélice circular
- Mide 5 μ longitud y presenta un PM de 10 millones,
que corresponde exactamente a 16.569 pb.
- No tiene histonas
- Dos cadenas complementarias asimétricas
- Cadena H con mayor concentración de G+T
- Cadena L
- No contiene intrones
- NO existe mecanismos de reparación.
- Su replicación es independiente del DNA nuclear
- Exclusivo de la madre
Ovulo=citoplasma
Esperma= cuello(colita)

ARN
Es el ácido nucleico más abundante en la célula eucariota, donde suele ser 10 veces más abundante que el
ADN.
1. El ARN suele ser monocatenario (una sola cadena).
2. Contiene uracilo en lugar de timina.
3. La pentosa que constituye a sus nucleótidos es la ribosa, en lugar de la 2-
desoxirribosa del ADN (la presencia del grupo hidroxilo en el C2 ́ de la ribosa
provoca que el ARN sea una molécula químicamente inestable).

TIPOS
 ARNm (Mensajero): Este tipo de ARN puede entrar y salir del núcleo sin
problemas y tiene como función transportar el material genético o ADN.

 ARNt (Transferencia): Este tipo de ARN se encuentra en el ribosoma y tiene

como función leer el material genético o ADN, cada 3 bases nitrogenadas, en
donde cada conjunto o triplete de bases forma un aminoácido (aa') especifico, la
unión de más de veinte de aminoácidos forma una
proteína.

 ARNr (Ribosomal): Este tipo de ARN se encuentra en el núcleolo y tiene

como función fabricar los ribosomas, los cuales salen del núcleo y se ubican en el citoplasma de la célula,
y en el REL.

DNA RNA
Función Repositorio de Involucrado en la síntesis de
Información proteínas y regulación génica;
génetica portador de la información
genética en algunos virus
Azúcar Desoxirribosa Ribosa
Estructura Hélice doble Generalmente monocatenario
Bases C, T, A, G C, U, A, G
REPLICACION DEL ADN

Experimental – Meselson y Stahl: utilizando bacterias e isotopos de nitrógeno, para distinguir entre las cadenas
parentales y las Re sintetizadas

Solo en DNA es capaz de realizar la replicación y reparación y síntesis de proteínas

Cada cadena tiene la información requerida para la construcción de la otra cadena

Semiconservativa: cada cadena debe construir de una hebra completa heredada a una cadena hija

Replicación de células procariotas:

Hebra molde – da cadena nueva de 5 a 3

1. Iniciación: complejo de pre-replicación

Orígenes de replicación – secuencia especifica oriC

Bidireccional
Doble hélice parental se separa y nucleótidos se incorporan a la cadena complementaria

DNA girasa: produce cortes de doble cadena y elimina superenrollamientos positivos

Proteínas:
 Helicasa – separación de las cadenas (rompe puentes de hidrogeno) – desenrolla las dos cadenas –
forma burbuja
Proteínas ssb – mantiene separadas
Topoisomerasas – deshacer superenrollamiento

Solo sintetiza de 5 a 3
Leeo de 3 a 5

1. Elongación
Empieza en cadena con OH 3 terminal – denominado “iniciador”- solo ahí se alladen los nucleótidos

RNA Primasa – sintetiza pequeños fragmentos de cebadores complementarios de ADN – para

comenzar indican
DNA polimerasa III – añade nucleótidos de 3 a 5 – sintetizan las nuevas cadenas
fragmentos de OKASAKI (nacen de la hebra retardada): de 5 a 3, por lo que añade varios fragmentos
de 3 a 5 - > Ligasa – pega

2. terminación

telómero – dice a DNA polimerasa que pare – TTAGGG – no sirven para replicar

En procariotas:
Existen multimples orígenes de replicación
1. iniciación – separación de cadenas
cebador RNA
primer
RNA polimerasa III -
Primasa – sintetiza indicadores de RNA
2. elongación
añade DNA
fragmentos de Okazaki
3. finalización
DNA polimerasa I – llena los espacios con DNA
Ligasa une fragmentos de Okazaki a la cadena continua
Separación de maquinaria

*secuencia en cadena retardada: helicasa, primasa, polimerasa III, polimerasa I, ligasa

DNA polimerasas
Alfa (retrasada) - delta(adelantada): encargadas de duplicación del DNA cromosomal o genómico
Beta: reparación del DNA
Gamma: en mitocondrias, se encarga de la duplicación
Épsilon: mas reciente, similar a delata (cadena adelantada)
Replicación de las histonas

Formación de histonas nuevas con cadenas hijas e histonas viejas en la cadena molde

Telómeros

Telomerasa: se una a una secuencia complementaria en el telómero y alarga el extremo saliente para evitar
que acorte la información genética

Un telómero es el final de un cromosoma.

Los telómeros son secuencias repetitivas de ADN no codificante del cromosoma que protegen de cualquier
daño.
Se componen de cientos o miles de repeticiones de la misma secuencia corta de ADN, que varía entre
organismos, pero en seres humanos y otros mamíferos es 5’-TTAGGG-3'.
REPARACION

¿Qué lo daña? –
radiación ionizante (rupturas frecuentes). Radiación UV (pirimidinas forman dímeros), reactivos
químicos (alteraciones estructurales)

fallo en replicación por:

- envejecimiento (senescencia)
- suicidio celular (apoptosis)
- cáncer

Reparación directa:
por agentes quelantes – enzimas que recorren el DNA – fotoliasa – puentes de timina

Sobre la marcha:
DNA polimerasa – exonucleasas

Rupturas de cadena sencilla:

mal apareamiento por –
escinción de bases (BER): reparación – elimina nucleótidos alterados por reactivos químicos
escinción de nucleótidos (NER)- elimina lesiones de dímeros de pirimidinas

Rupturas de cadena doble:

recombinación no homólogos – unión de extremos homólogos
reparación – utiliza proteínas quinasa para separar y reparar

Proteínas P53:
apoptosis

Respuesta SOS:
Nucleótidos al azar

reparación de cadena sencilla

De mal apareamiento (MMR) – sistema para reparar y reconocer la incorporación de bases erróneas
durante la replicación y recombinación

ENFERMEDADES POR FALLO DE REPARACION DE DNA

- Xerodermia: defectos en genes XPA-XPG que codifican para las proteínas de los mecanismos
de reparación NER. Sensibilidad de todas las fuentes de radiación UV
 - síndrome de Bloom: daño en el gen BLM, que codifica proteína de las helicasas y falla la
recombinación homologa. Hipersensibilidad a la luz, presenta un rash eritematoso

- anemia de Fanconi: recombinación homologa y síntesis de translesion del ADN y predispone

individuos afectados por cancercomo.

- progeria: envejecimiento prematuro de inicio postnatal de la familia de las helicasas de DNA y

falla de la recombinación homologa

- ataxia telangiectasia: diferentes mutaciones en la proteína ATM, reduce la recombinación

homologa, provocando degeneración neuronal progresiva

- síndrome de Cockayne: mutación en genes ERCC8 O 6, que afecta reparación NER. Sensibilidad
a la luz solar, baja estatura y apariencia de edad prematura

¿Qué es un gen?
Unidad elemental de la herencia, región física y funcional que controla una característica hereditaria
concreta.
Se comprende de:
- región estructural: codificante, determina la expresión real del gen. Incluye exones e intrones
- región reguladora: no codificante, rio arriba (hacia 5) de la región estructural, incluye regiones
promotoras
Nomenclatura:

genes: 3 letras minúsculas y cursivas

proteínas: 3 letras mayúsculas, sin cursivas

transcripción – dogma central de la biología celular

síntesis de acido ribonucleico a partir de una plantilla de DNA
las RNA polimerasas: incorporan nucleótidos en una cadena de RNA cuya secuencia es
complementaria de una cadena ADN, la cual actúa como plantilla o molde
inician la transcripción con ayuda de un factor sigma, inicia después de 9 bases

Eucariotas Procariotas
Polimerasa RNA I, II, III 4 subunidades proteicas: 2 alfa, beta, beta prima
Dos subunidades grandes: beta y beta prima y factor sigma = holoenzima
De 12 a 15 proteínas pequeñas adicionales
Iniciación
Iniciación - reconocimiento TATA: gracias a factor
- reconocimiento TATA, por RNA sigma
polimerasa II - apertura de doble hélice
- apertura de doble hélice - caja tata- promotor, que concuerda con
elongación tamaño de la holoenzima
- ARN poli: lee 3 a 5 y polimeriza 5 a 3 elongación
Finalización - factor sigma se suelta después de 9
- Añade en 5 una 7 metilguanosina bases polimerizadas
- CAP: guía para salir del núcleo, indica - ARN poli: lee 3 a 5 y polimeriza 5 a 3
inicio de traducción al RNAt, protección Finalización
en citoplasma - Zona CGTTTTTT
- Zona TATA - Dependiente de RHO
- Añade la cola Poli A
Maduración
- Trascripto primario
- Splicing: cortar intrones y empalmar
exones
- Trascrito secundario- RNA mensajero
maduro