Biología 3

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Semana 1 - TÉCNICAS EN BIOLOGÍA MOLECULAR Y CELULAR

LA CÉLULA Unidad básica de la vida.

EL MICROSCOPIO Cualquiera de los distintos tipos de instrumentos que se utilizan para


obtener una imagen aumentada de objetos minúsculos o detalles muy pequeños de los
mismos. Instrumento que se utiliza para obtener una imagen aumentada de objetos
minúsculos o detalles muy pequeños de los mismos.

HISTORIA

 1590. Primer microscopio fue desarrollado por Zacarías Janssen y su sobrino H.


Janssen.
 1665. Robert Hooke, observó las primeras células por medio de microscopios
inventados por él.
 1670. Antonie Van Leeuwenhoek, sus microscopios permitieron ver el interior de
las células. (Padre de la Microscopía óptica)
 1839. Theodor Schwan y Mathias Schleiden. Teoría Celular.
 1930. Se desarrolló el microscopio electrónico.

TIPOS DE MICROSCOPIOS

1. MICROSCOPIO ÓPTICO. Su fuente de iluminación es luz visible y su sistema de


lentes es una serie de lentes de vidrio.
2. MICROSCOPIO ELECTRÓNICO. Su fuente de iluminación es un haz de
electrones emitidos por un filamento de tungsteno calentado y el sistema de lentes
consiste en series de electroimanes.

LA CONFERENCIA DE ASILOMAR La Conferencia de Asilomar sobre ADN


recombinante fue una conferencia influyente organizada por Paul Berg para discutir los
posibles riesgos biológicos y la regulación de la biotecnología, celebrada en febrero de
1975 en un centro de conferencias en Asilomar State Beach.

EL MICROSCOPIO ÓPTICO

Es el objeto que permitió a los biólogos descubrir la existencia misma de las células y
proporcionar el punto de partida para toda la información que ha surgido. Los
microscopios son instrumentos que producen una imagen ampliada de un objeto.

Funciona a base luz, natural o artificial, de una longitud de onda de 400 a 700
nanómetros. Tiene la capacidad de aumentar de 500 a 1,000 veces (X) el tamaño de los
objetos.
Los intentos de ampliar la imagen más allá de este punto, produce una ampliación vacía.

COMPUESTOS MÁS IMPORTANTES DE UN MICROSCOPIO ÓPTICO

1. Una fuente de luz. Que puede ser externa al microscopio o incorporada a su base
que ilumina la muestra.
2. Los lentes. Se cuenta con el lente condensador y los lentes objetivos y el lente
ocular.

La ampliación total obtenida por el microscopio es el producto de los aumentos


producidos por el lente objetivo y el lente ocular.

RESOLUCIÓN

 Es la medida en que los detalles de la muestra se conservan en la imagen.


 La resolución alcanzada por un microscopio está limitada por la difracción.
 El poder de resolución de un microscopio se puede definir en términos de la
capacidad de ver dos puntos vecinos en el campo visual como dos entidades
distintas.
 El poder de resolución de un microscopio está limitado por la longitud de onda de
la iluminación.
 El límite de resolución del microscopio óptico convencional es de
aproximadamente 0.2 um (200 nm), suficiente para ver organelos grandes como
mitocondrias y núcleo.
 Además de los factores teóricos, la capacidad de resolución también se ve
afectada por fallos o aberraciones. Se pueden encontrar 7 importantes.

VISIBILIDAD Además de la resolución se encuentra la visibilidad que se refiere a los


factores que permiten que un objeto sea realmente observado. Otro término importantes
es el contraste, o la diferencia de aspecto entre las partes adyacentes de un objeto o
entre otro objeto y su fondo. Por eso la importancia de la tinción de las muestras. Ejemplo:
tinción de Feulgen, para ADN. No se usa con células vivas.

CLASES DE MICROSCOPIOS ÓPTICOS

 Microscopio de campo brillante


 Microscopio de Contraste de fases.
 Microscopio de contraste de interferencia diferencial (DIC)
 Microscopio de fluorescencia.
 Microscopía confocal de escaneo láser
MICROSCOPÍA DE CAMPO BRILLANTE Y DE CONTRASTE DE FASE

Microscopio óptico de campo brillante.

1. Una fijación entera: es un objeto intacto, vivo o muerto, que puede consistir en un
organismo entero.
2. Secciones: primero se deben morir las células sumergiéndolas en una solución
química llamada: fijador. (formaldehído, alcohol o ácido acético), luego se
deshidrata y se le agrega cera.

Microscopio óptico de contraste de fase.

 Es un tipo de microscopio de interferencia.


 Pueden observarse objetos altamente transparentes
 Pueden observarse células vivas a una resolución extraordinariamente alta.
 Sus desventajas son: al haber cambios bruscos en el índice de refracción la
resolución disminuye y la imagen sufre halos y sombreados.

MICROSCOPÍA DE FLUORESCENCIA

 Esta técnica permite la visualización de células vivas.


 Se observa la ubicación de fluoróforos que son moléculas que absorben fotones
de una longitud de onda específica y liberan energía en longitudes de ondas más
largas, fenómeno llamado: fluorescencia.
 La rodamina o fluoresceína se utiliza en la inmunofluorescencia.

TIPOS

 Microscopía confocal de escaneo láser. Se agrega el uso de cámaras digitales


y el procesamiento de las imágenes en las computadores. Produce una imagen
de un plano delgado situado dentro de un espécimen mucho más grueso.
 Microscopía de fluorescencia de super resolución. Su resolución puede
alcanzar hasta 20 nm.
 Microscopía de fluorescencia mediante hoja de luz. Permite la obtención de
imágenes no invasivas de muestras tridimensionales grandes como embriones y
peces. Utiliza una hoja de luz de celosía. Se obtienen imágenes 3D.

MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE TRANSMISIÓN

Estos microscopios consisten en una columna cilíndrica y hueca a través de la cual pasa
el haz de electrones y una consola que contiene un panel de cuadrantes que controlan
electrónicamente la operación en la columna.
Funciona a base de electrones, que tienen una longitud de onda mucho menor que la luz
visible del sol.

La longitud de onda de los electrones es de 0.05 angstron. Alrededor de 100,000 veces


más corta que la longitud de onda de la luz visible

TIPOS

 Microscopía electrónica de transmisión: forman imágenes que usan electrones


que transmiten a través de una muestra. Brinda una resolución mucho mayor que
el MO. Su límite práctico de resolución es de 3 a 5 A° , su límite real es de 10 a
15 A°
 Microscopía electrónica de barrido. Utiliza electrones que rebotan en la
superficie de la muestras.

PREPARACIÓN DE LAS MUESTRAS PARA MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA

 Criofijación y el uso de muestras congeladas.


 Tinción negativa
 Proyección de sombras
 Replicación por congelación y fractura y grabado por congelación.

Semana 2 - ESTRUCTURA DE LA CÉLULA


El descubrimiento de las células generalmente se atribuye a Robert Hooke, un
microscopista inglés que, a los 27 años, recibió el puesto de conservador de la Royal
Society of London, la principal academia científica de Inglaterra.

Microscopio de un solo lente utilizado por Antonie van Leeuwenhoek para observar
bacterias y otros microorganismos. La lente biconvexa, que era capaz de aumentar un
objeto aproximadamente 270 veces y proporcionar una resolución de alrededor de 1.35
μm, se sostenía entre dos placas de metal

Hooke llamó a los poros células, porque le recordaban las celdas habitadas por los
monjes que vivían en un monasterio. De hecho, Hooke había observado las paredes
celulares vacías del tejido vegetal muerto, paredes que originalmente habían sido
producidas por las células vivas que las rodeaban.

Leeuwenhoek fue el primero en examinar una gota de agua estancada bajo el


microscopio y, para su asombro, observó los “animálculos” microscópicos que iban y
venían de un lado a otro ante sus ojos. También fue el primero en describir diversas
formas de bacterias, las cuales obtuvo del agua en la que había remojado pimienta y del
raspado de sus dientes.

En 1674 el comerciante holandés Antón Van Leeuwenhoek, aficionado naturalista se


dedicó a construir y perfeccionar microscopios simples, lo que le permitió observar
organismos microscópicos en las aguas de las charcas y en los fluidos corporales de los
animales. Vio por primera vez los glóbulos rojos de la sangre, observó los protozoos y
otros organismos microscópicos a los que llamo "animálculos" y que hoy conocemos
como microorganismos. Además, observó diversas células eucariotas (como protozoos
y espermatozoides) y procariotas (bacterias).

En 1838, Matthias Schleiden, un abogado alemán convertido en botánico, concluyó


que, a pesar de las diferencias en la estructura de varios tejidos, las plantas estaban
hechas de células, y que el embrión de la planta surgía de una sola célula.

En 1839, Theodor Schwann, un zoólogo alemán y colega de Schleiden, publicó un


informe exhaustivo sobre la base celular de la vida animal. Schwann concluyó que las
células de las plantas y los animales son estructuras similares, y propuso estos dos
principios de la teoría celular:

1. Todos los organismos están compuestos por una o más células.


2. La célula es la unidad estructural de la vida.

1855, Rudolf Virchow, un patólogo alemán, había hecho un caso convincente para el
tercer principio de la teoría celular:

 Las células pueden surgir únicamente por la división de una célula preexistente

RUDOLF WIRCHOW (1821-1902) QUIEN APORTA SU PRINCIPIO: "OMNIS CELLULA


E CELLULA"

3. TODA CÉLULA PROCEDE DE OTRA CÉLULA.

PROPIEDADES BÁSICAS DE LAS CÉLULAS Así como las plantas y los animales
están vivos, también lo están las células. La vida, de hecho, es la propiedad básica de
las células, y las células son las unidades más pequeñas que exhiben esta propiedad. A
diferencia de las partes de una célula, que simplemente se deterioran si están aisladas,
las células completas se pueden sacar de una planta o animal y cultivarse en un
laboratorio, donde crecerán y se reproducirán durante largos periodos. Si son
maltratadas pueden morir. La muerte también se puede considerar una de las
propiedades más básicas de la vida, porque solo una entidad viviente enfrenta esta
circunstancia
Propiedades de la célula

 Las células son altamente complejas y organizadas


 Las células poseen un programa genético y los medios para usarlo
 Las células son capaces de producir más de sí mismas
 Las células adquieren y utilizan energía
 Las células llevan a cabo una variedad de reacciones químicas
 Las células participan en actividades mecánicas
 Las células son capaces de responder a los estímulos Las células son capaces
de autorregularse
 Las células evolucionan

CÉLULAS PROCARIOTAS Y EUCARIOTAS

Se distinguen por su tamaño y por los tipos de estructuras internas u organelos que
contienen.

Las células procariotas, más simples estructuralmente, incluyen a bacterias.

Las células eucariotas, estructuralmente más complejas, incluyen: protistas hongos


plantas animales

Características que tienen en común los dos tipos de células:

 Membrana plasmática de construcción similar


 Información genética codificada en DNA utilizando un código genético idéntico.
 Mecanismos semejantes para la transcripción y traducción de información
genética, incluyendo ribosomas similares.
 Vías metabólicas compartidas (p. ej., glucólisis y ciclo de TCA).
 Un aparato similar para la conservación de energía química como ATP (ubicado
en la membrana plasmática de las procariotas y en la membrana mitocondrial de
las eucariotas).
 Mecanismo similar de fotosíntesis (entre cianobacterias y plantas verdes).
 Mecanismo similar para sintetizar e insertar proteínas de membrana.
 Proteasomas (estructuras de digestión de proteínas) de construcción similar
(entre arqueobacterias y eucariotas).
 Filamentos del citoesqueleto construidos con proteínas similares a la actina y la
tubulina. Características de las células eucariotas que no se encuentran en las
procariotas:
Características de las células eucariotas que no se encuentran en las procariotas:

 División de las células en núcleo y citoplasma, separados por una envoltura


nuclear que contiene complejas estructuras de poros.
 Cromosomas complejos compuestos por DNA y proteínas asociadas que son
capaces de compactarse en estructuras mitóticas.
 Organelos citoplasmáticos membranosos complejos (incluyen retículo
endoplasmático, complejo de Golgi, lisosomas, endosomas, peroxisomas y
glioxisomas)
 Organelos citoplasmáticos especializados para la respiración aeróbica
(mitocondrias) y la fotosíntesis (cloroplastos).
 Sistema citoesquelético complejo (que incluye los filamentos de actina, filamentos
intermedios y microtúbulos) y proteínas motoras asociadas.
 Flagelos complejos y cilios
 Capacidad de ingerir material particulado por envoltura dentro de vesículas de la
membrana plasmática (fagocitosis).
 Paredes celulares que contienen celulosa (en plantas).
 División celular usando un microtúbulo que contiene un huso mitótico que separa
los cromosomas.
 Presencia de dos copias de genes por célula (diploidía), una de cada padre
 Presencia de tres enzimas sintetizadoras de RNA diferentes (RNA polimerasas).
 Reproducción sexual que requiere meiosis y fecundación.

Los procariotas fueron la única forma de vida en la Tierra durante millones de años
hasta que las células eucariotas más complicadas llegaron a ser a través del
proceso de la evolución.

PROCARIOTA ------EUCARIOTA

 LAS procariotas no poseen sistemas de endomembranas (carioteca, retículo


endoplasmático rugoso y liso, Aparato de Golgi),
 sí están presentes en células eucariotas.
 ADN de las células procariotas es desnudo o libre (no Histónico) está
representado por una sola molécula de ADN compactada y plegada unida por uno
de sus extremos al lado interno de la membrana plasmática, las eucariotas
presentan múltiples moléculas de ADN asociados a la Histonas (proteínas
nucleares) formando un complejo de nucleoproteínas llamada Cromatina.
 Las células procariotas se dividen por amitosis o división simple, Las eucariotas
se dividen por mitosis y meiosis
 La amitosis o fisión binaria consiste en los siguientes eventos: Replicación del
ADN (1 nucleoide --> 2 nucleoides)
 Elongación celular (que separa ambos nuceloides)
 Formación de un tabique en la parte media de la célula

El único organelo no membranoso que comparten ambas células son los


ribosomas.

PROCARIOTA VRS EUCARIOTA

La principal diferencia entre una célula procariota y una eucariota es que las procariotas
(Pro=falso, Carion=núcleo) no presentan una verdadera organización nuclear, es decir,
no presentan un núcleo membranoso

Como las eucariotas (EU=VERDADERO, CARION =NÚCLEO)

Procariotas presentan pared celular no celulósica, constituída químicamente por ácidos


orgánicos que la propia bacteria elabora,

Las eucariotas presentan pared celular celulósica solo en los vegetales, ya que las
eucariotas animales poseen membrana celular.

Los mecanismos de endocitosis y exocitosis son propios de las eucariotas, están


ausentes en procariotas.

A pesar de estar constituido por 2 cadenas de nucleótidos, en las procariotas el ADN


tiene la forma de un círculo cerrado (replicación bidireccional), en cambio, en las
eucariotas el ADN presenta la forma de una hélice doble (forma helicoidal).

EUCARIOTAS: son organismos cuyas células están organizadas en estructuras


complejas por membranas internas y un citoesqueleto. La estructura más característica
de la membrana es el núcleo. Esta característica les da su nombre, (también deletreado
“eucaryote”) que viene del griego ευ, que significa bueno / verdadero, y κάρυον, que
significa nuez, refiriéndose al núcleo. Los animales, plantas, hongos y protistas son
eucariotas.

Las células madre embrionarias humanas (ESC) son células pluripotentes, lo que
significa que pueden fabricar cualquier otra célula del cuerpo. Están formadas a partir de
blastocistos, células encontradas en embriones humanos en sus primeras fases de
desarrollo

Las células madre del cordón umbilical se han utilizado para tratar cerca de 80
enfermedades, entre ellas numerosos tipos de tumores, anemias, trastornos metabólicos
congénitos y deficiencias del sistema inmunológico.
VIRUS

Todos los virus son parásitos intracelulares obligatorios; es decir, no pueden reproducirse
a menos que estén presentes dentro de una célula anfitriona. Dependiendo del virus
específico, el huésped puede ser una planta, un animal o una célula bacteriana.

Los virus son responsables de docenas de enfermedades humanas, como el sida, la


polio, la gripe, el ébola, el sarampión y algunos tipos de cáncer. Los virus se presentan
en una amplia variedad de formas, tamaños y construcciones muy diferentes, pero todos
comparten ciertas propiedades comunes.

VIRUS COMPLEJOS

Los virus complejos poseen una cápside que no es estrictamente helicoidal ni icosaédrica
y pueden tener más estructuras, tales como colas proteicas o una pared exterior
compleja. Las subunidades proteícas del virus se autoensamblaran a una cáspide, pero
el ADN de los virus complejos también codifica proteínas que ayudan a construir la
cáspide del virus. Muchos virus fago tienen forma compleja; poseen una cabeza
icosaédrica unida a una cola helicoidal. La cola puede tener una placa basal con fibras
de cola hechas de proteína. Algunos virus complejos no poseen fibras de cola.

VIRUS

Los virus carecen de membranas propias, de ribosomas sobre los cuales elaborar
proteínas, de citoplasma y de fuente de energía. No se mueven ni crecen por sí solos y
se reproducen únicamente en el interior de una célula huésped

La simplicidad de los virus hace imposible considerarlos como células. Un virus consiste
en una molécula de ADN o ARN, envuelta en una cubierta frecuentemente proteínica

Consta de dos partes: una molécula de material hereditario y una capa de proteína que
envuelve esa molécula.

La capa de proteína puede estar rodeada de una envoltura formada a partir de la


membrana plasmática de la célula huésped.

La cubierta proteínica de los virus, está especializada para permitir al virus penetrar en
las células de un huésped específico

Una vez que el virus ha entrado en la célula huésped, el material genético viral toma el
mando. La célula secuestrada es obligada a "leer" los genes virales y a utilizar las
instrucciones ahí codificadas para producir los componentes de nuevos virus. Las piezas
se ensamblan rápidamente, y un ejército de nuevos virus brota dispuesto a invadir y
conquistar las células vecinas.
Las infecciones virales causan enfermedades difíciles de tratar. Cada tipo de virus se
especializa en atacar a las células específicas del huésped. Hasta donde se sabe, ningún
organismo es inmune a algunos virus, incluso las bacterias sucumben víctimas de los
invasores virales; los virus que infectan bacterias se llaman bacteriófagos

La dificultad para atacar los virus que se "esconden" dentro de las células, se han
perfeccionado varios fármacos antivirales, muchos de éstos destruyen o bloquean el
funcionamiento de las enzimas que el virus en cuestión necesita para replicarse.

Las virtudes de los fármacos antivirales son limitadas, porque los virus adquieren
resistencia a los fármacos, debido a las altas tazas de mutación en los virus.

Los virus resistentes terminan por predominar y un fármaco antiviral que solía dar buenos
resultados pierde su eficacia.

VIROIDES Son simples cadenas cortas de ARN que carecen incluso de cubierta
proteínica. Al parecer los viroides penetran en el núcleo de la célula infectada, donde
dirigen la síntesis de más viroides.

PRIONES

PRION: Es una proteína mal plegada capaz de transmitir su forma mal plegada a otras
variedades de la misma proteína.

Los priones consisten en una única proteína que es producida por las células nerviosas
normales. Algunas copias de esta molécula proteínica normal, por razones que aún se
desconocen o no se comprenden bien, se pliegan de una forma errónea y de este modo
se transforman en priones infecciosos.

Con el tiempo, la concentración de priones en el tejido nervioso pueden llegar a ser lo


suficientemente grande para provocar daño y degeneración celulares. Otra peculiaridad
de las enfermedades priónicas es que pueden heredarse además de transmitirse por
infección.

Los priones son los responsables de las encefalopatías espongiformes transmisibles en


una variedad de mamíferos, incluida la encefalopatía espongiforme bovina (EEB,
también conocida como «enfermedad de las vacas locas») en el ganado y la enfermedad
de Creutzfeldt-Jakob (ECJ) en humanos.

Investigadores alemanes y suizos han descubierto que los priones, los agentes
infecciosos que inducen la enfermedad se transmiten por el aire

Los priones tienen la singular característica de carecer de material genético: se


componen exclusivamente de proteína priónica mutante, que actúa como una enzima
que cataliza la formación de más priones a partir de proteína priónica normal.
Semana 3 - LAS BASES QUÍMICAS DE LA VIDA
ORIGEN QUÍMICO DE LA VIDA

 Hace aproximadamente 4 600 millones de años se formó nuestro sistema solar


 Durante 1 000 millones de años la tierra fue un lugar tumultuoso con violentas
erupciones volcánicas.
 Se cree que la vida pudo a ver proliferado hace 3.5 000 millones de años
 Protocélulas (células antiguas) estaban formadas por Ácidos nucleicos (DNA o
RNA) y una membrana.
 1952 Harold Urey y Stanley Miller simularon la tierra primitiva. Luego de 2
semanas observaron la formación de compuestos orgánicos: aminoácidos y
azúcares.

Enlaces Covalentes

 Cuando las uniones atómicas de una molécula comparten electrones entre pares
de átomos.
 El número de enlaces que un átomo puede formar depende del número de
electrones necesarios para llenar su capa exterior.
 La formación de un enlace covalente se acompaña de la liberación de energía
 80 a 100 kilocalorías por mol se necesitan para dividir enlaces covalentes de C-
H, C-C o C-O.
 0.6 Kcal/mol es la energía térmica de una molécula.
 Esta es la razón por la que son estables estos enlaces en la mayoría de
condiciones.

Tipos

 Enlaces simples: Cuando comparte 1 par de electrones


 Enlaces doble: Cuando se comparten 2 pares de electrones
 Enlaces triple: Cuando se comparten 3 pares de electrones

Moléculas polares y no polares

Moléculas Polares: Moléculas con una distribución asimétrica de carga (dipolo):


Oxígeno (O) Nitrógeno (N) Azufre (S)

Moléculas no Polares: Carecen de átomos electronegativos y enlaces polarizados


Moléculas formadas solo por carbono (C) e hidrógeno (H)
Ionización:

Proceso mediante el cual un átomo cargado electronegativamente captura electrones de


otros átomos durante una reacción química.

El resultado genera la polarización positiva y negativa de los iones:

 Anión: carga negativa


 Catión: carga positiva

Radicales libres:

Átomos o moléculas inestables con orbitales que contienen un solo electrón no pareado.
Como: Peróxio de Hidrógeno, Radical Superóxido y Radical Hidroxilo, Son
extremadamente reactivos y capaces de alterar químicamente muchos tipos de
moléculas (proteínas, ácidos nucleicos y lípidos)

Enlaces no Covalentes

Son enlaces más débiles (1 a 5 kcal/mol) que no dependen de electrones compartidos.


Dependen de fuerzas atractivas entre átomos que tienen una carga opuesta.

Enlaces Iónicos: Se deben a la atracción electroestática de dos iones. Dentro de la


célula, su fuerza generalmente es débil (3 kcal/mol) por la presencia de agua en la
misma. En ausencia de agua, pueden ser más fuertes

Enlaces de hidrógeno: Se forma por el desplazamiento de electrones de hidrogeno


hacia un ion electronegativo (dentro de una unión covalente). El resultado hace que el
átomo de hidrogeno quede con una carga positiva parcial, esto hace que se pueda
acercar hacia un par cargado negativamente sin necesidad de compartir electrones.
Tienen una energía de aproximadamente 1 kcal/mol. Estos enlaces se rompen
fácilmente.

Interacciones hidrofóbicas y fuerzas de Van der Waals

 Moléculas Hidrofílicas: Alta afinidad al agua (azúcarea y aminoácidos)


 Moléculas Hidrófobas: Poca o escasa afinidad al agua, aquellas que no se
pueden mezclar en ella (grasas)
 Fuerza de Van der Waals: Fuerza de atraccióon débil (0.1 a 0.3 kcal/mol)
originada entre dos moléculas con dipolos transitorios

Propiedades del agua que mantiene la vida:

1. El agua es una molécula asimétrica


2. Cada uno de los dos enlaces covalentes en la molécula está altamente polarizado.
3. Las tres moléculas del agua son eficientes para formar enlaces de hidrógeno
4. Cada molécula de agua puede formar enlaces de hidrógeno con hasta cuatro
moléculas altamente interconectadas.
5. Biológicamente el agua es importante porque forma el 80 % de peso de la célula.
6. ADEMAS, es el solvente universal de la célula. Significa que en la célula todos los
componentes hidrofílicos se disuelven en el agua.

Solutos: sustancias disueltas dentro de un volumen acuoso.

Solvente: sustancia que permite la dispersión de otra sustancia en esta a nivel molecular
o iónico.

El agua no solo es un solvente, determina la estructura de las moléculas biológicas y los


tipos de interacciones en las que pueden participar.

Ácidos, bases y tampones

Ácido: Molécula capaz de liberar (donar) u ion de hidrógeno.

Base: Cualquier molécula que sea capaz de aceptar un protón.

La acidez de una solución se mide por la concentración de iones hidrógeno y se expresa


en pH

El pH sanguíneo normal es de 7.35 – 7.45 (7.4)

Tampones: Compuestos que reaccionan con hidrógeno libre o iones hidróxilo,


resistiendo así los cambios de pH.

La sangre está tamponada por ácido carbónico y por iones de bicarbonato.

La naturaleza de las moléculas biológicas

 La mayor parte de un organismo es agua.


 Compuestos Bioquímicos: Todos aquellos compuestos producidos por
organismos vivos.
 La química de la vida se centra en la química del átomo de carbono.

Grupos funcionales: Agrupaciones particulares de átomos que se comportan como una


unidad y dan a las moléculas orgánicas sus propiedades física, reactividad química y
solubilidad en solución acuosa. Entre estos están: • Metilo • Hidroxilo • Carboxilo •
Aminado • Fostato • Carbonilo • Sulfihidrilo
Clasificación de moléculas biológicas por función:

 Macromoléculas
 Bloques de construcción de las macromoléculas
 Intermediarios metabólicos (metabolitos)
 Moléculas de diversas funciones

Carbohidratos Llamados también glucanos. Comprenden desde moléculas simples


(monosacáridos) y las más grandes construidas con bloque de azúcar. Funciones
principales: Depósitos de energía química y Material de construcción duraderos para
la construcción biológica.

Fórmula química es (CH2O)n

Los azúcares más simples se llaman monosacáridos y se clasifican de acuerdo a su


cantidad de carbonos: 3 carbonos se llaman Triosas, 4 carbonos tetrosas, 5 carbonos
pentosas, 6 carbonos hexosas y 7 carbonos heptosas.

Estructura de los azúcares simples, son los que se denominan MONOSACÁRIDOS


Consiste en una columna central de átomos de carbono unidos entre sí en una serie
lineal por enlaces simples, si el monosácarido tiene 3 carbonos es un triosa, si tiene 5,
es una pentosa como la ribosa y la desoxirribosa del RN y ADN. Si tiene 6 carbonos es
una hexosa como la glucosa que es la principal molécula energética de la célula. Cada
átomo de carbono de la cadena principal está unida a un grupo hidroxilo (excepci{on de
uno que porta un grupo carnbonilo (C=O)

Estereoisomerismo

Se refiere a la disposición de los grupos hidroxilo alrededor de un átomo de carbono

1 átomo de carbono puede unirse con otros 4 átomos

 D: si el grupo hidroxilo se proyecta a la derecha


 L: si el grupo hidroxilo se proyecta a la izquierda
 Alfa piranosa: si el grupo hidroxilo se proyecta arriba del anillo
 Beta piranosa: si el grupo hidroxilo se proyecta debajo del anillo

Unión de los azúcares Se pueden unir mediante enlaces glucosídicos. Estos se forma
por reacción entre el átomo de carbono C1 de un azúcar y el grupo hidroxilo de otro
azúcar generando un enlace C-O-C entre dos azúcares

Las moléculas compuestas de solo dos unidades de azúcar simple o monosacáridos son
DISACARIDOS. Sirven como reservas de energía de fácil acceso
Los azúcares también se pueden unir para formar pequeñas cadenas llamadas
oligosacáridos. Cuando se unen a lípidos y proteínas formar glucolípidos y
glucoproteínas.

Polisacáridos: Polímero de unidades de azúcar unidas por enlaces glucosídicos.

Algunos polisacáridos forman materiales estructurales resistentes y duraderos

 Celulosa: Componente principal de las paredes celulares de las plantas. Material


resitenta a las fuerzas de tracción o tensión.
 Quitina: polímero no ramificado del azúcar n-acetilglucosamina. Material
estructural entre los invertebrados, particularmente en la cuierta exterior de
insectos, arañas y crustáceos. Material resistente, elástico y flexible.
 Glucosaminoglucanos (GAG): polisacáridos de estructuras complejas que
realizan distintas funciones dentro de los organismos.

LÍPIDOS

Son un grupo diverso de moléculas biológicas no polares cuyas propiedades comunes


son disolverse en solventes orgánicos y su incapacidad para disolverse en agua.

Lípidos de importancia en la función celular:

Grasas:

 Consisten en una moléculas de glicerol unida por enlaces éster a tres ácidos
grasos.
 La molécula completa se denomina Triglicérido.
 Se almacenan como fuente de energía en los adipocitos. (células del tejido
adiposo)
 Ácidos grasos: Cadenas de hidrocarburos largas no ramificadas con un grupo
carboxilo en un extremo. Son hidrofóbicas pero tienen un una región hidrofílica,
por eso se les llama afipáticas.
 Las grasas que son líquidas se denominan aceites,
 Son fuentes de energía a largo plazo para la célula.
 Son ricas en energía química.
 Almacenan energía a largo plazo.
 Son extremadamente insolubles en agua
 Se almacenan en los adipocitos.
Esteroides:

 Se construyen alrededor de un esqueleto de hidrocarburos de cuatro anillos.


 Uno de los más importantes es el colesterol (componente de las membranas de
las células animales y precursor de la síntesis de varias hormonas: sexuales y
hormonas esteroideas como los glucocorticoides. Están presentes en las
membranas celulares.

Fosfolípidos:

 Su estructura consta de glicerol, dos cadenas de ácidos grasos, un grupo fosfato


y un pequeño grupo polar (colina,inositol, serina y etanolamina)
 Biológicamente son importantes componentes de las membranas celulares.

Semana 4 - BASES QUÍMICAS DE LA VIDA.


Las proteínas son las macromoléculas que llevan a cabo prácticamente todas las
actividades de una célula; son las herramientas moleculares y las máquinas que hacen
que las cosas sucedan.

Cada proteína, sin embargo, tiene una estructura única у definida permite llevar a cabo
una función particular. Lo más importante es que las proteínas tienen formas y superficies
que les permiten interactuar selectivamente con otras moléculas. Las proteínas, en otras
palabras, exhiben un alto grado de especificidad.

ESTRUCTURA DE LOS AMINOÁCIDOS

 Las proteínas son polímeros hechos de monómeros de aminoácidos. Cada


proteína tiene una secuencia única de aminoácidos que le da a la molécula sus
propiedades únicas.
 Veinte aminoácidos diferentes se utilizan comúnmente en la construcción de
proteínas, ya sea de un virus o un ser humano.
 Hay que considerar dos aspectos de la estructura de los aminoácidos: el que es
común a todos ellos y el que es único para cada uno.
 Los aminoácidos también tienen átomos de carbono asimétricos. Con la
excepción de la glicina, el carbono a de los aminoácidos se une a cuatro grupos
diferentes, de modo que cada aminoácido puede existir tanto en forma de D o de
L
 Los aminoácidos también tienen átomos de carbono asimétricos. Con la
excepción de la glicina, el carbono a de los aminoácidos se une a cuatro grupos
diferentes, de modo que cada aminoácido puede existir tanto en forma de D o de
L
 Los aminoácidos utilizados en la síntesis de una proteína en un ribosoma son
siempre L-aminoácidos. La "selección" de L aminoácidos debe haber ocurrido
muy temprano en la evolución celular y se ha conservado durante miles de
millones de años. Los microorganismos, sin embargo, usan D-aminoácidos en la
síntesis de ciertos péptidos pequeños, que incluyen los de la pared celular y varios
antibióticos (p.ej., gramicidina A).
 Durante el proceso de síntesis de proteínas, cada aminoácido se une a otros dos
aminoácidos, formando un polímero largo, continuo y no ramificado llamado
cadena polipeptídica. Los aminoácidos que componen una cadena polipeptídica
se unen mediante enlaces peptídicos que resultan de la unión del grupo carboxilo
de un aminoácido al grupo amino de su vecino, con la eliminación de una molécula
de agua. Una cadena polipeptídica compuesta de una cadena de aminoácidos
unidos por enlaces peptídicos

ESTRUCTURA PRIMARIA Y SECUNDARIA DE PROTEÍNAS.

SE DESCRIBEN CUATRO NIVELES.

La primera, la estructura primaria, se refiere a la secuencia de aminoácidos de una


proteína, mientras que los últimos tres niveles se refieren a la organización de la molécula
en el espacio.

LA ESTRUCTURA PRIMARIA.

De un polipéptido es la secuencia lineal específica de aminoácidos que constituyen la


cadena. Con 20 bloques de construcción diferentes, la cantidad de polipéptidos
diferentes que se pueden formar es 2on, donde n es el número de aminoácidos en la
cadena. Debido a que la mayoría de los polipéptidos contienen más de 100 aminoácidos,
la variedad de secuencias posibles es esencialmente ilimitada. La información para el
orden preciso de aminoácidos en cada proteína que un organismo puede producir está
codificada dentro del genoma de ese organismo.

ESTRUCTURA SECUNDARIA.

Toda la materia existe en el espacio y, por tanto, tiene una forma tridimensional. Las
proteínas están formadas por enlaces entre un gran número de átomos; en
consecuencia, su forma es compleja. El término conformación se refiere a la disposición
tridimensional de los átomos de una molécula, es decir, a su organización espacial. La
estructura secundaria describe la conformación de porciones de la cadena polipeptídica.

Lámina beta (B), que consiste en varios segmentos de un polipéptido que yacen uno al
lado del otro. A diferencia de la forma cilíndrica en espiral de la hélice a, la cadena
principal de cada segmento de polipéptido (o cadena B) en una lámina B adopta una
conformación plegada o plisada.

Se propusieron dos conformaciones. La cadena principal del polipéptido asumió la


forma de una espiral cilíndrica y torcida llamada la hélice alfa.

ESTRUCTURA TERCIARIA DE LAS PROTEÍNAS

Mientras que la estructura secundaria se estabiliza principalmente por enlaces de


hidrógeno entre átomos que forman los enlaces peptídicos de la cadena principal, la
estructura terciaria se estabiliza mediante una matriz de enlaces no covalentes entre las
diversas cadenas laterales de la proteína. La estructura secundaria se limita en gran
medida a un pequeño número de conformaciones, pero la estructura terciaria es
prácticamente ilimitada.

ESTRUCTURA CUATERNARIA

Informa de la unión, mediante enlaces débiles (no covalentes) de varias cadenas


polipeptídicas con estructura terciaria, para formar un complejo proteico. Cada una de
estas cadenas polipeptídicas recibe el nombre de protómero.

PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS

"Es el proceso expedito, termodinámicamente no espontáneo (reversible) por el que una


proteína soluble alcanza su estructura tridimensional. La función biológica de una
proteína depende de su correcto plegamiento, el cual es un proceso
termodinámicamente irreversible por ser espontáneo. Si una proteína no se pliega
correctamente, la misma no será funcional y, por lo tanto, no será capaz de cumplir con
su función biológica. En estos casos, misma puede ser susceptible de alcanzar estados
aberrantes de agregación, que incluyen la formación de apilamientos amiloides
causantes de neuropatías, como ocurre con el llamado prion."

"El proceso inverso del plegamiento es conocido como desnaturalización de proteínas.


Una proteína desnaturalizada no es más que una cadena de aminoácidos sin una
estructura tridimensional definida ni estable. A menudo, las proteínas desnaturalizadas
precipitan, perdiendo de ese modo su solubilidad. En algunos casos los procesos de
plegamiento y desnaturalización son reversibles, aunque en otros no. Esta última
posibilidad es frecuente cuando la desnaturalización conduce a intermediario que es
capaz de formar un agregado regular." El despliegue o desorganización de una proteína
se denomina desnaturalización, y puede ser provocada por una variedad de agentes,
incluidos los detergentes, disolventes orgánicos, radiación, calor y compuestos como la
urea y el cloruro de guanidina, todos los cuales interfieren con las diversas interacciones
que estabilizan la estructura terciaria de una proteína.
Semana 5 - PROTEÓMICA E INTERACTOMICA
Genes Unidades de almacenamiento de información

Proteínas Organizan las actividades celulares

Genoma: Equivalente al ADN de un conjunto haploide de cromosomas de una especie


biológica. (Conjunto de genes de una especie)

Genoma humano Contiene aprox. de 20,000 a 22,000 genes

Proteoma Inventario completo de proteínas que produce un organismo Inventario de


proteínas que están presentes en un tejido específico, célula y organelo celular.

PROTEÓMICA

Término que describe el campo en expansión de la bioquímica de proteínas. Uso de las


tecnologías de última generación para realizar estudios a gran escala en diversas
matrices de proteínas

El campo de la proteómica abarca el estudio de todas las proteínas que se producen en


los distintos tipos de células. Por tal motivo, son más difíciles de trabajar porque cada
proteína tiene propiedades químicas y requisitos de manejo únicos.

La proteómica se encarga del estudio a gran escala de las funciones de la proteínas


dentro de los organismos, desde su estructura, actividad (in vitro), síntesis, los cambios
que sufre por adición de otras sustancia (ej. fosfatos o azúcares) y cuánto tiempo tarda
en ser degradada. Todo esto a través de técnicas de alto rendimiento para catalogar la
gran variedad de proteínas producidas por una célula particular.

La tecnología clave en proteómica es la espectrometría de masas. Esta es una técnica


para determinar la masa precisa de una molécula o fragmento de una molécula, que
luego puede utilizarse para identificar esa molécula.

Al analizar la proteína total extraída de una célula mediante espectrometría de masas,


es posible determinar una lista de todas las proteínas presentes en la célula, esta lista
se conoce como PROTEOMA DE LA CELULA.

APLICACIONES DE LA PROTEOMICA

En el estudio de las enfermedades humanas como cáncer, a través de la búsqueda de


biomarcadores entre miles de proteínas presentes en la sangre y otros fluidos corporales.
Ejemplo:

 PSA (Antígeno prostático específico): Prueba utilizada en la detección de cáncer


de próstata.
 OVA 1: Prueba de análisis que se dedica a la detección de todos los tipos de
cáncer de ovario en pacientes con una masa pélvica.

INTERACTOMICA

Se refiere al estudio del conjunto de interacciones entre distintas biomoléculas en un


entorno determinado. En la actualidad se centra en el estudio de las interacciones entre
proteína-proteína.

Para realizar dicho estudio se utiliza la espectrometría de masas. Los resultados de los
estudios de interacción proteína-proteína a gran escala se pueden presentar en forma
de una red debido a los posibles compañeros de unión de varias proteínas.

Las proteínas que tienen múltiples compañeros de unión se denominan Centros de la


red de interacción de proteínas. Estas proteínas concentradas son más propensas a ser
proteínas esenciales.

Otros centros tienen una única interfaz de enlace que es capaz de vincular varios socios
diferentes, pero solo uno a la vez, estas proteínas desempeñan un papel central en el
proceso de expresión génica y otras un papel importante en el proceso de división celular.

Se estima en promedio cada proteína codificada del genoma de un organismo eucariota


interactúa con aproximadamente cinco socios proteicos diferentes.

INGENIERIA DE LAS PROTEINAS

 La tecnología actual permite la creación de proteínas distintas a las fabricadas por


los organismos vivos.
 Consiste en diseñar y producir en masa proteínas novedosas que son diferentes
de las fabricadas por organismos vivos.
 Es posible sintetizar genes artificiales que puedan usarse en la producción de una
proteína que tenga cualquier secuencia deseada de aminoácidos.
 La creación de proteínas de manera artificial podría permitir la fabricación de
secuencias de aminoácidos que pueden servir en medicina para bloquear sitios
de unión de diferentes agentes infecciosos.
 También podría permitir la fabricación nuevos medicamentos frente a estas
infecciones o en la actualidad para la fabricación de nuevas vacunas frente a otras
enfermedades
PRODUCCIÓN DE NUEVAS PROTEÍNAS

 Proteínas artificiales producidas por técnicas de ingeniería genética.


 Permitirá en un futuro la construcción de proteínas que serán capaces de catalizar
prácticamente cualquier reacción química.
 Estas técnicas también se utilizarían para modificar aquellas que ya está
producidas por las células.

MUTAGÉNESIS DIRIGIDA AL SITIO:

Técnica biomolecular que consiste en aislar un gen individual de los cromosomas


humanos para alterar su contenido de información de una manera determinada con
precisión y de esta manera sintetizar una proteína modificada con su secuencia de
aminoácidos alterada.

Aplicación:

 Investigación: Para el análisis de funciones específicas de las partes diminutas


de prácticamente todas las proteínas de interés para los biólogos.
 Biología: Para modificar la estructura de proteínas clínicamente `tiles para
producir diversos efectos biológicos.

Diseño de fármacos basada en la estructura

 La producción de nuevas proteínas se utiliza también en el desarrollo de nuevos


fármacos que actúan uniéndose a las proteínas conocidas, inhibiendo así su
actividad.
 El diseño de fármacos basado en estructuras se basa en el conocimientos de las
estructura del objetivo de un proteína.
 Esto permite la producción de nuevas moléculas de drogas “virtuales” cuyo
tamaño y forma les permita encajar en las aparentes grietas de las proteínas para
inactivarlas.

ADAPTACIÓN Y EVOLUCIÓN DE PROTEÍNAS

Las adaptaciones son rasgos que mejoran la probabilidad de que un organismo


sobreviva en un entorno particular. Las proteínas son adaptaciones bioquímicas que
están sujetas a selección natural y al cambio evolutivo.

Las proteínas homologas (similares) aisladas de diferente organismos pueden exhibir


formas prácticamente idénticas y patrones de plegamientos, pero muestran secuencias
de aminoácidos sorprendentemente divergentes.
Estudios realizados con la globina indican que las estructuras secundaria y terciaria de
las proteínas cambian muchos más lentamente durante la evolución que sus estructuras
primarias.

Isoformas: Término que se refiere a las diversas versiones de una proteína que están
adaptadas para funcionar en diferentes tejidos o en distintos etapas de desarrollo.

ACIDOS NUCLEICOS

 Son macromoléculas construidas a partir de cadenas largas de monómeros


llamados nucleótidos, fundamentales en la célula, por su papel en el
almacenamiento, transmisión y expresión de la información genética.
 Funcionan principalmente en el almacenamiento y la trasmisión de información
genética.
 También tienen funciones estructurales o catalíticas.

Se clasifican en:

 Acido desoxirribonucleico (DNA) Material genético de todos los organismos


celulares
 Ácido ribonucleico (RNA) Desempeña la función de material genético para
muchos virus.

La información almacenada en el DNA se usa para controlar las actividades celulares a


través de la formación de mensajes de RNA.

Cada nucleótidos en una cadena de DNA consta de tres partes:

 1Azúcar de 5 carbonos (Desoxirribosa)


 1 Base nitrogenada
 1 grupo fosfato

Cada nucleótidos en una cadena de RNA consta de tres partes:

 1Azúcar de 5 carbonos (ribosa)


 1 Base nitrogenada
 1 grupo fosfato

El azúcar y la base nitrogenada juntos forman un nucleósido. En el RNA se conocen


también como ribonucleósidos monosfosfatos. El fosfato está ligado al carbono 5´del
azúcar. La base nitrogenada está unida al carbono 1´ del azúcar
Durante el ensamblaje de una cadena de ácido nucleico el grupo hidroxilo unido al
carbono 3´del azúcar de un nucleótido se une mediante un enlace éster al grupo fosfato
unido al carbono 5´ del siguiente nucleótido de la cadena.

Así los nucleótidos de la cadena de RNA o DNA están conectados por enlaces azúcar-
fosfato, estos enlaces se llaman enlaces fosfodiéster 3´-5´

Existen 4 tipos de nucleótidos (monómeros) en las cadenas de DNA o RNA. Según su


base nitrogenada se dividen en:

 Pirimidinas: Moléculas que consisten en un solo anillos


 Purinas: Moléculas que constan de dos anillos

El RNA

 2 purinas; adenina y guanina


 2 pirimidinas: Citosina y Uracilo

El DNA

 2 purinas: adenina y guanina


 2 pirimidinas: Citosina y Timina

Polinucleótido: Cadena constituida por la unión de múltiples nucleótidos.

ACIDO DESOXIRRIBONUCLEICO (DNA)

 Desempeña un papel único como material genético, que en células eucariotas se


encuentra en el núcleo.
 La polimerización de nucleótidos forma polinucleótidos.
 EL ADN: Alberga la información genética de un organismo.
 Está conformada por dos cadenas de polinucléotidos.

ACIDO RIBONUCLEICO (RNA)

Existen 3 tipos de ácido ribonucleico:

 ARN mensajero: lleva un mensaje genético del ADN a los ribosomas


 ARN ribosómico: componente ribosomal
 ARN de transferencia: participa en la traducción genética o síntesis de proteínas.
 Las bases nitrogenadas de los nucleótidos del ARN son: adenina, guanina,
citosina y uracilo. El azúcar es la ribosa y siempre está presente el grupo fosfato.
 RNA ribosomales son moléculas que sirven como andamios estructurales en los
que se pueden unir a las proteínas del ribosoma y como elementeos que
reconocen y unen diversos componentes solubles requeridos para la síntesis de
proteínas.
 Los RNA que tienen una función catalítica se llaman enzimas de RNA o
ribozimas.

COMPARACIÓN ENTRE ADN Y ARN

Los nucleótidos también tienen funciones importantes por derecho propio, ejemplo:

ATP (trifosfato de adenosina) nucleótido fundamental en la obtención de energía para


la mayoría de procesos celulares.

GTP (trifosfato de guanosina) nucleótido de enorme importancia en las actividades


celulares. Unido a la proteína G, actúa como interruptor para activar múltiples funciones
celulares.
Resumen Biología – Modulo 2

(ATP, adenosine triphosphate) LA MONEDA ENERGETICA

Para mantener un nivel tan alto de actividad, una célula debe adquirir y gastar energía.

El estudio de los diversos tipos de transformaciones de energía que ocurren en los


organismos vivos se conoce como bioenergética.

La energía se define como la capacidad de hacer trabajo, es decir, la capacidad de


cambiar o mover algo.

La termodinámica es el estudio de los cambios de energía que acompañan a los


eventos del universo.

LA PRIMERA LEY DE LA TERMODINÁMICA

Es la ley de la conservación de la energía. Establece que la energía no puede ser creada


ni destruida. Sin embargo, la energía se puede convertir (transformarse) de una forma a
otra.

Las células también son capaces de transformar, almacenar y transportar la energía.

El ATP se convierte en energía mecánica cuando los músculos se contraen

La pérdida o ganancia se debe equilibrar con una ganancia o pérdida correspondiente


en el entorno, de modo que la cantidad en el universo como un todo permanezca
constante. La energía del sistema se denomina energía interna (E)

Las reacciones que pierden calor se denominan exotérmicas y las que ganan calor son
endotérmicas, y hay muchas reacciones de ambos tipos.

LA SEGUNDA LEY DE LA TERMODINÁMICA

Expresa el concepto de que los eventos en el universo tienen dirección; tienden a


proceder “colina abajo” desde un estado de mayor energía a un estado de menor energía.
Se dice que estos eventos son espontáneos, un término que indica que son
termodinámicamente favorables y que pueden ocurrir sin entrada de energía externa.

La pérdida de energía disponible durante un proceso es el resultado de una tendencia a


que la aleatoriedad o desorden del universo aumenta cada vez que hay una transferencia
de energía. Esta ganancia en el desorden es medida por el término entropía

La liberación de energía térmica por los organismos vivos aumenta la velocidad de los
movimientos aleatorios de átomos y moléculas

ENERGÍA LIBRE

Juntas, la primera y la segunda leyes de la termodinámica indican que la energía del


universo es constante, pero la entropía continúa aumentando hacia un máximo.

Energía libre; es decir, el cambio de la energía disponible para hacer trabajo durante un
proceso

Los procesos que pueden ocurrir espontáneamente, es decir, los procesos que se ven
favorecidos termodinámicamente (tienen un –ΔG), se describen como exergónicos.

Dichos procesos son termodinámicamente desfavorables y se describen como


endergónicos

La variación estándar de energía libre (ΔG°9) describe la energía libre liberada cuando
los reactivos se convierten en productos bajo estas condiciones estándar.

El flujo continuo de oxígeno y otros materiales hacia dentro y fuera de las células permite
que el metabolismo celular exista en un estado estacionario

Las enzimas son los mediadores del metabolismo, responsables de prácticamente cada
reacción que ocurre en una célula.

La primera evidencia de que las enzimas son proteínas se obtuvo en 1926 por James
Sumner de la Universidad de Cornell

Muchas de ellas son proteínas conjugadas; es decir, contienen componentes no


proteicos llamados cofactores, que pueden ser inorgánicos (metales) u orgánicos
(coenzimas)
Propiedades de las enzimas

1) Solo se requieren en pequeñas cantidades;


2) No se alteran irreversiblemente durante el curso de la reacción y, por tanto, cada
molécula de enzima puede participar repetidamente en reacciones individuales
3) No tienen efecto alguno sobre la termodinámica de la reacción.

Las enzimas suelen aumentar la velocidad de una reacción de 10x8 a 10x13 veces

Los reaccionantes enlazados por una enzima se llaman sustratos.

Los reaccionantes deben contener suficiente energía cinética (energía de movimiento)


que superen una barrera, llamada energía de activación (EA)

 La velocidad de la reacción depende del número de moléculas reactivas que


poseen la energía cinética necesaria en un momento dado.
 Las enzimas catalizan reacciones al disminuir la magnitud de la barrera de energía
de activación
 Las enzimas son capaces de reducir las energías de activación uniéndose más
firmemente al estado de transición que a los reaccionantes, lo que estabiliza este
complejo activado disminuyendo así su energía.

EL SITIO ACTIVO

Las enzimas hacen esto formando un complejo con los reaccionantes, llamado complejo
enzima-sustrato (ES, enzyme-substrate)

Aquella parte de la molécula de la enzima que está directamente involucrada en la unión


del sustrato se denomina sitio activo

 El sitio activo normalmente está enterrado en una hendidura o grieta que conduce
desde el entorno acuoso a las profundidades de la proteína.
 La mayoría de las enzimas son capaces de unir solo una molécula biológica, o un
pequeño número de ellas estrechamente relacionadas.

MECANISMOS DE LA CATÁLISIS DE ENZIMAS

La formación del complejo enzima-sustrato, que permite que el (los) sustrato(s) se


extraiga(n) de la disolución y se mantenga(n) en la superficie de la gran molécula del
catalizador.

 Las enzimas reducen la entropía de sus sustratos de una manera similar.


 Los sustratos unidos a la superficie de una enzima se juntan exactamente en la
orientación correcta para realizar la reacción
 Las enzimas se componen de aminoácidos que tienen una variedad de diferentes
tipos de cadenas laterales
 La velocidad de las reacciones puede verse muy afectada por los cambios en el
pH
 Los sitios activos de muchas enzimas contienen cadenas laterales con una carga
parcial positiva o negativa.

La conformación cambia de modo que se mejora el ajuste complementario entre la


enzima y los reaccionantes (un ajuste inducido)

CINÉTICA DE ENZIMAS

La actividad catalítica de una enzima se revela mediante el estudio de su cinética, es


decir, la velocidad a la que cataliza una reacción en diversas condiciones experimentales.

En 1913, Leonor Michaelis y Maud Menten informaron sobre la relación matemática entre
la concentración del sustrato y la velocidad de las reacciones enzimáticas, medida por la
velocidad de formación de productos

A altas concentraciones de sustrato, las enzimas colisionan con las moléculas de este
más rápidamente de lo que pueden convertirse en producto.

NÚMERO DE RECAMBIO es la cantidad máxima de moléculas de sustrato que una


molécula de enzima puede convertir en producto por unidad de tiempo

Los inhibidores enzimáticos son moléculas que pueden unirse a una enzima y
disminuir su actividad.

Los inhibidores irreversibles son aquellos que se unen muy fuertemente a una enzima,
a menudo formando un enlace covalente a uno de sus residuos de aminoácidos.

Los inhibidores competitivos son inhibidores reversibles que compiten con un sustrato
para acceder al sitio activo de una enzima.

La inhibición no competitiva, el sustrato y el inhibidor no compiten por el mismo sitio


de unión; por lo general el inhibidor actúa en un sitio que no es el sitio activo de la enzima.

El producto final de la glucolisis AEROBICA es el PIRUVATO, y cuando es


ANAEROBICA es el LACTATO

El metabolismo es la colección de reacciones bioquímicas que ocurren dentro de una


célula

Vías metabólicas que contienen una secuencia de reacciones químicas en las que una
enzima específica cataliza cada reacción, y el producto de una reacción es el sustrato
para la siguiente.

Los compuestos formados en cada paso a lo largo de la ruta son intermediarios


metabólicos (o metabolitos)

Las vías catabólicas conducen al desmontaje de moléculas complejas para formar


productos más simples.

Las secuencias anabólicas conducen a la síntesis de compuestos más complejos a


partir de materiales más simples.

Las reacciones que implican un cambio en el estado electrónico de los reaccionantes se


denominan reacciones de oxidación-reducción (o redox)

La oxidación de un reaccionante debe ir acompañada de la reducción simultánea de


algún otro reaccionante, y viceversa.

La sustancia que se oxida durante una reacción redox, es decir, la que pierde electrones,
se llama agente reductor, y la que se reduce, o sea, la que gana electrones, se llama
agente oxidante

Cuando un átomo pierde uno o más electrones, se dice que se oxida

Cuando un átomo gana uno o más electrones, se dice que se reduce.

 El estado de oxidación de los átomos de carbono en una molécula orgánica


proporciona una medida del contenido de energía libre de la molécula
 La glucosa es una molécula clave en el metabolismo energético de plantas y
animales.

LA PRIMERA ETAPA, LA GLUCÓLISIS, ocurre en la fase soluble del citoplasma (el


citosol) y conduce a la formación de piruvato. LA SEGUNDA ETAPA ES EL CICLO DEL
ÁCIDO TRICARBOXÍLICO (o TCA, tricarboxylic acid), que se produce dentro de las
mitocondrias de las células eucariotas y el citosol de las procariotas, y conduce a la
oxidación final de los átomos de carbono a dióxido de carbono.

El uso de ATP en esta etapa se puede considerar una inversión de energía, el costo de
ingresar al negocio de oxidación de glucosa.

Una enzima que cataliza este tipo de reacción se denomina deshidrogenasa; la enzima
que cataliza la reacción anterior es la gliceraldehído 3-fosfato deshidrogenasa.

NAD, que se deriva de la vitamina niacina, actúa como una coenzima débilmente
asociada a la deshidrogenasa en posición de aceptar el ion hidruro

La energía liberada durante el transporte de electrones se utiliza para formar ATP


mediante un proceso llamado fosforilación oxidativa.

Esta ruta directa de formación de ATP se denomina fosforilación a nivel de sustrato


porque se produce por transferencia de un grupo fosfato de uno de los sustratos al ADP.

Potencial de transferencia es útil para comparar cualquier serie de donantes y


aceptores con independencia del grupo que se transfiera, ya sean protones, electrones,
oxígeno o grupos fosfato

 La glucólisis se puede considerar una vía anaeróbica para la producción de ATP


 Debido a que cada molécula de glucosa produce dos moléculas de gliceraldehído
3-fosfato, se generan cuatro moléculas de ATP por molécula de glucosa oxidada
a piruvato.
 Cuando 1 mol de glucosa se oxida por completo, se liberan 686 kilocalorías

EL PIRUVATO, EL PRODUCTO FINAL DE LA GLUCÓLISIS

LAS RESERVAS DE ENERGÍA DE UNA CÉLULA SE ALMACENAN COMO


POLISACÁRIDOS Y GRASAS

Las enzimas que transfieren grupos de fosfato a otras proteínas se denominan proteínas
quinasas y regulan actividades tan diversas como la acción de hormonas, la división
celular y la expresión génica.

La modulación alostérica es un mecanismo por el cual la actividad de una enzima es


inhibida o estimulada por un compuesto que se une a un sitio, llamado sitio alostérico

Uno de los mecanismos principales que usan las células para cerrar las líneas de
ensamblaje anabólico es un tipo de modulación alostérica llamada inhibición de
retroalimentación, en la cual la enzima que cataliza el primer paso comprometido en
una ruta metabólica se inactiva temporalmente cuando la concentración del producto final
de esa secuencia alcanza un cierto nivel.
LA SÍNTESIS DE LA GLUCOSA (GLUCONEOGÉNESIS)

La AMPK controla la actividad de otras enzimas mediante la adición de grupos de fosfato


a residuos específicos de serina o treonina dentro de su estructura

Anaerobios organismos que capturaban y utilizaban energía por medio del metabolismo
independiente del oxígeno, como la glucólisis y la fermentación

Organismos, que se volvieron dependientes del oxígeno, fueron los primeros aerobios
de la Tierra, y dieron lugar a todas las procariotas y eucariotas dependientes de oxígeno
que viven en la actualidad.

En las eucariotas, la utilización del oxígeno como medio de extracción de energía se lleva
a cabo en un organelo especializado, la mitocondria.

Los movimientos de un espermatozoide son impulsados por el ATP producido en estas


mitocondrias.

La membrana mitocondrial externa encierra completamente a la mitocondria, sirviendo


como su límite exterior. La membrana mitocondrial interna se subdivide en dos
dominios principales que tienen diferentes proteínas residentes y realizan distintas
funciones. Uno de estos dominios, llamado membrana límite interna, se encuentra justo
dentro de la membrana mitocondrial externa, formando una doble envoltura externa de
membrana. Es rica en las proteínas responsables de la importación de proteínas
mitocondriales.

Un complejo proteico asociado a la membrana interna llamado MitOS (también conocido


como MICOS o MINOS) se encuentra en las uniones de crestas y se requiere para la
organización normal de las crestas.

Las membranas de la mitocondria dividen el organelo en dos compartimentos acuosos,


uno dentro del interior de la mitocondria, llamado matriz, y un segundo entre la
membrana externa y la interna, llamada espacio intermembranoso

La membrana externa está compuesta de casi 50% de lípidos por peso y contiene una
curiosa mezcla de enzimas involucradas en actividades tan diversas como la oxidación
de la epinefrina, la degradación del triptófano y la elongación de los ácidos grasos. La
membrana interna contiene más de 100 polipéptidos diferentes y tiene una relación
proteína/lípido muy alta
Las mitocondrias poseen su propio material genético y la maquinaria para fabricar sus
propios RNA y proteínas

Las reacciones de la glucólisis generan piruvato y NADH en el citosol

36 ATP DE UNA SOLA MOLÉCULA DE GLUCOSA.

Ciclo del ácido tricarboxílico (TCA) también se conoce como el ciclo de Krebs
después que el bioquímico británico Hans Krebs trabajara en la descripción de la vía en
la década de 1930, o ciclo del ácido cítrico, a partir de una molécula clave formada en
la vía.

La mitocondria se convierte en el foco para los pasos de conservación de la energía


final en el metabolismo independientemente de la naturaleza del material de partida.

Cada par de electrones transferidos de NADH al oxígeno por medio de la cadena


transportadora de electrones libera suficiente energía para impulsar la formación de
alrededor de tres moléculas de ATP. Cada par donado por el FADH2 libera energía
suficiente para la formación de casi dos moléculas de ATP.

Las células están separadas del mundo externo por una estructura delgada y frágil
llamada membrana plasmática o membrana celular, de solo 5 a 10 nm de ancho.

FUNCIONES DE LA MEMBRANA

1. Compartimentación. Las membranas son láminas continuas e ininterrumpidas y,


como tales, inevitablemente encierran compartimientos. La membrana plasmática
encierra el contenido de la célula completa, mientras que las membranas nucleares y
citoplásmicas encierran diversos espacios intracelulares. Los diversos compartimientos
de una célula unidos a la membrana poseen contenidos marcadamente diferentes. La
compartimentación de la membrana permite que las actividades especializadas
continúen sin interferencia externa, y permite la regulación independiente de las
actividades celulares.

2. Plataforma para actividades bioquímicas. Las membranas no solo encierran


compartimientos, sino que ellas mismas son también un compartimiento diferente. Para
los reactivos que flotan libremente en disolución, las interacciones dependen de
colisiones aleatorias. Por el contrario, los componentes que están incrustados en una
membrana ya no flotan libremente, y se pueden ordenar para una interacción efectiva.
3. Proporcionar una barrera permeable selectiva. Las membranas evitan el
intercambio irrestricto de moléculas de un lado a otro. Al mismo tiempo, las membranas
proporcionan los medios de comunicación entre los compartimientos que separan. La
membrana plasmática que rodea a una célula se puede comparar con un foso alrededor
de un castillo: ambos sirven como una barrera general, pero ambos tienen “puentes” con
compuertas que promueven el movimiento de elementos selectos dentro y fuera del
espacio vital encerrado.

4. Transporte de solutos. La membrana plasmática contiene la maquinaria para


transportar físicamente sustancias desde un lado a otro de ella, a menudo desde una
región donde el soluto se envía a baja concentración a una región donde ese soluto está
presente a una concentración mucho mayor.

5. Respuesta a estímulos externos. La membrana plasmática desempeña un papel


crítico en la respuesta de una célula a estímulos externos, un proceso conocido como
transducción de señales. Las membranas poseen receptores que se combinan con
moléculas específicas (ligandos) o responden a otros tipos de estímulos, como la luz o
la tensión mecánica.

6. Interacción intercelular. Situada en el borde exterior de cada célula viva, la


membrana plasmática de los organismos multicelulares media las interacciones entre
una célula y sus vecinos. Permite a las células reconocerse y señalizarse entre sí,
adherirse cuando sea apropiado, e intercambiar materiales e información.

7. Transformación de energía. Las membranas están íntimamente involucradas en los


procesos mediante los cuales un tipo de energía se convierte en otro. La transformación
de energía más básica ocurre durante la fotosíntesis, cuando los pigmentos unidos a la
membrana absorben la energía de la luz solar, esta se convierte en energía química y
se almacena en los carbohidratos. Las membranas también están involucradas en la
transferencia de energía química de carbohidratos y grasas al ATP.

COMPOSICIÓN LIPÍDICA DE LAS MEMBRANAS

 Las membranas son ensambles de lípidos y proteínas en las que los componentes
se mantienen unidos en una lámina delgada mediante enlaces no covalentes
 La bicapa lipídica sirve principalmente como columna estructural de la membrana,
y proporciona una barrera que evita los movimientos aleatorios de los materiales
solubles en agua hacia dentro y fuera de la célula.
 La relación de lípido a proteína en una membrana varía, en dependencia del tipo
de membrana celular, el tipo de organismo y el tipo de célula.

Anfipáticos; contienen regiones hidrofílicas e hidrofóbicas.


FOSFOGLICERIDOS: La mayoría de los lípidos de la membrana contienen un grupo
fosfato, que los convierte en fosfolípidos. Debido a que la mayor parte de los fosfolípidos
de membrana se basan en un esqueleto de glicerol, se denominan fosfoglicéridos

ESFINDOLIPÍDOS: se derivan de la esfingosina, un aminoalcohol que contiene una larga


cadena de hidrocarburos, consisten en esfingosina unida a un ácido graso por su grupo
amino Esta molécula es una ceramida.

 Si la sustitución es fosforilcolina, la molécula es esfingomielina


 Si la sustitución es un hidrato de carbono, la molécula es un glucolípido
 Si el carbohidrato es un azúcar simple, el glucolípido se llama cerebrósido.
 si se trata de un pequeño grupo de azúcares que incluye ácido siálico, el
glucolípido se llama gangliósido

COLESTEROL: están orientadas con su pequeño grupo hidroxilo hidrofílico hacia la


superficie de la membrana, y el resto de la molécula incrustada en la bicapa lipídica. Los
anillos hidrofóbicos de una molécula de colesterol son planos y rígidos, e interfieren con
los movimientos de las colas de ácidos grasos de los fosfolípidos.

CARBOHIDRATOS DE MEMBRANA

El contenido de carbohidratos de la membrana plasmática oscila entre 2 y 10% en peso.


Más de 90% de los carbohidratos de la membrana se unen en forma covalente a las
proteínas para formar glucoproteínas

El carbohidrato de las glucoproteínas está presente como oligosacáridos hidrofílicos


cortos ramificados, que es usual posean menos de unos 15 azúcares por cadena.

Los carbohidratos de los glucolípidos en la membrana plasmática de los glóbulos


rojos determinan si el tipo de sangre de una persona es A, B, AB u O

PROTEÍNAS DE MEMBRANA

1. Proteínas integrales que penetran en la bicapa lipídica. Las proteínas integrales son
proteínas transmembrana; es decir, traspasan totalmente la bicapa lipídica, y por ello
tienen dominios que sobresalen de los lados extracelular y citoplásmico de la membrana.

2. Proteínas periféricas que se localizan completamente fuera de la bicapa lipídica, ya


sea en el lado citoplásmico o extracelular, aunque asociadas con la superficie de la
membrana por enlaces no covalentes.

3. Proteínas ancladas a lípidos (que se localizan fuera de la bicapa lipídica, ya sea en


la superficie extracelular o citoplásmica, pero unidas en forma covalente a una molécula
de lípido que se encuentra dentro de la bicapa.
La mayoría de las proteínas integrales de membrana funcionan en las siguientes
capacidades:

Como receptoras que unen sustancias específicas en la superficie de la membrana,


como canales o transportadores involucrados en el movimiento de iones y solutos a
través de la membrana, o como agentes que transfieren electrones durante los procesos
de fotosíntesis y respiración. También son anfipáticas, y tienen porciones hidrofílicas
e hidrofóbicas.

Esos segmentos de proteína incrustados dentro de la membrana, que se describen como


los dominios transmembrana, tienen una estructura simple; consisten en una cadena
de aproximadamente 20 aminoácidos de predominio no polar, que abarcan el núcleo de
la bicapa lipídica como una hélice.

La mutagénesis dirigida al sitio al introducir cambios específicos en el gen que codifica


la proteína.

LÍPIDOS DE MEMBRANA Y FLUIDEZ DE LA MEMBRANA

El estado físico del lípido de una membrana se describe por su fluidez (o viscosidad).

La temperatura a la que se produce este cambio se denomina temperatura de


transición

Los ácidos grasos saturados tienen la forma de una barra recta y flexible.

Los ácidos grasos insaturados cis tienen dobleces en la cadena, en los sitios de un
doble enlace.

Las membranas solo surgen a partir de membranas preexistentes, y su crecimiento se


logra mediante la inserción de lípidos y proteínas en la matriz fluida de la lámina
membranosa.

Las enzimas llamadas desaturasas catalizan la desaturación de enlaces simples para


formar dobles enlaces. Las fosfolipasas llevan a cabo la reorganización, al separar el
ácido graso de la columna de glicerol; asimismo, las aciltransferasas, transfieren ácidos
grasos entre los fosfolípidos.

Balsas lipídicas parches de colesterol y esfingolípidos

La fusión celular es una técnica mediante la cual dos tipos diferentes de células, o
células de dos especies diferentes, se pueden fusionar para producir una célula con un
citoplasma común y una sola membrana plasmática continua.
Movimiento de solutos a través de las membranas celulares

La membrana plasmática es una barrera que retiene los materiales disueltos de la célula
para que no se filtren al medio ambiente; sin embargo, debe permitir el intercambio de
materia-les necesarios dentro y fuera de la célula

Existen dos medios para el movimiento de sustancias a través de una membrana:


pasivamente por difusión, o activamente por un proceso de transporte acoplado a la
energía.
El término flujo neto indica que el movimiento de la sustancia hacia la célula (afluencia) y
fuera de la célula (eflujo) no está equilibrado, sino que uno excede al otro.

Se conocen cuatro procesos diferentes por los cuales las sustancias se mueven a
través de las membranas: difusión simple a través de la bicapa lipídica; difusión simple
a través de un canal acuoso revestido de proteína; difusión facilitada por un transportador
de proteínas, y el transporte activo, que requiere una “bomba” de proteínas, impulsadas
por energía, capaz de mover sustancias contra el gradiente de concentración

La difusión es un proceso espontáneo en el que una sustancia se mueve desde una


región de alta concentración a una región de baja concentración.

La difusión depende del movimiento térmico continuo de los solutos, y es un proceso


exergónico impulsado por un aumento en la entropía.

Las moléculas se moverán de regiones de concentración más altas a regiones de


concentración más bajas que a la inversa.
El cambio de energía libre cuando un soluto sin carga eléctrica (un no electrólito) se
difunde a través de una membrana depende de cuán diferente es la concentración en los
dos lados de la membrana. Esta diferencia se conoce como gradiente de concentración.

La afluencia neta de soluto se favorece termodinámicamente (exergónica).

La tendencia de un electrólito a difundirse entre dos compartimientos depende de dos


gradientes: un gradiente químico, determinado por la diferencia de concentración de la
sustancia entre los dos compartimientos, y el gradiente de potencial eléctrico,
determinado por la diferencia de carga. Juntas, estas diferencias se combinan para
formar un gradiente electroquímico.

La difusión es un proceso independiente de la energía en el que un soluto desciende un


gradiente electroquímico, y disipa la energía libre almacenada en el gradiente.

Los solutos inorgánicos pequeños como el O2, CO2 y H2O penetran fácilmente en la
bicapa lipídica, al igual que los solutos con alta solubilidad en lípidos.

Una membrana puede ser permeable a un soluto dado, ya sea


1) porque ese soluto puede pasar directa-mente a través de la bicapa lipídica, o
2) porque ese soluto puede atravesar un poro acuoso que abarca la membrana

Una medida simple de la polaridad (o no polaridad) de una sustancia es su coeficiente


de partición, que es la relación de su solubilidad en un disolvente no polar.

El agua se mueve fácilmente a través de una membrana semipermeable desde una


región de menor concentración de soluto a una región de mayor concentración de soluto.
Este proceso se llama ósmosis.

 Compartimiento con la concentración de soluto más alta es hipertónico (o


hiperosmótico)
 Compartimiento de menor concentración de soluto, que se describe como
hipotónico (o hipo osmótico)

En un medio hipotónico la recuperación ocurre cuando las células pierden iones, lo que
reduce su presión osmótica interna. En un medio hipertónico, la recuperación ocurre
cuando las células obtienen iones del medio.

Una vez que la concentración interna de soluto es igual a la concentración externa de


soluto, los fluidos internos y externos son isotónicos (o isosmóticos)
Las células animales, que por lo general son isotónicas con el medio en el que se
sumergen, las células vegetales son hipertónicas en comparación con su entorno fluido.
Como resultado hay una tendencia a que el agua ingrese a la célula, lo que provoca que
desarrolle una presión interna (turgencia) que la empuja contra la pared circundante.

Si una célula vegetal se coloca en un medio hipertónico, su volumen se reduce a medida


que la membrana plasmática se aleja de la pared celular circundante, un proceso llamado
plasmólisis

Una familia de pequeñas proteínas integrales, llamadas acuaporinas, permite el


movimiento pasivo de agua de un lado de la membrana plasmática al otro.

La hormona vasopresina, que estimula la retención de agua por los conductos


colectores del riñón, actúa por medio de una de estas proteínas (AQP2).

LA DIFUSIÓN DE IONES A TRAVÉS DE MEMBRANAS

La bicapa lipídica que constituye el núcleo de las membranas biológicas es altamente


impermeable a las sustancias cargadas, incluidos los iones pequeños como Na+, K+,
Ca2+ y Cl–.el movimiento rápido (conductancia) de estos iones a través de las
membranas

En 1955, Alan Hodgkin y Richard Keynes de la Universidad de Cambridge propusieron


por primera vez que las membranas celulares contienen canales iónicos; es decir,
aberturas en la membrana que son permeables a iones específicos.

La difusión de iones a través de un canal siempre es descendente; es decir, desde un


estado de energía superior a un estado de energía inferior.

La mayoría de los canales iónicos que se han identificado pueden existir en una
configuración abierta o cerrada; se dice que dichos canales son de compuerta.

Se distinguen tres categorías principales de canales con compuerta:


1. Canales activados por voltaje, cuyo estado conformacional depende de la
diferencia en la carga iónica en ambos lados de la membrana.
2. Canales activados por ligandos, cuyo estado conformacional depende del
enlace de una molécula específica (el ligando), que normalmente no es el soluto
que pasa a través del canal. Algunos canales activados por ligandos se abren (o
se cierran) después de la unión de una molécula a la superficie externa del canal;
otros se abren (o se cierran) después de la unión de un ligando a la superficie
interna del canal.
3. Canales de compuerta mecánica cuyo estado conformacional depende de las
fuerzas mecánicas que se aplican a la membrana.
En 1998 Roderick MacKinnon y sus colegas de la Universidad Rockefeller proporcionaron
la primera imagen de resolución atómica de una proteína de canal iónico; en este caso,
un canal de ion K+ bacteriano llamado KcsA.
Una vez abierto el canal, más de 10 millones de iones de potasio pueden pasar por
segundo, que es casi la velocidad que alcanzaría la difusión libre en la solución.

La inactivación del canal se logra mediante el movimiento de un péptido de inactivación


pequeño, que cuelga de la porción citoplásmica de la proteína.

El retículo endoplásmico, el complejo de Golgi, los endosomas, los lisosomas y las


vacuolas. Estos organelos forman un sistema de endomembrana.

Se puede discernir una vía biosintética en la que las proteínas se sintetizan en el retículo
endoplásmico, se modifican durante el paso a través del complejo de Golgi y se
transportan desde el complejo de Golgi a diversos destinos, como la membrana
plasmática, un lisosoma o la gran vacuola de una célula vegetal. Esta ruta también se
conoce como la vía secretora porque muchas de las proteínas sintetizadas en el retículo
endoplásmico, están destinadas a ser descargadas (secretadas o exocitosadas) de la
célula

LAS ACTIVIDADES SECRETORAS DE LAS CÉLULAS SE PUEDEN DIVIDIR EN DOS


TIPOS:
 Secreción constitutiva, los materiales se transportan en vesículas secretoras
desde sus sitios de síntesis y se descargan en el espacio extracelular de forma
continua. La mayoría de las células participan en la secreción constitutiva, un
proceso que contribuye no solo a la formación de la matriz extracelular, sino
también a la formación de la membrana plasmática.
 Secreción regulada, los materiales se almacenan como paquetes de membrana
y se descargan solo en respuesta a un estímulo apropiado. La secreción regulada
ocurre, por ejemplo, en las células endocrinas que liberan hormonas, en células
acinares pancreáticas que liberan enzimas digestivas y en las células nerviosas
que liberan neurotransmisores.

En algunas de estas células los materiales que se van a secretar se almacenan en


grandes gránulos secretores unidos a membrana, densamente empaquetados.
La vía endocítica los materiales se mueven desde la superficie externa de la célula a los
compartimientos, como los endosomas y los lisosomas, ubicados dentro del citoplasma.

Las señales de clasificación son reconocidas por receptores específicos que residen
en las membranas o capas superficiales de vesículas en gemación, asegurando que la
proteína sea transportada al destino apropiado.

James Jamieson y George Palade de la Universidad Rockefeller utilizaron la técnica de


autorradiografía proporciona un medio para visualizar los procesos bioquímicos al
permitir que un investigador determine la ubicación de los materiales marcados
radiactivamente dentro de una célula.

El pulso se refiere a la breve incubación con radioactividad durante la cual los


aminoácidos marcados se incorporan a la proteína.
La persecución se refiere al periodo en que el tejido está expuesto al medio no marcado,
un periodo durante el cual se sintetizan proteínas adicionales usando aminoácidos no
radiactivos.

Las técnicas para romper (homogeneizar) las células y aislar tipos particulares de
organelos fueron iniciadas en los años 1950 y 1960 por Albert Claude y Christian De
Duve.

Las vesículas derivadas de diferentes organelos tienen diferentes propiedades que les
permiten separarse una de otra, un enfoque que se denomina fraccionamiento
subcelular.

Las vesículas membranosas derivadas del sistema de endomembrana forman una


colección heterogénea de vesículas de tamaño similar denominadas microsomas.

Sistemas libres de células, llamados así porque no contenían células completas,


proporcionaban una gran cantidad de información sobre procesos biológicos que eran
imposibles de estudiar en el complejo entorno de las células intactas.

Un mutante es un organismo (o célula cultivada) cuyos cromosomas contienen uno o


más genes que codifican proteínas anormales.
En la levadura, como en todas las células eucariotas, las vesículas salen del ER y viajan
al complejo de Golgi, donde se fusionan con las cisternas de Golgi.

El retículo endoplásmico (ER) comprende una red de membranas que penetra gran
parte del citoplasma.
El retículo endoplásmico se divide en dos subcompartimientos, el retículo endoplásmico
rugoso (RER) y el retículo endoplásmico liso (SER).

El ER rugoso se define por la presencia de ribosomas unidos a su superficie citosólica,


mientras que el ER liso no se asocia a ribosomas. El RER se compone típicamente de
una red de sacos aplanados (cisterna), donde cada capa está conectada a sus vecinos
por membranas helicoidales. El RER es continuo con la membrana externa de la
envoltura nuclear, que también porta ribosomas en su superficie citosólica.

Las membranas del SER son muy curvas y tubulares, formando un sistema
interconectado de tuberías que atraviesan el citoplasma. Cuando las células se
homogeneizan, los túbulos de SER se fragmentan en vesículas de superficie lisa,
mientras que las placas de RER se fragmentan en vesículas ásperas de superficie
rugosa.

1- Síntesis de proteínas en ribosomas ligados a membranas versus libres


Casi una tercera parte de las proteínas codificadas por un ge-noma de mamífero se
sintetizan en ribosomas unidos a la superficie citosólica de las membranas del RER y se
liberan en la luz del RE en un proceso llamado translocación cotraduccional.

Las proteínas secretoras contienen una señal de secuencia en su extremo-N que dirige
el polipéptido y ribosoma emergentes a la membrana ER

2- Síntesis de proteínas secretoras, lisosomales o vacuolar de las plantas

La síntesis de las proteínas secretoras, lisosomales o vacuolares de las plantas se realiza


por lo general mediante translocación translacional. En este proceso, las proteínas recién
formadas se depositan en la luz del ER mediante un ribosoma que está unido a la
membrana del ER

Un polipéptido naciente es aquel que está en el proceso de ser sintetizado.


A medida que emerge del ribosoma, la secuencia de señal hidrofóbica es reconocida por
una partícula de reconocimiento de señal (SRP) que consiste en células de mamífero
de seis polipéptidos distintos y una molécula de RNA llamada RNA 7SL.

El translocón es un canal de proteína incrustado en la membrana del ER a través del


cual el polipéptido naciente puede moverse en su paso del ribosoma a la luz del ER.

Las proteínas GTP unidas (o proteínas G) desempeñan funciones reguladoras clave en


muchos procesos celulares diferentes.

3- Procesamiento de proteínas recién sintetizadas en el retículo endoplásmico


La porción N-terminal que contiene el péptido señal se elimina de la mayoría de los
polipéptidos nacientes mediante una enzima proteolítica, la señal peptidasa.

4- Síntesis de proteínas integrales de membranas en ribosomas unidos al ER


Proteínas ancladas, carece de una secuencia de señal, pero no obstante logran
insertarse de forma adecuada en la membrana del ER. Estas proteínas se sintetizan en
el citoplasma y se dirigen al ER a través de una serie de interacciones con las proteínas
en la vía Get

Las membranas surgen de membranas preexistentes. Las membranas crecen como


proteínas recién sintetizadas, y los lípidos se insertan en las membranas existentes en el
retículo endoplásmico (ER).

La mayoría de los lípidos de la membrana se sintetizan por completo dentro del retículo
endoplásmico. Las principales excepciones son:
1) Esfingomielina y glucolípidos, cuya síntesis comienza en el ER y se completa en
el complejo de Golgi,
2) Algunos de los lípidos únicos de las membranas mitocondriales y cloroplástica,
que son sintetizados por enzimas que residen en esas membranas.

Los fosfolípidos recién sintetizados se insertan en la mitad de la bicapa mirando al citosol.

Las células contienen proteínas de transferencia de lípidos que pueden unir y


transportar lípidos a través del citosol acuoso desde un compartimiento de membrana a
otro
 Casi todas las proteínas producidas en los ribosomas unidos a la membrana, ya
sean componentes integrales de una membrana, enzimas solubles lisosomales o
vacuolares, o partes de la matriz extracelular, se convierten en glucoproteínas.
 Las secuencias de azúcares que comprenden los oligosacáridos de las
glucoproteínas son altamente específicas; si los oligosacáridos se aíslan de una
proteína purificada de un tipo dado de célula, su secuencia es consistente y
predecible.
 La disposición de azúcares en las cadenas de oligosacáridos de una glucoproteína
depende de la localización espacial de enzimas particulares en la línea de
ensamblaje.
La adición de azúcares a una cadena de oligosacáridos está catalizada por una gran
familia de enzimas unidas a la membrana llamadas glucosiltransferasas.

El segmento basal, o central, de cada cadena de carbohidratos no se ensambla en la


proteína en sí, sino que se junta de forma independiente en un vehículo lipídico y luego
se transfiere, como un bloque, a residuos específicos de asparagina del polipéptido. Este
transportador de lípidos, que se llama dolicol fosfato

Un sistema de control de la calidad que determina si es apto para pasar al siguiente


compartimiento de la ruta biosintética.

La acumulación de proteínas mal plegadas, que es potencialmente letal para las células,
desencadena un “plan de acción” integral dentro de la célula conocida como respuesta
de proteína desplegada (UPR)

Las vesículas de transporte se fusionan entre sí para formar vesículas más grandes y
túbulos interconectados en la región entre el ER y el complejo de Golgi. Esta región ha
sido llamada retículo endoplásmico del compartimiento intermedio de Golgi

Las cisternas, cuyos diámetros son de 0.5 a 1.0 μm. Una pila de Golgi contiene
menos de ocho cisternas.
La cara de entrada o cis más cercana al ER a la cara de salida o trans en el extremo
opuesto de la pila.
La cara más cis del organelo se compone de una red interconectada de túbulos
denominada red cis Golgi (CGN)
La red trans Golgi(TGN) es una estación de clasificación donde las proteínas se
segregan en diferentes tipos de vesículas que conducen a la membrana plasmática o a
diversos destinos intracelulares.
 El complejo de Golgi es también el sitio de síntesis de la mayoría de los
polisacáridos complejos de una célula, incluidas las cadenas de
glucosaminoglucanos del proteoglucano y las pectinas y hemicelulosas que se
encuentran en las paredes celulares de las plantas.

El movimiento de materiales a través del complejo de Golgi


Se suponía que las cisternas de Golgi se formaron en la cara cis de la pila median-te la
fusión de portadores membranosos del ER y ERGIC y que cada cisterna se movía
físicamente desde la cis al extremo trans de la pila, cambiando en composición a medida
que progresaba. Esto se conoce como el modelo de maduración cisternal
Modelo de transporte vesicular, la carga se transporta a través de la pila de Golgi,
desde la CGN al TGN, en vesículas que brotan de un compartimiento de membrana y se
fusionan con un compartimiento vecino más adelante a lo largo de la pila.

Los materiales se transportan entre compartimientos mediante vesículas que brotan de


las membranas donantes y se fusionan con membranas aceptoras.

Las tres vesículas recubiertas mejor estudiadas son las siguientes:


1. Las vesículas recubiertas con COPII mueven los materiales del ER “hacia
adelante” al complejo ERGIC y Golgi. (COP es un acrónimo de proteínas de la
cubierta).
2. Las vesículas recubiertas de COPI mueven los materiales en dirección retrógrada
 Desde ERGIC y pilas de Golgi hacia “atrás” hacia el ER
 Desde cisternas de Golgi trans hacia atrás a cisternas de Golgi cis.
3. Las vesículas recubiertas de clatrina mueven los materiales del TGN a los
endosomas, lisosomas y vacuolas de las plantas. También mueven materiales de
la membrana plasmática a compartimientos citoplásmicos a lo largo de la vía
endocítica. También han sido implicados en el tráfico de endosomas y lisosomas.

La capa de COPI se compone de un complejo de siete proteínas llamado coatómero.

Los estudios sugieren que las proteínas se mantienen en un organelo mediante


una combinación de dos mecanismos:
1. Retención de moléculas residentes que están excluidas de las vesículas de
transporte. La retención puede basarse por lo general en las propiedades físicas
de la proteína.
2. Recuperación de moléculas “escapadas” de vuelta al compartimiento en el que
normalmente residen.

La red trans Golgi (TGN), que es la última parada en el complejo de Golgi, funciona
como una importante estación de clasificación, que dirige las proteínas a varios destinos.
La mejor comprensión de las vías posGolgi es una que lleva enzimas lisosomales.

El término adaptador describe una molécula que vincula físicamente dos o más
componentes.

Las enzimas lisosomales son escoltadas del TGN por una familia de proteínas
adaptadoras llamadas GGAs.

CAPÍTULO 8, PÁG.: 286-304

Las vesículas del ER, por ejemplo, se fusionan con la red ERGIC o cis de Golgi y no con
una cisterna trans. La fusión selectiva es uno de los factores que asegura un flujo dirigido
a través de los compartimientos membranosos de la célula.

1- Movimiento de la vesícula hacia el compartimiento blanco específico.

Estos tipos de movimiento están mediados en gran parte por microtúbulos y sus proteínas
motoras asociadas, que actúan de manera análoga a un sistema ferroviario que
transporta carga a lo largo de trayectorias definidas hacia destinos predeterminados.

2- Anclar las vesículas al compartimiento blanco.

Se han descrito dos grupos de proteínas de anclajes proteínas fibrosas en forma de


bastón que son capaces de formar un puente molecular entre las dos membranas a una
distancia considerable (50-200 nm) y grandes complejos multiproteicos que parecen
mantener las dos membranas en una proximidad más cercana.

Gran parte de la especificidad entre la vesícula y el objetivo puede ser conferida por una
familia de pequeñas proteínas G llamadas Rab, que ciclan entre un esta-do activo unido
a GTP y un estado inactivo unido a GTP.

Con más de 60 genes Rab diferentes identifica-dos en humanos.


3- Acoplamiento de vesículas en el compartimiento blanco.

Las proteínas clave que participan en estas interacciones se llaman SNARE, y


constituyen una familia de más de 35 proteínas de membrana cuyos miembros están
localizados en compartimientos subcelulares específicos.

Todos contienen un segmento en su dominio citosólico llamado motivo SNARE que


consta de 60-70 aminoácidos capaces de formar un complejo con otro motivo SNARE.

v-SNARE, que se incorporan a las membranas de las vesículas de transporte durante la


gemación, y t-SNARE, que se localizan en las membranas de los compartimientos blanco

Es interesante observar que los SNARE de la vesícula sináptica y la membrana


presináptica son los objetivos de dos de las toxinas bacterianas más potentes: las
responsables del botulismo y el tétanos.

La escisión de las SNARE neuronales por las toxinas bloquea la liberación de


neurotransmisores, lo que causa la parálisis.

4- Fusión entre las vesículas y las membranas objetivo.

Vesículas lipídicas artificiales (liposomas)

La capacidad de fusión de una vesícula y una membrana blanco particular está


determinada por la combinación específica de proteínas que interactúan, que incluyen
proteínas de anclaje, Rab y SNARE que pueden ensamblarse en ese sitio en la célula.

EXOCITOSIS:

La fusión de una vesícula secretora o gránulo secretor con la membrana plasmática y


posterior descarga de su contenido se llama exocitosis.

Los ejemplos mejor estudiados de exocitosis son aquellos que ocurren durante la secreción
regulada, especialmente la liberación de neurotransmisores en la hendidura sináptica.

LISOSOMAS

Los lisosomas son organelos digestivos de una célula animal. Un lisosoma típico contiene
al menos 50 enzimas hidrolíticas diferentes producidas en el ER rugoso y dirigidas a estos
organelos.

Todas tienen su actividad óptima a un pH ácido y, por tanto, son hidrolasas ácidas.

La concentración de protón interna ácida se mantiene mediante una bomba de protones


presente en la membrana límite del organelo.
Célula de Kupffer, una célula fagocítica en el hígado que envuelve los glóbulos rojos
envejecidos.

Muchos organismos unicelulares individuales ingieren partículas de alimentos, que luego


se desensamblan enzimáticamente en un lisosoma. Los nutrientes resultantes pasan a
través de la membrana lisosomal hacia el citosol.

En los mamíferos, las células fagocíticas, como los macrófagos y los neutrófilos,
funcionan como carroñeros que ingieren desechos y microorganismos potencialmente
peligrosos.

El recambio de organelos, es decir, la destrucción regulada de los propios organelos de


la célula y su reemplazo

AUTOFAGIA, un organelo, como la mitocondria, está rodeado por una estructura de


doble membrana (o fagoforo) para producir una vesícula secuestrante de doble
membrana llamada autofagosoma. En las células de los mamíferos, se cree que los
autofagosomas se forman por primera vez a partir de los sitios de contacto entre el ER y
las membranas externas mitocondriales. Una vez formada, la membrana externa del
autofagosoma se fusiona con un lisosoma, generando una estructura llamada
autolisosoma, en la que tanto la membrana interna del autofagosoma como los
contenidos incluidos se degradan.

Una vez que se ha completado el proceso digestivo en el autolisosoma, el organelo se


denomina cuerpo residual

VACUOLAS DE CÉLULAS VEGETALES

Muchos de los solutos y macromoléculas de una célula, incluidos iones, azúcares,


aminoácidos, proteínas y polisacáridos, se alma-cenan temporalmente en la vacuola.

La membrana que limita la vacuola, el tonoplasto, contiene varios sistemas de transporte


activos que bombean iones en el compartimiento vacuolar a una concentración mucho
más alta que la del citoplasma o el fluido extracelular.

Debido a su alta concentración de iones, el agua ingresa a la vacuola por ósmosis.

Las vacuolas de las plantas también son sitios de digestión intracelular

Las vacuolas vegetales tienen algunas de las mismas hidrolasas ácidas que se
encuentran en los lisosomas.

Muchas de las proteínas de una vacuola vegetal se sintetizan en los ribosomas del RER
unidos a la membrana, se transportan a través del complejo de Golgi y se clasifican en la
cara trans del Golgi antes de dirigirse a la vacuola.
ENDOCITOSIS

La vía endocítica, en la que los segmentos de la membrana plasmática se invaginan para


formar vesículas citoplásmicas que se transportan al interior de la célula.

La endocitosis es un proceso principalmente por el cual la célula internaliza receptores


de superficie celular y ligandos extracelulares unidos.

La fagocitosis describe la absorción de material particulado.

La endocitosis a gran escala (también conocida como pinocito-sis) es la captación no


específica de fluidos extracelulares.

La endocitosis mediada por receptor (RME), que también se denomina endocitosis


mediada por clatrina, provoca la captación de macromoléculas extracelulares específicas
(ligandos) después de su unión a los receptores en la superficie externa de la membrana
plasmática.

La construcción geométrica de la capa se deriva de la estructura de sus bloques de


construcción de clatrina. Cada molécula de clatrina consiste en tres cadenas pesadas y
tres cadenas ligeras, unidas en el centro para formar un conjunto de tres patas llamados
triskelion

La dinamina es una proteína grande unida a GTP que se re-quiere para la fisión de la
vesícula de la membrana sobre la que se forma.

LA VÍA ENDOCÍTICA

Un grupo de receptores, al que nos referiremos como “receptores de limpieza”, es


responsable de la absorción de los materiales que utilizará la célula. Los ejemplos mejor
estudiados son los receptores de transferrina y LDL (lipoproteína de baja densidad), que
median la entrega a las células de hierro y colesterol, respectivamente.

“receptores de señalización”, son responsables de unir ligandos extracelulares que


llevan mensajes que cambian las actividades de la célula.

Regulación negativa del receptor, que tiene el efecto de reducir la sensibilidad de la


célula a la estimulación adicional por la hormona o el factor de crecimiento.

La etiqueta es una pequeña proteína llamada ubiquitina, que se agrega enzimáticamente.

Los materiales unidos a vesículas se transportan a una red dinámica de túbulos y


vesículas conocidas colectivamente como endosomas

Los endosomas se dividen en dos clases: endosomas tempranos, que típicamente se


localizan cerca de la región periférica de la célula, y endosomas tardíos, que típicamente
se localizan más cerca del núcleo.
El colesterol es una molécula hidrofóbica que se transporta en la sangre como parte de
grandes complejos de lipoproteínas, como la lipoproteína de baja densidad (LDL)

Cada partícula de LDL contiene un núcleo central de casi 1 500 moléculas de colesterol
esterificadas a ácidos grasos de cadena larga.

Aterosclerosis, una condición caracterizada por la formación de placas en el


revestimiento interno de las arterias que reducen el flujo de sangre a través del vaso y
actúan como sitios para la formación de coágulos sanguíneos.

Los coágulos de la sangre que bloquean las arterias coronarias son la principal causa de
infarto de miocardio (ataque cardiaco).

La reducción de los niveles de LDL en la sangre se logra con mayor facilidad mediante la
administración de medicamentos llamados estatinas que bloquean la HMG CoA
reductasa, una enzima clave en la síntesis del colesterol

La LDL sirve en lo fundamental para transportar moléculas de colesterol del hígado,


donde se sintetizan y empacan, a través de la sangre a las células del cuerpo. HDL lleva
colesterol en la dirección opuesta.

FAGOCITOSIS

Se lleva a cabo de forma extensiva por algunos tipos de células especializadas para la
captación de partículas relativamente grandes (>0.5 μm de diámetro) del entorno.

Una vez dentro del fagocito, los microorganismos pueden ser destruidos por enzimas
lisosomales o por radicales libres de oxígeno generados dentro del lumen del fagosoma.

Captación postraduccional de proteínas por peroxisomas, mitocondrias y cloroplastos

El tráfico de proteínas dentro de una célula eucariota se rige por

1) señales de clasificación, como el péptido señal de proteínas secretadas o grupos


manosafosfato de enzimas lisosomales,
2) receptores que reconocen estas señales y entregan proteínas que los contienen
en el compartimiento adecuado.

Cuatro de los principales organelos de la célula (núcleo, mitocondrias, cloroplastos y


peroxisomas) importan proteínas a través de una o más membranas externas limitantes.

Las proteínas derivadas de un peroxisoma poseen una señal de orientación


peroxisomal, ya sea una PTS para una proteína de matriz peroxisomal o una mPTS para
una proteína de membrana peroxisomal.
Los receptores de PTS se unen a proteínas derivadas del peroxisoma con límite de eje
en el citosol y las transportan a la superficie del peroxisoma, donde pueden ingre-sar al
organelo.

La fusión de las vesículas permite la formación de un translocón peroxisomal completo,


que luego facilita el movimiento de las proteínas en el peroxisoma.

Las mitocondrias tienen cuatro subcompartimientos en los que se pueden liberar


proteínas: una membrana mitocondrial externa (OMM), membrana mitocondrial interna
(IMM), espacio intermembrana y matriz

El OMM contiene un complejo de importación de proteínas, el complejo TOM, que


incluye

1) receptores que reconocen y unen proteínas mitocondriales


2) canales revestidos de proteínas a través de los cuales los polipéptidos
desplegados se translocan a través de la membrana externa

CAPÍTULO 9, PÁG.: 309-333

El citoesqueleto está compuesto por tres estructuras fi-lamentosas bien definidas: los
microtúbulos, los filamentos de actina y los filamentos intermedios, que juntas
forman una elaborada red interactiva y dinámica.
Los microtúbulos son tubos largos, huecos y no ramificados formados por subunidades
de la proteína tubulina. Los filamentos de actina son estructuras sólidas y delgadas, a
menudo organizadas en una red de ramificación. Los filamentos intermedios son fibras
resistentes, similares a cuerdas, compuestas por una variedad de proteínas relacionadas.

EL CITOESQUELETO DE ESTAS CÉLULAS FUNCIONA COMO:


 Un andamio dinámico que proporciona un soporte estructural, el cual puede
determinar la forma de la célula y resistir las fuer-zas que tienden a deformarla.
 Un marco interno responsable de posicionar los diversos organelos dentro del
interior de la célula.
 Una red de rieles que dirigen el movimiento de materiales y organelos dentro de
las células.
 El aparato generador de fuerza que mueve las células de un lugar a otro. Los
organismos unicelulares se mueven “arrastrándose” sobre la superficie de un
sustrato sólido o impulsándose a través de su entorno acuoso con la ayuda de
organelos locomotores (cilios y flagelos) especializados que contienen
microtúbulos y que sobresalen de la superficie de la célula.
 Un componente esencial de la maquinaria de división de la célula. Los elementos
del citoesqueleto constituyen el aparato responsable de separar los cromosomas
durante la mitosis y la meiosis y de dividir la célula madre en dos células hijas
durante la citoquinesis.

ESTRUCTURA Y FUNCIÓN DE LOS MICROTÚBULOS

Se encuentran en el citoesqueleto, el huso mitótico, los centriolos y el núcleo de cilios y


flagelos. Funcionan en diversas actividades, como el soporte de la célula y el movimiento
de materiales entre la célula y las terminales de una neurona.

Tienen un diámetro exterior de 25 nm, un grosor de pared de aproximadamente 4 nm y


pueden extenderse a lo largo o ancho de una célula.

La pared de un microtúbulo está compuesto por proteínas globulares dispuestas en filas


longitudinales, denominadas protofilamentos

Se observa que los microtúbulos consisten en 13 protofilamentos alineados uno al lado


del otro en un patrón circular dentro de la pared

Los microtúbulos preparados a partir de tejido vivo que normal-mente contienen proteínas
adicionales, se llaman proteínas asociadas a microtúbulos (MAP).

Las primeras MAP que se identifican se conocen como “MAP clásicas” y generalmente
tienen un dominio que se une al lateral de un microtúbulo y otro dominio que sobresale
hacia afuera como una cola desde la superficie del microtúbulo.

Los filamentos enredados (llamados marañas neurofibrilares) son moléculas que están
excesivamente fosforiladas y son incapaces de unirse a los microtúbulos.

Los filamentos neurofibrilares contribuyen a la muerte de las células nerviosas, pero si


estos filamentos en realidad provocan la degeneración neuronal o si son solo una
consecuencia de la muerte neuronal continúa siendo un tema controvertido.

El axón de una neurona motora individual puede extenderse desde la médula espinal
hasta la punta de un dedo de la mano o del pie.
Los diferentes materiales se mueven a ritmos distintos, y el transporte axonal más rápido
se produce a velocidades de 5 μm por segundo.

PROTEÍNAS MOTORAS: LAS CINESINAS Y LAS DINEÍNAS


Las proteínas motoras de una célula convierten la energía química (almacenada en ATP)
en energía mecánica, que se usa para generar fuerza, como cuando una célula muscular
se contrae o para mover carga celular conectada al motor.

Las cinesinas y las dineínas se mueven a lo largo de microtúbulos, mientras que las
miosinas lo hacen a través de los filamentos de actina.
Los pasos en el ciclo químico incluyen la unión de una molécula de ATP al motor, la
hidrólisis de ATP, la liberación de los productos (ADP y Pi) del motor, y la unión de una
nueva molécula de ATP.

En 1985 Ronald Vale y sus colegas aislaron una proteína motora del citoplasma de los
axones gigantes de los calamares que usaban microtúbulos como su rastro. Llamaron a
la proteína cinesina, que se encuentra sustancialmente en casi todas las células
eucariotas.

Una superfamilia de proteínas relacionadas, llamadas proteínas relacionadas con


cinesina (KRP). Las KRP se clasifican en 14 familias diferentes (cinesina-1 a cinesina-
14)
Los miembros de la superfamilia de cinesina están fuertemente implicados como agentes
generadores de fuerza que impulsan el movimiento de esta carga limitada a la membrana.

El movimiento de las moléculas de cinesina, tanto in vitro como in vivo, es altamente


progresivo, lo que significa que la proteína motora tiende a moverse a lo largo de un
microtúbulo individual a distancias considerables (más de 1 μm) sin caerse.

El primer motor asociado a microtúbulos fue descubierto en 1963 como la proteína


responsable del movimiento de cilios y flagelos. La proteína se denominó dineína.

La dineína citoplásmica es una proteína enorme compuesta de dos cadenas pesadas


idénticas y una variedad de cadenas intermedias y ligeras

Un cuerpo de evidencia sugiere al menos dos papeles bien estudiados para la


dineína citoplásmica:
1. Como un agente generador de fuerza para posicionar el huso y mover los
cromosomas durante la mitosis.
2. Como un motor microtubular negativo dirigido a los extremos con un papel en el
posicionamiento del centrosoma y el complejo de Golgi y en el movimiento de
organelos, vesículas y partículas a través del citoplasma.

Las cinesinas y la dineína citoplásmica mueven materiales similares en direcciones


opuestas sobre la misma red de rieles

CENTROS ORGANIZADORES DE MICROTÚBULOS (MTOC)

La función de un microtúbulo dentro de una célula viva depende de su ubicación y


orientación

La nucleación de los microtúbulos se produce rápidamente dentro de una célula, don-de


se produce en asociación con una variedad de estructuras especializadas llamadas
centros organizadores de microtúbulos

El centrosoma, una estructura compleja que contiene dos centriolos en forma de barril
rodeados por material pericentriolar (PCM) amorfo y electrodenso

Todos los MTOC comparten un componente de proteína común, un tipo de tubulina


llamado gammatubulina, que se descubrió por primera vez a finales de la década de
1980 por Berl Oakley y sus colaboradores utilizando pantallas genéticas en el hongo
Aspergillus

DINÁMICA DE MICROTÚBULOS

Los microtúbulos del huso mitótico o el citoesqueleto son extremadamente lábiles, es


decir, sensibles al desensamblaje. Los microtúbulos de las neuronas maduras son mucho
menos lábiles, y los de centriolos, cilios y flagelos son muy estables.

El desmontaje puede ser inducido por la temperatura fría, la presión hidrostática, la


concentración elevada de Ca2+ y una variedad de productos químicos.

El taxol se une al polímero de microtúbulos, inhibiendo su desensamblaje, evitando así


que la célula ensamble nuevas estructuras microtubulares según sea necesario.

Los microtúbulos se logran mediante una combinación de dos mecanismos


separados:
1) la reorganización de los micro-túbulos existentes
2) el desmontaje de los microtúbulos existentes y el reensamblaje de los nuevos en
diferentes regiones de la célula
Debido a que el cambio de crecimiento a contracción ocurre con alta frecuencia in vivo,
la mayoría de los microtúbulos desaparecen de la célula en cuestión de minutos y son
reemplazados por nuevos microtúbulos que crecen desde el centrosoma.

La inestabilidad dinámica explica la observación


1) de que los microtúbulos en crecimiento y contracción pueden coexistir en la misma
región de una célula
2) que un microtúbulo determinado puede cambiar de forma impredecible
(estocástica) entre fases de crecimiento y acortamiento,

La inestabilidad dinámica también permite que las células respondan rápidamente a las
condiciones cambiantes que requieren la remodelación del citoesqueleto microtubular.

ESTRUCTURA Y FUNCIÓN DE LOS CILIOS Y FLAGELOS

Los cilios y flagelos son organelos en forma de pelos, a veces móviles, que se proyectan
desde la superficie de una variedad de células eucariotas.

Un cilio puede asemejarse a un remo ya que mueve la célula en una dirección


perpendicular al propio cilio.
En su carrera de poder, el cilio se mantiene en un estado rígido cuando empuja contra el
medio circundante. En su carrera de recuperación, el cilio se vuelve flexible, ofreciendo
poca resistencia al medio.

No todos los cilios son móviles: casi todas las células del cuerpo humano contienen un
único cilio no móvil (llamado un cilio primario) que se cree que tiene una función
sensorial, el seguimiento de las propiedades mecánicas y químicas de los fluidos
extracelulares

Los cilios sensoriales especializados incluyen cilios que detectan el flujo de fluido en
el riñón, los cilios olfativos en la nariz que perciben el olor y los segmentos externos de
las células de la vara y el cono en la retina, que de hecho son cilios primarios altamente
especializados.

El núcleo del cilio, llamado axonema, contiene una matriz de microtúbulos que recorren
longitudinalmente todo el organelo.

El axonema de un cilio o un flagelo móvil consiste en nueve microtúbulos dobles


periféricos que rodean un par central de microtúbulos individuales
Dineínas axonemales, complejos proteicos relacionados con la dineína citoplásmica que
son responsables de generar el movimiento de flexión en cilios y flagelos.

1993 que Joel Rosenbaum y sus colegas en la universidad de Yale observaron el


movimiento de partículas en el espacio entre los dobletes periféricos y la membrana
plasmática circundante y denominó a este movimiento transporte intraflagelar (IFT)

Las partículas en movimiento que se ven en el IFT son complejos de 20 proteínas,


conocidas como proteínas IFT, que se ensamblan en un complejo de proteína llamado
partícula IFT. Estas partículas IFT se alinean para formar matrices lineales llamadas
trenes IFT, y estos trenes se trasladan a la punta del cilio a través de los extremos más
y menos de la proteína motora, la cinesina.

La fuerza de deslizamiento es generada por puentes cruzados en forma de trinquete que


residen en la cabeza de la molécula de miosina.

 Pasó 1, los brazos de dineína anclados a lo largo del túbulo A del tercio superior
inferior se unen a los sitios de unión en el túbulo B del doblete superior.
 Pasó 2, las moléculas de dineína experimentan un cambio de conformación, o
golpe de poder, que hace que el doblete inferior se deslice hacia el extremo basal
del doblete superior.
 Pasó 3, los brazos de dineína se han desprendido del túbulo B del doblete superior.
 Pasó 4, los brazos se han vuelto a unir al doblete superior para que pueda
comenzar otro ciclo.

CAPÍTULO 9, PÁG.: 335-358

FILAMENTOS INTERMEDIOS

Filamentos sólidos no ramificados con un diámetro de 10-12 nm, están codificadas por
aproximadamente 70 genes diferentes.
Los filamentos intermedios solo se han identificado en células animales. Los filamentos
intermedios son fibras fuertes, flexibles y similares a los cables que proporcionan
resistencia mecánica a las células que están sometidas a estrés físico, incluidas las
neuronas, las células musculares y las células epiteliales que recubren las cavidades del
cuerpo.

El dominio fibroso central está flanqueado en cada lado por dominios globulares de
tamaño y secuencia variables

Los IF es un tetrámero en forma de varilla, formado por dos dímeros que se alinean lado
a lado de forma escalonada con sus extremos N y C apuntando en direcciones opuestas

A diferencia de los otros dos elementos principales del citoesqueleto, el ensamblaje y el


desmontaje de los IF se controlan principalmente por fosforilación y desfosforilación de
las subunidades.

Los filamentos de queratina constituyen las proteínas estructura-les primarias de las


células epiteliales

LA ACTINA

Está involucrada en procesos móviles intracelulares, como el movimiento de vesículas,


la fagocitosis y la citoquinesis. Juega un papel importante en la determinación de las
formas de las células y puede proporcionar un soporte estructural para varios tipos de
proyecciones celulares.

La mayoría de los procesos que involucran la actina requieren la actividad de las


proteínas motoras, específicamente las de la superfamilia de la miosina.

La actina es una ATPasa

Los eventos que ocurren durante el ensamblaje/desensamblaje de actina in vitro


dependen de la concentración de monómeros de actina y de la dinámica de elongación
de los extremos del filamento.

LA MIOSINA: EL MOTOR MOLECULAR DE LA ACTINA

Todas las miosinas comparten un dominio motor (cabeza) característico. La cabeza


contiene un sitio que se une a un filamento de actina y un sitio que se une e hidroliza el
ATP para impulsar el motor de la miosina.

Generalmente se dividen en dos grandes grupos: las miosinas convencionales (o tipo


II), que se identificaron por primera vez en el tejido muscular, y las miosinas no
convencionales. Estas se subdividen sobre la base de la secuencia de aminoácidos en
al menos 17 clases diferentes (tipo I y tipos III-XVIII).
Los humanos contienen alrededor de 40 miosinas diferentes de al menos 12 clases, cada
una de las cuales se presume que tiene su propia función especializada.

El examen de la molécula muestra que consiste en

1) Un par de cabezas globulares que contienen el sitio catalítico de la molécula;


2) Un par de cuellos, cada uno formado por una única alfahélice ininterrumpida y dos
cadenas ligeras asociadas
3) Una única cola larga en forma de vara formada por el entrelazado de largas
secciones alfahelicoidales de las dos cadenas pesadas.

Miosinas convencionales (tipo II)

Son los principales motores para la contracción muscular, pero también se encuentran
en una variedad de células no musculares. El genoma humano codifica 16 cadenas
pesadas de miosina II diferentes, tres de las cuales funcionan en células no musculares.
Se mueven hacia el extremo con púas de un filamento de actina.

La porción de cola fibrosa de una molécula de miosina II desempeña un papel estructural,


lo que permite que la proteína forme filamentos.

Miosinas no convencionales

En 1973 Thomas Pollard y Edward Korn de los Institutos Nacionales de la Salud


describieron una proteína única similar a la miosina que se extrajo del protista
Acanthamoeba. Esta miosina no convencional más pequeña tenía una sola cabeza y no
podía ensamblarse en filamentos in vitro; la proteína se conoce como miosina I.

La miosina I a menudo sirve como un enlace cruzado entre los filamentos de actina del
citoesqueleto y la bicapa lipídica de la membrana plasmática.

En los mamíferos, los gránulos de pigmento (melanosomas) son transporta-dos en los


procesos periféricos finos de la célula de pigmento por una de las isoformas de la miosina
V llamados Va.

Los ratones que carecen de actividad de miosina Va no pueden transferir melanosomas


a los folículos capilares, lo que hace que su pelaje tenga un color mucho más claro.

ORGANIZACIÓN MUSCULAR Y CONTRACCIÓN

Los músculos esqueléticos derivan su nombre del hecho de que la mayoría de ellos están
anclados a los huesos que se mueven.

Una única célula muscular de forma cilíndrica tiene típicamente un grosor de 10 a 100
μm, más de 100 mm de largo y contiene cientos de núcleos.
Una sección longitudinal de una fibra muscular revela un cable formado por cientos de
hebras cilíndricas más delgadas, llamadas miofibrillas. Cada miofibrilla consiste en una
matriz lineal repetitiva de unidades contráctiles, llamadas sarcómeros. Cada sarcómero
a su vez exhibe un patrón de bandas característico, que le da a la fibra muscular una
apariencia rayada o estriada.

Dos tipos distintos de filamentos, filamentos finos y filamentos gruesos

Andrew Huxley y Rolf Niedergerke, y Hugh Huxley y Jean Hanson, propusieron un modelo
de gran alcance en 1954 para explicar la contracción muscular. Propusieron que el
acortamiento de los sarcómeros individuales no se debía al acortamiento de los
filamentos, sino a que se deslizaran unos sobre otros.

Los filamentos delgados de un músculo esquelético contienen otras dos proteínas, la


tropomiosina y la troponina

La tropomiosina es una molécula alargada (de aproximadamente 40 nm de longitud)


que se ajusta de forma segura en los surcos dentro del filamento delgado.

Cada filamento grueso está compuesto por varios cientos de moléculas de miosina II
junto con pequeñas cantidades de otras proteínas.

La tercera proteína más abundante de los músculos esqueléticos de los vertebrados es


la titina, que es la proteína más grande aún por descubrir en cualquier organismo.

El gen de titina de longitud completa codifica un polipéptido de más de 3.5 millones de


daltones en masa molecular y que contiene más de 38 000 aminoácidos.

La titina es una proteína altamente elástica que se estira como un resorte molecular a
medida que ciertas regiones dentro de la molécula se desenrollan.

Durante una contracción, cada cabeza de miosina se extiende hacia afuera y se une
fuertemente a un filamento delgado, formando los puentes cruzados que se ven entre los
dos tipos de filamentos

La publicación de la primera estructura atómica del fragmento de miosina II S1 en


1993 por Ivan Rayment, Hazel Holden y sus colegas de la Universidad de Wisconsin
centró la atención en una propuesta para explicar su mecanismo de acción.

Las moléculas de miosina con cuellos más cortos generan desplazamientos más
pequeños, mientras que las que tienen cuellos más largos generan mayores
desplazamientos.

Cuando una molécula de ATP se une a la cabeza de miosina, un evento que induce la
disociación del puente cruzado del filamento de actina.
La liberación del ADP unido va seguida de la unión de una nueva molécula de ATP para
que pueda comenzar un nuevo ciclo.

La incapacidad de los puentes cruzados de miosina para desprenderse en ausencia de


ATP es la base de la condición de rigor mortis

El punto de contacto de un término de un axón con una fibra muscular se denomina unión
neuromuscular

Los pasos que vinculan la llegada de un impulso nervioso a la membrana plasmática del
músculo con el acortamiento de los sarcómeros en las profundidades de la fibra muscular
constituyen un proceso denominado acoplamiento de excitación-contracción.

El impulso generado en una célula del músculo esquelético se propaga hacia el interior
de la célula a lo largo de pliegues membranosos llamados túbulos transversales (T).
Los túbulos T terminan muy cerca de un sistema de membranas citoplásmicas que
forman el retículo sarcoplásmico (SR), que forma una manga membranosa alrededor
de la miofibrilla.

LAS PROTEÍNAS DE UNIÓN A LA ACTINA

Las estructuras altamente ordenadas que se ven en las células musculares representan
una forma en que las redes de actina se pueden organizar en las células para orquestar
la contractilidad y el movimiento.

La actina purificada puede polimerizarse in vitro para formar filamentos de actina, pero
estos no pueden interactuar entre sí o realizar actividades útiles.

Proteínas de unión a actina, afectan el ensamblaje localizado o el desmontaje de los


filamentos de actina, sus propiedades físicas y sus interacciones entre sí y con los
organelos celulares

Las proteínas de unión a actina se pueden dividir en varias categorías según su función
presunta en la célula:

1. Proteínas de nucleación.

Requiere que al menos tres monómeros de actina se unan en la orientación adecuada


para comenzar la formación del polímero.

La formación de un filamento de actina se acelera por la presencia de una semilla o


núcleo preexistente al que se pueden agregar monómeros

El complejo Arp2/3, que contiene dos “proteínas relacionadas con actina” (o Arps) —
proteínas que comparten una considerable homología de secuencia con las actinas, pero
que no se consideran actinas “verdaderas”.
2. Proteínas para secuestro de monómeros.

Las timosinas son proteínas que se unen a los monómeros de actina-ATP y evitan que
se polimericen.

3. Proteínas que bloquean o tapan.

Regulan la longitud de los filamentos de actina uniéndose a uno u otro extremo de los
filamentos, formando un tapón que bloquea tanto la pérdida como la ganancia de las
subunidades.

4. Proteínas de unión a monómeros.

La profilina promueve el crecimiento de los filamentos de actina. La profilina lo hace


uniéndose a un monómero de actina y catalizando la disociación de su ADP unido, que
se reemplaza rápidamente por ATP.

5. Proteínas despolimerizadoras.

Su papel en el rápido cambio de filamentos de actina en sitios de cambios dinámicos en


la estructura del citoesqueleto. Son esenciales para la locomoción celular, la fagocitosis
y la citoquinesis

6. Proteínas que forman enlaces cruzados.

Pueden alterar la organización tridimensional de una población de filamentos de actina.


Tienen la forma de una barra larga y flexible y promueven la formación de redes sueltas
de filamentos interconectados en ángulos rectos entre sí

7. Proteínas cortadoras de filamentos.

Tienen la capacidad de unirse al lado de un filamento existente y partirlo en dos.

8. Proteínas que se unen a la membrana.

Las fuerzas generadas por las proteínas contráctiles actúan sobre la membrana
plasmática, haciendo que sobresalga o invagine

MOTILIDAD CELULAR

Una variedad de actividades dinámicas en células no musculares, que incluyen


citoquinesis, fagocitosis, transmisión citoplásmica, tráfico de vesículas, activación de
plaquetas sanguíneas, movimientos laterales de proteínas integrales dentro de las
membranas, interacciones célula-sustrato, locomoción celular, crecimiento axonal y
cambios en la forma de las células.
Aunque las células móviles pueden adoptar formas muy diferentes a medida que se
arrastran sobre un sustrato, muestran una secuencia similar de actividades

La clave de la locomoción del fibroblasto se ve al examinar su borde anterior, que se


extiende desde la célula como una protrusión ancha, aplanada y en forma de velo,
llamada lamelipodio

WASP, el miembro fundador de la familia, fue descubierto como el producto de un gen


responsable del síndrome de Wiskott-Aldrich.

Las principales fuerzas involucradas en la locomoción celular son aquellas


generadas en los sitios de adhesión que se requieren para tirar o “remolcar” el cuerpo
principal de la célula hacia adelante
Semana 16
INTERACCIONES ENTRE LAS CÉLULAS Y SU ENTORNO
MATRIZ EXTRACELULAR

Glucocálix media las interacciones célula-célula y célula-sustrato, proporciona


protección mecánica a las células, actúa como una barrera para las partículas que se
mueven hacia la membrana plasmática y une importantes factores reguladores que
actúan sobre la superficie celular

Matriz extracelular (ECM): una red organizada de moléculas secretadas que


proporciona andamiaje a las células y tejidos que rodea

La membrana basal (o lámina basal), una lámina continua de 50 a 200 nm de espesor


que

1) rodea las fibras nerviosas, los músculos y las células grasas


2) subyace a la superficie basal de los tejidos epiteliales, como la epidermis de la piel,
o el revestimiento de los tractos digestivo y respiratorio,
3) subyace al revestimiento endotelial interno de los vasos sanguíneos.

Las membranas basales proporcionan soporte mecánico para las células unidas, generan
señales que mantienen la supervivencia celular, sirven como un sustrato para la
migración celular, separan los tejidos adyacentes dentro de un órgano y actúan como una
barrera para el paso de las macromoléculas. Sirven como una barrera para la invasión
de tejidos por células cancerígenas

COMPONENTES DE LA MATRIZ EXTRACELULAR

Incluyen colágenos, proteoglucanos y una variedad de proteínas, como la fibronectina y


la laminina.
LOS COLÁGENOS

Comprenden una familia de glucoproteínas fibrosas que están presentes solo en las
matrices extracelulares. Los colágenos se encuentran en todo el reino animal y se
destacan por su alta resistencia a la tracción, es decir, su resistencia a las fuerzas de
tracción.

El colágeno es la proteína más abundante en el cuerpo humano —constituye más de


25% de todas las proteínas—

 Se produce principalmente por los fibroblastos, células


 Se han identificado 28 tipos distintos de colágeno humano
 Las enzimas que agregan grupos hidroxilo a la lisina y a los aminoácidos de prolina
del colágeno requieren ácido ascórbico como coenzima.
 La capa media y gruesa de la córnea es el estroma, que contiene fibrillas de
colágeno relativamente cortas que se organizan en distintas capas.
 Los segmentos no helicoidales hacen que la molécula sea flexible, mientras que
los extremos globulares sirven como sitios de interacción entre las moléculas que
le dan al complejo su carácter reticular

Fibrosis es el resultado de la producción excesiva de tejido conectivo que contiene


colágeno.

Osteogénesis imperfecta, una enfermedad potencialmente mortal que se caracteriza


por huesos extremadamente frágiles, piel delgada y tendones débiles.

Las mutaciones en los genes que codifican colágeno tipo II alteran las propiedades del
tejido del cartílago y causan enanismo y deformidades esqueléticas.

Síndrome de Alport, una enfermedad renal hereditaria en la que se altera la membrana


basal glomerular

PROTEOGLUCANO

Consiste en una molécula de proteína central a la cual se unen de forma covalente


cadenas de glicosaminoglicanos

Forman un gel poroso e hidratado que llena el espacio extracelular como material de
empaque y resiste las fuerzas de aplastamiento

FIBRONECTINA

Matriz implica una estructura compuesta por una red de componentes que interactúan.
 La fibronectina, consiste en una matriz lineal de distintos “bloques de construcción”
o dominios, que le da a cada polipéptido una construcción modular
 En la fibronectina, los aproximadamente 30 dominios Fn se combinan para formar
cinco o seis unidades funcionales más grandes
 La importancia de la fibronectina y otras proteínas extracelulares es
particularmente evidente durante el desarrollo embrionario.

LAMININA

Son una familia de glucoproteínas extracelulares que constan de tres cadenas


polipeptídicas diferentes unidas por enlaces disulfuro y organizadas en una molécula que
se asemeja a una cruz con tres brazos cortos y un brazo largo

Se han identificado 15 lamininas diferentes.

La degradación de los materiales extracelulares, junto con las proteínas de la superficie


celular, se logra en gran parte por una familia de enzimas que contienen zinc llamadas
metaloproteinasas de la matriz (MMP)

INTEGRINAS

Son una familia de proteínas de membrana que se encuentran solo en animales y


desempeñan una función clave en la integración de los entornos extracelular e
intracelular.

Están compuestas por dos cadenas de polipéptidos que se unen a las membranas, una
cadena α y una cadena β, que están unidas de manera no covalente.

Se han identificado 18 subunidades α y ocho subunidades β diferentes.

Las integrinas han sido implicadas en dos tipos principales de actividades: la adhesión
de las células a su sustrato y la transmisión de señales entre el entorno externo y el
interior de la célula.

Muchas de las proteínas extracelulares que se unen a las integrinas lo hacen porque
contienen la secuencia de aminoácidos arginina-glicina-ácido aspártico

ANCLAJE DE CÉLULAS A SU SUSTRATO

ADHESIONES FOCALES

La célula está anclada a la superficie del plato solo en sitios dispersos y discretos,
llamados adhesiones focales

Las fuerzas mecánicas aplicadas a las superficies de las células se pueden convertir por
las adhesiones focales en señales bioquímicas en el citoplasma.
HEMIDESMOSOMAS

Contienen una placa densa en la superficie interna de la membrana plasmática con


filamentos que salen hacia el citoplasma

Los filamentos del hemidesmosoma son más gruesos y se componen de la proteína


queratina.

INTERACCIONES DE LAS CÉLULAS CON OTRAS CÉLULAS

Cuatro familias diferentes de proteínas de membrana integrales desempeñan una función


principal en la mediación de la adhesión célula-célula:

1) selectinas
2) ciertos miembros de la superfamilia de inmunoglobulinas
3) ciertos miembros de la familia de las integrinas y
4) cadherinas.

Las selectinas comprenden una familia de glucoproteínas integrales de membrana que


reconocen y se unen a una disposición particular de azúcares en los oligosacáridos que
se proyectan desde las superficies de otras células

Hay tres selectinas conocidas: selectina E, presente en las células endoteliales;


selectina P, en plaquetas y células endoteliales, y selectina L, presente en los leucocitos

LA SUPERFAMILIA DE INMUNOGLOBULINAS

Inmunoglobulina (o Ig), consisten en cadenas polipeptídicas compuestas de varios


dominios similares. Cada uno de estos dominios de Ig, está compuesto de 70 a 110
aminoácidos organizados en una estructura fuertemente plegada

El genoma humano codifica 765 dominios de Ig distintos, lo que lo convierte en el dominio


más abundante en proteínas humanas.

Tomadas como un grupo, estas proteínas son miembros de la superfamilia de


inmunoglobulinas o IgSF.

CADHERINAS

Son una gran familia de glucoproteínas que median la adhesión célula-célula dependiente
de Ca2+ y transmiten señales desde la ECM al citoplasma.

Unen las células de tipo similar entre sí y lo hacen predominantemente uniéndose a la


misma cadherina presente en la superficie de la célula vecina.
Cuanto mayor es el número de cadherinas que interactúan en un grupo, mayor es la
fuerza de adhesión entre las células que se adhieren.

La transición epitelio-mesénquima (o EMT) se ilustra mediante la formación del


mesodermo durante la gastrulación en un pollo o embrión de mamífero. Estas células se
desprenden de una capa epitelial cohesiva (llamada epiblasto) en la superficie dorsal
del embrión temprano y migran hacia las regiones interiores como células
mesenquimales.

UNIONES ADHERENTES Y DESMOSOMAS

LAS UNIONES ADHERENTES

El revestimiento del intestino, donde aparecen como “bandas” que rodean cada una de
las células cerca de su superficie apical y unen esa célula con sus vecinos circundantes.

Las moléculas de cadherina que tienden un puente de unión de 30 nm entre las células
vecinas

Los desmosomas son uniones adhesivas en forma de disco de aproximadamente 1 μm


de diámetro que se encuentran en una variedad de tejidos.

Una de las funciones de las proteínas integrales de membrana es transferir información


a través de la membrana plasmática, un proceso conocido como señalización
transmembrana.

UNIONES GAP Y PLASMODESMOS: MEDIACIÓN DE LA COMUNICACIÓN


INTERCELULAR

Las uniones gap y los plasmodesmos son sitios especializados de comunicación entre
células adyacentes en animales y plantas, respectivamente. Las membranas plasmáticas
de una unión gap contienen canales que conectan el citoplasma de una célula con el
citoplasma de la célula adyacente.

Los plasmodesmos son canales citoplásmicos entre células adyacentes de plantas que
permiten el libre paso de moléculas de soluto.

UNIONES GAP

Son sitios entre las células animales que están especializados para la comunicación
intercelular.

Son sitios en los que las membranas plasmáticas de las células adyacentes se acercan
una a la otra (dentro de aproximadamente 3 nm) los canales de unión gap son
relativamente no selectivos.
Las uniones gap tienen una composición molecular simple; están compuestas
completamente por una proteína de membrana integral llamada conexina.

Las conexinas están organizadas en complejos multisubunidad, denominados


conexonas se compone de seis subunidades de conexinas dispuestas en un anillo
alrededor de una abertura central, o annulus, que tiene aproximadamente 1.5 nm de
diámetro en su superficie extracelular.

Las uniones gap:

 Pueden colocar un gran número de células de un tejido en contacto citoplásmico


íntimo.
 Tienen el potencial de integrar las actividades de las células individuales de un
tejido en una unidad funcional.
 Permiten a las células cooperar de forma metabólica al compartir metabolitos clave

Las conexinas (Cx), las proteínas de las cuales se construyen las uniones gap, son
miembros de una familia multigénica. Se han identificado aproximadamente 20 conexinas
diferentes con distintas distribuciones específicas de tejidos.

PLASMODESMOS

Las células vegetales se separan una de otra por una barrera sustancial: la pared celular.

La mayoría de las células vegetales están conectadas entre sí por los plasmodesmos.

Sirven como sitios de comunicación célula a célula, a medida que las sustancias pasan
a través del anillo que rodea al desmotúbulo.

Los plasmodesmos son canales citoplasmáticos que pasan a través de las paredes
celulares de las células adyacentes.

Los virus codificaban una proteína de movimiento que interactuaba con la pared del
plasmodesmo y aumentaba el diámetro del poro.

Semana 17
SEÑALIZACIÓN CELULAR Y TRANSDUCCIÓN DE
SEÑAL: COMUNICACIÓN ENTRE CÉLULAS
Las células generalmente se comunican entre sí a través de moléculas mensajeras
extracelulares.
Las células tienen que comunicarse entre sí, lo cual se realiza por un proceso llamado
señalización celular, el que hace posible que las células respondan de manera
apropiada a un estímulo ambiental específico.

Los mensajeros extracelulares pueden viajar una distancia corta y estimular las células
que están muy cerca del origen del mensaje, o pueden viajar a través de todo el cuerpo,
estimulando potencialmente células que están muy lejos de la fuente.

La señalización autocrina, la célula que está produciendo el mensajero expresa


receptores en su superficie que pueden responder a ese mensajero. En consecuencia,
las células que liberan el mensajero se estimularán (o inhibirán) a ellas mismas.

La señalización paracrina, las moléculas mensajeras viajan sólo distancias cortas a


través del espacio extracelular a las células que están muy cerca de la célula que está
generando el mensajero.

Durante la señalización endocrina, las moléculas mensajeras alcanzan su células


blanco a través del paso por el torrente sanguíneo. Los mensajeros endocrinos también
se llaman hormonas, y generalmente actúan sobre las células blanco ubicadas en sitios
distantes en el cuerpo.

Las células sólo pueden responder a un mensaje extracelular particular si expresan


receptores que reconocen específicamente y unen esa molécula mensajera

Un tipo de receptor transmite una señal desde su dominio citoplásmico a una enzima
cercana, que genera un segundo mensajero. Debido a que provoca (efectúa) la
respuesta celular mediante la generación de un segundo mensajero, la enzima
responsable se conoce como un efector. Los segundos mensajeros son pequeñas
sustancias que normalmente activan (o inactivan) proteínas específicas. Dependiendo de
su estructura química, un segundo mensajero puede difundirse a través del citosol o
permanecer incrustado en la bicapa lipídica de una membrana.

Si la señal se transmite por un segundo mensajero o por reclutamiento de proteínas, el


resultado es similar; una proteína que está posicionada en la parte superior de una vía
de señalización intracelular se activa

La mayoría de las “proteínas de señalización” están construidas de múltiples dominios,


lo que les permite interactuar de una manera dinámica con una serie de socios diferentes,
ya sea simultánea o secuencialmente.

La molécula que se une al receptor se llama ligando. Los distintos tipos de células
poseen diferentes complementos de receptores que les permiten responder a diversos
mensajeros extracelulares.
El genoma humano codifica más de 500 proteínas cinasas diferentes y
aproximadamente 150 proteínas fosfatasas diferentes.

La mayoría de las proteínas cinasas transfieren grupos fosfato a residuos de serina o


treonina de sus sustratos proteicos, pero un grupo muy importante de cinasas
(aproximadamente 90 en humanos) fosforila residuos de tirosina

Dependiendo del tipo de célula y mensaje, la respuesta iniciada por la proteína blanco
puede implicar un cambio en la expresión del gen, una alteración de la actividad de las
enzimas metabólicas, una reconfiguración del citoesqueleto, un aumento o disminución
en la movilidad de la célula, un cambio en la permeabilidad iónica, la activación de la
síntesis de DNA, o incluso la muerte de la célula.

Este proceso general, en el que la información transportada por moléculas mensajeras


extracelulares se traduce en cambios que ocurren dentro de una célula, es referido como
transducción de señal

MENSAJEROS EXTRACELULARES Y SUS RECEPTORES

Una gran variedad de moléculas puede funcionar como portadores extracelulares


de información. Estas incluyen:

 Aminoácidos y derivados de aminoácidos.


 Gases, como el NO y el CO.
 Esteroides, que se derivan del colesterol. Hormonas esteroides que regulan la
diferenciación sexual, el embarazo, el metabolismo de los carbohidratos y la
excreción de iones de sodio y potasio.
 Eicosanoides, que son moléculas no polares que contienen 20 carbonos que se
derivan de un ácido graso llamado ácido araquidónico.
 Una amplia variedad de polipéptidos y proteínas.
Los receptores que han evolucionado para mediar la transducción de señal se
indican a continuación.

1. Los receptores acoplados a proteína G (GPCR) son una gran familia de receptores
que contienen siete hélices alfa transmembrana. Estos receptores traducen la
unión de las moléculas de señalización extracelular en la activación de proteínas
de unión a GTP
2. La proteína tirosina cinasa receptora (RTK) representa una segunda clase de
receptores, estas proteínas cinasas fosforilan residuos de tirosina específicos de
las proteínas citoplásmicas de sustrato, alterando así su actividad, su localización,
o su capacidad de interactuar con otras proteínas dentro de la célula.
3. Los canales activados por ligando representan una tercera clase de receptores de
superficie celular que se unen a ligandos extracelulares. La habilidad de estas
proteínas para conducir un flujo de iones a través de la membrana plasmática está
regulada directamente por la unión del ligando.
4. Los receptores de hormonas esteroides funcionan como factores de transcripción
regulados por ligandos. Las hormonas esteroides se difunden a través de la
membrana plasmática y se unen a sus receptores, que están presentes en el
citoplasma.
5. Finalmente, existen otros tipos de receptores que actúan por mecanismos únicos.
Los receptores de células B y T que están implicados en la respuesta a antígenos
extraños, se asocian con moléculas de señalización conocidas, como las cinasas
citoplásmicas de la proteína tirosina

TRANSDUCCIÓN DE SEÑAL POR RECEPTORES ACOPLADOS A PROTEÍNA G

Los receptores acoplados a proteína G (GPCR) se denominan así porque interactúan con
las proteínas G, como se analiza a continuación. Los miembros de la superfamilia GPCR
también se denominan receptores transmembranales siete porque contienen siete
hélices transmembrana

Los receptores acoplados a proteína G normalmente tienen la siguiente topología. Su


terminación amino está presente en el exterior de la célula, las siete hélices alfa que
cruzan la membrana plasmática están relacionadas por asas de longitud variada, y la
terminación carboxilo está presente en el interior de la célula

Las proteínas G heterotriméricas fueron descubiertas, purifica-das y caracterizadas por


Martin Rodbell y sus colegas en los Institutos Nacionales de Salud, y Alfredo Gilman con
sus colegas en la Universidad de Virginia. Sus estudios se discuten en la “Vía
experimental”.

Estas proteínas se conocen como proteínas G por que unen nucleótidos de guanina, ya
sea GDP o GTP. Se describen como heterotriméricas porque todas ellas consisten de
tres subunidades de polipéptidos diferentes, llamadas α, β, y γ.

El mecanismo para transmitir señales a través de la membrana plasmática por las


proteínas G es de origen evolutivo antiguo y está muy conservado.

SEGUNDOS MENSAJEROS

Los fosfolípidos de las membranas celulares se convierten en segundos mensajeros por


una variedad de enzimas que están reguladas en respuesta a señales extracelulares. En
estas enzimas se incluyen las fosfolipasas (enzimas que hidrolizan a los lípidos), las
fosfolípidos cinasas (enzimas que fosforilan lípidos), y las fosfolípido fosfatasas (enzimas
que desfosforilan lípidos).
El isótopo se incorporó primeramente dentro del fosfatidilinositol, el cual se convirtió
rápidamente en otros derivados fosforilados, los cuales en conjunto se denominan
fosfoinosítidos.

Cuando la acetilcolina se une a una célula del músculo liso, o un antígeno se une a un
mastocito, el receptor ligado activa una proteína G heterotrimérica, que a su vez activa al
efector fosfoliasa específica de fosfatidilinositol

El cAMP se sintetiza por la adenilil ciclasa, una proteína integral de membrana cuyo
dominio catalítico reside en la superficie interna de la membrana plasmática. El cAMP
evoca una respuesta que conduce a la movilización de glucosa, lo cual inicia una cadena
de reacciones.

SEÑALIZACIÓN POR EL RECEPTOR DE INSULINA

Nuestros cuerpos realizan un esfuerzo considerable en mantener los niveles de glucosa


en sangre dentro de un rango estrecho. Un descenso en los niveles de glucosa en sangre
puede conducir a la pérdida de conciencia y al coma, debido a que el sistema nervioso
central depende en gran medida de la glucosa en sangre para su metabolismo energético.
Una elevación persistente de los niveles de glucosa en sangre resulta en una pérdida de
glucosa, fluidos y electrólitos en la orina y graves problemas de salud.

Cada receptor de insulina está compuesto de una cadena α y β, las cuales se derivan de
una única proteína precursora por el procesamiento proteolítico. La cadena α es
completamente extracelular y contiene el sitio de unión a insulina. La cadena β está
compuesta de una región extracelular, una sola región transmembrana, y una región
citoplásmica.

Las cadenas α y β están unidas por enlaces disulfuro.

El receptor de insulina es una excepción de esta regla debido a que se asocia con una
pequeña familia de proteínas adaptadoras, llamadas sustratos receptores de insulina
(IRS)

Los niveles elevados de insulina sobreestimulan las células blanco en el hígado y en otras
partes del cuerpo, que conducen a una condición referida como resistencia a la insulina,
en la cual estas células blanco detienen la respuesta en presencia de la hormona.

APOPTOSIS (MUERTE CELULAR PROGRAMADA)

La apoptosis o muerte celular programada es un proceso normal, exclusivo de las células


animales. La apoptosis ocurre mediante una secuencia orquestada de eventos que
conduce a la muerte de una célula. La muerte por apoptosis es un proceso limpio y
ordenado caracterizado por la contracción general en el volumen de la célula y su núcleo,
la pérdida de adhesión a las células vecinas, la formación de ampollas en la superficie
celular, la disección de la cromatina dentro de pequeños fragmentos, y el englobe rápido
de los “restos” por fagocitosis.

La necrosis se caracteriza por la inflamación tanto de la célula como de sus organelos


membranosos internos, la rotura de la membrana, la fuga del contenido celular hacia el
medio, y la inducción de inflamación.

El término apoptosis fue acuñado en 1972 por John Kerr, Andrew Wylie, y A. R. Currie
de la Universidad de Aberdeen, Escocia, en un documento que describe por primera vez
los even-tos coordinados que ocurrieron durante la muerte programada de un amplio
rango de células.

La identificación del gen CED-3 en los nemátodos conduce al descubrimiento de una


familia homóloga de proteínas en los mamíferos, la cual ahora se denomina caspasa.
Esta es un grupo distintivo de cisteínas proteasas (es decir, cisteínas proteasas con un
residuo de cisteína clave en su sitio catalítico) que son activadas en las etapas tempranas
de la apoptosis y son responsables de desencadenar la mayoría, si no todos, de los
cambios observados durante la muerte celular.

El dominio citoplásmico de cada subunidad del receptor TNF contiene un segmento de


alrededor de 70 aminoácidos llamado “dominio de la muerte” que media las
interacciones proteína-proteína.

Los estímulos internos, como el daño genético irreparable, la falta de oxígeno (la hipoxia),
las concentraciones extremadamente altas del Ca2+ citosólico, las infecciones virales, el
estrés del ER, o estrés oxidativo grave, desencadenan la apoptosis por la vía intrínseca

Necroptosis: la muerte celular necróptica provoca la rotura de la membrana plasmática,


causando contenidos celulares que son derramados dentro del ambiente, y a menudo
des-encadenando una respuesta inflamatoria, que con frecuencia puede ser beneficiosa,
por ejemplo, como un medio de guía inmunitaria de células a un sitio de infección.

Semana 18
CONTROL DE LA EXPRESIÓN GENÉTICA
Una diferencia principal entre los organismos procariotas y eucariotas es la presencia de
un núcleo en las células eucariotas. Además, la mayoría de los organismos eucariotas
tienen genomas mucho más grandes, que están presentes como moléculas de DNA de
doble cadena dispuestas en cromosomas lineales que pueden visualizarse con facilidad
durante la mitosis
Grandes genomas se empaquetan en complejos de DNA-proteína llamados cromatina.

Los contenidos del núcleo están presentes como una masa viscosa y amorfa de material
encerrada por una envoltura nuclear compleja que forma un límite entre el núcleo y el
citoplasma.

La envoltura nuclear consiste en dos membranas celulares dispuestas paralelas entre


sí y separadas por 10 a 50 nm. Juntas, estas membranas contienen más de 60 proteínas
transmembrana distintas, incluidas varias especies que unen la membrana nuclear
externa con elementos del citoesqueleto

Las laminillas son miembros de la misma superfamilia de polipéptidos que se ensamblan


en los filamentos intermedios de 10 nm del citoplasma

El cambio en la secuencia de DNA altera la forma en que se empalma la transcripción del


gen, lo que lleva a la producción de una proteína acortada, que es lo que causa el fenotipo
alterado.

La replicación y la transcripción del material genético dentro del núcleo requieren la


participación de un gran número de proteínas que se sintetizan en el citoplasma y se
transportan a través de la envoltura nuclear.

Los poros nucleares contienen una estructura en forma de rosquilla llamada complejo
de poros nucleares (NPC), que abarca la envoltura nuclear, proyectándose en el
citoplasma y el nucleoplasma.

A pesar de su considerable tamaño y complejidad, los NPC contienen sólo unas 30


proteínas diferentes, llamadas nucleoporinas, que se conservan, en gran medida, entre
la levadura y los vertebrados.

En 1982, Robert Laskey y sus colegas en el Medical Research Council de Inglaterra


descubrieron que la nucleoplasmina, una de las proteínas nucleares más abundantes de
los ovocitos de anfibios, contiene un tramo de aminoácidos cerca de su terminal C que
funciona como una señal de localización nuclear (NLS)

Receptores de transporte móviles, transportan macromoléculas a través de la


envoltura nuclear. Dentro de esta familia, las importinas mueven las macro-moléculas
del citoplasma al núcleo y las exportinas mueven las macromoléculas en la dirección
opuesta.

Las proteínas exportadas desde el núcleo contienen secuencias de aminoácidos


llamadas señales de exportación nuclear (NESs)

Los cromosomas están compuestos por DNA y proteínas asociadas, llamadas en


conjunto cromatina.
EMPAQUETADO DEL GENOMA EUCARIOTA

El empaquetado ordenado del DNA eucariota depende de las histonas, un grupo notable
de proteínas pequeñas que poseen un contenido inusualmente alto de los aminoácidos
básicos arginina y lisina.

Hay cinco tipos de histonas llamadas H1, H2A, H2B, H3 y H4.

En 1974, utilizando datos de la digestión con nucleasa y otros tipos de información, Roger
Kornberg pro-puso una estructura completamente nueva para la cromatina. Kornberg
expuso que el DNA y las histonas se organizan en subunidades repetitivas, llamadas
nucleosomas.

Ahora se sabe que cada nucleosoma contiene una partícula nuclear nucleosómica que
consta de 146 pares de bases de DNA superenrollado envuelto casi dos veces alrededor
de un complejo en forma de disco de ocho moléculas de histona

Una molécula de DNA envuelta alrededor de partículas nucleares del nucleosoma de 10


nm de diámetro es el nivel más bajo de la organización de la cromatina.

La cohesina es una proteína con forma de anillo

HETEROCROMATINA

La cromatina que permanece compactada durante la interfase se llama


heterocromatina, para distinguirla de la eucromatina, que vuelve a un estado activo
disperso.

La heterocromatina se divide en dos clases. La heterocromatina constitutiva


permanece en estado compactado en todas las células en todo momento y, por tanto,
representa DNA que se silencia de forma permanente.

Cuando los genes que son por lo común activos se mueven en una posición adyacente
a estas regiones como resultado de la transposición o translocación, tienden a silenciarse
transcripcionalmente, un fenómeno conocido como efecto de posición

La heterocromatina facultativa es la cromatina que se ha inactivado específicamente


durante ciertas etapas de la vida de un organismo o en ciertos tipos de células
diferenciadas

Las células de los machos tienen un cromosoma Y diminuto y un cromosoma X


mucho más grande.
La heterocromatinización en el embrión es un proceso aleatorio en el sentido de que el
cromosoma X derivado del padre y el cromosoma X derivado de la madre tienen la misma
probabilidad de quedar inactivados en cualquier célula dada.

La hipótesis conocida como el código de histonas, que postula que el estado y la


actividad de una región particular de la cromatina dependen de las modificaciones
específicas, o combinación de modificaciones, de las colas de las histonas en esa región.

La formación de una lisina metilada en la posición núm. 9 transmite a la cola de la histona


H3 una importante propiedad: se vuelve capaz de unirse con alta afinidad a las proteínas
que con-tienen un dominio particular, denominado cromodominio.

El genoma humano contiene, al menos, 30 proteínas con cromodominios, de las cuales,


la mejor estudiada es la proteína heterocromática 1

ESTRUCTURA DE UN CROMOSOMA MITÓTICO

Las puntas de cada molécula de DNA están compuestas por un tramo in-usual de
secuencias repetidas que, junto con un grupo de proteínas especializadas, forman un
casquete en cada extremo del cromosoma llamado telómero.

Los telómeros humanos contienen la secuencia TTAGGG - AATCCC repetida alrededor


de 500 a 5 000 veces

Los telómeros son partes muy importantes de un cromosoma: son necesarios para la
replicación completa del cromosoma, forman casquetes que protegen los cromosomas
de las nucleasas y otras influencias desestabilizadoras, y evitan que los extremos de los
cromosomas se fusionen entre sí.

Las células dejan de dividirse por completo después de, aproximadamente, 50 a 80


duplicaciones de población, y entran en una etapa conocida como senescencia
replicativa.

El sitio de la constricción marca el centrómero del cromosoma. En los seres humanos,


el centrómero contiene una secuencia de DNA de 171 pares de base repetidos en tándem
(llamada DNA satélite α) que se extiende por, al menos, 500 kilo-bases.

 Inversiones. A veces, un cromosoma se rompe en dos lugares, y el segmento


entre las roturas se vuelve a sellar en el cromosoma en orientación inversa.
 Translocaciones. Cuando todo o una parte de un cromosoma se une a otro
cromosoma, la aberración
 Deleciones. Una deleción ocurre cuando falta una porción de un cromosoma.
 Duplicaciones. Una duplicación ocurre cuando se repite una porción de un
cromosoma.
Semana 19
LA NATURALEZA DEL GEN Y EL GENOMA
Los primeros acontecimientos fundamentales, a lo largo de este notable viaje de
descubrimiento, que finaliza con la descripción de la estructura doble helicoidal del DNA
en 1953.

Genoma, que es el cuerpo colectivo de la información genética que está presente en una
especie.

La ciencia de la genética comenzó en la década de 1860 con el trabajo de Gregor Mendel,


un fraile de la abadía de Santo Tomás, ubicada en la hoy República Checa.

No se sabe exactamente qué motivó a Mendel a comenzar sus estudios, pero es evidente
que tenía un claro plan experimental en mente: su objetivo era aparear, o cruzar, plantas
de guisantes que tenían diferentes características hereditarias y determinar el patrón por
el cual estas características eran transmitidas a la descendencia.

Después de varios años de investigación, Mendel extrajo las siguientes


conclusiones, que se expresan en la terminología genética moderna.

 Las características de las plantas se rigen por distintos factores (o unidades) de


herencia, que más tarde se denominaron genes. Una planta individual posee dos
copias de un gen que controla el desarrollo de cada rasgo, uno derivado de cada
padre. Las dos copias pueden ser idénticas entre sí o no. Las formas alternativas
de un gen se llaman alelos.
 Cada célula reproductiva (o gameto) producida por una planta contiene sólo una
copia de un gen para cada rasgo. Un gameto particular puede tener el alelo
recesivo o el dominante para un rasgo dado, pero no ambos.
 Aunque el par de alelos que gobierna un rasgo permanece junto a lo largo de la
vida de una planta individual, se separan (o segregan) el uno del otro durante la
formación de los gametos. Este hallazgo formó la base de la ley de segregación
de Mendel
 La segregación del par de alelos para un rasgo no tiene ningún efecto sobre la
segregación de alelos para otro rasgo.

Walther Flemming, a principios de la década de 1880, revelaron que los contenidos


citoplasmáticos eran enviados a una célula hija u otra por una cuestión de suerte, según
el plano a través del cual el surco casualmente dividió la célula.
Durante la división celular, el material del núcleo se organizó en “filamentos” visibles, que
fueron denominados cromosomas, lo que significa “cuerpo que se tiñe”.

CROMOSOMAS COMO PORTADORES DE INFORMACIÓN GENÉTICA

Once pares de cromosomas se pueden distinguir junto con un cromosoma adicional


denominado cromosoma accesorio (que luego se mostró que era un cromosoma X
determinante del sexo) que no era parte de un par obvio.

Sutton se dio cuenta de que la presencia en cada célula de pares de cromosomas, o


cromosomas homólogos

Los genes en el mismo cromosoma deberían actuar como si estuvieran relacionados


entre sí; es decir, deben ser parte del mismo grupo de relación.

En raras ocasiones, se produce un cambio espontáneo o mutación dentro de un gen,


alterándolo permanentemente, de forma que el rasgo alterado se transmite de generación
en generación.

Janssens había propuesto que esta interacción entre los cromosomas maternos y
paternos dio lugar a la ruptura e intercambio de piezas. Aprovechando esta propuesta,
Morgan sugirió que este fenómeno, que denominó entrecruzamiento (o recombinación
genética), podría explicar la apariencia de descendientes (recombinantes) que tienen
combinaciones inesperadas de rasgos genéticos.

Se conocía que el bloque de construcción básico del DNA era un nucleótido, que
consiste en el azúcar desoxirribosa de cinco carbonos, para la cual un fosfato se
esterifica en la posición 5’ del anillo de azúcar y una base nitrogenada se une en el sitio
1’.

Dos tipos de bases nitrogenadas están presentes en un ácido nucleico: las pirimidinas,
que contienen un solo anillo, y las purinas, que contienen dos anillos

El DNA contiene dos pirimidinas diferentes, la timina (T) y la citosina (C), así como dos
purinas diferentes, la guanina (G) y la adenina (A).

Los nucleótidos están unidos de manera covalente entre sí para formar un polímero lineal,
o cadena, con un esqueleto compuesto de grupos alternados de azúcar y fosfato unidos
por enlaces fosfodiéster 3’- 5’

LAS DOS CADENAS DE DOBLE HÉLICE SON COMPLEMENTARIAS ENTRE SÍ.

Desde el momento en que los biólogos consideraron por primera vez el DNA como el
material genético, se esperó que cumpliera tres funciones principales:
 Almacenamiento de información genética.
 Replicación y herencia.
 Expresión del mensaje genético.

DNA SUPERENROLLADO

Se dice que el DNA en este estado está superenrollado. Debido a que el DNA
superenrollado es más compacto que su homólogo relajado, ocupa un volumen más
pequeño y se mueve más rápido en respuesta a una fuerza centrífuga o a un campo
eléctrico

Una molécula en esta condición tiene el número estándar de 10 pares de bases por vuelta
de la hélice y se dice que está relajada.

Una molécula de DNA menos enrollada tiene un mayor número de pares de bases por
cada vuelta de la hélice.

Se dice que el DNA está superenrollado negativamente cuando está menos enrollado
y superenrollado positivamente cuando está más enrollado.

Las células dependen de enzimas para cambiar el estado superenrollado de un DNA


dúplex. Estas enzimas se llaman topoisomerasas, porque cambian la topología del
DNA.

COMPLEJIDAD DEL GENOMA

El DNA es una macromolécula, un conjunto de una gran cantidad de átomos unidos en


una disposición definida, cuya estructura tridimensional se puede describir mediante
técnicas tales como la cristalografía de rayos X.

Para los seres humanos, el genoma es en esencia equivalente a toda la información


genética que está presente en un solo conjunto de cromosomas humanos (haploide),que
incluye 22 autosomas diferentes y los cromosomas sexuales X y Y.

Las más importantes propiedades de la doble hélice de DNA: su capacidad de separarse


en sus dos cadenas componentes, una propiedad denominada desnaturalización.

El progreso de desnaturalización térmica (o fusión del DNA) usualmente se controla


siguiendo el aumento en la absorbancia de la luz ultravioleta por el DNA disuelto.

Las moléculas de DNA monocatenario complementarias eran capaces de reasociarse,


un evento denominado renaturalización o reasociación.
La reasociación ha llevado al desarrollo de una metodología llamada hibridación de
ácido nucleico, en la que cadenas complementarias de ácidos nucleicos de diferentes
fuentes pueden mezclarse para formar moléculas de doble cadenas (híbridas)

LAS FRACCIONES ALTAMENTE REPETIDAS (también llamadas repeticiones en


tándem) constituyen, en cualquier sitio, aproximadamente de 1 a 10% del DNA total. Son
por lo general, cortas (unos pocos cientos de nucleótidos en su punto más largo) y se
presentan en grupos en los que la secuencia dada se repite una y otra vez sin
interrupción.

 DNA satélites. Los DNA satélites consisten en secuencias cortas (alrededor de


cinco a unos pocos cientos de pares de bases de longitud) que forman grandes
matrices lineales, cada una con hasta varios millones de pares bases de DNA.
 DNA minisatélites. Las secuencias minisatélites tienen un rango de
aproximadamente 10 a 100 pares de bases de longitud y se encuentran en grupos
considerables que contienen hasta 3 000 repeticiones. Por tanto, las secuencias
minisatélites ocupan tramos considerablemente más cortos del genoma que las
secuencias satélites.
 DNA microsatélites. Los microsatélites son las secuencias más cortas (1 a 9
pares de bases de longitud) y están, por lo común, presentes en pequeños grupos
de aproximadamente 10 a 40 pares de bases de longitud, que están dispersos de
manera bastante uniforme a través del genoma.

SECUENCIAS DE DNA MODERADAMENTE REPETIDAS La fracción moderadamente


repetida de los genomas de plantas y animales puede variar desde alrededor de 20 a
más de 80% del DNA total, en dependencia del organismo. Esta fracción incluye
secuencias que se repiten dentro del genoma, en cualquier lugar, de unas pocas veces
a decenas de miles de veces. Se incluyen en la fracción de DNA moderadamente repetida
algunas secuencias que codifican productos genéticos conocidos, ya sea RNA (como
RNAr) o proteínas (incluidas las histonas), pero la mayor parte de esta fracción de DNA
carece de una función de codificación.

SECUENCIAS DE DNA NO REPETIDAS Como fue predicho inicialmente por Mendel,


estudios clásicos sobre los patrones de herencia de los rasgos visibles llevaron a los
genetistas a concluir que cada gen estaba presente en una copia por cada conjunto único
de cromosomas (haploide). Cuando el DNA eucariota desnaturalizado puede
reasociarse, una fracción significativa de los fragmentos es muy lenta para encontrar
pareja, tan lenta de hecho, que se presume que está presente en una sola copia por
genoma.
Semana 20
REPLICACIÓN Y REPARACIÓN DEL ADN
El proceso de reproducción se puede observar en varios niveles: los organismos se
duplican por reproducción asexual o sexual, las células se duplican por división celular y
el material genético se duplica por la replicación del DNA.

La propuesta de Watson y Crick para la estructura del DNA en 1953 estuvo acompañada
por un mecanismo sugerido para su “autoduplicación”. Las dos hebras de doble hélice se
mantienen unidas por enlaces de hidrógeno entre las bases. Individualmente, estos
enlaces de hidrógeno son débiles y se rompen fácilmente.

REPLICACIÓN DE DNA EN CÉLULAS BACTERIANAS

El aislamiento de mutantes sensibles a la temperatura, en los que la deficiencia solo


se revela a una temperatura elevada, denominada temperatura no permisiva (o
restrictiva).

La replicación comienza en un sitio específico en el cromosoma bacteriano llamado


origen.

El origen de replicación en el cromosoma de la E. coli es una secuencia específica


llamada oriC donde se unen varias proteínas para iniciar el proceso de replicación.

La replicación procede hacia afuera desde el origen en ambas direcciones, es decir,


bidireccionalmente

El par de segmentos replicados se juntan y se unen al DNA no replicado se denominan


horquillas de replicación.

Las dos horquillas de replicación se mueven en direcciones opuestas hasta que se


encuentran en un punto a través del círculo desde el origen, donde finaliza la replicación.
Los dos dúplex recién replicados se separan unos de otros y finalmente se dirigen a dos
células diferentes

Es evidente que la separación de las hebras de una doble hélice es también un proceso
de desenrollado de la estructura.

La separación de las dos hebras de una molécula de DNA circular es análoga a tener un
extremo de una molécula lineal unida a una pared; en todos estos casos, la tensión que
se desarrolla en la molécula no se puede aliviar mediante la rotación de la molécula
completa.
Una enzima de este tipo, llamada DNA girasa, una topoisomerasa tipo II, alivia la tensión
mecánica que se acumula durante la replicación en la E. coli.

Las moléculas de DNA girasa viajan a lo largo del DNA por delante de la horquilla de
replicación y eliminan los superenrollamientos positivos. La DNA girasa logra esta proeza
mediante la división de ambas hebras del DNA dúplex, al pasar un segmento de DNA a
través de la ruptura de la doble hebra al otro lado y luego sellar los cortes, un proceso
que se impulsa por la energía liberada durante la hidrólisis del ATP

Las DNA polimerasas, las enzimas que sintetizan nuevas hebras de DNA.

El estudio de estas enzimas se inició en la década de 1950 por Arthur Kornberg en la


Universidad de Washington. En sus experimentos iniciales, Kornberg y sus colegas
purificaron una enzima de extractos bacterianos que incorporaban precursores de DNA
marcados radiactivamente en un polímero insoluble en ácido identificado como DNA.

El DNA recién sintetizado, marcado radiactivamente tenía la misma composición de base


que el DNA original no marcado, lo que sugiere en alto grado que las hebras de DNA
originales habían servido como plantillas para la reacción de polimerización.

Un DNA circular monocatenario no puede servir como plantilla para la DNA


polimerasa porque la enzima no puede iniciar la formación de una hebra de DNA.

La hebra que proporciona el terminal 39OH necesario se llama primaria.

El diagrama de la replicación del DNA presentado por primera vez por Watson y Crick
describía los eventos como se esperaría que ocurrieran en la horquilla de replicación. El
diagrama sugiere que una de las hebras recién sintetizadas se polimeriza en una
dirección de 5’→ 3’, mientras que la otra hebra se polimeriza en una dirección de 3’→ 5’.

Una célula bacteriana típica contiene de 300 a 400 moléculas de DNA polimerasa I
pero solo alrededor de 10 copias de DNA polimerasa III.

En la dirección de 3’→ 5’ las hebras de DNA no se pueden sintetizar.

Las moléculas de polimerasa responsables de la construcción de las dos nuevas hebras


de DNA se mueven en una dirección de 3’-a-5’ a lo largo de la plantilla, y ambas
construyen una hebra que crece mediante la adición de nucleótidos a su terminal 3’-OH

La hebra que se sintetiza de forma continua se denomina hebra adelantada porque su


síntesis continúa a medida que avanza la horquilla de replicación.

La hebra que se sintetiza de forma discontinua se denomina hebra retrasada porque la


iniciación de cada fragmento debe esperar a que las hebras parentales se separen y
expongan una plantilla adicional.
Debido a que una hebra se sintetiza continuamente y la otra discontinuamente, se dice
que la replicación es semidiscontinua.

Una parte del DNA se construyó en segmentos pequeños (más tarde llamados
fragmentos de Okazaki) que se unieron rápidamente a piezas más largas que se habían
sintetizado previamente.

La enzima que une los fragmentos de Okazaki en una hebra continua se llama DNA
ligasa.

La iniciación no se realiza mediante una DNA polimerasa sino, más bien, mediante un
tipo distinto de RNA polimerasa, llamada primasa, que construye un primario corto
compuesto de RNA, no de DNA

LA MAQUINARIA QUE OPERA EN LA HORQUILLA DE REPLICACIÓN

El desenrollado del dúplex y la separación de las hebras requieren la ayuda de dos tipos
de proteínas que se unen al DNA, una helicasa y proteínas ligantes de DNA de hebra
simple

La E. coli tiene al menos 12 helicasas diferentes para su uso en diversos aspectos del
metabolismo del DNA (y el RNA). Una de estas helicasas producto del gen DNAB
funciona como la principal máquina de desenrollar durante la replicación.

El “modelo de trombón” el enlace de DNA de forma repetida crece y colapsa


repetidamente durante la replicación de la hebra retrasada, que evoca el movimiento de
“lazo” de un trombón de bronce cuando se toca. Estudios recientes han demostrado que
el complejo de replicación, o replisoma, contiene tres copias de la DNA polimerasa III en
lugar del modelo tradicional de dos copias que se presenta aquí.

ESTRUCTURA Y FUNCIONES DE LAS DNA POLIMERASAS

Uno de los componentes no catalíticos de la holoenzima, denominada abrazadera β,


mantiene la polimerasa asociada con el DNA plantilla.

Las DNA polimerasas (poseen dos propiedades algo contrastantes:

1) deben permanecer asociadas a la plantilla en tramos largos si van a sintetizar una


hebra complementaria continua,
2) deben estar lo suficientemente sueltas para poder moverse a través de la plantilla
desde un nucleótido al siguiente.

La supervivencia de un organismo depende de la duplicación precisa del genoma. Un


error cometido en la síntesis de una molécula de RNA mensajero por una RNA polimerasa
da como resultado la síntesis de proteínas defectuosas, pero una molécula de RNAm es
solo una plantilla de vida corta entre una gran población de tales moléculas; por ello, el
error dura poco.

Se cree que los humanos tienen una tasa de mutación espontánea similar para la
replicación de secuencias de codificación de proteínas

La fidelidad de la replicación del DNA se puede remontar a tres actividades


distintas:

1) selección precisa de nucleótidos,


2) Repaso inmediata
3) reparación de apareamiento posterior.

La replicación de un cromosoma bacteriano completo en aproximadamente 40 minutos a


37 °C requiere que cada horquilla de replicación se mueva aproximadamente 1 000
nucleótidos por segundo, lo que es equivalente a la longitud de un fragmento completo
de Okazaki.

REPLICACIÓN DEL DNA EN LAS CÉLULAS EUCARIOTAS

Desarrollo de sistemas in vitro donde la replicación puede ocurrir en extractos celulares


o mezclas de proteínas purificadas. El más valioso de estos sistemas ha utilizado
Xenopus, una rana acuática que comienza su vida como un enorme huevo con todas las
proteínas necesarias para llevarlo a través de una docena de rondas muy rápidas de
división celular.

Las células eucarióticas replican su genoma en pequeñas porciones, denominadas


replicones.

Aproximadamente de 10 a 15% de los replicones participan activamente en la


replicación en cualquier momento dado durante la fase S del ciclo celular

La presencia de histonas acetiladas, que están estrechamente relacionadas con la


transcripción génica, es un factor probable para determinar la replicación temprana de
los loci genéticos activos.

El locus β globina se replica temprano durante la fase S en las células eritroides donde
se expresa el gen, pero mucho más tarde en las células no eritroides donde el gen
permanece en silencio.

La replicación del DNA en el que están contenidas, se las denomina secuencias de


replicación autónomas
El elemento central de un ARS consiste en una secuencia conservada de 11 pares de
bases, que funciona como un sitio de unión específico para un complejo multiproteico
esencial llamado complejo de reconocimiento de origen

Se cree que la selección real de sitios para el inicio de la replicación está regida por
factores epigenéticos locales, como la posición de los nucleosomas, los tipos de
modificaciones de histonas, el estado de metilación del DNA, el grado de
superenrollamiento y el nivel de la transcripción.

Las actividades que ocurren en las horquillas de replicación son bastante similares,
independientemente del tipo de genoma que se replica, ya sea viral, bacteriano, arqueas
o eucariótico.

Las horquillas de replicación que están activas en un momento determinado no se


distribuyen aleatoriamente en todo el núcleo de la célula, sino que se localizan en 50 a
250 sitios, denominados focos de replicación

ESTRUCTURA Y REPLICACIÓN DE CROMATINA

Los cromosomas de las células eucariotas consisten en DNA estrechamente complejo


con matrices regulares de proteínas histonas que están presentes en forma de
nucleosomas

Las células hijas llevan a cabo el mismo patrón de transcripción que sus células
originales; esta es una de las piedras angulares que subyacen al funcionamiento
homeostático de los tejidos y órganos.

La información epigenética no está codificada dentro de la secuencia de DNA de un


cromosoma, sino en el patrón de residuos metilados de citosina en el DNA de una célula
y en el patrón de modificaciones postraduccionales de las histonas nucleares asociadas
con el DNA.

REPARACIÓN DEL DNA

El DNA es una de las moléculas en una célula más susceptibles al daño ambiental.

La magnitud de estas alteraciones espontáneas, o lesiones, puede apreciarse a partir


de la estimación de que cada célula de un mamífero de sangre caliente ¡pierde
aproximadamente 10 000 bases por día! El fallo en reparar tales lesiones produce
alteraciones permanentes o mutaciones en el DNA.

La reparación por escisión de nucleótidos (NER) funciona mediante un mecanismo


de corte y parche, el cual elimina una variedad de lesiones voluminosas, incluyendo los
dímeros de pirimidina y los nucleótidos a los que se han unido diversos grupos químicos.
1) Una vía acoplada a transcripción en la que las hebras plantillas de genes que
se transcriben de forma activa se reparan de manera preferente. Esta vía de
reparación preferencial asegura que aquellos genes de mayor importancia para la
célula, que son los genes que la célula transcribe activamente, reciben la más alta
prioridad en la “lista de reparación”.
2) Una vía genómica global más lenta y menos eficiente que corrige las hebras de
DNA en el resto del genoma.

Los pasos en esta vía de reparación en las eucariotas, que se llama reparación por
escisión de base (BER), se inicia por una DNA glicosilasa que reconoce la alteración y
elimina la base alterada por escisión del enlace glucosídico que contiene la base al azúcar
desoxirribosa. Se han identificado varias DNA glicosilasas diferentes, cada una más o
menos específica para un tipo particular de base alterada, incluido el uracilo, la 8-
oxoguanina y la 3-metiladenina.

Las células pueden eliminar las bases mal emparejadas que son incorporadas por la DNA
polimerasa y escapan a la exonucleasa de corrección de la enzima. Este proceso se
denomina reparación de desajuste (MMR)

Las rupturas de la doble hebra (DSB) también pueden ser causadas por ciertos
químicos, incluidos varios utilizados en la quimioterapia contra el cáncer, y los radicales
libres producidos por el metabolismo celular normal

La vía predominante en las células de mamíferos se denomina unión de extremos no


homólogos (NHEJ), en la que un complejo de proteínas se une a los extremos rotos del
DNA dúplex y cataliza una serie de reacciones que vuelven a unir a las hebras rotas.

Recombinación homóloga (HR) requiere un cromo-soma homólogo para servir como


plantilla para la reparación de la hebra rota.
Semana 21
DOGMA CENTRAL: DEL ADN AL ARN A LA PROTEÍNA

Relación entre genes, proteínas y RNA:

Griffith, Avery, Hershey y Chase demostraron que los genes estaban compuestos de
DNA, y Watson y Crick resolvieron el rompecabezas de la estructura del DNA, que
explicaba cómo esta notable macromolécula podría codificar información hereditaria.

Archibald Garrod, un médico escocés que reportó en 1908 que la ausencia de enzimas
específicas era la causa de los síntomas que presentaban las personas con ciertas raras
enfermedades hereditarias.

La alcaptonuria, una condición que se diagnostica claramente porque la orina se


oscurece al exponerse al aire.

La expresión génica se refiere a la producción de un producto funcional usando la


información codificada en un gen.

La síntesis de un RNA a partir de una plantilla de DNA se denomina transcripción.

Hay un intermediario entre un gen y su polipéptido; el intermediario es el RNA mensajero


(mRNA).

Un mRNA también se puede describir como una cadena “de sentido” o un RNA de
codificación. El uso de RNA mensajero permite a la célula separar el
almacenamiento de información del uso de esta.
El concepto de un gen con base en DNA que codifica un mensaje basado en RNA, que
luego se traduce en una proteína, se conoce como el dogma central.

Las proteínas se sintetizan en el citoplasma mediante un complejo proceso llamado


traducción genética.

Los ribosomas son “máquinas” complejas y citoplásmicas, que se pueden


programar como un ordenador para traducir la información codificada por
cualquier mRNA.

Los ribosomas contienen tanto proteínas como RNA. Los RNA de un ribosoma se llaman
RNA ribosómicos (rRNA), y al igual que los mRNA, cada uno se transcribe a partir de
una de las cadenas de DNA de un gen.

Los rRNA proporcionan un soporte estructural para construir el ribosoma, y ayudar


a catalizar la reacción química en la que los aminoácidos se unen en forma
covalente entre sí

Los RNA de transferencia (o tRNA) sirven para traducir la información en código de los
nucleótidos del mRNA al “alfabeto” de aminoácidos de un polipéptido.

Papel de las RNA polimerasas en la transcripción:

Las enzimas responsables de la transcripción en células procariotas y eucariotas se


denominan RNA polimerasa dependiente de DNA, o simplemente RNA polimerasas.

El primer paso en la síntesis de un RNA es la asociación de la polimerasa con la


plantilla del DNA.

El sitio del DNA al que se une una molécula de RNA polimerasa antes de iniciar la
transcripción se denomina promotor.

Las RNA polimerasas celulares no son capaces de reconocer a los promotores por sí
mismas, sino que requieren la ayuda de proteínas adicionales llamadas factores de
transcripción.

Las RNA polimerasas son capaces de incorporar de 20 a 50 nucleótidos por


segundo aproximadamente en una molécula de RNA en crecimiento.

La capacidad de la RNA polimerasa para reconocer y eliminar un nucleótido incorporado


erróneamente se conoce como corrección de pruebas.

Descripción general de la transcripción en células procariotas y eucariotas:


El complejo de la polimerasa, factor σ y DNA con las hebras separadas se denomina
complejo abierto.

TTGACA se denomina secuencia consenso

El RNA precursor inicial es equivalente en longitud a la longitud total del DNA transcrito,
y se denomina transcrito primario, o pre-RNA. El segmento correspondiente de DNA a
partir del cual se transcribe una transcripción primaria se denomina unidad de
transcripción.

Síntesis y procesamiento de ribosomas eucariotas y RNA de transferencia:

El genoma humano tiene cinco clústeres de rDNA, cada uno en un cromosoma


diferente.

En una célula no divisoria (interfase), los clústeres de rDNA se reúnen como parte de una
o más estructuras nucleares de forma irregular llamadas nucléolos, que funcionan en la
producción de ribosomas.

El procesamiento del pre-rRNA se logra con la ayuda de un gran número de RNA


nucleolares pequeños (snoRNA) que están empaquetados con proteínas particulares
para formar partículas llamadas ribonucleoproteínas nucleolares pequeñas (o
snoRNP).

“exosoma” es una máquina de degradación de RNA que consiste en casi una docena
de exonucleasas diferentes.

El nucléolo es el sitio no sólo de procesamiento de rRNA, sino también de ensamblaje


de las dos subunidades ribosomales.

Se estima que las células vegetales y animales tienen aproximadamente 50


especies diferentes de RNA de transferencia, cada especie codificada por una
secuencia repetida de DNA.

Síntesis y estructura de los RNA mensajeros eucarióticos:

La mayor parte de la radiactividad se incorpora a moléculas de RNA que poseen las


siguientes propiedades:

1) tienen grandes pesos moleculares (hasta aproximadamente 80S, o 50 000


nucleótidos)
2) como grupo, están representadas por RNA de secuencia de nucleótidos diversa
(heterogénea)
3) sólo se encuentran en el núcleo.
Es por dichas propiedades que estos RNA se denominan RNA nucleares
heterogéneos (nhRNA)

La RNA polimerasa II sintetiza todos los precursores de mRNA eucariótico; es una


enzima compuesta por una docena de subunidades diferentes que se conserva
notablemente desde la levadura hasta los mamíferos.

La RNA polimerasa II se une al promotor con la cooperación de varios factores generales


de transcripción (GTF, general transcription factors) para formar un complejo de
preinicio (PIC).

De acuerdo con algunas estimaciones, una RNA polimerasa II elongada puede


contener más de 50 componentes y constituir una masa total de más de 3 millones
de daltons.

Los RNA mensajeros comparten ciertas propiedades:

1. Contienen una secuencia continua de nucleótidos que codifica un polipéptido


específico.
2. Se encuentran en el citoplasma.
3. Cuando se transcriben están unidos a ribosomas.
4. La mayoría de los mRNA contienen un segmento significativo que no codifica, es
decir, una porción que no dirige el ensamblaje de aminoácidos.
5. Los mRNA eucariotas tienen modificaciones especiales en sus extremos 5 y 3 que
no se encuentran en los mRNA bacterianos, ni en el tRNA ni el rRNA.

El adenovirus es un patógeno capaz de infectar una variedad de células de mamíferos.

Las partes de un gen dividido que contribuyen al producto de RNA maduro se llaman
exones, mientras que las secuencias intermedias se llaman intrones.

El gen humano promedio contiene aproximadamente nueve intrones que constituyen más
de 95% de la unidad de transcripción.

Procesamiento de los RNA mensajeros eucarióticos:

Las partes de una secuencia de comandos primaria que corresponden a las secuencias
de DNA intermedias se deben eliminar mediante un proceso complejo conocido como
empalme RNA.

Para empalmar un RNA se deben introducir rupturas en el filamento en los extremos 5’ y


3’ sitios de empalme de cada intrón, y los exones situados a cada lado de los sitios de
corte y empalme se deben enlazar de forma covalente (ligarse).
Se estima que aproximadamente 15% de las enfermedades humanas heredadas se
producen directamente a partir de mutaciones que alteran el empalme previo al
mRNA.

A medida que se transcribe cada molécula de hnRNA grande, se asocia con una variedad
de proteínas para formar una ribonucleoproteína nuclear heterogénea (hnRNP), que
representa el sustrato para las reacciones de procesamiento que siguen. El
procesamiento ocurre cuando cada intrón del pre-mRNA se asocia con una máquina
macromolecular dinámica llamada espliceosoma. Cada espliceosoma consiste en una
variedad de proteínas y varias partículas de ribonucleoproteínas diferentes, llamadas
ribonucleoproteínas nucleares pequeñas (snRNP)

El movimiento de “módulos” genéticos entre genes no relacionados, proceso llamado


mezcla de exones se ve facilitado en gran medida por la presencia de los intrones, que
actúan como elementos espaciadores inertes entre los exones.

Silenciamiento RNA, en el que los RNA pequeños, que por lo general trabajan junto con
la maquinaria de proteína, actúan para inhibir la expresión génica de diversas maneras.

Semana 22
DOGMA CENTRAL: TRADUCCIÓN DEL ARN A LA PROTEÍNA

Codificación de la información genética


Uno de los primeros modelos del código genético fue presentado por el físico George
Gamow, quien propuso que cada aminoácido en un polipéptido estaba codificado por tres
nucleótidos secuenciales. Dicho de otra forma, las palabras del código, o codones, eran
tripletas de nucleótidos en los aminoácidos.

Decodificación de codones: el papel de los RNA de transferencia

La traducción requiere que la información codificada en la secuencia de nucleótidos de


un mRNA se decodifique, y se use para dirigir el ensamblaje secuencial de aminoácidos
en una cadena polipeptídica.

La parte del tRNA que participa en esta interacción complementaria con el codón del
mRNA es un tramo de tres nucleótidos secuenciales, llamado anticodón, que está
situado en el lazo medio de la molécula de tRNA
Dado el hecho de que 61 codones diferentes pueden especificar un aminoácido, se puede
esperar que una célula tenga al menos 61 tRNA diferentes, cada uno con un anticodón
diferente

Los aminoácidos están unidos en forma covalente a los extremos 3 de sus tRNA afines
por una enzima llamada aminoacil-tRNA sintetasa (aaRS)

La energía del ATP activa el aminoácido mediante la formación de un aminoácido


adenilado, que se une a la enzima.

Traducción de información genética: inicio

El ensamblaje de una proteína requiere todos los diversos tRNA con sus adjuntos
aminoácidos, ribosomas, un RNA mensajero, numerosas proteínas con diferentes
funciones, cationes, y GTP

La síntesis de una cadena de polipéptido se puede dividir en tres actividades bastante


diferentes: inicio de la cadena, elongación de la cadena, y terminación de la cadena.

El ribosoma se enlaza al mRNA en un sitio preciso, llamado el codón de inicio, que se


especifica como AUG.

La vinculación a este codón coloca automáticamente el ribosoma en el marco de lectura


adecuado para que lea correctamente el mensaje completo a partir de ese momento.

Los ribosomas son máquinas programables: la información almacenada en el mRNA


determina la secuencia de aminoacil-tRNA que el ribosoma acepta durante la traducción.

Cada ribosoma tiene tres sitios para asociarse con moléculas de RNA de transferencia.
Estos sitios, denominados el sitio A (aminoacilo), el sitio P (peptidilo) y el sitio E (salida),
reciben cada tRNA en pasos sucesivos del ciclo de elongación.

Traducción de información genética: elongación y terminación

 Paso 1 de la elongación: selección del aminoacil-tRNA


 Paso 2 de la elongación: formación de enlaces peptídicos
 Paso 3 de la elongación: translocación
 Paso 4 de la elongación: liberación del tRNA desacilado
 Terminación

La peptidil transferasa, un componente de la gran subunidad del ribosoma, cataliza la


reacción.
Translocación, se caracteriza por un pequeño movimiento de trinquete (6°) de la
subunidad pequeña en relación con la subunidad grande

El ribosoma se mueve a lo largo del mRNA en el marco de lectura incorrecto desde el


punto de mutación hasta el resto de la secuencia de codificación. Las mutaciones de este
tipo se llaman mutaciones de cambio de marco.

Los factores de liberación se pueden dividir en dos grupos: RF de clase I, que


reconocen codones de terminación en el sitio A del ribosoma, y RF de clase II, proteínas
de unión al GTP (proteínas G) cuyas funciones no se conocen bien.

Vigilancia mRNA y control de calidad

Mutaciones que produzcan codones de terminación dentro de la secuencia codificante


de un gen Las mutaciones de este tipo, denominadas mutaciones sin sentido

Los mRNA que contienen tales mutaciones se transcriben sólo una vez antes de ser
destruidos selectivamente por un proceso llamado degradación mediada por mutación
sin sentido (NMD)

Cuando un intrón se elimina mediante un espliceosoma, se deposita un complejo de


proteínas en el transcripto a 20-24 nucleótidos corriente arriba de la unión exón-exón
recién formada. Este punto de referencia del proceso de empalme se llama complejo
exón-unión (EJC), que se queda con el mRNA hasta que se traduce.

Semana 23
FASE M DEL CICLO CELULAR: MITOSIS Y CITOCINESIS.

El ciclo celular

El proceso por el cual las células nuevas surgen de otras células vivas se llama división
celular.

La mitosis conduce a la producción de células que son genéticamente idénticas a las de


su antecesora, mientras que la meiosis conduce a la producción de células con la mitad
del contenido genético de la célula madre.

En una población de células en división, ya sea dentro del cuerpo o en una placa de
cultivo, cada célula pasa por una serie de etapas definidas, que constituyen el ciclo
celular
La fase M incluye 1) el proceso de mitosis, durante el cual los cromosomas duplicados
se separan en dos núcleos (cariocinesis) y 2) la citocinesis, durante la cual la célula
completa se divide en dos células hijas.

La interfase, el periodo entre las divisiones celulares, es un momento en que la célula


crece y se involucra en diversas actividades metabólicas.

La replicación del DNA ocurre durante el periodo del ciclo celular denominado fase S

Ciclos celulares in vivo

1. Células como las neuronas, las células musculares o los glóbulos rojos, que son
altamente especializadas y carecen de la capacidad de dividirse.
2. Células que normalmente no se dividen, pero que pueden inducirse a comenzar la
síntesis del DNA y dividirse cuando se les administra un estímulo apropiado.
3. Células que normalmente poseen un nivel relativamente alto de actividad mitótica.

Una división celular asimétrica es aquella en la que las dos células hijas tienen
diferentes tamaños, componentes o destinos

Regulación del ciclo celular


La entrada de una célula en la fase M es iniciada por una proteína llamada factor
promotor de la maduración (MPF)

El MPF consta de dos subunidades: 1) una subunidad con actividad de cinasa que
transfiere grupos de fosfato del ATP a residuos específicos de serina y treonina de
sustratos proteicos específicos y 2) una subunidad reguladora llamada ciclina.

Control del ciclo celular: el papel de las proteínas cinasas

La localización subcelular es un fenómeno dinámico, en el que los reguladores del ciclo


celular se mueven a diferentes compartimientos en etapas diversas.

Control del ciclo celular: puntos de control, inhibidores Cdk y respuestas celulares

La ataxia-telangiectasia (AT) es un trastorno hereditario recesivo caracterizado por una


serie de síntomas diversos, incluido un riesgo mucho mayor de ciertos tipos de cáncer

Leland Hartwell y Ted Weinert en 1988 de que las células poseen puntos de control
como parte de su ciclo celular. Los puntos de control son mecanismos de vigilancia que
detienen el progreso del ciclo celular si 1) se daña alguno de los DNA cromosómicos o 2)
ciertos procesos críticos no han sido completados de forma apropiada, como la
replicación del DNA durante la fase S o el alineamiento cromosómico durante la fase M.
Descripción general de la fase M: mitosis y citocinesis
La mitosis es un proceso de división nuclear en el que las moléculas de DNA replicadas
de cada cromosoma se reparten con exactitud en dos núcleos.

La mitosis suele ir acompañada de citocinesis, un proceso mediante el cual una célula


en división se divide en dos, dividiendo el citoplasma en dos paquetes celulares.

La mitosis por lo general se divide en cinco etapas, profase, prometafase, metafase,


anafase y telofase, cada una caracterizada por una particular serie de eventos.

Profase

La primera etapa de la mitosis, la profase, los cromosomas duplicados se preparan para


la separación y se ensambla la maquinaria mitótica.

Antes de segregar sus cromosomas, una célula los convierte en estructuras mucho más
cortas y gruesas mediante un notable proceso de compactación cromosómica (o
condensación cromosómica), que se produce durante la profase temprana

Los cromosomas mitóticos revela que cada uno de ellos está compuesto por dos
cromátidas “hermanas” de imagen especular

El DNA de cada cromosoma interfásico se asocia en sitios a lo largo de su longitud con


un complejo multiproteico llamado cohesina

El punto de referencia más notable de un cromosoma mitótico es una indentación o


constricción primaria que marca la posición del centrómero

El examen de las secciones a través de un cromosoma mitótico revela la presencia de


una estructura proteinácea parecida a un botón, llamada cinetocoro, en la superficie
externa del centrómero de cada cromátida

El ensamblaje de microtúbulos en las células animales es iniciado por una estructura


especial organizadora de microtúbulos, el centrosoma

Los microtúbulos del citoesqueleto transitan por una dispersión generalizada, en


preparación para su reensamblaje como componentes de una máquina compleja de
microtamaño llamada huso mitótico.

La primera etapa en la formación del huso mitótico en una célula animal típica es la
aparición de microtúbulos en una disposición astral de “estallido” o áster alrededor de
cada centrosoma, durante la fase temprana de la profase.
Prometafase

La disolución de la envoltura nuclear marca el inicio de la segunda fase de la mitosis, la


prometafase, durante la cual se completa el ensamblaje del huso mitótico, y los
cromosomas se mueven a su posición en el centro de la célula.

Los cromosomas de una célula de prometafase se mueven mediante un proceso


denominado congresión hacia el centro del huso mitótico, a medio camino entre los
polos

Metafase

Una vez que todos los cromosomas se alinean en el ecuador del huso —con una
cromátida de cada cromosoma conectada por su cinetocoro a los microtúbulos de un
polo, y su cromátida hermana conectada por su cinetocoro a los microtúbulos del polo
opuesto— la célula ha alcanzado la metafase

1. Microtúbulos astrales, que se irradian hacia afuera desde el centrosoma hacia


la región fuera del cuerpo del huso.
2. Microtúbulos cromosómicos (del cinetocoro) que se extienden entre el
centrosoma y los cinetocoros de los cromosomas.
3. Microtúbulos polares (o interpolares) que se extienden desde el centrosoma
más allá de los cromosomas.

Anafase
La anafase comienza cuando las cromátidas hermanas de cada cromosoma se separan
y comienzan su movimiento hacia los polos opuestos.

El movimiento de los cromosomas hacia los polos se conoce como anafase A, para
distinguirlo de un movimiento separado —pero simultáneo— llamado anafase B, en el
que los dos polos del huso se separan más.

El punto de control del ensamblaje del huso (SAC), como se le llama, se revela mejor
cuando un cromosoma no se alinea correctamente en la placa de la metafase.

Telofase y citocinesis

A medida que los cromosomas se acercan a sus respectivos polos tienden a acumularse
en una masa, lo que marca el comienzo de la etapa final de la mitosis o telofase

La mitosis se caracteriza por los amplios movimientos de las estructuras celulares.


La mitosis logra la segregación de cromosomas duplicados en los núcleos hijos, pero la
célula se divide en dos células hijas mediante un proceso separado llamado citocinesis.

La formación de una nueva célula comienza con la construcción de un precursor más


simple, llamado la placa celular.

El fragmoplasto consiste en racimos de microtúbulos interdigitados, orientados de forma


perpendicular a la futura placa, junto a filamentos de actina, vesículas membranosas y
material denso en electrones.

Profase
1. El material cromosómico se condensa para formar cromosomas mitóticos
compactos. Se ve que los cromosomas están compuestos de dos cromátidas
unidas juntas en el centrómero.
2. Se desensambla el citoesqueleto y se ensambla el huso mitótico.
3. Complejo de Golgi y fragmento de retículo endoplásmico (ER). La envoltura
nuclear se dispersa.

Prometafase

1. Los microtúbulos cromosómicos se unen a los cinetocoros de los cromosomas.


2. Los cromosomas se mueven al ecuador del huso.

Metafase

1. Los cromosomas están alineados a lo largo de la placa metafásica, unidos por


microtúbulos cromosómicos a ambos polos.

Anafase

1. Los centrómeros se dividen, y las cromátidas se separan.


2. Los cromosomas se mueven a los polos opuestos del huso.
3. Los polos del huso se separan.

Telofase

1. Los cromosomas se agrupan en los polos opuestos del huso.


2. Los cromosomas se dispersan.
3. La envoltura nuclear se ensambla alrededor de los cúmulos de cromosomas.
4. El complejo de Golgi y el ER se reforman.
5. Células hijas formadas por citocinesis.
Semana 24
REPRODUCCIÓN SEXUAL, MEIOSIS Y
RECOMBINACIÓN GENÉTICA.

Descripción general de la meiosis

La duplicación del número de cromosomas en la fecundación se compensa por una


reducción equivalente en el número de cromosomas, en una etapa anterior a la formación
de los gametos. Esto se logra mediante la meiosis

1. Meiosis gamética o terminal. En este grupo, que incluye a todos los animales
multicelulares y muchos protistas, las divisiones meióticas están estrechamente
vinculadas a la formación de los gametos
2. Meiosis cigótica o inicial. En este grupo, que incluye solo protistas y hongos, las
divisiones meióticas ocurren justo después de la fertilización para producir esporas
haploides
3. Meiosis en esporas o intermedia. En este grupo, que incluye plantas y algunas
algas, las divisiones meióticas tienen lugar en una etapa no relacionada con la
formación o fertilización de gametos

El ciclo de vida con la unión de un gameto masculino (el grano de polen) y un gameto
femenino (el huevo), el cigoto diploide sufre mitosis y se desarrolla en un diploide
esporófito.

En alguna etapa del desarrollo del esporófito ocurre la esporogénesis (que incluye la
meiosis), y produce esporas que germinan directamente en un gametófito haploide.

Las etapas de la meiosis

La primera etapa de la profase I es el leptoteno, durante la cual los cromosomas se


compactan y son visibles en el microscopio óptico.

La segunda etapa de la profase I, llamada cigoteno, está marcada por la asociación


visible de homólogos entre sí. Este proceso de emparejamiento cromosómico se llama
sinapsis

El complejo sinaptonémico (SC) es una estructura en forma de escalera con filamentos


de proteínas transversales que conectan los dos elementos laterales
El complejo formado por un par de cromosomas homólogos sinapsados se llama un
bivalente o una tétrada.

El final de la sinapsis marca el final del cigoteno y el comienzo de la próxima etapa de la


profase I, llamada paquiteno, que se caracteriza por un complejo sinaptonémico
completamente formado.

Nódulos de recombinación corresponden a los sitios donde tiene lugar el intercambio


de segmentos cromosómicos, como se evidencia por la síntesis asociada de DNA que
ocurre durante los pasos intermedios de recombinación

El comienzo del diploteno, la próxima etapa de la profase meiótica I, se reconoce por la


disolución del SC, que deja los cromosomas unidos entre sí en puntos específicos por
estructuras en forma de X, denominadas quiasmas

Durante la etapa final de la profase meiótica I, llamada diacinesis, se ensambla el huso


meiótico y se preparan los cromosomas para la separación.

La etapa entre las dos divisiones meióticas se denomina intercinesis y por lo general es
de corta vida. En animales las células en esta etapa fugaz se denominan espermatocitos
secundarios u ovocitos secundarios.

Semana 25
CÁNCER
Las células normales no se dividen a menos que sean estimuladas por la maquinaria
homeostática del cuerpo; ni sobreviven si han sufrido daños irreparables; ni vagan lejos
de un tejido para iniciar nuevas colonias en otras partes del cuerpo.

Pero los tumores malignos tienden a hacer metástasis, es decir, a generar células
renegadas que se separan de la masa parental, ingresan a la circulación linfática o
vascular y se diseminan a sitios distantes del cuerpo donde establecen tumores
secundarios letales (metástasis) que ya no son susceptibles de eliminación quirúrgica.

Las células cancerosas se pueden obtener mediante la eliminación de un tumor maligno,


la disociación del tejido en sus células separadas, y el cultivo de las células in vitro.

La capacidad de crecimiento y división de una célula cancerosa no es muy diferente a


la de la mayoría de las células normales.

Las células cancerosas son genéticamente inestables y a menudo tienen complementos


cromosómicos altamente anómalos, una condición llamada aneuploidía, que puede
ocurrir principalmente como resultado de defectos en el punto de control mitótico o la
presencia de un número anormal de centrosomas

Causas del cáncer


El uso a largo plazo de medicamentos antiinflamatorios no esteroideos (NSAID) como la
aspirina y la indometacina ha demostrado que disminuye de manera sustancial el riesgo
de cáncer de colon.

Varios virus pueden infectar células de mamíferos que crecen en cultivos celulares,
transformándolos en células cancerosas. Estos virus se dividen de manera amplia en dos
grandes grupos: virus tumorales de DNA y virus tumorales de RNA, según el tipo de
ácido nucleico que se encuentre dentro de la partícula de virus maduro

La determinación de las causas de los diferentes tipos de cáncer es una tarea llevada a
cabo por epidemiólogos, investigadores que estudian los patrones de las enfermedades
en las poblaciones.

Cáncer: un desorden genético

El desarrollo de un tumor maligno (oncogénesis) es un proceso de múltiples pasos


caracterizado por una progresión de alteraciones genéticas permanentes en una sola
línea de células, que puede ocurrir a lo largo de muchas divisiones celulares sucesivas y
que toma décadas para completarse.

Las células de la mayoría de los tejidos se pueden dividir de manera aproximada en tres
grupos:

1) las células madre, que poseen un potencial de proliferación ilimitado, tienen la


capacidad de producir más células madre y pueden dar origen a todas las células
del tejido;
2) células progenitoras, que se derivan de células madre y poseen una capacidad
limitada para proliferar,
3) los productos finales diferenciados del tejido, que generalmente carecen de la
capacidad de dividirse.

Algunos tejidos a menudo generan tumores benignos, que contienen células que han
proliferado para formar una masa que representa una pequeña amenaza de convertirse
en maligno.

Los estudios indican que las células pigmentarias que componen un lunar han sufrido
una respuesta que les hace entrar en un estado permanente de detención del
crecimiento, conocido como senescencia.
Descripción de los genes supresores de tumores y oncogenes

Los genes supresores de tumores actúan como frenos celulares; codifican proteínas
que restringen el crecimiento celular y evitan que las células se vuelvan malignas.

Los oncogenes, codifican proteínas que promueven la pérdida del control del crecimiento
y la conversión de una célula a un estado maligno.

Las células poseen una variedad de genes, ahora conocidos como protooncogenes,
que tienen el potencial de subvertir las propias actividades de la célula y empujar a la
célula hacia el estado maligno

Los oncogenes actúan de manera dominante, lo que significa que una sola copia de un
oncogén puede hacer que la célula exprese el fenotipo alterado, independientemente de
si hay una copia normal, no activada, del gen en el cromosoma homólogo.

Genes supresores de tumores: el gen RB


El primer gen supresor tumoral estudiado y finalmente clonado, y uno de los más
importantes, se asocia con un raro cáncer infantil de la retina del ojo, llamado
retinoblastoma.

La incidencia de retinoblastoma sigue dos patrones distintos:

1) ocurre con gran frecuencia y a una edad temprana en los miembros de ciertas
familias,
2) ocurre esporádicamente a una edad más avanzada entre los miembros de la
población en general.

En 1971, Alfred Knudson, de la Universidad de Texas, explicó la base genética del


retinoblastoma. Knudson propuso que el desarrollo del retinoblastoma requiere que
ambas copias del gen RB de una célula retiniana se eliminen o muten antes de que la
célula pueda dar lugar a un retinoblastoma. En otras palabras, el cáncer surge como
resultado de dos “golpes” independientes en una sola célula.

Cuando las células de estos tumores se cultivan in vitro, la reintroducción de un gen RB


de tipo nativo en las células es generalmente suficiente para suprimir su fenotipo
canceroso, lo que indica que la pérdida de esta función del gen contribuye
significativamente a la tumorogénesis

Genes supresores de tumores: el gen TP53


El gen TP53 puede tener más nexos con el desarrollo del cáncer humano que cualquier
otro componente del genoma. Recibe su nombre del producto que codifica, p53, que es
un polipéptido que tiene una masa molecular de 53 000 daltones. En 1990, TP53 fue
reconocido como el gen supresor de tumores que, cuando está ausente, es responsable
de un raro trastorno hereditario llamado síndrome de Li-Fraumeni.

Debido a su capacidad para desencadenar apoptosis, la p53 desempeña un papel


fundamental en el tratamiento del cáncer mediante radiación y quimioterapia.

Si p53 mueve una célula hacia la detención del ciclo celular, la apoptosis o la
senescencia, depende aparentemente del tipo de modificaciones postraduccionales a las
que está sometido.

Otros genes supresores de tumores

Aunque las mutaciones en RB y TP53 están asociadas con una gran variedad de tumores
malignos humanos, las mutaciones en otros genes supresores de tumores se detectan
sólo en algunos tipos de cáncer.

La poliposis adenomatosa colónica familiar (FAP) es un trastorno hereditario en el


que los individuos desarrollan cientos, incluso miles, de pólipos premalignos (adenomas)
de células epiteliales que recubren la pared del colon.

Oncogenes

El virus de la eritroblastosis aviar, es portador de un oncogén (erbB) que codifica un


receptor del EGF al que le falta parte del dominio extracelular de la proteína que se une
al factor de crecimiento.

Las proteínas cinasas sobreactivadas funcionan como oncogenes al generar señales que
conducen a una proliferación o supervivencia celular inadecuada.

El primer oncogén descubierto, el SRC, también es una proteína cinasa, pero fosforila
los residuos de tirosina en sustratos de proteínas en lugar de residuos de serina y
treonina.

Varios oncogenes codifican proteínas que actúan como factores de transcripción. La


progresión de las células a través del ciclo celular requiere la activación (o represión)
oportuna de una gran variedad de genes cuyos productos contribuyen de diversas
maneras al crecimiento y la división celular.

El gen MYC es uno de los protooncogenes que se alteran con más frecuencia en los
cánceres humanos, a menudo se amplifica dentro del genoma o se reorganiza como
resultado de una translocación cromosómica
Los factores más importantes para determinar el estado epigenético de la cromatina son

1) si los sitios particulares en el DNA de los promotores de genes están o no


metilados
2) las modificaciones particulares presentes en las colas de ciertas histonas
nucleares dentro de los nucleosomas de estos mismos promotores de genes.

La apoptosis es uno de los mecanismos clave del cuerpo para deshacerse de las células
tumorales en una etapa temprana en su progresión hacia la malignidad.

El oncogén más estrechamente vinculado a la apoptosis es BCL-2, que codifica una


proteína unida a la membrana que inhibe la apoptosis.

El gen BCL-2 también puede desempeñar un papel en la reducción de la eficacia de la


quimioterapia al mantener vivas y en proliferación las células tumorales a pesar del daño
causado por el tratamiento farmacológico.

Fenotipo mutador: genes mutantes involucrados en la reparación del DNA

Los procesos de reparación del DNA requieren esfuerzos conjuntos de un número


sustancial de proteínas, incluidas las proteínas que reconocen la lesión, eliminan una
porción de la cadena que contiene la lesión y sustituyen el segmento faltante con
nucleótidos complementarios. Si alguna de estas proteínas es defectuosa, se puede
esperar que la célula afectada muestre un índice de mutaciones demasiado alto, descrito
como un “fenotipo mutador”.

“genes del cáncer”, es decir, genes que se cree sean los promotores del desarrollo de,
al menos, un tipo de malignidad.

Un estudio del panorama mutacional de más de 3 000 tumores de 12 tipos principales de


cáncer identificó 127 mutaciones genéticas que impactaron un conjunto central de 20 vías
o procesos celulares.

La mejor manera de determinar cómo se originó un cáncer es analizar el estado del


genoma en las células en etapas muy tempranas de la formación de tumores.
Desafortunadamente, es casi imposible identificar tumores cuando están compuestos por
un pequeño número de células. En el momento en que se detectan los tumores, las
células ya muestran un alto grado de trastorno genético, lo que dificulta determinar si
estas alteraciones genéticas son una causa o un efecto del crecimiento del tumor.

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