Bioquimica Libro
Bioquimica Libro
Bioquimica Libro
DE LA BIOQUÍMICA
Aida Macías
Alvia Janeth Reina Hurtado
Astudillo Dolores Mirella
Cedeño Holguín Franklin
Antonio Vite Solórzano María
Magaly Scott Álava Patricio
Alfredo Vallejo Valdivieso María
Jacqueline Macías Alvia Jhonny
Willian Santana Sornoza María
Jaritza Espinoza Macías Sonia
Patricia Ubillús Saltos Shirley
Ximena Arteaga Espinoza Oscar
Eduardo Torres Macías José
Manuel Pigüave Reyes
Leonardo Alfredo Mera Villamar
Dolores Isabel Chavarría Cedeño
Kevin Joseph Intriago Sánchez
INTRODUCCIÓN AL ESTUDIO
DE LA BIOQUÍMICA
Aida Macías
Alvia Janeth Reina Hurtado
Astudillo Dolores Mirella Cedeño
Holguín Franklin Antonio Vite
Solórzano María Magaly Scott
Álava Patricio Alfredo Vallejo
Valdivieso María Jacqueline
Macías Alvia Jhonny Willian
Santana Sornoza María Jaritza
Espinoza Macías Sonia Patricia
Ubillús Saltos Shirley Ximena
Arteaga Espinoza Oscar Eduardo
Torres Macías José Manuel
Pigüave Reyes Leonardo
Alfredo Mera Villamar Dolores
Isabel Chavarría Cedeño Kevin
Joseph Intriago Sánchez
Editorial Área de Innovación y Desarrollo,S.L.
Quedan todos los derechos reservados. Esta publicación no puede ser reproducida, distribuida,
comunicada públicamente o utilizada,total o parcialmente, sin previa autorización.
ISBN:978-84-949306-0-7
DOI: http://dx.doi.org/10.17993/CcyLl.2018.28
ÍNDICE
CAPÍTULO I: BIOMOLÉCULAS Y CÉLULAS...............................................................9
1.1. Introducción....................................................................................................9
1.1.1. Bioquímica, definición y su objeto...........................................................9
1.2. Partes de la bioquímica.................................................................................10
1.3. Composición química de los organismos bióticos.........................................11
1.3.1.............................................................................................................La
célula.....................................................................................................11
1.3. Jerarquía molecular de las estructuras celulares. Características de los
organismos bióticos.............................................................................................17
1.4. Metabolismo primario y metabolismo secundario. Estado estacionario.
Secuencias metabólicas........................................................................................18
1.5. Papel de las enzimas en el metabolismo. Regulación del metabolismo......23
1.6. Transferencia de información........................................................................24
1.7. Papel del ATP y las reacciones redox en la transferencia de energía en el
metabolismo........................................................................................................24
1.8. Mecanismo de transporte a nivel de membrana.........................................26
CAPÍTULO II: AGENTES QUE INTERVIENEN EN EL METABOLISMO.
ENZIMAS, VITAMINAS Y HORMONAS...................................................................29
2.1. Introducción..................................................................................................29
2.2. Enzimas.........................................................................................................30
2.3. Cinética enzimática. Teoría de Michaelis-Menten. Constante de Michaelis
(Km) y velocidad máxima (Vmax). Constante catalítica (K cat)...........................36
2.4. Factoresfísico-químicos que afectan la actividad enzimática.......................39
2.5. Regulación de la actividad enzimática. Enzimas reguladoras. Características y
modo de acción....................................................................................................42
2.6. Vitaminas. Definición y Clasificación. Funciones Generales. Acción co-
enzimática de las vitaminas.................................................................................43
2.7. Hormonas. Características generales de las hormonas animales y vegetales.
Mecanismos generales de acción de las hormonas............................................47
CAPÍTULO III: METABOLISMO DE LAS PRINCIPALES BIOMOLÉCULAS................53
3.1. Introducción..................................................................................................53
3.2. Glúcidos o carbohidratos. Metabolismo catabólico: Degradación del almidón y
del glucógeno.......................................................................................................53
3.3. Glucólisis. Fermentación láctica alcohólica y otras. Balance material y
energético............................................................................................................54
3.4......................................................................................................................O
xidación aeróbica de la glucosa. Ciclo de Krebs. Reacciones y esquema
general.................................................................................................................62
3.5. Cadena de Transporte electrónico. Reacciones y esquema general. Análisis
energético...........................................................................................................69
3.6. Fosforilación oxidativa. Mecanismo..............................................................71
CAPÍTULO IV: LA FOTOSÍNTESIS..............................................................................77
4.1. Introducción..................................................................................................77
4.2. Metabolismo anabólico: Fotosíntesis aspectos generales. Reacciones
lumínicas. Reacciones bioquímicas. Ciclo de Calvin..............................................77
4.3. Otras vías defijación del CO 2: Ciclo C4. Fotorrespiración..............................86
4.4. Síntesis de almidón y sacarosa. Gluconeogénesis. Glucogenolisis.................89
4.5. Regulación metabólica de las vías anabólicas y catabólicas..........................91
CAPÍTULO V: METABOLISMO DE LÍPIDOS............................................................93
5.1. Introducción..................................................................................................93
5.2. Lípidos o grasas.............................................................................................93
5.3. Metabolismo catabólico: acción de las lipasas (Hidrólisis de lostriacilglicéridos).98
5.4. Oxidación de la glicerina.............................................................................100
5.5. Activación y penetración de los ácidos grasos a la mitocondria................100
5.6. Beta-oxidación de los ácidos grasos de nº par e impar de átomos de
carbono y de ácidos grasos insaturados............................................................101
5.7. Balance material y energético....................................................................105
5.8. Otrasformas de oxidación de ácidos grasos. Ciclo del glioxalato...............108
5.9. Cetogénesis.................................................................................................108
5.10. Síntesis de Novo. Elongación mitocondrial y microsomal.........................110
5.11. Síntesis de ácidos grasos insaturados. Síntesis detriacilglicéridos............113
5.12. Interrelación con otras vías metabólicas...................................................115
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS...........................................................................117
ÍNDICE DE TABLAS
Tabla 1.Porcentaje relativo de componentes químicos presentes en la célula viva.............11
Tabla 2.Organización jerárquica de la célula........................................................................17
Tabla 3.Cuadro sinóptico.......................................................................................................21
Tabla 4.Valores de KM para diferentes sustratos..................................................................39
Tabla 5.Principales vitaminas, alimentos, funciones y efectos en el organismo...................46
Tabla 6.Enzimas que participan en el ciclo de Krebs...........................................................69
Tabla 7.Potenciales estándares..............................................................................................70
Tabla 8.Función de los lípidos...............................................................................................97
Tabla 9.Balance energético..................................................................................................105
Tabla 10.Balance energético del succinato en el Ciclo de Krebs........................................107
Tabla 11.Resumen de las rutas de síntesis de los ácidos grasos........................................114
ÍNDICE DE FIGURAS
Figura 1.Esquema del estado estacionario de las células.....................................................23
Figura 2.Estructura del ATP y sus productos de hidrólisis...................................................25
Figura 3.Molécula de ATP: Sufórmula es 10H 16N5O 13P3................................................................................................... 26
C
Figura 4.Perfil energético de una reacción catalizada enzimáticamente yuna reacción no
catalizada...............................................................................................................................36
Figura 5.Representación gráfica de la M y la max ................................................................37
K V
Figura 6.Efecto de la concentración del sustrato sobre la velocidad de una reacción catalizada
enzimáticamente...................................................................................................................37
Figura 7.Representación gráfica de la K................................................................................39
M
Figura 8.Efecto del pH sobre la velocidad de una reacción enzimática...............................40
Figura 9.Secuencia de reacciones de la glucólisis................................................................58
Figura 10.Ciclo de Krebs........................................................................................................68
Figura 11.Representación ordenada de los componentes de la cadena respiratoria...........70
Figura 12.Descenso de la energía libre a medida quetranscurre eltransporte electrónico
hasta el O2................................................................................................................................................................................................................................. 72
FIgura 13.Representación del acoplamiento del ciclo de Krebs a la cadena respiratoria (CR) y
a lafosforilación oxidativa (PO).............................................................................................74
Figura 14.Esquema general de la fotosíntesis......................................................................78
Figura 15.Cloroplasto...........................................................................................................79
Figura 16.Esquema del Ciclo de Calvin.................................................................................85
Figura 17.Ciclo Calvin.............................................................................................................86
FIgura 18.Esquema de fotorespiración....................................................................................87
FIgura 19.Fijación de CO2 de las plantas C...........................................................................88
4
Figura 20.Glucogenólisis y Glucogénesis................................................................................90
Figura 22.Hidrólisis de una grasa neutra..............................................................................98
Figura 23.Resumen de la β-oxidación.................................................................................105
Figura 24.Cetogénesis........................................................................................................109
Figura 25.Salida del acetil CoA de la mitocondria..............................................................110
Figura 26.Síntesis de novo...................................................................................................111
Figura 27.Síntesis de las grasas neutras...............................................................................114
A. Macías Alviaet
Volver al 1
A. Macías Alviaet
a un nivel productivo, los principios y los conceptos básicos del metabolismo así
como la cinética enzimática de las biomoléculas a los procesos biotecnológicos y
de la industria alimentaria, para predecir las posibles causas de contaminación de
productos, disminución de rendimiento durante la biosíntesis de sustancias
activas, etc.
1.2. Partes de la bioquímica
Para penetrar en la esencia de los procesos vitales (fenómenos bioquímicos), es
condición necesaria el conocimiento de la composición química de los organismos
y de las características químicas de las sustancias que los constituyen. Del estudio
de las diversas sustancias que componen la materia viva, se ocupa una parte de la
bioquímica que recibe el nombre debioquímica estática. Este estudio también es
objetivo de la química de los productos naturales. Pero latarea más específica de
la bioquímica consiste en investigar lastransformaciones que ocurren en las
sustancias, desde el momento de su entrada en el organismo hasta su devolución
al exterior como productosfinales innecesarios. Por otra parte labioquímica
dinámicaes el conjunto detodas estastransformaciones, de complicadas cadenas
de reacciones de síntesis y de degradación que es elmetabolismo,que representa
el objeto de estudio del aspecto más importante de la bioquímica:
Todas las reacciones bioquímicas son aceleradas catalíticamente por sustancias de
naturaleza protéica. Los biocatalizadores (Enzimas) son indispensables para la
vida, se encuentran presentes entodas las células y actúan en cantidades mínimas.
Son sustancias específicas y es característico de ellos actuar bajo
condicionesfisiológicas específicas detemperatura, presión, acidez y
otrosfactores presentes en los organismos vivos. Puede decirse que el estudio
del metabolismo es una ampliación del estudio de las enzimas y que es
fundamental conocer sus mecanismos de reacción para la plena comprensión de
los procesos vitales.
El análisis de la naturaleza química de los enzimas y el mecanismo de su actividad
es el objeto de estudio de una parte importante de la bioquímica dinámica
denominada enzimología. El desarrollo de la enzimología está íntimamente
relacionado con los progresos de la química de las proteínas y de la química-
física. Si se mezclan en forma arbitrariatodos los componentes de la materia viva:
proteínas, carbohidratos, ácidos nucleicos, lípidos, etc., más otras
sustanciastambién indispensables a la materia viva como son los ácidos
inorgánicos, el agua y las sales minerales, no se obtendría materia viva, toda vez
que en esta mezcla se producirían reacciones químicas desordenadas y
violentas que llegarían a detenerse. Esto indica que la vida está caracterizada no
sólo por una composición química definida, sinotambién por una estructura
igualmente determinada.
1 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 1
A. Macías Alviaet
Componentes inorgánicos
AGUA
Representa el componente más abundante en la célula. Una parte del agua se
encuentra libre (aproximadamente 95 % del total) el resto, en forma combinada.
El agua libre no se encuentra asociada a ningún componente celular yrepresenta
el medio líquido de transporte en la célula. El agua combinada aparece solo unida
a las proteínas mediante puentes de hidrógeno y muy particularmente se une a los
grupos positivos y negativos de los aminoácidos (actúa como un dipolo),
orientándose según las cargas de estos en una proporción aproximada de 2 a 6
moléculas de agua por cada grupo amino. La distribución de agua en los
organismos varía con la edad, naturaleza de la célula y actividad metabólica en los
vegetales influyen grandemente el medio y la especie vegetal. En la célula, las
funciones del agua se derivan, en esencia, de sus propiedadesfisicoquímicas,
entre ellas: su calor especifico, calores latentes de vaporización y fusión,
constante dieléctrica, poder disolvente. Entre sus funciones más notables pueden
citarse:
1. Es un componente estructural celular: en las membranas
representa 30-40 %: en mitocondrias y cloroplastos no menos
de 60%.
2. Interviene en el mantenimiento y forma estructural de la célula.
3. Representa el medio dispersante del contenido protoplasmático: es
el disolvente por excelencia de los componentes solubles.
4. Contribuye al transporte de metabolitos residuales y al
movimiento y distribución de sales e iones minerales dentro de la
célula.
5. Participa activamente en reacciones metabólicas, por ejemplo,
en las reacciones de hidrólisis provoca el desdoblamiento de
componentes complejos en otros más sencillos: en lafotosíntesis
aporta los electrones necesarios para que se realice el proceso,
y en la cadena respiratoria también cede electrones para que se
produzca la reducción del oxigeno.
6. Es un factor importante en el rendimiento celular, pues forma
parte de estructuras celulares, y además, la masa protoplasmática
celular presenta el mayor porcentaje de agua con respecto al
resto de los componentes celulares: por esta razón las células,
para llegar a su estado adulto, deben incorporar agua a su interior
a medida que se desarrollan, para adquirir su volumenfinal. Es
preciso destacar que alcanzar su volumenfinal no implica que la
célula deje de incorporar agua: este proceso continúa, pero
regulándose la plasmolisis por la concentración salina interior.
7. Presenta acción termorreguladora, ya que permite la regulación
de la temperatura en el interior de la célula.
1 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 1
A. Macías Alviaet
1 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 1
A. Macías Alviaet
LÍPIDOS
Bajo la denominación de lípidos se conocetodo un conjunto de sustancias
estructuralmente heterogéneas, las cuales pueden ser extraídas detejidos vegetales
o animales al sertratados con disolventes orgánicos apolares.
Los lípidos se clasifican como simples, entre los que se encuentran las grasas
neutras formadas por la unión entre la glicerina y los ácidos grasos y complejos
entre los que se incluyen los esteroides las lecitinas yotros.
De las grasas neutras estudiaremos uno de sus componentes principales: los
ácidos grasos aunque sólo aparecen entrazas en la célula. Los ácidos grasos
revisten gran importancia porque constituyen los sillares estructurales de
diferentestipos de lípidos. Estos ácidos grasos pueden ser saturados o insaturados
la mayoría de los que están presentes en plantas y animales poseen un número
par de átomos de carbono, siendo los más abundantes los de 16 y 18 carbonos
(C16 palmítico. C18 esteárico).
Los ácidos grasos insaturados predominan en las grasas neutras de ciertas especies,
presentándose con másfrecuencia la insaturación entre los carbonos9y 10. Como
ejemplo de ácido graso insaturadotenemos el ácido oléico C 17H33COOH.
Los ácidos grasos presentes en las grasas neutras pueden ser iguales o diferentes,
ocupando posiciones variables con respecto al grupo hidróxilo que esterifiquen,
de manera que podrá presentarse gran diversidad detriacilglicéridos.
Los triacilglicéridos son los componentes principales, en los depósitos de grasas en
células animales y vegetales: los más abundantes resultan ser:tripalmitilglicérido,
triestearilglicérido y trioleilglicérido.
Funciones.Entre las principalesfunciones de los lípidos están las siguientes:
1. Constituyen componentes estructurales de membranas, pues
conjuntamente con las proteínasforman la llamada membrana
unidad lipoprotéica en todos los sistemas membranosos celulares.
2. Son material energético celular, porque estas sustancias
presentan un gran contenido energético por su estado
reducido.
3. Constituyen sustancias de reserva. Los lípidos se almacenan en
tejidos y semillas, por ejemplo, en eltejido adiposo yen las
grasas vegetales.
4. Tienenfunción protectora. Están presentes en:
• paredes celulares de bacterias y plantas,
• exoesqueleto de insectos,
• piel de vertebrados.
1 Volver al
Introducción al estudio de la
Núcleo,
Orgánulos mitocondrias,
lisosomas,
MM:1011-1013
Cloroplastos
Complejos
Estructuras enzimáticos,
supramoleculares ribosomas
MM: 106-1010 Sistemas
contráctiles
Macromoléculas Polisacáridos
complejas
Proteínas
MM:103-106 Ácidos Nucleicos Lípidos
Monómeros
biológicos
Sillares Nucleótidos Aminoácidos Monosacáridos Ácidos grasos
estructurales Glicerina
MM: 100-350
Compuestos
químicos
intermedios Piruvato Citrato Malato Gliceraldehido
MM: 50- 250 3-fosfato
Precursores del
entorno CO2, N2, NH3, H2O,
MM: 18- 44
O2 KPO4,
Volver al 1
A. Macías Alviaet
La estructura de la célula
Una de las diferencias más importantes entre las células procariontes y
eucariontes está relacionada con los elementos membranosos derivados de la
membrana citoplasmática. De esta como una consecuencia directa del grado de
jerarquización de las diferentes moléculas que integran la célula, se derivan un
conjunto de estructuras (perfectamente definidas en las células eucariontes) que,
presentes y constantes, permiten a la célula el desarrollo funcional que caracteriza
a la materia viva.
Al estudiar la morfología celular con ayuda de técnicas especiales tales como la
polarización óptica la difracción de rayos X y la microscopia electrónica, se verá
que esta presenta los siguientes elementos:
1. Una membrana que la delimita llamada membrana celular.
2. Un medio dispersante, donde se encuentran inmersos diferentes
orgánulos celulares llamado citoplasma.
3. Una estructura especial dentro del conjunto de orgánulos
presentes en el citoplasma detamaño variable (en dependencia
deltipo de célula) y estructura definida, llamada núcleo.
Las células procariontes no presentan una organizacióntan compleja en cuanto a
su morfología, pero sí es de destacar en estos la membrana celular, el citoplasma
y el núcleo, el cual presenta un cierto carácter difuso y no definido.
Célula vegetal
Célula animal
Volver al 2
A. Macías Alviaet
ATP
Se comprende de lo anteriormente expuesto, que el concepto de metabolismo
como proceso principal en la célula, se hace extensible altejido, al órgano y al
organismo en su conjunto. El metabolismo está regulado, o sea,tiene sus
mecanismos de control, los que están dados por:
Factores intrínsecos (hereditarios)
a) síntesis de proteínas específicas;
b) genoma celular;
c) síntesis enzimática y regulación.
Factores extrínsecos (fisiológicos y ambientales)
a) factores determinantes del medio: concentración osmótica, pH y
otros;
b) nutrición y su influencia en lafisiología celular.
2 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 2
A. Macías Alviaet
Volver al 2
A. Macías Alviaet
Muchas de estas reacciones han sido estudiadas como sistemas aislados con enzimas
cristalinas puras, y por ello, la enzimologíatiene como objetivo reproducir in vitro los
cambios que ocurren en los diferentes órganos,tejidos, etc., del organismo. Además,
desde el punto de vista de la clínica, el estudio de la actividad, inhibición ofalta de
algunas enzimas,tiene gran importancia, pues, generalmente, las enfermedades
son consecuencia de un disturbio metabólico y no existe prácticamente en la célula
reacción alguna que no esté catalizada por las enzimas.
La actividad de las enzimas puede estar regulada a varios niveles:
1. Por factores externos como el pH, la temperatura T, la
concentración de sustrato [s], y la concentración de enzima [E].
2. Por acción de enzimas reguladores que se encuentran localizadas
al inicio de una secuencia metabólica determinada y reciben el
nombre de enzimas alostéricas o reguladoras y su actividad
puede estar determinada por la concentración en que se
encuentre el productofinal, o el sustrato inicial de la secuencia
metabólica donde ellas participan. Deforma general, estas
enzimas regulan la velocidad de la vía metabólica completa.
1.6. Transferencia de información
Como ya se explicó los ácidos nucleicos son responsables de la conservación
ytransferencia de la información genética de los seres vivos garantizando su
funcionamiento, conservación y evolución en eltiempo.
Desde el punto de vista biológico, la expresión de la información genética de un
organismo y sutransmisión entre generaciones es un proceso complejo en el que
interviene un gran número de proteínas y de mecanismos. Estos mecanismos
aseguran lafidelidad de la copia de la información desde el ADN al ARN para
asegurar la expresión, y del ADN a una nueva molécula de ADN para asegurar
latransmisión. Sin embargo, además de latraducción del ARN por los
ribosomas, para que se produzca una correcta expresión del mensaje genético ha
de estar controlado el momento de dicha expresión, ha de asegurarse que el
mensaje (proteína) adquiera la conformación correcta para su funcionamiento y
se coloque en el lugar celular correspondiente.
Desde el punto de vista biotecnológico,todos estos procesos son manipulables
para poder conseguir la expresión artificial de proteínas de interés industrial en
procesos llevados a cabo por microorganismos.
1.7. Papel del ATP y las reacciones redox en la transferencia de
energía en el metabolismo
La energía de que se valen los organismos para efectuar los procesos inherentes
a la materia viva puede provenir de varias fuentes, de las cuales, la proveniente
del Soles la más importante. La energía solar es utilizada por los organismos
autótrofosfotosintetizadores para llevar a cabo lafotosíntesis, proceso que
permite
2 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 2
A. Macías Alviaet
proteína
Volver al 2
A. Macías Alviaet
2 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 3
A. Macías Alviaet
3 Volver al
Introducción al estudio de la
2.2. Enzimas
Los cambios químicos que se verifican en los seres vivos ofrecen la extraordinaria
particularidad de efectuarse, casi en sutotalidad, por la acción activadora de
catalizadores específicos denominados enzimas.
Las enzimas son catalizadores orgánicos producidos en los seres vivos y capaces de
funcionar fuera de la célula u organismo que los producen.
Una parte importante del estudio de la bioquímica está, hoy día, dedicado a
las enzimas, puesto quetodas lasfuncionesfisiológicas, como por ejemplo la
contracción muscular, la conducción de los impulsos nerviosos, la excreción por el
riñón, la respiración, etc., están íntimamente unidas a la acción de las enzimas
Muchas de estas reacciones han sido estudiadas como sistemas aislados con
enzimas cristalinas puras, y por ello, la enzimologíatiene como objetivo reproducir
in vitro los cambios que ocurren en los diferentes órganos,tejidos, etc., del
organismo, no existe prácticamente en la célula reacción alguna que no esté
catalizada por las enzimas.
Características generales
Se ha demostrado quetodas las enzimas son de naturaleza protéica. El análisis de los
aminoácidos constituyentes de ellos no ha permitido apreciar ninguna característica
que los diferencie de los aminoácidos que constituyen el resto de las proteínas;
todos son α -aminoácidosy se puede afirmar quetodas las enzimas son proteínas,
pero no todas las proteínas son enzimas.
Las proteínas quetienen acción enzimática poseen iguales propiedades químicas
que el resto de las proteínas, pero además, las quetienen acción enzimáticatiene
otras propiedades que las diferencian del resto de las proteínas y que están
relacionadas con su modo de acción. Estas propiedades son laespecificidad,
laeficiencia catalíticay lareversibilidad, que serán objeto de estudio en
epígrafes posteriores, cuando hayan sido explicados algunostérminos quefaciliten
su comprensión. Las enzimas pueden dividirse en enzimas simples y enzimas
complejas.
Enzimas simples. Son aquellas que para ejercer su acción sólo necesitan de la parte
protéica. Esta puede estar constituida por una o varias cadenas, pero no necesita
ningúnfactor adicional para llevar a cabo su acción sobre la molécula que va a
transformar, la cual se denomina sustrato. Un ejemplo de enzima simple es la ureasa,
encargada de catalizar la transformación de la urea en CO2 y NH3. Para que la enzima
actúe, sólo es necesario que esté presente el sustrato, en este caso específico es la
urea, y la reacción quetiene lugar es la siguiente:
Volver al 3
A. Macías Alviaet
*E: hexoquinasa.
En el caso específico de las enzimas complejas, a la parte protéica se le denomina
apoenzima y la unión de la apoenzima con losfactoresforma la holoenzima.
La apoenzima libre notiene actividad, o lo que es lo mismo, no lleva a efecto la
transformación: cuando esta se halla unida a los cofactores (holoenzima) sí es
activa y realiza la acción catalítica. A veces una enzima compleja puede necesitar
más de un cofactor para llevar a efecto la reacción. Todos estos cofactores
necesarios para que una enzima pueda efectuar su acción junto con la parte
protéica o apoenzima y el sustrato, se agrupan bajo el nombre
decomplejofuncional enzimático,ellos son:
• Apoenzima • Coenzima
• Sustrato •Grupo prostético
• Cosustrato •Activadores
La apoenzima como se explicó anteriormente, es la parte protéica de la enzima:
en ella radica la especificidad de acción de las enzimas a causa de la presencia del
centro activo, que es el sitio donde se coloca el sustrato para sertransformado y
cuya estructura se explicará más adelante.
El Sustrato es la molécula sobre la cual la enzima va a ejercer su acción. Tanto la
apoenzima como el sustratotienen que estar obligatoriamente presentes para que
pueda efectuarse la reacción.
El Cosustrato es una molécula diferente a la molécula de sustrato la cual acepta
un grupo proveniente del mismo. Estetipo de componente es característico de
las reacciones de transferencia, donde un grupo del sustrato es transferido a una
molécula aceptora (cosustrato).
Las Coenzimas son compuestos orgánicos derivados,fundamentalmente de las
vitaminas, donde abundan los derivados de las vitaminas B como la coenzima
A(CoASH), el NAD, el TPP y otros, además de algunos nucleótidos importantes
como el ATP, UTP, ADP, GTP, CDP, etc. Las coenzimastienen la característica de
regenerarse después de haber participado en la reacción mediante una reacción
subsiguiente, y deforma general, pueden ser separadas de la enzima por diálisis,
porque están débilmente unidas a la enzima.
3 Volver al
Introducción al estudio de la
de la temperatura puede acelerar una reacción, las enzimas son inestables cuando
se calientan. La actividad catalítica de una enzima está determinada sobretodo
por su secuencia de aminoácidos y por la estructuraterciaria, es decir, la
estructura de plegamiento tridimensional de la macromolécula.
Como norma, las enzimas no atacan a las células vivas. Sin embargo, tan pronto
muere una célula, ésta es digerida por enzimas que rompen sus proteínas.
Es absoluta cuando la enzima es estrictamente específica para untipo de enlace
correspondiente a un sustrato único; incluso la enzima no ataca a otro sustrato de
estructura muy relacionada. Por ejemplo la ureasa, que cataliza la descomposición
de la urea en CO2 y NH3.
La eficiencia catalítica de las enzimas es otra propiedad importante que los
diferencia del resto de las proteínas; esta se manifiesta incluso en preparados muy
impuros o en disoluciones muy diluidas de enzimas. Esta propiedad consiste en
que una sola molécula de enzima puedetransformar, en una unidad detiempo,
grandes cantidades de moléculas de sustrato. Su explicación se hace más evidente
cuando se cuantifica.
Se ha calculado que una célula contiene 100 000 moléculas de enzimas para
acelerar las 1 000 a 2 000 reacciones químicas quetienen lugar en su interior, lo
que ofrece un promedio de 50 a 100 moléculas de enzima por cada proceso. Se
ha calculado también, que una molécula de la enzima que transforma el H202 en
H20 y 02 puede actuar sobre más de 5 000 000 de moléculas de peróxido por
minuto. Otras enzimas transforman, en el mismotiempo, de 1 000 a 500 000
moléculas. Estos valores aclaran por si mismos cuán eficaces son las enzimas.
Las enzimas son muy eficaces, cantidades pequeñas de una enzima pueden
realizar a bajastemperaturas lo que podría requerir reactivos violentos y
altastemperaturas con métodos químicos ordinarios. Por ejemplo, unos 30 g de
pepsina cristalina pura son capaces de digerir casi dostoneladas métricas de clara
de huevo en pocas horas.
La reversibilidad se explica porque de acuerdo con la Ley de acción de masas,
una enzima, como cualquier catalizador, afecta por igual una reacción química en
cualquier dirección en que se verifique, sin que cambie el punto de equilibrio de la
reacción. En apariencia, muchas enzimas sólo parecen dirigir lastransformaciones
de los sustratos en un sentido. La causa de este hecho radica en lafacilidad con
que se encadenan en el medio celular unas reacciones con otras, de forma que el
producto de una reacción es el sustrato de la siguiente. De este modo se origina
una variación constante de las condicionesfísicas del equilibrio al sustraer de la
acción de la enzima los productos que se van formando. La reversibilidad de la
acción de muchas enzimas resultafácilmente demostrable in vitro, mediante un
simple cambio de las condiciones de reacción.
Clasificación y nomenclatura de las enzimas
En un principio las Enzimas se nombraban añadiendo el sufijo –asa- al nombre del
sustrato sobre la cual la enzima ejercía su acción catalítica. Por ejemplo, ureasa es
la enzima que cataliza la hidrólisis de la urea con producción de amoniaco y CO2.
3 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 3
A. Macías Alviaet
Como se puede apreciar, la clasificación de los enzimas está de acuerdo con las
reacciones que puede experimentar el sustrato. Los ejemplos mostrados se
ajustan a la clasificación de los enzimas.
A veces los nombres sistemáticos son muy complejos y muchos enzimas se conocen
por su nombre usual.
Modo de acción
Todos las enzimas, además de poseer estructura primaria, secundaria,terciaria,
y en algunos casos, cuaternaria, poseen un sitio especifico dentro de la molécula
denominadocentro activoo cetro catalítico, este, por supuesto, está en la
apoenzima y es la parte de la enzima que se combina con el sustrato. El centro
activo está formado por una agrupación especial y específica de aminoácidos,
constituyendo una parte muy pequeña de la enzima.
Los aminoácidos que constituyen el centro activo se agrupan en dostipos:
aminoácidos de contacto, que son los que participan en lafijación del sustrato a la
enzima y aminoácidos auxiliares, encargados detransformar el sustrato en producto.
El resto de los aminoácidos que participan en el centro activotienen lafunción
de soportar la estructura espacial de este. El centro activo puede estarformado
por aminoácidos de una sola cadena o por aminoácidos de varias cadenas, en
dependencia de la estructura de la enzima en cuestión.
Esta estructura puede representarse deforma esquemática como se muestra en la
figura.
3 Volver al
Introducción al estudio de la
3 Volver al
Introducción al estudio de la
(1)
(2)
Volver al 4
A. Macías Alviaet
4 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 4
A. Macías Alviaet
la enzima.
Volver al 4
A. Macías Alviaet
4 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 4
A. Macías Alviaet
4 Volver al
Introducción al estudio de la
4 Volver al
Introducción al estudio de la
B6 Convulsiones,
Cereales, verduras, Metabolismo de los
alteraciones en la piel
Piridoxina carnes aminoácidos y cálculos renales
Carnes rojas, huevos, Metabolismo de los ácidos Anemia perniciosa,
B12 Cobalamina productos lácteos trastornos neurológicos
nucleicos
H Síntesis de ácidos grasos
Carnes , verduras, y metabolismo de Depresión,fatiga,
Biotina legumbres aminoácidos náuseas
Formación de colágeno
C Cítricos, frutas, en dientes, huesos y Escorbuto (hemorragias y
verduras de hoja tejido conectivo de vasos
Ácido ascórbico caída de dientes)
verde, tomates sanguíneos
Bc Alimentos integrales,
Metabolismo de los ácidos
verduras de hoja Anemia, diarrea
Ácidofólico verde, legumbres nucleicos
Volver al 5
A. Macías Alviaet
5 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 5
A. Macías Alviaet
Volver al 5
A. Macías Alviaet
Volver al 5
A. Macías Alviaet
PREGUNTAS
1. ¿Qué es una enzima y cuál es su naturaleza química?
2. Explique qué es el centro activo cómo está constituido.
3. Enumere las propiedades de los enzimas que los diferencian del
resto de las proteínas.
4. Justifique mediante un gráfico el efecto de la concentración de las
enzimas sobre la velocidad de la reacción.
5. ¿Qué expresa la ecuación de Michaelis-Menten?
6. ¿Cómo puede definirse laK M?
7. Represente gráficamente laK M
mediante el gráfico de Michaelis-
Menten.
8. Explique mediante gráficos la inhibición competitiva y la no
competitiva.
9. Explique el efecto de la temperatura y el pH sobre la velocidad de
las reacciones enzimáticas.
10. Explique en qué consiste del Feed Back.
11. ¿Qué se entiendo por vitamina?
12. ¿Cómo se clasifican las vitaminas y por qué?
13. ¿Cuál es el concepto de provitamina? Citar ejemplos y explicar la
importancia metabólica de ellas.
14. Explique el papel biológico de 3 vitaminas.
15. ¿Qué vitamina usted considera con mayor importancia biológica?
Justifique su respuesta.
16. Explique en que consiste el mecanismo de acción de las hormonas.
17. ¿Cuál es el modo de acción de lasfitohormanas?
18. Describa la acción de las auxinas en el desarrollo de la planta.
19. Explique el efecto de las hormonas de lafloración y la división
celular.
20. ¿Qué características mínimas indispensables reúnen las
sustancias que les permitetener actividad auxínica?
21. ¿Quéfitohormanasfomentan el crecimiento de las yemas laterales
y se oponen así a la auxina?
5 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 5
A. Macías Alviaet
(Respiración)
Muchos autores coinciden en considerar dosfases o etapas en el proceso de
glucólisis, sin embargo, las reacciones que comprende cada una de ellas difiere
para los diferentes autores.
Se considera comoprimera faselatransformación de la glucosa en fructuosa
1,6-disfosfatoy comosegunda fase, laescisión de este compuesto en dos triosas y
su conversión en piruvato. Es decir la primerafase está constituida por un conjunto
de reacciones preparatorias en la que la molécula de D-glucosa esfosforilada a
expensas del ATP para adquirir la reactividad necesaria, altransformarse en un
éster fosfórico de la glucosa.
Precisamente son estos ésteresfosfóricos los puntos de partida detodas las
reacciones de degradación y suformación es catalizada por enzimas específicas
llamadas quinasas, que se encuentran presentes en las células.
Lafosforilación previa del azúcar que ha de experimentar glucólisis se produce en
el paso de hexosa, principalmente la D-glucosa, pero en algunos casostambién la
experimentan la D-fructosa, la D-manosa y la D-glucosamina.
Las reacciones de la glucólisistienen lugar en el espacio citoplasmático de las
células y son catalizadas por diez enzimas La ubicación de la secuencia glicolítica
en el citoplasma estáfundamentada por el hecho de que la mayoría de las enzimas
5 Volver al
Introducción al estudio de la
se
Volver al 6
A. Macías Alviaet
Además, desde un punto de vistafísico, ofrece a las células una gran ventaja pues
convierte a la glucosa, que puede salir y entrar libremente al interior de las células
através de las membranas celulares, en sustanciastípicamente intracelulares,
facilitándosetrabajo osmótico de captación de la glucosa. La ecuación que describe
lafosforilación de la glucosa es la que se muestra a continuación:
D-glucosa D-glucosa-6-P
La enzima que cataliza la reacción, es representativa de un grupo
detransfosforilasas que catalizan las transferencias del fosfato terminal del ATP a
un aceptor adecuado, genéricamente son llamadasquinasas.
Las glucoquinasas constituyen el segundo grupo,fosforilan solamente a la
D-glucosa: sin embargo, su afinidad por esta hexosa es mucho menor que la que
posee la hexoquinasa. Está presente en el hígado e interviene sólo en condiciones
de emergencia.
Glucoquinasa: KM = 0,2 mM.
Hexoquinasa KM = 0.05 mM.
Ambas quinasas necesitan el concurso de un catión divalente: Mg2+ o Mn2+. Estos
cationes se combinan previamente con el ATP paraformar el verdadero sustrato
MgATP2+ o MnATP2+. La reacción catalizada por la hexoquinasa constituye un
punto de control secundario en el proceso glicolítico, ya que esfuertemente
inhibida por su propio producto: la glucosa-6-fosfato, que actúa como modulador
negativo.
CONVERSIÓN DE LA D-GLUCOSA-6-P EN D-FRUCTOSA-6-FOSFATO
Robinson (1932),fue el primero en extraer la glucosa-6-P de una mezcla que
conteníatambiénfructosa-6-P. Investigaciones realizadas posteriormente por
Lohmann (1933) y otros investigadores demostraron,tanto en el músculo como en
las plantas, la presencia de una enzima que catalizaba un equilibrio dinámico
entre ambos ésteresfosfóricos. Esta enzimafue denominadafosfohexoisomerasa y
es una metaloproteína de alta especificidad.
∆G = 1,67 kJ/mol
Glucosa-6-P Fructosa-6-P
Volver al 6
A. Macías Alviaet
El equilibrio de esta reacción está del lado de la glucosa-6-P de ahí que en él, la
concentración de ambos ésteresfosfóricos sea de 70% de glucosa-6-P y 30% de
fructosa-6P.
La enzimafosfoglucoisomerasa ha sido aislada y purificada y es específica para
ambos ésteresfosfóricos; requiere de la presencia de iones Mn 2+ o Mg2+.
Fosforilación de la D-fructoa-6-P afructosa -1-6-difosfato.
Laformación defructosa 1-6-difosfato involucra unatransferencia del grupofosfato
desde el ATP a lafructosa-6-P catalizada enzimáticamente. Esta reacción es similar
a la reacción catalizada por la hexoquinasa, y está caracterizada por un
elevado∆G° negativo. Lafosforilación se produce en la posición 1 de lafructosa-6-
P, actuando como enzima la fosfofructoquinasa que requiere de iones Mg2+.
Fructosa-6-P Fructosa-1,6-P
El inosintrifosfato (ITP) y el uridintrifosfato (UTP) pueden actuar,también, como
dadores del grupo fosfato.
El equilibrio de la reacción se desplaza hacia laformación de lafructosa-1-6-
difosfato. Esta reacción resulta prácticamente irreversible y constituye el punto
de control principal de la secuencia glicolítica, porque lafosfofructoquinasa es una
enzima alostérica y limita la velocidad de la secuencia de reacciones. La mayoría
de las enzimas reguladores catalizan reacciones irreversibles. La
fosfofructoquinasa es una enzima reguladora multivalente; su actividad es
estimulada por el ADP y por Pi y resulta inhibida por el ATP, y por el citrato. Cuando
la relación ATP/ADP es elevada, la enzima esfuertemente inhibida y cuando la
relación es baja, aumenta, su actividad.
El citrato actúa como modulador negativo específico de lafosfofructóquinasa.
El citrato producido por el ciclo de Krebs puede abandonar la mitocondria e
incorporarse al citoplasma mediante el sistema transportador del citrato de la
membrana mitocondrial.
Siempre que haya superproducción de citrato, este actúa como inhibidor de la
fosfofructoquinasa, retardando el ritmo de la glucólisis; en general, cuando se
produce abundante ATP en las oxidaciones de la mitocondria, el exceso de ATP
inhibe la glucólisis en este punto, ya qué detiene lafosforilación de lafructosa-
6-P. Ocurre lo contrario cuandofalta ATP, la concentración de ADP aumenta y este
activa a lafosfofructoquinasa. Una reacción importante en el hígado, porque
aporta glucosa libre a la sangre, es la desfosforilación de la glucosa por acción de
una enzima totalmente diferente, la glucosa-6-fosfatasa.
6 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 6
A. Macías Alviaet
del ácido pirúvico a ácido láctico, estas se acoplan entre sí, por lo que no
Volver al 6
A. Macías Alviaet
deshidrogenasa,
Volver al 6
A. Macías Alviaet
Etanol
En general, lafermentación láctica y lafermentación alcohólica resultan ser dos
procesos muy semejantes con dos diferencias básicas:
1. La reducción del ácido pirúvico a etanol es irreversible, no así su
reducción a ácido láctico.
2. El productofinal de lafermentación alcohólica, el etanol, es neutro,
por lo que al no alterar prácticamente el pH del medio, posibilita
que la reacción prosiga durante un período más largo que lo que
pueda ocurrir en lafermentación láctica del músculo, que es un
proceso transitorio.
Rendimiento energético de lafermentación alcohólica
El rendimiento energético de lafermentación alcohólica es similar al de la
fermentación láctica, ya que la energía remanente en laformación del etanol es
análoga a la que queda cuando es el ácido láctico el productofinal, y laformación
de ATP es idéntica, puesto que las dos reaccionesfinales, descarboxilación e
hidrogenación del ácido pirúvico, no provocan ni ganancia ni pérdida de ATP.
La ecuación global de lafermentación alcohólica puede expresarse como sigue:
Glucosa+ 2 ADP + 2 Pi 2 etanol + 2 CO+2 + 2 ATP
En general, todos los organismos con un metabolismo basado en la fermentación,
al igual que La levadura, desdoblan grandes cantidades de sustrato, pues más del
90 % de la energía que se pudiera obtener teóricamente del proceso se queda en
productos del desdoblamiento y no es aprovechada directamente por los mismos.
6 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 7
A. Macías Alviaet
El acetil CoA que se produce en cada caso, se incorpora al ciclo de Krebs para su
degradaciónfinal, constituyendo este metabolito la materia prima del ciclo.
Ciclo de Krebs - Definición y localización
La reacción general del ciclo tricarboxílico o ciclo de Krebs se representa de la forma
siguiente:
CH3COOH + 2H2O + GDP + Pi2CO2 + 8H + GTP
GTP + ADPGDP + ATP
Como se observa, en el ciclo no participan O2 molecular, ni ATP; sufunción
primaria es la deshidrogenación del ácido acético paraformar dos moléculas de
CO 2 y cuatro pares de átomos de H que pasan a la CR (cadena Respiratoria): a su
vez,en el ciclo ocurre una fosforilación a nivel de sustrato que conduce a la
formación de una molécula de GTP. El GTPformado cede su grupo Pterminal al
ADP paraformar ATP.
El ciclo de Krebs lo constituye una serie ordenada de reacciones de carácter cíclico
en las que participan los diferentes metabolitos que sirven como sustratos o
punto de partida para elfuncionamiento de la CR (Cadena Respiratoria) y la PO
(Fosforilación Oxidativa). Fue descrito por primera vez por H. A. Krebs (1937) y a
suformulación actual han contribuido diversos investigadores como Szent-Gyorgyi.
Knoop. Martuis, Ochoa y otros. El ciclo de Krebs estambién conocido como ciclo
del ácido cítrico o ciclotricarboxílico y en las células aeróbicas constituye la
rutafinal del catabolismo oxidativo detodas las moléculas combustibles, como
son, los carbohidratos, los lípidos y las proteínas.
Todas las enzimas participantes del ciclo de Krebs así como las coenzimas y
cofactores están localizadas en la matriz mitocondrial al igual que los de la CR y la
PO, están localizados a nivel de la membrana interna de la mitocondria. Esta
localización del ciclo de Krebs es la esperada a causa de su íntima relación con los
dos procesos anteriormente descritos.
7 Volver al
Introducción al estudio de la
ΔGo=-32,2kJ/mol
Volver al 7
A. Macías Alviaet
El equilibrio estaría desplazado hacia laformación del ácido cítrico si nofuera porque
in vivoel ácido isocítrico se elimina rápidamente por oxidación, lo cual provoca un
desplazamiento de equilibrio quetiende a sustituir su desaparición. Elfluoracetato
bloquea la acción de esta enzima, ya que este puede condensarse con el AOA
(Ácido oxalacético) para dar un análogo del citrato que no es reconocido por la
aconitasa y provoca la acumulación del citrato.
Formación deα-cetoglutarato
Esta reacción es catalizada por la isocitrico deshidrogenasa. La mayor parte de
los materiales orgánicos y de lostejidos de animales superiores y de las plantas,
contienen dostipos de isocitrato deshidrogenasa: una de ellas es dependiente del
NAD+ la otra del NADP+. Ha sido ampliamente discutido, cuál de las dos enzimas es
la responsable de la conversión del isocitrato aα-cetoglutarato en el ciclo de
Krebs. Ambas catalizan la reacción siguiente:
Isocitrato + NAD+ o NADP+ α-cetoglutarato + CO2 + NADH + H+ o NADPH + H+
*E: Isocitrato deshidrogenasa
Tanto la isocitrato deshidrogenasa dependiente del NAD+ como la dependiente
del NADP+. Han sido encontradas en la mitocondrias de muchostejidos, pero las
primeras se encuentran exclusivamente en las mitocondrias, mientras que las
últimas se encuentrantambién en el citoplasma. La isocítrico deshidrogenasa
ligada al NAD + es el catalizador normal de la oxidación del isocitrato en el CK
(Ciclo de Krebs) (la cualtiene comofunción la descarboxilación oxidativa del
isocitrato), mientras que la que utiliza como coenzima al NADP+ interviene
fundamentalmente en reacciones biosintéticas auxiliares del ciclo.
La reacción catalizada por la isocitrato dehidrogenasa dependiente del NAD+ es la
siguiente:
7 Volver al
Introducción al estudio de la
Pi, la velocidad del ciclo se acelera producto del alosterismo positivo, efectuado
por el ADP+.
El equilibrio de la reacciónfavorece laformación delα-cetoglutarato bajo condiciones
fisiológicas por la gran liberación de energía libre a que conduce, siendo irreversible el
ciclo en esta reacción. En algunostejidos constituye un control de la velocidad del ciclo,
mientras que en otros, representa la reacción reguladora primaria del ciclo de Krebs.
Descarboxilación oxidativa delα-cetoglutarato
Esta reacción de descarboxilación requiere de ácido lipídico ytiaminpirofosfato
(TPP) y aunque la enzima se ha nombradoα-cetoglutárico desidrogenasa, es en
realidad un complejo multienzimático que actúa promoviendo laformación del
succinil CoA; es muy semejante al complejo de la piruvato deshidrogenasa en su
modo de acción. La oxidación delα-cetoglutarato a succinato, que es irreversible
en los organismos heterótrofos, se produce en dos etapas:
Volver al 7
A. Macías Alviaet
7 Volver al
Introducción al estudio de la
1
8
2
3
6
5 4
Volver al 7
A. Macías Alviaet
*(pH = 7 y temperatura = 25 o
7 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 8
A. Macías Alviaet
Deltotal de los hidrógenos producidos seis de ellos van a ser captados por el NAD +
produciéndose por consiguientetres NADH + H + y los otros dos restantes van a ser
captados por el FAD+ produciéndose FADH2. Los NADH + H+ y FADH 2 originados van
a incorporarse a la cadena respiratoria, de modo que a través de estas coencimas
y grupos prostéticos y con la participación conjunta de la coencima Q y los
citocromos, los H de los sustratos van a sertransportadosfinalmente hasta el O 2
con la consiguiente formación H2O ver lafigura en la página siguiente.
Considerando lafosforilación del ADP acoplada a la cadena respiratoria en la
fosforilación oxidativa es posible efectuar el balance energéticototal del ciclo de
Krebs, teniendo en cuenta que por cadaNADH + H + que interviene en la cadena
respiratoria, se sintetizan3 ATPpor lafosforilación oxidativa, por cadaFADH 2 2
ATP mediante el mismo proceso.
Es de señalar que la única deshidrogenación del ciclo que implica una ganancia de
dos ATP por el FADH2 que se produce, es la del succinato pasando a fumarato por
tener el par succinato/fumarato un potencial de reducción estándar superior a -
0.32 V, que será el correspondiente al del par NAD/NADH + H +, no pudiendo por
tanto cederle el succinato sus hidrógenos al NAD + para oxidarse (requisito
indispensable del transporte electrónico). También es importante destacar que
una molécula de ATP es aportada a nivel del ciclo mediante una fosforilación a
nivel de sustrato de acuerdo con la siguiente reacción:
GTP + ADP ATP + GDP
8 Volver al
Introducción al estudio de la
FIgura 13.Representación del acoplamiento del ciclo de Krebs a la cadena respiratoria (CR)
y a lafosforilación oxidativa (PO).
Conclusiones
La glucólisis es una secuencia de reacciones quetiene lugar en una gran variedad
de organismos ytejidos. Constituye una cadena metabólica, que partiendo de una
hexosa generalmente la D-glucosa conduce a la producción de dos moléculas de
triosa, el ácido pirúvico o el ácido láctico, que se puede considerar el lactato como
sustanciafinal de la glucólisis.
Se pueden considerar dos fases o etapas en el proceso de glucólisis.
Se considera comoprimera faselatransformación de la glucosa en
fructuosa 1,6-disfosfatoy comosegunda fase, laescisión de este compuesto en
dos triosas y su conversión en piruvato.
La glucólisis en condiciones anaeróbicas pueden tener lugar con la obtención de
ácido láctico o de etanol, en dependencia de la dotación enzimática de la célula.
En presencia de oxígeno la glucólisistrascurre vía CK hasta la cadena respiratoria,
propiciando lafosforilación oxidativa.
La respiración se realiza entresfases:
1. Formación de acetil CoA por oxidación de diversas moléculas
orgánicas.
Volver al 8
A. Macías Alviaet
8 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 8
A. Macías Alviaet
8 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 8
A. Macías Alviaet
8 Volver al
Introducción al estudio de la
CLOROFILA
La mayoría de la actividad
fotosintética de las plantas
superiores se realiza en las hojas
verdes que están particularmente
adaptadas para realizar
eficazmente este proceso; es por
eso que se afirma que las
clorofilas son los pigmentos más
importantes del
dispositivofotosintetizante, como
lo demuestra el hecho de que esta
función notiene lugar en las partes
no verdes de las hojas.
Devlin (1975), reportó que habían
sido determinados y estudiados hasta ese momento sietetipos de clorofilas,
resaltándose que lasclorofilas a y bson los únicos pigmentos clorofílicos de las
plantas superiores, mientras los demás se encuentran combinados con la clorofila
exclusivamente en las algas.
Laclorofilaes una porfirina, esto es, presenta cuatro núcleos pirrólicos unidos por
puentes metílicos, donde los cuatro átomos de N centrales se hallan coordinados
con union Mg 2+ para formar uncomplejo esencialmente plano muy estable.
La clorofila posee, además, una cadena lateralterpenoide unida al anillo (IV) larga
La clorofila es una molécula compleja,formada por e cuatro anillos pirrólicos,
hidrófoba,formada por un átomo d
el alcohol denominadofito
eterificado por un resto de
ácido propiónico, que es un sustituyente en el mismo anillo (IV).
Igualmente se observa en la estructura de la clorofila un anillo de ciclopentanona
condensado (V), situado hacia el anillo pirrólico (III), que contiene un grupo
carboxílico esterificado con el alcohol metílico.
En cuanto a la composición y estructura, la clorofila b se semeja mucho a la
clorofila a, distinguiéndose de ella en que el grupo metilo del anillo pirrólico (II)
está sustituido por un grupo aldehídico.
En su estructura, la molécula de clorofila presenta un número considerable de grupos
químicos activos, lo que condiciona la alta capacidad de reacción de los pigmentos
verdes.
Volver al 8
A. Macías Alviaet
La relación Cla/Clb varía de 1,5 a 3,0, según lafase del crecimiento de las plantas,
siendo mayor al inicio de lafase vegetativa, disminuyendo alfinal de la misma
(Genchev, 1970).
CAROTENOIDES
Además de la clorofila, pueden actuar como receptores lumínicos los carotenoides,
grupo de pigmentos que están difundidos entodas las plantas, con excepción de
algunos hongos.
Los carotenoidesformados solamente por carbono e hidrógeno se llaman
carotenos y los quetienen además oxígeno reciben el nombre de xantofilas.
Los verdaderos carotenoidestienen 40 átomos de C, lo que corresponde a ocho
restos de isoprenoformando largas moléculas cuyos extremos están constituidos
por un anillo de ciclohexeno sustituido y no saturado.
El carotenoide que se encuentra en mayor abundancia en lostejidos de las
plantas es un pigmento amarillo-anaranjado, elβ-caroteno, que suele ir
acompañado por cantidades variables de α -caroteno y γ -caroteno.
Los pigmentosfotosintéticos, en los cloroplastos de las plantas, están organizados
en dos conjuntos o agrupacionesfuncionales que, a su vez, se hallan conectados
con cadenas detransporte electrónico características.
Alrededor de 1960, y mediante los estudios del efecto Emerson, se comprendió
que lafotosíntesis requiere la cooperación de dos procesosfotoquímicos distintos,
originándose la división de los pigmentos en dosfotosistemas:fotosistema I y
fotosistema II.
El sistema de pigmentos I está compuesto por:
1. Cla 683 (tipo de clorofila a. que absorbe a 683 nm).
2.P-700 (tipo de Cl a que absorbe a 700 nm y que está presente en
pequeñas proporciones).
3.Carotenos, este sistema es activado por radiaciones de longitudes
de ondas largas.
El sistema de pigmentos II está compuesto por:
1. Cla-673.
2. Clb.
3. Ficobilinas.
El papel fundamental de los fotosistemas es la absorción de la radiación luminosa y su
conversión en energía química utilizable, basándose en untransporte de
electrones quetiene lugar en el cloroplasto, desde un dador electrónico (H 2O) a
un aceptor (NADP+) en una dirección opuesta a los potenciales estándar de
reducción, por lo que es imprescindible la energía luminosa para que se realice
esta transferencia por ser el proceso no espontáneo.
8 Volver al
Introducción al estudio de la
Cuando una molécula absorbe un cuanto de luz, queda excitada, es decir, pasa
de su estado normal a un estado excitado. Pero no todos los cuantos de luz son
capaces de llevar a la clorofila a un estado de energía más elevado, nitodas las
moléculas del pigmento absorben luz o son activados al mismotiempo: se cree
que la energía luminosa absorbida por una molécula de pigmento es transportada
través de muchas otras moléculas de pigmento antes de llegar a su punto de
acción. El cuantode luz absorbido migra de molécula a molécula mediante
transferencia por resonancia quetiene lugar, preferentemente, desde un
pigmento con una banda de absorción correspondiente a una longitud de onda
pequeña, hasta un pigmento con una banda de absorción a una longitud de onda
mayor. De este modo, la migración de energía hasta la molécula de P-700
resultafavorecida gracias a su banda de absorción en una onda más larga
(Devlin.1975), Emerson y sus colaboradores (1960) descubrieron que la eficacia de
lafotosíntesis en longitudes de ondas superiores a 680 nm puede hacerse normal
mediante aplicación simultánea de luz de longitud de onda más corta. El efecto de
los dos haces de luz superpuestos sobre la intensidad de lafotosíntesis, es mayor
que la suma de los efectos de ambos haces de luz empleados por separado.
Este reforzamientofotosintético es lo que se llama efecto Emerson.
La disposición apretada de las moléculas de clorofila en los cuantosomas, explica
la excelente migración de energía que presenta mediante transferencia por
resonancia. Se cree que en el sistema de pigmentos I,donde actúa el pigmento P-
700, los demás pigmentos actúan comotrampas energéticas, por lo que el
cuantosoma en cuestión contiene un pequeño número de moléculas de
pigmentos con una banda de absorción larga; la energía de excitación
procedente de la absorción de un cuantode luz por la clorofilaa(683), migra hasta
el P-700 y es recogida por él. El hecho de que se ha calculado que el P-700 está
presente en el cloroplasto a una concentración de 1:2 moléculas por 400
moléculas de clorofila, parece estar de acuerdo con esta idea; por ello, se suele
pensar que el P-700 actúa en el cuantosoma como centro de la reacción
fotoquímica.
La migración del exceso de energía y su conversión en energía química es lo que
tiene verdadera importancia y esto se logra mediante eltransporte de electrones
en la oxidación-reducción reversible de compuestos orgánicos. Todas las células
fotosintéticas que desprenden oxigeno molecular contienen ambosfotosistemas (I
y II), mientras que las bacteriasfotosintéticas que no desprenden oxígeno
contienen solamente elfotosistema I, se postula que elfotosistema II, activado por
longitudes de ondas inferiores, es el necesario para que haya desprendimiento
de oxígeno (Lehninguer, 1972).
A continuación se describen las dosfases que constituyen el procesofotosintético:
lafase lumínicayfase oscurao bioquímica, así como los procesos que se incluyen
en cada caso.
Fase luminosa; procesos
Hill en 1937, encontró que el dióxido de carbono no era necesario para la reacción
Volver al 9
A. Macías Alviaet
Volver al 9
A. Macías Alviaet
9 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 9
A. Macías Alviaet
9 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 9
A. Macías Alviaet
Volver al 9
A. Macías Alviaet
la rubisco.
Las plantas C4 se caracterizan por presentar una anatomía en corona o con vaina
amilífera, que rodea los conductos o haces vasculares. Los cloroplastos de las
células de la vaina son más grandes que los del mesófilo, acumulan mucho almidón
y poseen pocas granas o son agranales.
En regiones con un clima árido y elevadastemperaturas en verano, que limitan
mucho el rendimiento de las plantas, las especiestipo C 4 son de gran interés. Entre
estas plantas están algunas quenopodiáceas, como el sisallo (Salsola vermiculata), la
caña de azúcar, el maíz, el sorgo y el amaranto (bledo o alegría).
En las plantas que han desarrollado un ciclo previo para evitar
laFotorespiración, lafijación del CO 2 comienza en elfosfoenolpiruvato (PEP),
molécula detres a 3-C, que se convierte en ácido oxalacético de cuatro carbonos.
El oxálico es convertido en ácido málico (también de cuatro carbonos). Todo esto
ocurre en las células del parénquima clorofiliano del mesófilo y luego el ácido
málico pasa a las células de la vainafascicular donde se desdobla nuevamente en
PEP y anhídrido carbónico, que entra en el ciclo de Calvin, mientras que el PEP
vuelve a las células del mesófilo. La glucosaformada puede sertransportada
9 Volver al
Introducción al estudio de la
Las plantas que usan la vía de los cuatro carbonos (por ejemplo caña de azúcar y
maíz) evolucionaron en lostrópicos y están adaptadas a mayorestemperaturas.
Note que el oxalacetato y el málicotienenfunciones en otros procesos, por lotanto
están presentes entodas las plantas, permitiendo a los científicos hipotizar que la
vía de los cuatro carbonos evolucionó independientemente muchas veces, en un
mecanismo denominado evolución convergente.
4.4. Síntesis de almidón y sacarosa. Gluconeogénesis.
Glucogenolisis
Gluconeogénesis
Laconversión de piruvato en glucosaes la vía más general e importante para
labiosíntesis de los monosacáridos y los polisacáridosa partir de moléculas
precursoras. El proceso recibe el nombre degluconeogénesis,que significa
formación de azúcar nuevo. Este proceso ocurre de manera general entodos los
organismos através del mismo se obtienentambién disacáridos.
El piruvato, el oxalacetato, el lactato y los aminoácidos glucogenéticos, entre
otros, son precursores simples que pueden ser transformados en glucosa y
glucógeno por los organismos heterótropos.
Los carbohidratos pueden ser, además, biosintetizados a partir de diversas
sustancias. Estos constituyen precursores sencillos que pueden ser glúcidos
preexistentes u otras sustancias de naturaleza diferente Los glúcidos preformados
pueden originar carbohidratos por interconversión mientras que las sustancias no
glucídicas requieren procesos químicos más complejos.
Aminoácidos glucogénicos
En general,todos aquellos compuestos que pueden convertirse en un metabolito
intermediario de la vía glucolítica pueden ser precursores de la glucosa y por lo
tanto, pueden realizar gluconeogénesis
La vía de conversión de piruvato en glucosa ocurre mediante una serie de
reacciones catalizadas enzimáticamente: las enzimas que participan en la vía, en su
mayor parte, participan en la vía glucolítica y pueden catalizar las reacciones en
sentido opuesto. Además, a esta senda metabólicafluyen otras dos sendas
alimentadoras que parten de diferentes precursores no carbohidratos. Una de
ellastransforma metabolitos intermediarios del ciclo de Krebs en piruvato, y la
otra, que notiene efecto para los organismos heterótrofos y sirve para
diferenciarlos de los organismos autótrofos, es el conjunto de reacciones mediante
las cuales se produce lafotosíntesis.
Reacciones individuales de la gluconeogénesis
La transformación de piruvato en glucosa se produce por inversión de la mayoría
de las reacciones de la glucolisis, existiendotres etapas irreversibles que son
utilizadas en la conversión depiruvato en glucosa. Estas etapas se sustituyen por
reacciones alternativas que sonfavorablestermodinámicamente a la síntesis.
Volver al 1
A. Macías Alviaet
1 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 1
A. Macías Alviaet
PREGUNTAS
1. ¿Cuál es la importancia de lafotosíntesis?
2. ¿Qué es lafotólisis?
3. Represente en un esquema simplificado lafotosíntesis
4. ¿En qué orgánulo de la célulatiene lugar lafotosíntesis?
5. ¿Cuáles son las sustancias necesarias para que se produzca la
fotosíntesis?
6. ¿Qué moléculas aportan el carbono y el hidrógeno en lafotosíntesis?
7. ¿Cuáles son lasfases en que se produce lafotosíntesis y que
sustancias intervienen en cada una?
8. ¿Qué pigmento está presente en lafotosíntesis?
9. ¿Dónde interviene la enzima Rubisco en lafatosíntesis?
10. ¿Qué es lafotorrespiración y cuáles son sus causas?
11. ¿Qué se entiende por plantas C 3 y C4 explique, cuáles son más
eficiente en lafotosíntesis y por qué?
12. ¿Qué es la gluconeogénesis?
13. ¿Cuáles son las etapas utilizadas en la conversión de piruvato en
glucosa?
14. ¿Cómo se produce la regulación metabólica de las vías anabólicas y
catabólicas de los carbohidratos?
1 Volver al
Introducción al estudio de la
1 Volver al
Introducción al estudio de la
De estructura general.
Las ceras se obtienen defuentes naturales, dentro de ellas las más importantes son.
• Cera carnauba; obtenida de una especie de palma que lleva ese
nombre.
• Cera de abejas.
Volver al 1
A. Macías Alviaet
1 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 1
A. Macías Alviaet
1 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 1
A. Macías Alviaet
Trigricélidos Isomerasa
Fosfoenolpiruvato
Piruvato
Anaerobia Aerobia
F. lácticaCK, CR, PO
F. alcohólica
La abundancia de ácidos grasos en animales es relativamente mayor que en las
plantas, encontrándose los anteriormente citados y muchos otros más complejos.
Normalmente, en la sangre de los vertebrados, son transportados incesantemente
ácidos grasos de un lugar a otro del organismo. La variación de la concentración
1 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 1
A. Macías Alviaet
metabólicos yfisiológicos.
Una vez que se ha degradado la grasa en sus unidades constituyentes: ácidos
grasos y glicerina, cada uno de ellostornará o encauzará su degradaciónfinal por
rutas diferentes.
5.4. Oxidación de la glicerina
La glicerina está íntimamente relacionada con el catabolismo de los carbohidratos
en sufase intermedia, por ser estafácilmente convertida por un conjunto de
enzimas en el gliceraldehido 3-fosfato,tal como se muestra en la secuencia de
reacciones de lafigura, se aprecia cómo la glicerina primeramente esfosforilada
por la acción de una quinasa y una molécula de ATP que dona uno de sus
gruposfosfato; este último esterifica el OH del C númerotres de la
molécula,formándose así la molécula de glicerol-fosfato, que posteriormente bajo
la acción de una enzima dependiente del NAD+, la glicerol-fosfato-deshidrogenasa
(glicero!-P-deshtdrogenasa), pierde dos hidrógenos, quedando la molécula con una
densidad de carga negativa quefacilita laformación de un nuevo enlace con el
oxígeno, para dar lugar a la dihidroxiacetona fosfato (DHAP), que rápidamente
puede ser convertida, mediante una isomerasa, en el gliceraldehído-3-P.
5.5. Activación y penetración de los ácidos grasos a la mitocondria
Investigaciones llevadas a cabo recientemente muestran que haytres etapas
en la entrada de los ácidos grasos procedentes del cítoplasma al interior de las
mitocondrias, ellas son:
1. Esterificación enzimática del ácido graso libre con el CoA
extramitocondrial, a expensas del ATP en la membrana exterior
de la mitocondria.
2. Transferencia del grupo acilo graso desde el CoA a la molécula
transportadora Carnitina, la que lo conduce através de la membrana
interior.
3. Latransferencia del grupo acilo graso desde la carnitina al CoA
intramitocondrial.
Estas tres etapas ocurren mediante la secuencia de reacciones que se muestran en
lafigura.
10 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 1
Introducción al estudio de la
PRIMERA DESHIDROGENACIÓN
En la primera reacción, el ácido graso activado (acil CoA) es deshidrogenado
enzimáticamente en los carbonos α y con la participación de la enzima
deshidrogenasa del acil CoA graso dependiente del FAD. En esta enzima el FAD
estará estrechamente unido a ella reduciéndose al captar los hidrógenos del ácil
CoA, sustrato de la reacción, nuevamente restablecerá su estado oxidado
cediendo los mismos a la CR, por no poderse oxidar directamente con el oxigeno,
La reacción puede representarse de la siguienteforma:
*Acetil CoA
El producto de la reacción es un compuesto insaturado entre los carbonos α yβ
denominado acilen CoA. o α ,β-transdehidroacil CoA.
En la literatura son reportadas para esta reacción cuatro clases diferentes de
flavoproteínas específicas para una determinada longitud de la cadena de acil CoA
original.
HIDRATACIÓN
El producto de la anterior reacción se hidrata en presencia de la enzima enoil hidratasa,
también llamada crotonasa. Químicamente es la adición de una molécula de agua
al doble enlace con la consiguienteformación de un hidroxiacil CoA. La reacción es
reversible y estereoespecífica, dando como resultado el L-estereoisómero.
Volver al 10
A. Macías Alviaet
El NAD+ que se reduce a NADH + H+ cederá sus e- a la C.R para restablecer su forma
oxidada.
*β-cetoacetil CoA
ESCISIÓN TIOLÍTICA O RUPTURA TIOLÍTICA
10 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 10
A. Macías Alviaet
10 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 10
A. Macías Alviaet
También se propone que la oxidación del propionil CoA no ocurre por la ruta
anteriormente propuesta, sino que la carboxilación del propionil CoA es determinada
por latransferencia de un radical -COOH desde el ácido oxalacético en reacción
catalizada por la metilmalonil carboxitransferasa, quetambién precisa como
coenzima a la biotina. La reacción es la siguiente:
Propionil CoA + AOA E metilmalonil CoA + piruvato
Para establecer el rendimiento energético de la degradación de los ácidos grasos
de número impar de átomos de carbono ha de seguirse, entodos los casos, el
aporte en ATP producido en la oxidación normal, y a continuación, el aporte
producido por la entrada del succinil CoA al ciclo de Krebs, como se muestra en la
tabla
Tabla 10.Balance energético del succinato en el Ciclo de Krebs.
Reacción Coenzima Rendimiento
Succinil CoA + ADP + Pi Succinato+ ATP (GTP)1 ATP
Succinato Fumarato FADH2 2 ATP
Malato OAA NADH + H+ 3 ATP
Este balance no es real, puesto que se consume 1 ATP en laformación del
metilmalonil CoA por lo que 6 ATP – 1 = 5 ATP. En la degradación de un ácido graso
de número impar de carbonos, el rendimiento energético neto estará disminuido
producto de la degradación del succinil CoA en el CK.
10 Volver al
Introducción al estudio de la
Acetoacetíl Co A
El acetoacetil CoA pierde posteriormente otro CoASH por desacilación en la que
se forma b-hidroxi-b-metilglutaril CoA, metabolito precursorfundamental en la
obtención de varios esteroles, entre ellos el colesterol.
Acetoacetato Acetona
Tanto el acetoacetato corno b-hidroxibutirato
producidos, pueden difundirse desde el
hígado, vía sanguínea hasta lostejidos
periféricos y allí ser utilizados y oxidados en el
ciclo de Krebs. Cuando la velocidad de Figura 24.Cetogénesis.
producción de cuerpos
cetónicos supera la velocidad o posibilidad de consumo de estos por lostejidos
periféricos, aparece el estado conocido como cetósis.
Es importante destacar que otra razón por la cual pueden encontrarse valores
altos de cuerpos cetónicos en la sangre es una inhibición de la enzima citrato
sintetasa que imposibilita la entrada y oxidación del acetil CoA en el CK. De la
misma manera, el ayuno prolongado de glucosa produce un aumento de estos e
inclusive su eliminación en grandes cantidades por la orina.
10 Volver al
Introducción al estudio de la
Volver al 1
A. Macías Alviaet
11 Volver al
Introducción al estudio de la
dichos
Volver al 1
Introducción al estudio de la
Volver al 11
A. Macías Alviaet
Volver al 11
A. Macías Alviaet
Transportador
ACP CoA CoA
de acilos
C12, 14. 16, 18 C10 y 16 saturados y
ProductosÁc palmítico(C16) 20, 22 y 24 C18 insaturados
Agente
malonil CoAacetil CoAmalonil CoA
elongante
11 Volver al
Introducción al estudio de la
Conclusiones
Los lípidos constituyen un grupo de compuestos de composición química muy
variada.
Los ácidos grasos o carboxílicos son compuestos orgánicos con un grupofuncional
(COOH) y son las sustancias orgánicas que mayor grado de acidez presentan.
Los ácidos mixtos, hidroxiácidos, cetoácidos y los ácidos aldeídicos son de gran
importancia metabólica pues ellos participan en diferentes procesos vitales para
el normalfuncionamiento de las células vegetales y animales. Además los ácidos
dicarboxílicos saturados y no saturados son metabolitos intermediarios en los
procesos que ocurren a nivel celular.
Las grasas neutras constituyen una importante reserva de energética para las
plantas y los animales, requieren de una vía más compleja para su catabolismo
pero poseen un mayor rendimiento energético.
La hidrólisis de una grasa neutra rinde glicerina y ácidos grasos que por betaoxidación
se incorporan directamente a la CR, este procesotiene lugar en pares de carbonos
que en cada siclo de la espiral degradativa rinde una molécula reducida de NADH
+
H+ que aporta 3 ATD y otra de FADH2 que aporta 2 ATD, mientras que susfracciones
pares de la cadena carbonada en pares se incorporan enforma de Acetil CoA al
CK, Los restos de glicerina se oxida incorporándose a la glicólisis enforma de
Gliceraldehido-3-P.
Volver al 11
A. Macías Alviaet
PREGUNTAS
1. Que se obtiene por hidrólisis de una grasa neutra.
2. Formule cada una de las reacciones constitutivas de laβ-oxidación.
¿Qué productos se obtienen en cadafase y cuál es su destino?
3. Calcule y compare el rendimiento energético de la degradación de
una molécula de glucosa y de ácido esteárico (C18). ¿Cuál
metabolito es más energético?
4. Qué sustancias son las iniciadoras de la síntesis de los ácidos grasos.
5. Elabore un cuadro comparativo de los diferentes sistemas de
elongación de ácidos grasos atendiendo a:
• Localización
• Agente elongante
• Agente reductor
•Otras moléculas participantes
•Tipos de ácidos grasos producidos
6. Explique en qué consiste esencialmente la síntesis de los triglicéridos.
11 Volver al
Introducción al estudio de la
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
García J. M. y Ferro, A.(2010).Introducción al Estudio de la Bioquímica.
Biblioteca virtual.UHo. Recuperado de:
http://biblio.ict.uho.edu.cu/3wisis_search/ bbvirtual.htm
Ramos, A.,et al.(2008).Bioquímica para estudiantes de Ciencias Agropecuarias.La
Habana, Cuba: Editorial Félix Varela.
Villar Palasí, V. y Santos Ruíz, Á.(1977).Tratado de Bioquímica.Barcelona, España:
Editorial Augusta.
Volver al 11
A. Macías Alviaet
11 Volver al