HUMANA

CA
BIO UÍMI

- F
QB II
MED -
Q

CÁTEDRA 1
UB
.

A - DPTO

TEÓRICO

SÍNTESIS DE PROTEÍNAS

ACCIÓN DE ANTIBIÓTICOS

MATERIA: QUÍMICA BIOLÓGICA II

CÁTEDRA 1
DPTO. BIOQUÍMICA HUMANA - FMED - UBA
CICLO LECTIVO 2022
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SÍNTESIS DE PROTEÍNAS (TRADUCCIÓN)

BIBLIOGRAFÍA RECOMENDADA
1) Principios de Bioquímica de Lehninger (6º Ed). Nelson and Cox, 2014
2) Bioquímica Ilustrada de Stryer (28º Ed), 2009.
3) Bioquímica Básica de Marks. Un enfoque clínico. Smith, Marks y Liberman (2º Ed), 2006.
4) Harper Bioquímica Ilustrada (31º Ed), Rodwell, Bender, Botham, Kennelly y Weil, 2016.

La comprensión completa del proceso de síntesis de proteínas ha sido uno de los

mayores desafíos de la bioquímica. La síntesis de proteínas eucariotas requiere
• más de 70 proteínas ribosomales,
• 20 o más enzimas para activar a los aminoácidos precursores,
• una docena o más de enzimas auxiliares y otros factores proteicos para la
iniciación, elongación y terminación de las proteínas,
• otras 100 enzimas adicionales para el procesamiento final y
• 40 o más tipos de ARN.

En suma, se requiere de aproximadamente 300 macromoléculas diferentes. Una

idea de la importancia de este proceso la da la cantidad de recursos destinados. Hasta un
90% de la energía celular utilizada en todos los procesos biosintéticos celulares, se destina
a la síntesis de proteínas.
Teniendo en cuenta la gran complejidad de este proceso se puede decir que ocurre
a una velocidad muy alta. En bacterias, por ejemplo, se sintetiza un polipéptido de 100
aminoácidos en alrededor de 5 segundos. Por otra parte, la síntesis, localización subcelular
y degradación de las proteínas son procesos altamente regulados para responder a las
necesidades celulares metabólicas del momento.

EL CÓDIGO GENÉTICO
Tanto la transcripción, la transferencia del mensaje genético del ADN al ARN, como
la traducción, el cambio del lenguaje de nucleótidos de los ácidos nucleicos al de los
aminoácidos de las proteínas, dependen de apareamiento de bases.
Cuando en la década de 1950-1960 los biólogos moleculares al intentar descifrar el
proceso de traducción se encontraron con dos problemas: El primero era decodificar la
relación entre el "lenguaje" de los ácidos nucleicos y el "lenguaje" de las proteínas, y el
segundo determinar el mecanismo molecular mediante el que se produce la “traducción”
entre esos dos lenguajes. Las proteínas incorporan veinte aminoácidos diferentes y, por lo
tanto, el alfabeto de las proteínas tiene 20 letras. El alfabeto de los ácidos nucleicos, sin
embargo, tiene solamente cuatro, correspondientes a los cuatro nucleótidos del ARNm (A,
G, C y U). Si el código para un aminoácido estuviera constituido por dos nucleótidos,
entonces sólo podrían especificarse 42= 16 aminoácidos. Por lo tanto, el número de
nucleótidos que codifican para un aminoácido tiene que ser tres, lo que proporciona 43 o 64

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combinaciones posibles o "codones", más de lo necesario, pero no demasiado excesivo.

Los científicos se propusieron determinar cuáles codones eran específicos para cada
aminoácido. En 1961 Nirenberg obtuvo la primera decodificación del código genético (la
colección de los codones que especifican todos los aminoácidos encontrados en las
proteínas) al mostrar que el poli (U), un polinucleótido en el que todas las bases son uracilo,
da lugar al polipéptido polifenilalanina en un sistema de síntesis de proteínas in vitro. Por lo
tanto, el codón UUU debía codificar para fenilalanina. Como resultado de otros
experimentos utilizando polinucleótidos sintéticos en lugar de ARNm, se identificaron los
otros codones.
Los biólogos moleculares rápidamente entendieron que, debido a que los
aminoácidos no pueden unirse directamente a los tres nucleótidos que forman sus codones,

se requiere de "adaptadores" y posteriormente se encontró que los "adaptadores" eran

moléculas de ARN que se denominaron ARN de transferencia (ARNt).

ARN de transferencia (ARNt)

Cada molécula de ARNt contiene un anticodón y une covalentemente un aminoácido
específico en su extremo 3’. El anticodón de una molécula de ARNt es un conjunto de tres
nucleótidos que pueden interactuar con un codón del ARNm. Para interactuar, el codón y
el anticodón deben ser complementarios (es decir, deben ser capaces de formar un
apareamiento de bases en orientación antiparalela). Por lo tanto, el anticodón del ARNt
sirve como enlace entre el codón del ARNm y el aminoácido que el codón especifica.
Evidentemente, cada codón presente en un ARNm debe corresponder a un aminoácido
específico. Nirenberg descubrió que secuencias de trinucleótidos conocidos podrían unirse
a los ribosomas e inducir la unión de aminoacil-ARNt específicos (es decir, con ARNt unidos
covalentemente a aminoácidos). Como resultado de estos y otros experimentos, se dilucidó
la relación entre los 64 codones y los aminoácidos (la totalidad del código genético) a
mediados de la década de 1960. Tres de los 64 posibles codones (UGA, UAG y UAA)
terminan la síntesis de proteínas y se conocen como codones de terminación "stop" o
codones sin sentido. Los restantes 61 codones especifican aminoácidos. Dos aminoácidos
tienen cada uno un solo codón (AUG = metionina; UGG = triptófano). Los aminoácidos
restantes están codificados por múltiples codones.

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El código genético es degenerado, pero no es ambiguo

Debido a que muchos aminoácidos son codificados por más de un codón, el código
genético se describe como degenerado. Sin embargo, cada codón especifica solamente
un aminoácido, y el código genético es, por lo tanto, no ambiguo.
Si miramos la tabla de codones veremos que, en la mayoría de los casos de codones
múltiples para un solo aminoácido, la variación se produce en la tercera base del codón.
Crick observó que el enlace entre la tercera base del codón y la primera del anticodón no
siempre sigue las reglas estrictas del apareamiento de bases que él y Watson habían
descubierto anteriormente (es decir, los pares A con U y G con C). Esta observación dio
lugar a la hipótesis del "balanceo".
Si en la primera base del anticodón del ARNt (que se aparea con la tercera del codón)
hay una U, este ARNt reconocerá codones que tengan A o G en la tercera posición (en el
ARNm, obviamente).
Si, en cambio, en la primera base del anticodón hay una G, se reconocen codones
con C o U en la tercera posición.
Si en la primera base del anticodón hay hipoxantina (I) entonces este ARNt
reconocerá codones con A, U o C en la tercera posición. Por lo tanto, tres de los cuatro
codones de alanina (GCU, GCC y GCA) pueden aparearse con un único ARNt que contiene
el anticodón 5’-IGC-3’. Estos apareamientos son más débiles que los clásicos (A=U y CG)
Si se requiriera de un ARNt diferente para reconocer cada uno de los 61 codones
para aminoácidos, las células deberían contener 61 ARNt diferentes. No obstante, debido

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a este "balanceo" entre el codón y anticodón, sólo se encuentran 32 ARNt diferentes que
reconocen todos los codones (1 para el codón de iniciación y 31 para el resto).

El código genético es casi universal

Todos los organismos estudiados hasta ahora usan el mismo código genético, con
algunas raras excepciones. Una excepción se produce en el ARNm mitocondrial humano,
donde el codón UGA codifica para el triptófano en lugar de servir como un codón de
terminación, AUA codifica para metionina en lugar de isoleucina, y CUA codifica treonina
en lugar de leucina. Otras excepciones se encuentran en algunas bacterias y en eucariotas
unicelulares.

El código genético no se superpone y no tiene puntuación

El ARNm no contiene puntuaciones para separar un codón del siguiente y los
codones no se superponen. Cada nucleótido se lee sólo una vez. Comenzando con el
codón de iniciación (AUG) cerca del extremo 5' del ARNm, los codones se leen
secuencialmente, terminando con un codón de terminación (UGA, UAG o UAA) cerca del
3' del ARNm.

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El codón de iniciación (AUG) establece el marco de lectura, el orden de los codones

en el que se ordena la secuencia de nucleótidos del ARNm. El orden de los codones en el
ARNm determina la secuencia en la que se añaden los aminoácidos a la cadena
polipeptídica creciente. Por lo tanto, el orden de los codones en el ARNm determina la
secuencia lineal de aminoácidos en la proteína. Si luego de un codón de iniciación se
encuentran más de 50 codones hasta llegar a un codón de terminación se dice que se trata
de un “marco de lectura abierto”.

EFECTOS DE LAS MUTACIONES

Las mutaciones, que son consecuencia de daño en los nucleótidos de las moléculas
de ADN o de una falla en la reparación de errores durante la replicación, pueden ser
transcriptas en el ARNm, y, por lo tanto, puede resultar en la traducción de una proteína
con una secuencia de aminoácidos anormal. Pueden ocurrir varios tipos de mutaciones con
diferentes efectos sobre la proteína codificada.

Mutaciones puntuales
Las mutaciones puntuales se producen cuando sólo se altera una base en el ADN,
produciendo un cambio en una única base de un codón del ARNm. Hay tres tipos básicos
de mutaciones puntuales: mutaciones silenciosas, mutaciones de cambio de sentido y
mutaciones sin sentido, donde sentido se refiere a significado. Se dice que una mutación
puntual es silenciosa cuando no afecta la secuencia de aminoácidos de la proteína. Por
ej. un cambio de codón de CGA a CGG no afecta la secuencia de aminoácidos de la
proteína porque ambos codones especifican arginina. En las mutaciones con cambio de
sentido, se sustituye un aminoácido de la proteína por uno diferente.
Este cambio de aminoácido puede ser aceptable, parcialmente aceptable o
inaceptable. Por ej., estudios poblacionales realizados sobre la cadena β de la hemoglobina
indicaron que un cambio de lisina por asparagina en la posición 61 genera la denominada
hemoglobina de Hikari cuya función es normal (aceptable). Una mutación en el codón que
codifica para glutamato en la posición 6 genera hemoglobina S con valina en esa posición.
Esta hemoglobina une oxígeno, pero precipita cuando está desoxigenada (parcialmente
aceptable). Finalmente, un cambio de histidina por tirosina en la posición 58 de la cadena

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alfa produce la Hb M (Boston) que no une oxígeno y permite la oxidación del hierro
(inaceptable).
Una mutación sin sentido causa la terminación prematura de la cadena
polipeptídica. Por ejemplo, un cambio de codón UGA a CGA causa la sustitución de un
codón para arginina por un codón de terminación y la síntesis de la proteína mutante termina
en ese punto.

Inserciones, deleciones y mutaciones que cambian el marco de lectura

Una inserción se produce cuando se añaden uno o más nucleótidos al ADN. Si la
inserción no genera un codón de terminación, puede producirse una proteína con
aminoácidos de más. Cuando uno o más nucleótidos se eliminan del ADN, se denomina a
la mutación como una deleción. Si la eliminación no afecta ni al inicio de la traducción, ni
a los codones de terminación puede producirse una proteína con menos aminoácidos que
la normal.
Una mutación de desplazamiento de marco de lectura se produce cuando el
número de nucleótidos insertados o eliminados no es un múltiplo de tres. El marco de
lectura se desplaza en el punto de la inserción o la deleción. Más allá de ese punto, la
secuencia de aminoácidos de la proteína traducida a partir de ese ARNm difiere de la
proteína normal.

Formación del aminoacil-ARNt

Un ARNt que contiene un aminoácido unido covalentemente a su extremo 3’ se
denomina aminoacil-ARNt y se dice que está cargado. Los aminoacil-ARNt se nombran por
el aminoácido y por el ARNt que lleva ese aminoácido. Por ejemplo, el ARNt para alanina
(ARNtala) une alanina y se transforma en alanil-ARNtala. Existe un ARNt particular que
reconoce sólo el codón de iniciación AUG y no otros codones AUG que especifican la
inserción de metionina dentro de la cadena polipeptídica. Este metionil-ARNtmet iniciador se
nombra con el subíndice “i” generando metionil-ARNtmeti. La unión de los aminoácidos a sus
ARNt es catalizada por enzimas altamente específicas conocidas como aminoacil-ARNt
sintetasas. Existen 20 sintetasas diferentes, una para cada aminoácido. Cada sintetasa
reconoce un aminoácido particular y todos los ARNt que llevan ese aminoácido. La
formación de la unión éster que une el aminoácido al ARNt, catalizada por la aminoacil-
ARNt sintetasa es un proceso que requiere energía y ocurre en dos pasos.

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ARN de transferencia (ARNt)

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En un primer paso el aminoácido es activado cuando su grupo carboxilo reacciona

con ATP para formar un complejo enzima/aminoacil-AMP y pirofosfato. La ruptura del
enlace de alta energía del ATP provee la energía y la hidrólisis subsecuente del pirofosfato
por una pirofosfatasa favorece el avance de la reacción removiendo uno de los productos.

En el segundo paso, el aminoácido activado se transfiere a los grupos hidroxilo 2’ o

3' (dependiendo del tipo de sintetasa que cataliza la reacción) de la adenosina del extremo
3' del ARNt y se libera el AMP (recuerden que todos los ARNt tienen un -CCA unido a su
extremo 3' en forma post-transcripcional). La energía del enlace éster del aminoacil-ARNt
se utiliza luego en la formación del enlace peptídico durante la síntesis de la proteína.
Algunas sintetasas utilizan el anticodón del ARNt como sitio de reconocimiento, sin
embargo, otras sintetasas reconocen bases localizadas en otras posiciones del ARNt (por
ej. en el brazo del aminoácido). La inserción del aminoácido en un polipéptido en
crecimiento depende solamente de la secuencia de bases del anticodón, por
complementariedad de bases con el ARNm.

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EL PROCESO DE TRADUCCION
La traducción de una proteína involucra tres etapas: Iniciación, Elongación y
Terminación. Comienza con la formación del complejo de iniciación y luego por una serie
de pasos de elongación (que se repiten para cada aminoácido) se van incorporando los
aminoácidos a la cadena en crecimiento. La terminación ocurre cuando se llega a un codón
de terminación (en el marco de lectura) del ARNm y se libera la cadena polipeptídica.

Iniciación de la traducción en eucariotas

La iniciación puede dividirse en cuatro pasos: 1) disociación del ribosoma en sus
subunidades 40S y 60S, 2) Unión del complejo ternario que contiene metionil-ARNtiMet, GTP
e eIF-2 a la subunidad 40S para formar el complejo de preiniciación, 3) unión del ARNm y
4) unión de la subunidad 60S para formar el complejo de iniciación 80S.

Disociación del ribosoma

Cuando se disocian las subunidades 40S y 60S del ribosoma, se unen los factores
de iniciación eIF-3 y eIF-1A a la subunidad 40S lo que evita su reasociación con la
subunidad mayor del ribosoma.

Formación del complejo de preiniciación

En primer lugar, el Factor de Iniciación eucariota 2 (eI-F2) une GTP. Este complejo
binario se une entonces al metionil-ARNtiMet, que es el ARNt que reconoce específicamente
el AUG de iniciación (hay otro ARNtMet que reconoce codones AUG ubicados en el interior
de la secuencia de la proteína). El complejo ternario luego se une a la subunidad menor del
ribosoma (40S). El factor eIF-2 es uno de los puntos de control de la iniciación de la síntesis
proteica en eucariotas. Contiene tres subunidades (α, β y γ). La subunidad α es fosforilada
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en serina por varias quinasas que se activan cuando la célula sufre estrés o cuando el gasto
de energía requerido en la síntesis de proteínas será deletéreo para la célula. Esto ocurre
cuando el aporte de glucosa o aminoácidos disminuye, cuando hay una infección viral,
cuando las proteínas no se pliegan correctamente en el retículo endoplásmico, o en casos
de hiperosmolaridad o shock térmico. La activación de la quinasa PKR por virus provee un
mecanismo de defensa a la célula huésped que, al disminuir la síntesis proteica, previene
la replicación viral. Cuando la subunidad α de eIF-2 se fosforila se inactiva la proteína que
interviene en el reciclado de GTP/GDP, se previene la formación del complejo de
preiniciación y se inhibe la síntesis proteica.

El “CAP” (7-metilguanosina trifosfato) en el extremo 5' del ARNm facilita la unión del
ARNm al complejo de preiniciación. Un complejo proteico (eIF-4F) formado por eIF-4E (4E)
y el complejo eIF-4G (4G)-eIF-4A (4A) se une entonces al CAP mediante 4E. En una
reacción que requiere la hidrólisis del ATP (debida a la actividad helicasa del factor 4A/B),
este complejo desenrolla las estructuras secundarias del ARNm y lo recorre hasta que
localiza el codón de iniciación AUG (generalmente el primer AUG que encuentra).
Se hidroliza GTP, se liberan los factores de iniciación y se une la subunidad mayor
del ribosoma (60S). El ribosoma está ahora completo. Contiene una subunidad menor y
una mayor y tiene dos sitios de unión para el ARNt, conocidos como sitios P (peptidilo) y A
(aminoacilo). Durante la iniciación el Met-ARNtiMet se une al ribosoma en el sitio P. El
proceso de iniciación difiere entre procariotas y eucariotas. En las bacterias, el metionil-
ARNt de iniciación se transforma en formilmetionil-ARNtfMet que participa en la formación
del complejo de iniciación. Sólo se requieren tres factores de iniciación (IFs) para generar
este complejo en procariotas, comparado con la docena o más que se requieren en
eucariotas. Los ribosomas también difieren en su tamaño. Los procariotas tienen ribosomas
70S, compuestos de subunidades 30S y 50S, y los eucariotas tienen ribosomas 80S,
compuestos de subunidades 40S y 60S. A diferencia del ARNm eucariota, el ARNm
bacteriano no presenta “CAP”. La identificación del triplete AUG de iniciación en los
procariotas ocurre cuando una secuencia del ARNm (conocida como la secuencia de
Shine–Dalgarno) se une a una secuencia complementaria cercana al extremo 3' del ARNr
16S de la subunidad menor del ribosoma.

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Desenrollamiento de
estructuras
secundarias, escaneo y
reconocimiento del
sitio de iniciación.

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El complejo de eIF-4E es particularmente importante en el control de la velocidad de

la traducción, su unión al CAP es la etapa limitante de este proceso. La fosforilación de eIF-
4E desencadenada por insulina y otros factores de crecimiento aumentan la afinidad del
complejo 4E por el CAP del ARNm y por lo tanto estimulan la síntesis proteica. La unión de
la proteína 4E-BP a eIF-4E previene su unión a eIF-4G y por lo tanto la unión de eI4F a la
subunidad menor del ribosoma. La fosforilación de 4E-BP en respuesta a insulina (quinasa
mTor) favorece su disociación de 4E.

Como ya se mencionó los ARNm eucariotas se unen a los ribosomas mediante el

complejo proteico 4F. Algunas de las
proteínas de este complejo se unen tanto el
extremo 5’ como el 3’ de los ARNm. En el
extremo 3’ el ARNm se une a una proteína de
unión al poliA (PABP). El complejo 4F se une
al CAP a través de 4E. Como la proteína 4G
se une tanto a 4E como a PABP los extremos
5’ y 3’ de los ARNm se encuentran cercanos
en el espacio y por lo tanto los ribosomas que
se disocian cuando termina la síntesis de la

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proteína pueden unirse más eficientemente al extremo 5’.

ELONGACIÓN DE LAS CADENAS POLIPEPTÍDICAS

Una vez formado el complejo de iniciación, el agregado de cada aminoácido a la
cadena polipeptídica en crecimiento involucra la unión de un aminoacil-ARNt al sitio A del
ribosoma, la formación de un enlace peptídico y la translocación del peptidil-ARNt al sitio P.
El peptidil-ARNt contiene la cadena polipeptídica en crecimiento.

Unión del aminoacil-ARNt al sitio A

Cuando el Met-ARNti (o un peptidil-ARNt) está unido al sitio P, el codón del ARNm
en el sitio A determina que aminoacil-ARNt se unirá a ese sitio. Será aquel aminoacil-ARNt
cuyo anticodón sea antiparalelo y complementario al codón del ARNm.
En eucariotas, el aminoacil-ARNt entrante se combina primero con el factor de
elongación EF1 que contiene GTP unido, antes de unirse al complejo ARNm–ribosoma
(EF1α es la subunidad que une GTP de una proteína G heterotrimérica). Cuando el
complejo aminoacil-ARNt-EF1-GTP se une al sitio A, se hidroliza el GTP a GDP. Esto
ocasiona la disociación de EF1-GDP del complejo ribosomal con aminoacil-ARNt
permitiendo que continúe la síntesis de proteínas.

El EF1α-GDP libre se reasocia con las otras subunidades de EF1 (βγ) y se libera
GDP. Luego se une GTP y las subunidades se disocian. Entonces, EF1α-GTP está en
condiciones de unir otra molécula de aminoacil-ARNt. El proceso de elongación es muy
similar en los procariotas, excepto que el factor correspondiente a EF1 se denomina EF-Tu
y los factores de elongación de la asociación se llaman EF-Ts en vez de EF1.

FORMACIÓN DEL ENLACE PEPTÍDICO

En el primer ciclo de elongación, el aminoácido del ARNt ubicado en el sitio A forma
un enlace peptídico con la metionina del ARNt ubicado en el sitio P. En los ciclos siguientes,
el aminoácido del ARNt del sitio A forma un enlace peptídico con el péptido en el ARNt del
sitio P. La peptidiltransferasa, que no es una proteína sino un ARNr de la subunidad mayor
del ribosoma cataliza la formación del enlace peptídico. El ARNt del sitio A contiene
entonces la cadena en crecimiento, y el ARNt del sitio P esta descargado (no contiene ni
aminoácidos ni péptidos).

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Traslocación
La traslocación en eucariotas involucra otra proteína G, el factor de elongación EF2
(EF-G en procariotas) que forma un complejo con GTP y se une al ribosoma, causando un
cambio conformacional que hace que el ribosoma avance un codón sobre el ARNm. El
ARNt descargado es desplazado del sitio P y se libera del ribosoma. El peptidil-ARNt se
encuentra ahora en el sitio P, y el siguiente codón del ARNm ocupa el sitio A. Durante la
traslocación, se hidroliza GTP a GDP y se libera del ribosoma junto con el factor de
elongación.

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Terminación de la traducción
Las tres etapas de la elongación se repiten hasta que
un codón de terminación se encuentra en el sitio A del
ribosoma. Normalmente en las células no hay ARNt con
anticodones que puedan aparearse con los codones de
terminación. En cambio, se unen factores de liberación al
ribosoma, ocasionando la hidrólisis del enlace entre la cadena
peptídica y el ARNt catalizada por la peptidiltransferasa. El
polipéptido recientemente sintetizado se libera del ribosoma,
que se disocia en sus subunidades liberando también el
ARNm.

POLISOMAS
Mientras un ribosoma se desplaza a lo largo del ARNm generando una cadena
polipeptídica, un segundo ribosoma se puede unir al extremo 5' libre del ARNm. Muchos
ribosomas pueden traducir simultáneamente un dado ARNm, formando un complejo
conocido como polisoma. Un único ribosoma cubre aproximadamente 80 nucleótidos del
ARNm. Por lo tanto, pueden encontrarse ribosomas en el ARNm a intervalos de
aproximadamente 100 nucleótidos. La cadena polipeptídica creciente unida al ribosoma se
hace más larga a medida que el ribosoma se mueve desde el extremo 5' hacia el 3' del
ARNm.

PROCESAMIENTO DE PROTEINAS
La cadena polipeptídica en formación atraviesa un túnel en el ribosoma, que puede
contener aproximadamente 30 residuos de aminoácidos. A medida que la síntesis progresa,
los aminoácidos del extremo amino de la proteína empiezan a emerger de esta región
protegida dentro del ribosoma y a plegarse y replegarse para adoptar la conformación
tridimensional del polipéptido. El plegamiento es favorecido por la unión de proteínas que
se unen al polipéptido naciente. Estos mediadores se llaman chaperonas y previenen la
formación de interacciones inadecuadas. Las enzimas disulfuro isomerasas catalizan la
formación de puentes disulfuro entre residuos de cisteína y estarían involucradas en la
generación de la estructura tridimensional.

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MODIFICACIONES POST TRADUCCIONALES

Luego de que las proteínas emergen del ribosoma pueden sufrir modificaciones
postraduccionales. La metionina inicial se remueve por proteasas especificas (no todas las
proteínas contienen metionina en su extremo amino). Luego pueden ocurrir otros cortes
específicos que convierten a las proteínas en formas más activas (por ej., la conversión de
proinsulina a insulina). Además, pueden ocurrir modificaciones de residuos de aminoácidos
dentro de las proteínas que pueden alterar la actividad o la estabilidad de las proteínas,
dirigirlas a un compartimiento subcelular o prepararlas para su secreción de las células.
Algunos residuos de aminoácidos se modifican enzimáticamente por el agregado de
varios grupos funcionales. Por ejemplo, el aminoácido N-terminal a menudo se encuentra
acetilado y se pueden agregar grupos metilo a residuos de lisina. Estos cambios alteran la
carga eléctrica de la proteína. Los residuos de prolina y lisina pueden modificarse por
hidroxilación. En el colágeno, las hidroxilaciones favorecen la estabilización de la proteína.
También son importantes las carboxilaciones, especialmente para la función de las
proteínas involucradas en la coagulación. La formación de -carboxilglutamato permite a
estas proteínas unir Ca2+, fundamental en la formación de coágulos. El agregado de ácidos
grasos u otros grupos hidrofóbicos (como los grupos prenilo) permiten el anclaje de
proteínas a la membrana. Se puede transferir un grupo ADP-ribosa del NAD+ a ciertas
proteínas. El agregado y remoción de grupos fosfato (que pueden unirse covalentemente a
serina, treonina o tirosina) permite la regulación de la actividad de muchas proteínas (como
las enzimas de la degradación del glucógeno o reguladores de la transcripción génica). La
glicosilación es una modificación común que ocurre principalmente en las proteínas
destinadas a ser secretadas o a ser incorporadas en lisosomas o membranas celulares.

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LOCALIZACIÓN SUBCELULAR Y EXTRACELULAR DE PROTEÍNAS

Muchas proteínas se sintetizan en polisomas en el citosol. Luego de liberarse de los
ribosomas permanecen en el citosol donde tienen su actividad. Otras proteínas, sintetizadas
en ribosomas citosólicos entran en organelas, como las mitocondrias o el núcleo. Estas
proteínas contienen secuencias de aminoácidos denominadas secuencias señal que
facilitan su transporte a las organelas. Otro grupo de proteínas se sintetizan en ribosomas
unidos al retículo endoplásmico. Estas proteínas se destinan a secreción, a la incorporación
a varias organelas subcelulares (lisosomas, retículo endoplásmico [ER], complejo de Golgi)
o a membranas celulares, incluyendo la membrana plasmática. Las proteínas que entran al
RE mientras se sintetizan, presentan péptidos señal (entre 15 y 30 aminoácidos) cerca de
su extremo amino que si bien no presentan una secuencia aminoacídica común contienen
varios residuos hidrofóbicos. Una partícula de reconocimiento de la señal (SRP) se une al
ribosoma y al péptido señal cuando el polipéptido naciente emerge del túnel del ribosoma,
y la traducción se frena. Cuando la SRP se une al receptor de SRP (proteína de anclaje) en
el RER, se reanuda la traducción y el polipéptido comienza a entrar al lumen del RER. El
péptido señal es removido por la peptidasa de la señal y el resto de la proteína entra al
lumen del RER. Estas proteínas se transfieren en pequeñas vesículas al complejo de Golgi
que procesa las proteínas que recibe del RER de modo tal que sean enviadas a sus
destinos adecuados. Este procesamiento involucra tanto glicosilaciones como modificación
de carbohidratos existentes. Algunas de estas señales de clasificación permiten el envío de
las proteínas a sus localizaciones correctas. Por ejemplo, la glicosilación de enzimas
destinadas al lisosoma agrega un residuo manosa-6-fosfato a un oligosacárido unido a la
enzima. Este residuo es reconocido por una proteína receptora de manosa-6-fosfato, que
incorpora la enzima a vesículas revestidas de clatrina. Estas vesículas se transportan a
endosomas y se incorporan finalmente a los lisosomas. Proteínas con regiones hidrofóbicas
pueden dirigirse a membranas. Algunas proteínas, cuyas señales de clasificación aún no
han sido determinadas entran en vesículas secretorias y son transportadas hacia la
membrana plasmática, donde son secretadas por exocitosis.

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ANTIBIOTICOS QUE INHIBEN LA SÍNTESIS DE PROTEÍNAS

Los procesos de traducción en los ribosomas bacterianos y en los ribosomas
citoplasmáticos de las células eucariotas presentan muchas similitudes, pero existe un
número de diferencias sutiles. Los antibióticos actúan en los pasos donde se encuentran
estas diferencias, y por lo tanto estos compuestos pueden utilizarse selectivamente para
prevenir la síntesis de proteínas bacterianas e inhibir la proliferación bacteriana con poco o
ningún efecto sobre la traducción en células humanas. Sin embargo, debe tenerse cuidado
con su uso dado que algunos de los antibióticos afectan las mitocondrias humanas, que
tienen una maquinaria de síntesis proteica similar a la de las bacterias. Otro problema con
estas drogas es que las bacterias pueden hacerse resistentes a su acción. Mutaciones en
los genes que codifican para las proteínas o el ARN ribosomales pueden causar resistencia.
También presentan resistencia las bacterias que llevan plásmidos que codifican para
enzimas que pueden inactivar los antibióticos. Dado el amplio, y a menudo indiscriminado,
uso de los antibióticos se están desarrollando rápidamente cepas de bacterias resistentes
a todos los antibióticos conocidos.
Algunos ejemplos de antibióticos y su mecanismo de acción:
Estreptomicina. Inhibe la iniciación de la traducción mediante su unión a tres
proteínas y probablemente al ARNr 16S de la subunidad 30S de las bacterias. Se acumulan
entonces complejos de iniciación anormales, denominados monosomas de estreptomicina.
También puede ocasionar errores en la lectura del ARNm resultando en una terminación
prematura de la traducción o en la incorporación de aminoácidos incorrectos en las cadenas
polipeptídicas en crecimiento. El uso de este antibiótico es limitado porque causa
ototoxicidad y puede resultar en la perdida de la audición.
Tetraciclina. Se une a la subunidad ribosomal 30S de las bacterias y evita la unión
del aminoacil-ARNt al sitio A del ribosoma. Este efecto es reversible; por lo tanto, cuando
se remueve la droga las bacterias reanudan la síntesis de proteínas y el crecimiento
resultando en la reaparición de la infección. La tetraciclina no se absorbe bien del intestino,
y su concentración en el contenido intestinal puede ser muy elevada, lo que puede llevar a
cambios en la flora intestinal. Dado que ha sido utilizada para tratar infecciones humanas y
se ha agregado al alimento de animales para evitar infecciones animales, los humanos han
tenido una extensa exposición a la tetraciclina. Como resultado se han desarrollado cepas
de bacterias resistentes al antibiótico.
Cloranfenicol. Se une a la subunidad ribosomal 50S de las bacterias y previene la
unión de la porción aminoacídica del aminoacil-ARNt, inhibiendo eficientemente la actividad
de peptidiltransferasa. Este antibiótico se utiliza para ciertas infecciones serias como la
meningitis y la fiebre tifoidea. El cloranfenicol entra rápidamente a las mitocondrias
humanas donde inhibe la síntesis proteica. A menudo las células de la medula ósea no se
desarrollan en pacientes tratados con cloranfenicol, y el uso de este antibiótico ha sido
correlacionado con discrasias sanguíneas fatales, incluyendo la anemia aplásica.
Eritromicina. Este y otros antibióticos macrólidos se unen a la subunidad ribosomal
50S de las bacterias cerca del sitio de unión del cloranfenicol. Bloquean el paso de
translocación, el movimiento del peptidil-ARNt del sitio “A” al sitio “P” del ribosoma. Dado
que los efectos laterales son menos severos y más rápidamente reversibles que para
muchos otros antibióticos, los macrólidos a menudo se usan para tratar infecciones en
personas que son alérgicas a la penicilina, un antibiótico que inhibe la síntesis de la pared

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bacteriana. Sin embargo, la resistencia bacteriana a la eritromicina es creciente. Por lo

tanto, a menudo se utiliza un antibiótico muy relacionado, la claritromicina.

Algunos videos que ilustran los temas de la clase:

https://www.youtube.com/watch?v=YCVR0NaBOpo

https://www.youtube.com/watch?v=YoyFpumWtHo

https://www.youtube.com/watch?v=-pB70QITK9A

https://www.youtube.com/watch?v=pdMD6ohp1fM

https://www.youtube.com/watch?v=180_sM9iYVk

https://www.youtube.com/watch?v=TfYf_rPWUdY

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