Investigación Acidos Nucleicos
Investigación Acidos Nucleicos
Investigación Acidos Nucleicos
BASES NITROGENADAS
Concepto.
Las bases nitrogenadas son compuestos orgánicos cíclicos, con dos o más átomos de nitrógeno, que constituyen
una parte fundamental de los nucleótidos, nucleósidos y ácidos nucleicos. Desde el punto de vista de la Biología
existen cinco bases nitrogenadas principales, que se clasifican en dos grupos, bases púricas (derivadas de la
estructura de la purina) y bases pirimidínicas (derivadas de la estructura de la pirimidina).
La adenina (A) y la guanina (G) son púricas, mientras que la timina (T), la citosina (C) y el uracilo (U) son
pirimidínicas. Las cuatro primeras bases se encuentran en el ADN, mientras que en el ARN en lugar de timina
existe el uracilo.
Aquí es donde empieza a entrar la importancia de las bases nitrogenadas. Y es que existen dos tipos de ácidos
nucleicos. Simplemente se diferencian entre ellos por el azúcar que llevan. Por un lado tenemos la desoxirribosa y
por otro lado la ribosa. Se diferencian también por las bases nitrogenadas que contienen. En el caso del ADN,
tenemos la adenina, guanina, citosina y timina. Por otro lado, en el ARN tenemos la adenina, guanina, citosina y
uracilo. La diferencia es que la estructura de las cadenas de las bases nitrogenadas es diferentes en el ADN y ARN.
Mientras que en el ADN son cadenas dobles en el ARN es una cadena sencilla.
PENTOSAS.
Definición
Las pentosas son monosacáridos (glúcidos simples) formados por una cadena de cinco átomos de carbono que
cumplen una función estructural. Como en los demás monosacáridos, aparecen en su estructura grupos hidroxilo
(OH). Además, también pueden llevar grupos cetónicos o aldehídicos.
Diferencia entre ribosa y desoxirribosa
La ribosa se diferencia con la desoxirribosa en el Carbono 2, la ribosa presenta un grupo OH unido, en cambio la
desoxirribosa como su nombre lo indica carece de ese átomo de oxígeno, solo tiene H.
NUCLEÓSIDO
Definición
Un nucleósido es una molécula monomérica orgánica, que integra las macromoléculas de los ácidos nucleicos y
que resulta de la unión covalente entre una base nitrogenada con una pentosa, que puede ser ribosa o desoxirribosa.
Ejemplos de nucleósidos son la citidina, uridina, adenosina, guanosina y la timidina.
Se pueden concebir como nucleótidos que no cuentan con el grupo fosfato. Es decir, los nucleósidos pueden
combinarse con un grupo fosfórico (ácido fosfórico: H3PO4) mediante determinadas quinasas de la célula,
produciendo nucleótidos, que son los componentes moleculares básicos del ADN y el ARN.
Nomenclatura. Ejemplos
Funciones de los nucleósidos y ejemplo de algunos nucleósidos de interés para la vida y salud de los animales
superiores.
NUCLEÓTIDO
Definición
Son moléculas pequeñas sintetizadas por todos los organismos vivos, que están formadas por la unión de tres
elementos: una base nitrogenada, un azúcar simple y un grupo fosfato.
Los nucleótidos son los componentes estructurales básicos (monómeros) de los ácidos nucleicos, en los cuales se
ubican como los peldaños transversales de la forma desenrollada de escalera del ácido nucleico, pero también
realizan funciones importantes como molécula libre (por ejemplo, el ATP o el GTP).
ÁCIDOS NUCLEICOS|
Definición.
Los ácidos nucleicos son macromoléculas en una larga cadena de carbonos formada por ácido fosfórico,
carbohidrato y base orgánica nitrogenada. Están presentes en el material genético (ADN y ARN) de todos los
organismos vivos.
Los ácidos nucleicos son grandes moléculas que se encuentran en todas las células y son esenciales para la vida, ya
que contienen la información genética de los seres vivos. Esta información o código genético contiene las
instrucciones para construir y mantener las estructuras y funciones de los organismos vivos; en palabras más
técnicas, especifica todos los procesos necesarios para que una célula desarrolle todas las características
fisiológicas y morfológicas de la especie y llegue a convertirse en un adulto.
Los ácidos nucleicos son macromoléculas, es decir, moléculas muy grandes que están formadas por la unión de
muchas unidades más pequeñas llamadas nucleótidos. Podemos imaginar a los ácidos nucleicos como una cadena,
en donde cada uno de los eslabones es un nucleótido. Cada uno de los nucleótidos está compuesto por tres partes:
una pentosa (un tipo de azúcar particular con 5 átomos de carbono, por eso el nombre de pentosa); una base
nitrogenada y un grupo fosfato.
Tipos
Los ácidos nucleicos constituyen el material genético de los organismos y son necesarios para el almacenamiento y
la expresión de la información genética.
Existen dos tipos de ácidos nucleicos química y estructuralmente distintos: el ácido desoxirribonucleico (ADN) y
el ácido ribonucleico (ARN); ambos se encuentran en todas las células procariotas, eucariotas y virus. El ADN
funciona como el almacén de la información genética y se localiza en los cromosomas del núcleo, las mitocondrias
y los cloroplastos de las células eucariotas. El ARN interviene en la transferencia de la información contenida en el
ADN hacia los compartimientos celulares. Se encuentra en el núcleo, el citoplasma, la matriz mitocondrial y el
estroma de cloroplastos de células eucariotas.
El ADN
Significado de las siglas ADN
Acido desoxirribonucleico
Composición química
La información en el ADN se almacena como un código compuesto por cuatro bases químicas, adenina (A),
guanina (G), citosina (C) y timina (T). El orden o secuencia de estas bases determina la información disponible
para construir y mantener un organismo, similar a la forma en que las letras del alfabeto aparecen en un cierto
orden para formar palabras y oraciones.
Las bases de ADN se emparejan entre sí, adenina (A) con timina (T) y citosina (C) con guanina (G); para formar
unidades llamadas pares de bases. Cada base también está unida a una molécula de azúcar y una molécula de
fosfato. Juntos (una base, un azúcar y un fosfato) se llaman nucleótidos. Los nucleótidos están dispuestos en dos
hebras largas que forman una espiral llamada doble hélice. La estructura de la doble hélice es algo parecido a una
escalera, los pares de bases forman los peldaños de la escalera y las moléculas de azúcar y fosfato son sus
pasamanos.
Ubicación celular
El ADN lo encontraremos en dos lugares dentro de cada célula: en mayor medida, en el núcleo de la célula
(concretamente, en los cromosomas) y en una menor medida, en las mitocondrias.
De ahí los términos ADN nuclear y ADN mitocondrial, respectivamente.
Función celular
La función principal de la molécula de ADN es el almacenamiento a largo plazo de información para construir
otros componentes de las células, como las proteínas y las moléculas de ARN. Los segmentos de ADN que llevan
esta información genética son llamados genes, pero las otras secuencias de ADN tienen propósitos estructurales o
toman parte en la regulación del uso de esta información genética.
Estructura:
Doble hélice
es un término que se usa para describir la estructura física del ADN. Una molécula de ADN está compuesta por
dos cadenas complementarias que se enrollan entre sí y parecen una escalera de caracol con forma de hélice.
Cada hebra tiene una estructura principal compuesta por grupos alternados de azúcar (desoxirribosa) y fosfato.
Unida a cada azúcar hay una de cuatro bases: adenina (A), citosina (C), guanina (G) o timina (T). Las dos
hebras se conectan por enlaces químicos entre las bases: enlaces de adenina con timina y enlaces de citosina
con guanina.
En su modelo de doble hélice, situaron el esqueleto de azúcares y fosfatos en la parte exterior de la molécula y
las bases nitrogenadas dirigidas hacia el interior de tal manera que las dos cadenas polinucleotídicas
permanecen unidas mediante puentes de hidrógeno entre las parejas de bases. Situando las dos cadenas en fase,
como sugería el patrón regular de difracción de rayos X, observaron que la estructura solo podía ser estable si
la disposición de estas es antiparalela, entendiendo como tal que presentan orientaciones opuestas (3’ a 5’ y 5’
a 3’ respectivamente). En esta disposición, las adeninas pueden establecer dos puentes de hidrógeno con las
timinas, mientras que las guaninas pueden establecer tres enlaces con las citosinas. Estos enlaces no covalentes
ayudan a estabilizar la molécula y explican las propiedades físicas del ADN. Además, las dos cadenas no
pueden separarse si no se rompen previamente, lo que se conoce como enrollamiento plectonémico
¿Qué implica la desnaturalización del ADN?
Si una disolución de ADN se calienta suficientemente ambas cadenas se separan, pues se rompen los enlaces
de hidrógeno que unen las bases, y el ADN se desnaturaliza. La temperatura de desnaturalización depende de
la proporción de bases. A mayor proporción de C-G, mayor temperatura de desnaturalización, pues la citosina
y la guanina establecen tres puentes de hidrógeno, mientras que la adenina y la timina sólo dos y, por lo tanto,
a mayor proporción de C-G, más puentes de hidrógeno unirán ambas cadenas. La desnaturalización se produce
también variando el pH o a concentraciones salinas elevadas. Si se restablecen las condiciones, el ADN se
renaturaliza y ambas cadenas se unen de nuevo.
El calentamiento del ADN en ciertos medios iónicos produce la ruptura de los enlaces de hidrógeno entre las
dos cadenas de la doble hélice. En este proceso llamado desnaturalización o fusión la doble cadena de ADN se
separa en dos cadenas complementarias sencillas. Esto genera un incremento en la absorción ultravioleta y una
disminución de la capacidad de rotación óptica y de la viscosidad de la solución.
La desnaturalización térmica del ADN es un proceso reversible. Si ha sido solo parcial, cada molécula puede
renaturalizame mediante una reacción rápida cuando disminuye la temperatura. Si el ADN se encuentra
completamente desnaturalizado, las dos cadenas complementarias pueden reasociarse por un proceso lento.
La desnaturalización puede producirse también mediante tratamientos químicos.
La síntesis de las cadenas de ADN durante la replicación se lleva a cabo en dirección 5’ → 3’ tanto en eucariotes
como en procariotes. Solamente el carbono de la posición 3’ de la pentosa posee un radical hidroxilo (OH) libre,
con el que puede formar un nuevo enlace fosfodiéster con otro desoxirribonucleótido y formar así la hebra
creciente de ADN; por esta razón, la cadena de ADN sólo puede crecer en dirección 3’. A este proceso se le llama
polimerización, que consiste en la unión de un dNTP (desoxirribonucleótido) complementario a la hebra molde
según la Ley de Chargaff
El ARN
Significado de las siglas ARN
Acido Ribonucleico
Composición química
Monocatenario. Los ácidos ribonucléicos (ARN) están formados por ribonucléotidos (nucleótido de ribosa), sus
bases nitrogenadas son adenina, guanina, citosina y uracilo, compuesto este último que sustituye a la timina del
ADN.
Estos ribonucléotidos se unen entre sí mediante enlaces fosfodiéster en sentido 5 → 3, al igual que el ADN. A
diferencia del ADN, el ARN es casi siempre monocatenario (excepto en los reovirus donde es bicatenario).
Poseen, no obstante, zonas con estructura de doble hélice, denominadas horquillas. Cuando las zonas
complementarias están separadas por regiones no complementarias se forman lazos o bucles.
El ARN mensajero o ARNm es el ácido ribonucleico que transfiere el código genético procedente del ADN del
núcleo celular a un ribosoma en el citoplasma, es decir, el que determina el orden en que se unirán los aminoácidos
de una proteína y actúa como plantilla o patrón para la síntesis de dicha proteína.
*Los ARN de transferencia o ARNt son moléculas que actúan como portadores temporales de aminoácidos,
llevando los aminoácidos apropiados al ribosoma basándose en la secuencia de nucleótidos del ARN mensajero
(ARNm). De esta forma, actúan como intermediarios entre las secuencias de nucleótidos y aminoácidos.
Los ARNt son ácidos ribonucleicos y, por lo tanto, son capaces de formar enlaces de hidrógeno con el ARNm.
Además, también pueden formar enlaces éster con aminoácidos y, por lo tanto, pueden unir físicamente el ARNm
y los aminoácidos durante el proceso de traducción. Se emparejan con el ARNm de manera complementaria y
antiparalela, y cada ARNt puede emparejarse con un tramo de tres nucleótidos en el ARNm. Estos conjuntos de
tres nucleótidos en el ARNm se denominan codones y la secuencia correspondiente en el ARNt se llama anticodón.
El apareamiento de bases entre el codón y el anticodón aporta especificidad al proceso de traducción. En un
extremo del ARNt, se une un aminoácido apropiado a su grupo hidroxilo 3 ‘basado en el anticodón y el ribosoma
cataliza la formación de un enlace peptídico entre este aminoácido y la cadena polipeptídica alargada.*
Este tipo de ARN tiene como labor “traducir” los mensajes que envía el ADN a las células. Los mensajes del ADN
consisten en secuencias de nucleótidos que las células no son capaces de entender. Para que puedan comprender
los mensajes que el ADN ha enviado el ARN ribosomal transforma las secuencias de nucleótidos en secuencias de
aminoácidos. Para que este proceso sea posible el ARN ribosomal utiliza ribosomas que contiene la célula.
La traducción es el segundo proceso de la síntesis proteica (parte del proceso general de la expresión génica) que
ocurre en todos los seres vivos. Se produce en el citoplasma, donde se encuentran los ribosomas; en la célula
eucariota ocurre también en el retículo endoplasmático rugoso (RER), y las mitocondrias tienen su propio proceso
de traducción. Los ribosomas están formados por una subunidad pequeña y una grande, que rodean al ARN. En la
traducción, el ARN mensajero se decodifica para generar una cadena específica de aminoácidos, llamada
polipéptido (el producto de la traducción), de acuerdo con las reglas especificadas por el código genético. Es el
proceso que convierte una secuencia de ARN mensajero en una cadena de aminoácidos para formar una proteína.1
Es necesario que la traducción venga precedida de un primer proceso de transcripción. Las fases de la traducción
son tres: iniciación, elongación y terminación,2 durante los cuales se va dando el crecimiento del polipéptido.
La síntesis de proteínas: describir brevemente en qué consisten las tres las tres fases. Importancia de ese
proceso.
La síntesis de proteínas es el proceso de construcción de las proteínas en las células a partir de los
aminoácidos. Las proteínas son importantes para el funcionamiento de la célula, por lo que son esenciales para
todos los seres vivos.
La síntesis de las proteínas consiste en la traducción del ARN mensajero (ARNm) que se produjo a partir del
ADN. De esta forma, la información genética en el ADN se transforma en proteínas, que son las encargadas
de llevar a cabo las actividades celulares.
El organelo encargado de la síntesis de proteínas es el ribosoma. Aquí también participan el ARNm, el ARN
de transferencia (ARNt), los aminoácidos y algunas proteínas asistentes.
La síntesis de proteínas es un proceso anabólico, es decir, se construye una macromolécula a partir de
unidades más pequeñas. Así, los aminoácidos son las unidades que se ligan para formar la proteína. Por
ejemplo, el colágeno es una proteína con más de 4000 aminoácidos.
Tanto en las células eucariotas (animales, plantas, hongos y protozoarios) como en las células procariotas
(bacterias y arqueas) se sintetizan proteínas. Sin embargo, existen algunas diferencias que han permitido crear
antibióticos para eliminar las bacterias.
Por ejemplo, los aminoglicósidos (gentamicina, amikacina y estreptomicina) y los macrólidos (eritromicina y
azitromicina) se unen a los ribosomas bacterianos, impidiendo la síntesis de proteínas en las bacterias,
causando su destrucción.
El proceso de producción de proteínas es importante para la creación de nuevo tejido o su reparación. Por lo
tanto, un problema en su producción puede significar la aparición de enfermedades.
Etapas de la síntesis de proteínas. Durante la síntesis de proteínas, la secuencia del ARNm se traduce en una
secuencia de aminoácidos. La síntesis proteica es un proceso cíclico que se puede dividir en tres etapas o
fases: iniciación, elongación y terminación.
Iniciación
La iniciación consiste de identificar el sitio exacto en la secuencia de nucleótidos en un ARNm para empezar
la traducción. La lectura del ARNm se hace cada tres nucleótidos (codón), es decir, que tres nucleótidos del
ARNm corresponden a un aminoácido.
El inicio de la síntesis de proteínas comienza con el ensamble del ribosoma sobre el ARNm en el codón AUG
que especifica el aminoácido metionina, el primer aminoácido de la proteína.
El ARN de transferencia (ARNt) unido a la metionina se aparea con el AUG del ARNm en el sitio P
ribosomal (centro de Péptido).
Elongación
La elongación de las proteínas consiste de la adición continua de aminoácidos para la producción de una
proteína. Esta asegura que el ribosoma se mueva a lo largo del ARNm “leyendo” grupos de tres nucleótidos
que especifican cada aminoácido, haciendo crecer la cadena de aminoácidos.
En el sitio A ribosomal (centro aceptor de nuevos ARNt unidos a aminoácidos) se incorpora el ARNt con el
siguiente aminoácido y una molécula energética (GTP). En el ribosoma existe la enzima que une el
aminoácido en el sitio A con el aminoácido en el sitio P. El ARNt en el sitio P queda libre de aminoácido y se
mueve al sitio E (por exit, salida en inglés) desde donde sale del ribosoma.
Ahora el sitio P queda libre y el ARNt-péptido del sitio A se mueve al sitio P, dejando libre el sitio A. Esto se
repite hasta llegar al codón de parada en el ARNm.
NUCLEÓTIDOS NO NUCLEICOS
No forman parte de los ácidos nucleicos, se encuentran libres en las células e intervienen en el metabolismo y en su
regulación de enzimas, aportando energía química en las reacciones celulares, como coenzimas o como intermediarios
activos en la síntesis de biomoléculas.
Significado de las siglas NAD, NADP, FAD y ATP
NAD: Nicotinamida Adenina Dinucleótido
NADP: Nicotinamida Adenina Dinucleótido Fosfato
FAD: Flavina Adenina Dinucleótido
ATP: Adenosin Trifosfato
NADP: La nicotinamida adenina dinucleótido fosfato (abreviada NADP+ en su forma oxidada y NADPH+H+ en
su forma reducida) es una coenzima que interviene en numerosas vías anabólicas. Su estructura química contiene la
vitamina B3 y es además análogo de la nicotinamida adenina dinucleótido (NADH+H+; NAD+ en su forma
oxidada). Su fórmula empírica es C21H29N7O17P3.
El NADPH+H+ proporciona parte del poder reductor necesario para las reacciones de reducción de la biosíntesis.
Interviene en la fase oscura de la fotosíntesis (ciclo de Calvin), en la que se fija el dióxido de carbono (CO2); el
NADPH+H+ se genera durante la fase luminosa.
Este cofactor es esencial tanto en reacciones anabólicas como catabólicas. Las rutas catabólicas suministran
energía química en forma de ATP, NADH+H+, NADPH+H+ y FADH2. Estos transportadores de energía se
utilizan en las rutas anabólicas para convertir moléculas precursoras pequeñas en macromoléculas celulares. En los
procesos anabólicos actúa como cofactor de las reductasas.
En los animales, la mayor fuente de NADPH+H+ es la fase oxidativa de la ruta de la pentosa fosfato, que produce
60% de los requerimientos de la célula.
FAD: El flavín adenín dinucleótido o dinucleótido de flavina y adenina (abreviado FAD en su forma oxidada y
FADH2 en su forma reducida) es una coenzima que interviene en las reacciones metabólicas de oxidación-
reducción.
El FAD es una molécula compuesta por una unidad de riboflavina (vitamina B2), unida a un pirofosfato (PPi), este
unido a una ribosa y ésta unida a una adenina. Por tanto, la molécula es en realidad ADP unido a riboflavina; o
también AMP unido a la coenzima Flavín mononucleótido o FNDH2.
El FAD es una coenzima que interviene como dador o aceptor de electrones y protones (poder reductor) en
reacciones metabólicas redox; su estado oxidado (FAD) se reduce a FADH2 al aceptar dos átomos de hidrógeno
(cada uno formado por un electrón y un protón). Por tanto, al reducirse capta dos protones y dos electrones, lo que
lo capacita para intervenir como dador de energía o de poder reductor en el metabolismo. Por ejemplo, el FAD (y
también el NAD) se reduce en el ciclo de Krebs y se oxida en la cadena respiratoria (respiración aeróbica).
La función bioquímica general del FAD es oxidar los alcanos a alquenos, mientras que el NAD+ (un coenzima con
similar función) oxida los alcoholes a aldehídos o cetonas. Esto es debido a que la oxidación de un alcano (como el
succinato) a un alqueno (como el fumarato) es suficientemente exergónica como para reducir el FAD a FADH2,
pero no para reducir el NAD+ a NADH.
Coenzima A: La coenzima A (CoA, CoASH o HSCoA) es una coenzima, notable por su papel en la biosíntesis y
la oxidación de ácidos grasos, así como en la descarboxilación oxidativa del ácido pirúvico, paso previo al ciclo de
Krebs. Su molécula consta de ácido pantoténico (vitamina B5), adenosín difosfato y cisteamina.
La coenzima A está formada por la unión de las siguientes moléculas: ribosa - 3 - fosfato, adenina, dos ácido
fosfórico, ácido pantoténico, y b - mercapto - etil - amina.
La función de la coenzima A es la de servir como transportador de grupos acilo en varias reacciones enzimáticas.
Puesto que la coenzima A es químicamente un tiol, puede reaccionar con los ácidos carboxílicos para formar
tioésteres, de modo que actúa como un portador del grupo acilo. Cuando una molécula de coenzima A lleva un
grupo acetilo se denomina acetil-CoA, que es un importante elemento común para muchas rutas del metabolismo
de todas las células.
NAD (
El estudiante tiene la responsabilidad de investigar, estudiar y aprender los temas anteriormente citados, para luego
defenderlos en una prueba corta que cuya fecha le será notificada por su docente. Previo a esa evaluación tendrán
derecho a realizar consultas individuales a su docente de teoría.