Introducción

Fenol es un anillo aromático con un hidroxilo, al oxidarse da muchos compuestos reactivos. El

alcohol está formado por una cadena alifática con un hidroxilo, al oxidarse da aldehídos y
cetonas.

El fenol es más acido que el alcohol porque cuando se desprotona, la carga negativa que tiene,
la tiene deslocalizada en todos sus átomos y por ello el anión es más estable, el alcohol tiene
una carga negativa localizada siendo mas inestable.

La deficiencia de vitamina C o ácido ascórbico provoca rotura de huesos y hemorragias.

El colágeno es una proteína fibrosa en estructura de triple hélice de aminoácidos, es necesaria

que la prolina este en forma de hidroxiprolina. Cuando se forma la proteína se hidroxila, la
lisina y prolina pasaran a ser hidroxiprolina e hidroxilisina. El colágeno sin hidroxiprolina no
forma cadenas de hidrógeno. Estos compuestos son necesarios para el mantenimiento de
huesos. Otro problema son las hemorragias, el déficit de vitamina C provoca el desgastamiento
de vasos sanguíneos provocando su rotura y hemorragias.

La complejidad de la composición de los seres vivos ha generado nuevas disciplinas que tratan
solamente sobre ciertas partes de la composición molecular y estos conjuntos de moléculas se
las conoce como:

- Glicoma es el conjunto de las moléculas modificadas por hidratos de carbonos,

específicamente las proteínas.
- Lipidoma, conjunto de todos los lípidos que tienen un determinado organismo.
- Genoma son todas las moléculas relacionadas con ácido nucleico.
- Proteoma, conjunto de todas las proteínas de un organismo.
- Metaboloma es el estudio de todos los metabolitos que tiene un individuo.

La biología de sistemas se basa en entender el funcionamiento normal del organismo.

a) Hitos en el desarrollo de la bioquímica:

- Secuenciación de la insulina, es una proteína pequeña, pero fue la primera proteína
que se secuencio con el método de Sanger. (Fred Sanger).
- Secuenciación de los ácidos nucleicos.
- Watson, Crick y Rosalind Frankling. Explicar la geometría de la difracción de rayos x en
el átomo.
- Descubrimiento de la penicilina, primer antibiótico que se descubrió. Alexander
Fleming.

b) Átomos mayoritarios de los seres h.umanos

- H, O, C, N, Ca, P, Cl, K, S, Na, Mg.

Las moléculas orgánicas se caracterizan por la formación de enlaces, el átomo más versátil es
el carbono, este se puede enlazar de diferentes maneras por diferentes tipos de hibridaciones.
Las hibridaciones es la interacción de los orbitales. El carbono tiene 6 electrones totales y 2 en
la última capa. Permite formar 4 enlaces, los orbitales se deben hibridar, 4 exactamente y los
llamaremos sp3 (tetragonal s1 px1, py1 y pz1). Existe la posibilidad que tenga hibridación sp2
(plana y trigonal). También se puede formar triples enlaces dando una estructura lineal.

El doble enlace es más reactivo porque se le puede añadir agua, el hidrogeno se añade a un
carbono y el OH en otro formando un alcohol, tienen más capacidad de reacción que el enlace
sencillo ya que este solo se puede romper u oxidar. La distancia de enlace y geometrías van a
ser muy características. Los enlaces pueden girar o no. Si tiene giro libre puede tener
diferentes conformaciones especificas a no ser que haya grupos sustituyentes que limiten ese
giro. La molécula tendrá una conformación especifica con propiedades específicas.

Las macromoléculas:

- DNA tiene una masa de 2 x10^10 Daltons. Un mol de DNA 10 mil millones de gramos.
Con propiedades de almacenamiento y transmisión de la información genética.
- Proteínas tienen masas de 10.000 a casi 1 millón de Daltons. El colágeno está formado
por un polímero de proteínas, la mioglobina tiene forma globular y es pequeña.
Propiedad estructural (queratina), enzimas (hidroxilasa), hormonas (secretadas por el
organismo que irán al tejido diana, que tendrán receptores de membrana que serán
proteínas y producirán un efecto. Ej: hormona de crecimiento, glucagón), receptores
(acuoporinas)
 La mioglobina tiene un grupo Hemo en el centro con un átomo de hierro que va a
unir oxigeno cuando se necesite. El cachalote se utilizó para purificar mioglobina
porque retiene mucho oxígeno.
- RNA, (25.000 Da) propiedad de almacenamiento y transmisión de la información
genética.
- Polisacáridos, (500-1000 Da) pero no los monosacárido o disacáridos. Esencialmente
estructural (celulosa) y de reserva (almidón o glicógeno)

Los lípidos no son macromoléculas excepto si están unidos a proteínas. Tienen

propiedades de almacenamiento de energía, membranas etc.

Macromolécula Monómero Enlace

Proteínas Aminoácido Péptido (amida9
Polisacárido Monosacárido Glicosido (éter)
AN Nucleótido Fosfodiester
lípidos Ácidos grasos ester
Los fosfatos pueden formar 3 enlaces porque tiene 3 OH.

c) Enlaces Los átomos están unidos con enlaces y estos tienen energía de enlace. La energía
de enlace es la energía necesaria para romper el propio enlace. La energía se representa
en Kj/mol.
- Enlaces fuertes:
 Enlace covalente. Los enlaces covalentes son estables y en ocasiones se rompe
mediante algún tipo de estrategia química o aportando energía necesaria, pero
esto no se da mucho. Cierto tipo de reacciones que tienen tendencia a darse.
Están por encima de la radiación visible.

Si tenemos un ácido graso para dar CO2, deberíamos insaturar un simple enlace
para dar doble enlace (estamos oxidando porque pierde 2 electrones), a
continuación, hidratamos con una molécula de agua y nos daría;

-C—C—CH—CH—C—C --C—C—C=C—C-- --C—C—C—C--C

 Las energías de enlaces dobles y triples son más fuerte que los sencillos. Aunque
la molécula sea estable es un sumatorio de enlaces simples y serán lábiles para
que se rompan con productos químicos.

- En las interacciones débiles tendremos. Las interacciones no covalentes son de

naturaleza electrostática.
 Enlaces de hidrogeno se establece entre un H que está unido a un átomo muy
electronegativo y otro átomo electronegativo que tenga pares de electrones
para compartir.
--0—H—0=C

Los enlaces de hidrogeno son direccionales, tienen implicaciones geométricas

en las moléculas influyendo en la ordenación de átomos. También están
presentes en el agua, el agua puede formar enlaces de hidrogeno como
donador y aceptor.
o Las proteínas son polímeros de aminoacido, cada aa puede formar dos
enlaces estabilizadas por enlaces amida (enlace covalente). También
están influenciadas por los enlaces de hidrogeno que dará una estructura
u otra. La hélice alfa, un elemento estructural común en las proteínas, se
mantiene por enlaces de hidrogeno N-H…..O=C entre grupos de la
cadena proteica. Dando estructuras como el pelo.

 Fuerzas de van der Waals Son interacciones muy débiles que mantienen unidas
temporalmente átomos o moléculas no polares. También son interacciones de
tipo carga-carga, pero dependen de la distancia entre átomos. Son "dipolos
temporales", solo en el momento en que el electrón de un átomo se acerca o
aleja del átomo con el que está enlazado.
  Puentes salinos En la célula, los iones (por ejemplo, Na+, K+ o Cr) van a
establecer entre sí, interacciones de tipo electrostático (entre cargas opuestas),
también denominadas puente salino. Es una interacción entre moléculas
cargadas. Por ejemplo, fosfatos (-) unido a histonas (+) en el DNA.

Cuando las moléculas se separan unas de otras el proceso de rotura de interacciones

viene dado por el peso molecular, a mayor peso, más cantidad de interacciones y
mayor energía hay que aportar para romperlos. Cuando hay enlaces de hidrogeno
entre esas moléculas, la molécula que debería ser gaseoso es líquida, el agua. La
energía que hay que darle es mucho mayor. Los parámetros asociados son los puntos
de fusión y ebullición.

Un ácido graso saturado respecto a uno insaturado tendrá interacciones más fuertes
entre moléculas el saturado y los enlaces más fuertes dentro de moléculas será en los
ácidos grasos insaturados.

Algunas moléculas sufren interacciones, no porque tengan cargas netas, sino porque poseen
momentos dipolares. El CO y el H2O tienen momentos dipolares. Los Px, Py y Pz tienen algunos
de 90 grados entre ellos.

- En el agua las nubes electrónicas del 2s2 y Px2 se repelen entre sí en el átomo más
electronegativo que es el oxígeno, entonces al repelerse debería tener un ángulo de 90
grados más pequeño, pero no es así porque los átomos están hibridados.
El agua es polar, existe una distribución irregular de densidad electrónica, tiene dos
pares de electrones enlazantes y dos pares de electrones libres dando un ángulo
menor a 109º.

- El CO2 tiene 2 átomos de oxigeno que comparten 2 pares de electrones dando minina
repulsión entre sus pares de electrones enlazantes. Es apolar por su momento dipolar
es cero ya que porque se anulan y da una geometría lineal.

Se puede inducir el momento dipolar. Las interacciones carga-carga son mayores en ordenes
de magnitud de interacciones de van der Waals. Las de van de Waals depende de la distancia a
mayor cercanía más fuertes son. Los enlaces de hidrogeno son energéticamente inferior a un
enlace covalente.

El DNA tiene dos cadenadas con enlace covalente entre nucleótidos y enlace diester, tienen
fosfatos, estos tienen fuerzas repulsivas porque tienen carga negativa, no atractivas y
disminuyen con la distancia. En los que respecta a las bases nitrogenadas de una misma hebra,
son moléculas aromáticas y planas y tiene disposición de moléculas apiladas entre ellas en
dobles hélice y hélices sencillas. Se establece fuerzas de Van de Waals entre las bases
nitrogenadas apiladas. Las bases nitrogenadas de una hebra a la otra pueden formar enlaces
de hidrogeno. Estos tienen una direccionalidad y dan una estructura determinada. Las histonas
y el DNA se atraen porque la histona al ser una proteínas tiene alta contenido en aminoácidos
básicos (arginina y lisina) con cargas positivas en las cadenas laterales, los grupos de carboxilo
y amino no cuentan como cargas porque están formando el enlace amida, no están libres. Las
cargas positivas estarán atraídas por las cargas negativas de los fosfatos del DNA.

Loa DNA suelen están acomplejados con las histonas que tiene cargas + en la cadena lateral de
los aminoacidos básicos. Interaccionan puricas con pirimidicas.

d) Grupos enlaces funcionales 1,2,3,4,5,6

Hidroxilo Éter

Alcohol Ester

Carbonilo Anhídrido

Carboxilo Amida

Amina

Grupo enol Interconversión entre grupos

carbonilos y enol

Guanidino Si se rompe daría lugar a la

urea. Va a ser bastantes más
básicos por la deslocalización.

Imidazol Grupo funcional de la

histidina

Sulfidrilo También llamado tiol y

aparecerá en la cisteína o en
la coenzima A. será muy
importante por los enlaces
que forma.
Grupo amino Se encontrara protonado por
debajo al ph = PKa y por
encima estará desprotonado.

Imina Base de schiff por la

deshidratación del grupo
carbonilo y amino.
Guanidinio Protonado

Disulfuro formado por dos tiol, se

formar por una reacción
redox de oxidación

Se formara entre un grupo

Tioester carboxilo y un tiol. Aparece
en la coenzima A. los tioester
tiene unas características
peculiares porque son menos
inestables que los esteres y
tienen más tendencia a
hidrolizarse.
Fosfórico

Fosfoanhidro

Fosfoanhidrido mixto

Fosfodiester

Acetil Tiene que estar a un oxígeno

para ser un acetil derivado
porque sino hablaríamos de
una acetona. Tiene un
agrupamiento éster.
Un radical es un sustituyente, con carencia de un hidrogeno para formar un enlace.

Propilo Fenilo

Etilo Propionil

Alilo Acil

Vinilo

- Ácido salicílico o dos hidroxibenzoico da una molécula derivada que es un

acetilsalicílico. Proviene de un árbol llamado salix.

- Hisitidina, no se puede romper ni por el Carbono- Carbono del grupo imidazol, ni el

grupo amino unido a un carbono por enlace covalente, ni tampoco por el carbono del
carboxilo. Pero los sustituyentes sí podrían reaccionar con otros compuestos. Las
síntesis de histidina es muy complicado.

- Epinefrina o adrenalina no se podría romper por ningún sitio. Podríamos protonar el

grupo amino y formar una sal cuaternaria. Se podría ionizar fácilmente los grupos OH
unido al benceno denominado fenol.
- Acetil coenzima A el acetilo está unido con un tioester a la coenzima A. se podría
hidrolizar el tioester dando tiol y acido carboxilo, en enlace tioester es rico en energía
porque es poco estable en el enlace fosfoester al hidrolizarlos nos dará el fosfato y el
hidroxilo, estos no son muy ricos en energía, la reacción de formación no está
favorecida pero si la de hidrolisis. En anillo de la derecha es una anillo de purina o
adenina, la purina está unida con el nitrógeno a CH, una hidrolisis en ese punto daría
un alcohol, llamado N-glicosidico (moléculas nitrogenada unido a un alcohol). El
fosfato unido al anillo principal puede estar cargando y depende del PH en el que este.

A partir de ácido pantotenico sintetizaremos el acetil Coa. Se podría formar un

derivado a partir de propionico que daría propionil Coa. Los ácidos grasos van a estar
normalmente en forma de derivados de CoA. Los ácidos grasos son cadenas
hidrocarbonadas capaces de formar derivados de CoA.

- Adenosintrifosfato (ATP), es un compuesto considerado rico en energía. Esta molécula

tiene una adenina unida a una ribosa mediante un enlace glicosidico de tipo
fosfoanhidro. Esta molécula llamada adenosina está unida a tres grupos fosfatos. El
primero fosfato está unido al oxigeno del carbono 5 de la ribosa mediante un enlace
fosfoester y este primer fosfato denominado fosfoanhidrido, está unido al segundo,
denominado fosfato anhidro, mediante otro enlace fosfoanhidro. El ser un compuesto
rico en enrgia se debe a los enlaces fosfoanhidro y este hecho se puede ilustrar
diciendo que la variación de energía libre de la reacción de AG del enlace es muy
negativa a, con un valor aproximado de -30 kj/mol.
El ATP es la moneda energética por antonomasia, no va a almacenar energía, es una
formar de energía para sintetizar biomoleculas, transporte de membranas y formación
de gradientes y trabajo mecánico.

 Proceso de transducción de señales, en las cuales una señal de un tipo se

convierte en señal de otro tipo, ejemplo transducción de hormonas.
 o Una hormona podría ser la adrenalina, sintetizada por la capsula
suprarrenales (medula), las capsulas suprarrenales reciben señal de la
hipófisis a través de vías nerviosas por una señal. La señal extracelular
llega a la célula, la señal extracelular produce una señal intracelular que
va a provocar la unión de un receptor de la célula y produce unos
efectos. La adrenalina activa células G mediante una señal química y
provoca que el ATP pase a AMP cíclico, la fosfodiesterasa rompe uniones
fosfodiester del ATP (3 fosfatos) para dar AMP cíclico (2 fosfatos). El AMP
cíclico se une a la proteinquinasa A (une fosfatos del ATP a otras
proteínas) produciendo unos efectos como aumentar la degradación de
glucógeno, una vez degradad se convierte en glucosa libre y esta glucosa
podrá ir al musculo por ejemplo, por una situación de estrés.

 También habrá transducción de energía, una energía de un tipo se transformara

en energía de otro tipo.
o Como por ejemplo energía de hidrolisis (romper enlaces para dar
energía)
o Potencial electroquímico. El potencial electroquímico es cuando hay
diferente concentración de cargas, a un lado habrá cargas positivas y al
otro lado cargas negativas, dará un potencial eléctrico debido a la
diferencia de cargas pudiéndose trasducir a energía de hidrolisis.
o Los fotones, son radiaciones electromagnéticas (luz visible, ultravioleta o
infrarrojo). Las radiaciones electromagnéticas provocan que ciertas
sustancias de saltos electrónicos y absorban la radiación a través de
fotoreceptores . se pueden transducir en energía de reducción.
o Proceso redox, un ácido graso se puede oxidar obteniéndose mucha
energía porque es una molécula muy reducida, la energía de oxidación se
saca poco a poco para que la célula la pueda utilizar. En pasos redox esta
energía se puede convertir en energía química de hidrolisis.

 Tenemos una molécula que será un aldehído, tiene energía de oxidación

y puede pasar a acido carboxilo. El fosfato se unirá al ácido y formara un
anhidro mixto que tiene tendencia a romperse para dar otra vez ácido y
fosfato.
7
 El NADH tiene poder reductor y puede reoxidarse de manera que cederá
electrones y estos electrones serán captados por alguien, provocando
una trasferencia electrónica en cadena (cadena transportadora de
electrones), el aceptor de estos electrones será el oxígeno
transformándose en agua. Da una gran cantidad de energía, esta energía
se transfiere en pequeños pasos para ser utilizada, esta energía redox se
convierte en potencial electroquímico. El potencial electroquímico nos
ayudara a sintetizar ATP.

Los electrones serán captados por el aceptor final llamado NADP+ que se
convertirá en NADPH. El NADPH reduce al CO2 a componentes
biológicamente de la cadena transportadora de electrones utilizable
como la glucosa, es muy importante porque será fuente de carbono.

- Cianocobalamina o vitamina B12 (se encuentra en las células hepáticas) las flechas del
centro indican enlace dativo, átomo con pares de electrones sin compartir y que puede
establecer enlaces. Los enlaces dativos se dan entre los nitrógenos y el cobalto iónico 2
con carga positiva. El cobalto también esta único con un carbono procedente del
grupo funcional cianuro. Tiene un dimetil derivado del benzimidazol con enlaces
conjugados, grupos fosfatos con agrupamiento fosfoester formando un fosfodiester,
grupos amido, y anillos pirrol con el nitrógeno formándose un tetrapirrol.
Para desprender el cianuro se acidularía el compuesto. Se pueden romper los enlaces
amida, N-glicosidico

El cianuro es malo pero esta acomplejado y tiene poca cantidad por eso no llega a ser
peligroso. El cianuro es peligroso porque se suele acomplejar con el hierro del grupo
hemo provocando que no se pueda transportar oxígeno, asfixia.
La hemoglobina al oxidarse, es el paso de fe 2+ a fe 3+ pasando a metahemoglobina es
peligroso porque solo la FE2+ transporta el oxígeno.
1. Ácidos dicarboxilicos
El ácido carboxílico más sencillo sería el de dos carbonos. Saberse los primeros 5

Los ácidos a pH fisiológico están ionizados (aniones), los dos carboxílicos estando en
dianiones por ello se nombraran como aniones.

Existen otros aniones

Oxalacetico

Ácido maleico (cis)

Ácido fumarico (trans)

Otros ácidos dicarboxilicos y tricarboxilico

Malico o malato

Alfa-cetoglutarico
Ácido cítrico. No es Asimétrica, sin isómeros
pero se comporta biológicamente como
asimétrico.

Ácido isocitrico. Asimétrico con 4 isómeros

Cis-aconito

Oxal succínico

Lactato y pirutavo

a) Letras griegas
Posición alfa: cuando tenemos una función oxigenada con grupo carboxilo o carbonilo,
denominaremos alfa al carbono contiguo respecto al carboxilo.

--CH2—CH2—CH2—CH2—COOH
5 4 3 2 1
Ganma beta alfa

El otro caso cuando utilizamos alfa es cuando tenemos un grupo cetona, los CH2 están en
posición beta respecto a la cetona.

--CH2—CO—CH2

La omega se utiliza mucho en los ácidos grasos, se refiere a cuando tenemos una cadena muy
larga, a la última insaturación la llamamos omega para no saberse todos el abecedario griego.
Omega tres significa que empezamos a contar desde el ultimo carbono y la sobre
instauraciones está en la posición 3 respecto al omega. Una cadena de 18 carbonos con una
insaturación C16 y otra en C12, diríamos que es un omega 3. Se nombra la última insaturación
por eso un omega 3 puede tener varias insaturaciones. Las insaturaciones van de 3 carbonos
en 3 carbonos. Más allá de delta 9 no podremos introducir más instauraciones.

Son ácidos grasos esenciales porque no podemos sintetizarlos, tienen importancia en

prevención de enfermedades patológicas.

Es importante donde se encuentren los dobles enlaces porque puede dar compuestos
conjugados o no conjugados
Los compuestos conjugados tienen niveles energéticos son más bajos, sus niveles son más
cercanos, dando saltos más fáciles, saltos de radiación visible como los pigmentos. Los ácidos
grasos tienen instauraciones alternadas.

Los dobles enlaces condensados son muy inestables --C =C=C—C

b) Compuestos
- Lactonas: éster ciclado, heterociclo que se forma tiene un heteroatomo que sería el
oxígeno que cerrara el ciclo. Se forman con una molécula con carboxilo y un hidroxilo
se cicla con un ácido y da una lactona.

Delta lactona

- Lactama: amida cíclica, el puente será un nitrógeno. Los átomos de 5 o 6 carbonos son
más estables porque sus ángulos se parecen más a la hibridación de los carbonos. Los
antibióticos tiene beta-lactama (amoxicilina). El beta-lactamico es inestable y reactivo,
dejaríamos que se inactivara si lo hidrolizamos con microorganismos con enzimas
beta-lactamasa haciéndose las bacterias resistentes. Los antibióticos rompen la pared
de la bacteria (peptidoglicano) y muere por presión ornatico porque se hincha, ataca a
bacterias que se dividen.
Otra forma es utilizar inhibidores de beta lactamasa (amoxicilina con ácido
clavulanico), entrarían dentro de la bacteria inhibiendo la beta lactamasa haciendo
que la bacteria no pueda luchar contra la amoxicilina, no funcionaría estabilizando la
lactama porque al estabilizarla, no reaccionaria con la pared bacteriana.

Beta

- Serina y homoserina. El carboxilo con el hidroxilo si reaccionaria podrían formar una

lactona, sería más fácil que se produzca esta reacción con la homoserina porque darían
un anillo de 5 carbonos, es más estable porque se parecen más a la hibridación
características de esos ángulos.
c) Anillos
- Hidroxihexano: no es una molécula plana. No tiene carbonos asimétricos.
- Naftaleno anillo condensado de dos benzenos. Un hecano es tridimensional teniendo
conformación de silla o bote.

- Benzoquinona, tien dos carbonilos, no es una cetona, es una

naftoquinona/benzoquinona. Tiene una cadena terpenicas. Vitamina K. si tuviera un
OH hablaríamos de fenol no de alcohol.

- Antraceno y fenantreno, tres anillos condensados, si están lineales se llamada de una

manera y sino será el fenantreno.

- Ciclopentanoperhidrofenantreno, es un esteroide, es un anillo de colestano (anillo

base del colesterol). Tiene un fenantreno totalmente hidrogenado (sin dobles enlaces)
con un ciclopentano.
La posición 13 y 10 puede haber sustituyentes y sobre 17 suele haber una cadenas mas
larga.

El colesterol tiene isómeros (4 sustituyentes diferentes), con 8 isómeros posibles pero

solo 1 con funcional natural. Las proteínas serán las moléculas que reconocerán y
diferenciaran estas moléculas con diferentes estructuras espaciales.
d) Heteroclicos (ciclos con una átomo diferentes al carbono). Pueden tener diferentes
grados de insaturacion y los heterociclos tiene una insaturacion concreta.

- Furano y pirano: su heteroatomos el oxígeno. Estos ciclos darán lugar a las furanosas o
piranosas, derivados de azucares.
Están totalmente insaturados, se empieza a numerar por el oxígeno porque tiene más
peso atómico, sería el 1 y nos daría igual numerar hacia la derecha o izquierda sino
tuviera sustituyentes.

- Pirrol. Empezaríamos a numerarlo por el nitrógeno, es un heterociclo insaturado. Se

podría protonar para dar NH2+ y luego desprotonarse. No al revés. 8. El NH no puede
desprotonarse para dar NH-.

- Imidazol: 2 nitrógenos separados por un carbono, si estuvieran juntos tendría un

nombre diferentes, numeraríamos por un nitrógeno hacia el otro. Es importante
porque es la cadena lateral del aminoácido histidina, el grupo puede tener
características acido base, se podría protonar uno de los nitrógenos, nunca los dos
porque no soportaría el anillo dos cargas positivas, daría NH NH2+ o N NH+ y
luego se podrían desprotonar.

- Piridina: anillos de 6 insaturado, es una anillo aromático, es decir plana. Se puede

protononar sobre el nitrógeno y tener una carga positiva. Puede tener un radical en el
nitrógeno y dar NAD+. Servirán en intervenir en reacciones redox, cuando oxidamos
compuestos lo que hacemos es reducir otros compuestos (nad+ o NADH)y volverse a
reoxidar en la cadena de electrones y todo esto nos ayudara a sintetizar ATP. También
está relacionado con la vitamina B6. 9
- Indol: aparece como cadena lateral, es un anillo condensado de un anillo de benceno y
un pirrol. Se empieza a numerar por el nitrógeno y aparece en la cadena lateral del
triptófano.

- Pirimidina es una anillo de 6 con dos nitrógenos en posiciones 1 y 3, se numera

empezando por un nitrógeno hacia el otro, se unirá por el nitrógeno 1 para unirse a la
ribosa y pasar de nucleótido a nucleótidos.

- Purina es un anillo condensado con un pirimidina con un imidazol. Empieza la

numeración por el nanillo e 6, se une por el nitrógeno 9 a la ribosa. La adenina se
denomina 6-amino purina.

- Tiazol se número por el azufre hacia el nitrógeno, apareció en la vitamina B1 o tiamina.

La tiazolidina aparece condensando con un anillo betalactamico.

- Isoaloxazina tiene una interconversión en dos formas, el paso de la primera sustancia a

la segunda sufre un proceso de reducción porque capta dos electrones.
 10

e) Grados de oxidación del carbono

La oxidación es la perdida de electrones y la reducción es la ganancia de electrones.
Habrá procesos globales redox pero pocas reacciones individuales redox. 11
4e

Pierde 2e- 2e 2e 2e

Gana 2- 2e 2e 2e

- En la oxidación del metano, hemos pasado de un 4- a 4+, quiere decir que han perdido
electrones, 8 en total y han sido captados por 4 átomos de oxígeno y cada oxigeno ha
aceptado 2 por ello ha captado un total de 8 electrones. Oxidación

- En el formaldehido, el carbono tiene un estado de oxidación de 0, ha perdido 4

electrones, que han sido captados por el oxígeno. Oxidación.
0 4+
HCHO + O2  CO2 + H2O

- El grado de oxidación del metanol seria 2, pasando de -2 a +4, ha perdido 16

electrones.

-2 +4

Cuando se produce la oxidación de estos compuestos ha CO2 puede pasar que se

produzca una combustión no completa, cunado falte el oxígeno, los compuestos
pasaran a CO, se forma en concentración baja, el CO se unirá al grupo hemo donde se
 encuentra el oxígeno. EL Co se une con mayor afinidad que la del oxígeno y por ello
produce una intoxicación. El estado de oxidación seria -2. El CO2 no se une.12

5 O2
HOH2C-CH2OH
Dialcohol
1 O2
HOOC-COOH
Dicarboxilico
5 O2
CH2-CHO
Acetaldehido
3 O2
CHO-CHO
Formaldehido

f) Alquenos 13

CH2=CH2
Eteno/etileno

CH3-CH3
Etano

CH3-CH2OH
Etanol

El hidrocarburo insaturado CH2=CH2 está más 2e mas oxidado que el etano CH2-CH2.

--C—C—C—C—C—C MAS REDUCIDA

--C=C—C=C—C=C-- MAS OXIDADA 6 electrones

El eteno para pasar a etano se convierte por hidrogenación y al revés seria por oxidación. El
eteno para pasar a etano se va a hidratar.

14
 Succínico Fumarico Málico Oxalacético

El NADH y FADH2 lo reoxidamos

2. Reacciones redox

La mayoría de la energía biológica proviene de la oxidación de metabolitos más o menos

reducidos en una serie de reacciones como el oxígeno como aceptor final de los electrones.

No toda la energía metabólica proviene de la oxidación mediante el oxígeno. Otras sustancias,

diferentes al oxígeno, pueden ser los aceptores finales de los electrones.

El proceso de aceptor final de e que desempeña el oxígeno lo pueden hacer otras sustancias en
organismo anaerobios, como el nitrato reduciéndose a amoniaco o nitrógeno. También poder
ser le nitrógeno que se reduzca a amoniaco.

a) Lactato a piruvato
El lactato se oxida en el grupo alcohol para pasar a un grupo carbonilo, al estar hablando
de un alcohol secundario la función es cetona, si fuera un alcohol primario será a un
aldehído. Los aldehídos tienen carácter reductor. el proceso de glucosa a piruvato se
produce NADH por la oxidación del NAD, la reoxidacion de NADH a NAD se produce gracias
al oxígeno. La forma para reoxidar el NADH se haría reduciendo el piruvato a lactato.

Un alcohol primario está a unido a un carbono que también está unido a un carbono. Se
oxida a aldehído.

--C—C—OH

Un alcohol secundario está unido a un carbono que este está unido a dos carbonos. Se
oxida a cetona
 OH
--C—C—C
Un alcohol terciario está unido a un carbono que este está unido a 3 carbonos.

OH
--C—C—C

De lactato a piruvato la reacción se oxida en el carbono dos a grupo ceto, se pierde

electrones, los electrones los ganara NAD convirtiéndose en NADH, catalizado por un
enzima llamada lacto deshidrogenasa.

b) Acetil CoA a malonato

c) Paso del gliceraldehido 3 fosfato a 1-3 bifosfoglicerato

Gliceraldehido 3 fosfato. En el carbono uno tenemos una función aldehído (carbonilo
terminal aldehído) y en el carbono 2 tiene una función alcohol y el carbono 3 tiene
también función alcohol formando un fosfoéster. Se denomina gliceraldehido porque en
vez de tener 3 alcoholes en el glicerol, tiene en el carbono uno tiene un aldehído.
La molécula de 1-3 bisfosfoglicerato el carbono 2 y 3 es igual que en el gliceraldehido, en
cambio cambia el carbono 1 porque está fosforilada. Y está más oxidado porque es un
carboxilo unido a un ácido fosfórico formando un enlace anhídrido mixto. En el 1,3
bifosfoglicerato es más energético que el ATP, al estar unido a un fosfato impide formas
resonantes siendo mas inestables.
En definitiva, se ha producido una oxidación (pérdida de electrones) de un aldehído a un
ácido.

d) Fosfoenolpiruvato a piruvato.
El enlace fosfoester es muy energético porque está impidiendo formas tautomerías, esta
desestabilizando la molécula y su rotura esta favorecido. Favorece que el ATP se fosforile.
e) Convertir ácido graso en cadena hidrocarbonada
Es pasar del grupo ceto a metilo, es una reducción. Es una reacción complicada.
El grupo ceto lo hemos convertido a alcohol produciendo una deshidratación, una vez
conseguido el doble enlace se hidrogena. Se ganan 4 electrones 19

f) La oxidación de glucosa a CO2

Los electrones no van de la glucosa al oxígeno porque arderíamos, la liberamos poco a
poco a moléculas intermedias como NAD+, FAD. Tiene mucha tendencia a darse pero es
lenta.
La oxidación global se va a producir gracias a las enzimas. 20

g) Que esta mas oxidado un ácido graso o la glucosa.

Glucosa Ácido graso (palmítico)

Las reacciones con el oxígeno se hacen para ver que reacción está más oxidada que la otra
cuando tenemos los mismos carbonos, la glucosa con ácido grasos no se podría comparar
así. Las reacciones dependen del estado inicial y final no de los pasos intermedios. Las
moléculas más reducidas son mejores para almacenar energía. Los ácidos grasos están más
reducidos y se utilizan para almacenar energía en forma de TG en el tejido adiposo,
mientras el HC está en forma de glucógeno.
 La glucosa está más oxidada, sus carbonos están más oxidados que los carbonos de la
cadena hidrocarbonada del ácido grasos, sin embargo el carboxilo del ácido graso es el
más oxidado peor hay que mirar los demás carbonos.
Si comparamos la glucosa con un insaturada estaría más oxidada que uno saturado pero
aun así menos que la glucosa.

Los ácidos grasos son muy insolubles, debe de transportarse en forma de seroalbumina
por la sangre al tejido que queramos, se almacenan en forma anhidro. Los azucares son
solubles, se almacenan hidratados (almacenamos agua)

Hay reacciones de transferencia de protón a dos electrones, un equivalente reductor puede

definirse como un mol de átomo de hidrogeno convirtiéndose en hidruro.

3. Resonancia, tautomería, isómeros.

a) Resonancia son diferentes formas de definir una molécula, se suele comparar en
compuestos aromáticos, son compuestos cíclicos que tienen dobles enlaces
conjugados de manera que los dobles enlaces puedan estar en un lugar y en otro. Las
formas resonantes son superposiciones de las dos, no hay una forma que sea correcta
y la otra no. La adenina forma unos puentes de hidrogeno con la timina y que si está
en otras formas tautomerías puede estar reconociendo otra base nitrogenada
provocando mutaciones. La adenina no tiene formas ceto pero la guanina sí.
No se puede aislar cada molécula física.

El ácido fosfórico tiene formas resonantes y cada átomo de oxigeno tiene ¾ partes de
carga y sus enlaces no son ni simples ni dobles sino enlaces intermedios. Será mas
estable libre que unido. 21
b) Tautomería La tautomería es una forma de definir estructuras diferentes en una
molécula, la más conocida es la ceto-enolica. Cuando tenemos una molécula con un
grupo ceto donde hay un transposición de un hidrogeno por doble enlace. La
tautomería ceto-enolica si tiene equilibrios, por ello se pone una flecha doble. La
tautomería definía mayor estabilidad en unas moléculas que en otras.
Mayor estabilidad la ceto. En otros casos es la enol.
Tiene un equilibrio de conversión, existen las formas fisicamentes.

Las interacciones de las formas tautomerías de las bases nitrogenadas son

terriblemente importantes para el reconocimiento de bases. Existen sistemas de
reparación y relectura para evitar esto. Para eliminar tautomerías formaríamos un
fosfoester en el OH, al estar el fosfoester el doble enlace no se podría colocar por lo
tanto no podría haber tautomería siendo más inestable.

Estas moléculas son iguales, la de arriba tiene un grupo ceto y la de abajo un grupo
alcohol con forma enolica. La forma ceto es más estable.
Si le añadimos un grupo O-P no podrá formar el grupo ceto impidiendo que se
estabilice y tendrá tendencia a romperse. 22. El grupo ceto es aceptor mientras que el
enol es donador.

El grupo amino tiene tendencia a ser donador de enlaces de hidrogeno en cambio la

estructura de la derecha tiene función de aceptor de hidrogeno. 23
 - ¿La existencia de formas resonantes y tautomerías estabilizaron o desestabilizan la
molécula?
Estabilizan porque puede ser descrita por más de una forma.
- Si una molécula se convierte en otra y la inicial o la final tiene formas resonantes o
tautomerías ¿qué forma, la inicial o la final es más estable?
La más estable será la molécula con formas resonantes y tautomerías.

c) Isómeros. Moléculas muy fundamentales para bioquímica serán losa azucares. Todos
los azucares o casi todos son de la seria D, peor podrían haber sido L. en cambio toda
la seria de aminoácido son L. los isómeros son importante para entender la interacción
de enzimas-sustratos, antígeno-anticuerpos y hormonas- receptores.

En el aspártico el carboxilo terminal esta metilado, el carboxilo tiene un éster metílico

formado por la unión de un metanol y el carboxilo libre. CH3OH + COOH.

Las dos moléculas se diferencias en el carbono asimétrico o carbono alfa, tiene dos
isómeros diferentes. El aspartamos es capaz de activar un determinando receptor para
dar sabor dulce o amargo.

Otro ejemplo es el conocido del cis y trans retinal implicada esta isomería en el
proceso de visión. El retinal es un isoprenoide unido a una proteína que es la opsina.
La isomerización del cis al trans está implicada en la visión. Lo que media la conversión
de una a otra.

La carvona es un terpeno y el isómero R o S dan el olor característico de la menta o el

comino, respectivamente.
 Cuando se produce una síntesis química se obtiene una mezcla de los dos isómeros, a esa
mezcla se denomina mezcla racémica. Si uno de los dos tiene una actividad determinada,
en la mezcla racémica es la mitad por ello debería ser el doble de cantidad.

4. Componentes celulares
Una célula está hecha de proteínas, hidratos de carbono, lípidos AN, minerales etc. La
bacteria e-coli es representativa y completa de una célula procariota porque conocemos
detalladamente su composición, estructura y funciones. De una eucariota es una levadura.
Y para cuestiones de desarrollo la mosca de la fruta es su representante.

La mayor proporción de una célula es en agua. Un célula de E.coli tiene muchos ribosomas
por el ARN está especializado en diferentes funciones (ribosómico, transferencia,
mensajero y trascripción). El DNA de e-coli tiene 4,6x10^6 pb con un peso molecular de
3000x10^6, tiene forma de doble hélice, muy asimétrica (larga y estrecha).

Si consideramos el tamaño relativo de diferentes componentes de la célula podemos ver el

extracto seco de una célula está compuesta por el 50% de proteínas
- Una molécula de Alanina tiene unos 0,5 nm.
- Los ribosomas están formados por RNA y proteínas y tiene 20 nm de diámetro.
- Una molécula de hemoglobina, compuesta de unos 600 aas tiene unos 5,5 nm de
diámetro.

La microscopia electrónica permite una resolución casi a nivel atómico, obteniendo

resultados comparables a la difracción de rayos x. Rosalin Franklin. La primera proteína
descrita es la mioglobina.
El citoesqueleto es el esqueleto celular, está hecho de polímeros, de tipo de
microfilamentos (actina), microtubulos (tubulina) y filamentos intermedios (diferentes
proteínas según el tipo de celular, propios del tejido).
Para que se vean en diferentes colores al microscopio por los anticuerpos, son muy
específicos y se pegaran a lo que queramos dando el color rojo a verde.
Las células más asimétricas que existen son las neuronas, tienen un tamaño muy largo de
medio metro o metro entero.

La existencia de membranas biológicas principalmente para proteger pero también como

sistemas de control (transportadores de nutrientes y salida de productos de desechos). En
las raíces de una planta si pasa el agua de maravilla tendrá pocas raíces, sin embargo si las
raíces de la planta no tiene transportadores de agua adecuados generara más raíces,
absorbiendo más agua.

5. Origen de la vida y evolución

La primera molécula biológica que apareció fue el RNA. Los RNA catalizaban las reacciones,
dio origen a la aparición de aminoácidos y proteínas. Las proteínas fueron las que
continuaron catalizando y ahora el RNA es un intermedio de reacción.
Los procesos evolutivos tienen lugar gracias a un equilibrio entre una alta tasa de
mutación, que haría inviables las células, y una muy baja tasa, que impediría el avance
evolutivo.
 Una tasa intermedia hace posible la aparición de cambios que puedan ser utilizados por
una célula como ventaja respecto a las células vecinas.

a) Tipos de metabolismo
- Aeróbio. Un compuesto se oxidara perdiendo electrones y el aceptor final de
electrones será el oxígeno. Todo este proceso de gradiente de electrones se obtendrá
ATP, aceptando los electrones el NADP, EL NADP es una molécula muy reductora.

La luz genera un transporte eléctrico, una reacción redox se hará de forma que el agua
se oxida de agua a oxigeno es una reacción muy desfavorecida. El primer organismo
que utilizo agua produjo una atmosfera oxidante en lugar de una atmosfera reductora
de CO2 dando las demás formas de vida sobre la tierra.
Las primeras rutas metabólicas para la obtención de energía, probablemente, fueron
quimiolitotróficas y anaerobias y debieron utilizar FeS y H2S, oxidándose el Fe(Ii) a
Fe(III) reduciéndose el H a H2.
La atmósfera oxidante fue producida por los organismos fotosintéticos que empezaron
a utilizar agua como reductor.

Para ver en qué medida somos parecidos por ejemplo a la e-coli debemos observar las
secuencias de RNA ribosomales.

EL AGUA
Es el medio de todos los procesos, La concentración de muchos elementos de un
organismo se mantienen siempre constantes. Las concentraciones de los diferentes
compuestos en el interior de un ser vivo se mantiene casi constantes mediante un
equilibrio dinámico mediante transporte, como en el caso de iones o mediante regulación
de síntesis y degradación.
Donadores y aceptores de enlaces de H en el agua. Los dos pares de electrones no
enlazados del O actúan como aceptores de enlaces de H y los dos O-H actúan como
donadores de enlaces de H. El ángulo entre los dos enlaces O-H es de 104,5; por eso, el
agua tiene un momento dipolar neto.
En el hielo los puentes de hidrogeno están formados dando una red cristalina en cambio al
agua líquida no tiene esa estructura tan estricta. El hielo tiene 4 enlaces porque cada
hidrogeno poder formar uno cada uno y el oxigeno tiene dos orbitales dos enlazados que
pueden ser aceptores por lo tanto puede formar 4. Los enlaces cambias en cuestión de
picosegundos (1x10^-12).
El agua líquida es más densa que el hielo.

Cuando rompemos los enlaces entre las moléculas para producir una fusión o ebullición,
los enlaces que rompemos entre moléculas serán los enlaces no covalentes (más débiles
que los de hidrogeno), específicamente fuerzas de van der Waals por ello el punto de
fusión y ebullición son muy elevados.
En la estructura de hidrogeno están cambiando continuamente los enlaces de hidrogeno,
son muy dinámicas siendo el agua líquida más densa que el hielo.
Hay transferencia de protones entre moléculas de agua a moléculas de agua, siendo muy
rápida.

- Existen moléculas polares

 Glucosa
 Glicina
 Aspartico
 Lactato
 Glicerol

- Existen moléculas apolares. Son menos solubles en agua

 Cera (Ácido graso)
 Fenilalanina (anfipatica)
 Fosfatidilcolina (anfipatica). Fosfolípido.

Los gases más abundantes son lo nitrógeno y oxígeno, son poco solubles en agua. El
oxígeno se transporta acomplejado con la hemoglobina, no se transporta suelto. El
nitrógeno no tiene transportador similar y no se disuelve.
El CO2 se puede disolver más porque se puede ionizar en formar de bicarbonato. El
amoniaco es muy polar y soluble en medio acuoso.

- Hidrofilicas
 Cargadas: Cuando los iones estas en disolución están rodeadas de capas de
solvatación.
 No cargadas: forman puentes de hidrogeno

- Las sustancias hidrofobias (polar)

Dos moléculas hidrofobias tienden a agregarse, forman un clatrato, aumento de
entropía siendo un proceso favorecido. Favorece la liberación de moléculas de agua.
La interacción de un sustrato y una enzima estará favorecido y será estable

- Las moléculas anfipáticas. Tendrán una cabeza polar y cola apolar

  Ácidos grasos. Tiene una cadena hidrofóbica y una cabeza polar. Será más polar
el ácido graso a pH básica porque estará desprotonado e ionizado.
 Lípidos. Tiene un glicerol. Puede estar cargada con carga positiva o negativa. Es
un componente prototípico de membranas.
 Detergentes. Derivados de ácidos grasos. A muchos pH diferentes estará
ionizada y muy ionizado siendo más polar.
- Pueden formar
 Monocapas
 Micelas, dispersa lípidos insolubles para poder llevar a cabo la digestión y
absorberlo.
 Vesículas con bicapas, más parecido a membranas.

a) Interacción entre macroiones en disolución.

Moléculas polares en disolución con interés especial en bioquímica serán las proteínas,
rodeadas de nubes de contraiones específicos de signo contrario apantallando
interacciones.
Los aminoácidos unidos a proteínas tienen cadenas laterales con cargas, estarán
expuestas en el exterior. Implicará la interacción de iones de signo contrario, en
cambio a una cierta distancia la concentración de iones de un signo y de otro será
igual.
Si tenemos una concentración de iones baja, la interacción de macromoléculas no está
impedida, puede interaccionar y precipitar. Al subir muchos más la fuerza iónica el
agua compite con los iones por solvatación, y las macromoléculas dejan de estar
solvatadas, provocando agregación pasando a moléculas insolubles y precipitaran, se
denominará precipitación salina. Necesitaremos una sal para dar una fuerza iónica
elevadísima y muy soluble como el sulfato amonio.

A parte de la fuerza iónica podemos jugar con el punto isoeléctrico para precipitar
proteínas específicas.
Los AN tienen carga negativa, repeliéndose e impiden formar agregados. La interacción
con proteínas ricas en cargas positivas en la cadena lateral, si forma agregados y
podría precipitar.

Intracelularmente en los comportamientos celulares serán cercanos a la neutralidad

menos en lisosomas que serán ácidos.

b) Equilibrios iónicos
La estructura del fosfato es tetraédrica. Tiene diferentes formas resonantes.

H3PO4 H2PO4 ❑−¿¿ HPO4❑2−¿¿ PO4❑3−¿¿

2,14 7,2 12,7

Cuando queremos preparar un tampón, hay que elegir una molécula con pka en la
franja donde queramos el tampón.

- El tampón TRIS. Problema. Se utiliza como tampón por su amina primara, la amina no
se puede disociar. Tiene un Pka de 8,06 con un pH cerca de la neutralidad, esa
molécula en su equilibrio puede tener una zona más o menos plana donde la adición
de bases o ácidos no va a provocar mucha variación.
Una unidad de pH por encima y por debajo es válida es decir que pH fuera de 7 a 9 no
valdría
El pka es parte de la reacción TRIS + + H20 ↔TRIS o + H20 La proporción de tris+ y tris 0
será igual cuando el PH y el pka serán iguales. 26 y 27
El TRIS o es la base conjugada y es mayor que el ácido conjugado TRIS +.El TRIS O tiene
una concentración mayor de 8,5-8,06= 0,44 10^ 0.44=
 Amina primaria: tiene un hidrogeno sustituido. Es un tampón útil porque se
puede protonar R-NH2
 Amina secundaria R-NH-R
 Amina terciaria

Para hacer la disolución podemos poner agua en un vaso de precipitado con agua, se
le añade el TRIS0 y se le va añadiendo un ácido para llevar al pH que queramos.

TRIS 1M pH=8,5 pka=8,06 [tris0] + [tris-]=1M

PH= pka + log[tris-]/[tris0] [tris0]= 1-[tris-]

8,5-8,06= log[tris-]/[tris0] 2,75 =[tris-]/1 -[tris-]

0,44= log[tris-]/[tris0] [tris-]=2,75 M - 2,75[tris-]-->

3,75[tris-]= 2,75
10^(0,44)=[tris-]/[tris0]
[tris-]= 2,75/3,75= 0,73M
2,75=[tris-]/[tris0]
[tris0]= 1 - 0,73= 0,27M

Los aminoácidos tiene 3 grupos ionizables por separado y a PH característicos. Los

aminoácidos en las proteínas no van a tener ionizaciones en el carboxilo ni en el amino
pero si en la cadena lateral. Esta ionización de la cadena lateral será útil para tamponar
en el medio siempre cuando el pka sea próximo al pH que queramos mantener.

Los fluidos intracelulares y extracelulares van a estar próximos neutralidad. El pH

normal de a sangre en humanos es 7,4.
 Acidosis, unas décimas por debajo será muy perjudicial.
 Alcalosis, unas décimas por encima será muy perjudial.

Para controlar los fluidos intracelular será con ayuda del fosfato porque es muy
abundante en células.
 La sangre contiene CO2 disuelto producto del deshecho del metabolismo del sistema
CO2/bicarbonatos.
La formación de la acetilcolina será importante en las vías nerviosas, se hidrolizara por
la acetilcoliesterasa que romperá los enlaces éster. Los insecticidas inhiben la
acetilcolinesterasa.

1. Energía, calor y trabajo

La homeostasis esta fuera del equilibrio.

a) Metabolismo.
Utiliza formas de energía. El ADP se puede fosforilar
- Fosforilación a nivel de sustrato. Molécula con alta energía de hidrolisis para transferir el
fosfato. Los fosfatos unidos al ADP y por este motivo obtendremos su energía al
hidrolizar el ATP. La oxidación a nivel de sustrato es una reacción directa entre una
molécula y otra, transferencia de fosfato que va a ser cuantitativamente menor pero va a
haber células que viven solo de eso.
 - Fosforilacion oxidativa reoxidacion de nucleótidos. El proceso mayoritario de obtención
de energía, consiste en oxidar compuestos, obtener nucleótidos reducidos NADH O
FADH2 y luego la reoxidacion de esos compuestos vía en una cadena transportadora de
electrones con un aceptor final que será el oxígeno, nos dará la energía suficiente para
producir ATP. Existe otra forma de energía intermedia denominada gradiente.
El gradiente se produce a nivel de membrana interna, la mitocondria tiene dos
membrana, la externa y la interna. La externa es impermeable, tiene muchos
transportadores. El pH de la matriz mitocondrial será mayor que en el espacio
intermembranal y en la intermembrana será mayor por más concentración de
protones. Esto hace que tengamos mayores cargas positivas en el espacio
intermenbranal y mayores cargas negativas en la matriz, dándonos un potencial
eléctrico que es una forma de energía. También hay una diferencia de
concentraciones de energía. La suma de estas energía dará un potencial
electroquímico dando energía que servirá para que la ATP sintetasa (motor
rotatorio) ayude a pasar los protones nos dará la síntesis de ATP.

- Fotofosforilacion con ayuda de la energía luminosa que pasara a energía química.

b) Compuestos fosforilados ricos en energía

Los compuestos ricos en energía serán poco estables, tienden a romperse, en su
proceso de ruptura dará energía.

Fosfopiruvato
1,3 bifosfoglicerato

Creatina fosfato

ATP

Pirofosfato pp

AMP

El ATP tiene una adenina, ribosa y trifosfato unido por un fosfoanhidrido. La hidrolisis se dan
entre el delta y en ganma dando ADP y fosfato. Si se rompe por el alfa y beta daría AMP y
pirofosfato se da cuando se necesita mayor energía que con la rotura para dar ADP y fosfato.

También se puede romper por enlace fosfoester, no es muy rico en energía produciendo la
adenosina y 3 fosfatos

- La liberación del fosfato provoca un aumento de entropía.

 El ácido carbamil es H2N-COOH Y EL carbamil fosfato es un intermedio del ciclo
de la urea y la biosíntesis de nucleótido. 24
  Adenosina fosfosulfato. La adenosina adenina con una ribosa. Da mucha energía
por la unión del sulfato y fosfato. Las moléculas con derivados sulfonados es
acida.
 Acil-CoA, el acilo unido con enlace tioester al CoA. El tioester es muy similar al
éster, el éster esta en los ácidos grasos, estos no son ricos en energía cuando se
hidroliza pero si ricos en oxidación. Los tioesteres son más ricos en energía que
los esteres porque son menos estables por resonancia. 25

- Ejemplos de reacciones
 Glucosa a glucosa 6- fosfato, no tiene tendencia a darse.
 El ATP se hidroliza a ADP y fosfato tiene tendencia a darse, de forma lenta.
Las dos reacciones se acoplen una favorecida y otra no para que se acoplan y la general
este favorecida.

c) Potenciales redox como fuente de energía en sistemas biológicos

La oxidación de nutrientes como los hidratos de carbono o las grasas les da a las
células suficiente energía libre para la síntesis de ATP.
La transferencia de los electrones de los nutrientes al O2 libera energía que se
almacena en forma de un gradiente de protones a través de una membrana que, a su
vez, es la fuerza que dirige la síntesis de ATP.
La transferencia electrónica se produce a través de una serie de reacciones redox.
Para entender los procesos por los que la energía metabólica es extraída de los
nutrientes, se debe entender el cálculo de la energía en una reacción redox.
Una reacción redox tiene que tener un reactivo aceptor de electrones, que se reduce.
Y otro reactivo que sea un donador de electrones, que se oxida.
El donador de electrones es el reductor que se oxida.
El aceptor de electrones es el oxidante, que se reduce.